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当前共找到 1652 篇文献,本页显示第 801 - 820 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
801 2026-02-17
Evaluating deconvolution methods using real bulk RNA-expression data for robust prognostic insights across cancer types
2026-Jan-21, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本研究提出了一种基于真实批量RNA表达数据的新框架,用于评估五种去卷积方法,并识别出ReCIDE和BayesPrism作为稳健方法,同时发现基质癌症相关成纤维细胞(mCAF)作为跨多种癌症的预后标志物 引入了一个新颖的真实数据框架,利用18个真实批量RNA表达队列来评估去卷积方法,并基于三种创新基准场景(与scRNA-seq的一致性、跨队列可重复性、预后相关性可重复性)进行验证 传统伪批量基准在真实世界设置中可能不可靠,因为绝对细胞比例未知 评估去卷积方法在真实批量RNA表达数据中的性能,以提供精准肿瘤学的可操作工具并指导转化研究中的方法选择 18个真实批量RNA表达队列(5,891个样本)涵盖九种癌症类型,以及TCGA和GEO队列 自然语言处理 肺癌 批量RNA测序,单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA表达数据 5,891个样本 NA 批量RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
802 2026-02-17
CCL14, identified by multi-omics approach, serves as a novel indicator of disease severity and progression in lymphangioleiomyomatosis
2026-Jan-20, Orphanet journal of rare diseases IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过多组学方法鉴定出CCL14是淋巴管平滑肌瘤病(LAM)疾病严重程度和进展的新型生物标志物 首次通过整合血浆蛋白质组学和单细胞RNA测序,系统揭示了CCL14在LAM中的表达模式、细胞来源及其在疾病微环境中的调控网络,并验证了其作为预测疾病进展的临床潜力 样本量相对有限(尤其是单细胞测序部分),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性队列验证CCL14的临床预测价值 探索CCL14在淋巴管平滑肌瘤病(LAM)中的生物学功能及其作为疾病生物标志物的临床价值 淋巴管平滑肌瘤病(LAM)患者和健康对照者的血浆样本及肺组织样本 生物信息学与多组学整合分析 淋巴管平滑肌瘤病 蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), ELISA 生物信息学通路富集分析, CellPhoneDB细胞互作分析 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 临床表型数据 单细胞测序:6名LAM患者和5名健康供体的肺组织;ELISA验证:53名LAM患者和25名对照的血浆样本 NA 单细胞RNA-seq, 血浆蛋白质组学 NA NA
803 2026-02-17
Dysregulated TGFβ-ERK Signaling Drives Aberrant Extracellular Matrix Production in Noonan Syndrome-Associated Pulmonary Valve Stenosis
2026-Jan-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用人iPSC瓣膜分化平台,揭示了Noonan综合征相关肺动脉瓣狭窄中TGFβ-ERK信号失调驱动细胞外基质异常产生的分子机制 首次建立人iPSC瓣膜分化平台模拟NS相关PVS,结合单细胞转录组学和磷酸化蛋白质组学揭示TGFβ信号通路异常激活是导致ECM病理改变的核心机制 研究样本量有限(仅两个NS婴儿瓣膜组织验证),iPSC模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 阐明Noonan综合征相关肺动脉瓣狭窄的分子发病机制 CRISPR编辑的iPSC衍生的瓣膜间质细胞亚型(纤维层和海绵层VICs),NS婴儿的狭窄肺动脉瓣组织 发育生物学与疾病建模 先天性心脏病(肺动脉瓣狭窄) iPSC分化、CRISPR基因编辑、单细胞RNA测序、磷酸化蛋白质组学(质谱)、组织病理学分析 人iPSC疾病模型 单细胞转录组数据、磷酸化蛋白质组数据、组织病理图像 CRISPR编辑的多种基因型iPSC系,两个NS婴儿的肺动脉瓣组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
804 2026-02-17
Multimodal single-cell and spatial profiling reveals altered T cell-mediated immunity and B-cell follicular architecture in non-metastatic lymph nodes of patients with aggressive non-small cell lung cancer
2026-Jan-18, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究通过多模态单细胞和空间分析,揭示了侵袭性非小细胞肺癌患者非转移性区域淋巴结中T细胞介导的免疫和B细胞滤泡结构的改变 首次结合CITE-seq、scRNA-seq和成像质谱流式细胞术,在侵袭性NSCLC患者的非转移性区域淋巴结中识别出免疫抑制微环境和B细胞滤泡结构异常 样本量较小(36个淋巴结来自11名患者),且仅针对非转移性淋巴结进行研究,可能未涵盖转移性淋巴结的免疫特征 探究侵袭性非小细胞肺癌患者非转移性区域淋巴结中的免疫失调机制 非小细胞肺癌患者的区域淋巴结 数字病理学 肺癌 CITE-seq, scRNA-seq, 成像质谱流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据、空间成像数据 36个淋巴结来自11名患者 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
805 2026-02-17
Uniform pre-processing of bacterial single-cell RNA-seq
2026-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种针对细菌单细胞RNA测序数据的统一预处理方法,通过改进kallisto-bustools工具套件以适应细菌基因组的特性 将原本用于真核生物scRNA-seq的kallisto-bustools工具套件进行优化,使其能够处理细菌的操纵子结构和更短的基因长度分布,实现了细菌scRNA-seq数据的高效准确量化 未明确说明该方法在具体细菌种类或实验条件下的性能限制,也未与其他预处理方法进行广泛比较 开发一种统一、高效的细菌单细胞RNA测序数据预处理方法,以促进微生物单细胞转录组学的标准化分析 细菌单细胞RNA测序数据 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 NA 测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
806 2026-02-17
Defects in tissue-resident macrophages lead to smaller eardrums and abnormal neurovascular networks with increased middle-ear infection
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了组织驻留巨噬细胞在耳鼓膜发育和神经血管网络形成中的关键作用 首次发现耳鼓膜组织驻留巨噬细胞的异质性来源,并证明其缺失会导致耳鼓膜变小、神经血管网络异常及中耳感染风险增加 NA 探究组织驻留巨噬细胞在耳鼓膜发育和先天免疫保护中的作用 小鼠耳鼓膜组织驻留巨噬细胞 单细胞测序 中耳感染 命运图谱、单细胞RNA测序、巨噬细胞耗竭 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
807 2026-02-17
Spatiotemporal transcriptomic and metabolomic landscapes of wild soybean seed development reveal regulatory mechanisms of nutrient accumulation
2026-Jan-12, Plant communications IF:9.4Q1
研究论文 本研究结合空间转录组学和代谢组学,解析了野生大豆种子发育中期细胞分化和营养积累的时空动态机制 首次在野生大豆中整合空间转录组学和代谢组学,揭示了胚胎中背腹侧薄壁细胞在蛋白质和脂质代谢途径上的空间差异,并鉴定出关键调控基因GsMAPK23-4 研究仅聚焦于野生大豆种子发育中期阶段,未涵盖整个发育过程,且功能验证仅基于敲除突变体 揭示野生大豆种子发育过程中细胞分化和营养积累的时空调控机制,以提升大豆产量和品质 野生大豆(Glycine soja)种子 空间转录组学 NA 空间转录组学, 代谢组学 NA 转录组数据, 代谢组数据 未明确指定样本数量,但基于野生大豆种子发育中期阶段 NA 空间转录组学 NA NA
808 2026-02-17
Quantifying uncertainty in RNA velocity
2026-Jan-06, Biometrics IF:1.4Q2
研究论文 本文提出了一种贝叶斯分层模型来估计RNA速度,通过结合马尔可夫链蒙特卡洛和共识方法进行全贝叶斯推断,实现了校准良好的不确定性量化 首次在RNA速度估计中引入时间依赖性转录速率和非平凡初始条件,并讨论了模型参数的可识别性,包括潜在时间的较大值,这是以往未涉及的 模型可能仍受限于单细胞RNA测序数据的固有噪声和稀疏性,且计算复杂度较高 量化单细胞RNA测序数据中RNA速度的不确定性,以提取更可靠的动态信息 小鼠胚胎干细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 贝叶斯分层模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
809 2026-02-17
Single-cell RNA Sequencing Analysis Reveals the Regulatory Functions of Copines Family Genes in Testicular Cancer Progression
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
研究论文 本研究基于单细胞转录组数据,揭示了Copines家族基因在睾丸癌不同细胞亚群中的表达模式及其通过调控PI3K-Akt信号通路和细胞周期驱动癌症进展的潜在分子机制 首次在单细胞水平上系统分析Copines家族基因在睾丸癌中的表达和调控功能,并识别出关键信号通路如PI3K-Akt,为精准治疗提供了新靶点 研究基于单细胞转录组数据,未进行实验验证,且样本量未明确说明,可能限制结论的普适性 探究Copines家族基因在睾丸癌细胞亚群中的表达模式及其调控癌症进展的机制 睾丸癌的单细胞转录组数据,包括NK/T细胞、肿瘤细胞、B细胞和巨噬细胞等亚群 数字病理学 睾丸癌 单细胞RNA测序 聚类分析、差异表达分析、功能富集分析、伪时间分析 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
810 2026-02-17
Prognostic Value and Immune Characterization of Genes Associated with Childhood Acute Leukemia applying Single-Cell RNA Sequencing
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
研究论文 本研究整合单细胞和批量转录组数据,识别儿童急性淋巴细胞白血病中的关键B细胞亚群和分子标志物,并构建预后风险模型 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,识别cALL中与增殖相关的B细胞C2亚群,并基于四个标记基因构建具有高预测精度的预后模型 研究样本量较小(仅2名cALL患者和3名健康对照),且仅针对B细胞起源的cALL,未涵盖其他亚型 探究儿童急性淋巴细胞白血病的免疫特征,并开发预后预测模型 儿童急性淋巴细胞白血病患者及健康儿童的骨髓样本 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序,批量RNA测序 Cox回归,LASSO回归 RNA测序数据 2名cALL患者和3名健康儿童的骨髓样本(单细胞数据),511名cALL样本(批量数据) NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
811 2026-02-16
Integrated Multi-Omics and Spatial Transcriptomics Identify FBLL1 as a Malignant Transformation Driver in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jan-27, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究通过整合多组学与空间转录组学数据,识别出FBLL1作为肝细胞癌恶性转化的关键驱动因子 首次将FBLL1鉴定为肝细胞癌中与恶性状态转换相关的新调控因子,揭示了其通过协同上调c-Myc和EGFR配体来激活EGFR-MAPK信号通路的机制 研究主要基于TCGA和ICGC队列数据,样本来源可能有限;体内外功能验证虽充分,但临床转化潜力需进一步探索 探究肝细胞癌中核糖体生物合成失调的具体分子驱动因子及其在肿瘤发生发展中的作用 肝细胞癌患者样本、HCC细胞系及小鼠异种移植模型 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、转录组分析、Western blotting NA 多组学数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组学数据 TCGA和ICGC队列的肝细胞癌患者样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
812 2026-02-16
Research on the molecular mechanism of celastrol targeting CTNNB1/STAT3 to inhibit uveal melanoma based on network pharmacology and multi-omics analysis
2026-Jan-24, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究基于网络药理学和多组学分析,探讨了雷公藤红素通过靶向CTNNB1/STAT3抑制葡萄膜黑色素瘤的分子机制 结合网络药理学、转录组学、机器学习、免疫浸润分析、单细胞RNA测序及分子对接与动力学模拟,系统揭示了雷公藤红素在葡萄膜黑色素瘤中的新靶点和作用机制 研究主要基于细胞系实验,缺乏体内动物模型或临床样本的验证,且机制探索深度有待进一步拓展 阐明雷公藤红素在葡萄膜黑色素瘤中的抗肿瘤作用机制 葡萄膜黑色素瘤细胞系B16-F10和C918 机器学习 葡萄膜黑色素瘤 网络药理学、转录组学、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟、实时定量PCR、Western blot 机器学习算法 转录组数据、单细胞RNA测序数据 两种细胞系(B16-F10和C918) NA 单细胞RNA测序 NA NA
813 2026-02-16
Loss of biomechanical features reveals smooth muscle disruption and disease progression in prostate cancer
2026-Jan-20, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,揭示了生物力学特征丧失与平滑肌破坏在前列腺癌进展中的作用,并开发了一个预后指数MRPX用于风险分层和治疗指导 首次系统性地将生物力学特征与前列腺癌进展联系起来,通过整合大量转录组和单细胞数据定义了生物力学亚型,并开发了具有临床实用性的预后指数MRPX 研究主要基于回顾性队列数据,需要进一步的前瞻性验证;体外实验模型可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 阐明生物力学特征在前列腺癌进展中的作用及其潜在机制 前列腺癌患者和细胞系 生物信息学 前列腺癌 转录组测序,单细胞RNA测序,RT-qPCR,机器学习,共培养模型 机器学习模型(具体类型未明确指定) 转录组数据,单细胞RNA测序数据 1693名前列腺癌患者(来自10个公共队列)和19个前列腺癌样本的单细胞数据 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
814 2026-02-16
Current Overview of Multi-omics Analyses in Microscopic Polyangiitis and Granulomatosis with Polyangiitis
2026-Jan-15, Internal medicine (Tokyo, Japan)
综述 本文综述了多组学分析在显微镜下多血管炎和肉芽肿性多血管炎中的最新进展 整合了基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等多组学数据,以全面理解AAV的复杂病理生理学,并强调了单细胞RNA测序和空间转录组学等新技术在揭示基因表达谱和细胞相互作用中的应用 作为一篇综述,未涉及原始研究数据,可能未涵盖所有最新研究,且依赖于现有文献的总结 旨在通过多组学分析开发基于AAV分子和遗传特征的个性化诊断和治疗策略 抗中性粒细胞胞浆抗体相关血管炎(AAV),特别是显微镜下多血管炎和肉芽肿性多血管炎 自然语言处理 自身免疫性疾病 多组学分析,包括基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学 NA 文本 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
815 2026-02-16
Multi-omics characterization of RNA modification enzymes identifies NAT10 as a functionally validated prognostic biomarker in hepatocellular carcinoma
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学分析,揭示了RNA修饰酶在多种癌症中的失调模式,并建立了诊断和预后模型 首次全面描绘了RNA修饰酶在泛癌中的拷贝数变异相关失调景观,并利用机器学习识别出12个可靠的肿瘤诊断标志物,同时通过单细胞转录组分析揭示了其在肿瘤微环境中的异质性表达 研究主要基于关联分析,功能验证仅针对NAT10进行,其他RNA修饰酶的具体生物学机制仍需进一步实验探索 系统表征RNA修饰酶在癌症中的全局调控模式及其临床相关性 多种癌症类型中的RNA修饰酶 生物信息学 肝细胞癌 多组学分析、单细胞RNA测序、机器学习、LASSO回归、EdU实验、qRT-PCR、免疫组化 LASSO回归模型 基因表达数据、拷贝数变异数据、临床数据、单细胞转录组数据 多个独立队列的癌症样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
816 2026-02-16
Prognostic gene screening and experimental validation in renal clear cell carcinoma based on spatial transcriptomics and single-cell sequencing
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,筛选出七个预后基因并构建风险模型,用于肾透明细胞癌的风险分层和生存预测,并鉴定ATP1A1为潜在治疗靶点 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学数据识别肾透明细胞癌的预后基因,并构建了包含七个基因的风险模型和列线图,提高了生存预测的准确性 研究依赖于公共数据库(TCGA和ICGC)的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证,且功能分析主要基于生物信息学方法,实验验证有限 识别肾透明细胞癌的可靠预后生物标志物和治疗靶点,以改善患者分层和个性化治疗 肾透明细胞癌(ccRCC)患者 数字病理学 肾癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学(ST) 风险模型,列线图(nomogram) 基因表达数据,空间转录组数据 TCGA和ICGC数据集中的肾透明细胞癌患者样本 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
817 2026-02-16
Transcriptome and single-cell RNA sequencing analysis with 101 machine learning combinations and experimental verification reveals the mechanism of action of mannose metabolism in bladder cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过转录组和单细胞RNA测序分析结合101种机器学习组合及实验验证,揭示了甘露糖代谢在膀胱癌中的作用机制 首次系统整合101种机器学习算法组合来识别膀胱癌中与甘露糖代谢相关的预后基因,并通过单细胞分析确认巨噬细胞为关键细胞类型 研究主要基于公共数据库数据,需要更多独立队列验证;单细胞分析样本量可能有限 探究甘露糖代谢对膀胱癌预后的影响机制 膀胱癌患者样本及相关基因 生物信息学 膀胱癌 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blotting, 免疫组化 机器学习算法组合, 回归分析 基因表达数据, 单细胞数据 未明确具体样本数量,使用公共数据库数据集 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
818 2026-02-16
PSMA4 as a Druggable Target in Hidradenitis Suppurativa: Evidence From Mendelian Randomization and Single-Cell Transcriptomics
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过药物基因组范围的孟德尔随机化分析,结合单细胞转录组学,识别了化脓性汗腺炎(HS)的潜在治疗靶点PSMA4和MAST3 首次整合孟德尔随机化、共定位分析和单细胞RNA测序,揭示PSMA4在CD4 T细胞中的富集及其通过TNF通路促进炎症的作用,为HS提供了新的治疗靶点 研究主要基于遗传和转录组数据,缺乏实验验证靶点功能的具体机制,且样本来源和疾病异质性可能影响结果普适性 识别化脓性汗腺炎的新型治疗靶点 化脓性汗腺炎患者 自然语言处理 皮肤炎症性疾病 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、共定位分析、细胞间通讯分析 NA 遗传数据、转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
819 2026-02-15
Integrated single-cell and transcriptomic analysis of CD8+CD101+TIM3+ T cells in hepatocellular carcinoma: implications for tumor microenvironment and prognostic modeling
2026-Jan-31, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究通过整合单细胞和转录组学分析,揭示了肝细胞癌中CD8+CD101+TIM3+ T细胞的功能、分化机制及其在肿瘤微环境中的作用,并构建了一个预后模型 首次在肝细胞癌中系统研究了CD8+CD101+TIM3+ T细胞的功能、分化轨迹及其与肿瘤微环境的相互作用,并基于此构建了一个新的预后预测模型 研究主要基于公共数据库和单细胞测序数据,缺乏体内实验验证;预后模型在验证队列中的表现略低于训练队列 探究肝细胞癌中特定T细胞亚群的功能、分化机制及其对免疫治疗和预后的影响 肝细胞癌组织中的CD8+CD101+TIM3+ T细胞及其前体细胞 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,转录组分析 Cox回归模型,LASSO回归模型 单细胞RNA测序数据,临床数据,转录组数据 来自TCGA和GEO数据库的肝细胞癌样本数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
820 2026-02-15
Prognostic value of palmitoylation-regulated mechanisms in glioblastoma: integrated multi-omics analysis via least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) regression and single-cell sequencing
2026-Jan-31, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究通过整合多组学分析和单细胞测序,系统探讨了棕榈酰化相关基因在胶质母细胞瘤中的预后价值 结合LASSO回归和单细胞RNA测序分析,识别出与患者总生存期显著相关的核心基因,并揭示了它们在关键致癌通路中的富集和异质表达模式 研究主要基于公共数据库(如TCGA和GTEx)的转录组数据,可能未涵盖所有临床或分子亚型,且功能验证仅限于细胞系实验 系统研究棕榈酰化相关基因在胶质母细胞瘤中的预后意义 胶质母细胞瘤组织和正常脑组织 生物信息学 胶质母细胞瘤 转录组分析、单细胞RNA测序、LASSO回归、Kaplan-Meier生存分析 LASSO回归 RNA-seq数据、单细胞RNA-seq数据 基于TCGA和GTEx数据库的胶质母细胞瘤与正常组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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