单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202601] [清除筛选条件]
当前共找到 1426 篇文献,本页显示第 921 - 940 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
921 2026-01-23
Dysregulation of argininosuccinate synthase 1, phosphoenolpyruvate carboxykinase 1, and carbonyl reductase 3: Key arginine-proline metabolic mediators in mesangioproliferative glomerulopathies
2026-Jan, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究通过整合RNA测序和机器学习算法,鉴定了精氨酸-脯氨酸代谢通路中的关键基因ASS1、PCK1和CBR3,作为IgA肾病和狼疮性肾炎中系膜细胞增殖的核心调控因子,并验证了其诊断和治疗潜力 首次通过整合机器学习算法和单细胞RNA测序,系统性识别了精氨酸-脯氨酸代谢通路在系膜增殖性肾小球病中的关键调控基因,并建立了基于这些基因的诊断模型 研究主要基于转录组数据,功能验证多在细胞和小鼠模型中进行,缺乏大规模临床样本的直接验证 探究精氨酸-脯氨酸代谢通路在IgA肾病和狼疮性肾炎等系膜增殖性肾小球病中的调控机制,并识别关键诊断和治疗靶点 系膜细胞、小鼠模型(包括抗Thy1肾炎大鼠、BAFF转基因IgA肾病小鼠、MRL/lpr狼疮性肾炎小鼠)和人类系膜细胞 生物信息学 肾脏疾病 RNA测序、单细胞RNA测序、机器学习算法(LASSO和SVM-RFE) LASSO、SVM-RFE RNA测序数据 未明确指定样本数量,但涉及多个内部和外部数据集以及小鼠模型 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
922 2026-01-23
From chronic gastritis to gastric cancer: Mendelian randomisation and multi-omics interrogation of leukaemia inhibitory factor receptor (LIFR), hepatocyte growth factor (HGF), serine protease inhibitor E1 (SERPINE1) and interleukin-10 receptor subunit beta (IL10RB)
2026-Jan, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究结合孟德尔随机化与多组学分析,揭示了从慢性胃炎到胃癌进展过程中的关键炎症因子与分子机制 首次整合孟德尔随机化、多组学数据(转录组、蛋白质组、单细胞RNA测序)以及计算药物筛选,系统性地识别并验证了LIFR、HGF、SERPINE1和IL10RB在胃炎-胃癌转化中的核心作用,并提出了药物再利用策略 研究主要基于观察性数据和计算预测,虽然进行了实验验证,但具体的体内功能机制和临床转化效果仍需进一步研究 阐明驱动慢性胃炎进展为胃癌的特定炎症因子和分子机制,并探索潜在的治疗靶点 慢性胃炎和胃癌相关的基因组、转录组、蛋白质组数据以及患者样本 生物信息学与计算生物学 胃癌 孟德尔随机化、全基因组关联研究、转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序、定量逆转录PCR、Western印迹、免疫组织化学、基于结构的虚拟筛选、分子对接 NA 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、图像数据 来自癌症基因组图谱、基因表达综合数据库及独立队列的数据集,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
923 2026-01-23
Apoferritin-conjugated melanin nanoparticles rescue photoreceptor degeneration via dual iron chelation and ROS scavenging in dry AMD therapy
2026-Jan, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究开发了一种仿生纳米颗粒AFn-MNP,通过结合铁螯合和ROS清除能力,有效治疗干性年龄相关性黄斑变性模型中的光感受器退化 首次将载铁蛋白与黑色素纳米颗粒结合,构建了具有双重功能(铁螯合和抗氧化)的纳米治疗剂,并利用单细胞转录组分析揭示了光感受器铁死亡在疾病进展中的关键作用 研究主要基于NaIO诱导的动物模型,尚未在人类患者中进行验证;长期安全性和疗效有待进一步评估 开发一种针对干性年龄相关性黄斑变性的新型纳米疗法,通过同时调节铁稳态和氧化应激来治疗视网膜退行性疾病 视网膜组织、光感受器细胞、NaIO诱导的干性年龄相关性黄斑变性模型小鼠 数字病理学 年龄相关性黄斑变性 单细胞转录组测序 NA 转录组数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
924 2026-01-23
Cancer-cell-secreted DDAH1 induces TGF-β1/Smad3 signaling pathway to promote fibrosis and aging in lung
2026-Jan, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本文揭示了癌细胞分泌的DDAH1蛋白通过诱导瓜氨酸积累,促进肺纤维化和衰老的机制 首次发现癌细胞分泌的DDAH1蛋白通过调控瓜氨酸水平激活TGF-β1/Smad3信号通路,促进肺纤维化和衰老 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;DDAH1抑制剂的具体临床应用潜力尚未完全阐明 探究癌症背景下肺衰老的分子机制及治疗靶点 癌细胞、肺成纤维细胞、遗传敲除小鼠 分子生物学 肺癌 单细胞测序、遗传敲除 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
925 2026-01-23
Increased mROS Generation Associates With Cardiovascular Risk in BioHEART-CT PBMCs
2026-Jan, Clinical and translational science
研究论文 本研究探讨了外周血单个核细胞中线粒体活性氧产生与冠状动脉疾病之间的关联 首次结合MitoSOX流式细胞术和单细胞RNA测序技术,在BioHEART-CT队列中评估PBMC mROS作为CAD生物标志物的潜力 样本量较小(40名参与者),亚组分析结果不一致且缺乏普遍性,横断面设计无法确定因果关系 探索PBMC中mROS水平与CAD状态及心血管风险因素之间的关联 40名BioHEART-CT研究参与者(有或无CT定义的CAD)的外周血单个核细胞 心血管疾病研究 冠状动脉疾病 MitoSOX流式细胞术,单细胞RNA测序 NA 流式细胞数据,单细胞RNA测序数据 40名参与者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
926 2026-01-23
A multimodal framework to identify molecular mechanisms driving patient group-associated morphology through the integration of spatial transcriptomics and whole slide imaging
2026, NPJ artificial intelligence
研究论文 提出一种整合空间转录组学和全切片成像的多模态AI框架,以识别与患者群体相关形态背后的分子机制 首次结合基础模型特征、多示例学习、无监督聚类和分子分析,在形态-分子机制-临床结局的完整轴向上提供可解释性见解 空间转录组数据可用性有限,方法在HER2+乳腺癌外的泛化能力未验证 识别驱动患者群体相关形态的分子机制,为精准医疗提供依据 HER2阳性乳腺癌组织 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学,全切片成像 基础模型,多示例学习 图像,转录组数据 未明确 NA 空间转录组学 NA NA
927 2026-01-23
Spatiotemporal Evolution of Malignant Hepatocyte Clones Unveils Immune Evasion Features and Therapeutic Vulnerabilities in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jan, Biotechnology journal IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学,揭示了肝细胞癌中恶性肝细胞克隆的时空演化、免疫逃逸特征及治疗脆弱性 识别了“Scissor细胞”(主要为肝细胞)作为潜在的恶性前体细胞,揭示了其获得免疫逃逸能力和不良预后的演化过程,并发现了驱动肝细胞恶性转化的关键信号通路(如MDK-SDC4和COL4A-SDC) NA 研究肝细胞癌的发生和进展过程中的多细胞生态系统及分子特征 肝细胞癌 数字病理学 肝癌 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
928 2026-01-22
Differential Hes1 activation defines neural stem cell lineage commitment and niche maintenance in embryonic and adult mouse cortex
2026-Jan-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学和条件敲除小鼠模型,揭示了Notch非依赖性表达的Hes1(NIHes1)神经干细胞在胚胎和成年小鼠皮层中的谱系承诺和微环境维持中的关键作用 首次将Hes1的差异激活模式与神经干细胞异质性联系起来,并定义了NIHes1 NSCs作为祖先前体细胞的功能独特性 研究主要基于小鼠模型,结果在人类或其他物种中的普适性尚需验证 探究Hes1差异激活如何定义神经干细胞谱系承诺和微环境维持 胚胎和成年小鼠皮层中的神经干细胞/祖细胞(NSCs/NPCs) 神经科学 NA 单细胞转录组学,条件敲除小鼠模型 Nestin-CreERT2;NIHes1条件敲除小鼠模型 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
929 2026-01-22
Decoding 'Wntch': the intertwined Wnt and Notch pathways in development and disease
2026-Jan-21, Open biology IF:4.5Q1
综述 本文综述了Wnt和Notch信号通路在发育和疾病中的相互作用,提出了'Wntch'信号概念 提出了'Wntch'信号概念,强调Wnt和Notch通路不是孤立线性途径,而是形成一个整合信号以确保发育和生理结果精确控制的连贯网络 作为一篇综述文章,未提出新的实验数据或模型,主要基于现有研究进行综合分析和讨论 探讨Wnt和Notch信号通路在发育和疾病中的直接交互作用及其功能整合 多细胞生物中的Wnt和Notch信号通路分子及其相互作用 NA NA 单细胞RNA测序、邻近标记 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
930 2026-01-22
EphrinB2 Regulates DPSC Pericyte-like Functions via the Focal Adhesion Pathway
2026-Jan-21, Journal of dental research IF:5.7Q1
研究论文 本研究揭示了EphrinB2通过Src/FAK/paxillin信号通路调控牙髓干细胞(DPSCs)周细胞样功能及其与内皮细胞(ECs)的相互作用 首次阐明EphB4/ephrinB2信号如何通过黏着斑通路调控DPSCs的周细胞生物学功能及其与ECs的相互作用 研究主要基于体外实验,体内功能验证和临床转化潜力仍需进一步探索 探究EphB4/ephrinB2信号通路对牙髓干细胞周细胞功能的调控机制 人牙髓干细胞(DPSCs)、内皮细胞(ECs)、人脑血管周细胞 干细胞生物学 牙髓疾病 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、慢病毒转导、3D纤维蛋白珠分析 NA 基因表达数据、图像数据 健康人牙髓组织 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
931 2026-01-22
Dissecting the Cell-Type-Specific Response to an Emerging Tobamovirus in Tomato Reveals Cultivar-Dependent Involvement of Brassinosteroid Signalling
2026-Jan-21, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了番茄对新兴烟草花叶病毒ToBRFV的细胞类型特异性响应,揭示了不同遗传背景番茄品种中油菜素内酯信号通路的差异参与 首次在单细胞分辨率下解析了番茄对ToBRFV的感染动态,并发现了油菜素内酯信号通路在品种依赖性抗性中的关键作用 研究仅针对两个番茄品种,可能无法代表所有遗传背景;单细胞测序数据仅来自叶片,未涵盖其他组织 探究植物病毒感染的细胞类型特异性响应机制,以及遗传背景如何影响这些响应 番茄植物及其对番茄褐色皱纹果病毒(ToBRFV)的感染响应 植物病理学与单细胞组学 植物病毒病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 两个番茄品种('Jinpeng No. 1'和'Rutgers')的感染叶片样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
932 2026-01-22
The topographical distribution of spermatogonial subpopulations during the cycle of seminiferous epithelium in Macaca Fascicularis†
2026-Jan-21, Biology of reproduction IF:3.1Q2
研究论文 本研究通过免疫组化染色和定量分析,探讨了猕猴(Macaca fascicularis)精原细胞亚群在生精上皮周期中的空间分布模式 首次描述了灵长类动物中不同精原细胞亚群(PIWIL4+、GFRA1+、NANOS3+和KIT+)在生精小管基底室中的阶段依赖性空间定位,揭示了其与生精上皮周期的协调关系 研究仅基于猕猴样本,可能无法完全代表其他灵长类或哺乳动物;且依赖于固定组织样本的免疫组化分析,可能受技术限制影响空间分辨率的精确性 旨在解析灵长类动物精原细胞亚群的空间拓扑分布及其与生精上皮微环境的动态关系 猕猴(Macaca fascicularis)睾丸组织中的精原细胞亚群 生殖生物学 NA 免疫组化染色、单细胞RNA测序(作为背景参考)、Strauss线性选择性指数分析 NA 组织图像、定量空间分布数据 未明确指定样本数量,但基于Bouin固定的猕猴睾丸样本 NA NA NA NA
933 2026-01-22
Multi-omics integrative analysis of stemness-associated pathological signatures to guide prognosis and therapeutic strategies in uveal melanoma
2026-Jan-21, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、批量转录组数据和病理全切片图像,系统研究了葡萄膜黑色素瘤中与干性相关的异质性,并构建了一个基于机器学习的病理图像衍生预后评分系统 提出了一个结合病理组学和单细胞RNA测序的新颖整合框架,以解码葡萄膜黑色素瘤中干性驱动的异质性,并构建了一个非侵入性的预后评分模型用于风险分层和治疗指导 预后评分模型仅在单个TCGA-UVM队列中推导和内部验证,其普适性需要在独立的多中心队列中进行验证 研究葡萄膜黑色素瘤中与干性相关的病理特征,以指导预后和治疗策略 葡萄膜黑色素瘤患者 数字病理学 葡萄膜黑色素瘤 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 机器学习模型 图像, 文本 TCGA-UVM队列 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
934 2026-01-22
Mechanisms of DDR1 in Reinforcing the Resistance to Radiotherapy in Breast Cancer Through the AMPK/SIRT1/PGC-1α Pathway
2026-Jan-20, Biochemical genetics IF:2.1Q3
研究论文 本研究探讨了DDR1通过AMPK/SIRT1/PGC-1α通路增强乳腺癌放疗抵抗的机制 首次揭示了DDR1在乳腺癌放疗抵抗中的作用,并阐明了其通过AMPK/SIRT1/PGC-1α通路调控的分子机制 研究主要基于体外和体内实验,临床样本验证有限,且未涉及其他潜在通路或DDR1抑制剂的具体应用 探究DDR1在乳腺癌放疗抵抗中的作用及其分子机制 乳腺癌细胞及建立的放疗抵抗株 肿瘤生物学 乳腺癌 单细胞RNA测序、qPCR、CCK-8、集落形成实验、流式细胞术、Western blot、免疫组化 NA 基因表达数据、蛋白质水平数据、细胞功能数据 未明确具体样本数量,但涉及乳腺癌细胞系及体内实验模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
935 2026-01-22
Malignant cell-secreted chemokines drive colorectal cancer progression through endothelial cell activation
2026-Jan-20, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序等技术,揭示了结直肠癌中恶性细胞分泌的CXCL2通过激活内皮细胞上的ACKR1受体驱动肿瘤进展的机制 首次通过单细胞测序结合T分期分层分析,鉴定出CXCL2-ACKR1轴在晚期结直肠癌中驱动肿瘤侵袭的关键作用,并提出了针对内皮细胞ACKR1的阶段性干预新策略 研究样本量相对较小(26例患者),且主要基于体外细胞实验验证,缺乏体内动物模型或更大规模临床队列的进一步验证 解析结直肠癌肿瘤微环境中细胞互作如何驱动肿瘤进展,并寻找阶段特异性的治疗靶点 结直肠癌患者肿瘤组织、恶性细胞、内皮细胞、LoVo细胞系、人脐静脉内皮细胞 单细胞组学 结直肠癌 单细胞RNA测序、拷贝数变异推断、非负矩阵分解 NA 单细胞转录组数据 26例结直肠癌患者(按T分期分层:T2、T3、T4a) NA 单细胞RNA-seq NA NA
936 2026-01-22
Inflammasome activation and oxidative stress in SARS-CoV-2 infection and symptomatic rebound
2026-Jan-20, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过分析接种疫苗个体的外周血单核细胞,探讨了SARS-CoV-2感染及症状反弹期间炎症小体激活和氧化应激的机制 揭示了临床反弹期间炎症、应激和抗病毒反应的部分复苏,并识别出具有独特抗原呈递和I型干扰素信号通路的单核细胞亚群 样本量较小(EA组n=6,LA组n=6,反弹组n=8,健康志愿者n=7),且仅基于外周血分析,可能未全面反映组织特异性免疫反应 阐明COVID-19反弹症状的驱动机制,并探索潜在的治疗策略 接种疫苗后出现早期急性症状、晚期急性症状或临床反弹的个体,以及健康志愿者的外周血单核细胞 数字病理学 COVID-19 单细胞RNA测序,流式细胞术,Imagestream分析 NA 单细胞RNA测序数据,流式细胞术数据,血清抗原数据 27名参与者(EA组6人,LA组6人,反弹组8人,健康志愿者7人) NA 单细胞RNA-seq NA NA
937 2026-01-22
scDGCL: a Dual-level and Graph-constrained Contrastive Learning Method for Single-cell RNA Sequencing Data Clustering
2026-Jan-20, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本文提出了一种名为scDGCL的新型双层次图约束对比学习方法,用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 提出了一种结合双层次对比学习(DCL)和图约束对比学习(GCL)的新型框架,通过同时考虑细胞和簇级别的相似性与差异性来优化细胞表征,并将学习到的表征与图关系先验对齐 NA 提高单细胞RNA测序数据的聚类性能 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 对比学习 基因表达数据 12个真实数据集和8个模拟数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
938 2026-01-22
Transthyretin-mediated regulation of neuropathic pain and anxiety-like behavior in the lateral parabrachial nucleus
2026-Jan-19, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究揭示了在神经病理性疼痛模型中,外侧臂旁核(LPBN)内转甲状腺素蛋白(TTR)通过结合其受体RAGE并激活NF-κB信号通路,调控疼痛-焦虑共病的关键作用 首次在单细胞水平上发现神经病理性疼痛模型中LPBN的TTR表达上调,并通过双向条件性敲除和过表达实验,证实了LPBN谷氨酸能神经元中的TTR是疼痛-焦虑共病的必要且充分的调节因子 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类中的普适性有待进一步验证;TTR-RAGE-NF-κB轴下游的具体效应分子和细胞类型间的相互作用网络尚未完全阐明 探究神经病理性疼痛及其共病焦虑的分子、细胞和环路机制,并寻找潜在的治疗靶点 小鼠的外侧臂旁核(LPBN)神经元,特别是谷氨酸能神经元 神经科学 神经病理性疼痛 单细胞测序,双向条件性基因敲除(cKO),基因过表达 NA 单细胞基因表达数据,行为学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
939 2026-01-22
Upregulation of ZAP70 in CD8+ T cells enhances its anti-tumor function and correlates with a favorable prognosis in hepatocellular carcinoma
2026-Jan-19, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了ZAP70在CD8+ T细胞中的上调通过增强其抗肿瘤功能与肝细胞癌患者良好预后相关 首次将单细胞RNA测序数据与体外体内实验结合,系统性地证明了ZAP70在CD8+ T细胞中的表达水平是影响肝细胞癌免疫微环境及患者预后的关键因素,并明确了其作为潜在免疫治疗靶点的价值 研究主要基于公共数据库(TCGA, GEO)和实验模型,需要在更大规模的前瞻性临床队列中进一步验证ZAP70的预后预测价值及其作为治疗靶点的有效性 探究肝细胞癌肿瘤免疫微环境中免疫细胞浸润模式及免疫相关基因的表达特征,并阐明其影响预后的机制,以寻找新的免疫治疗靶点 肝细胞癌患者样本(来自TCGA数据库和GEO数据库的单细胞RNA测序数据)、CD8+ T细胞、肝细胞癌细胞系、小鼠异种移植和原位肿瘤模型 生物信息学与肿瘤免疫学 肝细胞癌 单样本基因集富集分析(ssGSEA)、转录组分析、LASSO-Cox回归分析、单细胞RNA测序、体外共培养实验、体内小鼠模型(异种移植和原位模型) 预后风险特征模型、预后列线图(Nomogram) 基因表达数据(转录组数据)、单细胞RNA测序数据 TCGA-HCC样本(具体数量未在摘要中明确,但被分为3个亚型进行分析)、来自GEO数据库的单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
940 2026-01-22
Succinate-mediated activation of the GPR91/MALT1/NF-κB/CCL2 pathway in macrophages contributes to pulmonary fibrosis
2026-Jan-19, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了琥珀酸通过激活巨噬细胞中的GPR91/MALT1/NF-κB/CCL2通路加剧肺纤维化的分子机制 首次阐明了琥珀酸通过GPR91/MALT1/NF-κB轴促进巨噬细胞CCL2分泌从而驱动肺纤维化的具体信号通路 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;琥珀酸抑制剂的长期安全性未评估 阐明琥珀酸在肺纤维化发展中的具体作用机制 野生型和GPR91敲除小鼠、原代小鼠巨噬细胞和成纤维细胞 分子病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序、RNA测序 动物模型(小鼠) 基因表达数据 未明确样本数量的小鼠模型和细胞实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部