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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
821 2026-06-13
Neuro-immune-related gene signatures define molecular subtypes and prognostic score in bladder cancer with SERPINE2 as a potential therapeutic target
2026, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 通过分析神经免疫相关基因表达谱,构建膀胱癌分子亚型和预后评分模型,并验证SERPINE2作为潜在治疗靶点 首次系统揭示神经免疫相关基因在膀胱癌中的分子亚型特征,构建预后评分模型,并发现SERPINE2的致癌作用 未提及明显局限性,但研究基于公开数据库,可能需要更多临床样本验证 探索神经免疫相互作用在膀胱癌中的分子特征,建立预后预测模型并发现新治疗靶点 膀胱癌患者的转录组数据和单细胞转录组数据 机器学习 膀胱癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, shRNA敲低 NA 转录组数据, 单细胞转录组数据 来自TCGA和UCSC Xena数据库的膀胱癌样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
822 2026-06-13
Itaconate Modulates Neutrophil Homeostasis to Ameliorate Airway Inflammation in Diesel Exhaust Particles-exacerbated Asthma via Inhibiting NETs Formation
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本文发现衣康酸通过抑制中性粒细胞胞外陷阱形成来调节中性粒细胞稳态,从而改善柴油机尾气颗粒加重的哮喘气道炎症 首次揭示中性粒细胞在DEP诱导的糖皮质激素抵抗性哮喘中的双重免疫调节功能,并阐明衣康酸作为负调控因子的治疗潜力 NA 研究衣康酸在DEP加重的中性粒细胞性哮喘中的免疫调节机制及治疗潜力 小鼠哮喘模型中的中性粒细胞和Th17细胞 NA 哮喘 多组学分析、单细胞测序 NA 基因表达数据 小鼠模型样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序分析
823 2026-06-13
Targeting Macrophage-to-Myofibroblast Transition Mitigates Progression from Inflammation to Fibrosis in Rosacea
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究揭示巨噬细胞-肌成纤维细胞转化(MMT)是玫瑰痤疮从炎症进展为纤维化的关键驱动因素,并发现天然苦木素Bruceine A通过靶向STAT3棕榈酰化发挥双重抑制作用 首次发现MMT在玫瑰痤疮纤维化重塑中的致病作用,鉴定STAT3棕榈酰化作为新治疗靶点,并发现Bruceine A的双重作用机制 NA 阐明玫瑰痤疮中巨噬细胞浸润促进纤维化重塑的分子机制,并寻找潜在治疗靶点 玫瑰痤疮患者皮肤活检组织及LL37诱导的玫瑰痤疮小鼠模型 数字病理学 皮肤病 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 血清蛋白质组学, 组织学染色, 谱系追踪 NA 基因表达数据, 空间转录数据, 蛋白质组数据, 组织图像 玫瑰痤疮患者皮肤活检样本及LL37诱导小鼠模型样本 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
824 2026-06-13
ANXA1-mediated mTOR/FABP4 Inhibition Drives Antifibrotic Macrophage Reprogramming in Lupus Nephritis
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究发现ANXA1通过抑制mTOR/FABP4通路驱动抗纤维化巨噬细胞重编程,减轻狼疮性肾炎的纤维化 首次揭示ANXA1通过FPR2/ALX受体抑制mTOR/FABP4活性,促进脂肪酸氧化从而驱动巨噬细胞向抗纤维化表型极化的分子机制 暂无明确说明 阐明ANXA1在狼疮性肾炎巨噬细胞介导的纤维化中的功能及机制 狼疮性肾炎患者和狼疮易感小鼠模型的研究对象 机器学习 狼疮性肾炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 狼疮性肾炎患者和狼疮易感小鼠的肾脏组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
825 2026-06-13
Lactylation-driven metabolic reprogramming promotes osteosarcoma malignancy via HDGF-mediated proliferation and immune modulation
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过多组学整合分析揭示乳酰化驱动的代谢重编程通过HDGF促进骨肉瘤恶性进展和免疫调节的机制 首次发现乳酰化-HDGF调控轴在骨肉瘤中的作用,并结合单细胞测序、空间转录组学和机器学习预后模型系统解析乳酰化相关网络 文章未提及明显局限性 探究代谢重编程通过乳酰化修饰驱动骨肉瘤进展和免疫微环境调节的机制 骨肉瘤组织样本和细胞系 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 SHAP可解释性框架, 共表达网络分析 基因表达数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
826 2026-06-13
Exploring glycerophospholipid metabolism in nasopharyngeal carcinoma: interactions between malignant epithelial cells and CCL11-expressing fibroblasts
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 探究鼻咽癌中甘油磷脂代谢的机制及其与CCL11表达成纤维细胞的相互作用 整合单细胞转录组学、10x空间转录组学和空间代谢组学的多组学方法,首次揭示恶上皮细胞与CCL11表达成纤维细胞间的代谢相互作用 未提及具体局限性 阐明鼻咽癌中甘油磷脂代谢的作用,特别是恶上皮细胞与成纤维细胞间的相互作用 鼻咽癌组织中的恶上皮细胞和成纤维细胞 数字病理学, 机器学 鼻咽癌 单细胞转录组学, 空间转录组学, 空间代谢组学 NA 图像, 文本 鼻咽癌组织样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 10x 空间转录组学 10x 空间转录组学平台
827 2026-06-13
Characterizing malignant prognostic signatures in primary glioma based on single-cell and bulk transcriptome sequencing
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 基于单细胞和批量转录组测序表征原发性胶质瘤的恶性预后标志 整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,通过Cox回归和LASSO方法识别出三个新的恶性预后标志IGFBP2、MDK和RARRES2,并验证其预测准确性 NA 识别原发性胶质瘤的恶性预后标志并探索其与药物反应和免疫细胞浸润的相关性 原发性胶质瘤患者的肿瘤组织样本 机器学习 胶质瘤 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 Cox回归, LASSO 基因表达数据 TCGA和CGGA队列的批量RNA测序数据以及GEO数据集和内部样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
828 2026-06-13
GPX7 marks fibroblast-associated stromal-innate immune crosstalk in ulcerative colitis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究整合孟德尔随机化、跨队列结肠转录组学和单细胞RNA测序,发现GPX7是溃疡性结肠炎中成纤维细胞相关基质-先天免疫交互作用的标志物 首次将丝氨酸-甘氨酸-一碳代谢与溃疡性结肠炎的成纤维细胞-巨噬细胞交互作用联系起来,并通过基因支持、临床分层和共培养模型等多维度验证 研究局限于相关性分析和初步扰动实验,缺乏体内功能验证和因果机制的深入解析;分子对接和动力学模拟仅作为假设生成的结构分析,尚需实验验证 探究丝氨酸-甘氨酸-一碳代谢在溃疡性结肠炎成纤维细胞-巨噬细胞交互作用中的作用 溃疡性结肠炎患者的结肠黏膜组织样本、成纤维细胞和巨噬细胞 生物信息学 溃疡性结肠炎 孟德尔随机化、全转录组测序、单细胞RNA测序、qPCR、共培养模型、分子对接与动力学模拟 NA 转录组数据、单细胞测序数据、临床队列数据 多个队列的结肠组织样本(具体数量未在摘要中提供);一个独立临床队列中因夫利昔单抗应答者与非应答者的活检样本 NA 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA NA
829 2026-06-13
Integrative multi-omics analysis identifies SNRPE as a key driver gene in uterine corpus endometrial carcinoma: promoting tumor progression, and mediating immune evasion
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 整合多组学分析发现SNRPE是子宫内膜癌关键驱动基因,促进肿瘤进展并介导免疫逃逸 首次鉴定SNRPE通过调控可变剪接同时影响肿瘤内在恶性进展和外在免疫抑制的机制 未充分阐明SNRPE调控剪接的具体分子机制及临床应用潜力 探究SNRPE在子宫内膜癌中驱动肿瘤进展和免疫逃逸的分子机制 子宫内膜癌患者样本及细胞系 数字病理学 子宫内膜癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, sQTL, eQTL, GWAS NA 基因表达数据, 剪接定量数据, 单细胞转录组数据 TCGA-UCEC队列及独立临床样本队列 Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq NA
830 2026-06-13
Research progress of CMTM4 in the tumor immune microenvironment and immunotherapy
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了CMTM4在肿瘤免疫微环境及免疫治疗中的研究进展 首次系统总结CMTM4在PD-L1稳定性调控、与TME相关膜蛋白互作、以及作为免疫检查点抑制剂耐药潜在生物标志物和治疗靶点的三方面机制 当前研究模型存在局限性,临床转化面临挑战,且CMTM4的功能具有环境依赖性,尚未解决许多机制性问题 阐明CMTM4在肿瘤免疫调控中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 CMTM4蛋白及其在肿瘤免疫微环境中的功能 数字病理学 肿瘤 NA NA NA NA NA 单细胞多组学, 空间转录组学, 蛋白质组学 NA NA
831 2026-06-13
Integrative multi-omics analysis reveals inflammation-related molecular networks in acute mountain sickness
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 整合多组学分析揭示急性高山病中炎症相关的分子网络 首次通过整合bulk RNA-seq、非编码RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,系统揭示单核细胞介导的炎症和ErbB通路在高海拔脑水肿中的关键机制,并鉴定HBEGF为潜在治疗靶点 未提及具体局限性 探索急性高山病中炎症相关的分子调控网络 急性高山病和脑水肿的分子机制 机器学习 急性高山病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因本体分析, KEGG通路分析 NA 基因表达数据 多个公开数据集(GSE75665, GSE90500)及小鼠模型 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 非编码RNA-seq NA NA
832 2026-06-13
Integrated transcriptomic identification and validation reveal key autophagy-associated biomarkers in sleep deprivation
2026, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 通过整合转录组和实验验证,识别睡眠剥夺相关的关键自噬生物标志物 首次通过整合转录组分析、机器学习算法和实验验证,从自噬角度筛选出睡眠剥夺的关键生物标志物CDKN1A、HSPA5和NR4A1,并构建了诊断模型 未提及明显的局限性 识别与睡眠剥夺相关的自噬基因生物标志物,并揭示其在睡眠剥夺发病机制中的作用 小鼠脑组织、人外周血样本、大鼠脑组织 机器学习 睡眠剥夺 RNA-seq, RT-qPCR, 单细胞RNA测序 机器学习算法 基因表达数据 小鼠脑组织数据集GSE33302和GSE9442、人外周血样本数据集GSE9441和GSE3767、单细胞RNA-seq数据集GSE37665;大鼠模型:雄性Sprague-Dawley大鼠连续睡眠剥夺7天 Illumina RNA-seq, 单细胞RNA测序 未明确指定 未明确指定
833 2026-06-11
Spatial transcriptomics reveals the mechanistic role of lactate metabolism in the pancreatic ductal adenocarcinoma microenvironment
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过空间转录组学揭示乳酸代谢在胰腺导管腺癌微环境中的机制作用 首次结合高通量转录组测序和单细胞转录组分析,系统探讨乳酸代谢在胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的作用,并建立基于机器学习的预后模型,识别出溶菌酶和聚合免疫球蛋白受体作为潜在临床生物标志物 样本量相对较小(8个PDAC样本,50795个细胞),且主要依赖公开数据集,缺乏独立外部验证队列 阐明乳酸代谢在胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的作用机制,并建立基于乳酸代谢基因的预后模型以指导早期诊断和个性化治疗 胰腺导管腺癌患者的肿瘤细胞及其微环境 数字病理学 胰腺导管腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,高通量转录组测序 机器学习(StepCox + Enet,α=0.5) 基因表达数据 8个PDAC样本中的50795个细胞,以及多个队列共345个患者(ICGC:92;GSE28735:45;GSE62452:69;GSE183795:139) NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
834 2026-06-11
Identification and validation of prognostic genes related to glycolysis and M2 macrophage in hepatocellular carcinoma: an integrated analysis of bulk RNA sequencing and single-cell RNA sequencing
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,鉴定与肝细胞癌中糖酵解和M2巨噬细胞相关的预后基因 首次通过整合糖酵解相关基因、M2巨噬细胞相关基因和差异表达基因,系统筛选出8个与两者交叉相关的预后基因,并构建风险模型 研究基于公共数据库数据,缺乏多中心外部验证队列,且RT-qPCR验证样本量有限 鉴定肝细胞癌中同时与糖酵解和M2巨噬细胞相关的预后基因并阐明其机制 肝细胞癌肿瘤组织和细胞样本 生物信息学 肝细胞癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR 回归分析风险模型 转录组数据, 单细胞表达数据 公共数据库数据(TCGA-LIHC等)+ RT-qPCR验证样本(具体数量未说明) NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
835 2026-06-11
Reprogramming the immunosuppressive breast cancer microenvironment: integrating cellular, metabolic, and stromal targets for rational immunotherapy
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 这篇综述整合了关于乳腺癌肿瘤免疫微环境在细胞、分子和代谢层面复杂性的最新进展,并强调了阻碍持久治疗效果的免疫抑制机制 提出了将免疫“冷”肿瘤转化为免疫“热”肿瘤的新策略,包括代谢调节、基质重编程和精准联合疗法,并整合了空间转录组学和液体活检等新型生物标志物策略 未明确提及具体局限性 总结乳腺癌肿瘤免疫微环境的最新研究进展,并探讨克服免疫抑制的合理免疫治疗策略 乳腺癌肿瘤免疫微环境 machine learning 乳腺癌 空间转录组学 NA 文本 NA NA 空间转录组学 NA NA
836 2026-06-11
Integrative omics and experimental validation reveal METTL17 and SLC27A1 as biomarkers and potential therapeutic targets in chronic kidney disease
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
research paper 通过整合分析转录组、单细胞测序和实验验证,发现METTL17和SLC27A1是慢性肾病中连接线粒体功能障碍和巨噬细胞极化的关键基因,可作为生物标志物和潜在治疗靶点 首次整合多组学数据与实验验证,揭示METTL17和SLC27A1在慢性肾病中调节线粒体功能和免疫失衡的双重作用,并明确其细胞来源为近端肾小管细胞和平滑肌细胞 研究仅在体外和动物模型中进行验证,缺乏大规模临床队列验证,且样本量有限 鉴定慢性肾病中连接线粒体调节与巨噬细胞极化的关键基因及潜在治疗靶点 慢性肾病患者外周血样本和单侧输尿管梗阻小鼠模型 machine learning chronic kidney disease bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, qPCR, immunohistochemistry, Western blotting, machine learning machine learning models (unspecified specific type) gene expression data (RNA-seq), single-cell transcriptomic data, clinical data CKD患者外周血样本(具体数量未提及)和UUO小鼠模型 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
837 2026-06-11
Single-cell transcriptomic profiling of C. elegans Q neuroblast lineage during migration and differentiation
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示秀丽隐杆线虫Q神经母细胞在迁移和分化过程中的分子机制 首次构建了Q神经母细胞谱系的高分辨率转录组分化图谱,发现亲代Q细胞初始具有上皮样特性并经历上皮-间充质转化,以及Wnt相关基因的左右不对称表达 未在摘要中明确说明局限性 研究Q神经母细胞迁移和分化的分子机制 秀丽隐杆线虫Q神经母细胞谱系 数字病理学 NA 单细胞RNA测序、流式细胞分选 NA 转录组数据 Q谱系细胞在不同发育阶段分离 NA 单细胞RNA测序 NA 通过FACS分离Q谱系细胞进行单细胞RNA测序
838 2026-06-11
Mass spectrometry-based multi-omics analysis elucidates immune microenvironmental characteristics and the risk of distant metastasis in N1c colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 基于质谱的多组学分析阐明了N1c结直肠癌的免疫微环境特征及远处转移风险 首次通过DIA-MS蛋白质组学技术系统研究了N1c结直肠癌的分子特征,并基于机器学习算法鉴定了10个肿瘤沉积相关转移基因(TDRGs),用于预测无病生存期和免疫治疗反应 样本量较小(13例),缺乏独立外部验证队列,且PLOD1的功能验证仅限于体外实验 揭示N1c结直肠癌的生物学特征、免疫微环境及其与远处转移的关系 N1c结直肠癌患者的FFPE样本(13例T1-T4N1cM1)及多个公共数据集的1582例结直肠癌患者 机器学习 结直肠癌 DIA-MS蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, Masson三色染色, 伤口愈合实验, Transwell实验 9种机器学习算法(具体未列出) 蛋白质组学数据, 单细胞RNA测序数据, 组织病理图像 13例N1c结直肠癌患者的FFPE组织样本;单细胞RNA测序及公共数据集共1582例结直肠癌患者样本 NA 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 NA NA
839 2026-06-11
Multi-dimensional evidence establishing the causal association between metabolic syndrome and gout and the molecular mechanisms of comorbidity
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过多维方法系统证明代谢综合征与痛风的因果关系,并揭示其共病的分子机制 首次整合真实世界队列、孟德尔随机化和单细胞转录组等多维证据,建立代谢综合征与痛风的因果关系链,并提出TAP2-UPR-Th17病理轴 研究可能受到观察性研究的混杂因素影响,且样本量和数据集的代表性存在一定局限 系统评估代谢综合征及其组分与痛风的因果关系,揭示共病的遗传基础和转录组特征 代谢综合征、痛风及共病患者,包括真实世界临床队列、遗传数据和转录组样本 机器学习 代谢综合征, 痛风 倾向性评分匹配, 限制性立方样条, 潜类别轨迹建模, 孟德尔随机化, 连锁不平衡分数回归 NA 临床数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 真实世界临床队列样本量8,853人,转录组数据GSE160170和GSE98895,单细胞数据GSE217561 NA 单细胞RNA-seq NA NA
840 2026-06-11
Integrating multi-omics and machine learning to unravel mechanisms of lymph node metastasis in papillary carcinoma with and without thyroiditis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 整合多组学与机器学习方法,揭示伴或不伴甲状腺炎的乳头状甲状腺癌淋巴结转移的不同机制 首次比较PTC-blank和PTC-thyroiditis两种亚型淋巴结转移的分子和细胞异质性,发现PI16+成纤维细胞亚群在PTC-blank中与ECM重塑相关,并利用机器学习和孟德尔随机化鉴定出SHISA5作为新的因果基因和潜在治疗靶点 未明确说明,但可推测单细胞数据仅来自一个公开数据集,且预测模型的外部验证可能有限 比较PTC-blank和PTC-thyroiditis的分子和细胞异质性,识别淋巴结转移的关键驱动因素,并开发临床预测模型 乳头状甲状腺癌(PTC)患者,分为伴甲状腺炎(PTC-thyroiditis)和不伴甲状腺炎(PTC-blank)两类 机器学习 甲状腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq LASSO, 随机森林, KNN 基因表达数据 TCGA数据库的bulk RNA-seq数据和GSE184362的单细胞RNA-seq数据 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
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