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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2026-01-10 |
TEAD4 and RXRA Regulate the Function of Nucleus Pulposus Cells in Intervertebral Disc Degeneration Via the TNF-α/NF-κB Pathway: An Integrated Analysis of Single-Cell RNA-Seq, Bulk RNA-Seq, and In Vitro Validation
2026-Jan-09, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05534-4
PMID:41511606
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 922 | 2026-01-10 |
Alleviated T cell exhaustion and SLC1A3-mediated stroma-remodelling dictate chemoimmunotherapy efficacy in oesophageal squamous cell carcinoma
2026-Jan-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335642
PMID:40983502
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等方法,揭示了化疗联合抗PD-1疗法在食管鳞状细胞癌中的协同增效机制及耐药原因 | 发现了化疗通过减轻上皮应激肿瘤细胞与CD8+ T细胞间的免疫检查点相互作用(TIGIT-NECTIN2和NECTIN1-CD96)来防止T细胞耗竭,并首次鉴定出高表达SLC1A3的肿瘤细胞亚群通过诱导富含细胞外基质的肿瘤微环境阻碍CD8+ T细胞浸润,导致耐药 | 研究样本量未明确说明,且机制验证主要在临床样本和小鼠模型中进行,缺乏更大规模的临床队列验证 | 探究化疗增强免疫检查点阻断疗效的机制,并阐明无应答患者持续耐药的因素 | 接受化疗联合抗PD-1或抗PD-1单药治疗的食管鳞状细胞癌患者组织样本及小鼠模型 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞转录组学、T细胞受体谱分析、多重免疫组化 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 923 | 2026-01-10 |
Single-Cell Clonal Lineage Tracing Identifies the Transcriptional Program Controlling the Cell-Fate Decisions by Neoantigen-Specific CD8+ T Cells
2026-Jan-08, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0203
PMID:41081433
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研究论文 | 本研究通过单细胞克隆谱系追踪技术,揭示了新抗原特异性CD8+ T细胞的转录程序如何调控其细胞命运决定,并与癌症患者的临床预后相关 | 首次结合单细胞转录组和T细胞受体谱分析,系统描绘了新抗原特异性CD8+ T细胞在肿瘤和引流淋巴结中的克隆扩增与分化轨迹,并识别了关键的转录调控程序 | 研究主要基于小鼠前列腺癌模型,人类临床样本的验证有限,且单细胞技术可能无法完全捕获所有细胞状态 | 阐明新抗原特异性CD8+ T细胞的转录程序如何控制其细胞命运决定,并探索其与癌症免疫治疗响应的关联 | 小鼠前列腺癌模型中的新抗原特异性CD8+ T细胞,以及癌症患者的临床样本 | 单细胞组学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序,T细胞受体谱分析 | NA | 单细胞RNA-seq数据,T细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 924 | 2026-01-10 |
Single-cell multimodal analysis reveals the dynamic immunopathogenesis of HBV-ACLF progression
2026-Jan-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333308
PMID:40841166
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了HBV相关慢加急性肝衰竭(HBV-ACLF)进展中的动态免疫发病机制 | 首次结合单细胞RNA测序和单细胞蛋白质组学,纵向描绘了HBV-ACLF疾病过程中免疫反应的动态轨迹,并识别了关键的免疫细胞模块用于患者分层和预后预测 | 样本量相对较小(45个样本),且主要基于外周血单核细胞,可能未完全反映肝脏局部免疫环境 | 全面描绘HBV-ACLF疾病过程中免疫反应的动态轨迹,以揭示其免疫发病机制并探索精准治疗策略 | HBV相关慢加急性肝衰竭(HBV-ACLF)患者的外周血单核细胞 | 单细胞多组学 | 肝病 | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA序列数据, 蛋白质组学数据 | 45个样本(来自17名住院患者和15名对照受试者) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 925 | 2026-01-10 |
Deciphering the Heterogeneity of Pulmonary Macrophages in Response to Fine Particles
2026-Jan-08, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202507293
PMID:41504080
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研究论文 | 本研究开发了一种双标记金纳米颗粒模型,结合流式细胞分选和单细胞RNA测序,揭示了肺部巨噬细胞亚群对吸入细颗粒物的异质性响应 | 开发了新型双标记金纳米颗粒模型来捕获颗粒物响应细胞亚群,首次系统描绘了肺泡巨噬细胞、募集巨噬细胞和间质巨噬细胞中14个功能各异亚群对颗粒物的响应图谱 | 研究主要基于金纳米颗粒模型,可能与真实环境细颗粒物的生物效应存在差异;单细胞测序样本量有限 | 解析肺部巨噬细胞对吸入细颗粒物的异质性响应机制 | 肺部巨噬细胞亚群(肺泡巨噬细胞、募集巨噬细胞、间质巨噬细胞) | 单细胞组学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序,荧光激活细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 926 | 2026-01-10 |
CD20+FCRL4+ B Cells Activate CD8+ T Cells via MHC-I Restriction in Nasopharyngeal Carcinoma Anti-Tumor Immunity
2026-Jan-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514982
PMID:41504259
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序等技术,揭示了鼻咽癌中CD20+FCRL4+ B细胞亚群通过MHC-I途径激活CD8+ T细胞的抗肿瘤机制 | 首次在鼻咽癌中鉴定出CD20+FCRL4+ B细胞亚群,并阐明其通过MHC-I限制性方式激活CD8+ T细胞的具体分子机制,特别是IFNγ通过上调WDFY4增强抗原呈递的关键作用 | 研究主要基于体外和动物模型,人体内验证仍需进一步临床研究;B细胞亚群的具体发育来源和调控网络尚未完全阐明 | 探究鼻咽癌免疫微环境中B细胞的功能及其与其他免疫细胞的相互作用,为免疫治疗提供新见解 | 鼻咽癌组织样本、CD20+FCRL4+ B细胞亚群、CD8+ T细胞 | 免疫肿瘤学 | 鼻咽癌 | 单细胞测序、免疫组织化学、流式细胞术、体外共培养系统、体内实验 | NA | 单细胞测序数据、组织图像、流式数据 | 未明确说明具体样本数量,但包括鼻咽癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 927 | 2026-01-10 |
Early Radial Extracorporeal Shockwave Stimulation on Proximal Tibial Circular Osteotomy Site Enhanced Heterotopic Skin Wound Healing via Small Extracellular Vesicles
2026-Jan-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517257
PMID:41504389
|
研究论文 | 本研究探讨了在胫骨环形截骨部位应用径向体外冲击波疗法如何通过小细胞外囊泡增强大鼠足背伤口愈合 | 首次将径向体外冲击波疗法应用于胫骨截骨部位以促进伤口愈合,并揭示了小细胞外囊泡通过ATP/P2X7R/p38MAPK通路释放及Thbs1蛋白增强的机制 | 研究仅基于大鼠模型,尚未在人类慢性伤口如糖尿病足溃疡中进行验证 | 探索新型伤口愈合治疗方法,特别是针对慢性伤口如糖尿病足溃疡 | 大鼠足背伤口模型 | 再生医学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞测序、蛋白质组学分析 | 动物模型(大鼠) | 测序数据、蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及大鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 928 | 2026-01-10 |
ROS Activated NETosis of Bone Marrow CD55+ Intermediate Mature Neutrophils Through HIF1α-PADI4 Pathway to Initiate Bone Aging
2026-Jan-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202500046
PMID:41504495
|
研究论文 | 本研究揭示了骨髓中CD55+中间成熟中性粒细胞通过HIF1α-PADI4通路激活NETosis,从而引发骨老化的机制 | 首次发现CD55+中间成熟中性粒细胞亚群在骨老化中的关键作用,并揭示了ROS与HIF1α-PADI4通路协同调控NETosis的新机制 | 研究主要基于小鼠模型(SAMP6),尚未在人类样本中验证 | 探究骨髓中性粒细胞NETosis在骨老化中的调控机制及其与细胞衰老的相互作用 | 3个月大的雄性SAMP6小鼠骨髓样本,包括中性粒细胞亚群和骨髓间充质干细胞(BMSCs) | 单细胞组学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),细胞移植实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 3个月大的雄性SAMP6小鼠骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 929 | 2026-01-10 |
Mass Spectrometry Imaging Combined With Single-Cell Transcriptional Profiling Reveals the Multidimensional Spatial Distributions and Biosynthetic Pathways of Medicinal Components in Andrographis paniculata
2026-Jan-08, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70534
PMID:41504619
|
研究论文 | 本研究首次在穿心莲中建立了质谱成像与单细胞RNA测序整合的系统,揭示了药用成分的多维空间分布和生物合成途径 | 首次在穿心莲中整合质谱成像与单细胞转录组技术,揭示了药用成分在细胞类型特异性中的精细分布和光调控的生物合成机制 | 研究主要聚焦于穿心莲的叶片和茎组织,可能未涵盖所有药用成分在其他组织中的分布情况 | 探究药用植物穿心莲中活性成分的精细空间分布和生物合成途径 | 穿心莲(Andrographis paniculata)的叶片和茎组织 | 植物代谢组学 | NA | 质谱成像(MSI)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、LC-QQQ-MS/MS | NA | 质谱成像数据、单细胞转录组数据 | 穿心莲的叶片和茎组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 930 | 2026-01-10 |
Cellular microenvironment of erythropoietin-producing cells in hypoxic and injured mouse kidneys
2026-Jan-08, Experimental physiology
IF:2.6Q2
DOI:10.1113/EP093422
PMID:41504852
|
研究论文 | 本研究结合空间转录组学、mRNA荧光原位杂交和连续免疫荧光技术,揭示了缺氧和损伤小鼠肾脏中促红细胞生成素产生细胞的微环境特征 | 首次利用空间转录组学等技术系统表征了活性REP细胞的直接邻域,揭示了其在缺氧和损伤条件下微环境的动态变化 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证;技术方法可能受限于空间分辨率 | 探究调控促红细胞生成素产生的机制 | 小鼠肾脏中的Norn细胞和肾促红细胞生成素产生细胞 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学, mRNA荧光原位杂交, 连续免疫荧光 | NA | 空间转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 931 | 2026-01-10 |
IL-21 enhances the cytotoxicity of intratumoral CD8+ T cells improving radiation efficacy
2026-Jan-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.190531
PMID:41505202
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研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素-21(IL-21)与放疗联合应用在增强肿瘤微环境中CD8+ T细胞细胞毒性、改善放疗疗效方面的作用 | 首次系统性地揭示了IL-21与放疗之间的协同作用,通过单细胞转录组测序阐明了其增强CD8+ T细胞效应功能和防止耗竭的分子机制,并在人源化小鼠模型和患者样本中进行了验证 | 研究主要基于临床前模型(小鼠模型和人源化小鼠),尚未在大型临床试验中得到验证;食管癌患者样本分析为回顾性,样本量有限 | 探索IL-21作为放疗佐剂,通过调节肿瘤微环境增强抗肿瘤免疫反应,从而提高放疗疗效 | 小鼠肿瘤模型、人源化小鼠模型(A549肿瘤)、食管癌患者术后样本 | 肿瘤免疫学 | 癌症(食管癌、肺癌模型) | 单细胞转录组测序、组织微阵列分析、数据库挖掘 | NA | 转录组数据、组织样本数据、临床数据 | 小鼠模型、人源化小鼠模型及食管癌患者术后样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 932 | 2026-01-10 |
IDH-mutant gliomas arise from glial progenitor cells harboring the initial driver mutation
2026-Jan-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adt0559
PMID:41505555
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研究论文 | 本研究通过深度测序和空间转录组学分析,确定了IDH突变胶质瘤起源于携带初始驱动突变的胶质祖细胞 | 首次结合细胞类型特异性突变分析、克隆进化方向、患者大脑空间转录组学和癌症小鼠模型,明确了IDH突变胶质瘤的起源细胞 | 样本量相对有限(70名患者),且仅针对IDH突变胶质瘤,可能不适用于其他类型脑肿瘤 | 探究IDH突变胶质瘤的起源细胞,以理解肿瘤进化并开发新治疗方法 | IDH突变胶质瘤患者(70名)的肿瘤组织、瘤周皮质、脑室下区和血液样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 深度测序, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 70名患者的142个组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 933 | 2026-01-10 |
CD73 blockade enhances antitumor efficacy of oHSV in solid tumors by increasing macrophage-mediated antigen presentation
2026-Jan-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013640
PMID:41506791
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研究论文 | 本研究探讨了CD73阻断如何通过增强巨噬细胞介导的抗原呈递来提高溶瘤疱疹病毒在实体瘤中的抗肿瘤疗效 | 揭示了免疫抑制性胞外腺苷信号是溶瘤病毒疗法的主要障碍,并证明CD73阻断可防止肿瘤免疫逃逸,支持了溶瘤病毒与CD73阻断联合策略的临床开发 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本的转录组分析,尚未在大型临床试验中验证联合疗法的安全性和长期疗效 | 研究免疫抑制性胞外腺苷信号在调节溶瘤疱疹病毒抗肿瘤免疫疗效中的作用 | 实体瘤模型(包括颅内肿瘤模型)、CD73基因敲除小鼠、患者肿瘤样本 | 肿瘤免疫学 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术免疫表型分析、免疫荧光成像、转录组分析 | CD73基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、流式细胞术数据、免疫荧光图像 | 患者肿瘤样本(治疗前与治疗后)、CD73敲除小鼠与野生型小鼠的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 934 | 2026-01-10 |
Representation learning of single-cell RNA-seq data
2026-Jan-08, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080889.125
PMID:41506911
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序数据的表示学习方法,包括因子模型、自编码器、对比学习和基于Transformer的基础模型 | 提出了一个连贯的分类法,阐明了这些方法的概念基础、共同假设和关键区别,并讨论了现有基准和未来挑战 | NA | 综述单细胞RNA测序数据的表示学习方法,提供分类框架并讨论未来挑战 | 单细胞RNA测序数据及其表示学习方法 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子模型, 自编码器, 对比学习, Transformer | 基因表达数据 | 超过1亿个测序细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 935 | 2026-01-10 |
Revealing high-resolution spatial metagenes from spatial transcriptomics
2026-Jan-08, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01848-x
PMID:41507531
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 936 | 2026-01-10 |
Uncovering the potential of pathomics: prognostic prediction and mechanistic investigation of pancreatic cancer
2026-Jan-08, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70011
PMID:41508286
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研究论文 | 本研究探讨了基于机器学习的病理组学模型在预测胰腺癌患者术后总生存期方面的价值及其生物学意义 | 结合肿瘤和瘤周区域的病理组学参数提供互补的预后信息,并首次将LASSO机器学习方法与临床参数结合构建综合列线图,同时利用空间分析和单细胞测序揭示病理组学评分与免疫细胞浸润的关联 | 回顾性研究设计,样本量相对较小(173例患者),且仅来自两个中心,可能存在选择偏倚 | 预测胰腺导管腺癌患者的术后总生存期并探究其生物学机制 | 胰腺导管腺癌患者 | 数字病理 | 胰腺癌 | 病理组学分析,机器学习,多重免疫荧光,空间分析,单细胞测序 | LASSO,以及其他四种机器学习方法 | 病理图像,临床数据,基因表达数据 | 173例胰腺导管腺癌患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 937 | 2026-01-10 |
Single-cell RNA sequencing reveals the therapeutic mechanism of Calvatia lilacina in promoting wound healing of anal fistula
2026-Jan-07, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-025-01293-w
PMID:41495793
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了紫色秃马勃孢子促进肛瘘伤口愈合的治疗机制 | 首次从单细胞水平解析了紫色秃马勃孢子通过调节巨噬细胞与成纤维细胞相互作用促进肛瘘伤口愈合的分子机制 | 样本量较小(仅20例患者),且为单中心研究,需要更大规模的多中心验证 | 探究紫色秃马勃孢子促进肛瘘伤口愈合的疗效和机制 | 肛瘘术后患者的肉芽组织样本及小鼠皮肤成纤维细胞 | 数字病理学 | 肛瘘 | 单细胞RNA测序, ELISA, 免疫组化, Western blot, 免疫荧光, 流式细胞术, 细胞共培养 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 细胞图像数据 | 20例肛瘘手术患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 938 | 2026-01-10 |
Replication stress-inducing ELF3 upregulation promotes BRCA1-deficient breast tumorigenesis in luminal progenitors
2026-Jan-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89573
PMID:41498327
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研究论文 | 本研究揭示了复制应激在BRCA1缺陷型乳腺肿瘤发生中的作用,并阐明了ELF3在促进管腔祖细胞转化中的关键机制 | 首次通过单细胞测序和RNA-seq技术,揭示了复制应激作为BRCA1缺陷型乳腺肿瘤发生的驱动因素,并发现ELF3在这一过程中的核心调控作用 | 研究主要基于人类突变乳腺癌样本和BRCA1缺陷的正常乳腺细胞,可能未完全涵盖所有肿瘤亚型或体内微环境的影响 | 探究BRCA1缺陷型乳腺癌在管腔祖细胞中易转化的原因 | 人类BRCA1突变乳腺癌样本和BRCA1缺陷的正常乳腺细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 939 | 2026-01-10 |
Integrative multi-omics and radiogenomic profiling decodes NNK-related tumor remodeling and prognostic stratification in pancreatic cancer
2026-Jan-07, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004732
PMID:41504500
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研究论文 | 本研究通过整合多组学和放射基因组学分析,揭示了烟草特异性致癌物NNK与胰腺癌进展的关系,并开发了一个基于CT的放射组学模型,用于无创解码NNK相关的分子改变 | 首次将NNK暴露与胰腺癌的分子改变和影像表型联系起来,开发了基于ITGA3的放射组学模型,实现了术前风险分层 | 研究依赖于回顾性数据,需要前瞻性验证;放射组学模型的泛化能力有待进一步评估 | 阐明NNK如何促进胰腺癌进展,并开发无创的放射组学模型进行预后分层 | 胰腺癌患者 | 放射组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,放射组学特征提取 | 多算法机器学习框架,Cox比例风险模型 | CT图像,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 多个队列的胰腺癌患者,包括TCIA和独立手术队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 940 | 2026-01-10 |
Digital twins for in vivo metabolic flux estimations in patients with brain cancer
2026-Jan-06, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2025.10.022
PMID:41330373
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研究论文 | 本文开发了两种基于机器学习的框架,用于在脑癌患者体内进行代谢通量估计 | 开发了数字孪生框架和单细胞代谢通量分析框架,首次实现了在人类患者体内进行代谢通量估计,克服了组织采样、肿瘤微环境异质性和非稳态条件等挑战 | 未明确说明样本量大小或具体验证方法 | 开发能够在人类患者体内进行代谢通量估计的新方法 | 脑癌患者和脑癌小鼠模型 | 机器学习 | 脑癌 | 单细胞RNA测序,C-同位素示踪 | 卷积神经网络 | bulk样本数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |