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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2026-04-02 |
Stereo-Seq Transcriptomics in Arabidopsis Leaves in Response to Salicylic Acid
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5214-5_12
PMID:41917665
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研究论文 | 本文描述了一个完整的Stereo-seq工作流程,用于研究拟南芥叶片在响应水杨酸处理时的空间转录组变化 | 首次将Stereo-seq技术应用于拟南芥叶片响应水杨酸的空间转录组研究,并提供了从样本制备到数据分析的完整工作流程 | 未明确说明样本数量,且工作流程可能受特定平台限制 | 研究拟南芥叶片在响应水杨酸处理时的空间转录组变化 | 拟南芥叶片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | STOmics, MGI | 空间转录组学 | STOmics V1.3 1 × 1 cm芯片, DNBSEQ平台 | STOmics V1.3 1 × 1 cm芯片用于文库构建,DNBSEQ平台用于测序 |
| 882 | 2026-04-02 |
APOE and CCR2: Potential Macrophage-Specific Biomarkers in the Rheumatoid Arthritis Synovial Microenvironment Identified by Bioinformatics and Experimental Verification in Murine Models
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S587712
PMID:41918589
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,在类风湿关节炎滑膜微环境中识别出APOE和CCR2作为潜在的巨噬细胞特异性生物标志物 | 结合批量与单细胞RNA-seq数据,识别出在滑膜巨噬细胞中特异性高表达并与炎症反应相关的枢纽基因APOE和CCR2,并通过实验验证了其表达调控 | 需要进一步研究以阐明APOE和CCR2在类风湿关节炎中的具体作用机制 | 识别类风湿关节炎中巨噬细胞特异性的枢纽基因并研究其生物学功能 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织及小鼠RAW264.7细胞系 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, ELISA, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 883 | 2026-04-02 |
Editorial: Unraveling breast cancer complexity: insights from single-cell sequencing and spatial transcriptomics
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1816191
PMID:41918756
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 884 | 2026-04-02 |
Identification of a GPR182-postive stem cell population that drives polyp progression in familial adenomatous polyposis
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20704
PMID:41918858
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据分析,识别了家族性腺瘤性息肉病中驱动息肉异质性的关键细胞亚群——GPR182阳性息肉干细胞 | 首次在家族性腺瘤性息肉病中鉴定出GPR182阳性息肉干细胞,并揭示其在驱动息肉异质性、免疫逃逸及预后和药物反应预测中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据分析,缺乏前瞻性临床验证,且功能验证实验可能有限 | 解析家族性腺瘤性息肉病中息肉进展的异质性,以识别新的治疗靶点和生物标志物 | 家族性腺瘤性息肉病患者的单细胞和批量转录组数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞测序,批量转录组测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 涉及多个公共数据集(GSE109308等),具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 885 | 2026-04-02 |
Elevated growth differentiation factor-15 in sepsis: clinical associations and immune cell context
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1789747
PMID:41918885
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研究论文 | 本研究探讨了脓毒症患者血清中生长分化因子-15(GDF-15)水平的升高情况,及其与疾病严重程度、器官功能障碍和炎症活动的关联,并利用单细胞RNA测序数据分析了GDF15在免疫细胞中的表达模式 | 首次在脓毒症中结合临床血清GDF-15测量与公开的单细胞转录组数据,系统描述了GDF-15与疾病严重程度的关联及其在特定免疫细胞(浆细胞和单核细胞)中的表达富集,为理解其在危重疾病中的生物学背景提供了新见解 | 研究样本量较小(脓毒症患者n=19,健康对照n=23),为探索性观察研究,需要更大规模、特征明确的队列进行验证 | 阐明脓毒症中GDF-15的临床关联及其在免疫细胞中的表达背景,评估其作为反映系统生物应激的潜在生物标志物的价值 | 成人脓毒症患者和健康对照者的血清样本,以及公开的单细胞RNA测序数据集(GSE217906)中的免疫细胞 | NA | 脓毒症 | 酶联免疫吸附试验(ELISA),单细胞RNA测序数据分析 | NA | 血清蛋白浓度数据,单细胞转录组数据 | 临床队列:脓毒症患者19例,健康对照23例;生物信息学分析:公开数据集GSE217906 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 886 | 2026-04-02 |
Noninvasive assessment of core metastatic genes in lung adenocarcinoma: development of a predictive model integrating single-cell transcriptomics and radiomics
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1784914
PMID:41919253
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和CT影像组学,识别了肺腺癌转移的关键分子驱动基因,并开发了一个非侵入性的影像预测模型 | 创新性地结合单细胞RNA测序和CT影像组学来识别肺腺癌转移的核心基因并构建预测模型,实现了分子表型与影像特征的关联 | 研究基于公共数据库数据,可能需要进一步的前瞻性临床验证来确认模型的泛化能力 | 开发一个非侵入性的预测模型,用于评估肺腺癌的转移潜能和预后 | 肺腺癌(LUAD)患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CT影像组学、免疫组织化学(IHC)、RT-qPCR | LASSO回归、影像组学模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、CT影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 887 | 2026-01-23 |
Building consensus: construction of a juvenile and adult scRNA-seq meta-atlas for dataset comparisons and harmonizing transcriptomic definitions of enteric neuron subtypes
2026-Jan-22, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12283-5
PMID:41566221
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 888 | 2026-04-01 |
Ovarian hormone deficiency enhances wood smoke-induced immune dysfunction via transcriptomic and metabolic alterations
2026-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.14.699504
PMID:41648465
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探究了卵巢激素缺乏如何加剧木材烟雾暴露诱导的骨髓免疫功能障碍,揭示了相关的转录组学和代谢改变机制 | 首次在卵巢激素缺乏背景下,结合单细胞RNA测序和功能验证,系统揭示了木材烟雾暴露对骨髓免疫细胞的特定影响,并发现了免疫-代谢解耦这一新机制 | 研究主要聚焦于卵巢切除小鼠模型,未涉及其他激素缺乏状态或人类样本;功能验证主要在骨髓来源巨噬细胞中进行,体内整体免疫表型验证有限 | 探究卵巢激素缺乏是否增加对木材烟雾诱导的免疫功能障碍的易感性,并阐明其分子机制 | 卵巢切除(OVX)小鼠和假手术(Sham)小鼠的骨髓免疫细胞及骨髓来源巨噬细胞 | 单细胞组学 | 免疫功能障碍 | 单细胞RNA测序,代谢功能测定,巨噬细胞极化分析 | NA | 单细胞转录组数据,功能测定数据 | 卵巢切除和假手术小鼠,暴露于过滤空气或木材烟雾 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 889 | 2026-04-01 |
Endothelial CEPT1 Promotes Angiogenesis Through PPARα and VEGF-A Signaling
2026-Jan, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323302
PMID:41263082
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研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞CEPT1通过PPARα和VEGF-A信号通路促进血管生成的作用 | 首次揭示了CEPT1在糖尿病背景下通过PPARα和VEGF-A信号通路促进缺血后血管生成和恢复的机制,并利用单细胞RNA测序技术进行了验证 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,在人体中的直接功能验证尚不充分,且糖尿病模型的复杂性可能影响结果的普适性 | 探究CEPT1在糖尿病背景下促进缺血后血管生成和恢复的分子机制 | 人类外周动脉疾病患者的外周动脉样本、条件性内皮细胞特异性Cept1过表达小鼠、小鼠主动脉和内皮细胞 | 分子生物学与血管生物学 | 糖尿病与心血管疾病 | 单细胞RNA测序、分子通路分析、基因工程小鼠模型 | 条件性基因过表达小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、功能实验数据 | 人类患者外周动脉样本(具体数量未明确)、C57BL/6J背景的基因工程小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 890 | 2026-04-01 |
A unique microglia subset associated with aggressive α-synucleinopathy uncovered in a rapidly progressive multiple system atrophy cerebellar type model
2026-01, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.107206
PMID:41325908
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研究论文 | 本研究通过建立快速进展型多系统萎缩小脑型小鼠模型,发现了一种与侵袭性α-突触核蛋白病相关的独特小胶质细胞亚群 | 首次在快速进展的MSA-C模型中鉴定出一个表达Tlr2、Tgm2、Msr1等基因的独特促炎性小胶质细胞亚群,该亚群位于p-α-syn聚集物附近,且不同于以往报道的保护性疾病相关小胶质细胞和边界相关巨噬细胞 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本仅来自6例尸检病例,样本量较小;CSF1R抑制剂BLZ945的预防性给药加剧了疾病表型,其治疗时间窗和剂量效应需进一步探索 | 探究多系统萎缩小脑型(MSA-C)的病理机制,特别是小胶质细胞在疾病进展中的作用 | MSA-C小鼠模型(Tet-Off系统诱导少突胶质细胞特异性过表达人A53T α-syn)以及6例人类MSA-C尸检病例 | 数字病理学 | 多系统萎缩 | 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型(Tet-Off诱导型) | 单细胞转录组数据、组织病理学数据 | 小鼠模型队列及6例人类MSA-C尸检病例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 891 | 2026-04-01 |
Identification of CXCL12 as a key gene of trophoblast and endometrial stromal cell decidualization in pregnancy via scRNA-seq and experimental validation
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1768015
PMID:41696581
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和实验验证,探讨了CXCL12在复发性流产中母胎界面的作用及其机制 | 利用单细胞RNA测序技术构建正常与复发性流产样本的母胎界面单细胞图谱,首次系统分析了CXCL12在滋养层细胞和子宫内膜基质细胞蜕膜化中的关键作用 | 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;样本量可能有限,需要更大规模临床样本验证 | 探究CXCL12在复发性流产发病机制中的作用,为潜在诊断和治疗策略提供实验依据 | 正常和复发性流产妊娠早期母胎界面组织样本、HTR-8/SVneo滋养层细胞系、子宫内膜基质细胞 | 单细胞组学 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序、MTT法、细胞划痕实验、Transwell侵袭实验 | NA | 单细胞RNA测序数据、细胞功能实验数据 | 正常和复发性流产妊娠早期母胎界面组织样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 892 | 2026-04-01 |
GenX-associated molecular signatures overlap with testicular aging and male infertility: a multi-omics integration analysis
2026, Journal of environmental science and health. Part A, Toxic/hazardous substances & environmental engineering
DOI:10.1080/10934529.2026.2640332
PMID:41797399
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析,揭示了GenX(一种PFAS替代物)暴露与睾丸衰老及男性不育相关的分子特征重叠 | 首次将GenX相关基因与衰老相关基因整合构建基因集,并结合单细胞RNA测序、机器学习算法及分子对接技术,系统揭示了GenX诱导生殖毒性的关键分子机制和候选生物标志物 | 研究主要基于公共数据集和动物模型验证,缺乏大规模人群队列的直接证据;分子对接结果需进一步实验验证 | 探究GenX暴露对男性生殖系统的毒性作用机制,并寻找相关的生物标志物 | 人类睾丸衰老的单细胞RNA测序数据、男性不育转录组数据集、GenX暴露的大鼠睾丸组织 | 生物信息学 | 男性不育 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组分析、RT-qPCR、分子对接 | LASSO回归、支持向量机递归特征消除(SVM-RFE) | 基因表达数据 | 人类睾丸衰老数据集(GSE254315)、男性不育数据集(GSE45885/GSE45887)、GenX暴露的大鼠睾丸组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 893 | 2026-04-01 |
PFKFB2-Induced Glycolysis and Ferroptosis in Diabetic Nephropathy by HIF-1α
2026, Critical reviews in eukaryotic gene expression
IF:1.5Q4
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研究论文 | 本研究探讨了PFKFB2在糖尿病肾病中的作用及其通过HIF-1α调控糖酵解和铁死亡的分子机制 | 首次揭示了PFKFB2通过抑制HIF-1α泛素化来调控线粒体ROS诱导的铁死亡,从而影响糖尿病肾病进程 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,缺乏临床样本的直接验证 | 探究PFKFB2在糖尿病肾病中的保护作用及其分子机制 | 糖尿病肾病小鼠模型和高糖刺激的人肾近端小管HK-2细胞 | NA | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | DN小鼠模型和HK-2细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 894 | 2026-04-01 |
Syntaxin 4 protects islet β-cells from cytokine-induced senescence
2026, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2026.1725252
PMID:41877925
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研究论文 | 本研究探讨了Syntaxin 4(STX4)在保护胰岛β细胞免受细胞因子诱导的衰老中的作用 | 首次揭示了STX4通过抑制衰老相关转录程序和重塑β细胞分泌组来保护β细胞免受衰老影响 | 研究主要基于体外细胞模型和动物模型,人类样本的直接验证有限 | 探究STX4是否能够减轻糖尿病应激下β细胞的衰老 | MIN6细胞、人类胰岛、小鼠胰岛以及非肥胖糖尿病(NOD)小鼠 | 细胞生物学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序、条件培养基蛋白质组学 | NA | RNA测序数据、蛋白质组学数据 | MIN6细胞、人类胰岛、小鼠胰岛及NOD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 895 | 2026-04-01 |
Single-cell and multi-omics analyses identify CAMP-associated neutrophil remodeling during radiochemotherapy in cervical cancer
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1773562
PMID:41878161
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研究论文 | 本研究通过单细胞和多组学分析,探讨了CAMP在宫颈癌进展及放化疗期间对中性粒细胞重塑的关键调控作用 | 首次在单细胞水平揭示了CAMP介导的中性粒细胞亚群在宫颈癌放化疗过程中的动态变化及其对肿瘤免疫微环境的重塑机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏大规模临床队列验证,且体内功能机制仍需进一步探索 | 探究宫颈癌进展及放化疗过程中关键基因及免疫微环境动态,特别关注CAMP介导的中性粒细胞调控 | 宫颈癌组织、中性粒细胞亚群、肿瘤微环境中的细胞间通讯网络 | 单细胞组学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、转录组数据分析、功能富集分析、伪时间轨迹分析、细胞间通讯分析 | Cox回归模型、差异表达分析模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 整合TCGA、GTEx和GEO数据库的转录组数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 896 | 2026-04-01 |
Integrative Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis Reveals MAIT Cell Dysfunction in Relapsed HCC
2026, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S575861
PMID:41878224
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了复发肝细胞癌中MAIT细胞的功能失调及其与恶性肝细胞表型的关联 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统性地描述了复发肝细胞癌中MAIT细胞的转录组和空间特征,并发现其与恶性肝细胞干性增强及患者不良预后相关 | 样本量较小(原发性HCC n=3,复发性HCC n=2),且为观察性研究,需要进一步的功能实验验证MAIT细胞在复发HCC中的具体作用机制 | 旨在表征复发肝细胞癌中MAIT细胞的转录组和空间特征,并探讨其与恶性肝细胞表型的关联 | 肝细胞癌患者的肿瘤样本,包括原发性(n=3)和复发性(n=2)HCC | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Seurat, Harmony | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 5例HCC患者肿瘤样本(原发性3例,复发性2例),共49,229个细胞,35个感兴趣区域 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 897 | 2026-04-01 |
Metabolic profiling of the TME uncovers the contrasting impacts of CKMT2 and PDE2A in CRC progression and therapeutic response
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1732137
PMID:41878336
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研究论文 | 本研究通过转录组数据和生物信息学方法,探索了结直肠癌中代谢重编程与肿瘤微环境的相互作用,识别了基于代谢和微环境的CRC亚型及候选生物标志物 | 首次将PDE2A和CKMT2鉴定为区分CRC亚型的关键代谢生物标志物,揭示了它们与不同肿瘤微环境组成和预后的关联 | 研究主要基于公共数据库和生物信息学分析,实验验证仅限于免疫组化,缺乏更深入的体内外功能验证 | 探索结直肠癌中代谢重编程与肿瘤微环境的相互作用,识别CRC亚型及候选生物标志物 | 结直肠癌组织样本和公共转录组数据集 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组测序、免疫组化、单细胞RNA测序 | 共识聚类分析 | 基因表达数据、临床数据 | 来自TCGA COAD、READ及六个GEO CRC数据集的多中心样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 898 | 2026-04-01 |
AI-derived prognostic model identifies high-risk gene signatures in pediatric gliomas
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1704720
PMID:41878416
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研究论文 | 本研究应用AI衍生的预后指数模型分析儿童胶质瘤转录组数据,识别关键基因特征以改进预后预测 | 首次将AIDPI模型应用于儿童胶质瘤,识别出9个跨数据集一致的关键预后基因,并构建了优于30个现有模型的机器学习预后模型 | 研究主要基于转录组数据,临床验证和功能机制研究尚需进一步深入 | 通过AI和转录组数据整合,改进儿童胶质瘤的预后模型,指导个性化治疗策略 | 儿童胶质瘤患者,包括低级别和高级别胶质瘤 | 机器学习 | 儿童胶质瘤 | 转录组分析,单细胞RNA-seq | 机器学习模型 | 转录组数据,单细胞RNA-seq数据 | 多个儿童胶质瘤数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 899 | 2026-04-01 |
Dysregulated NK-cell gene expression defines the enduring symptoms of long COVID-19
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1720551
PMID:41878441
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了长新冠患者中NK细胞的失调及其与持久症状的关联 | 首次通过单细胞转录组学结合流式细胞术,系统性地鉴定了长新冠患者中NK细胞的定量和功能缺陷,并发现了与神经感觉通路抑制相关的转录重编程 | 样本量相对有限,且主要为观察性研究,需要更大规模的前瞻性队列验证 | 探究长新冠综合征的免疫学机制,特别是NK细胞在其中的作用 | 健康对照、新冠康复者及长新冠患者的血浆抗体、细胞因子和外周血单个核细胞 | 免疫学 | 长新冠综合征 | 多参数流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据 | 血浆样本:健康对照66例、康复者24例、长新冠患者94例;流式细胞术:健康对照9例、康复者6例、长新冠患者23例;单细胞RNA测序:健康对照8例、康复者6例、长新冠患者32例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 900 | 2026-04-01 |
Identification of PANoptosis hub genes driving immune activation and tubulointerstitial injury in diabetic kidney disease by integrative bioinformatics and machine learning
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1759781
PMID:41878449
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法,识别了驱动糖尿病肾病免疫激活和肾小管间质损伤的PANoptosis枢纽基因 | 首次在糖尿病肾病中系统性地定义了PANoptosis(整合焦亡、凋亡和坏死性凋亡的协调程序)的作用,并利用多算法机器学习识别了关键枢纽基因和风险评分 | 研究主要基于转录组数据,功能验证主要在动物模型中进行,临床转化需要进一步验证 | 阐明PANoptosis在糖尿病肾病肾小管间质损伤中的作用,并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 糖尿病肾病患者的肾小管间质转录组数据、单细胞RNA-seq数据以及糖尿病小鼠模型 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 加权基因共表达网络分析, 机器学习算法 | 转录组数据 | 多个糖尿病肾病和对照队列的肾小管间质转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |