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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1121 | 2026-02-24 |
Altered immune and treatment response gene expression signatures among poverty-exposed children with B-ALL
2026-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.27.702019
PMID:41659564
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析贫困暴露的B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)儿童患者的白血病母细胞及其微环境,揭示了其在诊断时表现出类固醇耐药和免疫细胞功能改变的转录特征 | 首次在单细胞水平上揭示了贫困暴露与B-ALL儿童患者白血病细胞类固醇耐药性及免疫微环境改变的关联 | 研究样本量有限,且机制性关联需要进一步实验验证 | 探究贫困暴露对B-ALL儿童患者治疗反应和免疫微环境的影响 | 标准风险B-ALL儿童患者(贫困暴露与非贫困暴露对比) | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,但涉及贫困暴露和非贫困暴露的B-ALL儿童患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1122 | 2026-02-24 |
Sod1 trisomy causes ENS developmental defects and susceptibility to Hirschsprung disease via neuronal Ret suppression and glial remodeling
2026-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.26.701837
PMID:41659476
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研究论文 | 本研究揭示了21号染色体基因SOD1剂量增加如何通过抑制神经元Ret表达和重塑胶质细胞状态,导致肠神经系统发育缺陷并增加先天性巨结肠症易感性 | 首次证明SOD1基因剂量单独增加足以扰乱肠神经系统发育,并阐明了其通过双重机制(抑制神经发生与促进胶质细胞反应性增殖)导致先天性巨结肠易感性的具体通路 | 研究基于人源化三体小鼠模型,与人类Down综合征的完整遗传背景存在差异;单细胞测序仅分析了出生后第0天的远端结肠组织 | 解析Down综合征患者先天性巨结肠症风险增高的特定染色体21基因机制 | 携带人源SOD1基因座的转基因小鼠肠神经系统细胞 | 单细胞组学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | 转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据,荧光图像数据 | 未明确样本数量(出生后第0天小鼠远端结肠组织) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1123 | 2026-02-24 |
Spatial transcriptomics reveals brain-wide circadian disruption in an Alzheimer's disease model
2026-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.26.701799
PMID:41659563
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,揭示了小鼠大脑中昼夜节律转录的空间组织架构,并发现阿尔茨海默病模型中存在早期、区域特异性的昼夜节律紊乱 | 首次在大规模空间转录组学层面,绘制了健康与阿尔茨海默病模型小鼠大脑中24小时节律转录的空间分布图,揭示了区域特异性节律紊乱作为疾病早期特征 | 研究基于小鼠模型(APP23),可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的复杂性;且主要关注转录水平,未深入探讨功能机制 | 探究健康与阿尔茨海默病状态下大脑昼夜节律转录的空间组织特征及其在疾病发病机制中的作用 | 小鼠大脑(包括皮质和皮质下区域),特别是APP23阿尔茨海默病模型小鼠 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及小鼠大脑多个区域的大规模空间转录组分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1124 | 2026-02-22 |
stGCL: a versatile cross-modality fusion method based on multi-modal graph contrastive learning for spatial transcriptomics
2026-Jan-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03896-w
PMID:41606649
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1125 | 2026-02-24 |
Generation of human pineal gland organoids with melatonin production for disease modeling
2026-Jan-08, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.12.004
PMID:41475351
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研究论文 | 本研究开发了人松果体类器官,用于模拟松果体发育和功能,并应用于疾病建模 | 首次从多能干细胞生成人松果体类器官,成功模拟松果体发育和褪黑素生产,并应用于Angelman综合征疾病模型 | 研究基于体外模型,可能无法完全复制体内复杂环境,且样本来源有限 | 开发人松果体类器官平台,用于研究松果体发育、昼夜节律调节及相关疾病 | 人松果体类器官、Angelman综合征患者来源的iPSCs、松果体切除小鼠 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1126 | 2026-02-24 |
SLC25A37 as a novel therapeutic target for benign prostatic hyperplasia: integrative analyses of single-cell RNA sequencing and genome-wide association studies
2026-Jan, Open medicine (Warsaw, Poland)
DOI:10.1515/med-2025-1371
PMID:41726128
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和全基因组关联分析,鉴定出SLC25A37是良性前列腺增生(BPH)的一个新型致病基因,并探索了其作为治疗靶点的潜力 | 首次将单细胞RNA测序与全基因组关联研究相结合,在BPH的经典单核细胞中鉴定出SLC25A37这一新的致病基因,并探索了靶向该基因的潜在治疗药物 | 未明确说明样本的具体数量,且体外实验验证可能不足以完全代表体内复杂的病理生理环境 | 识别良性前列腺增生(BPH)的致病基因并探索潜在的治疗靶点 | 良性前列腺增生(BPH)患者与健康对照者的前列腺组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),全基因组关联研究(GWAS),孟德尔随机化(MR),贝叶斯共定位,分子对接,流式细胞术,qRT-PCR,蛋白质印迹,免疫组织化学,免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据,基因组关联数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1127 | 2026-02-24 |
Multi-scale systems toxicology defines a KLF5-centered adverse outcome pathway linking DEHP exposure to pancreatic cancer progression and signaling programs relevant to therapy tolerance
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1769023
PMID:41727317
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研究论文 | 本研究通过多尺度系统毒理学框架,揭示了DEHP暴露通过KLF5中心的不良结局通路促进胰腺癌进展的机制 | 整合了异质集成机器学习、孟德尔随机化、分子对接与动力学、单细胞转录组学等多种方法,首次提出KLF5为中心的DEHP-PDAC关联通路 | 研究结果主要为假设生成性质,需要进一步实验验证 | 阐明DEHP暴露与胰腺癌进展之间的分子机制和不良结局通路 | 胰腺导管腺癌(PDAC)相关基因、KLF5蛋白、PANC-1细胞系 | 系统毒理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学、分子对接、分子动力学模拟、孟德尔随机化 | TabPFN增强集成模型、异质集成机器学习 | 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据、分子结构数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1128 | 2026-02-24 |
Single-cell RNA sequencing suggests different progenitor lineages between IDH mutant and IDHwt glioma
2026 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdag003
PMID:41727340
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了IDH突变型和IDH野生型胶质瘤在祖细胞谱系标记表达上的差异 | 首次将胎儿脑神经祖细胞分类系统应用于IDH突变型和野生型胶质瘤的单细胞分析,揭示了THY1表达在两类胶质瘤中的显著差异 | 研究依赖于公开数据集,样本量有限,且未进行实验验证 | 比较IDH突变型和IDH野生型胶质瘤的祖细胞谱系差异 | IDH突变型星形细胞瘤、少突胶质细胞瘤和IDH野生型胶质母细胞瘤样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 90个样本(74个IDHwt原发和复发样本,6个原发少突胶质细胞瘤样本,10个原发IDH突变型星形细胞瘤样本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1129 | 2026-02-24 |
Multi-omics comprehensive analysis identified KIF22 and KRAS as highly synthetic lethal pairs for triple-negative breast cancer
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1748954
PMID:41727639
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研究论文 | 本研究通过多组学分析识别出KIF22和KRAS作为三阴性乳腺癌的合成致死基因对 | 首次通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序等多组学数据,结合机器学习方法,系统性地鉴定出三阴性乳腺癌中具有高合成致死活性的新型细胞亚型,并实验验证了KIF22和KRAS作为合成致死基因对的功能 | 研究主要基于生物信息学分析和体外体内实验验证,临床转化潜力尚需进一步临床试验评估 | 探索三阴性乳腺癌的异质性,识别与疾病进展相关的合成致死基因对,为靶向治疗提供新策略 | 三阴性乳腺癌细胞及其微环境细胞亚群 | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 随机森林, 机器学习 | RNA测序数据 | 未明确指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1130 | 2026-02-24 |
ESRP1 drives epithelial-mesenchymal transition by activating EPAC-RAP1A signaling axis
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1734619
PMID:41728622
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研究论文 | 本研究揭示了ESRP1通过激活EPAC-RAP1A信号轴驱动上皮-间质转化,从而促进特发性肺纤维化进展 | 首次在单细胞水平上识别ESRP1作为EMT的关键上游调控因子,并阐明其通过EPAC-RAP1A轴的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,人类样本验证不足,且未探讨其他潜在信号通路 | 探究特发性肺纤维化中上皮-间质转化的分子机制 | 小鼠肺组织、原代肺泡上皮细胞、MLE-12肺泡上皮细胞系 | 单细胞转录组学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、qPCR、Western blot、免疫荧光、Co-IP | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据、蛋白质互作数据 | 未明确样本数量,包括BLM处理的小鼠模型和细胞培养实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1131 | 2026-02-23 |
An integrated single-cell lung cancer atlas reveals distinct fibroblast phenotypes between adenocarcinoma and squamous cell carcinomas
2026-Jan-23, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01279-3
PMID:41577803
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研究论文 | 本研究通过整合公共可用的单细胞RNA测序数据,构建了一个非小细胞肺癌的综合图谱,揭示了肺腺癌和肺鳞状细胞癌之间肿瘤微环境异质性、细胞组成以及癌症相关成纤维细胞亚型的显著差异 | 首次通过整合大规模公共单细胞RNA测序数据,系统比较了肺腺癌和肺鳞状细胞癌中肿瘤微环境的异质性,并明确了两种亚型中占主导地位的癌症相关成纤维细胞亚型及其与预后的不同关联 | 研究依赖于公共数据集,可能存在批次效应;研究结果主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;共培养实验在体外进行,可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 | 探究非小细胞肺癌中肺腺癌和肺鳞状细胞癌之间肿瘤微环境,特别是癌症相关成纤维细胞亚型的差异及其与预后的关系 | 非小细胞肺癌患者肿瘤组织中的细胞,特别是癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 整合了公共可用的大规模单细胞RNA测序数据集(具体样本数量未在摘要中明确给出) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1132 | 2026-02-23 |
Expression Atlas in 2026: enabling FAIR and open expression data through community collaboration and integration
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1238
PMID:41370097
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研究论文 | 本文介绍了Expression Atlas知识库在2026年的更新,包括内容扩展、功能增强和社区协作,以支持FAIR原则下的基因和蛋白质表达数据 | 新增了批量基线实验的标记基因分析模块,整合了单细胞RNA-seq数据集如Tabula Sapiens和GTEx单核图谱,并计划提供AI就绪数据格式 | 未明确提及具体的技术或数据局限性,主要关注资源更新和未来方向 | 通过社区协作和集成,实现FAIR和开放的表达数据,支持基础和转化研究 | 基因和蛋白质表达数据,涵盖组织、细胞类型、条件和多种物种 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 超过4500项研究,涉及67个物种,包括数百个单细胞RNA-seq实验 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1133 | 2026-02-22 |
A Single-Cell and Spatial 3D Multi-omic Atlas of Developing Human Basal Ganglia and Inhibitory Neurons
2026-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.28.702385
PMID:41659519
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研究论文 | 本研究构建了发育中人类基底神经节和抑制性神经元的单细胞与空间3D多组学图谱 | 首次结合单核甲基-3C测序、高多重空间转录组学和染色质+RNA单分子成像技术,揭示了基底神经节发育中3D表观基因组的动态变化 | 研究主要关注围产期大脑,未涵盖更广泛的发育阶段或疾病状态 | 阐明基底神经节发育过程中表观基因组和3D基因组的动态变化 | 人类基底神经节、神经节隆起及其衍生的神经元 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单核甲基-3C测序, 空间转录组学, 染色质+RNA单分子成像 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据, 3D基因组数据 | 未明确说明样本数量,但涉及发育中的人类大脑组织 | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1134 | 2026-02-22 |
The clinical significance of the Mediterranean fever gene MEFV variants in Castleman disease
2026-Jan-29, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-026-01392-1
PMID:41611845
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研究论文 | 本研究探讨了地中海热基因MEFV变异在Castleman病(CD)中的临床意义,特别是在iMCD-TAFRO亚型中的作用 | 首次在较大队列中揭示MEFV变异在CD中的高流行率,并通过体外实验和单细胞RNA测序阐明了MEFV表达与IL-6通路激活的关联 | 样本量较小(37例患者),且为回顾性研究,可能限制结果的普遍性 | 阐明MEFV基因变异在Castleman病发病机制中的作用,特别是对iMCD-TAFRO亚型的影响 | Castleman病患者(包括iMCD-TAFRO亚型)及其血液/淋巴结活检样本 | 单细胞组学 | Castleman病 | 全外显子测序, 单细胞RNA测序, 定量PCR, Luminex细胞因子检测 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 临床数据 | 37例CD患者,包括一名青少年TAFRO患者及其无症状父母和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1135 | 2026-02-22 |
Machine learning identifies disulfidptosis-related gene signature for pancreatic cancer prognosis and immune infiltration
2026-Jan-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04463-w
PMID:41591656
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和单细胞分析,探索了与胰腺癌预后和免疫浸润相关的二硫死亡相关基因特征 | 首次将新型细胞死亡方式——二硫死亡相关基因特征应用于胰腺癌预后模型的构建,并结合单细胞RNA测序揭示了关键基因在肿瘤微环境中的表达模式 | 外部验证集的模型性能中等(C-index=0.6),表明模型有待进一步优化 | 识别胰腺癌的预后生物标志物和免疫浸润模式 | 胰腺癌患者 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 随机生存森林,StepCox | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1136 | 2026-02-22 |
Exploring the key molecular mechanisms and immune microenvironment of oxidative stress-related pathways in pancreatic neuroendocrine tumor combining scRNA-seq and bulk RNA
2026-Jan-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04515-1
PMID:41591671
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,系统探索了氧化应激相关通路在胰腺神经内分泌肿瘤中的关键分子机制和免疫微环境 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据,系统阐明氧化应激通路通过BCL2L1和PHGDH等关键基因调控pNET进展的分子机制和免疫微环境相互作用 | 研究主要基于公共数据集的分析,缺乏实验验证;单细胞数据样本量相对有限(20个样本) | 阐明氧化应激相关通路如何驱动胰腺神经内分泌肿瘤进展的分子机制及其与肿瘤微环境的相互作用 | 胰腺神经内分泌肿瘤(pNET)样本 | 生物信息学 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, 差异表达分析, WGCNA, GO/KEGG富集分析, PPI网络, CIBERSORTx免疫浸润分析, ceRNA网络构建, 转录因子预测, 药物预测, 分子对接 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 蛋白质-蛋白质相互作用网络, 预后列线图模型, ROC分析 | 基因表达数据(RNA-seq) | 批量RNA-seq数据集GSE73338包含63个pNET样本和5个对照样本;单细胞RNA-seq数据集GSE256136包含20个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1137 | 2026-02-22 |
KIF5B-driven unfolded protein response reprograms breast cancer immunosuppressive microenvironment for single-cell guided therapeutic targeting
2026-Jan-26, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04526-y
PMID:41587002
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据,揭示了KIF5B在乳腺癌中作为预后生物标志物和治疗靶点的作用,并探讨了其对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次通过多模态数据分析,将KIF5B与未折叠蛋白反应、免疫浸润和药物敏感性联系起来,为乳腺癌的精准治疗提供了新见解 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;数据来源于多个数据集,可能存在批次效应 | 探究KIF5B在乳腺癌预后、肿瘤微环境和治疗反应中的综合作用 | 乳腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | hdWGCNA, 共识聚类 | RNA-seq数据 | 多个数据集的样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1138 | 2026-02-22 |
Intermittent fasting inhibits Tp53-driven glioma through gut microbiota-mediated methionine-m6A regulation
2026-Jan-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68512-2
PMID:41559043
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研究论文 | 本研究揭示了间歇性禁食(IF)通过肠道菌群介导的甲硫氨酸-m6A调控途径抑制Tp53驱动型胶质瘤的分子机制 | 首次发现IF的抗肿瘤效果与胶质母细胞瘤(GBM)亚型(Tp53型 vs CDKN2A型)相关,并通过多组学技术系统阐明了肠道菌群-甲硫氨酸-m6A修饰-TGF-β信号轴在其中的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人体临床验证尚需开展;对CDKN2A亚型GBM中IF效果不显著的机制未深入探讨 | 探究间歇性禁食抑制胶质母细胞瘤的亚型特异性机制 | Tp53驱动型和Cdkn2a驱动型胶质母细胞瘤小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 多组学测序(空间转录组、空间代谢组、单细胞转录组、单细胞RNA甲基化、代谢组、微生物组) | 小鼠肿瘤模型 | 多组学数据 | 未明确说明 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞转录组学, 单细胞RNA甲基化, 代谢组学, 微生物组学 | NA | NA |
| 1139 | 2026-02-22 |
Biologically interpretable deep learning-derived MRI phenotypes reveal lymph node involvement and neoadjuvant therapy response in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Jan-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001671
PMID:41525512
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研究论文 | 本研究开发了一个名为SwinU-CliRad的深度学习模型,用于对肝内胆管癌的淋巴结受累风险进行分层,并评估其对新辅助治疗反应的预测能力 | 整合了基于Swin UNETR的MRI衍生输出与临床放射学特征,构建了可解释的深度学习模型,并探索了模型输出与肿瘤多组学特征的相关性 | 研究涉及多个队列,但外部验证队列样本量相对较小(n=88),且模型性能仍需在更广泛的多中心数据中进一步验证 | 开发一个模型以改进肝内胆管癌的淋巴结受累分层,并为治疗决策提供信息 | 肝内胆管癌患者 | 计算机视觉 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序,多组学分析 | Swin UNETR,SwinU-CliRad框架 | 磁共振成像,临床放射学特征 | 发现队列682例,内部测试队列204例,外部多中心队列88例,新辅助治疗队列145例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1140 | 2026-01-14 |
Decoding the tumor microenvironment remodeling orchestrated by CLEC3B+ inflammatory cancer-associated fibroblasts in lung adenocarcinoma immunotherapy: elucidation from pan-cancer spatially single-cell transcriptomics landscape
2026-Jan-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07677-2
PMID:41526921
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |