单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202601] [清除筛选条件]
当前共找到 1921 篇文献,本页显示第 901 - 920 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
901 2026-04-01
Integrative single-cell, spatial, and bulk transcriptomics reveal an FMR1-FTO axis linked to the immune-excluded phenotype in gastric cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和功能实验,揭示了胃癌中FMR1-FTO轴与免疫排斥表型的关联 首次整合单细胞、空间和批量转录组学数据,量化m6A调节因子评分,并发现FMR1-FTO轴在驱动免疫排斥中的关键作用 研究主要基于转录组学数据,功能验证实验有限,且样本来源和数量未明确说明 阐明胃癌中免疫排斥的空间机制,并探索m6A调节因子在其中的作用 胃癌微环境,包括CAFs、T细胞和m6A调节因子如FTO和FMR1 数字病理学 胃癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量转录组学, 免疫组化, 多重免疫荧光 NA 转录组数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
902 2026-03-31
Loss of Intestinal Endosome-associated Protein Sorting Nexin 27 Disrupts Epithelial Barrier and Promotes Inflammation
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨了分选连接蛋白SNX27在肠道稳态中的作用,发现其缺失会破坏上皮屏障并促进炎症 首次揭示了SNX27在肠道上皮细胞中的关键作用,并建立了肠道上皮细胞特异性SNX27敲除小鼠模型 研究主要基于小鼠模型,人类样本分析依赖于现有数据库,需要进一步验证SNX27在人类IBD中的具体机制 确定SNX27在调节肠道稳态、上皮屏障完整性和炎症反应中的未知作用 人类炎症性肠病(IBD)样本、肠道上皮细胞特异性SNX27敲除小鼠 分子生物学与病理学 炎症性肠病(包括溃疡性结肠炎和克罗恩病) 单细胞RNA测序、基因表达分析、小鼠模型构建 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达数据、组织病理学数据 未明确具体样本数量,使用了NCBI GEO数据库和单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
903 2026-03-31
Adoptive cellular therapy prevents reconstitution of myeloid-derived suppressor cells in the glioma tumor microenvironment
2026 Jan-Dec, Neuro-oncology advances IF:3.7Q2
研究论文 本研究探讨了针对胶质母细胞瘤的过继细胞疗法如何通过调节CCL12信号通路,阻止髓源性抑制细胞在肿瘤微环境中的积累,从而增强抗肿瘤免疫反应 首次揭示了过继细胞疗法通过减少肿瘤相关巨噬细胞来源的CCL12,抑制髓源性抑制细胞向胶质瘤肿瘤微环境的迁移,这一机制先前未被认识 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证;CCL12在MDSC招募中的因果作用需要未来体内研究进一步确认 探究过继细胞疗法如何影响免疫恢复,特别是对髓源性抑制细胞在胶质瘤肿瘤微环境中积累的调控机制 胶质母细胞瘤(GBM)模型小鼠,重点关注髓源性抑制细胞(MDSCs)和肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) 数字病理学 胶质母细胞瘤 流式细胞术、空间基因组学、多重蛋白分析、单细胞转录组学、Trans-well迁移实验 NA 细胞表型数据、空间转录组数据、蛋白质表达数据、单细胞RNA测序数据 使用KR158B胶质瘤荷瘤小鼠模型进行研究,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
904 2026-03-30
Isolation of Pericytes from Mouse Cortical Tissue Using FACS for Single-cell Sequencing
2026-01-30, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文建立了一种优化的FACS方法,用于从小鼠皮层组织中分离周细胞,适用于单细胞RNA测序 在已建立的CD13/CD31分选策略基础上,引入了20% BSA溶液重悬细胞的关键步骤,以最小化应激和聚集,从而最大化测序所需的细胞活力和RNA质量 NA 研究周细胞的异质性,并阐明其在神经血管疾病中的机制 小鼠大脑周细胞 单细胞测序 神经血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 3只成年C57BL/6小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
905 2026-03-30
AUTOENCODIX: a generalized and versatile framework to train and evaluate autoencoders for biological representation learning and beyond
2026-01, Nature computational science IF:12.0Q1
研究论文 本文介绍了AUTOENCODIX,一个用于训练和评估自编码器的开源框架,旨在标准化和灵活处理生物表示学习任务 提出一个标准化、灵活且可比较的自编码器框架,支持基于本体和跨模态的自编码器,增强了表示学习的可解释性和数据模态转换能力 未明确说明框架在特定数据集或应用场景中的性能限制或潜在偏差 开发一个通用框架以标准化自编码器的训练和评估,促进生物表示学习的研究 自编码器架构及其在生物数据表示学习中的应用 机器学习 NA 自编码器深度学习 自编码器(包括基于本体和跨模态的自编码器) 多模态数据(包括基因组、单细胞测序和成像数据) NA NA NA NA NA
906 2026-03-29
Single-cell omics for nutrition research: an emerging opportunity for human-centric investigations
2026, Critical reviews in food science and nutrition IF:7.3Q1
综述 本文综述了单细胞组学技术在营养研究中的新兴应用及其潜力 提出了将单细胞组学技术与类器官、器官芯片等先进人体衍生系统相结合,以在生理相关背景下进行机制研究的新框架 讨论了该领域面临的技术限制、模型选择困难和机构偏见等关键挑战 推进以人为中心的营养研究,揭示饮食化合物对人类健康的影响机制 饮食化合物与人体细胞的相互作用 NA NA 单细胞RNA测序,单细胞蛋白质组学,单细胞代谢组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
907 2026-03-29
Resveratrol Alleviates Intervertebral Disc Degeneration by Targeting NCOA4-Mediated Ferritinophagy Through Dual Antioxidant and Anti-Inflammatory Effects
2026, Drug design, development and therapy
研究论文 本研究通过多组学分析和实验模型,揭示了NCOA4介导的铁蛋白自噬在椎间盘退变中的关键作用,并发现白藜芦醇通过靶向NCOA4发挥双重抗氧化和抗炎效应来缓解退变 首次将铁蛋白自噬确立为椎间盘退变的新型病理机制,并阐明NCOA4作为协调铁死亡与自噬交互作用的关键节点,同时验证了天然化合物白藜芦醇通过多靶点调控炎症和铁稳态通路治疗椎间盘退变的潜力 研究主要基于大鼠模型和细胞实验,临床转化仍需进一步验证;铁蛋白自噬的具体调控网络及其与其他细胞死亡方式的相互作用尚未完全阐明 探究铁蛋白自噬在椎间盘退变中的作用机制,并评估白藜芦醇的治疗效果 椎间盘退变患者样本、大鼠椎间盘退变模型、髓核细胞 生物信息学与分子生物学 椎间盘退变 生物信息学分析、单细胞测序、转录组分析、实验模型验证 NA 临床转录组数据、单细胞测序数据、实验数据 未明确具体样本数量,涉及临床样本、大鼠模型和细胞研究 NA 单细胞测序 NA NA
908 2026-03-29
Cell Differentiation of DPSCs Infected With Different Periodontal Pathogens
2026-Jan, Oral diseases IF:2.9Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探究了两种牙周病原体(牙龈卟啉单胞菌和牙周二氧化碳嗜纤维菌)对人牙髓干细胞亚群分化的不同影响 首次在单细胞分辨率下揭示了不同牙周病原体对牙髓干细胞亚群分化的特异性调控作用,并识别出对特定病原体有独特反应的细胞亚群 研究样本来源于健康供体,未考虑临床患者个体差异;体外感染模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 探究牙周病原体感染对牙髓干细胞分化的影响机制 人牙髓干细胞 单细胞组学 牙周病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 健康供体来源的牙髓干细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
909 2026-03-28
Integration of imaging-based and sequencing-based spatial omics mapping on the same tissue section via DBiTplus
2026-Jan-15, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为DBiTplus的新型整合多模态空间组学方法,可在同一组织切片上结合测序型空间转录组学与多重蛋白成像技术 开发了DBiTplus整合工作流程,首次实现同一组织切片上测序型空间转录组与多重蛋白成像的同步分析,并采用RNase H介导的cDNA回收技术以保留组织架构 方法在极具挑战性的临床样本(如FFPE组织)中的全面性能仍需进一步验证 开发一种整合成像与测序的空间组学映射技术,以在单细胞分辨率下探索细胞异质性和功能 冷冻小鼠胚胎、福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的人体淋巴结及淋巴瘤组织 空间组学 淋巴瘤 空间条形码技术、RNase H介导的cDNA回收、多重蛋白成像、空间转录组学 NA 空间转录组数据、蛋白成像数据 多种样本类型,包括小鼠胚胎和人类淋巴组织 NA 空间转录组学, 多重蛋白成像 DBiTplus DBiTplus整合工作流程,支持测序型空间转录组学与成像型蛋白分析在同一组织切片上进行
910 2026-03-27
LLOT: application of Laplacian Linear Optimal Transport in spatial transcriptome reconstruction
2026-Jan-06, Biometrics IF:1.4Q2
研究论文 本文提出了一种名为LLOT的可解释方法,用于整合单细胞和空间转录组学数据,以在全基因组和单细胞分辨率下重建缺失的空间信息 LLOT通过迭代校正平台效应并利用拉普拉斯最优传输,将空间转录组学数据中的每个点分解为空间平滑的单细胞概率混合,提供了一种可解释且通用的框架 NA 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,以重建组织中的空间基因表达和推断细胞位置 单细胞RNA测序数据和空间转录组学数据(如原位杂交、Slide-seq、10x Visium和Visium HD) 空间转录组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学技术(如原位杂交、Slide-seq、10x Visium、Visium HD) 拉普拉斯线性最优传输(LLOT) 基因表达数据(包括单细胞和空间数据) NA 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium, Visium HD 10x Visium和Visium HD用于空间转录组学测量
911 2026-03-27
Screening and molecular functional analysis of telomere-related genes in abdominal aortic aneurysms based on bioinformatics
2026, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过生物信息学方法筛选并分析了腹主动脉瘤中端粒相关基因的分子特征,以识别潜在的治疗靶点 结合WGCNA、LASSO、SVM算法及单细胞RNA-seq数据,系统鉴定出KLF15和ZBTB16作为腹主动脉瘤的关键生物标志物,并验证了其在免疫炎症调控中的作用 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,实验验证仅限于体外细胞模型,缺乏体内动物模型或临床样本的进一步验证 探究腹主动脉瘤中端粒相关分子的特征,为开发治疗药物提供潜在靶点 腹主动脉瘤患者与正常对照的RNA表达数据及单细胞RNA-seq数据 生物信息学 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, Western blot, ELISA, 流式细胞术, Trans-well实验 WGCNA, LASSO, SVM 基因表达数据, 单细胞数据 基于公共数据集GSE57691和GSE237230,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
912 2026-03-27
Cochlear macrophage CD74 enhances the apoptosis of senescent cochlear hair cells by down-regulating MIF
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过分析小鼠耳蜗单细胞测序数据,揭示了巨噬细胞CD74通过下调MIF促进衰老耳蜗毛细胞凋亡的新机制 首次发现衰老耳蜗中巨噬细胞CD74表达上调,并通过与MIF相互作用降低局部MIF水平,从而削弱MIF对衰老听觉细胞的保护作用,促进其凋亡 研究主要基于HEI-OC1细胞模型和小鼠数据,尚未在人体组织中得到验证,且具体信号通路机制有待进一步阐明 探究年龄相关性听力损失的细胞分子机制,特别是巨噬细胞在耳蜗衰老过程中的作用 C57BL/6J小鼠的耳蜗组织、HEI-OC1听觉细胞系、BV2小胶质细胞系 单细胞生物学 年龄相关性听力损失 单细胞RNA测序 细胞共培养模型 单细胞转录组数据、细胞实验数据 不同年龄段的C57BL/6J小鼠耳蜗组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
913 2026-03-25
Single-cell sequencing and network pharmacology coupled with molecular docking and experimental validation reveal the effects of YPFS on macrophages in stage I non-small cell lung cancer
2026-Jan-27, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究结合单细胞测序、网络药理学、分子对接和实验验证,揭示了玉屏风散(YPFS)对I期非小细胞肺癌(NSCLC)中巨噬细胞的影响 首次将单细胞测序与网络药理学、分子对接及实验验证相结合,系统研究了传统中药玉屏风散(YPFS)对NSCLC肿瘤微环境中巨噬细胞亚群极化的调控作用,并鉴定出关键靶点AHSA1及活性成分槲皮素 研究主要聚焦于I期NSCLC,未涵盖更晚期肿瘤;分子对接和体外实验的发现需进一步的体内实验和临床研究验证 探究I期非小细胞肺癌(NSCLC)肿瘤微环境中巨噬细胞的异质性,并评估传统中药玉屏风散(YPFS)对其极化的调控作用及潜在治疗价值 I期非小细胞肺癌(NSCLC)患者的肿瘤组织样本(用于单细胞测序),以及巨噬细胞系(用于实验验证) 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),网络药理学,分子对接,体外细胞实验 NA 单细胞转录组数据,化合物结构数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
914 2026-03-25
Acute Phase Response-driven Hepatic Niche Remodeling Promotes Fibrosis Resolution After Alcohol Cessation
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,探究了酒精戒断后急性期反应驱动的肝微环境重塑如何促进纤维化消退的机制 首次通过空间转录组学识别了酒精戒断后肝内独特的纤维生成与纤维溶解微环境,并揭示了血清淀粉样蛋白A(SAA)通过HDL介导的巨噬细胞摄取促进纤维化消退的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;空间转录组学数据可能受技术分辨率限制;未全面评估长期戒断效果 探究酒精戒断后酒精相关性肝病(ALD)纤维化消退的分子与细胞机制 酒精相关性肝病(ALD)小鼠模型及人类肝组织样本 空间转录组学 酒精相关性肝病 空间转录组学、体外细胞分析、基因敲除模型 小鼠疾病模型 空间转录组学数据、基因表达数据 未明确指定样本数量,但涉及小鼠模型和人类肝样本 Nanostring 空间转录组学 CosMx 1000-plex CosMx空间转录组学检测
915 2026-03-25
Proteasome Assembly Chaperone 3 Defines Metabolic-Immune Programs and Poor Prognosis in Breast Cancer via Multi-Omics Approaches
2026, Journal of Cancer IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过整合多组学方法,揭示了蛋白酶体组装伴侣PSMG3在乳腺癌中的关键作用,其高表达与不良预后、代谢重编程及肿瘤免疫微环境特征相关 首次系统性地将PSMG3家族基因与乳腺癌的代谢-免疫程序及临床预后联系起来,并利用多队列基因组学、转录组学及单细胞RNA测序数据进行综合分析 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本数据来源于公共数据库,可能存在批次效应或选择偏倚 探究PSMG家族基因在乳腺癌中的作用,特别是PSMG3与临床预后、代谢通路及肿瘤免疫微环境的关系 乳腺癌患者的多组学数据,包括TCGA-BRCA、METABRIC及多个NCBI GEO队列 生物信息学 乳腺癌 RNA测序、单细胞RNA测序、基因集富集分析、免疫浸润分析、分子对接 生物信息学分析模型(如CIBERSORT、TIMER) 基因组数据、转录组数据 多个乳腺癌队列(具体样本数未明确说明) NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
916 2026-03-25
NUP85 as a Pan-Cancer Immune Biomarker: Integrated Multi Omics and Functional Analyses Reveal Its Role in Tumor Prognosis
2026, ImmunoTargets and therapy IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过多组学分析和功能验证,探讨NUP85作为泛癌免疫生物标志物在肿瘤预后中的作用 首次全面整合多组学数据和功能实验,揭示NUP85在肿瘤免疫和预后中的关键作用,特别是在增殖性T细胞中的表达特征 研究主要基于公共数据库和细胞系实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接验证 阐明NUP85在癌症发病机制中的潜在作用,探索其作为肿瘤标志物的价值 多种肿瘤类型,重点关注肺腺癌和口腔鳞状细胞癌的细胞系 生物信息学 泛癌研究 多组学分析,包括转录组、蛋白质组、表观遗传组和单细胞测序 NA 多组学数据,包括基因表达、蛋白质表达、甲基化、拷贝数变异等 基于TCGA、GTEx、CPTAC等多个公共数据库的大规模样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,多组学分析 NA NA
917 2026-03-25
Integrative Multi-Omics and Single-Cell Profiling Identify Chitinase Domain Containing Protein 1 (CHID1) as a Prognostic Biomarker in Glioblastoma
2026, Journal of Cancer IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过整合多组学和单细胞分析,鉴定CHID1作为胶质母细胞瘤的预后生物标志物 首次全面探索CHID1在胶质母细胞瘤中的表达模式及其与代谢和氧化还原相关通路的关联 研究主要基于生物信息学分析,缺乏深入的实验验证 探究CHID1在胶质母细胞瘤中的表达、功能及其作为预后标志物的潜力 胶质母细胞瘤患者样本及正常脑组织 生物信息学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、转录组学分析、分子对接 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 TCGA-GBM和CGGA数据集中的胶质母细胞瘤样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
918 2026-03-25
Spatial Omics in Gastrointestinal Oncology: Recent Advances, Therapeutic Insights, and Clinical Translation
2026, Journal of Cancer IF:3.3Q2
综述 本文综述了空间组学技术在胃肠道肿瘤学中的最新进展、治疗见解及临床转化应用 整合了空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学和表观基因组学等多组学技术,以高分辨率解析肿瘤微环境,揭示空间定义的生态位,为个性化治疗提供新视角 面临标准化、数据整合和临床验证等挑战,尚未完全融入常规肿瘤学实践 探讨空间组学技术在胃肠道肿瘤诊断、治疗分层和疗效监测中的应用潜力 胃肠道癌症,包括结直肠癌、胃癌和食管癌 数字病理学 胃肠道癌症 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间代谢组学、空间表观基因组学 NA 空间多组学数据 NA NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学, 空间表观基因组学 NA NA
919 2026-03-25
Mapping Myeloid Cell Diversity in Diffuse Large B-Cell Lymphoma: Impact on T Cell Exhaustion and Clinical Prognosis
2026, Journal of Cancer IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞测序技术分析了超过3000名弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的免疫微环境,揭示了恶性B细胞和髓系细胞的多样性及其与临床预后的关联 利用单细胞测序技术大规模描绘DLBCL肿瘤微环境中的髓系细胞多样性,并发现巨噬细胞与CD8 T细胞间的相互作用可能导致T细胞耗竭,为免疫抑制微环境提供了新见解 研究主要基于单细胞和RNA表达微阵列数据的回顾性分析,缺乏实验验证和前瞻性临床研究 研究弥漫性大B细胞淋巴瘤肿瘤微环境中的免疫细胞多样性及其对临床预后的影响 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者肿瘤组织中的恶性B细胞和髓系细胞 数字病理学 弥漫性大B细胞淋巴瘤 单细胞测序,RNA表达微阵列 NA 单细胞数据,RNA表达数据 超过3000名DLBCL患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
920 2026-03-24
SAMSN1 restrains NK cell mediated anti-tumor immunity in hepatocellular carcinoma
2026-01-21, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文发现SAMSN1作为肝癌中NK细胞功能的新型免疫检查点,抑制其活性并影响抗肿瘤免疫 首次识别SAMSN1为肝癌中NK细胞功能的关键调节因子,并证明其特异性缺失可增强抗肿瘤免疫 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据,人类样本验证和临床转化潜力需进一步探索 探究SAMSN1在肝癌微环境中对NK细胞功能的调控机制及其作为免疫治疗靶点的潜力 肝癌患者样本、小鼠肝癌模型(Hepa1-6)及NK细胞 免疫学 肝癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部