单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1234 篇文献，本页显示第 1021 - 1040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1021 | 2026-01-07 |
Fecal microbiota transplantation promotes type 2 mucosal immune responses with colonic epithelium proliferation in patients with recurrent Clostridioides difficile
2026-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195678
PMID:41252206
|
研究论文 | 本研究通过临床试验探讨了粪便微生物移植（FMT）在治疗复发性艰难梭菌感染（rCDI）中的作用机制，发现FMT能促进结肠上皮增殖并上调2型免疫反应 | 首次结合空间转录组学与单细胞基因集分析，揭示了FMT在结肠上皮局部促进增殖性细胞类型并抑制分化结肠细胞特征 | 样本量较小（n=16），且仅评估了FMT后2个月的短期效果，长期影响未知 | 阐明FMT治疗rCDI的分子和免疫机制 | 复发性艰难梭菌感染患者（n=16）和健康对照 | 数字病理学 | 艰难梭菌感染 | 高通量测序、流式细胞术、空间转录组学 | NA | 结肠活检、血浆、PBMCs、粪便样本 | 16名rCDI患者及健康对照 | NA | 空间转录组学, 单细胞基因集分析 | NA | NA |
| 1022 | 2026-01-07 |
An integrated single-cell and spatial transcriptomic atlas of thyroid cancer progression identifies prognostic fibroblast subpopulations
2026-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191990
PMID:41480746
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和空间转录组学数据，构建了甲状腺癌进展的图谱，识别了与预后相关的成纤维细胞亚群 | 结合单细胞和空间转录组学分析甲状腺癌进展，特别是在混合WDTC/ATC组织病理学样本中，首次定义了POSTN+肌成纤维细胞癌症相关成纤维细胞（myCAFs）亚群，该亚群与侵袭性肿瘤细胞紧密相关并预测不良预后 | 样本量相对有限（81个单细胞样本和28个空间转录组肿瘤），且主要基于转录组数据，可能未涵盖所有分子机制 | 理解甲状腺癌在儿童和成人中的演变过程，识别与疾病进展和预后相关的细胞亚群 | 甲状腺癌样本，包括分化良好的甲状腺癌（WDTC）、间变性甲状腺癌（ATC）、混合WDTC/ATC肿瘤以及儿童弥漫性硬化性甲状腺癌 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | 转录组数据, 空间数据 | 423,733个细胞来自81个样本，28个肿瘤进行空间转录组分析，5个大型甲状腺癌批量RNA测序队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1023 | 2026-01-07 |
Recovering gene regulatory networks in single-cell multi-omics data with PRISM-GRN
2026-Jan-05, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280757.125
PMID:41067887
|
研究论文 | 提出了一种名为PRISM-GRN的贝叶斯模型，用于从单细胞多组学数据中重建细胞类型特异性的基因调控网络 | 首次将已知的基因调控网络、scRNA-seq和scATAC-seq数据整合到一个概率框架中，采用基于生物学可解释机制的架构，能够处理非配对组学数据和有限的先验网络信息 | 未明确说明模型对计算资源的需求或可扩展性限制 | 从单细胞多组学数据中精确、稳健地重建基因调控网络 | 基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 贝叶斯模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 四个基准数据集（包含配对scRNA-seq和scATAC-seq数据） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1024 | 2026-01-07 |
scHyperLink: Revealing Cell-Type-Specific Gene Regulation with Hypergraph Neural Networks
2026-Jan-05, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3650661
PMID:41489955
|
研究论文 | 本文提出了一种基于超图神经网络的单细胞基因调控网络重建框架scHyperLink | 首次将超图神经网络应用于单细胞基因调控网络重建，能够捕捉基因间的高阶依赖关系，克服传统图神经网络仅能建模成对节点交互的局限 | 未明确说明模型在超大规模数据集上的计算效率，也未讨论对特定细胞类型或组织类型的泛化能力 | 提高单细胞分辨率下基因调控网络重建的准确性，特别是捕捉多转录因子协同调控的高阶依赖关系 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 超图神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1025 | 2026-01-07 |
Hot zones for liver cancer: metabolic zonation, ferroptosis, and the origins of HCC
2026-Jan-05, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-5839
PMID:41490712
|
研究论文 | 本研究通过小鼠遗传学模型和空间转录组学技术，揭示了肝细胞癌（HCC）主要起源于肝小叶的中央周围区（zone-3），并阐明了谷胱甘肽S-转移酶Gstm2/Gstm3通过抑制铁死亡（ferroptosis）在肝癌发生中的关键作用 | 首次结合精细的遗传学操作和空间转录组学，在活体组织中追踪癌前肝细胞的命运，发现了克隆扩增能力与肿瘤发生潜能之间的显著分离现象，并确定了Gstm2/Gstm3通过调控氧化还原平衡和抑制铁死亡来决定肝细胞肿瘤发生潜能的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类HCC中的普适性仍需进一步验证；空间转录组学技术可能无法完全解析单个细胞的异质性 | 探究肝癌发生的细胞起源及其与肝脏代谢分区（zonation）的关系，并寻找潜在的治疗靶点 | 小鼠肝脏组织、肝细胞、癌前克隆、肝细胞癌（HCC） | 空间转录组学 | 肝癌 | 空间转录组学、小鼠遗传学模型、功能筛选、基因敲除/敲低、化学抑制 | NA | 空间基因表达数据、遗传表型数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1026 | 2026-01-07 |
PPIA regulates fatty acid and glutamine metabolism in lung adenocarcinoma based on multiomics prognostic model and experiment validation
2026-Jan-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34313-8
PMID:41491011
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析构建了一个基于脂肪酸代谢相关基因的肺腺癌预后风险模型，并通过实验验证了PPIA通过c-Myc介导的脂肪酸-谷氨酰胺代谢轴驱动肺腺癌进展的机制 | 首次整合多组学数据、单细胞RNA测序和实验验证，揭示了PPIA通过调控c-Myc介导的脂肪酸-谷氨酰胺代谢网络重塑来促进肺腺癌恶性进展和影响免疫微环境的新机制，并构建了一个具有强预测能力的四基因预后风险模型 | 部分数据集的临床信息不完整，无法进行全面的亚组分析 | 阐明PPIA在肺腺癌代谢重编程和肿瘤进展中的具体作用机制，并构建有效的预后评估工具 | 肺腺癌细胞系（A549和H1975细胞）以及来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者多组学数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，WGCNA，qRT-PCR，Western blotting，CCK-8，集落形成，伤口愈合，Transwell实验，代谢谱分析 | Cox回归风险模型，WGCNA | 多组学数据，单细胞RNA测序数据，基因表达数据，临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者队列数据，以及A549和H1975细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1027 | 2026-01-07 |
Decoding cell state transitions driven by dynamic cell-cell communication in spatial transcriptomics
2026-Jan-05, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00934-2
PMID:41491113
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CCCvelo的方法，用于通过联合优化动态细胞间通讯信号网络和潜在细胞状态转换时钟，重建空间转录组学中细胞间通讯驱动的细胞状态转换动态 | 提出CCCvelo方法，首次将细胞间配体-受体信号梯度与细胞内转录因子激活级联整合到一个统一的多尺度非线性动力学模型中，并开发了基于物理信息神经网络的协同进化学习算法PINN-CELL | NA | 解码空间转录组学中由动态细胞间通讯驱动的细胞状态转换 | 小鼠皮层、胚胎躯干发育和人类前列腺癌数据集 | 空间转录组学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | 物理信息神经网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1028 | 2026-01-07 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Key Factors in Gastric Intestinal Metaplasia
2026-Jan-05, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-025-18940-z
PMID:41492114
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了胃黏膜肠上皮化生（IM）中的细胞和分子动态变化，并识别了TFF3基因作为早期胃癌发展的潜在驱动因子 | 首次在单细胞水平上系统表征了胃黏膜肠上皮化生（IM）的细胞类型和分子特征，并发现TFF3在IM相关杯状细胞中的显著上调及其与疾病进展的强相关性 | TFF3在早期胃癌中的具体调控机制尚未完全阐明，且样本量相对有限，需要进一步的功能验证和更大规模的研究 | 探究胃黏膜肠上皮化生（IM）的分子驱动因素，以识别生物标志物和治疗靶点 | 胃上皮组织，包括对照组、慢性浅表性胃炎和肠上皮化生（IM）阶段的样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定具体样本数量，但涉及对照组、慢性浅表性胃炎和肠上皮化生（IM）阶段的胃上皮组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1029 | 2026-01-07 |
Single-cell transcriptomics reveal alveolar macrophages-specific responses in single-hit ozone exposure model in mice
2026-Jan-02, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00235.2025
PMID:41481288
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠肺泡巨噬细胞在臭氧暴露后的转录组变化和功能调控 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了臭氧浓度依赖性的肺泡巨噬细胞转录组景观和功能状态异质性 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠，未考虑性别差异；暴露时间固定为3小时，未评估长期效应 | 探究肺泡巨噬细胞对臭氧暴露的响应机制及其浓度依赖性变化 | 成年雄性C57BL/6J小鼠的肺泡巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三组小鼠（过滤空气、1 ppm臭氧、1.5 ppm臭氧暴露组），具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1030 | 2026-01-07 |
BCMA/CD19 CAR T cell therapy for refractory myasthenia gravis: Proteomic signatures and single-cell transcriptomics of disease flares
2026-Jan-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb6424
PMID:41481736
|
研究论文 | 本研究探讨了BCMA/CD19 CAR T细胞疗法在治疗难治性重症肌无力中的安全性和有效性，并通过蛋白质组学和单细胞转录组学分析了疾病复发的分子特征 | 首次将BCMA/CD19 CAR T细胞疗法应用于难治性重症肌无力患者，并识别出FCRL5作为复发的新潜在靶点 | 样本量较小（仅6名患者），且为单中心研究，需要更大规模试验验证 | 评估BCMA/CD19 CAR T细胞疗法对难治性重症肌无力的治疗效果并探索复发机制 | 6名难治性重症肌无力患者 | 单细胞转录组学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序, Olink蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 6名患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1031 | 2026-01-07 |
Liver Macrophage Changes during Early Adaptation to Alcohol Exposure
2026-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.10.004
PMID:41177326
|
研究论文 | 本研究探讨了酒精暴露早期对小鼠和人类肝脏中Kupffer细胞和浸润巨噬细胞的影响，揭示了它们如何适应以维持肝脏稳态并限制炎症 | 首次通过单细胞RNA测序结合流式细胞术和体外细胞培养，系统比较了酒精暴露早期小鼠肝脏巨噬细胞亚群的变化，并与人类肝脏样本进行关联分析，明确了Kupffer细胞在酒精适应中的抗炎角色 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，可能无法完全反映人类酒精性肝病的长期进程；单细胞测序样本量较小，且未深入探讨分子机制 | 探究酒精暴露早期对肝脏巨噬细胞（包括Kupffer细胞和浸润巨噬细胞）表型变化的影响，并比较小鼠模型与人类肝脏的观察结果 | 小鼠肝脏巨噬细胞（Kupffer细胞和浸润巨噬细胞）以及人类肝脏组织样本（来自尸检和移植患者） | 数字病理学 | 酒精性肝病 | 流式细胞术、体外细胞培养、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、组织样本 | 小鼠模型（具体数量未明确）和人类肝脏组织样本（来自尸检和移植患者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1032 | 2026-01-07 |
A single-cell multiomics roadmap of zebrafish spermatogenesis reveals regulatory principles of male germline formation
2026-Jan, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00157-7
PMID:41087739
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术绘制了斑马鱼精子发生的路线图，揭示了雄性生殖细胞形成的调控原理 | 首次在斑马鱼中结合单细胞RNA测序、单细胞染色质可及性分析和全基因组甲基化测序，全面解析精子发生过程，并识别出逃避全局染色质压缩的位点，为跨代遗传调控状态提供了潜在机制 | 研究主要聚焦于斑马鱼，对非羊膜动物精子发生的理解仍有限，且未涉及其他脊椎动物的比较验证 | 研究脊椎动物生殖细胞发育和表观遗传继承，特别是斑马鱼精子发生的调控机制 | 斑马鱼（Danio rerio）睾丸中的生殖细胞群体 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞染色质可及性分析（scATAC-seq），全基因组甲基化测序（WGBS） | NA | 单细胞转录组数据，单细胞染色质可及性数据，DNA甲基化数据 | 斑马鱼睾丸中分选的生殖细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，bulk DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 1033 | 2026-01-07 |
CellPredX, a computational framework for cross-data type, cross-sample, and cross-protocol cell type annotation through domain adaptation and deep metric learning
2026-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013824
PMID:41481570
|
研究论文 | 本文提出了一种名为CellPredX的计算框架，用于通过域适应和深度度量学习实现跨数据类型、跨样本和跨协议的单细胞类型注释 | CellPredX是一个结构统一但参数自适应的半监督跨模态框架，集成了域适应和深度度量学习，并引入了带有注意力机制的稀疏中心损失以增强判别性表示，同时通过基于梯度归因的解释器模块提供生物可解释性 | NA | 解决单细胞分析中跨异构数据集和模态的细胞类型注释挑战，特别是在scRNA-seq和scATAC-seq数据之间的标签转移 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq）数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | 深度度量学习，域适应 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1034 | 2026-01-07 |
TDP2 drives immune evasion and metastatic progression in prostate cancer
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0339607
PMID:41481587
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和通路富集分析，揭示了TDP2在前列腺癌中通过调控肿瘤微环境促进免疫逃逸和转移进展的关键作用 | 首次在单细胞水平上系统阐明了TDP2通过抑制M1巨噬细胞极化和树突状细胞成熟、富集EMT相关通路来驱动免疫逃逸和转移的机制 | 研究主要基于单细胞测序和通路分析，缺乏体内外功能实验的直接验证，且临床样本量未明确说明 | 探究TDP2在前列腺癌肿瘤微环境调控和疾病进展中的作用机制 | 前列腺癌患者样本中的上皮细胞、髓系细胞、巨噬细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1035 | 2026-01-07 |
A non-invasive urinary diagnostic signature for diabetic kidney disease revealed by machine learning and single-cell analysis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0340096
PMID:41481634
|
研究论文 | 本研究通过整合尿液和肾脏单细胞测序数据与机器学习，开发了一种用于糖尿病肾病（DKD）的非侵入性诊断生物标志物面板 | 首次利用尿液来源细胞的单细胞分析结合机器学习，识别出与肾小管损伤相关的三基因生物标志物面板（PDK4、RHCG、FBP1），用于DKD的非侵入性诊断 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，需要进一步在独立临床队列中进行前瞻性验证以确认其诊断效能 | 开发糖尿病肾病的非侵入性诊断生物标志物 | 糖尿病肾病患者的尿液来源细胞和肾脏组织 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序，机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据，批量转录组数据 | 2089个尿液来源细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1036 | 2026-01-07 |
Roll with the punches: Fibroblast growth factor 10 alleviates pyroptosis of alveolar epithelial cells in different immune niches
2026-Jan, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70569
PMID:41482636
|
研究论文 | 本研究揭示了成纤维细胞生长因子10（FGF10）通过抑制AMPK-RIPK1/caspase-8/caspase-3/GSDME介导的细胞焦亡，减轻急性肺损伤的机制 | 首次阐明FGF10通过调节ATP水平和AMPK活性，抑制不同免疫细胞引发的肺泡上皮细胞焦亡，为ARDS提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养系统，临床样本量有限，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探究FGF10在急性呼吸窘迫综合征（ARDS）中的临床意义及其减轻肺泡上皮细胞焦亡的分子机制 | ARDS患者血清样本、LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型、肺泡上皮细胞、巨噬细胞、中性粒细胞 | 单细胞组学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | ARDS患者血清样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1037 | 2026-01-07 |
Integrated Network Pharmacology, Single-Cell Transcriptomics Unveil the Mechanistic Role of Morusin in Aortic Dissection
2026-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70971
PMID:41482800
|
研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、单细胞转录组学和实验验证，揭示了桑根酮在主动脉夹层中的多靶点、多通路作用机制 | 首次结合网络药理学、单细胞转录组学及体内外实验，系统阐明桑根酮通过靶向IL-17、HIF-1和MAPK等信号通路，在细胞类型特异性水平上缓解主动脉夹层进展 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验，尚未进行临床验证；单细胞转录组分析可能受样本量和技术限制 | 阐明桑根酮缓解主动脉夹层进展的多靶点、多通路药理机制 | 桑根酮的药理靶点、主动脉夹层相关基因、血管平滑肌细胞、BAPN诱导的主动脉夹层小鼠模型 | 计算生物学 | 心血管疾病 | 网络药理学、单细胞转录组学、分子对接、体外细胞实验、体内动物模型 | NA | 转录组数据、蛋白质相互作用数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1038 | 2026-01-07 |
Pan-cancer analysis of RNA expression signatures associated with cancer tissue architecture
2026-Jan, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03233-9
PMID:41107552
|
研究论文 | 本研究通过非负矩阵分解方法分析了28种癌症类型的RNA表达数据，识别出七个与癌症组织结构相关的特征，揭示了其与癌症病理特征的关联 | 首次在泛癌水平上系统分析癌症组织结构相关的RNA表达特征，并识别出七个不同的CTA特征，包括普遍存在的纤维胶原相关特征和具有组织特异性的细胞间粘附特征 | 研究主要基于TCGA数据集，虽然使用了多种验证方法，但仍需更多独立队列和实验验证来确认发现的普适性 | 探究癌症组织结构在泛癌水平上的RNA表达特征及其与癌症病理特征的关系 | 28种癌症类型的肿瘤组织样本 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 非负矩阵分解，空间转录组学，体内外模型实验 | 非负矩阵分解 | RNA表达数据 | 来自28种癌症类型的多个样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1039 | 2026-01-06 |
Bulk and Single-Cell Transcriptomics Reveal the Role of Inflammatory Response-Related Genes in Cerebral Ischemia-Reperfusion Injury
2026-Jan-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503423R
PMID:41460635
|
研究论文 | 本研究整合单细胞和批量转录组学数据，揭示了炎症反应相关基因在脑缺血再灌注损伤中的关键作用 | 首次整合单细胞和批量转录组学数据，系统鉴定出四个关键的炎症反应相关基因，并发现小胶质细胞在CIRI中可分为七个功能异质性亚群 | 需要前瞻性临床研究和功能实验进一步验证 | 鉴定脑缺血再灌注损伤中的诊断和治疗性炎症反应相关基因 | 大鼠/小鼠脑缺血再灌注损伤模型 | 生物信息学 | 脑缺血再灌注损伤 | RNA-seq | LASSO回归, 共识聚类, Seurat, Monocle2 | 基因表达谱 | 来自GEO数据库的多个数据集（GSE97537, GSE61616, GSE137482, GSE227651） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1040 | 2026-01-06 |
Multi-Omic Profiling of T Cell-Mediated Rejection After Kidney Transplantation Reveals B Cell Receptor Repertoire Expansion and Its Prognostic Relevance
2026-Jan-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502448RR
PMID:41467897
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肾移植后T细胞介导排斥反应中B细胞受体库的扩增及其预后相关性 | 首次描绘了TCMR中BCR库的景观，识别了MEI1作为BCR相关关键基因，并发现浸润浆细胞是BCR的主要持有者，可作为独立的预后风险因素 | NA | 探索肾移植后T细胞介导排斥反应中B细胞受体库的免疫景观，以识别新的治疗靶点 | 肾移植患者的肾同种异体移植物，特别是T细胞介导排斥反应样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫荧光 | TRUST4算法 | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 细胞系数据, 图像数据 | 三个独立的肾移植队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |