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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-11-28 |
Perfluorooctanoic acid disrupts splenic immunity and antiviral responses in the LCMV model: Insights from single-cell transcriptomics
2026-Jan-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2025.127367
PMID:41224070
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了全氟辛酸对脾脏免疫功能和抗病毒反应的破坏机制 | 首次在LCMV病毒感染模型中系统阐明PFOA通过细胞类型特异性机制导致免疫抑制 | 研究仅使用雌性C57BL/6J小鼠,样本量相对有限 | 探究全氟辛酸对免疫系统的影响及其在病毒感染中的细胞特异性机制 | 雌性C57BL/6J小鼠的脾脏免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 对照组5522个细胞 vs 高剂量组4741个细胞,共13个注释细胞簇 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 82 | 2025-11-28 |
Unraveling Diabetes Mechanisms: A Computational scRNA-Seq Approach to Inflammation and Diabetes
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-03398-7_50
PMID:41273592
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研究论文 | 本研究通过计算分析单细胞RNA测序数据探索营养、炎症与糖尿病之间的分子机制关系 | 采用单细胞RNA测序数据和先进计算方法揭示饮食条件如何影响免疫反应并促进糖尿病发展的分子通路 | NA | 探索炎症与糖尿病之间的分子机制,识别关键基因表达谱和分子通路 | 单细胞RNA测序数据集GSE161872中的基因表达数据 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 计算方法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2025-11-24 |
Minimum Redundancy Maximum Relevance Feature Selection-Application on Single-Cell RNA Sequencing Dataset
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-03398-7_22
PMID:41273564
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研究论文 | 本研究评估了最小冗余最大相关性特征选择方法在帕金森病单细胞RNA测序数据集上的应用效果 | 将mRMR特征选择方法应用于帕金森病单细胞RNA测序数据,并比较了有无特征选择对分类算法性能的影响 | 仅使用了单一疾病数据集进行评估,缺乏在其他疾病或数据集上的验证 | 评估特征选择方法在单细胞RNA测序数据分析中的效果 | 帕金森病患者的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | mRMR, 分类算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2025-11-24 |
Ubiquitous and Brain Cell-Type-Specific Promoters and Enhancers in Lentiviral Vectors
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4807-0_7
PMID:41273642
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综述 | 本章讨论慢病毒载体中组成型和脑细胞类型特异性启动子及增强子的开发与应用,以实现精确高效的基因递送 | 利用单细胞转录组学和ATAC测序技术鉴定新型增强子区域,开发更精细靶向的慢病毒载体 | NA | 提高不同脑细胞群体中转基因表达的精确性和效率 | 兴奋性和抑制性神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞等脑细胞群体 | 基因治疗 | 神经系统疾病 | 单细胞转录组学, ATAC测序 | NA | 基因组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 85 | 2025-11-23 |
Residual disease in NPM1-mutated acute myeloid leukemia
2026-Jan-15, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2025.120586
PMID:40912477
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综述 | 本文综述了NPM1突变急性髓系白血病中微小残留病监测的技术进展与挑战 | 系统评估了qPCR、NGS、ddPCR等传统技术与CRISPR-Cas9、单细胞测序、人工智能等新兴技术在MRD监测中的综合应用 | 人工智能工具临床转化有限,受限于数据质量、算法偏见、基础设施和监管框架缺失等问题 | 评估NPM1突变AML中MRD监测技术的临床应用价值与发展前景 | NPM1突变急性髓系白血病患者的微小残留病监测 | 自然语言处理 | 急性髓系白血病 | 定量PCR、下一代测序、微滴数字PCR、CRISPR-Cas9、单细胞测序 | 人工智能、机器学习 | 分子检测数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2025-11-23 |
Cutting-edge nanobiosensors: Revolutionizing cancer diagnosis and enabling precision medicine
2026-Jan-15, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2025.120613
PMID:40962167
|
综述 | 本文综述了结合纳米技术与人工智能的尖端纳米生物传感器在癌症诊断和精准医疗中的革命性应用 | 整合纳米技术与人工智能提升生物传感器性能,开发多功能平台融合分子识别、成像和治疗功能,拓展RNA靶向检测新领域 | 存在规模化制造、长期稳定性、监管合规和环境可持续性方面的重大挑战 | 推动癌症早期检测、实时疾病监测和精准医疗发展 | 循环肿瘤DNA(ctDNA)、循环肿瘤细胞(CTCs)和微RNA(miRNAs)等关键生物标志物 | 生物医学工程 | 癌症 | 纳米生物传感技术、单细胞测序、表观转录组检测 | NA | 生物分子数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 87 | 2025-11-21 |
Single-cell transcriptome profiling reveals altered neural crest cell dynamics and novel biomarkers in EDNRB mutant mice with Hirschsprung's disease phenotype
2026-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101765
PMID:41262530
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2025-11-23 |
Single-Cell Spatial Transcriptomic of Sjögren's Disease Salivary Glands
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4997-8_14
PMID:41269557
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研究论文 | 本章探讨利用10X Genomics的Visium HD空间转录组技术分析干燥综合征患者唾液腺组织的细胞和分子景观 | 首次应用高分辨率空间转录组技术研究人类干燥综合征唾液腺组织,保留组织结构的同时解析免疫细胞与结构细胞的相互作用 | 研究受限于小唾液腺活检组织的有限样本量 | 解析干燥综合征炎症环境的异质性,探索疾病机制和治疗机会 | 福尔马林固定石蜡包埋的人类小唾液腺组织 | 空间转录组学 | 干燥综合征 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10X Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD空间转录组协议 |
| 89 | 2025-11-22 |
Epigenomics-guided precision oncology: Chromatin variants in prostate tumor evolution
2026-Jan-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.35327
PMID:39853587
|
综述 | 探讨表观基因组异质性在前列腺癌中的作用,重点关注染色质变异如何促进肿瘤进化和治疗耐药性 | 提出染色质变异作为表观基因组异质性的基本单位,强调其在细胞可塑性和治疗耐药性中的关键作用 | NA | 支持精准肿瘤学新时代,利用表观基因组学见解改善前列腺癌患者预后 | 前列腺癌及其染色质变异 | 表观基因组学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、液体活检表观基因组分析 | NA | 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 90 | 2025-11-22 |
Mechanisms underlying the therapeutic effects of Amygdalin in treating Cervical Cancer based on multi-omics analysis
2026-Jan-15, Journal of pharmaceutical and biomedical analysis
IF:3.1Q2
DOI:10.1016/j.jpba.2025.117232
PMID:41202397
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析系统验证了苦杏仁苷通过靶向CA9和HK2调控多通路发挥抗宫颈癌作用的机制 | 首次结合WGCNA、PPI网络、单细胞RNA测序、分子对接和分子动力学模拟等多种方法系统揭示苦杏仁苷抗宫颈癌的分子机制 | 研究主要基于细胞实验和计算分析,缺乏动物模型验证 | 探究苦杏仁苷治疗宫颈癌的作用机制 | 宫颈癌HeLa和SiHa细胞系 | 多组学分析 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,RNA-seq转录组学,分子对接,分子动力学模拟,酶活性检测 | WGCNA,PPI网络,MCODE算法 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据,转录组数据 | 宫颈癌组织样本和HeLa、SiHa细胞系 | NA | 单细胞RNA测序,RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2025-11-21 |
SRSF1 is essential for pancreatic β-cell proliferation and the maintenance of glucose homeostasis in mice
2026-Jan, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2025.156421
PMID:41138848
|
研究论文 | 本研究揭示了SRSF1通过MYC介导的通路对胰腺β细胞增殖和葡萄糖稳态维持的关键作用 | 首次阐明SRSF1在β细胞增殖中的核心调控功能及其通过MYC表达调控的作用机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类细胞中验证 | 探究SRSF1在胰腺β细胞增殖和葡萄糖调控中的作用机制 | 胰腺β细胞特异性SRSF1敲除小鼠及其胰岛组织 | 分子生物学 | 糖尿病 | RNA-seq, scRNA-seq, 免疫染色, 葡萄糖耐量测试 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 组织切片图像, 生理指标数据 | 不同年龄段的基因敲除和对照小鼠胰岛组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2025-11-21 |
Decoding bioprocesses with transcriptomics: current status and future potential
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108736
PMID:41092969
|
综述 | 本文总结了转录组学在生物过程工程中的应用现状并展望其未来潜力 | 系统梳理了从RT-qPCR到RNA-seq等转录组学技术在生物过程工程中的应用,并前瞻性地提出单细胞分析(scRNA-seq)和转录历史记录(Record-Seq)技术将推动对种群时空多样性的理解 | NA | 总结转录组学技术在生物过程工程领域的应用现状并展望未来发展 | 原核和真核细胞系统在生物过程中的基因表达谱 | 生物信息学 | NA | RT-qPCR, 微阵列, RNA-seq, scRNA-seq, Record-Seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 93 | 2025-07-30 |
Leveraging single-cell spatial transcriptomics and connectomics to resolve brain circuit function in psychiatry
2026-Jan, Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology
IF:6.6Q1
DOI:10.1038/s41386-025-02178-0
PMID:40721521
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2025-11-16 |
Periostin-positive stellate cells associated with perineural invasion in pancreatic adenocarcinoma
2026-Jan-01, Molecular and cellular endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1016/j.mce.2025.112678
PMID:41106801
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了胰腺星状细胞在胰腺癌神经侵袭中的关键作用 | 首次发现高表达Periostin的胰腺星状细胞在神经侵袭阳性样本中富集,并揭示了ANXA1-SPP1/PLAU信号轴在促进神经侵袭中的协调作用 | 样本量相对有限(24个活检标本),需要进一步功能验证实验确认机制 | 阐明胰腺导管腺癌中神经侵袭的细胞和分子机制 | 胰腺导管腺癌患者活检组织中的细胞群体 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 24个PDAC活检标本,约60,000个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 95 | 2025-11-15 |
Introduction to Oral Immunity
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-03176-1_1
PMID:41225090
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综述 | 本章全面概述口腔免疫系统的组成与功能,强调其在维持共生微生物耐受与病原体防御中的双重作用 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学等新技术在口腔免疫研究中的应用前景 | NA | 阐明口腔免疫机制在健康与炎症状态下的作用及其与全身免疫的关联 | 口腔免疫系统组分(上皮屏障、唾液抗菌因子、免疫细胞)及共生微生物 | NA | 口腔炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 宏基因组学, 多组学整合 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 96 | 2025-11-15 |
Inflammatory Mediators in Peri-Implantitis: From Pathophysiology to Therapeutic Targets
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-03176-1_21
PMID:41225110
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综述 | 本文系统探讨种植体周围炎的炎症介质特征及其从病理机制到治疗靶点的转化价值 | 整合基因多态性、蛋白质组学和单细胞RNA测序技术揭示种植体周围炎特有的细胞互作网络与炎症通路 | 未明确说明纳入研究的样本规模与实验方法的具体局限性 | 阐明种植体周围炎的发病机制并探索精准医疗策略 | 种植体周围炎相关的炎症介质与分子标志物 | 数字病理学 | 牙科种植体疾病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 基因多态性分析 | NA | 唾液样本, 种植体周沟液, 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2025-11-14 |
Computational identification of FOXP3-associated spatial prognostic markers in HCC via digital pathology
2026-Jan, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2025.109119
PMID:41135296
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研究论文 | 本研究通过计算分析数字病理切片,识别了肝细胞癌中与FOXP3相关的空间预后标志物 | 首次在点水平分辨率上计算识别空间差异基因,提供了一种经济高效且可扩展的空间生物标志物发现方法 | 样本量有限且统计功效可能不足,存在观察到的种族差异 | 识别肝细胞癌中具有预后意义的空间标志物 | TCGA-LIHC队列的肝细胞癌患者数字病理切片 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学分析,数字病理分析 | 计算流程,空间基因推断 | 数字病理切片,基因表达数据 | TCGA-LIHC队列样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 98 | 2025-11-14 |
Investigating the Shared Genetic Architecture of 3 Age-Related Ocular Disorders
2026-Jan, Ophthalmology science
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.xops.2025.100942
PMID:41211298
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研究论文 | 本研究通过遗传关联分析探索年龄相关性黄斑变性、白内障和原发性开角型青光眼三种年龄相关性眼病的共享遗传结构、因果关系及细胞类型特异性表达模式 | 首次综合运用跨性状荟萃分析、孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术系统揭示三种年龄相关性眼病间的遗传关联和分子机制 | 依赖于公开可用的GWAS数据库数据,可能存在样本选择偏差 | 探索年龄相关性眼病的共享遗传结构和分子机制,为靶向治疗提供依据 | 年龄相关性黄斑变性(AMD)、白内障和原发性开角型青光眼(POAG)三种年龄相关性眼病 | 遗传学 | 眼科疾病 | 全基因组关联研究(GWAS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化分析 | NA | 遗传数据、基因表达数据 | 来自公开GWAS数据库的三种眼病相关数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2025-11-07 |
Transcriptomics- and 3D imaging-based characterization of the lymphatic vasculature in human skin
2026-Jan-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20242353
PMID:41186588
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和三维成像技术对人类皮肤淋巴管系统进行表征研究 | 首次在人类皮肤中发现CD24作为淋巴瓣膜上瓣叶特异性标志物,并揭示了人类皮肤淋巴网络与鼠类的关键差异 | 研究主要聚焦于人类皮肤组织,未涉及其他组织类型的淋巴管比较 | 深入理解人类皮肤淋巴管的结构特征和功能 | 人类皮肤和皮下脂肪组织中的淋巴内皮细胞 | 单细胞生物学 | 淋巴系统疾病 | 单细胞RNA测序,三维成像 | NA | 基因表达数据,三维图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 100 | 2025-11-03 |
Bioinformatics Analysis of Transcriptomic Data (Bulk and scRNA-Seq) for Immuno-Oncology
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4734-9_18
PMID:41028272
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综述 | 本章提供了免疫学研究中使用生物信息学工具分析转录组数据的全面指南 | 系统整合了批量RNA测序和单细胞RNA测序在免疫肿瘤学中的生物信息学分析方法 | NA | 促进免疫学数据分析和解读,帮助理解免疫反应机制 | 免疫系统动态、免疫细胞异质性、基因表达模式、免疫受体库 | 生物信息学 | 肿瘤 | 下一代测序(NGS), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 质谱流式细胞术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |