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当前共找到 1921 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-07-15 |
Investigating the Role of TNFSF12 in Thyroid Cancer Progression via Single-Cell RNA Sequencing and Integrated Multiomics Analyses
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/4753653
PMID:41930700
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和整合多组学分析，研究TNFSF12在甲状腺癌进展中的作用 | 首次鉴定出TNFSF12在甲状腺癌中具有保护效应，但功能实验却显示其促进癌细胞增殖、侵袭和迁移，揭示了作为情境依赖性癌基因的复杂角色 | 未提及 | 识别和验证驱动甲状腺癌进展的关键髓系衍生基因 | 甲状腺癌组织样本、甲状腺癌细胞系 | 单细胞组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序、高维加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化、qPCR、CCK-8、集落形成实验、Transwell实验、微生物相关性分析、分子对接 | NA | 单细胞转录组数据、多组学数据 | 未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2026-07-15 |
Isolation and Sequencing of Single Circulating Tumor Cells
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5050-9_17
PMID:42426460
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研究论文 | 本文介绍了从非小细胞肺癌患者中富集、检测和分离单个循环肿瘤细胞并进行单细胞测序的工作流程 | 针对CTC稀有性和异质性挑战，开发了从富集到单细胞测序的完整流程 | 未提及具体技术局限或挑战 | 研究循环肿瘤细胞的分子异质性及靶向治疗耐药性 | 非小细胞肺癌循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序, 全基因组扩增, 靶向下一代测序, 低覆盖全基因组测序 | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 63 | 2026-07-15 |
Maternal high-fat diet exposure is associated with altered hypothalamic microglial development and reduced early postnatal TGFβ1 signaling in male offspring
2026, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2026.1862234
PMID:42440439
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研究论文 | 研究母体高脂饮食暴露对后代雄性小鼠下丘脑小胶质细胞发育及TGFβ1信号的影响 | 首次揭示母体高脂饮食通过干扰早期出生后TGFβ1/SMAD3信号通路，破坏下丘脑小胶质细胞稳态表型获取的发育过程 | 仅研究雄性后代，未涉及雌性后代；结果基于小鼠模型，人类外推需谨慎 | 探讨母体高脂饮食暴露是否干扰后代下丘脑小胶质细胞发育关键窗口期的稳态特征获取 | 高脂饮食喂养母鼠的雄性后代小鼠 | 机器学习 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据、免疫组化图像 | 多种发育阶段的雄性后代小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3' 测序 |
| 64 | 2026-07-15 |
Molecular diagnostics in pancreas transplantation: past, present, and future
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1825364
PMID:42440699
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综述 | 本文回顾了胰腺移植中分子诊断的应用，从过去的组织学评估到当前的转录组分析，并展望了未来发展方向 | 将胰腺移植物损伤概念化为双隔室过程，包括外分泌排斥和内分泌胰岛损伤，为评估新兴分子诊断提供了新框架 | 胰腺移植研究受限于小规模单中心队列，且胰腺特异性基因表达标志物尚未充分探索，缺乏其临床用途的稳健证据 | 综述胰腺移植中分子诊断的历史、现状和未来，并提出双隔室损伤框架 | 胰腺移植中的分子诊断技术和基因表达标志物 | 数字病理学 | 胰腺移植排斥反应, 1型糖尿病 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 65 | 2026-07-15 |
Spatial RNA velocity reveals cellular state transitions and prognostic markers in the melanoma microenvironment
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1845013
PMID:42440764
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研究论文 | 开发了一种新的计算框架，利用亚细胞转录本定位（以核RNA和胞质RNA分别作为未剪接和剪接mRNA的代理）进行空间RNA速度分析，揭示黑色素瘤微环境中的细胞状态转变和预后标志物 | 首次提出利用空间转录组学数据中核/胞质RNA分区信息替代传统剪接/未剪接mRNA计数进行RNA速度分析，填补了高分辨率空间转录组数据无法推断转录动力学的空白 | 未提及具体局限性 | 从静态空间转录组数据解码时空动态，识别黑色素瘤微环境中细胞状态转变轨迹和预后相关基因 | 黑色素瘤空间转录组数据中的黑色素瘤细胞和浸润T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学 | scVelo动态模型 | 图像 | 未提及具体样本量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 66 | 2026-07-15 |
Immune heterogeneity and therapeutic resistance in gynecological malignancies
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1837428
PMID:42440783
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综述 | 本综述总结了单细胞测序在宫颈癌、卵巢癌和子宫内膜癌中的免疫异质性、治疗抵抗及精准免疫治疗研究进展 | 系统整合了单细胞测序揭示的三种妇科恶性肿瘤在免疫微环境动态重塑、肿瘤-免疫互作网络及治疗抵抗机制方面的最新见解 | 未详细讨论各技术平台间的比较验证及跨队列整合分析中的批次效应问题 | 阐述单细胞测序技术如何解析妇科恶性肿瘤的免疫异质性与治疗抵抗机制 | 宫颈癌、卵巢癌、子宫内膜癌的肿瘤生态系统 | 数字病理学 | 宫颈癌, 卵巢癌, 子宫内膜癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明，涵盖已发表研究中涉及的肿瘤组织及液体活检样本 | 未明确提及 | 单细胞RNA测序 | 未明确提及 | 未明确提及 |
| 67 | 2026-07-15 |
Identifying Distinct Molecular Subtypes and Establishing a Prognostic Framework for DLBCL Patients via Multiomics Analysis and Machine Learning Approaches
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/7614954
PMID:42440855
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研究论文 | 通过多组学分析和机器学习方法识别弥漫大B细胞淋巴瘤的分子亚型并建立预后框架 | 首次利用单细胞RNA测序数据识别出弥漫大B细胞淋巴瘤中六个恶性B细胞亚群，并发现MB5亚群与不良预后相关，进而基于该亚群标志基因开发了CoxBoost-RSF机器学习预后模型 | 研究依赖公开数据集，MB5亚群的机制及临床应用仍需进一步验证 | 揭示弥漫大B细胞淋巴瘤的异质性并建立预后预测框架 | 弥漫大B细胞淋巴瘤患者的恶性B细胞亚群及预后生物标志物 | 机器学习 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、多组学分析 | CoxBoost-RSF | 单细胞转录组数据（scRNA-seq）和批量转录组数据 | GSE182434数据集和GSE32918数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2026-07-15 |
YAP1 depletion enhances TAZ and its complexation with TEAD4 and AP-1 heterodimer C-JUN/FOSB in gastric cancer progression and metastasis
2026, Cancer heterogeneity and plasticity
DOI:10.47248/chp2603010003
PMID:42441024
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研究论文 | 本研究发现YAP1的缺失增强TAZ及其与TEAD4和AP-1异二聚体c-JUN/FOSB的复合物形成，促进胃癌进展和转移 | 首次揭示在胃癌腹膜转移中YAP1抑制导致TAZ补偿性上调，并阐明TAZ与TEAD4及AP-1复合物结合的新机制，强调联合靶向YAP1和TAZ的优越抗肿瘤效果 | 未提及具体局限性 | 探究YAP1、TAZ和TEAD1-4在胃癌腹膜转移中的表达状态，并评估同时靶向YAP1和TAZ是否比单独抑制任一协同激活因子具有更强的抗肿瘤活性 | 胃癌腹膜转移样本及相关小鼠模型和细胞系 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、共免疫荧光染色、基因敲除、反义寡核苷酸抑制、免疫共沉淀、荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据、图像 | 胃癌腹膜转移样本（数量未明确）、患者来源异种移植模型、KP-Luc2同源模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2026-07-15 |
Transcriptomic characterization of key psoriasis-associated genes based on single-cell RNA-seq and machine learning
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0352663
PMID:42441578
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序和机器学习技术，表征银屑病的关键相关基因 | 结合单细胞RNA测序与机器学习算法，从大量数据中精准筛选出四个银屑病关键驱动基因（DEFB4A、GJB2、SERPINB3、SERPINB13），并探索其调控机制及潜在靶向治疗策略 | 仅依赖公共数据库数据，可能缺乏临床样本多样性；四个关键基因的功能验证还需进一步实验支持 | 识别银屑病的关键驱动基因并探索其作为治疗靶点的潜力 | 银屑病患者和健康对照的皮肤组织样本 | 机器学习 | 银屑病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 机器学习算法（具体模型类型未明确） | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的银屑病和健康样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2026-07-15 |
Establishment, functional dissection, and single-cell transcriptomal characteristics of patient-derived pulmonary sarcomatoid carcinoma organoids
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1867600
PMID:42444803
|
研究论文 | 本研究成功建立并表征了肺肉瘤样癌患者来源的类器官模型，评估了其在病理、基因组和功能上的保真度及转化潜力 | 首次建立并系统验证了肺肉瘤样癌患者来源的类器官模型，通过单细胞RNA测序揭示了类器官与原始肿瘤在细胞组成、转录组特征和拷贝数变异图谱上的高度相似性 | 仅基于单个患者来源的肿瘤组织建立了两个类器官系，样本量较小，可能无法完全代表PSC的异质性 | 建立并表征肺肉瘤样癌患者来源的类器官模型，评估其作为研究平台和个性化治疗筛选工具的潜力 | 肺肉瘤样癌患者肿瘤组织及其衍生的类器官模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自1名肺肉瘤样癌患者的肿瘤组织，建立了2个类器官系（PDO1和PDO2） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2026-07-15 |
Integrative multi-omics analysis implicates the RNF40-LIMA1 axis in hepatocellular carcinoma progression and immune microenvironment remodeling
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1846606
PMID:42444812
|
研究论文 | 该研究通过多组学整合分析，探讨RNF40-LIMA1轴在肝细胞癌进展及免疫微环境重塑中的作用 | 首次整合批量转录组、单细胞RNA测序和空间转录组数据，揭示RNF40通过泛素化降解LIMA1调控肝癌进展及免疫抑制微环境的新型分子机制 | LIMA1的预后和免疫治疗预测价值需在独立临床队列和更大规模的免疫检查点抑制剂治疗肝癌数据集中进一步验证 | 阐明RNF40介导的LIMA1泛素化在肝细胞癌进展和免疫微环境重塑中的分子机制 | 肝细胞癌中的RNF40和LIMA1表达及功能关系 | 机器学习 | 肝癌 | 批量转录组测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 多个转录组和蛋白质组数据集，包括TCGA-LIHC等公共数据及实验验证中的小鼠模型 | Illumina | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | Illumina NovaSeq, 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒, 10x Visium FFPE空间转录组试剂盒 |
| 72 | 2026-07-15 |
Identification and validation of novel candidate genes with diagnostic value for sepsis via weighted gene co-expression network analysis
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1817161
PMID:42445139
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研究论文 | 通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）鉴定脓毒症候选基因并评估其诊断价值 | 结合多个GEO数据集，利用WGCNA和蛋白质互作网络（PPI）筛选出五个核心基因（CDK1, CCNB1, CCNA2, AURKB, BUB1），并构建逻辑回归模型，在多个验证集中表现出诊断潜力 | 当前结果为相关性分析，未建立因果关系，仅作为假设生成性结论，需进一步在前瞻性独立队列中验证 | 筛选脓毒症候选基因并评估其诊断价值 | 脓毒症相关基因及其诊断模型 | 机器学习 | 脓毒症 | RNA-seq, qRT-PCR | 逻辑回归, WGCNA, PPI网络分析 | 基因表达数据, 单细胞RNA-seq数据 | 多个GEO数据集（包含儿童和成人样本） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2026-07-15 |
Evaluating glycolysis-associated biomarkers for radiotherapy sensitivity in head and neck squamous cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1736778
PMID:42445170
|
研究论文 | 本研究评估了头颈鳞状细胞癌中糖酵解相关生物标志物对放疗敏感性的影响，并开发了一个糖酵解相关的放射敏感性指数 | 首次开发基于糖酵解相关基因的放射敏感性指数（RI），并整合单细胞RNA测序揭示糖酵解与免疫逃避的关系 | 未提及明确的局限性，但基于公开数据集和体外实验，缺乏多中心验证和体内实验支持 | 开发糖酵解相关生物标志物以预测头颈鳞癌的放疗敏感性 | 头颈鳞状细胞癌患者及其肿瘤组织 | 机器学习 | 头颈鳞状细胞癌 | RNA-seq、单细胞RNA测序、Cox回归分析 | Cox回归模型 | 基因表达数据、临床数据 | 491名头颈鳞癌患者的基因表达和临床数据 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2026-07-15 |
CD4+ T cell signature in long COVID: insights from an unvaccinated cohort
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1823850
PMID:42445202
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研究论文 | 通过分析未接种疫苗的新冠患者队列，研究长期新冠中CD4+ T细胞的特征 | 首次在未接种疫苗且排除再感染干扰的队列中，通过单细胞RNA测序揭示长期新冠患者CD4+ T细胞存在急性活化特征和干扰素相关基因上调，而非克隆扩增 | 样本量较小（6例LC和4例RC），且仅关注CD4+ T细胞，未涵盖其他免疫细胞类型 | 探究长期新冠的免疫学机制，识别其主要免疫特征 | 未接种疫苗的巴西新冠患者（LC组和RC组） | 数字病理学 | COVID-19后遗症 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 104名患者用于体液免疫分析；6名LC和4名RC用于CD4+ T细胞分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3' 表达分析 |
| 75 | 2026-07-15 |
An integrated network toxicology and multi-omics study identifies ENO1 as a candidate mediator in benzo[a]pyrene-related gastric cancer progression
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1857843
PMID:42445243
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研究论文 | 本研究通过整合毒理基因组学与多组学优先化方法，结合初步验证，识别苯并[a]芘相关胃癌进展中的候选介质ENO1 | 首次通过整合网络毒理学与多组学方法，结合单细胞RNA测序和初步实验验证，系统识别BaP相关胃癌进展的关键候选介质ENO1，并构建跨平台优先化框架 | 初步验证仅限于体外实验，缺乏体内模型和临床样本验证；ENO1与BaP的蛋白水平相互作用仍需进一步结构生物学验证 | 识别苯并[a]芘相关胃癌进展的候选生物介质 | 胃癌细胞系及肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 毒理基因组学、多组学分析、单细胞RNA测序、分子对接 | 人工神经网络、LASSO回归 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 基于公共转录组数据集及单细胞RNA测序数据，具体样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2026-07-15 |
Mapping safety in space: the emerging role of spatial transcriptomics in safe drug development
2026, Frontiers in toxicology
IF:3.6Q2
DOI:10.3389/ftox.2026.1817521
PMID:42445318
|
review | 综述空间转录组学在药物开发中评估安全性的作用及平台选择策略 | 系统评估不同空间转录组平台在临床前安全性研究中的适用性，强调平台特异性优势与药物开发考量 | 空间转录组学方法成本高、数据复杂且需专业分析技能，实际应用中存在局限 | 为临床前安全性研究中的空间转录组平台选择提供指导 | 空间转录组技术及其在药物安全性评估中的应用 | machine learning | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 空间转录组学平台，如10x Visium |
| 77 | 2026-07-15 |
SLECA: A Single-Cell Atlas of Systemic Lupus Erythematosus Enabling Rare-Cell Discovery Using Graph Transformer
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0163
PMID:42445523
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研究论文 | 提出了SLECA，首个大规模系统性红斑狼疮单细胞转录组图谱，结合图变换器框架用于稀有细胞发现 | 首次构建大规模SLE单细胞转录组图谱并结合图变换器框架，实现了可解释的疾病相关稀有细胞群体发现 | 未明确提及局限性，但可能受限于样本来源和数据分析的偏差 | 建立系统性红斑狼疮单细胞图谱，并开发可解释的稀有细胞发现方法 | 系统性红斑狼疮患者及健康对照的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | 图变换器 | 单细胞转录数据 | 366个样本，整合了标准化的临床和生物学元数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2026-07-15 |
TelomereHunter2: improved in silico telomere analysis software for precision oncology and single-cell studies
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag187
PMID:42445596
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研究论文 | 开发了TelomereHunter2软件，用于从测序数据中改进端粒分析，以支持精准肿瘤学和单细胞研究 | 通过容器化软件并提升最多74%的运行时间，简化了与精准肿瘤学工作流的整合，并扩展支持非人类基因组和单细胞测序方法 | 仅在试点数据集上进行了验证，未提及在大型或多样化数据集上的全面测试 | 开发可持续的端粒分析框架，提升软件在精准肿瘤学和单细胞研究中的适用性 | 端粒生物学及其在肿瘤发生、衰老和基因组稳定性中的作用 | 机器学习 | 肿瘤 | NGS | NA | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2026-07-13 |
SCSEQ: A web tool for analyzing single-cell RNA-seq data
2026-01-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag029
PMID:42084898
|
研究论文 | 开发了一个基于网络交互式生物信息学分析平台SCSEQ，用于分析单细胞RNA-seq数据 | 提供了一个无需编程技能即可使用的综合性单细胞数据分析平台，涵盖从预处理到下游分析的完整流程，并支持多种输入格式和动态交互 | 未明确说明限制，但可能依赖于平台在线服务的稳定性和计算资源 | 解决单细胞RNA测序数据处理的挑战，为研究人员提供便捷的分析工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-07-13 |
4D single-cell spatial transcriptomics reveals dynamic morphogenetic gradients and regenerative domains in planarians
2026-01-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag064
PMID:42172041
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研究论文 | 利用高分辨率空间转录组学构建包含超过350万细胞、涵盖8个再生时间点的四维图谱，揭示涡虫再生的形态发生梯度和再生区域 | 首次生成覆盖涡虫全身再生的四维单细胞空间转录组图谱，识别出由Mediator 8调控的前再生区这一全新的损伤诱导空间域 | 未提及具体局限性 | 研究涡虫全身再生过程中基因表达与细胞反应的时空动态规律 | 涡虫（planarians） | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 超过350万个细胞，来自8个不同再生时间点的完整涡虫样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |