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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-07-13 |
Integrative single-cell transcriptomics and proteomics reveal an immunometabolic framework for MSC-exosome-mediated remodeling of expanded NK cells
2026-01-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag049
PMID:42008150
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和蛋白质组学整合分析,揭示间充质干细胞外泌体对扩增NK细胞功能重塑的免疫代谢调控机制 | 首次将单细胞转录组学与蛋白质组学结合,系统解析MSC-Exos对NK细胞代谢与免疫功能的多维度调控,并提出基于FcγR/CD16信号的外泌体作用假说 | 因果关系验证尚不充分,需进一步机制研究确认 | 评估MSC-Exos对人NK细胞体外扩增过程中功能状态的影响及其分子机制 | 人自然杀伤细胞(NK细胞)及间充质干细胞来源的外泌体 | 单细胞组学 | 肿瘤免疫、衰老免疫监视 | 单细胞转录组测序、蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | 体外扩增的人NK细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 82 | 2026-07-13 |
Inhibiting Nampt signaling promotes M2 macrophage polarization to enhance bone regeneration in periodontitis
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1768560
PMID:41969528
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研究论文 | 研究通过抑制Nampt信号促进M2型巨噬细胞极化,增强牙周炎骨再生 | 首次揭示NAMPT信号在牙周炎巨噬细胞极化中的作用,并证实局部注射FK866通过诱导M2极化促进骨再生 | NA | 阐明NAMPT信号在巨噬细胞极化中的功能及其对牙周骨再生的影响 | 牙周炎组织中的巨噬细胞、小鼠RAW264.7巨噬细胞、MC3T3-E1成骨细胞、结扎诱导的大鼠牙周炎模型 | NA | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、共培养、显微CT、组织学染色 | NA | 基因表达数据、图像 | 牙周炎组织样本、小鼠细胞系、大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2026-07-13 |
Malignant triton tumor with thoracic region as the initial presentation: a case report
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1764543
PMID:41971419
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病例报告 | 报道一例以胸痛为首发表现的罕见恶性Triton肿瘤,并综述其临床特征和治疗策略 | 首次将单细胞RNA测序应用于恶性Triton肿瘤,结合CopyKAT算法区分恶性与非恶性细胞,揭示肿瘤微环境的异质性 | 病例报告的代表性有限,单细胞测序的应用仍处于初步探索阶段,结论需要更大规模研究验证 | 总结恶性Triton肿瘤的临床表现和治疗策略,并探索单细胞RNA测序在揭示肿瘤分子特征中的作用 | 一名23岁女性恶性Triton肿瘤患者,伴有神经纤维瘤病1型病史 | 机器学 | 神经纤维瘤病1型相关恶性Triton肿瘤 | 单细胞RNA测序 | CopyKAT算法 | 单细胞转录组数据 | 1例患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2026-07-13 |
Ovarian tissue quality assessment and fertility preservation strategies enabled by multi-omics and artificial intelligence: current applications and clinical perspectives
2026, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2026.1789252
PMID:41971663
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综述 | 本文综述多组学和人工智能在卵巢组织质量评估和生育力保存策略中的应用及其临床前景 | 首次系统整合多组学(如转录组学、单细胞测序、蛋白质组学和空间转录组学)与人工智能技术,提出基于分子图谱和智能预测的个性化卵巢组织评估与移植决策框架 | 当前多组学和AI技术仍处于研究阶段,缺乏大规模临床验证,且整合多模态数据的标准化流程尚未建立 | 探讨多组学和人工智能在卵巢组织质量评估和生育力保存中的应用潜力 | 卵巢组织冷冻保存相关的组织质量评估、生育力保存策略及临床决策 | 数字病理学, 机器学习 | 卵巢早衰, 癌症 | 转录组学、单细胞测序、蛋白质组学、空间转录组学 | NA | 图像、文本、多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2026-07-13 |
Immune Cell-Mediated Retinoblastoma Development: Genetic and Molecular Mechanisms
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/6303747
PMID:41971766
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序探究免疫细胞介导的视网膜母细胞瘤发生机制 | 首次利用双样本孟德尔随机化分析结合单细胞RNA测序数据,系统揭示了28种免疫细胞与RB1基因的关联,并发现EZH2、UBLCP1和HKDC1基因在免疫细胞参与RB过程中的潜在分子机制 | 基于GWAS汇总统计数据的分析可能受限于数据来源和样本大小,单细胞RNA测序数据的细胞类型覆盖及因果关系推断需进一步验证 | 阐明免疫细胞通过RB1基因影响视网膜母细胞瘤发生的遗传和分子机制 | 视网膜母细胞瘤组织中的免疫细胞及RB1基因相关变异 | 机器学习 | 视网膜母细胞瘤 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 基于已发表的GWAS汇总统计数据,具体样本量未说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 86 | 2026-07-13 |
Integrative multi-omics dissection identifies ACO2, KLF5, and IMP4 as central regulators of the mitochondrial-immune axis in ulcerative colitis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1746810
PMID:41972123
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研究论文 | 通过整合多组学分析,识别ACO2、KLF5和IMP4为溃疡性结肠炎中线粒体-免疫轴的核心调控因子 | 首次系统鉴定ACO2、KLF5和IMP4作为连接线粒体代谢与免疫调控的关键基因,并从遗传、转录组和单细胞水平进行多重验证 | 未对AGPS在不同UC数据集中的转录差异进行功能验证,且部分发现仅基于公共数据库和动物模型,需进一步在临床样本中验证 | 探索溃疡性结肠炎中代谢-免疫调控的关键基因及其作用机制 | 溃疡性结肠炎患者及DSS诱导的小鼠结肠炎模型 | 机器学习和生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | GWAS、eQTL、转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因型数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | UC病例对照共计394,626人(GWAS),215例病例和134例对照(转录组),18例病例和12例对照(单细胞RNA测序) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 87 | 2026-07-13 |
The construction of CD8+ T cell-associated molecular subtypes in esophageal squamous cell carcinoma reveals tumor heterogeneity, tumor microenvironment, and immunotherapy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1775837
PMID:41972154
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研究论文 | 基于CD8+ T细胞分化基因表达谱构建食管鳞状细胞癌分子亚型,揭示肿瘤异质性、肿瘤微环境及免疫治疗反应 | 首次通过单细胞测序分析CD8+ T细胞分化动态,结合非负矩阵分解构建三种新型分子亚型,并利用孟德尔随机化分析发现RHOB基因作为食管鳞癌新生物标志物 | 未提及具体局限性 | 构建CD8+ T细胞相关分子亚型以预测食管鳞癌患者预后和治疗效果 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤样本及CD8+ T细胞 | 机器学习和生物信息学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | GSE53625队列及多个批量RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | Seurat包进行细胞聚类可视化,Harmony包去除批次效应,Monocle2包进行伪时间分析 |
| 88 | 2026-07-13 |
Correction: Mast cell marker gene signature: prognosis and immunotherapy response prediction in lung adenocarcinoma through integrated scRNA-seq and bulk RNA-seq
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1827500
PMID:41972190
|
更正 | 对一篇关于肥大细胞标记基因特征在肺腺癌预后和免疫治疗反应预测中作用的研究进行更正 | NA | NA | 更正已发表文章的错误 | NA | NA | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2026-07-13 |
IL21 is predominantly produced by a CXCL13 associated CD4+ T cell subset and shapes the immune microenvironment in colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1865519
PMID:42433376
|
研究论文 | 本研究揭示IL21在结直肠癌中主要由CXCL13相关CD4+ T细胞亚群产生,并塑造免疫微环境 | 首次明确结直肠癌中IL21的主要细胞来源为CXCL13+CD4+ T细胞,并鉴定候选关键转录因子(STAT1、IRF9等),揭示外源IL21诱导的转录重塑特征 | 直接机制验证仍有待开展 | 阐明IL21在结直肠癌中的细胞来源、调控程序及功能意义 | 结直肠癌肿瘤浸润T细胞、结直肠癌组织微阵列、AOM/DSS诱导的小鼠结直肠癌肿瘤组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光染色, SCENIC分析, 批量RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 全转录组测序数据, 免疫荧光图像 | 公开单细胞RNA测序数据集(具体数量未说明)、抗PD-1新辅助治疗单细胞队列(具体数量未说明)、结直肠癌组织微阵列(具体数量未说明)、AOM/DSS诱导小鼠模型(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2026-07-13 |
From islet to blood: macrophage remodeling signatures for diagnosis and risk stratification in type 1 diabetes
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1832672
PMID:42433374
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2026-07-12 |
A single-cell immune atlas of primary and secondary lymphoid organs in pigs
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1704257
PMID:41859083
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建猪初级和次级淋巴器官的免疫细胞图谱 | 首次创建涵盖猪多种淋巴组织(骨髓、胸腺、淋巴结和脾脏)的单细胞免疫图谱,识别出新的胸腺细胞群体,并揭示猪与人之间保守的先天淋巴样细胞亚群 | 未明确提及局限性,但可能包括样本量有限或仅覆盖关键淋巴器官 | 利用单细胞RNA测序构建猪淋巴器官免疫细胞图谱,以促进农业和生物医学研究 | 猪的初级淋巴器官(骨髓、胸腺)和次级淋巴器官(淋巴结、脾脏)中的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 多个猪淋巴组织样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 92 | 2026-07-12 |
Integrated spatial transcriptomics and single-cell RNA sequencing reveal Lars2-mediated spatiotemporal dynamics of myocardial remodeling in a mouse model of transverse aortic constriction
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1701776
PMID:41859105
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研究论文 | 整合空间转录组学和单细胞RNA测序,揭示小鼠主动脉缩窄模型中Lars2介导的心肌重塑时空动态变化 | 首次利用空间转录组学与单细胞RNA测序的整合分析,高分辨率解析压力超负荷诱导心肌肥厚过程中细胞组成和基因表达的时空动态变化,并鉴定Lars2为疾病进展相关基因 | NA | 通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序,全面表征压力超负荷诱导心肌重塑的细胞与空间动态变化 | 小鼠心脏组织,取自主动脉缩窄模型的不同疾病阶段(TAC-2w、TAC-4w、TAC-6w) | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据(空间转录组和单细胞RNA测序数据) | 不同疾病阶段的小鼠心脏组织样本(TAC-2w、TAC-4w、TAC-6w) | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2026-07-12 |
Quantitative profiling of lifespan-dependent cell-cell communication potential reveals dynamic ligand-receptor network shifts across mouse tissues
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0345045
PMID:41860844
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序数据推断小鼠四个器官(肝脏、肺、心脏和肾脏)中跨生命周期的细胞间通信动态变化,并开发了一种量化框架来捕捉配体-受体相互作用的变化 | 开发了Shrink and Expand (SE) 评分来量化两个生物学状态之间推断的配体-受体相互作用集的定向变化,并构建了跨器官和生命周期的配体-受体对变化数据集 | 该研究基于转录组推断而非蛋白质水平验证,可能存在假阳性或假阴性结果,且未涵盖所有潜在细胞类型 | 研究细胞间通信随年龄变化的动态模式,并开发可量化的比较方法 | 小鼠的肝脏、肺、心脏和肾脏组织 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠四个器官(肝脏、肺、心脏和肾脏),涵盖产后发育、成年和衰老三个阶段 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 94 | 2026-07-10 |
Single-Cell Transcriptomics and Integrated Bioinformatic Analysis Reveal Critical Biomarkers and Immune Infiltration Characteristics in Osteoarthritis
2026, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/genr/1174568
PMID:41502501
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研究论文 | 使用单细胞转录组学和整合生物信息学分析揭示骨关节炎的关键生物标志物和免疫浸润特征 | 首次通过单细胞RNA测序与整合生物信息学分析结合,识别出骨关节炎中八个不同的软骨细胞亚群,并发现NR4A2、BMP1和AVPR1A等基因具有强诊断潜力,且通过分子对接筛选出贝沙罗汀作为潜在治疗候选药物 | 基于公开数据集,样本来源有限,未进行实验验证;分子对接结果仅提供初步相互作用证据,需进一步体内外实验确认 | 探究骨关节炎的细胞异质性和分子机制,识别生物标志物和治疗靶点 | 骨关节炎患者和正常个体的软骨样本 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 骨关节炎和正常个体软骨样本(数据集GSE220243和GSE114007) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2026-07-10 |
JGR-NMF: joint graph-regularized non-negative matrix factorization for spatial domain identification
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20585
PMID:41695707
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研究论文 | 提出联合图正则化非负矩阵分解(JGR-NMF)用于空间域识别,提升准确性和鲁棒性 | 引入自适应邻域图构建策略,结合kNN图与空间邻接矩阵的联合图正则化框架 | 未明确说明局限性 | 提升空间转录组学数据中空间域识别的准确性和鲁棒性 | 两个乳腺癌数据集、一个小鼠肾脏数据集和一个小鼠胚胎数据集 | 机器学习 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 非负矩阵分解(NMF) | 空间转录组数据 | 四个数据集(两个乳腺癌、一个小鼠肾脏、一个小鼠胚胎) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 96 | 2026-07-10 |
The Evolution of Gene Sequencing Technologies: Unveiling Genetic Architecture of Nonsyndromic Orofacial Clefts
2026, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/genr/3754674
PMID:42017915
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综述 | 综述了随着测序技术从Sanger测序到下一代测序及第三代测序,再到表观基因组学、单细胞测序、空间组学和多组学整合的发展,非综合征性口面裂易感基因和位点识别的关键发现 | 系统梳理了测序技术演进如何推动非综合征性口面裂遗传学研究从低通量向高通量转变,从常见经典易感基因到新生突变、罕见变异和复杂基因组结构变异的发现,以及细胞分化轨迹的阐明 | 未来需持续推动测序技术的方法创新、优化研究设计并探索整合多组学方法,以完善基于种族和亚型的遗传数据库 | 总结测序技术发展不同阶段在识别非综合征性口面裂易感基因和位点方面的关键发现 | 非综合征性口面裂 | 自然语言处理 | 儿科疾病 | Sanger测序, 二代测序, 三代测序, 表观基因组学, 单细胞测序, 空间组学, 多组学整合 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2026-07-10 |
Identification and Validation of Mitophagy-Related Biomarkers in Colorectal Cancer: An Integrated Analysis of Single-Cell Transcriptome and Mendelian Randomization
2026, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/genr/5579542
PMID:42108926
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组和孟德尔随机化分析,鉴定并验证了结直肠癌中线粒体自噬相关生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法,确定了SGCE、ATP8B2和RANGAP1三个具有遗传因果关联的线粒体自噬相关生物标志物 | 未详细说明样本量和验证队列的多样性,可能限制结果的普适性 | 探索线粒体自噬在结直肠癌中的作用并识别相关的生物标志物 | 结直肠癌的基因表达数据和线粒体自噬相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,孟德尔随机化,机器学习,定量PCR | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2026-07-10 |
Comprehensive Analysis of Macrophage Dynamics, CCBE1, and Their Implications in Colorectal Cancer Microenvironment: Insights Into Tumor Progression and Therapeutic Opportunities
2026, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/genr/2678696
PMID:42381502
|
研究论文 | 综合分析结直肠癌微环境中巨噬细胞动态变化、CCBE1及其对肿瘤进展和治疗机会的影响 | 首次揭示CCBE1作为独立预后风险因子,通过促进M2巨噬细胞极化增强肿瘤增殖、迁移和侵袭,为结直肠癌治疗提供新靶点 | 研究主要基于公开数据集和体外实验,缺乏体内验证和更大规模临床样本确认 | 阐明M2巨噬细胞在结直肠癌中的具体作用及调控分子,探索CCBE1的预后价值和治疗潜力 | 结直肠癌细胞系及肿瘤微环境中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 转录组数据 | 4个结直肠癌公开数据集(EMTAB8107、GSE139555、GSE146771、GSE166555) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2026-07-10 |
HRD-Driven Reprogramming of Macrophage Function and Spatial Architecture in High-Grade Serous Ovarian Cancer
2026, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/genr/7364793
PMID:42106020
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了高浆液性卵巢癌中HRD驱动的巨噬细胞功能重编程及空间结构变化 | 首次系统描述了不同HRD亚型(FBI、HRD-Del、HRD-Dup)中巨噬细胞的转录组特征和空间分布差异,并关联了患者生存预后 | NA | 探究同源重组缺陷对高浆液性卵巢癌免疫微环境中巨噬细胞的影响 | 高浆液性卵巢癌患者的巨噬细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 166,895个巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 100 | 2026-07-10 |
Single-Cell and Multiomics Characterization of p21 in Cancer Progression and Therapeutic Sensitivity
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/5598948
PMID:42415742
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研究论文 | 通过单细胞和多组学分析揭示p21在癌症进展和治疗敏感性中的作用 | 在单细胞分辨率下系统描绘p21在肿瘤微环境中的功能,揭示其作为细胞周期抑制剂之外的免疫调节和治疗敏感性相关表型 | 功能发现需要进一步的临床验证 | 研究CDKN1A(编码p21)在肿瘤微环境中的功能,特别是其在单细胞分辨率下的表达模式和功能 | p21(CDKN1A)在多种癌症类型中的表达和功能 | 生物信息学 | 癌症 | NGS, RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 公共数据集中的多种癌症样本 | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | 公共数据集中使用的单细胞RNA-seq平台 |