单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202601] [清除筛选条件]
当前共找到 1234 篇文献,本页显示第 1041 - 1060 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1041 2026-01-06
1,3,6-Tri-O-Galloyl-β-D-Glucose Alleviates Sepsis-Induced Lung Damage by Inhibiting Inflammatory Response and Oxidative Stress Through Targeting Neutrophil IFIT1
2026-Jan-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究探讨了1,3,6-Tri-O-Galloyl-β-D-Glucose通过靶向中性粒细胞IFIT1抑制炎症反应和氧化应激,从而减轻脓毒症诱导的肺损伤 首次识别出具有组织保护潜力的Ifit1中性粒细胞亚群,并发现天然化合物TGG作为IFIT1的有效激动剂,为脓毒症肺损伤提供了新的治疗靶点和候选药物 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人类临床试验中验证TGG的安全性和有效性 阐明调节过度免疫反应和决定脓毒症预后的关键机制,并提供新的干预策略 脓毒症小鼠模型中的免疫细胞,特别是中性粒细胞 NA 脓毒症 单细胞RNA测序,流式细胞术,RNA测序,虚拟筛选,分子对接 NA 单细胞RNA测序数据,流式细胞术数据,RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1042 2026-01-06
Single-cell omics in investigating the effect of CAFs with KRAS overexpression on the malignant progression of anaplastic thyroid cancer
2026-Jan-05, Journal of the Chinese Medical Association : JCMA IF:1.9Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探究了KRAS过表达的癌症相关成纤维细胞(CAFs)对未分化甲状腺癌(ATC)恶性进展的影响 首次在单细胞水平上揭示了KRAS在ATC成纤维细胞中的表达谱,并证实了KRAS过表达的CAFs通过激活RAS/RAF/MAPK通路促进ATC细胞的增殖、迁移和侵袭 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;样本量可能有限,未详细说明具体样本数量 揭示KRAS过表达的CAFs对ATC恶性生物学行为的影响机制 未分化甲状腺癌(ATC)组织、癌症相关成纤维细胞(CAFs)、旁癌组织成纤维细胞(PTFs)及ATC细胞 单细胞组学 甲状腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、Western blot、克隆形成实验、EdU染色、Transwell实验、Annexin V-FITC/PI染色 NA 单细胞RNA测序数据、体外细胞实验数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1043 2026-01-06
HiST: Histological Images Reconstruct Tumor Spatial Transcriptomics via MultiScale Fusion Deep Learning
2026-Jan-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究开发了一个名为HiST的多尺度卷积深度学习框架,用于从组织学图像重建肿瘤空间转录组数据 HiST通过多尺度融合深度学习,首次实现了从组织学图像高精度预测空间基因表达谱,其性能优于现有模型约两倍 NA 解决空间转录组技术成本高昂的问题,通过深度学习从组织学图像重建空间基因表达谱 多种癌症类型(如乳腺癌)的组织学图像和空间转录组数据 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学 多尺度卷积深度学习框架 图像 NA NA 空间转录组学 NA NA
1044 2026-01-06
Spatially Resolved Multiomics Reveals Metabolic Remodeling and Autophagy Activation in Adamantinomatous Craniopharyngiomas
2026-Jan-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过整合空间分辨多组学技术,揭示了颅咽管瘤中代谢重塑和自噬激活是其进展和复发的关键驱动因素 首次在颅咽管瘤中整合应用CosMx SMI单细胞空间转录组学和AFADESI-MSI空间分辨代谢组学,结合代谢组学和功能验证,系统揭示了肿瘤上皮细胞亚群的空间异质性、独特的“囊液-肿瘤细胞”代谢轴及其与自噬激活的直接耦合关系 研究样本量未明确说明,且主要基于观察性关联分析,需要进一步的功能实验验证代谢轴与自噬激活之间的因果关系 揭示颅咽管瘤进展和复发的驱动因素,为这种难治性肿瘤提供精准生物标志物驱动的治疗机会 颅咽管瘤组织样本,包括肿瘤区域和复发性肿瘤上皮组织 数字病理学 颅咽管瘤 单细胞空间转录组学,空间分辨代谢组学,代谢组学,多重免疫组织化学 NA 空间转录组数据,代谢组数据,图像数据 NA NanoString 单细胞空间转录组学,空间分辨代谢组学 CosMx SMI CosMx SMI单细胞空间分子成像平台,用于单细胞分辨率空间转录组分析
1045 2026-01-06
Integrative transcriptomics defines CD36 as a key regulator of immunometabolic signaling in acute myeloid leukemia
2026-Jan-05, Genes & genomics IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过整合转录组学和空间验证,揭示了CD36在急性髓系白血病(AML)中作为免疫代谢信号关键调节因子的作用 首次将CD36定义为AML中免疫代谢信号的核心枢纽,并通过单细胞RNA测序和空间转录组学验证其在免疫微环境中的功能 需要更全面的体外和体内实验验证 研究CD36在AML发病机制中作为免疫代谢介质的调控作用 急性髓系白血病(AML)细胞、单核细胞、巨噬细胞 数字病理学 急性髓系白血病 整合转录组学、单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 转录组数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
1046 2026-01-06
Targeting IL27RA Enhances Immunotherapy in Triple-Negative Breast Cancer by Modulating Tumor Cells and the Tumor Microenvironment
2026-Jan-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现,在三阴性乳腺癌中,恶性上皮细胞高表达IL27RA会通过激活PI3K/AKT通路抑制MHC-I表达,从而损害CD8⁺ T细胞功能并导致免疫检查点抑制剂耐药,靶向IL27RA可增强免疫治疗效果 首次揭示了IL27RA在三阴性乳腺癌免疫治疗耐药中的关键作用,并阐明了其通过非经典的PI3K/AKT通路(而非经典的IL-27/STAT轴)抑制MHC-I表达的新机制 研究主要基于临床样本和小鼠模型,IL27RA靶向治疗的临床转化效果仍需进一步验证 探究三阴性乳腺癌免疫检查点抑制剂耐药的分子机制并寻找新的治疗靶点 三阴性乳腺癌患者肿瘤样本、小鼠原位肿瘤模型 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 包含未达到病理完全缓解(非pCR)患者的配对治疗前后肿瘤样本,以及3名pCR患者的独立队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1047 2026-01-06
SAGE: Spatially Aware Gene Selection and Dual-View Embedding Fusion for Domain Identification in Spatial Transcriptomics
2026-Jan-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文提出了一种名为SAGE的统一可重复框架,用于空间转录组学中的空间域识别,该框架结合了主题驱动的基因选择和双视图嵌入融合 提出了一种结合主题建模与分类器重要性评分的空间信息基因选择方法,并通过融合局部表达图与主题驱动的非局部图来联合学习空间和功能嵌入 未在摘要中明确说明 解决空间转录组学中由于复杂组织结构和方法限制导致的准确分割空间域的挑战 空间转录组学数据 空间转录组学 乳腺癌、黑色素瘤 空间转录组学 非负矩阵分解、图表示学习 空间基因表达数据 34个真实世界数据集 NA 空间转录组学 NA NA
1048 2026-01-06
BHLHE40 Orchestrates Effector Tissue-Resident Memory CD8+ T Cells and Limits Long-Term Survival of Kidney Graft
2026-Jan-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究利用小鼠肾移植模型,通过单细胞和空间转录组学技术,揭示了CD49a+PD-1+ CD8+ T细胞作为效应性组织驻留记忆T细胞的一个亚群,在移植排斥中的关键作用及其分化调控机制 首次在小鼠肾移植模型中,通过单细胞和空间转录组学,鉴定出CD49a+PD-1+ CD8+ T细胞是效应性组织驻留记忆T细胞的一个亚群,并阐明了BHLHE40在调控其分化和效应功能中的核心作用,强调了驻留免疫细胞而非循环细胞在移植排斥中的主导贡献 研究基于小鼠模型,其结论在人类移植中的普适性有待验证;研究聚焦于长期观察,早期事件可能未被完全捕捉;机制研究主要围绕BHLHE40和TGF-β通路,可能存在其他调控因子未被探索 探究组织驻留记忆T细胞在肾移植排斥中的稳态、分化及其调控机制 小鼠肾移植模型中的组织驻留记忆CD8+ T细胞 空间转录组学 肾移植排斥 单细胞转录组学,空间转录组学 NA 转录组数据,空间位置数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1049 2026-01-06
The Role of Microglial Cells and Cytokine Modulation in Alzheimer's Disease: A Neuroinflammatory Perspective
2026-Jan-02, Current Alzheimer research IF:1.8Q4
综述 本文从神经炎症角度综述了阿尔茨海默病中微胶质细胞和细胞因子调节的作用 强调了神经炎症作为阿尔茨海默病起始和进展关键初始事件的新兴证据,并探讨了疾病相关微胶质细胞(DAM)的复杂性及细胞因子失衡的自我延续炎症循环 针对微胶质细胞和细胞因子活性的疗法临床效果不一,仍需进一步探索神经炎症反应的时机、背景和变异以开发有效靶向治疗 探讨阿尔茨海默病中神经炎症过程与经典神经病理特征之间的关系,以及免疫反应的动态双重效应 阿尔茨海默病中的微胶质细胞、细胞因子信号及神经炎症机制 神经科学 阿尔茨海默病 神经影像学(如TSPO-PET)、细胞因子收集与组成分析、单细胞转录组学 NA NA NA NA 单细胞转录组学 NA NA
1050 2026-01-06
Oncogenic Ras, Yki and Notch signals converge to confer clone competitiveness through Upd2
2026-Jan, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了Ras、Yki和Notch信号通路在果蝇翅盘细胞竞争中通过上调Upd2来增强克隆竞争力,促进组织生长并可能驱动肿瘤发生 首次发现Ras、Yki和Notch信号通路在细胞竞争中共同上调Upd2作为关键汇聚点,并证明Upd2是维持组织生长但失调时可促进肿瘤发生的关键细胞适应性因子 研究主要基于果蝇模型,尚未在哺乳动物系统中验证;单细胞转录组学数据可能未完全捕捉所有信号通路细节 探究细胞竞争中信号通路如何通过共同机制克服克隆消除压力 果蝇翅盘中的scribble突变克隆和肠道干细胞 单细胞转录组学 肿瘤发生 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1051 2026-01-06
Single-cell transcriptome analysis reveals critical causative candidates for Down syndrome-related lung diseases
2026-Jan, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了唐氏综合征相关肺部疾病的关键致病候选因素 利用Dp16小鼠模型结合单细胞RNA测序技术,首次系统性地探索了21号染色体三体对肺部疾病的影响,并发现了APP相关相互作用增强、MHC-II信号上调等新机制 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的直接适用性需进一步验证;样本量相对有限,且性别差异的深入分析不足 探究唐氏综合征相关肺部疾病的分子机制和致病候选因素 Dp16小鼠模型的肺部细胞 数字病理学 唐氏综合征相关肺部疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、组织免疫荧光评估、经胸超声心动图 NA 单细胞转录组数据、图像数据 Dp16小鼠模型的肺部细胞样本(包括雄性和雌性) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1052 2026-01-06
The single-cell landscape of the human vein after arteriovenous fistula creation and implications for maturation failure
2026-Jan, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和组学分析,揭示了动静脉瘘(AVF)创建后静脉壁的细胞和分子变化,为理解AVF成熟失败机制提供了新见解 首次构建了人类静脉在动静脉瘘创建前后的单细胞转录组图谱,识别了失败AVF中持续的炎症反应和关键信号通路(如Myddosome复合物和骨桥蛋白) 样本量相对有限(20例患者),且为观察性研究,未能验证潜在治疗靶点的临床效果 探究动静脉瘘(AVF)成熟失败的生物学机制,以改善血液透析患者的治疗效果 人类静脉组织样本,包括术前静脉、早期切除样本、成熟AVF和失败AVF 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序,组织学分析 NA 单细胞转录组数据,组织切片图像 20例患者的70,281个细胞,以及23例患者的组织活检样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1053 2026-01-06
Single-cell spatial transcriptomics reveal intraglomerular cell activation and ligand-receptor relationships in chronic, active antibody mediated rejection
2026-Jan, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞空间转录组学技术,揭示了慢性活动性抗体介导排斥反应中肾小球内细胞激活及配体-受体关系的分子机制 首次在单细胞分辨率下应用空间转录组学技术,解析了CAMR中肾小球内皮细胞、NK细胞和巨噬细胞的空间分子相互作用,发现了新的配体-受体相互作用通路 研究样本量有限,仅基于福尔马林固定石蜡包埋的肾活检组织,且未进行功能验证实验 探究慢性活动性抗体介导排斥反应的发病机制,特别是肾小球内细胞的空间分子相互作用 慢性活动性抗体介导排斥反应患者的肾移植活检组织,以及无排斥反应的对照组织 数字病理学 肾脏疾病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 未明确指定样本数量,但包括CAMR患者和对照组的肾活检组织 NanoString 空间转录组学 CosMx Spatial Molecular Imager CosMx空间分子成像仪,用于单细胞分辨率的空间转录组分析
1054 2026-01-06
Transcript profiling and gene regulation of the human pre-implantation embryo: parental effects and impact of ARTs
2026-Jan-01, Human reproduction update IF:14.8Q1
综述 本文综述了人类植入前胚胎转录组如何受父母特征、辅助生殖技术条件及胚胎内在因素的影响 整合了多种因素(如父母年龄、ART干预、胚胎倍性)对胚胎转录组的影响,并利用单细胞RNA测序数据绘制了囊胚阶段谱系特异性转录模式 关于PCOS、子宫内膜异位症、精子异常及部分ART技术影响的人类囊胚数据仍然有限,部分结论依赖动物研究或其他发育阶段数据 探索父母特征、ART条件及胚胎因素如何影响人类植入前胚胎的转录组,并识别常见的失调分子通路 人类囊胚 生殖医学 不孕症 单细胞RNA测序,基因本体分析 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1055 2026-01-06
Insights into arteriovenous fistula (non)maturation: single-cell transcriptomics reveals new drivers of arteriovenous fistula remodeling
2026-Jan, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术分析动静脉瘘,揭示其失败主要由持续炎症、内皮功能障碍和成纤维细胞驱动的纤维化驱动,而非平滑肌增殖 首次应用单细胞转录组学于动静脉瘘研究,挑战了传统以平滑肌增殖为主导的失败机制观点,强调了炎症和纤维化在动静脉瘘重塑中的关键作用 未明确样本量或具体技术细节,可能缺乏临床验证或长期随访数据 探究动静脉瘘成熟失败的分子机制,以指导未来治疗策略 动静脉瘘组织 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1056 2026-01-05
Integrated Multi-Omics Analysis Reveals Cytokine Network Dynamics and Prognostic Signatures in Hepatitis B Virus-Associated Hepatocellular Carcinoma
2026-Jan-04, Applied biochemistry and biotechnology IF:3.1Q2
研究论文 本研究通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序,揭示了细胞因子网络在HBV相关肝细胞癌中的动态变化,并构建了一个基于六种细胞因子的预后风险模型 首次整合bulk和单细胞转录组学分析HBV-HCC中的细胞因子网络,构建了基于LASSO的六细胞因子预后特征,并通过功能实验验证了关键细胞因子GHR的作用 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平的验证;样本量可能有限,需要更大规模的前瞻性研究验证预后模型的临床适用性 阐明细胞因子在HBV相关肝细胞癌中的作用机制,并开发预后风险分层模型 HBV相关肝细胞癌患者样本(包括肿瘤组织和血清) 数字病理学 肝细胞癌 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 血清学检测, 体外功能实验 LASSO回归模型 RNA测序数据, 单细胞转录组数据, 血清蛋白数据 训练和验证队列中的HBV-HCC患者样本(具体数量未明确说明) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1057 2026-01-05
An insulin receptor activity surge in follicle cells drives vitellogenesis by upregulating CrebA
2026-Jan-03, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 本研究探讨了胰岛素信号在果蝇卵泡细胞中的作用,揭示了胰岛素受体活性激增通过上调CrebA驱动卵黄生成,并发现这一调控轴在人类颗粒细胞中保守 利用基于相分离的报告系统观察到卵泡细胞中胰岛素受体活性激增,并通过单细胞RNA-seq识别出对饮食敏感的卵泡细胞亚群,揭示了CrebA在胰岛素信号阶段特异性效应中的关键作用 研究主要基于果蝇模型,人类颗粒细胞中的保守性验证可能需进一步实验支持,且高蔗糖饮食的影响机制尚未完全阐明 探究胰岛素信号在果蝇卵泡细胞发育和卵黄生成中的功能及机制 果蝇卵泡细胞和人类颗粒细胞 发育生物学 NA 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据 未明确指定样本数量,但涉及果蝇卵泡细胞单细胞RNA-seq分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1058 2026-01-05
Microglia Mitochondrial Metabolism in Neurological Diseases
2026-Jan-03, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
综述 本文综述了小胶质细胞线粒体代谢在神经退行性疾病中的作用机制及其对神经炎症和疾病进展的影响 提出了线粒体质量控制失败导致线粒体DNA释放并激活cGAS-STING通路形成“表观遗传锁”的统一致病机制,并强调代谢灵活性丧失(而非糖酵解本身)是病理的真正驱动因素 缺乏纵向人类数据验证,缺少经过验证的生物标志物,实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型在多发性硬化症研究中存在争议 阐明小胶质细胞线粒体代谢在神经疾病中的作用机制,并提出针对恢复线粒体动力学和代谢灵活性的精准医学框架 小胶质细胞(中枢神经系统的常驻免疫细胞) 神经科学 阿尔茨海默病、帕金森病、多发性硬化症、缺血性中风 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1059 2026-01-05
Identification of Cuproptosis-Associated Biomarker Candidates in Hypertrophic Cardiomyopathy via Machine Learning and Multi-Omics Integration
2026-Jan-03, Applied biochemistry and biotechnology IF:3.1Q2
研究论文 本研究通过整合机器学习与多组学数据,识别了与肥厚型心肌病相关的铜死亡生物标志物候选物 首次将铜死亡相关基因与肥厚型心肌病关联,并利用机器学习整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据构建诊断模型 研究发现是关联性的且为假设生成性质,需要前瞻性临床评估和机制研究(如铜稳态扰动和基因操作)才能做出治疗推断 识别肥厚型心肌病的新型生物标志物候选物和治疗靶点 健康对照和肥厚型心肌病患者的基因表达数据 机器学习 心血管疾病 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq 加权基因共表达网络分析, 诊断模型 基因表达数据 来自健康对照和HCM患者的bulk RNA-seq和scRNA-seq数据 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1060 2026-01-05
Autologous human iPSC-derived alveolus-on-chip reveals early pathological events of Mycobacterium tuberculosis infection
2026-Jan-02, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究开发了一种基于单供体人类诱导多能干细胞衍生的肺芯片模型,用于模拟人类远端肺的细胞组成和机械环境,并应用于结核分枝杆菌感染的早期病理事件研究 首次构建了包含肺泡上皮细胞、血管内皮细胞和巨噬细胞的自体人类诱导多能干细胞衍生的肺芯片模型,结合微流体技术模拟三维机械拉伸和气液界面,用于研究结核分枝杆菌感染的早期病理机制 模型可能无法完全模拟体内复杂的免疫微环境和长期感染动态,且基于单供体细胞,个体差异影响未评估 开发一种免疫活性且实验可及的人类肺泡系统模型,以研究呼吸系统疾病如结核病的病理机制 人类诱导多能干细胞衍生的肺泡上皮细胞、血管内皮细胞和巨噬细胞,以及结核分枝杆菌 数字病理学 结核病 单细胞RNA测序 器官芯片 图像,单细胞RNA测序数据 基于单供体人类诱导多能干细胞的模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部