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当前共找到 1652 篇文献,本页显示第 861 - 880 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
861 2026-02-14
Integrating single-cell and bulk transcriptomes with machine learning reveals a CAF signature for immunotherapy response in dMMR endometrial cancer
2026-Jan-14, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,结合机器学习方法,构建了一个基于Wnt相关癌症相关成纤维细胞(CAF)的风险特征模型,用于预测错配修复缺陷子宫内膜癌(dMMR EC)的预后和免疫治疗反应 首次在dMMR EC中系统识别Wnt相关CAF亚群,并应用包含10种算法和101种组合的机器学习框架筛选最优基因特征,构建了结合临床病理特征和风险评分的列线图模型 研究主要基于公共数据库数据,缺乏独立的前瞻性临床队列验证,且CAF功能机制需进一步实验验证 探索CAF在dMMR EC预后和免疫治疗反应中的作用,并构建预测模型 错配修复缺陷子宫内膜癌(dMMR EC)患者 机器学习 子宫内膜癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq),拷贝数变异(CNV)分析 CoxBoost+Enet [alpha=0.6] 模型,列线图(nomogram) 转录组数据 单细胞数据包含9,682个肿瘤细胞和5,476个正常细胞(具体患者样本数未明确说明) NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
862 2026-02-14
Microbiome-Derived Metabolites Shape CD4+ T-Cell Differentiation and Immune Aging in Chronic HIV-1 Infection
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了肠道菌群衍生的芳香族代谢物(如p-甲酚硫酸盐)如何影响HIV-1感染者CD4+ T细胞的代谢、分化和免疫衰老,并揭示了这些代谢物与HIV-1病毒库持久性的潜在关联 首次将细胞相关肠道菌群代谢物(而非系统性水平)与CD4+ T细胞的代谢功能状态及HIV-1病毒库大小联系起来,并深入研究了p-甲酚硫酸盐作为机制原型的作用 研究主要基于体外实验和HIV-1感染者样本,因果关系和普遍性需进一步验证 探究肠道菌群代谢物在慢性HIV-1感染中对CD4+ T细胞免疫代谢和衰老的影响 HIV-1感染者(PLWH)的配对血浆和CD4 T细胞 免疫代谢学 HIV-1感染 代谢组学分析、流式细胞术、单细胞RNA测序、转录组学、蛋白质组学 NA 代谢物数据、细胞表型数据、基因表达数据 HIV-1感染者的配对血浆和CD4 T细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
863 2026-02-14
Single-cell and spatial transcriptomic profiling of cardiac fibroblasts following myocardial infarction
2026-Jan-13, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学技术,揭示了心肌梗死后心脏成纤维细胞的转录动态和修复性亚群的出现过程 结合了bulk RNA测序、RNAscope原位杂交和空间转录组学,首次在解剖和时间维度上映射了心脏成纤维细胞向修复性亚群转变的基因表达变化 研究主要关注心肌梗死早期阶段,长期动态和功能验证可能不足 探究心肌梗死后心脏成纤维细胞的异质性及修复性途径 心脏成纤维细胞,特别是修复性心脏成纤维细胞亚群 单细胞生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序,空间转录组学,RNAscope原位杂交,bulk RNA测序 NA 转录组数据,空间表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq NA NA
864 2026-02-14
Combined Vibrio and nanoplastics stress promotes nanoplastic accumulation while reducing bacterial lethality in shrimp
2026-Jan-13, NPJ science of food IF:6.3Q1
研究论文 本研究首次揭示了副溶血弧菌能捕获纳米塑料并促进其在凡纳滨对虾体内的转运,同时纳米塑料通过降低病原体毒力影响感染过程 首次证明细菌可作为纳米塑料载体影响其生物转运,并发现纳米塑料能通过激活宿主能量代谢和免疫通路增强抗病能力 研究仅针对单一虾种和特定病原体,自然环境中的多因素交互作用未充分探讨 探究纳米塑料与病原细菌对水生生物的交互影响机制 凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)及其病原体副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus) 环境毒理学 细菌感染 单细胞转录组学分析 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
865 2026-02-14
Single-cell immune transcriptomics reveals an inflammatory-inhibitory set-point spectrum in autoimmune diabetes
2026-Jan-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞免疫转录组学揭示了自身免疫性糖尿病中炎症-抑制设定点的连续谱,并识别了潜在的免疫治疗靶点 首次在单细胞水平上比较了LADA和T1D的免疫特征,定义了NF-κB/EGFR-JAK/STAT梯度和HLA-C-KIR轴作为关键调控机制 样本量相对有限,且仅基于外周血单核细胞,未直接分析胰腺组织中的免疫细胞 探究自身免疫性糖尿病(包括T1D和LADA)中决定不同炎症状态的免疫学机制 LADA患者、新诊断T1D患者和健康对照者的外周血单核细胞 单细胞组学 自身免疫性糖尿病 单细胞RNA测序,配对T和B细胞受体分析 NA 单细胞转录组数据,V(D)J序列数据 超过400,000个PBMCs NA 单细胞RNA-seq NA NA
866 2026-02-14
Chronic macrophage activation derails muscle repair by disrupting mannose-receptor-linked plasticity revealed by endogenous irg1/acod1 tracking
2026-Jan-07, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用靶向irg1/acod1的GFP敲入斑马鱼模型,追踪了在急性和慢性炎症条件下巨噬细胞状态在肌肉损伤修复过程中的动态转变,揭示了慢性巨噬细胞活化通过破坏甘露糖受体(mrc1b/cd206)相关的可塑性来损害肌肉修复的机制 首次在体内实时追踪了巨噬细胞在急性和慢性炎症下的动态状态转变,发现了混合M1/M2巨噬细胞状态的存在,并阐明了慢性炎症通过MyD88依赖性途径抑制mrc1b表达、限制巨噬细胞异质性从而损害肌肉修复的新机制 研究主要基于斑马鱼模型,其在哺乳动物中的普适性有待验证;慢性炎症模型通过基因突变诱导,可能与人类疾病中的慢性炎症状态存在差异 探究慢性炎症如何改变巨噬细胞功能并影响肌肉损伤修复过程 斑马鱼巨噬细胞在肌肉损伤修复过程中的动态行为与功能 发育生物学与免疫学 肌肉损伤与慢性炎症 GFP敲入斑马鱼模型、单细胞转录组测序、基因突变模型 斑马鱼遗传模型 活体成像数据、单细胞转录组数据、基因表达数据 未明确具体样本数量,但涉及野生型、nlrc3l突变型及慢性感染模型等多组斑马鱼 NA 单细胞转录组测序 NA NA
867 2026-02-14
Integrated multi-omics, spatial profiling and organoid modeling drive transformative advances in chronic liver disease and hepatocellular carcinoma immunomicroenvironment research
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了单细胞测序、空间转录组学和类器官模型等前沿技术在慢性肝病及肝细胞癌免疫微环境研究中的突破性应用 强调了多组学分析、空间定位和类器官建模的协同整合,推动研究范式从静态细胞描述转向时空机制解码,从群体水平认知转向个体化病理生理和治疗预测 NA 系统理解慢性肝病的复杂免疫病理机制,为构建针对肝脏免疫微环境时空调控的精准免疫治疗策略奠定技术基础 慢性肝病(CLD)及肝细胞癌(HCC)的免疫微环境 数字病理学 肝细胞癌 单细胞测序,空间转录组学,类器官建模,多组学整合 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
868 2026-02-14
Molecular crosstalk between MASLD and IVDD revealed through integrated biomarker discovery analysis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合生物信息学分析和实验验证,揭示了代谢功能障碍相关脂肪肝病(MASLD)与椎间盘退变(IVDD)之间潜在的分子串扰 首次通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,系统性地研究了MASLD与IVDD之间的共享分子机制,并识别出多个共同的生物标志物和信号通路 研究为初步证据,需要更大规模的队列和功能实验来验证所识别的生物标志物和通路的因果作用 探究MASLD与IVDD之间的共享致病机制和分子串扰 MASLD和IVDD患者及对照组的血液样本、公开的转录组数据集 生物信息学 代谢功能障碍相关脂肪肝病、椎间盘退变 bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、加权基因共表达网络分析、LASSO回归、Scissor分析 LASSO回归、Scissor分析 转录组数据、单细胞数据 10,388个NAFLD细胞、35,846个IVDD细胞,以及患者和对照的血液样本 NA 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq NA NA
869 2026-02-14
Single cell atlas of the comorbidity mechanism between chronic obstructive pulmonary disease and lung adenocarcinoma: a study of multi-omics combined analysis
2026, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 本研究通过多组学联合分析,揭示了慢性阻塞性肺疾病与肺腺癌共病机制中的关键基因和通路 首次结合孟德尔随机化、多组学分析和单细胞RNA测序,系统性地识别并验证了连接COPD与LUAD的炎症相关关键基因 研究主要基于公共数据集和患者血液样本验证,缺乏组织样本的直接验证和功能实验 揭示COPD与LUAD之间的共病分子机制,识别潜在的生物标志物和治疗靶点 慢性阻塞性肺疾病和肺腺癌患者 生物信息学 肺腺癌 单细胞RNA测序, qPCR, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化 LASSO回归 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 涉及多个公共数据集(GSE76925, GSE116959, GSE270667, GSE189357)和患者血液样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
870 2026-02-13
Integrated transcriptomic analysis reveals mitochondrial dysregulation and macrophage heterogeneity associated with MTHFD2 in glioblastoma
2026-Jan-31, Brain research bulletin IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合转录组分析,揭示了线粒体功能障碍和与MTHFD2相关的巨噬细胞异质性在胶质母细胞瘤中的关键作用 首次将MTHFD2鉴定为胶质母细胞瘤的诊断性线粒体枢纽基因,并利用单细胞RNA测序揭示了其在肿瘤相关巨噬细胞中的高表达和功能,关联了线粒体活性、巨噬细胞亚群分化状态与肿瘤进展 研究主要基于转录组数据集和体外实验,缺乏体内模型验证;单细胞分析的数据集可能有限,需要更多独立队列验证 探究胶质母细胞瘤中线粒体基因改变及其细胞特异性,特别是巨噬细胞异质性在肿瘤进展和免疫调节中的作用 胶质母细胞瘤患者样本(来自TCGA-GBM、GSE66354数据集)及体外培养的胶质母细胞瘤细胞和巨噬细胞 生物信息学与计算生物学 胶质母细胞瘤 转录组分析、单细胞RNA测序、Cox回归分析、功能富集分析、伪时间分析、体外功能实验(细胞增殖、侵袭、集落形成、迁移实验) NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 基于TCGA-GBM和GSE66354数据集,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
871 2026-02-13
Insight into modulating osteoarthritis progression: lncRNAs and TGF-β/Smad signalling pathway
2026-Jan-28, Clinical and experimental rheumatology IF:3.4Q2
综述 本文系统探讨了长链非编码RNA通过TGF-β/Smad信号通路调节骨关节炎软骨修复的分子机制及其临床转化策略 系统总结了lncRNAs通过TGF-β/Smad通路调控骨关节炎进展的分子机制,并整合了基于lncRNA的纳米颗粒递送、基因编辑等新型临床转化策略 lncRNA疗法在靶向递送效率和特异性方面仍面临挑战 探讨lncRNAs通过TGF-β/Smad信号通路调控骨关节炎进展的分子机制及治疗潜力 长链非编码RNA、TGF-β/Smad信号通路、骨关节炎 NA 骨关节炎 单细胞测序、基因编辑 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
872 2026-02-13
4D multimodal wound healing atlas reveals organ-level controls of repair phase transitions
2026-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过构建一个4D多模态伤口愈合图谱,揭示了器官水平上控制修复阶段转换的分子逻辑 首次创建了器官尺度的4D多模态伤口愈合图谱,整合了snRNA-seq、scRNA-seq、CITE-seq和高清空间转录组学,克服了传统图谱的技术限制,发现了之前被遗漏的关键角质形成细胞亚群及其在协调修复中的核心作用 研究主要基于小鼠模型,虽然进行了跨物种验证,但人类数据可能仍受解离诱导的伪影影响 解码哺乳动物伤口愈合在器官尺度的系统级原则,揭示修复阶段转换的分子控制机制 小鼠皮肤伤口愈合过程中的细胞状态和组织系统 空间转录组学 伤口愈合障碍 snRNA-seq, scRNA-seq, CITE-seq, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 超过725,000个小鼠单细胞和空间转录组 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
873 2026-02-13
Unveiling cholesterol metabolism-related gene ACOX2: a multi-omics discovery of a novel biomarker in IgA nephropathy
2026-Jan-15, Hereditas IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过多组学整合分析,揭示了胆固醇代谢相关基因ACOX2在IgA肾病中的保护性作用,并探索了其作为新型生物标志物的潜力 首次将GWAS、SMR、贝叶斯共定位、scRNA-seq、分子对接和分子动力学模拟等多组学方法整合,系统性地识别了IgA肾病中胆固醇代谢的关键调控基因ACOX2,并发现其与疾病风险的负相关关系 研究主要基于遗传和转录组数据,缺乏直接的体内功能验证实验,且分子对接结果需进一步实验证实 探究胆固醇代谢在IgA肾病中的作用机制,并识别关键调控基因作为潜在生物标志物 IgA肾病(IgAN)患者及相关遗传和转录组数据 生物信息学 肾脏疾病 GWAS, SMR, 贝叶斯共定位, scRNA-seq, 分子对接, 分子动力学模拟 NA 遗传数据, 转录组数据 NA NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
874 2026-02-13
T-cell exhaustion indicator characterizes the tumor microenvironment landscape and predicts colon adenocarcinoma prognosis via integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-sequencing
2026-Jan-14, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA-seq和bulk RNA测序数据,构建了一个基于T细胞耗竭相关基因的预后模型,用于预测结肠腺癌患者的生存和治疗反应,并验证了FAT4基因在COAD细胞中的功能作用 首次整合单细胞和bulk RNA测序数据,构建了基于T细胞耗竭相关基因的预后特征,并验证了FAT4基因在COAD中的调控作用 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床研究验证 阐明T细胞耗竭与结肠腺癌预后的关系,并开发预后预测模型 结肠腺癌患者和COAD细胞系 生物信息学 结肠癌 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 流式细胞术, RT-qPCR GSVA, 单变量Cox, LASSO, 随机森林 转录组数据 来自TCGA和GEO数据库(GSE103479, GSE17536)的结肠腺癌患者样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
875 2026-01-16
stRGAT: identifying spatial domains in spatial transcriptomics via a relational graph attention network
2026-Jan-14, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
876 2026-02-13
A novel anoikis resistance-associated gene model for prognostic prediction and immune microenvironment characterization in lung squamous cell carcinoma
2026-Jan-13, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究构建了一个基于失巢凋亡抵抗相关基因的预后模型,用于预测肺鳞状细胞癌患者的生存结果并表征肿瘤免疫微环境 首次在肺鳞状细胞癌中构建并验证了一个基于失巢凋亡抵抗相关基因的预后模型,揭示了该模型与肿瘤免疫微环境特征及免疫治疗反应性的关联 研究主要基于回顾性队列数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能和临床实用性 开发一个能够预测肺鳞状细胞癌患者预后并指导精准免疫治疗的基因模型 肺鳞状细胞癌患者及其肿瘤组织样本 生物信息学 肺癌 单细胞转录组学、通路富集分析、LASSO回归、Cox比例风险分析 预后风险评分模型 基因表达数据、临床数据 内部验证队列(TCGA-LUSC)和外部验证队列(GSE73403、GSE74777) NA 单细胞RNA-seq NA NA
877 2026-02-13
NR4A1 limits CD8+ T Cell effector responses and protection in tuberculosis
2026-Jan-13, Research square
研究论文 本研究通过小鼠、猕猴和人类数据验证,发现核受体NR4A1是结核病中CD8 T细胞免疫的关键抑制因子,并揭示了NR4A1-NKG7轴作为新的宿主导向治疗靶点 首次将NR4A1鉴定为结核病中CD8 T细胞免疫的负调控因子,并通过空间分析、ChIP-qPCR和药理学抑制验证了其作用机制 研究主要基于动物模型和体外实验,人类数据验证可能有限,且药理学抑制的长期效果和安全性未充分评估 探究NR4A1在结核病感染期间对CD8 T细胞效应功能和免疫保护的调控作用 小鼠、猕猴和人类数据集中的CD8 T细胞 免疫学 结核病 单细胞RNA测序、空间分析、ChIP-qPCR、药理学抑制 NA 基因表达数据、空间转录组数据 涉及小鼠、猕猴和人类数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
878 2026-02-13
Maternal Trypanosoma cruzi infection is associated with significant placental remodeling regardless of vertical transmission
2026-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了母体克氏锥虫感染对胎盘微环境和全身生理的影响,及其与先天性传播的关联 将先天性恰加斯病的概念框架从以传播为中心转变为认识到感染驱动的胎盘损伤是一个病理谱,并确定外周血作为预测不良妊娠结局生物标志物的非侵入性来源 先天性恰加斯传播的机制仍不完全清楚,需要进一步应用单细胞分辨率方法来完善发病机制模型 探究母体克氏锥虫感染是否改变胎盘微环境和全身生理,以及这些改变是否与先天性传播相关 感染克氏锥虫的孕妇及其胎盘组织 空间转录组学 恰加斯病 bulk RNA测序, 蛋白质组学, 空间转录组学 NA RNA序列数据, 蛋白质数据, 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
879 2026-02-13
A technical comparison of spatial transcriptomics platforms across six cancer types
2026-Jan-12, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本研究系统性地比较了五种商业空间转录组学平台在六种癌症类型FFPE样本中的技术性能 首次在相同FFPE肿瘤样本上同时评估基于测序和基于成像的空间转录组学平台,并首次比较Xenium Multi-Tissue与Xenium Prime在同一样本上的表现 研究主要关注商业平台的技术比较,可能未涵盖所有新兴技术或非商业方法 为空间转录组学社区提供FFPE肿瘤高通量空间分析的技术基准和设计参考 六种癌症类型的匹配FFPE人类肿瘤切片 空间转录组学 多种癌症类型 空间转录组学 NA 空间转录组数据、蛋白质数据 六种癌症类型的匹配FFPE肿瘤切片 10x Genomics, NanoString 空间转录组学, 空间多组学 Visium v1, Visium v2/CytAssist, Visium HD, Xenium, CosMx Visium v1, Visium v2/CytAssist, Visium HD, Xenium Multi-Tissue (377基因), Xenium Prime (5,000基因), CosMx
880 2026-02-13
Intracellular microbial signals in the gastrointestinal tract of dairy cattle
2026-Jan-12, Microbiome IF:13.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞分析揭示了奶牛胃肠道细胞内微生物信号的存在及其与瘤胃发育的潜在关联 首次在奶牛胃肠道上皮细胞中应用单细胞宿主-微生物互作分析(SAHMI),并识别出与特定微生物物种相关的细胞内微生物信号 研究样本数量有限,仅包括新生和成年奶牛,且微生物信号的功能验证仍需进一步实验 探究奶牛胃肠道细胞内微生物的存在及其对瘤胃发育的影响 奶牛胃肠道组织,包括十种组织类型,来自新生和成年个体 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序,细菌荧光原位杂交(FISH) NA 单细胞RNA测序数据,图像数据 来自新生和成年奶牛的十种胃肠道组织类型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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