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当前共找到 1921 篇文献,本页显示第 841 - 860 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
841 2026-04-13
Utilising Machine Learning and Single-Cell Analysis to Uncover SKCM Metastasis-Related Genes
2026 Jan-Dec, IET systems biology IF:1.9Q3
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序和机器学习,揭示了皮肤黑色素瘤转移相关的核心基因及其调控机制 创新性地构建了结合粒子群优化算法和支持向量机的二元分类模型(PSO-SVM),用于准确预测肿瘤转移,并整合单细胞与转录组数据进行多维度分析 未明确说明样本的具体数量及来源,模型在其他癌症中的泛化能力有待进一步验证 阐明皮肤黑色素瘤(SKCM)转移的核心分子机制,寻找早期诊断和靶向治疗的潜在生物标志物 转移性皮肤黑色素瘤与原发性肿瘤细胞 机器学习 皮肤黑色素瘤 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) PSO-SVM(粒子群优化-支持向量机) 单细胞RNA测序数据、转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
842 2026-04-12
Prognostic risk model based on cholesterol metabolism-Associated gene module for idiopathic pulmonary fibrosis
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究基于胆固醇代谢相关基因模块,构建了特发性肺纤维化(IPF)的预后风险模型,并探讨了这些基因在IPF进展中的潜在作用 首次系统性地将胆固醇代谢相关基因与IPF预后联系起来,并利用WGCNA构建基因模块,结合单细胞RNA测序数据解析模型基因的细胞背景 研究主要基于公共数据库的转录组数据,样本量有限,且动物实验仅验证了mRNA表达水平,缺乏功能验证 构建IPF的预后风险模型并探索胆固醇代谢相关基因在IPF中的作用机制 特发性肺纤维化(IPF)患者及动物模型 生物信息学 特发性肺纤维化 bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, WGCNA, LASSO回归, 生存分析 预后风险模型(基于PDLIM7, CFAP45, HP基因) 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 来自GEO数据库的IPF患者转录组数据集(GSE150910和GSE93606)及单细胞RNA测序数据 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
843 2026-04-12
Integrative Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveals the Crosstalk of CTHRC1+ CAF and MMP7+ Epithelial Axis as a Potential Therapeutic Target and Predicts Poor Clinical Outcomes in Colorectal Cancer
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示了结直肠癌中CTHRC1+ CAF与MMP7+上皮细胞轴作为潜在治疗靶点及其与不良临床预后的关联 识别了八个不同的CAF亚型,并首次揭示了CTHRC1+ CAF与MMP7+恶性上皮细胞之间通过THBS2-SDC4配体-受体信号介导的特定通讯轴 研究主要基于公共数据集,缺乏实验验证;CAF的异质性和功能角色仍需进一步探索 探究结直肠癌中癌症相关成纤维细胞的异质性、可塑性及其与肿瘤微环境中其他细胞的相互作用 结直肠癌患者肿瘤组织中的细胞,特别是癌症相关成纤维细胞和恶性上皮细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 Harmony, Monocle2, CellChat 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 来自四个公共结直肠癌数据集的样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
844 2026-04-11
PDK4-driven metabolic reprogramming enhances mesothelial cell invasion in colorectal cancer peritoneal metastasis
2026-Jan-28, Acta biochimica et biophysica Sinica IF:3.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现PDK4是结直肠癌腹膜转移中促进间皮细胞侵袭的关键基因,其通过代谢重编程和β-catenin乙酰化调控细胞侵袭 首次在单细胞水平揭示PDK4通过驱动脂肪酸氧化代谢重编程和β-catenin乙酰化促进间皮细胞侵袭的新机制 样本量较小(12例患者),且主要基于体外实验,需要更多体内验证 探究间皮细胞在结直肠癌腹膜转移中的分子机制 结直肠癌患者的腹膜转移组织样本及间皮细胞 单细胞组学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 12例结直肠癌腹膜转移患者的组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
845 2026-04-11
CD73 blockade enhances antitumor efficacy of oHSV in solid tumors by increasing macrophage-mediated antigen presentation
2026-Jan-08, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究探讨了在实体瘤中,阻断CD73如何通过增强巨噬细胞介导的抗原呈递来提高溶瘤疱疹病毒(oHSV)的抗肿瘤疗效 首次揭示了免疫抑制性细胞外腺苷(eADO)信号是oHSV疗法的主要障碍,并证明CD73阻断能防止肿瘤免疫逃逸,联合疗法可促进实体瘤中抗肿瘤免疫记忆反应的形成 研究主要在两种实体瘤小鼠模型中进行,临床转化效果需进一步验证;单细胞测序样本来源和数量可能有限 探究免疫抑制性eADO信号在调节溶瘤疱疹病毒(oHSV)抗肿瘤免疫疗效中的作用 实体瘤(包括脑肿瘤模型)、CD73基因敲除小鼠模型、患者肿瘤标本、免疫细胞(如巨噬细胞、CD4+ T细胞) 肿瘤免疫学 实体瘤 单细胞RNA测序、流式细胞术免疫表型分析、免疫荧光成像、转录组分析 CD73基因敲除小鼠模型 基因表达数据、单细胞测序数据、流式细胞术数据、影像数据 患者治疗前后肿瘤标本、两种不同实体瘤模型的小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
846 2026-04-11
Elevated Tumor-Associated Androgen Receptor Activity Correlates with Poor Immune Infiltration and Immunotherapy Response across Cancer Types
2026-01-01, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 本研究探讨了雄激素受体(AR)活性在多种癌症类型和性别中与肿瘤浸润白细胞、患者预后及免疫治疗反应的相关性 首次在泛癌种水平系统评估AR活性与免疫浸润及免疫治疗反应的关联,揭示了AR活性作为跨癌种免疫治疗反应预测生物标志物的潜力 研究主要基于回顾性数据分析,需要前瞻性临床试验进一步验证AR阻断在免疫治疗耐药肿瘤中的疗效 探究AR信号在调节抗肿瘤免疫反应中的广泛影响,评估AR活性作为免疫治疗反应生物标志物的价值 33种TCGA癌症类型的肿瘤样本、前列腺癌单细胞RNA-seq数据、免疫治疗队列患者、转移性前列腺癌纵向活检样本 计算生物学 泛癌种研究(包括前列腺癌、肉瘤、卵巢癌等) RNA-seq、单细胞RNA-seq、通路分析、Cox回归、TIMER、单样本基因集富集分析、数字空间分析、免疫组化 网络分析方法、生存分析模型 转录组数据、单细胞数据、临床数据、空间蛋白质组数据 33种TCGA癌症类型的泛癌种队列、前列腺癌单细胞meta-atlas、多个免疫治疗队列 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
847 2026-04-11
Exploring hub genes related to adipocytokines in keloids: a combined analysis integrating single-cell, Mendelian randomization and bulk transcriptome data with experimental verification
2026, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞、孟德尔随机化和批量转录组数据分析,探索了与脂肪细胞因子相关的枢纽基因在瘢痕疙瘩中的作用,并进行了实验验证 首次结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和批量转录组数据,识别了PIK3R3和ANGPTL5作为瘢痕疙瘩中与脂肪细胞因子相关的潜在枢纽基因,并提供了新的分子证据和机制见解 ANGPTL5的表达验证结果不一致,可能受样本限制影响 识别瘢痕疙瘩的潜在治疗靶点并阐明与脂肪细胞因子相关的病理机制 瘢痕疙瘩组织 数字病理学 皮肤肿瘤 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, RT-qPCR 机器学习 转录组数据 未明确具体样本数量,但涉及公开可用的转录组数据和临床样本验证 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
848 2026-04-11
CCS-mediated mechanistic link between gestational diabetes mellitus and carpal tunnel syndrome: a multi-omics MR framework
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多组学孟德尔随机化框架揭示了妊娠期糖尿病与腕管综合征之间的因果关联,并识别出CCS基因作为关键分子介质 首次采用多组学整合方法(包括遗传相关性分析、孟德尔随机化、eQTL/pQTL分析、单细胞转录组等)系统阐明GDM通过CCS介导的氧化、免疫和纤维化通路导致CTS的机制 研究主要基于欧洲人群的遗传数据,可能限制其跨人群普适性;动物模型和分子对接结果需进一步实验验证 探究妊娠期糖尿病是否以及如何通过分子通路因果增加腕管综合征风险 妊娠期糖尿病女性与腕管综合征患者 生物信息学与多组学整合 妊娠期糖尿病与腕管综合征 连锁不平衡评分回归、双样本孟德尔随机化、全基因组关联研究、eQTL/pQTL分析、贝叶斯共定位、RNA-seq、单细胞RNA-seq、组织学、免疫荧光、分子对接 孟德尔随机化框架、贝叶斯模型 遗传数据、转录组数据、蛋白质组数据、单细胞数据、动物实验数据 基于FinnGen和UK Biobank的大规模人群队列,具体样本量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
849 2026-04-11
A lactylation modification-related prediction model for the diagnosis of ulcerative colitis based on machine learning
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究基于机器学习方法,通过分析GEO数据库中的溃疡性结肠炎数据集,识别了与乳酸化修饰相关的核心基因,并构建了一个高预测性能的诊断模型 首次将乳酸化修饰与溃疡性结肠炎诊断相结合,利用机器学习方法从多组学数据中筛选核心基因,并构建了具有高AUC值的诊断预测模型 研究主要基于公共数据集,缺乏大规模独立队列验证,体外实验验证范围有限 探究乳酸化修饰在溃疡性结肠炎发病机制中的作用,并开发基于乳酸化相关基因的诊断预测模型 溃疡性结肠炎患者样本数据及体外细胞实验 机器学习 溃疡性结肠炎 RNA测序,单细胞RNA测序 机器学习模型 基因表达数据 三个GEO数据集(GSE206285、GSE75214、GSE87466) NA 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 NA NA
850 2026-04-11
Comprehensive management of hematopoietic stem cell transplantation complications: from infection prevention to immune microenvironment reconstruction
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文系统综述了造血干细胞移植(HSCT)关键并发症(如感染、移植物抗宿主病、肝窦阻塞综合征)的管理,并探讨了从感染预防到免疫微环境重建的综合策略 强调了优化预处理方案以降低感染风险,讨论了来特莫韦等新型抗病毒药物在感染控制中的作用转变,分析了涉及效应与调节性T细胞失衡的GVHD发病机制,并指出肠道微生物群调节是一种有前景的干预措施 作为一篇综述文章,未报告原始研究数据,其结论基于现有文献的综合分析 系统回顾并探讨造血干细胞移植并发症的综合管理策略及未来研究方向 造血干细胞移植(HSCT)患者及其相关并发症 NA NA 单细胞测序,微生物组分析 人工智能 NA NA NA NA NA NA
851 2026-04-11
Renshen-Baidu-San restores epithelial-immune crosstalk and drives type 2 immune repair in ulcerative colitis: an integrated multi-omics study
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学方法,揭示了人参败毒散通过调节代谢通路、恢复上皮-免疫细胞互作并驱动2型免疫修复来治疗溃疡性结肠炎的机制 首次结合血清代谢组学、网络药理学、分子对接和单细胞RNA测序,系统阐明了人参败毒散在溃疡性结肠炎中恢复上皮-免疫串扰并促进2型免疫修复的多重作用机制 研究基于DSS诱导的小鼠溃疡性结肠炎模型,其结论在人类患者中的普适性仍需进一步验证 阐明人参败毒散治疗溃疡性结肠炎的潜在生物学机制 DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型及结肠类器官 多组学整合分析 溃疡性结肠炎 血清代谢组学, 网络药理学, 分子对接, 单细胞RNA测序, 结肠类器官实验 NA 代谢组数据, 转录组数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
852 2026-04-11
M2-type tumor-associated macrophages promote invasion of canine breast cancer through ADAM9 upregulation
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过犬乳腺肿瘤模型和人类转录组数据集,揭示了ADAM9作为M2型肿瘤相关巨噬细胞促进肿瘤侵袭的关键效应分子 首次在跨物种水平上确认ADAM9在M2极化TAMs中的富集,并阐明其通过ECM重塑和细胞骨架调控介导肿瘤侵袭的机制 研究主要基于体外模型和转录组数据分析,缺乏体内实验验证;犬模型与人类疾病的直接可比性需进一步确认 探究肿瘤相关巨噬细胞驱动肿瘤侵袭的分子机制,并识别关键效应分子 犬乳腺肿瘤模型、人类转录组数据集、IL-4诱导的M2巨噬细胞、肿瘤球体模型 肿瘤免疫学 乳腺癌 单细胞RNA测序、转录组分析、基因敲低、条件培养基实验 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
853 2026-04-11
Sparse dimensionality reduction for analyzing single-cell-resolved interactions
2026, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 本文提出了一种针对单细胞细胞间相互作用数据的端到端降维工作流程,旨在简化细胞对间相互作用模式的分析 采用稀疏降维方法(特别是Boosting Autoencoder)来精确定位与细胞对簇相关的特定配体-受体相互作用,并提供包括结果可视化在内的全面工作流程 未在摘要中明确提及具体限制,但可能依赖于已知配体-受体相互作用的先验信息 增强单细胞转录组学数据中细胞间相互作用的重建和分析 单细胞细胞间相互作用数据,特别是基于配体-受体相互作用的细胞对 机器学习 NA 单细胞转录组学 Boosting Autoencoder 单细胞转录组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
854 2026-04-11
Signaling Through SCFA Receptors Gpr43 and Gpr109a Drives Pro-Inflammatory M1 Macrophage Polarization in Periodontitis
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究探讨了牙周炎中微生物群衍生的短链脂肪酸失衡与宿主免疫失调之间的联系,重点关注炎症性巨噬细胞的代谢重编程 通过整合系统综述、meta分析、批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,揭示了牙周炎中M1巨噬细胞极化受SCFA受体Gpr43和Gpr109a信号驱动的机制,并提出了“SCFA受体-代谢感应-炎症转录”的新疾病进展模型 meta分析显示丁酸盐水平下降趋势不显著;研究主要基于转录组学数据,缺乏蛋白质或功能验证 阐明牙周炎中短链脂肪酸代谢失衡如何通过影响巨噬细胞极化驱动疾病进展 人类牙龈组织、小鼠骨髓细胞 生物信息学 牙周炎 RNA-seq, scRNA-seq, 系统综述与meta分析 CIBERSORT, 伪时间轨迹分析 转录组测序数据 人类牙龈组织样本24例,小鼠单细胞数据未明确样本数 NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
855 2026-04-11
Protocol: A multi-factorial, multi-centre study, for biomarker identification in healthy controls for comparison to babies with moderate-severe NESHIE
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究是一项多中心观察性研究,旨在通过整合临床和分子数据,全面比较中度至重度新生儿缺氧缺血性脑病(NESHIE)患儿与健康足月对照,以阐明NESHIE的临床和生物学机制 提供了南非队列中NESHIE分子和微生物景观的多维视角,整合了基因组学、表观遗传学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组学和病理学等多种分析手段 研究设计为观察性研究,无法确定因果关系;样本来自特定地理区域(南非),可能限制结果的普适性 阐明新生儿缺氧缺血性脑病(NESHIE)的临床和生物学机制,以支持早期诊断生物标志物的开发、改善风险分层并指导新的治疗策略 中度至重度NESHIE新生儿和健康足月新生儿 数字病理学 新生儿缺氧缺血性脑病 全基因组测序、亚硫酸氢盐测序、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、液相色谱-质谱联用技术 NA 基因组数据、DNA甲基化数据、基因表达数据、蛋白质组数据、代谢组数据、微生物组数据、组织病理学图像 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
856 2026-04-11
Combined single-cell transcriptome and Mendelian randomization to identify and validate prognostic genes associated with endoplasmic reticulum stress and butyrate metabolism in lung adenocarcinoma
2026, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究整合单细胞转录组分析和孟德尔随机化方法,鉴定并验证了与内质网应激和丁酸代谢相关的肺腺癌预后基因 首次结合单细胞转录组与孟德尔随机化识别肺腺癌中内质网应激和丁酸代谢共调控的预后基因,并构建风险模型和列线图 需要临床队列和功能研究进一步验证以转化至临床应用 识别和验证与内质网应激和丁酸代谢相关的肺腺癌预后基因,以改善诊断、预后和潜在治疗靶点 肺腺癌患者数据及非小细胞肺癌细胞系 数字病理学 肺癌 单细胞转录组分析, 孟德尔随机化, RT-qPCR 加权基因共表达网络分析, 风险模型, 列线图 转录组数据, 单细胞数据 公共数据集及不同非小细胞肺癌细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
857 2026-04-10
PURE-seq integrates FACS and PIP-seq for single-cell genomics of ultra-rare cells
2026-Jan-21, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为PURE-seq的新方法,该技术整合了FACS和PIP-seq,用于对超稀有细胞进行单细胞基因组学研究 开发了PURE-seq技术,通过直接FACS分选细胞到PIP-seq反应中,实现了对超稀有细胞(如稀有度达百万分之一的细胞)的高效捕获和单细胞测序 NA 开发一种高灵敏度的方法,用于单细胞测序超稀有细胞,以解决传统单细胞转录组学中稀有细胞群体被稀释的问题 循环肿瘤细胞(来自转移性黑色素瘤患者血液)以及年轻、老年和中年小鼠的造血干细胞和祖细胞 单细胞基因组学 黑色素瘤 单细胞转录组学,FACS,PIP-seq NA 基因表达谱 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
858 2026-04-10
CD19 CAR T-Cell Therapy for Autoimmune Hemolytic Anemia
2026-Jan-15, The New England journal of medicine
研究论文 本研究评估了CD19 CAR T细胞疗法在治疗多难治性自身免疫性溶血性贫血患者中的安全性和疗效 首次将CD19 CAR T细胞疗法应用于多难治性自身免疫性溶血性贫血,并利用多组学分析揭示了复发特异性B细胞生态位的细胞间相互作用 样本量较小(11例患者),中位随访时间仅12.2个月,需要更大规模和更长期的随访研究 评估CD19 CAR T细胞疗法在多难治性自身免疫性溶血性贫血患者中的安全性和疗效 多难治性自身免疫性溶血性贫血患者 NA 自身免疫性溶血性贫血 流式细胞术、单细胞RNA测序、配对B细胞受体测序 NA 临床数据、多组学数据 11例患者(5例来自同情使用项目,6例来自1期研究) NA 单细胞RNA测序 NA NA
859 2026-04-10
MIF-mediated reprogramming of myeloid lineage within the glioma tumor microenvironment impacts the efficacy of immune stimulatory gene therapy
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析野生型和突变型IDH1胶质瘤的细胞异质性,重点关注髓系细胞群,揭示了MIF-CD74轴在调节胶质瘤免疫微环境中的关键作用 首次结合单细胞RNA测序和MIF-CD74轴机制研究,在胶质瘤中揭示MIF介导的髓系细胞重编程对免疫刺激基因疗法疗效的影响 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证有限,且未详细探讨其他免疫细胞亚群的作用 探究胶质瘤肿瘤微环境中髓系细胞的异质性及其对免疫疗法疗效的影响 野生型和突变型IDH1胶质瘤的髓系细胞群,特别是单核细胞来源的肿瘤相关巨噬细胞 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 未明确指定样本数量,但涉及wtIDH1和mIDH1胶质瘤模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
860 2026-04-09
Transcriptional signature of induced neurons differentiates virologically suppressed people with HIV from people without HIV
2026-Jan-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用诱导神经元模型,揭示了HIV感染者与未感染者之间的转录组差异,并识别出与神经认知损伤相关的基因特征 首次使用诱导神经元模型来模拟HIV感染者的神经元生物学和损伤,并发现IFI27上调及FOXL2NB-FOXL2-LINC01391表达降低与神经认知损伤相关 样本量较小(仅6名HIV感染者和7名未感染者),且研究基于体外诱导神经元模型,可能无法完全反映体内复杂环境 探索HIV感染者神经认知损伤的潜在机制 HIV感染者和未感染者的诱导神经元 数字病理学 HIV感染 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 诱导神经元模型 转录组数据 6名HIV感染者和7名未感染者的皮肤成纤维细胞衍生的诱导神经元 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
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