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当前共找到 1652 篇文献,本页显示第 841 - 860 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
841 2026-02-15
Resolving Single-Cell Gene Expression by Pseudotemporal Integration of Transcriptomic and Proteomic Datasets
2026-Jan, Molecular & cellular proteomics : MCP IF:6.1Q1
研究论文 本研究提出了一种利用伪时间细胞排序整合单细胞RNA-Seq和单细胞蛋白质组学数据的新方法,以分析缺氧条件下的转录-翻译表达动态 通过伪时间轨迹整合单细胞转录组和蛋白质组数据,揭示转录和翻译响应的时间差异,如即时转录组响应和延迟蛋白质组表达 NA 整合单细胞转录组和蛋白质组数据,构建全面的转录-翻译图谱,以理解缺氧应激下的细胞表型 单细胞样本(在缺氧条件下采集的纵向样本) 单细胞组学 NA 单细胞RNA-Seq, 单细胞蛋白质组学(质谱分析) NA 转录组数据, 蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 NA NA
842 2026-02-15
TMEM106C, BSG, COPE, CDCA8, KPNA2, LIG1, UQCRH, and CCT5: Predictive of Survival and Immunotherapy Resistance in Hepatocellular Carcinoma
2026, Human mutation IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和转录组分析,构建了一个基于衰老相关基因的预后模型,用于预测肝细胞癌患者的生存和免疫治疗反应 整合单细胞RNA测序和转录组数据,识别并验证了一个由八个基因(TMEM106C, BSG, COPE, CDCA8, KPNA2, LIG1, UQCRH, CCT5)组成的衰老相关基因特征,该特征可作为预测HCC预后和免疫治疗耐药性的稳健工具 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,实验验证主要在细胞系中进行,缺乏体内模型或大规模前瞻性临床队列的验证 识别肝细胞癌中与衰老相关的基因特征,构建预后模型以预测患者生存和免疫治疗反应 肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的细胞,特别是自然杀伤细胞 生物信息学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,转录组分析,qRT-PCR,CCK-8,伤口愈合实验,Transwell实验 LASSO Cox回归风险模型 单细胞RNA测序数据,批量转录组数据 来自GEO和TCGA数据库的样本,共识别了80,997个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
843 2026-02-15
Gut Microbiota-Derived Metabolites Regulate CASP3 and Neuroimmune Pathways in Multiple Sclerosis: An Integrative Multiomics Study
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合网络药理学、机器学习和单细胞转录组分析,揭示了肠道菌群代谢物通过调节CASP3及神经免疫通路在多发性硬化症中的作用 首次将网络药理学、机器学习(SHAP方法)和单细胞转录组分析结合,识别出CASP3作为肠道菌群代谢物的核心靶点,并通过孟德尔随机化验证因果关系 研究结果需要进一步的实验验证来确认机制和转化潜力 探究肠道菌群代谢物在多发性硬化症发病机制中的作用,识别潜在治疗靶点 多发性硬化症相关的差异表达基因、肠道菌群代谢物及其靶点 机器学习 多发性硬化症 网络药理学、机器学习、单细胞转录组分析、孟德尔随机化、分子对接 机器学习模型(未指定具体类型,但使用了SHAP方法) 转录组数据、单细胞数据 NA NA 单细胞转录组分析 NA NA
844 2026-02-15
Causal Association Between Plasma Proteins and Pericarditis: A Mendelian Randomization Study With Therapeutic Target Identification
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过孟德尔随机化分析探讨了血浆蛋白与心包炎之间的因果关系,并识别了潜在的治疗靶点 首次利用大规模血浆蛋白组GWAS数据,结合孟德尔随机化方法系统评估了血浆蛋白与心包炎的因果关联,并整合了单细胞RNA测序分析和分子对接技术来识别潜在治疗靶点和化合物 研究人群仅限于欧洲血统个体,可能限制了结果在其他人群中的普适性;孟德尔随机化分析依赖于遗传变异作为工具变量,可能存在残留混杂或水平多效性 评估血浆蛋白与心包炎之间的因果关系,并探索潜在的治疗靶点 35,559名欧洲血统个体的遗传和血浆蛋白数据,以及心包炎的遗传关联数据 生物信息学与遗传流行病学 心血管疾病 全基因组关联研究(GWAS)、孟德尔随机化(MR)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接 逆方差加权中位数法、方差加权法、MR-Egger回归 遗传变异数据、血浆蛋白定量数据、单细胞基因表达数据 35,559名欧洲血统个体 NA 单细胞RNA测序 NA NA
845 2026-02-15
Development and validation of an interpretable machine learning model identify the lactylation-related protein SUSD3 as a prognostic and therapeutic biomarker for breast cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究开发并验证了一个可解释的机器学习模型,用于识别乳酸化相关蛋白SUSD3作为乳腺癌的预后和治疗生物标志物 首次结合多种机器学习算法构建了与免疫细胞浸润、趋化因子表达和肿瘤突变负荷相关的乳酸化相关特征,并实验验证了枢纽基因SUSD3的作用 NA 探究乳酸化在乳腺癌发生发展中的作用,并开发用于预测恶性进展和免疫逃逸的风险模型 乳腺癌 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序、转录组学、空间转录组学 多种机器学习算法组合 基因组数据、转录组数据 来自公共数据库(TISCH、TCGA、GEO)的大量数据集 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq NA NA
846 2026-02-15
Integrated single-cell analysis with experimental validation reveals ANXA2 as a therapeutic target for ferroptosis in inflammatory bowel disease
2026, American journal of translational research IF:1.7Q4
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序分析与实验验证,揭示了ANXA2作为炎症性肠病中铁死亡的关键治疗靶点 首次结合单细胞RNA测序与实验验证,识别出ANXA2作为IBD中铁死亡的核心靶点,并验证其在体外和体内模型中的调控作用 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类样本验证有限,且铁死亡机制在IBD中的具体通路仍需进一步探索 识别与炎症性肠病中铁死亡相关的潜在治疗靶点 炎症性肠病(IBD)患者和DSS诱导的IBD小鼠模型中的结肠组织细胞 数字病理学 炎症性肠病 单细胞RNA测序,RT-qPCR,Western blotting,流式细胞术,ELISA,免疫荧光染色 NA 单细胞RNA测序数据,基因表达数据,蛋白质表达数据 28,974个细胞(来自GSE134809数据集) NA 单细胞RNA-seq NA NA
847 2026-02-15
Utilisation of spatial methodologies for the investigation of the tumour microenvironment
2026, Methods in cell biology
综述 本章节为研究人员提供了关于空间转录组学技术的实用指南,重点介绍了三种主流平台及其在肿瘤微环境研究中的应用 系统比较了Merscope、CosMx和Xenium三种前沿空间转录组学平台的原理与差异,并提供了从样本制备到数据分析的详细实验方案与实用技巧 作为技术指南章节,未报告新的实验数据或临床验证结果,主要基于现有技术和作者经验进行总结 为研究人员提供实施空间转录组学技术的实用指导,以促进肿瘤微环境表征和精准肿瘤学研究 肿瘤微环境中的空间组织特征,特别是巨噬细胞、细胞毒性T淋巴细胞等免疫细胞的分布与相互作用 空间转录组学 癌症 空间转录组学、多重成像 NA 空间转录组数据、成像数据 NA NA 空间转录组学 Merscope, CosMx, Xenium 三种主流空间转录组学分析平台
848 2026-02-14
Nectin-4 reduces T cell effector function and is a therapeutic target in pancreatic cancer
2026-Jan-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过分析胰腺导管腺癌(PDAC)中TIGIT轴配体和受体,发现Nectin-4在肿瘤细胞中特异性表达,与不良预后相关,并能抑制T细胞效应功能,而抗体药物偶联物enfortumab vedotin靶向Nectin-4可抑制肿瘤生长 首次在PDAC中揭示Nectin-4作为T细胞功能抑制因子和潜在治疗靶点,并通过患者来源的类器官模型验证了靶向Nectin-4的治疗效果 研究主要基于体外实验和类器官模型,缺乏体内临床试验验证,且样本来源和规模可能有限 探索PDAC中TIGIT轴相关分子在肿瘤免疫微环境中的作用,并寻找新的治疗靶点 胰腺导管腺癌(PDAC)患者肿瘤组织、血液样本、患者来源的PDAC类器官 数字病理学 胰腺癌 多色流式细胞术、免疫组化(IHC)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 图像、文本(基因表达数据) 来自不同阶段PDAC患者的肿瘤和血液样本、原发性肿瘤和肝转移样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
849 2026-02-14
Small molecule inhibition rescues the skeletal dysplasia phenotype of Trpv4 mutant mice
2026-Jan-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过构建表达TRPV4 p.R594H突变的敲入小鼠模型,探究TRPV4骨骼发育不良的机制,并测试TRPV4特异性抑制剂GSK2798745的治疗效果 首次在TRPV4骨骼发育不良小鼠模型中,通过体内实验证明TRPV4特异性抑制剂能显著改善骨骼表型并挽救生长板组织学异常,为靶向治疗提供了临床前证据 研究基于小鼠模型,其治疗结果向人类转化的有效性尚需进一步验证,且长期安全性和剂量优化未在本文中探讨 探究TRPV4骨骼发育不良的疾病机制,并验证TRPV4通道抑制作为治疗策略的可行性 表达p.R594H Trpv4突变的敲入小鼠模型及其软骨细胞 数字病理学 骨骼发育不良 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) 敲入小鼠模型 转录组数据 未在摘要中明确指定样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
850 2026-02-14
Transcriptomic characters of cochlear vascular cells with pericyte-driven angiogenetic activity
2026-Jan-23, Research square
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了成年小鼠耳蜗的内皮细胞和周细胞,揭示了耳蜗血管的分子特征和周细胞在血管生成中的关键作用 首次使用单细胞RNA测序技术全面解析耳蜗血管细胞的转录组特征,并发现周细胞具有向尖端细胞转化的能力,这为耳蜗血管再生提供了新靶点 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证,且体外实验模型可能无法完全模拟体内复杂环境 探究耳蜗血管细胞的遗传和分子特性,以理解其在听觉功能维持和血管再生中的作用 成年小鼠耳蜗的内皮细胞和周细胞 单细胞转录组学 听力障碍 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 成年小鼠耳蜗细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
851 2026-02-14
SAGE-FM: A lightweight and interpretable spatial transcriptomics foundation model
2026-Jan-21, ArXiv
PMID:41647237
研究论文 本文提出了一种轻量级且可解释的空间转录组学基础模型SAGE-FM,该模型基于图卷积网络,通过掩码中心点预测目标进行训练 开发了首个基于图卷积网络的轻量级空间转录组学基础模型,能够学习空间一致的嵌入表示,并在下游任务中表现出良好的泛化能力 模型仅在人类Visium样本上进行训练,尚未在其他平台或物种数据上验证其通用性 构建一个参数高效、可解释且具有空间感知能力的空间转录组学基础模型 空间转录组学数据 空间转录组学 口咽鳞状细胞癌、胶质母细胞瘤 空间转录组学 图卷积网络(GCN) 空间基因表达数据 416个人类Visium样本,涵盖15个器官 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间基因表达平台
852 2026-02-14
Nephron-associated Support Cell Transcriptional Plasticity Expands in Hypertension
2026-Jan-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过单细胞RNA测序分析高血压小鼠肾脏中的肾单位相关支持细胞,揭示了其在高血压条件下的转录可塑性变化 首次在高血压模型中鉴定出肾单位相关支持细胞的转录可塑性,并发现其相比淋巴管内皮细胞对炎症诱导变化更具抵抗力 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;样本量相对有限 探究高血压对肾脏细胞类型(特别是支持细胞)转录组的影响 高血压小鼠肾脏中的CD31+和podoplanin+细胞,重点关注肾单位相关支持细胞和淋巴管内皮细胞 单细胞转录组学 高血压 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 来自两种高血压小鼠模型的肾脏细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
853 2026-02-14
Klotho protects the osteogenic function of human periodontal ligament stem cells in periodontitis by inhibiting NOX4-mediated ferroptosis
2026-Jan-16, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究揭示了Klotho蛋白通过抑制NOX4介导的铁死亡,保护人牙周膜干细胞在牙周炎环境中的成骨功能 首次发现Klotho在牙周炎炎症环境中通过抑制NOX4表达来对抗hPDLSCs的铁死亡,从而保护其成骨功能 研究主要在体外炎症环境和动物模型中进行,尚未在人体临床试验中验证 探究Klotho蛋白是否能在炎症环境中保护人牙周膜干细胞免受铁死亡影响并维持其成骨功能 人牙周膜干细胞(hPDLSCs) 干细胞生物学与组织工程 牙周炎 单细胞RNA测序,细胞培养,动物模型 NA 基因表达数据,细胞表型数据 C57BL/6小鼠模型及体外培养的hPDLSCs NA 单细胞RNA-seq NA NA
854 2026-02-14
Targeting the CCL7-STAT1 axis attenuates microglial neurotoxicity and photoreceptor degeneration in retinitis pigmentosa
2026-Jan-16, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序鉴定出CCL7-STAT1轴是视网膜色素变性中驱动小胶质细胞功能障碍和光感受器退化的关键通路 首次在视网膜色素变性模型中通过单细胞RNA测序鉴定出CCL7hi小胶质细胞亚群,并揭示了CCL7-STAT1信号轴作为小胶质细胞介导的神经炎症和光感受器退化的核心分子机制 研究主要基于rd10小鼠模型,其发现是否完全适用于人类视网膜色素变性患者尚需进一步验证 阐明视网膜色素变性中驱动小胶质细胞功能障碍和光感受器退化的分子机制,并探索潜在的治疗靶点 rd10小鼠模型的视网膜小胶质细胞和光感受器 单细胞组学 视网膜色素变性 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 rd10小鼠模型的视网膜组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
855 2026-02-14
Macrophage Niche Reconstitution Reveals Dynamic Transcriptional and Communication Networks Renal Macrophage-Epithelial Communication
2026-Jan-16, Research square
研究论文 本研究通过诱导性hCD59 ILY消融系统结合纵向单细胞RNA测序,揭示了肾脏驻留巨噬细胞在急性耗竭后再生过程中的动态转录和细胞间通讯网络 首次系统性地描绘了肾脏巨噬细胞再生过程中的转录调控和细胞间通讯网络,并识别了上皮细胞来源的CX3CL1在驱动巨噬细胞招募和维持中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,其发现向人类肾脏的转化需要进一步验证 阐明肾脏驻留巨噬细胞在急性耗竭后再生过程中的细胞和分子机制 肾脏驻留巨噬细胞和肾上皮细胞 单细胞组学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 SCENIC, STRING 单细胞转录组数据 小鼠肾脏样本在基线及消融后第1、3、7天进行纵向采集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
856 2026-01-18
Combining spatial and single-cell transcriptome data to analyze tertiary lymphoid structures in clear cell renal cell carcinoma reveals prognostic biomarkers
2026-Jan-15, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
857 2026-02-14
Immune dysregulation triggered by inflammatory cytokines in patients with severe respiratory infections
2026-Jan-15, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了重症呼吸道感染患者中由炎症细胞因子触发的免疫失调机制,并评估了高剂量重组蛋白疫苗的潜在保护作用 构建了包含299,527个PBMCs的高分辨率免疫细胞图谱,首次系统性地描绘了COVID-19不同严重程度(中度、重度、危重、恢复期)患者的免疫特征,并发现高剂量重组蛋白疫苗可抑制单细胞炎症反应、增强保护性免疫 样本量相对较小(17例患者),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证结论 探究重症呼吸道病毒感染中免疫失调的潜在机制,并评估疫苗接种对免疫反应的影响 17例不同严重程度(中度、重度、危重、恢复期)的COVID-19患者的外周血单个核细胞(PBMCs) 单细胞组学 呼吸道感染(COVID-19) 单细胞转录组测序 NA 单细胞RNA测序数据 17例COVID-19患者(包括中度、重度、危重及恢复期病例)的PBMCs,共299,527个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
858 2026-02-14
Activating KRAS mutations mark premalignant cystic structures in congenital pulmonary airway malformations
2026-Jan-15, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了先天性肺气道畸形中KRAS突变作为恶性转化风险因子的作用 首次在先天性肺气道畸形中利用单细胞RNA测序结合气道类器官模型,系统比较KRAS突变与非突变区域的细胞组成和基因表达差异,揭示了KRAS突变与肺癌相似的转录组特征 样本量较小(n=3),可能限制统计功效和结论的普适性;研究基于类器官模型,可能与体内实际情况存在差异 评估KRAS突变作为先天性肺气道畸形恶性转化风险标志物的潜力,以指导临床治疗策略 先天性肺气道畸形患者的切除肺组织,包括病变区域(囊肿)和非病变区域(对照) 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,类器官培养 气道类器官模型 单细胞转录组数据,图像数据 3例患者(KRAS突变与非突变对比) NA 单细胞RNA-seq NA NA
859 2026-02-14
Spatiotemporal transcriptomic mapping reveals region-specific glial activation and astrocyte shifts in epileptogenesis beyond the hippocampus
2026-Jan-15, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,绘制了癫痫发生过程中大鼠脑内基因表达的时空动态图谱,揭示了海马以外区域的胶质细胞激活和星形胶质细胞功能亚型转变 首次在癫痫发生模型中应用Visium空间转录组学技术,系统性地揭示了癫痫发生过程中海马以外区域(如白质束和多个丘脑核团)的胶质细胞激活和星形胶质细胞功能亚型转变,挑战了传统上以海马为中心的癫痫发生观点 研究基于锂-毛果芸香碱诱导的癫痫持续状态大鼠模型,其结果在人类颞叶癫痫中的普适性有待验证;样本量相对较小(n=16);空间转录组学技术本身的分辨率限制 探究颞叶癫痫发生过程中,大脑不同区域在分子和细胞水平上的动态变化,特别是胶质细胞的激活模式和星形胶质细胞的功能转变 锂-毛果芸香碱诱导的癫痫持续状态大鼠模型(实验组)和对照组大鼠的冠状脑切片 空间转录组学 颞叶癫痫 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 16只大鼠(包括实验组和对照组) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium Visium空间基因表达技术
860 2026-02-14
Single-cell and immune-context integration identifies basement-membrane/metastasis signatures that sharpen bladder-cancer diagnosis and prognosis
2026-Jan-14, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究开发了一个基于转移-基底膜相关基因(MBRGs)的可解释预后模型,用于改善膀胱癌的临床和个性化治疗策略 通过整合单细胞和免疫背景分析,识别出基底膜/转移相关基因特征,并构建了一个六基因风险模型,该模型在TCGA和GEO队列中显示出良好的预后预测能力,并利用SHAP分析量化了特征贡献 模型在TCGA和GEO队列中的AUC值范围较宽(0.602-0.742),表明预测性能有待进一步优化,且研究主要基于公共数据库数据,缺乏前瞻性临床验证 增强膀胱癌的临床诊断和预后预测,并探索个性化治疗策略 膀胱癌患者 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, 功能富集分析 LASSO回归, Cox回归, 风险模型 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 TCGA和GEO队列中的膀胱癌患者样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
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