单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202601] [清除筛选条件]
当前共找到 1426 篇文献,本页显示第 861 - 880 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
861 2026-01-25
Single-cell RNA sequencing reveals immune regulatory mechanisms and molecular therapeutic strategies in the microenvironment of multiple myeloma
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序、孟德尔随机化和分子对接模拟,揭示了多发性骨髓瘤微环境中的免疫调控机制和潜在治疗靶点 结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和分子对接模拟,系统解析多发性骨髓瘤微环境中的细胞互作和信号通路,并识别新的小分子治疗策略 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量可能有限,影响结果的普适性 探究多发性骨髓瘤微环境中的分子和细胞相互作用,以发现治疗靶点 多发性骨髓瘤微环境中的肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 分子对接模拟 Seurat, GSVA, 两样本孟德尔随机化 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
862 2025-09-09
Comments on "Tracking adipose-derived stem cell exosomes applied in a mouse crush injury model: insights from fluorescent labeling and spatial transcriptomics - an experimental study"
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
863 2026-01-25
Immunological microenvironment differences between left and right colon cancer: dynamic interactions of CASC15+KLK6+ epithelial subpopulation with T cells and mast cells
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了左右半结肠癌免疫微环境的差异,并鉴定出一个与预后不良相关的CASC15+KLK6+上皮亚群 首次在单细胞水平系统比较左右半结肠癌的免疫微环境差异,并发现了一个具有高拷贝数变异和恶性通路活性的特异性上皮亚群,其与T细胞、肥大细胞的相互作用通过MIF和CD99信号通路驱动免疫抑制 样本量较小(单细胞测序仅6例),验证队列规模有限(70例),且未进行功能性实验验证信号通路的具体机制 探究左右半结肠癌免疫微环境的差异及其对临床行为的潜在影响 左半结肠癌和右半结肠癌患者的肿瘤组织 数字病理学 结肠癌 单细胞RNA测序,免疫荧光 Seurat, inferCNV, Monocle2, GSVA, CellChat 单细胞转录组数据,图像数据 单细胞测序:3例左半结肠癌和3例右半结肠癌;验证队列:70例患者(30例左半结肠癌,40例右半结肠癌) NA 单细胞RNA-seq NA NA
864 2026-01-25
Single-cell transcriptome analysis reveals regulatory programs associated with tumor resistance during immunotherapy in colorectal cancer
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了结直肠癌免疫治疗耐药期间T细胞亚群的调控程序 首次在转移性dMMR结直肠癌患者中系统比较了耐药与敏感组的单细胞转录组差异,并识别出TSTR和γδ T细胞的转录网络失调是耐药的核心机制 研究主要基于单细胞测序数据的生物信息学分析,缺乏体内外功能实验验证;临床样本量相对有限(190例) 探究结直肠癌免疫治疗耐药的分子机制 转移性DNA错配修复缺陷(dMMR)结直肠癌患者 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、临床组织样本 190例结直肠癌患者及其配对癌旁正常组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
865 2026-01-25
Polyethylene terephthalate microplastics exposure enhances the risk of ulcerative colitis: insights from multiomics integration, machine learning, and molecular docking reveal intestinal toxicity mechanisms
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过多组学整合、机器学习和分子对接揭示了聚乙烯对苯二甲酸酯微塑料暴露增加溃疡性结肠炎风险的肠道毒性机制 首次整合多组学数据、机器学习算法和分子对接技术,系统性识别了PET-MPs诱导UC的关键靶点基因,并构建了高精度的风险预测模型 研究主要基于公共数据库数据和动物模型,缺乏直接的人类临床验证,且PET-MPs暴露剂量和时长可能无法完全反映真实环境暴露情况 探究PET微塑料暴露与溃疡性结肠炎风险增加的分子机制 PET微塑料、溃疡性结肠炎相关基因靶点、动物模型肠道组织 机器学习 溃疡性结肠炎 多组学整合、机器学习、分子对接、单细胞测序分析、Western blot 多种机器学习算法(包括SHAP分析) 基因表达数据、蛋白质表达数据、分子对接模拟数据 未明确具体样本数量,但使用了公共数据库数据和动物模型 NA 单细胞测序 NA NA
866 2026-01-25
Selenomethionine alleviates aortic dissection via PGC-1α/NRF2/TFAM-mediated mitochondrial biosynthesis against ferroptosis: an experimental study
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究探讨了硒代蛋氨酸通过PGC-1α/NRF2/TFAM轴介导的线粒体生物合成抑制铁死亡,从而缓解主动脉夹层的治疗效果和机制 首次揭示了硒代蛋氨酸通过激活PGC-1α/NRF2/TFAM轴抑制铁死亡,从而减轻主动脉夹层的具体分子机制 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,临床转化仍需进一步验证 探索硒代蛋氨酸治疗主动脉夹层的疗效及其潜在分子机制 小鼠主动脉夹层模型和血小板衍生生长因子-BB诱导的血管平滑肌细胞 心血管疾病 主动脉夹层 单细胞测序、转录组分析、小干扰RNA敲低技术 小鼠模型、细胞模型 基因表达数据、细胞表型数据 未明确指定样本数量,涉及小鼠模型和患者VSMCs NA 单细胞RNA-seq、转录组测序 NA NA
867 2026-01-25
Metformin Restores Mitochondrial Function and Neurogenesis in POLG Patient-Derived Brain Organoids
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究利用患者来源的iPSC皮质类器官模拟POLG相关神经退行性疾病,并评估了二甲双胍在恢复线粒体功能和神经发生方面的治疗潜力 首次在POLG患者来源的脑类器官模型中,通过单细胞RNA-seq揭示不同神经元亚型的特异性脆弱性,并证明二甲双胍能恢复神经元身份、线粒体功能和代谢通路 研究基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内复杂环境;治疗剂量和时间窗口需进一步优化;未涉及长期疗效和潜在副作用评估 探究二甲双胍对POLG相关线粒体功能障碍和神经发生损伤的治疗作用及机制 POLG患者来源的诱导多能干细胞(iPSC)皮质类器官 神经科学 线粒体疾病 单细胞RNA-seq,功能测定(线粒体膜电位、质量、氧化应激),钙测量,非靶向代谢组学 脑类器官模型 单细胞转录组数据,功能测定数据,代谢组数据 患者来源的iPSC皮质类器官 NA 单细胞RNA-seq NA NA
868 2026-01-08
Spatial transcriptomics decodes the cellular landscape of plant-pathogen interaction
2026-Jan, Nature plants IF:15.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
869 2026-01-25
Integrated analysis of bulk RNA and single-cell RNA sequencing data reveals potential biomarkers and immune infiltrates associated with N7-methylguanosine in osteoarthritis
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过整合分析bulk RNA和单细胞RNA测序数据,揭示了与骨关节炎中N7-甲基鸟苷修饰相关的潜在生物标志物和免疫浸润特征 首次在骨关节炎中系统研究m7G修饰的作用,识别了四个关键m7G调节因子作为新型生物标志物,并探索了其与免疫浸润和软骨退化的关系 需要进一步实验来阐明骨关节炎的分子机制 识别与骨关节炎中m7G修饰相关的基因,并研究其诊断价值和免疫浸润特征 骨关节炎患者样本(106个OA样本) 生物信息学 骨关节炎 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 LASSO回归, 无监督聚类分析 RNA测序数据 106个骨关节炎样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
870 2026-01-25
Decoding the triglyceride-glucose index in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease: integrative insights from Mendelian randomization, cross-tissue transcriptomics, and spatial multi-omics
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过整合孟德尔随机化、跨组织转录组学和空间多组学方法,揭示了甘油三酯-葡萄糖指数在代谢功能障碍相关脂肪性肝病中的因果机制和分子驱动因素 首次采用多组学框架结合孟德尔随机化、转录组范围关联研究和空间转录组学,系统解析了TyG指数与MASLD之间的因果关系及组织特异性表达模式 研究主要基于欧洲人群的遗传数据,可能限制了结果在其他人群中的普适性;空间转录组学数据来源于小鼠胚胎期,与人类成年期疾病状态存在差异 阐明甘油三酯-葡萄糖指数在代谢功能障碍相关脂肪性肝病发展中的因果作用机制 代谢功能障碍相关脂肪性肝病患者及小鼠模型 生物信息学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 孟德尔随机化, 转录组范围关联研究, 空间转录组学, 单细胞测序 IVW, GSMR, JTI-PrediXcan, SMulTiXcan, FOCUS, FUSION, PoPS 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据 基于UK Biobank的192个全基因组显著单核苷酸多态性 NA 单细胞空间转录组学 NA NA
871 2026-01-25
SPP1 in notochord cells modulates intervertebral disc degeneration through CD44 recognition by macrophages based on single-cell transcriptome analysis
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过改进大鼠椎间盘压力模型,结合单细胞转录组分析,探讨了机械应力如何通过SPP1-CD44信号通路影响椎间盘退变 改进了大鼠椎间盘压力模型,并首次在单细胞水平揭示了机械应力下脊索细胞群的变化及SPP1-CD44信号通路在椎间盘退变中的作用 研究主要基于大鼠模型,人类数据验证部分依赖于公共数据库,缺乏直接的人类样本实验验证 探究机械应力导致椎间盘退变的分子机制 大鼠椎间盘组织及脊索细胞 单细胞转录组学 椎间盘退变 单细胞转录组测序 NA 单细胞RNA测序数据 手术组与假手术组大鼠椎间盘样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
872 2026-01-24
Single-cell transcriptomics uncovers malignant potential of gallbladder adenomyomatosis and identifies PRDX1+ immunosuppressive macrophages in gallbladder carcinoma
2026-Jan-23, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了胆囊腺肌症的恶性潜能,并识别出胆囊癌中PRDX1+免疫抑制性巨噬细胞的关键作用 首次在单细胞水平上描绘了胆囊腺肌症的转录组景观,并发现PRDX1/PPAR-δ/CPT1A轴调控巨噬细胞免疫代谢的新机制 样本量相对较小,且功能验证主要依赖体外和体内实验,临床转化需进一步验证 评估胆囊腺肌症的恶性潜能并识别胆囊癌发生中未被认识的分子通路 胆囊慢性炎症、胆囊腺肌症和胆囊癌患者组织样本 数字病理学 胆囊癌 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 多重免疫组化, 体外和体内功能验证 NA 单细胞转录组数据, 批量RNA-seq数据, 免疫组化图像 9例患者用于单细胞测序, 80例公共数据集, 62例独立队列用于验证 NA 单细胞RNA-seq NA NA
873 2026-01-24
Isocucurbitacin B targets STAT3 to induce ferroptosis and promote anti-PD1 immunotherapy responses in breast cancer
2026-Jan-23, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究探讨了异葫芦素B(IB)通过靶向STAT3诱导铁死亡并增强抗PD1免疫疗法在乳腺癌中的抗肿瘤机制 首次揭示IB通过直接靶向STAT3的SH2结构域抑制其激活,并发现STAT3转录激活SLC47A1导致铁死亡抵抗的新调控轴,同时证实IB与抗PD1抑制剂的协同作用 研究主要基于临床前模型(如小鼠模型和患者来源类器官),尚未进行人体临床试验,且机制验证多在细胞系中进行 探究IB在乳腺癌(特别是三阴性乳腺癌)中的抗肿瘤药理机制及其临床转化潜力 乳腺癌细胞系、MMTV-PyMT小鼠模型、患者来源类器官、4T1同基因小鼠模型 肿瘤药理学 乳腺癌 多组学整合分析(包括bulk和空间转录组学、非靶向代谢组学、蛋白质组学)、药物亲和响应靶点稳定性-质谱、染色质免疫沉淀-定量PCR、双荧光素酶报告基因检测、流式细胞术、Seahorse代谢通量分析 NA 多组学数据(转录组、代谢组、蛋白质组)、生化指标数据、影像数据 多种乳腺癌细胞系、小鼠模型及患者来源类器官,具体数量未明确说明 NA 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
874 2026-01-24
Silencing of Ifi27l2a Attenuates Inflammation After Spinal Cord Injury by Regulating Microglial Polarization via JAK2/STAT3 Signaling
2026-Jan-23, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
研究论文 本研究探讨了Ifi27l2a在脊髓损伤后通过JAK2/STAT3信号通路调控小胶质细胞M1/M2极化,从而减轻神经炎症的作用 首次揭示了Ifi27l2a在脊髓损伤后小胶质细胞极化中的关键作用,并阐明其通过JAK2/STAT3信号通路介导的机制 研究主要基于小鼠模型和BV-2细胞系,在人类临床样本中的验证尚需进一步研究 探究Ifi27l2a在脊髓损伤后神经炎症调控中的作用及其分子机制 C57BL/6小鼠脊髓损伤模型和BV-2小胶质细胞系 神经科学 脊髓损伤 单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blotting、免疫荧光染色 NA 基因表达数据、蛋白质数据、图像数据 C57BL/6小鼠和BV-2细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
875 2026-01-24
Intratumoral Lactobacillus johnsonii Enhances Sensitivity to PD-1 Blockade by Inducing CD8+ T Cell Expansion in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jan-22, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究揭示了瘤内约氏乳杆菌及其代谢产物烟酸通过富集IFN-γ+PD-1+CD8+ T细胞、重塑免疫微环境,从而增强PD-1阻断疗法敏感性并抑制肝细胞癌复发的机制 首次发现瘤内约氏乳杆菌可作为肝细胞癌无复发生存的独立预后预测因子,并阐明其通过代谢产物烟酸激活NF-κB/NR4A2通路,特异性扩增细胞毒性耗竭T细胞亚群以增强免疫治疗疗效的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,在人体内的直接验证及临床转化效果仍需进一步探索 探究肝细胞癌术后复发的机制并寻找潜在治疗靶点,以提高患者预后 肝细胞癌患者肿瘤样本、小鼠肿瘤模型、CD8+ T细胞 肿瘤免疫学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、转录组分析、体外功能实验 NA 微生物组数据、单细胞转录组数据、流式细胞术数据 早期复发与非复发肝细胞癌患者的肿瘤样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
876 2026-01-24
NSUN6 deficiency drives immune suppression in pancreatic cancer via the KDM5A-CCL2-macrophage axis
2026-Jan-22, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究揭示了RNA甲基转移酶NSUN6通过m5C-KDM5A-CCL2轴调控胰腺癌免疫微环境的机制 首次阐明NSUN6通过m5C修饰调控KDM5A表达,进而激活CCL2转录,驱动免疫抑制性巨噬细胞极化,并证明靶向CCL2可逆转免疫检查点抑制剂耐药 研究主要基于小鼠模型和临床队列分析,需进一步在人体组织中进行功能验证;NSUN6下游的具体m5C修饰靶点图谱有待更全面解析 阐明NSUN6在胰腺癌免疫微环境中的功能作用及分子机制 胰腺导管腺癌(PDAC) 肿瘤免疫学 胰腺癌 RNA亚硫酸氢盐测序, RNA测序, 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据, 单细胞转录组数据 人类PDAC队列及小鼠PDAC模型 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
877 2026-01-24
Testis Molecular Pathways in CAIS Unveil Testosterone/Estradiol on Germ Cell Tumor Risk in Non-Obstructive Azoospermia
2026-Jan-21, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了非梗阻性无精子症(NOA)中睾丸体细胞的分子通路,并探讨了睾酮/雌二醇比值对非遗传性NOA患者睾丸生殖细胞肿瘤风险的预测作用 首次在完全雄激素不敏感综合征(CAIS)患者睾丸体细胞中进行单细胞RNA测序,并整合多组数据揭示NOA与睾丸生殖细胞肿瘤风险的分子关联 样本量有限,特别是CAIS患者仅有一例,且研究主要基于转录组数据,缺乏功能验证 建立非遗传性和遗传性NOA(如CAIS和Klinefelter综合征)中睾丸体细胞的共享或特异性分子通路,以预测睾丸生殖细胞肿瘤风险 CAIS患者睾丸体细胞、正常精子发生睾丸、NOA、Klinefelter综合征及睾丸生殖细胞癌的scRNA-seq数据集,以及不同男性群体的睾酮和雌二醇水平数据 数字病理学 睾丸生殖细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据、临床数据 CAIS患者1例,年龄匹配男性群体包括120名生育男性、155名不育男性、116名NOA患者、18名Klinefelter综合征患者和343名睾丸生殖细胞癌患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
878 2026-01-24
Charting immune variation through genetics and single-cell genomics
2026-Jan-21, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 本文介绍了中国免疫多组学图谱,通过单细胞多组学方法分析428名健康中国成年人的免疫细胞,揭示了免疫变异的新生物学见解 首次大规模整合单细胞RNA测序和染色质可及性测序,构建了中国人群的免疫多组学图谱,填补了非欧洲人群和单数据模态研究的空白 研究仅针对健康中国成年人,未涵盖疾病状态或其他人群,且样本量相对有限 通过遗传学和单细胞基因组学绘制人类免疫变异图谱 428名健康中国成年人的免疫细胞 单细胞基因组学 NA 单细胞RNA测序, 单细胞染色质可及性测序 NA 单细胞多组学数据 428名健康中国成年人,超过1000万个免疫细胞 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
879 2026-01-24
Reactive oligodendrocytes promote glioblastoma progression through CCL5/CCR5-mediated glioma stem cell maintenance
2026-Jan-21, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了少突胶质细胞通过CCL5/CCR5信号轴维持胶质母细胞瘤干细胞特性并促进肿瘤进展的机制 首次在胶质母细胞瘤中发现干扰素诱导的反应性少突胶质细胞状态,并阐明其通过CCL5/CCR5信号通路维持肿瘤干细胞特性的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证仍需扩大规模,CCR5抑制剂在人体内的疗效需要进一步验证 探究少突胶质细胞在胶质母细胞瘤微环境中的作用机制及潜在治疗靶点 胶质母细胞瘤患者样本、小鼠模型、少突胶质细胞、胶质瘤干细胞 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞转录组测序、空间转录组学、免疫组化、细胞因子分析、迁移实验 NA 转录组数据、图像数据、蛋白质数据 原发性和复发性胶质母细胞瘤肿瘤样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
880 2026-01-24
Integrative multi-omics analysis reveals gut-skin axis mechanisms and novel therapeutic target GALE in atopic dermatitis
2026-Jan-20, mSystems IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过整合多组学分析揭示了特应性皮炎中肠道-皮肤轴的作用机制,并识别出新的治疗靶点GALE 结合单细胞RNA测序、细胞间通讯网络分析、伪时间轨迹推断、反向药物预测、分子对接和分子动力学模拟,首次系统阐明了肠道菌群通过维生素前体代谢途径影响特应性皮炎的机制,并发现GALE作为潜在治疗靶点 样本量较小(仅5名AD患者和4名健康对照),且研究主要基于计算模拟,缺乏实验验证 建立肠道菌群与特应性皮炎风险之间的因果关系,识别关键分子桥梁和治疗靶点 特应性皮炎患者和健康对照的皮肤活检样本 多组学分析 特应性皮炎 单细胞RNA测序,细胞间通讯网络分析,伪时间轨迹推断,反向药物预测,分子对接,分子动力学模拟 NA 单细胞RNA测序数据,分子对接数据,分子动力学模拟数据 5名特应性皮炎患者和4名健康对照的皮肤活检样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部