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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2026-04-18 |
Meningeal macrophages regulate fibroblasts to influence meningeal lymphatic function following traumatic brain injury
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.130263
PMID:41993613
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研究论文 | 本研究揭示了脑膜巨噬细胞通过PDGF-C/PDGFRα轴调控成纤维细胞产生VEGF-C,从而影响脑膜淋巴功能,为创伤性脑损伤后的神经修复提供了新的治疗策略 | 首次发现并鉴定了一群分泌VEGF-C的脑膜成纤维细胞,并阐明了脑膜常驻巨噬细胞通过PDGF-C调控该细胞群进而影响脑膜淋巴功能的分子机制 | 研究主要聚焦于TBI早期阶段,对长期影响及在其他神经系统疾病中的普适性仍需进一步探索 | 探究创伤性脑损伤后脑膜免疫细胞如何调控脑膜淋巴功能 | 小鼠脑膜中的成纤维细胞和常驻巨噬细胞 | 单细胞组学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序, 共聚焦显微镜, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 未明确说明具体样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 822 | 2026-04-18 |
Lung dysbiosis disrupts an FFAR2-mediated innate immune circuit against Klebsiella pneumoniae
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.131136
PMID:41993626
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研究论文 | 本研究揭示了肺微生物群通过短链脂肪酸-FFAR2轴协调肺泡巨噬细胞和γδ T细胞活化以抵抗肺炎克雷伯菌感染的机制 | 首次阐明了肺微生物群(而非肠道微生物群)通过SCFA-FFAR2信号轴调控肺部固有免疫应答的具体机制,并发现了FFAR2在肺泡巨噬细胞中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证相对有限;肺微生物群的具体菌种组成与功能关联需要进一步解析 | 探究肺微生物群在肺炎克雷伯菌肺部感染中的作用及其调控肺部免疫应答的机制 | 小鼠模型、肺泡巨噬细胞、γδ T细胞、肺炎克雷伯菌 | 免疫学、微生物学 | 肺炎、细菌感染 | 16S rRNA测序、液相色谱-质谱联用、bulk RNA测序、单细胞RNA测序重分析、细胞实验、细胞因子分析、基因表达分析 | 条件性基因敲除小鼠模型(Ffar2 fl/fl LysM cre/+) | 测序数据、质谱数据、细胞实验数据 | 小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 16S rRNA测序, bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 823 | 2026-04-18 |
Integrative genomic analysis identifies key target genes and candidate drugs for spinal stenosis
2026, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2026.1767263
PMID:41993646
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研究论文 | 本研究通过整合多组学策略,识别了脊柱狭窄的关键靶基因和候选药物 | 结合了总结数据孟德尔随机化、单细胞RNA测序和分子对接,揭示了TGF-β通路在疾病进展中的作用,并筛选出FDA批准的潜在治疗化合物 | NA | 识别脊柱狭窄的遗传驱动因素和细胞机制,以发现治疗靶点 | 脊柱组织样本和原代细胞 | 基因组学 | 脊柱狭窄 | 单细胞RNA测序、分子对接、免疫组化、Western印迹、实时定量PCR | NA | 基因组关联研究数据、表达数量性状位点数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 824 | 2026-04-18 |
Single-cell sequencing reveals the functional heterogeneity of melanoma cells and their crosstalk with the tumor microenvironment
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1779213
PMID:41993933
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了黑色素瘤细胞的功能异质性及其与肿瘤微环境的相互作用 | 识别了九个独特的黑色素瘤细胞亚群,发现了与良好预后相关的亚群及其与免疫细胞的信号通路,并构建了一个包含15个基因的预后特征 | 研究样本量相对较小(11个样本),且需要进一步的机制验证 | 理解黑色素瘤细胞的功能多样性及其与肿瘤微环境的相互作用,以开发有效的治疗策略和识别预后生物标志物 | 黑色素瘤细胞及其与肿瘤微环境(包括免疫细胞)的相互作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫荧光分析 | 多种机器学习算法(包括Seurat,Harmony,CellChat,Monocle 2) | 单细胞RNA测序数据,临床标本图像数据 | 70,760个细胞来自11个黑色素瘤样本,以及TCGA-SKCM队列和7名患者的临床标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 825 | 2026-04-18 |
BHLHE41-SLC7A11 transcriptional axis and chromatin remodeling signatures in osteogenic-lineage disulfidptosis-like stress in osteoporosis
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1794298
PMID:41993932
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研究论文 | 本研究通过整合外周血单核细胞微阵列数据和单细胞RNA测序,揭示了骨质疏松症中骨生成谱系细胞(特别是成骨细胞)的二硫化物应激相关程序,并提出了BHLHE41-SLC7A11转录轴与染色质重塑特征的联系 | 首次在单细胞分辨率下绘制了骨质疏松症中二硫化物应激相关程序的细胞类型特异性图谱,并提出了BHLHE41-SLC7A11这一新的转录调控轴,将其与成骨细胞的染色质重塑特征相关联 | 研究主要基于转录组学数据,缺乏直接的体内功能验证;样本量相对有限(20例OP vs 20例对照);机制细节有待进一步实验证实 | 阐明骨质疏松症中骨生成谱系细胞(特别是骨髓间充质干细胞及其成骨细胞分化)的二硫化物应激(disulfidptosis)相关程序及其上游转录和表观遗传调控机制 | 骨质疏松症患者的外周血单核细胞和骨髓细胞(特别是骨髓间充质干细胞及其成骨细胞分化群体) | 生物信息学,单细胞组学 | 骨质疏松症 | 微阵列,单细胞RNA测序,WGCNA,调控网络分析,染色质重塑通路评分 | 共表达网络分析(WGCNA),无监督聚类,调控子分析 | 基因表达数据(微阵列和单细胞RNA-seq) | 40例(20例骨质疏松症患者 vs 20例健康对照)的外周血单核细胞微阵列数据(GSE56815),以及未明确数量的单细胞RNA测序数据 | NA | 微阵列,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 826 | 2026-04-18 |
Single-cell RNA sequencing offers novel perspectives in viral infection research
2026, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2026.1798303
PMID:41994205
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综述 | 本文系统综述了单细胞RNA测序技术在病毒感染研究中的应用,包括其发展历程、平台比较及关键应用领域 | 通过整合单细胞RNA测序在病毒感染研究中的多方面应用,提供了分析动态复杂病毒-宿主相互作用的新研究和技术视角 | NA | 综述单细胞RNA测序技术在病毒感染研究中的关键作用,以促进该领域的未来发展 | 病毒感染过程中的宿主细胞反应和病毒-宿主相互作用 | 数字病理学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 827 | 2026-04-18 |
KDM5B recruits FOXG1 to suppress the IFN response, leading to malignant progression and immune evasion in cervical cancer
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1749536
PMID:41994447
|
研究论文 | 本研究揭示了宫颈癌恶性进展中KDM5B通过招募FOXG1抑制干扰素信号通路,从而促进肿瘤免疫逃逸的新机制 | 首次发现KDM5B通过招募转录抑制因子FOXG1来抑制干扰素信号通路,促进宫颈癌恶性进展和免疫逃逸 | NA | 探究宫颈癌恶性进展和免疫逃逸的分子机制 | 宫颈癌患者样本、细胞系和小鼠肿瘤模型 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、qPCR、Western blot、免疫共沉淀、免疫荧光、表面等离子共振、流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、图像数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 828 | 2026-04-17 |
Engineering and evaluation of precision-glycosylated clickable albumin nanoplatform for targeting the tumor microenvironment
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.123973
PMID:41355949
|
研究论文 | 本文开发了一种精确糖基化的可点击白蛋白纳米平台(CAN-DGIT),用于靶向肿瘤微环境,并结合空间转录组学评估纳米颗粒与TME的相互作用 | 通过精确控制糖基化程度和类型,实现了白蛋白纳米颗粒的可编程生物分布和细胞类型靶向,并创新性地整合PET成像与空间转录组学进行机制映射 | 研究仅在小鼠模型中进行,未涉及人类临床试验;糖基化类型和靶向机制的普适性需进一步验证 | 开发一种精确糖基化的纳米药物递送平台,以选择性靶向肿瘤微环境并评估其相互作用 | 白蛋白纳米颗粒、糖基化配体(甘露糖、半乳糖、葡萄糖)、4T1肿瘤小鼠模型 | 纳米医学 | 肿瘤 | 点击化学、MALDI-TOF质谱、UV-vis光谱、PET成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 健康小鼠和4T1肿瘤小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 829 | 2026-04-17 |
Identification and validation of SUMOylation-related key genes for osteoarthritis through integration of single-cell, bulk RNA sequencing and animal model experiments
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1779874
PMID:41987786
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和动物模型实验,识别并验证了与骨关节炎相关的SUMOylation关键基因 | 首次结合单细胞测序、批量测序和动物模型,系统识别了骨关节炎中SUMOylation相关的关键基因和细胞类型 | 样本量相对较小,动物模型仅使用大鼠,且未深入探讨关键基因的具体作用机制 | 检测和验证骨关节炎中SUMOylation相关基因的关键作用 | 骨关节炎患者样本和大鼠模型 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,差异表达分析,PPI网络,机器学习,ROC曲线,免疫浸润分析,药物预测 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 三个公共数据集(GSE51588, GSE55235, GSE152805)和大鼠模型(三个OA和三个假手术样本) | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 830 | 2026-04-17 |
Hypoxic microenvironment in cancer: role in metabolic reprogramming
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1771365
PMID:41988136
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综述 | 本文综述了肿瘤缺氧微环境如何通过代谢重编程驱动肿瘤进展和治疗抵抗 | 系统整合了单细胞多组学、空间转录组学等新兴技术证据,并讨论了靶向缺氧信号、血管生成通路和代谢酶等创新治疗策略 | NA | 阐明缺氧诱导的代谢重编程机制及其在肿瘤进展和治疗抵抗中的作用,并探讨利用缺氧相关代谢依赖性的精准肿瘤学策略 | 实体瘤及其缺氧微环境中的恶性细胞和基质细胞(包括癌症相关成纤维细胞、内皮细胞、肿瘤相关巨噬细胞和髓源性抑制细胞) | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞多组学,空间转录组学,代谢成像 | NA | NA | NA | NA | 单细胞多组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 831 | 2026-04-17 |
From forest floor to doctor's office: the immunological journey of Borrelia burgdorferi through vertebrate hosts
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1811554
PMID:41988178
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综述 | 本文综述了伯氏疏螺旋体在脊椎动物宿主中的免疫生物学进展,重点关注其通过免疫调节建立持续性感染的机制 | 采用阶段结构化框架整合了2020年后活体成像、单细胞转录组学、空间分析和系统免疫学等新技术带来的新见解 | NA | 理解伯氏疏螺旋体如何通过免疫调节在脊椎动物宿主中建立持续性感染,并为诊断、疫苗和治疗提供信息 | 伯氏疏螺旋体及其在脊椎动物宿主中的感染过程 | 自然语言处理 | 莱姆病 | 活体成像、单细胞转录组学、空间分析、系统免疫学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 832 | 2026-04-17 |
The mechanism of PKM2/HIF-1α axis polarizing TAMs by upregulating glucose-serine metabolism to promote melanoma progression
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1740155
PMID:41988200
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 833 | 2026-04-14 |
Engineering scalable vascularized kidney organoids for in vivo glomerular filtration with human endothelial integration
2026, npj biomedical innovations
DOI:10.1038/s44385-025-00063-5
PMID:41640674
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研究论文 | 本研究开发了一种可规模化生产血管化肾脏类器官的方法,并验证了其在体内的肾小球滤过功能 | 开发了一种成本效益高、产量提升超过50倍的大规模生产血管化肾脏类器官的方法,并首次展示了由人内皮细胞血管化的类器官肾小球具有尺寸选择性的滤过功能 | NA | 开发可规模化生产的血管化肾脏类器官,用于肾脏疾病研究和再生医学应用 | 由人多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 组织工程与再生医学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 834 | 2026-04-14 |
Integrative Multiomics and Single-Cell Analyses Identify FKBP10 as a Predictor of Radiotherapy Outcome in Colorectal Cancer
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/3905052
PMID:41969611
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研究论文 | 本研究通过整合多组学与单细胞分析,鉴定出FKBP10是结直肠癌放疗疗效的预测因子 | 首次通过整合多组学与单细胞RNA测序分析,将FKBP10鉴定为源自癌症相关成纤维细胞(CAFs)的放疗抵抗生物标志物和治疗靶点 | 研究样本量相对有限(发现队列200例,验证队列58例),且功能验证主要在细胞系中进行,需进一步体内实验验证 | 寻找能够预测结直肠癌放疗疗效的生物标志物和治疗靶点 | 结直肠癌患者样本(多组学数据)和放疗抵抗的结直肠癌细胞系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,多组学分析,功能缺失实验(增殖、迁移/侵袭、放射敏感性测定) | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 258例结直肠癌患者(发现队列200例,验证队列58例),63,689个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 835 | 2026-04-14 |
Integrated Single-Cell Profiling Reveals TL1A as a Biomarker and Driver of Type 2 Inflammation via Macrophage-Dependent Immunoregulation in Asthma
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1190
PMID:41970030
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析,揭示了TL1A作为哮喘中2型炎症的生物标志物和驱动因子,通过巨噬细胞依赖的免疫调节发挥作用 | 首次将TL1A鉴定为哮喘中巨噬细胞依赖的免疫调节关键分子,并阐明其通过DR3/CCL8/CCR8信号轴驱动2型炎症的机制,同时验证了抗TL1A抗体干预的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证的临床队列规模未明确说明,且未探讨TL1A在不同哮喘亚型中的特异性表达模式 | 探究TL1A在哮喘发病机制中的作用,并评估其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 哮喘患者(痰液和血清样本)、小鼠哮喘模型(包括髓系细胞特异性TL1A敲除小鼠) | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、临床指标数据 | 未明确说明患者样本数量,包含多种哮喘表型患者及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 836 | 2026-04-14 |
Cardiac fibroblast heterogeneity in cardiac fibrosis implication for cell-type-specific treatment
2026, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2026.1740147
PMID:41971660
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综述 | 本文综述了心脏成纤维细胞在心脏纤维化中的异质性及其对细胞类型特异性治疗的启示 | 利用谱系追踪和单细胞/空间转录组学揭示了心脏成纤维细胞的异质性及其在疾病中的特定激活轨迹,强调了免疫-成纤维细胞相互作用作为成纤维细胞命运的关键决定因素 | NA | 探讨心脏成纤维细胞异质性在心脏纤维化中的作用,以推动针对致病亚型的精准抗纤维化策略 | 心脏成纤维细胞及其在健康和疾病状态下的亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 谱系追踪,单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 837 | 2026-04-14 |
Integrative Learning of Disentangled Representations from Single-Cell RNA-Sequencing Datasets
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0015
PMID:41971949
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研究论文 | 提出了一种名为spVIPES的概率框架,用于从未配对、特征不匹配的单细胞RNA测序数据集中分解出共享和私有成分 | 开发了spVIPES框架,能够处理特征不匹配的未配对单细胞数据集,通过概率潜在变量模型分离数据集特异性与保守的细胞特征,并提供了有监督和无监督两种变体 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种能够整合未配对、特征不匹配单细胞RNA测序数据集的方法,以分离共享和私有的细胞特征 | 单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分推断,专家乘积模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 838 | 2026-04-14 |
Macrophage-associated prognostic modeling uncovers immunotherapy response mechanisms and defines HAGHL as a novel oncogenic driver in breast cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1776875
PMID:41972161
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研究论文 | 本研究基于巨噬细胞相关基因构建了一个预后模型,用于预测乳腺癌患者的生存和免疫治疗反应,并鉴定HAGHL为新的致癌驱动因子 | 首次整合多组学数据开发基于巨噬细胞相关基因的预后模型,并发现HAGHL作为乳腺癌的潜在致癌基因 | 研究主要依赖公共数据库数据,实验验证部分有限,模型需进一步外部验证 | 探究巨噬细胞相关基因在乳腺癌中的表达模式、预后价值及与免疫微环境的关系 | 乳腺癌患者样本及细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | 预后模型 | RNA测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 839 | 2026-04-14 |
Tumor lactate metabolism shapes immune suppression and therapeutic resistance revealed by integrative multi-omics and digital pathology
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1797798
PMID:41972178
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和数字病理学,开发了一种深度学习框架,能够直接从常规H&E全切片图像推断肿瘤乳酸代谢状态 | 首次开发了基于常规H&E病理切片的深度学习模型来推断肿瘤乳酸代谢状态,为临床提供了一种可扩展且成本低的代谢生物标志物评估方法 | 研究中使用的乳酸相关基因特征(59个基因)可能无法完全捕获乳酸代谢的复杂性,且模型性能在不同癌症类型间存在差异 | 开发一种临床可及且低成本的方法来评估肿瘤内乳酸活性,并研究其与肿瘤免疫微环境和治疗抵抗的关系 | 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,空间分析,计算分析 | 深度学习框架 | 图像,基因表达数据,蛋白质表达数据 | TCGA、GEO和单细胞RNA-seq数据集中的多个队列,以及独立的SAZHU-HNSCC真实世界队列 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 840 | 2026-04-14 |
Molecular insights into CRIP1 as an immunometabolic regulator revealed by CRIP1 knockout and single-cell transcriptomics
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1762474
PMID:41972184
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研究论文 | 本研究通过CRIP1基因敲除小鼠模型和单细胞转录组学分析,首次系统揭示了CRIP1在免疫调节和代谢中的基本功能 | 首次全面解析CRIP1在非恶性条件下的基本生物学功能,整合了代谢调控和免疫调节的双重视角,并利用单细胞转录组学在人类样本中验证其与炎症基因表达的关系 | 研究主要基于小鼠模型和体外分析,人类样本验证仅限于单细胞转录组数据分析,缺乏直接的体内功能验证 | 阐明CRIP1在免疫代谢调控中的基本生物学功能和作用机制 | CRIP1基因敲除小鼠、野生型小鼠、健康人和牙周炎患者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 牙周炎、肝癌、急性髓系白血病、多发性骨髓瘤、黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | CRIP1敲除和野生型小鼠的肝组织、健康人和牙周炎患者的外周血单个核细胞单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |