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当前共找到 2200 篇文献，本页显示第 861 - 880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2026-06-09 |
Trainable clustering framework for spatial transcriptomics
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag133
PMID:42254590
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研究论文 | 介绍了一种用于空间转录组学的可训练聚类框架，结合自编码器与聚类层实现空间域识别 | 提出了一种统一四种互补策略（ACT、FACT、Scatter和Ensemble）的可训练聚类框架，通过自编码器驱动特征学习与Mclust辅助聚类层的联合优化实现端到端训练 | 未明确讨论模型在大规模数据集上的计算效率或对高度噪声数据的鲁棒性 | 开发一种用于空间转录组空间域识别的可训练聚类框架 | 人类DLPFC、小鼠前脑、人类乳腺癌样本 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 自编码器、Mclust | 空间转录组数据 | 人类DLPFC、小鼠前脑和人类乳腺癌数据集，以及Stereo-seq和Slide-seq数据集 | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq, Slide-seq | NA |
| 862 | 2026-06-09 |
Single-cell and repertoire profiling reveals immune remodelling in paediatric upper airway: insights from adenoid hypertrophy
2026, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.70101
PMID:42255100
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和配对B/T细胞受体分析揭示了儿童腺样体肥大中的免疫重塑特征 | 首次在单细胞分辨率下联合分析腺样体肥大中B细胞和T细胞受体库，发现免疫细胞组成和功能改变 | 样本量较小（每组4例），且未进行功能性验证实验 | 解析儿童腺样体肥大中的免疫细胞景观和配对B/T细胞受体谱系变化 | 儿童腺样体组织（肥大组和对照组各4例） | 数字病理学 | 儿科疾病 | 10x Genomics 5'单细胞RNA测序，配对VDJ分析 | NA | 单细胞转录组和免疫受体库数据 | 8例腺样体组织（4例肥大，4例对照），共72,076个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，单细胞VDJ分析 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 5'试剂盒，含配对V(D)J分析 |
| 863 | 2026-06-09 |
Pathogenic Implications of the THY1/NF-κB Feedback Relationship in Osteoarthritis and Its Potential as a Therapeutic Target
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S597277
PMID:42255174
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研究论文 | 本研究通过整合差异表达分析、WGCNA和PPI网络分析等方法，鉴定出THY1作为骨关节炎的诊断标志物，并探讨其与NF-κB信号通路的反馈关系及作为治疗靶点的潜力 | 首次通过多种机器学习算法整合单细胞测序和分子动力学模拟，揭示THY1在骨关节炎软骨细胞发育中的动态表达，并预测小檗碱与THY1的结合作用 | 研究主要基于计算模拟和初步实验验证，THY1/NF-κB反馈关系的临床意义和分子机制仍需进一步验证；小檗碱与THY1的相互作用仅提供结构预测，缺乏体内药理学证据 | 鉴定骨关节炎的潜在治疗靶点并探索相关分子机制 | 骨关节炎患者和动物模型的软骨细胞及组织样本 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞测序、分子动力学模拟、WGCNA、PPI网络分析 | RF, LASSO, SVM-RFE | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 864 | 2026-06-09 |
Immune-excluded and immune-suppressive tumor microenvironments: mechanisms, spatial biomarkers, and therapeutic rewiring
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1855429
PMID:42255212
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综述 | 综述了免疫排斥和免疫抑制肿瘤微环境的机制、空间生物标志物及治疗重塑策略 | 整合空间转录组学、多重成像、空间蛋白质组学等新兴技术，系统阐述耐药性TME的空间组织特征和动态演化机制，提出空间生物标志物可优化患者分层和治疗决策 | 前瞻性临床验证仍有限，空间生物标志物系统的临床应用尚未成熟 | 阐明免疫排斥和免疫抑制肿瘤微环境的生物学机制、空间标志物的潜在价值及治疗重塑方向 | 肿瘤微环境中的基质重塑、癌相关成纤维细胞、髓系细胞主导、细胞因子和趋化因子网络、血管功能障碍、代谢应激及器官特异性微环境效应 | 数字病理学 | 恶性肿瘤（多种实体瘤） | 空间转录组学、多重成像、空间蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据、多重成像数据、空间蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 865 | 2026-06-09 |
BIRC5 drives cell-cycle dysregulation and represents a novel molecular target in retinoblastoma
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1854143
PMID:42255235
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和功能验证，确定BIRC5（survivin）是视网膜母细胞瘤恶性增殖的细胞状态特异性调节因子，并可作为新型分子靶点 | 首次在单细胞水平上鉴定BIRC5为视网膜母细胞瘤MKI67+增殖亚群的细胞状态特异性驱动因子，揭示了其通过CCND1/CDK4激活和CHEK2-p21检查点抑制促进细胞周期紊乱的机制 | 研究主要在细胞系中进行功能验证，缺乏体内动物模型的进一步验证；样本量相对有限（13个肿瘤和3个正常样本） | 识别视网膜母细胞瘤恶性增殖的分子调节因子和潜在治疗靶点 | 视网膜母细胞瘤肿瘤细胞和正常胎儿视网膜细胞 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 过表达 | NA | 单细胞转录组数据 | 13个视网膜母细胞瘤肿瘤和3个正常胎儿视网膜样本，共189431个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 866 | 2026-06-09 |
A cell death program-based tumor signature stratifies prognosis, immune landscape, and therapeutic response in glioma
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1824504
PMID:42255240
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研究论文 | 基于细胞死亡程序构建胶质瘤预后特征，揭示其与免疫微环境和治疗响应的关联 | 首次构建整合焦亡与凋亡相关基因的预后特征（PA.Sig），从单细胞水平揭示恶性细胞状态与免疫微环境的动态互作 | 未提及具体限制 | 开发一种基于细胞死亡信号的预后特征，并阐明其在胶质瘤中的生物学和临床相关性 | 胶质瘤患者样本及细胞系 | 机器学习 | 胶质瘤 | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据，临床数据 | TCGA-GBMLGG及外部验证队列 | NA | bulk RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 867 | 2026-06-09 |
Transplantation immunology: paradigm shift from systemic suppression to microenvironment remodeling and precision modulation
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1835561
PMID:42255472
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综述 | 系统阐述了移植免疫学从系统性免疫抑制向微环境重塑与精准调节的范式转变，重点介绍了四种前沿治疗策略 | 整合高维技术（单细胞测序、表观基因组学、代谢组学）与人工智能，提出从“广谱抑制”转向“精准调节”的免疫管理新框架 | 未提供临床试验证据，缺乏对具体策略效果的定量比较 | 推动移植免疫学从系统性免疫抑制向精准免疫微环境调节的范式转变 | 同种异体移植排斥反应中的免疫细胞、细胞因子及微环境组分 | 机器学习 | 终末期器官衰竭 | 单细胞测序、表观基因组学、代谢组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 868 | 2026-06-09 |
Deciphering skeletal muscle development: cellular heterogeneity and molecular regulatory networks from single-cell and spatial transcriptomic perspectives
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1827120
PMID:42255477
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综述 | 从单细胞和空间转录组学角度解析骨骼肌发育过程中的细胞异质性和分子调控网络 | 系统总结了单细胞RNA测序和空间转录组学在骨骼肌发育研究中的最新进展，揭示了跨物种保守机制与物种特异性调控特征，并强调了微环境作为肌肉干细胞行为空间调节因子的作用 | 未提及具体技术局限或研究空白 | 综述单细胞和空间转录组学在骨骼肌发育研究中的应用，揭示细胞异质性和分子调控网络 | 骨骼肌发育过程中的细胞和分子事件 | NA | 肌肉相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST） | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、多模态数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 869 | 2026-06-09 |
The miR-30c-5p/SOCS3 axis is a potential driver of inflammation and metabolic imbalance in Duchenne muscular dystrophy
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1841851
PMID:42255483
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据鉴定miR-30c-5p/SOCS3轴在杜氏肌营养不良症中驱动炎症和代谢失衡的作用 | 首次通过整合bulk RNA-seq、small RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，系统鉴定并验证miR-30c-5p/SOCS3轴在DMD中驱动炎症和代谢失衡的关键作用 | 未提供明确的局限性信息 | 探究miRNA-mRNA调控网络在DMD发病机制中的关键驱动因子 | DMD患者肌肉组织、mdx小鼠、C2C12肌母细胞和原代骨骼肌细胞 | 机器学习 | 杜氏肌营养不良症 | RNA-seq, 小RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 差异表达分析, 靶基因预测, 功能通路富集, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析, 双荧光素酶报告基因实验 | NA | 基因表达数据 | 整合GSE38417、GSE109178、GSE157668和GSE213925数据集，具体样本量未明确 | NA | bulk RNA-seq, small RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 870 | 2026-06-09 |
Identification of genes associated with smell dysfunction in Parkinson's disease
2026, Clinical parkinsonism & related disorders
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.prdoa.2026.100453
PMID:42255497
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研究论文 | 整合临床和转录组数据分析帕金森病嗅觉功能障碍相关基因 | 通过机器学习特征排序确定嗅觉功能丧失是区分帕金森病与健康对照的最有价值临床指标，并整合WGCNA、DNA甲基化和单细胞RNA测序数据揭示其分子机制 | 研究主要依赖外周血转录组数据，可能无法完全反映大脑嗅觉区域的分子变化；缺乏独立队列验证 | 探究帕金森病中嗅觉功能障碍的遗传基础及其作为早期诊断标志物的潜力 | 帕金森病患者和健康对照个体 | 机器学习 | 帕金森病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析 | 加权基因共表达网络分析 (WGCNA) | 临床数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | 来自PPMI数据库的外周血样本及独立单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 871 | 2026-06-09 |
Correction: Detection of differentially expressed genes in spatial transcriptomics data by spatial analysis of spatial transcriptomics: A novel method based on spatial statistics
2026, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2026.1867303
PMID:42255936
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更正 | 对前期发表的关于通过空间转录组学数据的空间分析检测差异表达基因的文章进行更正 | 更正本身不具备创新性 | 更正内容局限于对原文错误的修正 | 修正空间转录组学数据中差异表达基因检测方法的错误 | 更正通知本身无研究对象 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 872 | 2026-06-09 |
Immunoengineering in the field of tendon and bone regeneration: immunomodulatory biomaterials, delivery platforms, and preclinical models for chronic diseases
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1844904
PMID:42256713
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综述 | 系统总结了旨在克服肌腱-骨界面再生挑战的“骨免疫工程”最新范式转变 | 提出下一代智能生物物理和化学干预策略，包括压电纳米水凝胶、Janus不对称微流体接口和精准空间递送平台，并强调闭环动态自适应生物材料与人工智能的深度融合 | NA | 综述骨免疫工程在肌腱和骨再生中的最新进展，旨在克服慢性疾病导致的再生微环境破坏问题 | 肌腱-骨界面及其在慢性退行性病变（如衰老、糖尿病和类风湿关节炎）下的再生 | 机器学习 | 肌腱和骨损伤 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 873 | 2026-06-08 |
Identification of potential drug targets for Alzheimer's disease from genetic insights: A Mendelian randomization study
2026-Jan-30, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045715
PMID:41630303
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研究论文 | 通过孟德尔随机化研究从遗传学角度识别阿尔茨海默病的潜在药物靶点 | 首次联合孟德尔随机化分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络、分子对接和单细胞测序分析系统识别阿尔茨海默病的关键基因和潜在药物 | 研究依赖于公开的GWAS汇总统计数据，可能受限于原始数据的样本特征和混杂因素 | 探索血浆蛋白与阿尔茨海默病之间的因果关系并预测潜在药物靶点 | 阿尔茨海默病患者和对照组的血浆蛋白质组数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | NA | NA | 图像、文本 | 4907个血浆蛋白作为暴露因素，阿尔茨海默病作为结局 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 874 | 2026-06-08 |
Calcified Artery Preparation and Processing with Preserved Morphology and RNA for Digital Spatial Profiling
2026-Jan-23, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69159
PMID:41662190
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研究论文 | 提出一种针对钙化动脉的样本处理流程，保留形态和RNA完整性，用于数字空间分析 | 专门优化了钙化血管组织的处理流程，包括脱钙方法、组织微阵列构建和感兴趣区域选择策略，以克服血管组织用于空间转录组学的技术障碍 | 主要基于人类胫骨动脉样本，可能不适用于其他血管类型或钙化程度不同的样本 | 建立适用于钙化血管的空间转录组学样本制备协议，使科研人员能够获得层特异性基因表达数据 | 人类胫骨动脉（具有晚期病变） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 图像 | 人类胫骨动脉样本（具体数量未提及） | NanoString Technologies | 空间转录组学 | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler | NanoString GeoMx DSP系统，结合组织微阵列和感兴趣区域选择策略 |
| 875 | 2026-06-08 |
BayesRare: Bayesian mixture model for population-level rare cell type detection in multi-subject single-cell RNA sequencing data
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag024
PMID:41632592
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研究论文 | 提出BayesRare层次贝叶斯框架，用于多受试者单细胞RNA测序数据中群体水平稀有细胞类型的检测 | 首次将贝叶斯混合模型与稀有簇指示器结合，实现跨受试者信息整合的稀有细胞类型联合聚类与识别，并量化不确定性 | 未明确说明具体局限性 | 开发一种能够利用跨受试者信息进行群体水平稀有细胞类型检测的统计方法 | 单细胞RNA测序数据中的稀有细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯混合模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 876 | 2026-06-08 |
Cross-dataset transcriptomic analyses identify a conserved ENPP2+ macrophage-fibroblast activation axis in hypertrophic cardiomyopathy
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag036
PMID:41642196
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研究论文 | 本研究通过跨数据集转录组分析，在肥厚型心肌病中鉴定出一个保守的ENPP2+巨噬细胞-成纤维细胞活化轴 | 首次通过跨数据集单核RNA测序和空间转录组学分析，揭示肥厚型心肌病中巨噬细胞向促炎表型转化并由ENPP2高表达驱动成纤维细胞活化的保守机制 | 机制验证主要基于初步的组织病理学和分子生物学实验，需要进一步功能研究确定ENPP2下游信号及其作为治疗靶点的可行性 | 阐明肥厚型心肌病中心肌纤维化的分子机制，特别是巨噬细胞转化为成纤维细胞活化的调控机制 | 肥厚型心肌病患者的心肌组织样本 | 数字病理学 | 肥厚型心肌病 | snRNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多个公开数据集（包括两种最常见突变类型的snRNA-seq数据、最大现有snRNA-seq和空间转录组学数据集） | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 877 | 2026-06-08 |
High-Resolution Laser Microdissection to Investigate Transcriptional States in Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Samples
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5154-4_5
PMID:41629710
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研究论文 | 本文描述了如何利用高分辨率激光显微切割结合RNA测序分析福尔马林固定石蜡包埋样本中的转录状态 | 强调激光显微切割在空间转录组学中仍具有高空间分辨率和成本效益的优势，尤其适用于FFPE样本和回顾性研究 | 未明确提及，但可推断其通量低于新兴高通量空间转录组技术，且依赖精确的形态学注释 | 提供一种针对常规组织学样本（如FFPE）的稳健LMD-RNA-seq协议，用于揭示临床上相关的特定分子信息 | 福尔马林固定石蜡包埋的组织样本 | 数字病理学 | 未明确指定，但适用于多种疾病（如癌症） | 激光显微切割、RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 878 | 2026-06-08 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Immunosuppressive Trajectory in the Tumor Microenvironment of Human Giant Cell Tumor of Bone
2026, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/bmri/9855803
PMID:41635288
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示人骨巨细胞瘤肿瘤微环境中的免疫抑制轨迹 | 首次通过单细胞测序全面解析骨巨细胞瘤肿瘤微环境中的细胞异质性和免疫抑制机制，识别出肿瘤相关巨噬细胞、CD8+ T细胞和CD4+ T细胞的新亚型及其相互作用网络 | 样本量较小（7091个细胞），且未进行功能验证实验 | 阐明骨巨细胞瘤肿瘤微环境中的免疫抑制机制及细胞间相互作用 | 骨巨细胞瘤肿瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞 | 单细胞测序 | 骨巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 7091个细胞，来源于骨巨细胞瘤手术切除样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 879 | 2026-06-08 |
Spatial Analysis of Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms Defines a Paradoxical Keratin 17-Positive, Low-Grade Epithelial Population Harboring Malignant Features
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101749
PMID:41638478
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研究论文 | 通过对导管内乳头状黏液性肿瘤进行空间转录组学分析，发现了一个表达恶性特征的角蛋白17阳性低级别上皮细胞亚群 | 首次在组织学低级别IPMN中发现一个表达恶性转录特征（包括KRT17、S100A10和CEACAM5）的上皮细胞亚群，并验证了该高风险基因特征 | NA | 研究IPMN进展过程中的转录变化，寻找更准确的风险分层标志物 | 包含从低级别不典型增生到癌变完整病程的IPMN患者组织样本，以及分支导管和主胰管IPMN活检样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序，免疫荧光染色 | NA | 图像数据，空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 包含完整病程的IPMN患者样本和外部空间转录组数据集中的多个IPMN样本 | Nanostring | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | Nanostring GeoMx | 使用Nanostring GeoMx进行空间转录组学分析，并对分支导管和主胰管IPMN活检样本进行单细胞RNA测序 |
| 880 | 2026-06-08 |
TIMELESS Promotes LUAD Growth via Suppressing Transferrin-Mediated Ferroptosis and Reprograms the Tumor Microenvironment against Anti-PD-1 Immunotherapy
2026, Cancer communications (London, England)
DOI:10.34133/cancomm.0009
PMID:41641368
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研究论文 | 本研究揭示TIMELESS通过抑制转铁蛋白介导的铁死亡促进肺腺癌生长并重编程肿瘤微环境对抗PD-1免疫治疗 | 首次阐明TIMELESS通过招募CNOT3加速TF mRNA降解抑制铁死亡、促进肺腺癌进展的分子机制，并发现TIMELESS/TF调控轴可作为潜在治疗靶点 | NA | 探讨高表达RBP TIMELESS在肺腺癌中的分子网络及其在肿瘤进展中的机制作用 | 肺腺癌细胞系及原位肺癌小鼠模型 | 机器学习和数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 光激活核糖核苷增强交联免疫沉淀测序, 免疫共沉淀-质谱, GST pull-down, RNA免疫沉淀, 流式细胞术, 多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 组织微阵列图像 | TCGA-LUAD, GEO, scRNA-seq数据集；组织微阵列样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |