单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202601] [清除筛选条件]
当前共找到 1234 篇文献,本页显示第 881 - 900 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
881 2026-01-12
Generation of human pineal gland organoids with melatonin production for disease modeling
2026-Jan-08, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究开发了人类松果体类器官,用于模拟松果体发育和功能,并应用于疾病建模 首次从多能干细胞生成人类松果体类器官,模拟松果体发育和褪黑素生产,并用于Angelman综合征等疾病建模 人类组织获取困难,研究依赖于干细胞模型,可能无法完全复制体内复杂性 研究松果体发育、昼夜节律调节及其在神经发育和睡眠相关疾病中的破坏 人类松果体类器官、Angelman综合征患者来源的iPSCs、松果体切除小鼠 数字病理学 神经发育障碍 单细胞RNA测序 NA RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
882 2026-01-12
Cumulative environmental exposures adversely impact social behaviour and are associated with dysregulation of genes and proteins involved in epigenetic, ribosomal, and immune regulation in male mice
2026-Jan-08, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.] IF:4.8Q2
研究论文 本研究通过开发一种新型“三重打击”小鼠模型,探究了累积环境暴露对后代行为和大脑及外周免疫系统中炎症相关分子特征的影响 开发了结合孕前社会压力、产前高脂饮食和产后免疫挑战的“三重打击”小鼠模型,并利用单细胞RNA测序和蛋白质组学揭示了雄性特异性行为缺陷与炎症、核糖体通路改变之间的关联 研究结果仅为初步假设,需要独立验证以确认其机制意义,且样本量有限(N=70) 研究累积环境暴露如何影响后代行为和大脑及外周免疫系统的炎症相关分子特征 C57Bl/6JAusB小鼠(N=70)及其后代,重点关注雄性三重打击后代 神经科学 神经发育障碍 单细胞RNA测序(scRNA-seq),蛋白质组学 NA 基因表达数据,蛋白质丰度数据 70只C57Bl/6JAusB小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
883 2026-01-12
Spatial multi-omics mapping of tumor microanatomy dynamics following radiotherapy combined with targeted-immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2026-Jan-08, Biomarker research IF:9.5Q1
研究论文 本研究利用空间多组学技术,揭示了靶向-免疫-放疗三联疗法在晚期肝细胞癌中重塑肿瘤微环境的时空动态与细胞机制 首次在晚期肝细胞癌中,结合单细胞空间转录组学和空间蛋白质组学,构建了高分辨率的整合多组学图谱,以空间分辨率阐明了三联疗法诱导的肿瘤微环境重塑机制,特别是细胞毒性免疫细胞与抑制性免疫成分的空间分离现象 是一项回顾性临床队列研究,样本量有限,且主要针对伴有门静脉癌栓的晚期肝细胞癌患者 探究靶向-免疫-放疗三联疗法在晚期肝细胞癌中的疗效及重塑肿瘤微环境的时空与细胞机制 晚期肝细胞癌患者,特别是伴有门静脉癌栓的患者 数字病理学 肝细胞癌 单细胞空间转录组学,空间蛋白质组学 NA 空间多组学数据(转录组、蛋白质组) NA NA 单细胞空间转录组学,空间蛋白质组学 NA NA
884 2026-01-12
Bovine formative embryonic stem cell plasticity in embryonic and extraembryonic differentiation
2026-Jan-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
研究论文 本文报道了牛形成性胚胎干细胞(bFSCs)的生成,这些细胞在体外和体内均具有多能性,并能高效分化为神经祖细胞和原始生殖细胞样细胞 首次生成了具有独特形态和完全分化能力的牛形成性胚胎干细胞,展示了其在胚胎和胚胎外组织中的双重发育可塑性 未明确说明bFSCs在长期培养中的稳定性或其在更广泛疾病模型中的应用限制 研究牛胚胎干细胞的发育可塑性,以促进对牛胚胎发育的理解及农业生物技术应用 牛形成性胚胎干细胞(bFSCs) 发育生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组分析 NA 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 未明确指定样本数量,但涉及牛和小鼠胚胎的嵌合实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
885 2026-01-12
The dorsal aortic compartment is a developmental source of brown adipose tissue in mice
2026-Jan-07, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了小鼠棕色脂肪组织的一个非体节性发育来源,即背主动脉区室的多能间充质祖细胞 发现背主动脉区室是肩胛下、外侧、颈部和主动脉周围棕色脂肪组织的部分来源,挑战了传统认为棕色脂肪组织仅来源于体节中胚层的观点 研究主要基于小鼠模型,未在人类或其他物种中验证,且对背主动脉祖细胞的具体分化机制和调控网络仍需进一步探索 探究小鼠棕色脂肪组织的发育起源,特别是非体节性来源 小鼠胚胎发育过程中的背主动脉区室细胞及棕色脂肪组织 发育生物学 NA 单细胞测序,遗传谱系追踪 NA 单细胞测序数据,遗传谱系数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
886 2026-01-12
BRRIAR lncRNA alters breast cancer risk by modulating interferon signaling in cis and in trans
2026-Jan-07, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本研究功能性表征了乳腺癌相关长链非编码RNA BRRIAR,揭示了其通过顺式和反式作用调节干扰素信号通路,从而影响乳腺癌风险和治疗潜力 首次发现BRRIAR作为3p26乳腺癌风险区域的关键靶基因,通过核内顺式调节BHLHE40表达和胞质内反式结合RIG-I受体,双重机制激活干扰素信号,为lncRNA在肿瘤免疫中的调控作用提供了新见解 研究主要基于ER+乳腺癌模型,在其他乳腺癌亚型或实体瘤中的普适性尚未验证;体内实验采用异种移植模型,可能无法完全模拟人类肿瘤微环境 探究BRRIAR lncRNA在乳腺癌发生发展中的作用机制及其作为治疗靶点的潜力 雌激素受体阳性乳腺癌细胞、乳腺癌异种移植模型、人外周血单个核细胞 肿瘤免疫学 乳腺癌 qPCR、原位杂交、CRISPR干扰、染色质相互作用分析、ChIP测序、CRISPR-Cas9全基因组筛选、RNA测序、RNA pull-down结合质谱分析、流式细胞术、细胞因子谱分析 NA 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质互作数据 ER+乳腺癌细胞系、乳腺癌异种移植模型、人外周血单个核细胞样本 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
887 2026-01-12
CellMap: precision mapping of cellular landscape in spatial transcriptomics
2026-Jan-05, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CellMap的计算工具,用于将空间转录组学数据解析至单细胞分辨率 结合种子基因共线性、随机森林模型和线性分配算法,实现单细胞到空间点的最优分配,并在多种平台和组织类型中表现优于现有方法 NA 开发一种计算工具以提高空间转录组学数据的解析精度 空间转录组学数据中的细胞 计算生物学 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 随机森林模型 空间转录组学数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
888 2026-01-12
Extracellular vesicles secreted by LRP1+ ligament-derived stem cells promote tendon-bone healing after ACL reconstruction via miR-708-5p/Bambi axis
2026-Jan-03, Biomaterials IF:12.8Q1
研究论文 本研究揭示了LRP1阳性韧带源性干细胞分泌的细胞外囊泡通过miR-708-5p/Bambi轴促进前交叉韧带重建后腱骨愈合的机制 首次在单细胞水平鉴定了具有更强干性和成软骨分化潜能的LRP1阳性韧带源性干细胞亚群,并发现其分泌的细胞外囊泡通过miR-708-5p靶向抑制Bambi激活BMP信号通路,为腱骨愈合提供了新的无细胞治疗策略 研究主要基于大鼠模型,其结论在人体中的有效性有待进一步验证;细胞外囊泡的具体作用机制和最佳递送方案仍需深入探索 探究LRP1阳性韧带源性干细胞来源的细胞外囊泡促进前交叉韧带重建后腱骨愈合的分子机制 人前交叉韧带残端样本、大鼠前交叉韧带重建模型、LRP1阳性韧带源性干细胞及其分泌的细胞外囊泡 单细胞组学 运动系统损伤 单细胞RNA测序、miRNA测序 动物模型 单细胞转录组数据、miRNA表达数据 未明确说明具体样本数量,涉及人ACL残端样本和大鼠ACLR模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
889 2026-01-12
The mechanism of Akkermansia muciniphila inhibiting the proliferation of colorectal cancer cells via ferroptosis
2026-Jan, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
研究论文 本研究探讨了Akkermansia muciniphila通过铁死亡途径抑制结直肠癌细胞增殖的机制 首次揭示了Akkermansia muciniphila的代谢物通过诱导铁死亡来抑制结直肠癌细胞增殖的具体机制 研究仅使用Caco-2细胞系进行体外实验,未进行动物模型验证 阐明Akkermansia muciniphila抑制结直肠癌细胞增殖的分子机制 Caco-2结直肠癌细胞系 细胞生物学 结直肠癌 单细胞转录组学分析、流式细胞术、细胞划痕实验 NA 基因表达数据、细胞表型数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
890 2026-01-12
Interplay between Matrix Viscoelasticity and Integrin Engagement Modulates Cancer-Associated Fibroblast States
2026-Jan, Advanced healthcare materials IF:10.0Q1
研究论文 本研究探讨了基质粘弹性和整合素结合如何调节癌症相关成纤维细胞(CAFs)的状态,首次在体外模型中展示了这些因素对CAF可塑性的影响 首次结合基质粘弹性和整合素结合来调控CAF状态,并利用海藻酸水凝胶模型在体外可控地重现CAF异质性 研究基于体外模型,可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 理解CAF亚群的功能并开发CAF靶向治疗策略 癌症相关成纤维细胞(CAFs) 数字病理学 癌症 单细胞转录组学 NA 转录组数据 患者来源的CAFs NA 单细胞RNA-seq NA NA
891 2026-01-12
Single Cell and Spatial Transcriptomics Define a Proinflammatory and Profibrotic Niche After Kidney Injury
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了肾损伤后促炎和促纤维化微环境的形成机制 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学技术,系统描绘了肾纤维化过程中的细胞异质性、空间组织和分子相互作用,并明确了TNC在激活巨噬细胞中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;且未深入探讨其他潜在信号通路的影响 探究肾损伤后促炎和促纤维化微环境的形成机制及其在肾纤维化中的作用 小鼠肾脏组织,特别是单侧缺血再灌注损伤后的正常与纤维化肾脏 数字病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA RNA序列数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
892 2026-01-12
T-Cell Immune Dysfunction and Progression to Severe COVID-19 in Asthma Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2026-Jan, Tuberculosis and respiratory diseases IF:2.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了哮喘患者中T细胞免疫功能障碍与进展为重症COVID-19之间的关联 首次利用单细胞RNA测序技术,在哮喘患者中系统性地分析了COVID-19感染期间免疫细胞动态变化,并识别出T细胞比例减少和细胞毒性CD8+ T细胞比例增加与重症COVID-19相关 样本量较小(共12名患者),特别是哮喘/重症COVID-19组仅1名患者,可能限制结果的普遍性和统计效力 探究哮喘患者中驱动重症COVID-19的免疫信号通路 哮喘和非哮喘的COVID-19患者 数字病理学 COVID-19, 哮喘 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 12名患者(4名哮喘,8名非哮喘),共155,565个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
893 2026-01-12
Realgar-Induced CNS Toxicity: Exploring OTC-Mediated Ornithine Regulation of ZBTB7A Inhibits Astrocyte Glycolysis Based on the Liver-Brain Axis
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究探讨了雄黄诱导中枢神经系统毒性的分子机制,重点关注OTC介导的鸟氨酸通过调节ZBTB7A抑制星形胶质细胞糖酵解的作用 首次基于肝-脑轴揭示了雄黄通过抑制肝脏鸟氨酸转氨酶(OTC)导致鸟氨酸积累,进而调控星形胶质细胞转录因子ZBTB7A,间接加剧砷的神经毒性,并发现大黄酚具有拮抗作用 研究主要基于动物模型和细胞系,临床转化需进一步验证;单细胞转录组测序样本量可能有限,需扩大以增强统计效力 阐明雄黄诱导中枢神经系统毒性的分子机制,为预防和治疗相关神经损伤提供新靶点 条件干预动物模型(Zbtb7a敲低/Otc过表达/大黄酚干预)和C8-D1A星形胶质细胞系 数字病理学 神经系统毒性 单细胞转录组测序、代谢组学分析、神经行为学、分子生物学、组织病理学实验 条件干预动物模型、细胞转染模型 转录组数据、代谢组数据、行为数据、分子数据、病理图像 未明确指定样本数量,涉及动物模型和细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
894 2026-01-12
Deep Learning-Based Quality Control Using Subcellular RNA Spatial Distribution Patterns for Cell Segmentation in Spatial Transcriptomics Data
2026-Jan, Small methods IF:10.7Q1
研究论文 本文提出了一种基于深度学习的质量控制方法,利用亚细胞RNA空间分布模式来评估和改进空间转录组学数据中的细胞分割结果 通过深度神经网络利用不同类型RNA的亚细胞空间分布模式来评估分割细胞的质量,并首次将质量控制与基于Transformer的细胞分割方法结合,自动从训练数据集中移除低质量分割细胞以提高性能 方法主要应用于合成数据和真实Stereo-seq数据,可能在其他空间转录组学技术或数据集中需要进一步验证 提高空间转录组学数据中细胞分割的准确性和质量 空间转录组学数据中的细胞分割结果 数字病理学 NA 空间转录组学 深度神经网络, Transformer 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 Stereo-seq NA
895 2026-01-12
Loss of GNB2L1 promotes expansion of CD74+ dendritic cells and contributes to development of diabetic foot ulcers
2026-Jan, Molecular immunology IF:3.2Q3
研究论文 本研究探讨了GNB2L1基因缺失如何通过促进CD74+树突状细胞扩增来影响糖尿病足溃疡的发展 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了GNB2L1在糖尿病足溃疡中调控CD74+树突状细胞扩增的具体机制 样本量相对较小,仅包含3名非DFU糖尿病患者和4名DFU患者的单细胞数据,以及66名患者的临床样本 探究GNB2L1在糖尿病足溃疡发展中的作用机制 糖尿病患者足部皮肤样本、临床伤口组织、db/db小鼠伤口模型以及患者血液样本中的CD74+树突状细胞 数字病理学 糖尿病足溃疡 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据、临床样本数据 3名非DFU糖尿病患者和4名DFU患者的单细胞数据,36名DFU患者和30名非DFU糖尿病患者的临床组织样本,db/db小鼠伤口模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
896 2026-01-12
Altered somatostatin receptor 3 expression and functional dysregulation in tuberous sclerosis complex
2026-Jan, Progress in neurobiology IF:6.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和电生理学实验,揭示了结节性硬化症中生长抑素信号通路的异常及其对抑制性网络功能的影响 首次在单细胞水平上系统描述了结节性硬化症中生长抑素及其受体在不同脑细胞类型中的表达变化,并通过功能实验揭示了SSTR3受体在疾病中的代偿作用 研究主要基于体外电生理学实验和单细胞测序数据,缺乏在体动物模型的验证 探究生长抑素信号通路在结节性硬化症神经发育障碍中的具体作用和机制 对照和结节性硬化症患者的皮质样本、非洲爪蟾卵母细胞 神经科学 结节性硬化症 单细胞RNA测序、电生理学记录、药理学调控 NA RNA测序数据、电生理学记录数据 未明确说明具体样本数量,涉及对照和TSC皮质样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
897 2026-01-12
Increased TNF-α in SJS/TEN induced by PD-1 inhibitors supports the combination therapy of etanercept and systemic corticosteroids
2026-Jan, Molecular immunology IF:3.2Q3
研究论文 本研究探讨了PD-1抑制剂诱发的SJS/TEN中TNF-α的表达,并评估了依那西普联合全身性皮质类固醇治疗的疗效与安全性 首次在PD-1抑制剂诱发的SJS/TEN中通过单细胞RNA测序证实了TNF-α表达上调,并评估了靶向TNF-α的联合疗法 样本量较小(n=5),且仅对一名患者进行了单细胞RNA测序分析 研究PD-1抑制剂诱发的SJS/TEN的发病机制并探索新的治疗方案 PD-1抑制剂诱发的SJS/TEN患者 数字病理学 皮肤疾病 单细胞RNA测序,免疫荧光染色 NA RNA测序数据,图像数据 5名患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
898 2026-01-12
Soman-induced neurotoxicity in human iPSC-derived cerebral organoids: A whole-transcriptome analysis of ceRNA regulatory networks
2026-Jan, Neurotoxicology IF:3.4Q2
研究论文 本研究利用人诱导多能干细胞衍生的脑类器官模型,结合全转录组测序分析,揭示了梭曼诱导的神经毒性机制,并构建了竞争性内源RNA调控网络 首次在人脑类器官模型中系统评估梭曼的神经毒性,并通过单细胞RNA测序和全转录组分析构建了ceRNA调控网络,识别了关键lncRNAs、miRNAs和mRNAs作为潜在生物标志物和治疗靶点 研究基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内复杂的神经微环境和全身性反应;样本量相对有限;未进行长期暴露效应的评估 阐明梭曼诱导的神经毒性机制,并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 人诱导多能干细胞衍生的脑类器官 数字病理学 神经毒性损伤 全转录组测序,单细胞RNA测序,免疫荧光,TUNEL检测,Fluoro-Jade C染色 NA RNA测序数据,图像数据 未明确具体样本数量,但包括梭曼暴露组和对照组脑类器官 NA 单细胞RNA-seq,全转录组测序 NA NA
899 2026-01-12
Endothelial BMP6 Drives Hemodynamic-Dependent VSMCs Calcification in Carotid Atherosclerosis
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究探讨了内皮细胞BMP6在颈动脉粥样硬化中通过血流动力学依赖机制驱动血管平滑肌细胞钙化的作用 首次通过单细胞RNA测序识别出高表达BMP6的内皮细胞亚群,并揭示其通过BMP信号通路与血管平滑肌细胞相互作用,以及血流动力学扰动通过抑制Krüppel样因子4上调BMP6表达的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本的验证可能有限,且具体信号通路的详细调控网络仍需进一步探索 探究BMP6在颈动脉粥样硬化血管钙化中的作用及分子机制 人类颈动脉粥样硬化斑块、内皮细胞、血管平滑肌细胞、基因工程小鼠(BMP6敲除和过表达) 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
900 2026-01-12
Elevated Apolipoprotein E Expression in Hippocampal Microglia Drives Temporal Lobe Epilepsy Progression
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文通过整合生物信息学方法和生物标志物验证,揭示了载脂蛋白E(APOE)在颞叶癫痫(TLE)进展中的作用,特别是海马小胶质细胞中APOE高表达如何驱动疾病进程 首次发现APOE在海马小胶质细胞中的高表达是TLE进展的关键驱动因素,并揭示了其通过调节神经炎症、神经元凋亡和兴奋性来促进海马硬化和癫痫发作 研究主要基于小鼠模型和患者组织样本,临床转化潜力需进一步验证,且APOE下游信号通路的具体机制尚未完全阐明 阐明APOE在颞叶癫痫(TLE)进展中的作用机制,特别是其在小胶质细胞中的表达如何影响疾病进程 TLE患者的海马组织样本和TLE小鼠模型,重点关注海马小胶质细胞 神经科学 颞叶癫痫 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、生物信息学分析、体外研究、体内功能实验 NA 基因表达数据、组织样本 TLE患者海马组织和TLE小鼠模型,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部