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当前共找到 1234 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-02-10 |
CytoVerse: Single-Cell AI Foundation Models in the Browser
2026-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.29.702554
PMID:41659670
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研究论文 | 本文介绍了CytoVerse，一个在浏览器中运行单细胞RNA测序基础模型的框架，旨在解决单细胞数据映射到大型图谱时的服务器限制和隐私问题 | 通过ONNX部署模型实现无服务器计算，使用压缩索引（IVFPQ）在客户端搜索超过2000万个细胞参考，并提供轻量级协议以保护隐私共享嵌入 | NA | 开发一个可扩展且隐私保护的单细胞分析框架 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 基础模型（scFM） | 单细胞RNA测序数据 | 超过2000万个细胞参考 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-02-10 |
Multi-omics reveals hepatotoxic mechanisms and key toxic components of Polygoni Multiflori Radix and its processed products
2026-Jan-29, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.157908
PMID:41655553
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了何首乌及其炮制品的肝毒性机制和关键毒性成分 | 首次整合非靶向血清代谢组学、肝脏空间转录组学和肝脏空间代谢组学来阐明肝毒性机制，并识别出大黄素为主要毒性成分 | NA | 全面阐明何首乌及其炮制品的肝毒性过程并识别主要毒性成分 | 何首乌及其炮制品 | 多组学 | 肝损伤 | 非靶向血清代谢组学、肝脏空间转录组学、肝脏空间代谢组学、质谱分析 | NA | 代谢组数据、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 63 | 2026-02-10 |
Prostaglandin E₂ Reverses Myofibroblast Differentiation in Eosinophilic Esophagitis
2026-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.27.702012
PMID:41659461
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研究论文 | 本研究探讨了前列腺素E₂（PGE₂）在嗜酸性食管炎（EoE）中逆转肌成纤维细胞分化的功效及其机制 | 首次揭示了PGE₂通过cAMP/YAP/THBS-1通路促进肌成纤维细胞去分化，挑战了纤维化不可逆的范式，并提出了靶向肌成纤维细胞作为治疗纤维狭窄性EoE的新策略 | 研究主要关注成纤维细胞特异性机制，PGE₂对食管上皮分化、屏障功能及免疫细胞募集的影响尚未确定 | 探究PGE₂在EoE中逆转肌成纤维细胞分化的治疗效果及分子机制 | 胎儿食管成纤维细胞（FEF3）、患者来源的成纤维细胞以及EoE小鼠模型 | NA | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA-seq、转录组分析 | NA | RNA-seq数据、转录组数据 | 胎儿食管成纤维细胞系、患者来源成纤维细胞及EoE小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2026-02-10 |
A Single-Cell and Spatial 3D Multi-omic Atlas of Developing Human Basal Ganglia and Inhibitory Neurons
2026-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.28.702385
PMID:41659519
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间多组学技术，揭示了人类基底神经节发育过程中的表观基因组和3D基因组动态 | 首次结合单核甲基-3C测序、高多重空间转录组学和染色质+RNA单分子成像，构建了发育中人类基底神经节的多模态图谱，并识别了与神经精神疾病风险相关的调控区域 | 研究主要关注围产期大脑，可能未涵盖成年期的发育变化，且样本量有限 | 阐明基底神经节发育过程中的表观基因组和3D基因组动态 | 人类基底神经节和抑制性神经元 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单核甲基-3C测序, 空间转录组学, 染色质+RNA单分子成像 | NA | 基因组, 转录组, 空间数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 65 | 2026-02-10 |
Altered immune and treatment response gene expression signatures among poverty-exposed children with B-ALL
2026-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.27.702019
PMID:41659564
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析贫困暴露的B细胞急性淋巴细胞白血病儿童患者的白血病母细胞及其微环境，揭示了诊断时存在的类固醇耐药转录特征以及免疫细胞表达变化 | 首次在单细胞水平揭示贫困暴露与B-ALL患儿类固醇耐药性及免疫微环境改变的关联 | 研究样本量有限，机制性研究尚不深入，需要进一步验证 | 探究贫困暴露对B-ALL儿童患者治疗反应和免疫特征的影响 | 标准风险B细胞急性淋巴细胞白血病儿童患者 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2026-02-10 |
Sod1 trisomy causes ENS developmental defects and susceptibility to Hirschsprung disease via neuronal Ret suppression and glial remodeling
2026-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.26.701837
PMID:41659476
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和免疫荧光技术，研究了SOD1三体如何通过抑制神经元Ret表达和促进胶质细胞重塑，导致肠神经系统发育缺陷并增加Hirschsprung病的易感性 | 首次证明SOD1基因剂量增加足以扰乱肠神经系统发育，并揭示了其在Hirschsprung病易感性中的双重机制：抑制Ret依赖性神经发生和促进反应性/增殖性胶质细胞状态 | 研究基于小鼠模型，可能不完全反映人类疾病机制；样本量有限，仅分析了出生后第0天的远端结肠 | 探究染色体21特定基因（尤其是SOD1）在Down综合征患者Hirschsprung病风险增加中的因果作用 | 人类化三体小鼠模型的肠神经系统细胞 | 单细胞组学 | Hirschsprung病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 出生后第0天小鼠远端结肠样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2026-02-10 |
Spatial transcriptomics reveals brain-wide circadian disruption in an Alzheimer's disease model
2026-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.26.701799
PMID:41659563
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，揭示了小鼠大脑中昼夜节律转录的空间组织架构，并在阿尔茨海默病模型中观察到早期区域特异性节律失调 | 首次通过大规模空间转录组学绘制了大脑皮层和皮层下区域24小时节律转录图谱，并发现阿尔茨海默病早期在淀粉样斑块沉积前就出现区域特异性节律破坏 | 研究基于小鼠模型（APP23），可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的复杂性；空间转录组学技术分辨率可能存在限制 | 探究健康与疾病状态下大脑昼夜节律转录的空间组织特征 | 小鼠大脑（包括皮层和皮层下区域），特别是APP23阿尔茨海默病模型小鼠 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及小鼠大脑多个区域 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 68 | 2026-02-10 |
scAURA: Alignment- and Uniformity-based Graph Debiased Contrastive Representation Architecture for Self-Supervised Clustering of Single-Cell Transcriptomics
2026-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.25.701579
PMID:41659516
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研究论文 | 本文提出了一种名为scAURA的自监督聚类框架，用于解决单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别挑战 | 提出了一个结合图去偏对比学习和自监督聚类的统一框架，通过对齐性和均匀性优化来提升细胞聚类性能 | NA | 开发一种能够准确识别单细胞RNA测序数据中细胞类型的自监督聚类方法 | 人类和小鼠的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 图去偏对比学习架构 | 基因表达数据 | 18个真实单细胞数据集，涵盖多种组织和细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2026-02-10 |
Circulating Ly6Chigh monocyte-derived S100A4+ macrophages exacerbate neuroinflammation and impede recovery of traumatic brain injury
2026-Jan-26, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106472
PMID:41605306
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了创伤性脑损伤后循环Ly6Chigh单核细胞衍生的S100A4+巨噬细胞通过CCL4-CCR1轴浸润脑组织，加剧神经炎症并阻碍功能恢复的机制 | 首次在TBI模型中识别出源自循环Ly6C单核细胞的S100A4巨噬细胞亚群，并阐明其通过CCL4-CCR1轴浸润脑组织、通过SPP1-CD44通路激活小胶质细胞，以及IRF7作为关键转录因子驱动该过程的分子机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床样本中验证；药物干预效果仅基于动物实验，需进一步临床试验确认 | 探究创伤性脑损伤后系统性免疫反应的细胞与分子机制，并寻找潜在治疗靶点 | 创伤性脑损伤小鼠模型的脑组织与外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2026-02-10 |
The Effects of Hypertension on Signaling Dynamics in Rare Renal Cell Types
2026-Jan-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.23.701352
PMID:41659614
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析高血压对肾脏稀有细胞类型信号动态的影响，重点关注淋巴内皮细胞和支持细胞 | 首次在高血压模型中鉴定出新型多能性支持细胞群体，并利用NicheNet分析揭示细胞间信号通路的动态变化 | 研究基于小鼠模型，结果需在人类样本中验证；单细胞测序数据可能受技术变异影响 | 探究高血压如何改变肾脏稀有细胞类型的信号传导动态，以寻找减少肾脏炎症的新方法 | 小鼠肾脏中的淋巴内皮细胞、髓系免疫细胞和新型支持细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自血管紧张素II诱导和盐敏感性高血压模型小鼠的CD31+/podoplanin+肾脏细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2026-02-10 |
Longitudinal spatial transcriptomics reveals the molecular dynamics of pulmonary artery remodeling in pulmonary arterial hypertension
2026-Jan-21, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.01.017
PMID:41577266
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研究论文 | 本文通过纵向空间转录组学分析，揭示了肺动脉高压中肺动脉重塑的分子动态变化 | 首次在肺动脉高压患者中进行纵向空间转录组学分析，比较了13年间两个时间点的血管病变，识别了严重受影响小肺动脉特有的115个基因重塑特征和25个核心基因特征 | 研究仅基于单一患者的样本，样本量较小，可能限制结果的普适性 | 揭示肺动脉高压中肺动脉重塑的分子机制和动态变化 | 肺动脉高压患者的肺组织样本，包括小和大肺动脉 | 空间转录组学 | 肺动脉高压 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 1名患者，两个时间点（13年间隔）的肺组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 72 | 2026-02-10 |
Hepatic Arterial Flow-induced Portal Tract Fibrosis in Portal Hypertension: The Role of VCAM-1 and Osteopontin-expressing Macrophages
2026-Jan-19, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101728
PMID:41565157
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研究论文 | 本研究揭示了在门脉高压中，肝动脉血流增加通过VCAM-1和骨桥蛋白阳性巨噬细胞驱动门管区纤维化的分子机制 | 首次将肝动脉缓冲反应与门管区纤维化直接联系起来，并明确了VCAM-1介导的巨噬细胞招募及Spp1+巨噬细胞在驱动纤维化中的核心作用 | 研究主要在啮齿动物模型中进行，其结论在人类门脉高压中的普适性有待进一步验证 | 探究门脉高压背景下肝动脉血流增加诱导病理性门管区重塑的分子机制 | Sprague-Dawley大鼠（门脉部分结扎模型）及从模型分离的巨噬细胞和门脉成纤维细胞 | NA | 门脉高压 | 单细胞RNA测序，RNA荧光原位杂交，微计算机断层扫描，免疫细胞分析，血流动力学测量，转录组分析 | NA | 图像数据，转录组数据，血流动力学数据 | 使用Sprague-Dawley大鼠建立门脉部分结扎模型，具体样本数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2026-02-10 |
Aging-related Transcriptomic Changes with Spatial Resolution in the Human Prefrontal Cortex
2026-Jan-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.12.698703
PMID:41648412
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，在37名成年个体中分析了人前额叶皮层随年龄增长的转录组变化及其在不同皮层层次的差异 | 首次在人类前额叶皮层中，以空间分辨率（皮层层次特异性）系统地揭示了全生命周期范围内的年龄相关转录组变化，是目前该领域规模最大、最全面的空间转录组分析之一 | 研究基于死后脑组织样本，可能无法完全反映活体状态下的动态变化；样本量虽较大，但个体间的异质性可能影响结果的普适性 | 探究人前额叶皮层在衰老过程中转录组变化的时空特异性，以理解认知功能随年龄衰退的分子机制 | 人前额叶皮层组织 | 空间转录组学 | 衰老相关疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 37名成年个体（覆盖全生命周期）的死后前额叶皮层样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 74 | 2026-02-10 |
Comprehensive analysis of key palmitoylation-modifying enzymes in clear cell renal cell carcinoma: implications for prognosis and therapy
2026-Jan-10, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04155-5
PMID:41519750
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，系统识别并验证了透明细胞肾细胞癌中关键的棕榈酰化修饰酶，探讨了其临床意义 | 首次在ccRCC中系统评估棕榈酰化修饰酶的作用，并利用PalmScore系统结合机器学习算法识别出诊断和预后关键基因 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证，且临床样本的异质性可能影响结果 | 系统识别ccRCC中关键的棕榈酰化修饰酶，并探索其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者数据及细胞系 | 生物信息学 | 肾癌 | 多组学数据分析，单细胞RNA测序，siRNA敲低实验 | 机器学习算法 | 基因表达数据，临床数据 | 来自TCGA-KIRC和GEO数据集的ccRCC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2026-02-10 |
Differential expression analysis for spatially correlated data using smiDE
2026-Jan-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03867-1
PMID:41519776
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研究论文 | 本文提出了一种用于空间相关数据的差异表达分析方法，解决了空间转录组学中因分割错误和邻近细胞相关性导致的统计偏差问题 | 开发了smiDE方法，专门针对空间转录组数据中的分割误差和空间相关性进行校正，减少了假阳性发现 | NA | 改进空间转录组数据的差异表达分析，提高统计准确性 | 空间转录组数据中的细胞状态响应 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 76 | 2026-02-10 |
Mapping the secondary response to traumatic brain injury using spatial transcriptomics shows acute 4-aminopyridine treatment mitigates axonal and molecular pathology
2026-Jan-08, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02219-1
PMID:41508250
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，结合神经病理学分析，探讨了急性4-氨基吡啶治疗对创伤性脑损伤后轴突损伤和分子病理的缓解作用 | 首次将空间转录组学与临床导向的神经病理学相结合，全面分析创伤性脑损伤的次级损伤过程，并评估4-氨基吡啶作为急性治疗药物的潜力 | 研究仅使用小鼠模型，未涉及人类样本，且高剂量4-氨基吡啶可能诱发癫痫行为，限制了其临床应用 | 评估4-氨基吡啶作为急性创伤性脑损伤治疗药物，以减轻轴突损伤和促进活动依赖性修复 | 成年雄性和雌性小鼠的创伤性脑损伤模型，重点关注胼胝体轴突和皮质区域 | 空间转录组学 | 创伤性脑损伤 | 空间转录组学，免疫标记 | NA | 空间转录组数据，免疫组织化学图像 | 成年雄性和雌性小鼠，具体数量未在摘要中明确说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 77 | 2026-02-10 |
Tight junction-high and CDH17-positive cell population is the source of colorectal cancer liver metastases
2026-Jan-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68169-3
PMID:41484106
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研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌肝转移的细胞来源，发现IKKα缺失通过稳定紧密连接成分促进转移，并鉴定出CDH17⁺/CLDN2⁺上皮亚群在转移灶中的主导作用 | 意外发现IKKα缺失促进结直肠癌转移，并首次将紧密连接重塑驱动的CDH17⁺/CLDN2⁺上皮亚群确定为转移能力的来源 | 研究主要基于患者来源的类器官模型，体内验证和临床相关性需进一步探索 | 探究结直肠癌转移的细胞特征和驱动机制 | 结直肠癌患者来源的类器官、转移性病变组织 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、组织染色 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2026-02-10 |
Oxidative stress and GPX2 control pancreatic vs. non-pancreatic cell fate in human endoderm
2026-Jan-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68145-x
PMID:41484137
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研究论文 | 本研究揭示了氧化应激和GPX2在调控人类内胚层后前肠向胰腺与非胰腺细胞命运分化中的关键作用 | 首次发现谷胱甘肽过氧化物酶2（GPX2）通过调节氧化应激水平，决定人类后前肠细胞向胰腺或肝/肠谱系分化的命运选择 | 研究主要基于体外分化模型，体内生理环境中的验证尚需进一步研究 | 探究代谢产物在人类内胚层发育过程中细胞命运决定的作用机制 | 人类后前肠内胚层细胞 | 发育生物学 | NA | 批量转录组测序, 单细胞转录组测序, 染色质可及性分析 | NA | 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 79 | 2026-02-10 |
A pan-cancer single cell landscape reveals heterogeneity and functional diversity of double-negative T cells
2026-Jan-03, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02548-8
PMID:41484771
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据，揭示了双阴性T细胞在肿瘤微环境中的异质性和功能多样性 | 首次在泛癌水平构建了双阴性T细胞的单细胞图谱，识别了14个不同的亚群，并阐明了它们在肿瘤免疫治疗中的关键作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，功能验证仍需进一步实验支持，且样本来源和癌症类型可能存在偏差 | 探究双阴性T细胞在肿瘤微环境中的异质性、功能多样性及其对免疫治疗反应的影响 | 双阴性T细胞（DNT细胞），包括αβ DNT和γδ T细胞亚群 | 单细胞组学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重免疫荧光、空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 2,369个样本，涵盖23种癌症类型，包含157,025个高质量DNT细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 80 | 2026-02-10 |
Resolving Single-Cell Gene Expression by Pseudotemporal Integration of Transcriptomic and Proteomic Datasets
2026-Jan, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2025.101475
PMID:41317903
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研究论文 | 本研究提出了一种利用伪时间细胞排序整合单细胞RNA-Seq和单细胞蛋白质组学数据的新方法，以分析缺氧条件下的转录-翻译表达动态 | 首次使用伪时间轨迹整合单细胞转录组和蛋白质组数据，揭示转录与翻译的时序动态响应 | 仅针对缺氧条件进行研究，未涉及其他应激或疾病状态 | 整合单细胞转录组和蛋白质组数据，以理解缺氧应激下的细胞表型和转录-翻译动态 | 缺氧条件下的单细胞样本 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-Seq, 单细胞蛋白质组学质谱 | 伪时间轨迹分析 | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 纵向收集的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |