单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202601] [清除筛选条件]
当前共找到 2200 篇文献,本页显示第 921 - 940 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
921 2026-06-06
Integrative multi-omics reveal a CD4⁺ T cell-derived six-gene signature linking the immune-stromal ecosystem to prognosis and immunotherapy selection in pancreatic cancer
2026-Jan-22, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 整合多组学分析揭示胰腺癌中CD4⁺ T细胞来源的六基因标志物,关联免疫基质微环境与预后及免疫治疗选择 首次从CD4⁺ T细胞差异表达基因中推导出六基因标志物(KLF3、EZR、SMDT1、JPT1、ISG15、MT1X),该标志物能有效分层预后风险并揭示免疫-基质微环境在胰腺癌中的作用 主要基于公共数据库分析,缺乏大规模前瞻性临床验证,且实验验证仅限少数细胞系,未涉及体内模型 识别胰腺癌中免疫锚定的生物标志物,用于风险分层和指导免疫治疗选择 胰腺癌患者肿瘤组织及细胞系(H6C7、CAPAN-1、PANC-1) 机器学习 胰腺癌 RNA测序、单细胞RNA测序、定量实时聚合酶链反应、蛋白质印迹法 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据 TCGA、GTEx和GEO数据集(GSE57495)及单细胞数据集(GSE212966) NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
922 2026-06-06
Functional characterization of angiogenesis genes in hepatocellular carcinoma via integrated bulk and single cell RNA sequencing
2026-Jan-22, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过整合批量与单细胞RNA测序,系统性地探究肝细胞癌中血管生成相关基因的功能,并构建预后模型及发现潜在治疗靶点 首次全面探索所有血管生成与整合应激反应相关基因在HCC中的表达模式,并通过WGCNA识别与血管生成活性强相关的基因模块,构建预后模型用于评估免疫治疗反应,同时利用单细胞转录组分析发现DAB2在APOA2+巨噬细胞中的潜在作用及靶向药物 该文的摘要未提及研究的具体局限性 研究肝细胞癌中血管生成基因的表达变化、构建肿瘤预后预测模型,并探索潜在治疗靶点和药物 肝细胞癌患者样本及细胞数据 机器学习和数字病理学 肝细胞癌 RNA-seq、单细胞RNA-seq、分子对接 WGCNA、预后模型、药物反应模型 转录组数据(批量与单细胞) NA NA 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
923 2026-06-06
Integrative transcriptomic profiling reveals subtype-specific therapeutic vulnerabilities and resistance mechanisms in prostate cancer
2026-Jan-21, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 整合转录组学分析揭示前列腺癌亚型特异性治疗脆弱性和耐药机制 通过CRISPR筛选、RNA测序和空间转录组学等多组学整合分析,首次识别出三种分子亚型,发现MCL1作为关键耐药驱动因子,并揭示了AR依赖性与非依赖性生存通路在治疗逃逸中的作用 未提及明显局限性,但可能受限于细胞系模型与临床样本的异质性,以及CRISPR筛选的脱靶效应 剖析前列腺癌中AR依赖性与耐药机制,识别亚型特异性治疗靶点 AR依赖性(VCaP、LNCaP、22Rv1)和AR非依赖性(DU145、PC-3、WPE1-NA22、P4E6、Shmac5)前列腺癌细胞系,TCGA-PRAD、Changhai和DKFZ队列的RNA测序数据,原发肿瘤和转移样本的空间转录组学和单细胞RNA测序数据 机器学习 前列腺癌 CRISPR-Cas9筛选、RNA测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 共识聚类、模糊聚类 转录组数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 8种细胞系、TCGA-PRAD及两个外部验证队列(Changhai和DKFZ)的样本 Illumina, 10x Genomics RNA测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq, 10x Visium, 10x Chromium 空间转录组学使用10x Visium,单细胞RNA测序使用10x Chromium,RNA测序使用Illumina NovaSeq
924 2026-06-06
Glycolytic heterogeneity drives metabolic-targeted therapy in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Jan-20, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 利用空间转录组学、单细胞和批量RNA测序以及多组学方法,揭示胰腺导管腺癌中糖酵解异质性并探索其临床意义和治疗潜力 首次系统揭示PDAC中糖酵解活动的异质性,并基于糖酵解表型提出患者分层框架,指导个性化代谢治疗 未提及具体局限性,可能涉及样本量有限或体外模型与体内环境的差异 研究PDAC中糖酵解异质性及其对代谢靶向治疗的影响 胰腺导管腺癌患者肿瘤组织、患者来源的细胞模型、类器官 数字病理学 胰腺导管腺癌 空间转录组学,单细胞RNA测序,批量RNA测序,代谢组学,蛋白质组学,脂质组学 NA 空间转录组数据,单细胞转录组数据,批量转录组数据,代谢组数据,蛋白质组数据,脂质组数据 NA NA 空间转录组学,单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
925 2026-06-06
ASB5 is a specific marker for muscle satellite cells but dispensable for skeletal muscle development and regeneration
2026-Jan-19, Skeletal muscle IF:5.3Q2
研究论文 本研究识别ASB5为肌肉卫星细胞的特异性标志物,但发现其对于骨骼肌发育和再生并非必需 首次通过单细胞RNA测序数据鉴定ASB5为肌肉卫星细胞的特异性标志物,并利用CRISPR-Cas9基因编辑技术生成Asb5敲除小鼠模型,系统评估其在肌肉发育和再生中的功能 研究仅在正常生理条件下评估Asb5功能,未探讨在病理或应激条件下的作用;未进行体外分化实验以直接验证Asb5对肌源性分化的影响 鉴定新的肌肉卫星细胞分子标志物并阐明其在骨骼肌发育和再生中的功能 肌肉卫星细胞及其祖细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因编辑, 实时荧光定量PCR NA 单细胞RNA测序数据 Asb5敲除小鼠品系:通过CRISPR-Cas9删除外显子4生成;使用公开数据集Tabula Muris和GSE150366 NA 单细胞RNA测序 NA NA
926 2026-06-06
Targeting thymidylate synthase enhances CD8 + T-cell infiltration and inhibits tumor growth in cervical cancer
2026-Jan-19, Medical oncology (Northwood, London, England)
研究论文 通过整合单细胞RNA测序、功能实验和体内模型,揭示了胸苷酸合酶在宫颈癌中通过调节CD8+ T细胞浸润来影响肿瘤生长的免疫代谢调控机制 首次阐明胸苷酸合酶作为免疫代谢调控因子在宫颈癌肿瘤微环境中的作用,并开发了包含TYMS、MYO6、SPINT1和ESD的T细胞相关预后特征 研究主要基于体外和动物模型,缺乏大规模临床样本验证;分子对接仅鉴定了一种抑制剂的可能靶点,需进一步实验确认 探究胸苷酸合酶在宫颈癌免疫代谢调控中的功能及其作为治疗靶点的潜力 宫颈癌肿瘤微环境中的胸苷酸合酶、CD8+ T细胞及相关信号通路 机器学习 宫颈癌 单细胞RNA测序、功能实验、体内模型 NA 单细胞转录组数据、转录组数据 47,589个细胞 NA single-cell RNA-seq NA NA
927 2026-06-06
The Role of Cancer-Associated Fibroblasts and Tumor-Associated Macrophages in the Tumor Microenvironment and Their Impact on Ovarian Cancer Survival and Therapy
2026-Jan-19, Current oncology (Toronto, Ont.)
综述 本文综述了肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞(CAFs)和肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)在上皮性卵巢癌中的作用,以及它们对肿瘤进展、治疗耐药和免疫逃逸的影响,并探讨了靶向这些细胞的新型治疗策略 利用单细胞测序和空间转录组学等先进技术,更精确地识别CAFs和TAMs亚型,为开发更精准的靶向治疗提供新思路 作为综述,未提供原始实验数据;CAFs和TAMs的异质性和动态相互作用机制仍有待进一步阐明 总结CAFs和TAMs在卵巢癌肿瘤微环境中的作用及其对治疗的影响,探索靶向这些细胞以改善治疗效果的可能性 上皮性卵巢癌中的癌症相关成纤维细胞(CAFs)和肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) 数字病理学 卵巢癌 单细胞测序,空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
928 2026-06-06
Revealing hidden regulatory dependencies: multi-perspective graph learning for single-cell gene regulatory network inference
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出了ATFGRN,一种自适应拓扑特征融合图神经网络框架,用于从单细胞转录组数据中推断基因调控网络 创新性地融合了三个互补视角(子图结构编码、表达引导模块和相似性结构模块)的特征,通过注意力机制进行加权融合,实现了结构、表达和相似性信息的互补整合 未提及 提高从复杂高维单细胞转录组数据中推断基因调控网络的准确性 基因调控关系及其网络 机器学习 NA 单细胞转录组测序 图神经网络、图卷积网络、图注意力网络 基因表达矩阵 未提及 NA 单细胞RNA-seq NA NA
929 2026-06-06
Insights into Cardiomyocyte Regeneration from Screening and Transcriptomics Approaches
2026-Jan-07, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文通过对比高通量筛选和转录组学方法,总结了心肌细胞再生的最新研究进展,包括促增殖靶点的发现及不同筛选模型的优缺点 整合高通量筛选与单细胞组学数据,揭示了心肌细胞异质性对再生能力的影响,提出了多系统整合策略的重要性 缺乏临床转化验证,现有模型在模拟人类心脏微环境方面仍存在局限性,需进一步研究安全有效的促增殖靶点 系统比较用于发现心肌细胞增殖靶点的高通量筛选策略,并整合组学数据以推动心脏再生研究 包括斑马鱼胚胎、啮齿类心肌细胞、人诱导多能干细胞来源的心肌细胞和心脏类器官等模型 计算生物学 心血管疾病 高通量筛选, 单细胞核RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据 NA 10x Genomics, Illumina 单细胞转录组学, 空间转录组学 10x Chromium, Illumina NovaSeq 单细胞核RNA测序和空间转录组学平台
930 2026-06-06
Single-Cell RNA-Seq Reveals Conserved Cellular Communication Mechanisms Governing Ocular Lineage Specification from Human iPS Cells
2026-Jan-07, Cells IF:5.1Q2
研究论文 利用人诱导多能干细胞(hiPSCs)分化为眼类器官的单细胞RNA测序数据,揭示控制眼部谱系规范的保守细胞通讯机制 首次通过单细胞RNA测序分析hiPSCs向眼类器官分化过程中的细胞通讯网络,发现保守的发育信号通路(如Activin、FGF、BMP、WNT和视黄酸家族)在眼部器官形成中的作用 NA 研究早期眼睛发育过程中细胞命运决定的复杂性,并利用hiPSCs模拟这一过程 人诱导多能干细胞(hiPSCs)及其分化的二维眼类器官 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
931 2026-06-06
LncRNAs at the frontline of neuroimmune crosstalk in oral cancer
2026-Jan-06, Clinical and experimental immunology IF:3.4Q3
综述 本文综述了长链非编码RNA在口腔癌神经免疫串扰中的作用 首次聚焦长链非编码RNA介导的神经免疫交叉通路,提出神经-免疫-癌症轴的概念 缺乏口腔鳞状细胞癌特异性功能研究、长链非编码RNA活性的空间或单细胞分辨率数据有限、评估长链非编码RNA驱动神经侵犯的体内模型不足 探讨长链非编码RNA在口腔癌中调控神经免疫相互作用的机制及其潜在治疗靶点 口腔鳞状细胞癌中的长链非编码RNA、神经免疫相互作用 数字病理学 口腔癌 功能基因组学、空间转录组学、神经-肿瘤共培养模型 NA NA NA NA 空间转录组学 NA NA
932 2026-06-06
GSTO1 as a Potential Risk Factor for Diabetic Nephropathy: Evidence From Mendelian Randomisation and Multi-Omics Analyses
2026-Jan, Nephrology (Carlton, Vic.)
研究论文 通过孟德尔随机化和多组学分析探讨GSTO1与糖尿病肾病的潜在因果关系 首次利用孟德尔随机化联合单细胞RNA测序和多组学数据揭示GSTO1在糖尿病肾病中的因果作用 研究结果基于公共数据库和体外实验,尚需更大样本量和体内实验验证 探究GSTO1与糖尿病肾病风险之间的潜在因果关系 GSTO1基因变异、糖尿病肾病样本及高糖处理HK-2细胞 机器学习和生物信息学 糖尿病肾病 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、表达分析 NA 基因型数据、表达谱数据、单细胞RNA测序数据 MR分析包含GWAS汇总数据,表达分析涉及Nephroseq、GEO数据集及人肾小管上皮细胞系HK-2 NA 单细胞RNA测序 NA NA
933 2026-06-06
LncRNA ZFAS1 Promotes Alveolar Bone Resorption by Enhancing Osteoclastogenesis in Periodontitis
2026-Jan, Journal of cellular physiology IF:4.5Q1
研究论文 探究长链非编码RNA ZFAS1在牙周炎中通过增强破骨细胞生成促进牙槽骨吸收的机制 首次揭示lncRNA ZFAS1在牙周炎微环境中作为双重路径调控因子,同时促进破骨细胞生成和抑制成骨细胞生成,并通过单细胞和bulk RNA测序技术验证其与早期破骨标志基因的强相关性 未提供具体局限性信息 阐明lncRNA ZFAS1在牙周炎骨重塑失调中的机制作用 牙周炎患者和健康者的牙周组织,以及RAW264.7和MC3T3-E1细胞系 数字病理学 牙周炎 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、qPCR、组织学、免疫组化 NA 基因表达数据、组织图像 包含健康和患病牙周组织样本,具体数量未提及 NA 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq NA NA
934 2026-06-06
IL-21 mediates crosstalk between T cells and NK cells during the remission of type 1 diabetes
2026-Jan, Nature metabolism IF:18.9Q1
研究论文 揭示IL-21介导T细胞与NK细胞在1型糖尿病缓解期中的相互作用机制 首次鉴定出在1型糖尿病发病时扩增的CD226+CD56-CD16+ NK细胞亚群,并证明其通过IL-21和mTOR信号通路受到CD161+CD4+ T细胞调控,连接适应性免疫与先天免疫 主要在雌性小鼠模型中验证机制,人类纵向样本量有限 阐明自然杀伤细胞在1型糖尿病进展和缓解中的作用及免疫调节机制 1型糖尿病患者及雌性小鼠模型中的NK细胞和T细胞 免疫学 1型糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 1型糖尿病患者样本(横断面和纵向分析)及雌性小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
935 2026-06-06
Spatiotemporal Evolution of Malignant Hepatocyte Clones Unveils Immune Evasion Features and Therapeutic Vulnerabilities in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jan, Biotechnology journal IF:3.2Q2
研究论文 整合单细胞和空间转录组学分析揭示肝细胞癌中恶性肝细胞克隆的时空演化特征、免疫逃逸机制及治疗脆弱性 通过整合单细胞和空间转录组学数据,首次系统揭示了Scissor细胞(主要为肝细胞)向恶性细胞演化过程中的免疫逃逸特征和关键信号通路(如MDK-SDC4和COL4A-SDC)驱动机制 未提及具体限制 探究肝癌发生和进展过程中的多细胞生态系统分子特征 肝细胞癌患者样本中的多种细胞类型,特别是Scissor肝细胞及其演化过程中的恶性克隆 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据(单细胞和空间转录组) NA 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium,10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium空间转录组学
936 2026-06-06
Single-cell RNA-seq reveals the piperlongumine is a potential drug for ischemic stroke
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 使用单细胞RNA测序揭示胡椒碱是缺血性中风的潜在治疗药物 首次通过单细胞RNA测序结合Connectivity Map分析和分子对接,发现胡椒碱可通过结合Actb和Cflar编码的蛋白治疗缺血性中风 仅基于一个公共单细胞数据集(GSE174574)进行分析,需更多样本验证 探索缺血性中风的潜在分子机制和有效治疗药物 缺血性中风的细胞类型和分子机制 机器学习 脑血管疾病,缺血性中风 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 一个公共数据集(GSE174574) NA 单细胞RNA-seq NA NA
937 2026-06-06
AugGCL: Multimodal graph learning for spatial transcriptomics analysis with enhanced gene and morphological data
2026-Jan, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出AugGCL框架,通过增强基因和形态学数据的图卷积学习来改进空间转录组学分析 采用双流加权图卷积网络联合建模基因特征与图像形态信息,并引入图像感知辅助重建以增强弱空间信号和锐化边界 未提及具体局限性 提升空间转录组学中空间域重建的准确性和边界清晰度 人类背外侧前额叶皮层、乳腺癌和小鼠胚胎的组织样本 机器学习, 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学 加权图卷积网络 基因表达数据和图像数据 多个数据集(包括人类背外侧前额叶皮层、乳腺癌和小鼠胚胎) NA 空间转录组学 NA NA
938 2026-06-06
Differential Roles of Notch Receptors in Regulating Activation of Intact Adult Mouse Spinal Cord-Derived NSCs
2026-Jan, Developmental neurobiology IF:2.7Q3
research paper 研究成年小鼠脊髓来源神经干细胞中Notch受体在调控其激活中的差异角色 首次揭示Notch1和Notch2在成年脊髓神经干细胞激活和静息状态中的不同调控作用 研究对象仅局限于8周龄C57/BL6小鼠的脊髓神经干细胞,且未涉及体内环境验证 探究Notch受体在调控成年脊髓神经干细胞激活中的具体作用机制 8周龄C57/BL6小鼠脊髓来源的神经干细胞 digital pathology spinal cord injury single-cell RNA sequencing, lentiviral vector infection, Western blot analysis NA single-cell transcriptome data 8周龄C57/BL6小鼠脊髓来源的神经干细胞 10x Genomics single-cell RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
939 2026-06-06
Intrahepatic Lymphangiogenesis Is Associated with Early Post-Hepatectomy Liver Regeneration, in Part via IL-6/STAT3 Signaling
2026, International journal of medical sciences IF:3.2Q1
研究论文 研究揭示肝内淋巴管生成通过IL-6/STAT3信号通路部分促进肝切除术后早期肝脏再生 首次阐明肝内淋巴管生成在肝脏再生中的具体作用及其通过IL-6/STAT3信号通路的机制 研究基于小鼠模型,需在人类样本中进一步验证;部分依赖于IL-6/STAT3信号,可能还有其他通路参与 探讨肝内淋巴管生成在肝脏再生中的作用及潜在机制 肝内淋巴管内皮细胞(LyECs)以及肝切除术后的小鼠肝脏组织 数字病理学 NA 单细胞RNA测序,qRT-PCR,Western blotting,免疫荧光染色 NA 基因表达数据 小鼠模型(70%肝切除术后),具体样本量未在摘要中提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
940 2026-06-06
Unveiling the molecular mechanisms of burn injury through integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过整合单细胞和批量转录组分析揭示烧伤的分子机制 首次利用单细胞RNA测序技术系统解析烧伤微环境的细胞图谱,并结合机器学习方法鉴定关键标记基因 样本量有限且缺乏实验验证 探究烧伤损伤的免疫学微环境及其分子机制 烧伤微环境中的细胞亚群,特别是巨噬细胞和其他免疫细胞 机器学习, 数字病理学 烧伤 单细胞RNA测序, LASSO回归, 随机森林 UMAP 基因表达数据 9248个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部