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当前共找到 1652 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-05-09 |
Unraveling spermatogenesis: A single-cell genomics perspective
2026, Current topics in developmental biology
DOI:10.1016/bs.ctdb.2026.03.003
PMID:42097818
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综述 | 本文从单细胞基因组学角度综述了精子发生过程的技术演变、关键生物学争议及未来研究方向 | 系统整合了单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和单细胞DNA甲基化等技术在精子发生研究中的应用，并提出了多组学与空间转录组学的未来前景 | 未提及具体实验验证或定量比较不同技术的性能差异 | 综述单细胞基因组学技术对雄性生殖细胞研究带来的变革，并展望临床转化潜力 | 精子发生过程，包括精原干细胞、生殖细胞分化及表观遗传调控 | 单细胞基因组学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞DNA甲基化, 多组学, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞DNA甲基化, 多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 62 | 2026-05-09 |
Integrating single-cell and bulk RNA sequencing data reveals RGS4 as a functional driver in a proliferative subgroup of SF-1 lineage PitNETs
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1815682
PMID:42099385
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研究论文 | 整合单细胞和批量RNA测序数据揭示RGS4是SF-1谱系PitNETs增殖亚组的功能驱动因子 | 首次识别出一个高表达RGS4的SF-1谱系PitNETs亚组，并阐明RGS4通过促进p53泛素化降解驱动肿瘤增殖的机制 | 未提及具体局限性 | 探索SF-1谱系垂体神经内分泌肿瘤异质性和增殖行为的分子决定因素 | SF-1谱系垂体神经内分泌肿瘤 | 机器学习 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2026-05-08 |
scDenorm: a denormalization tool for integrating single-cell transcriptomics data
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag032
PMID:41915012
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研究论文 | 提出一种名为scDenorm的去标准化工具，用于整合单细胞转录组学数据 | 首次提出能逆转delta方法标准化后的单细胞组学数据、恢复原始计数并保持数据完整性的算法 | 仅对delta方法标准化的数据进行验证，未评估其他标准化方法的适用性 | 解决单细胞组学数据整合中因不同标准化方法导致的批次效应和基因表达失真问题 | 单细胞转录组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2026-05-08 |
SCSEQ: A web tool for analyzing single-cell RNA-seq data
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag029
PMID:42084898
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研究论文 | 开发了一个名为SCSEQ的交互式网页生物信息学分析平台，用于处理和分析单细胞RNA测序数据 | 提供一个无需编程技能即可使用的单细胞RNA测序数据分析平台，整合了从数据预处理到下游分析（如基因富集分析、转录因子分析、细胞间通讯分析等）的完整工作流，并支持不同工作流之间的信息传递和多种输入格式 | 未明确指出局限性，但可能依赖于用户对参数设置的理解，以及平台对大规模数据的处理能力有待进一步验证 | 解决单细胞RNA测序数据分析中数据处理和处理的挑战，为无编程背景的研究人员提供便捷的分析工具 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 65 | 2026-05-08 |
Cell-type- and chromosome-specific chromatin landscapes and DNA replication programs of Drosophila testis tumor stem cell-like cells
2026-01-05, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280809.125
PMID:41371963
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研究论文 | 开发细胞类型特异性基因组技术，分析果蝇睾丸肿瘤干细胞样细胞的转录组、组蛋白修饰图谱和复制时序 | 首次在体内对成年干细胞进行细胞类型特异性全基因组分析，整合转录组、染色质和复制数据，揭示生殖系干细胞样细胞独特的复制程序 | 仅使用了果蝇睾丸肿瘤干细胞样细胞模型，可能无法完全代表正常干细胞状态 | 阐明体内成体干细胞的转录、染色质和复制时序特征及其细胞类型特异性差异 | 果蝇睾丸生殖系干细胞样细胞和体细胞囊肿干细胞样细胞 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 细胞类型特异性染色质分析, 复制时序分析 | NA | 单细胞转录组数据, 组蛋白修饰数据（H3K4me3, H3K27me3, H3K9me3）, 复制时序数据 | 果蝇睾丸组织, 包含生殖系干细胞和体细胞囊肿干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 染色质免疫沉淀测序, 复制时序测序 | NA | NA |
| 66 | 2026-05-08 |
Recovering gene regulatory networks in single-cell multi-omics data with PRISM-GRN
2026-01-05, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280757.125
PMID:41067887
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研究论文 | 提出PRISM-GRN模型，利用贝叶斯框架整合scRNA-seq与scATAC-seq数据及已知调控网络，重建细胞类型特异性基因调控网络 | 创新性地将已知基因调控网络和生物可解释机制融入概率框架，通过机制驱动的生成过程和先验网络引导的推理过程实现精确稳健的GRN重建 | 具体局限未在摘要中提及 | 开发一种能够利用多组学数据和先验知识重建细胞类型特异性基因调控网络的方法 | 多组学单细胞数据中的基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | 贝叶斯模型 | 基因表达数据，染色质可及性数据 | 四个基准数据集及PBMC数据集 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 67 | 2026-05-08 |
Microenvironment-aware spatial modeling for accurate inference of cell identity
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1477
PMID:41495904
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研究论文 | 提出了一种名为MEcell的无参数方法，通过显式纳入空间上下文和自动调整其贡献来改进细胞身份建模 | 首次开发了无参数方法MEcell，能够显式结合空间上下文并自动调整其对细胞身份建模的贡献 | 在多个空间转录组平台和组织类型上进行了验证，但未提及对某些特定疾病或复杂组织的适用性 | 准确推断空间组学数据中的细胞身份 | 空间转录组数据中的细胞身份 | 计算生物学 | 未提及 | 空间转录组学 | 无参数模型 | 空间转录组数据 | 90个模拟数据集和7个真实数据集 | Vizgen, 10x Genomics, NanoString, BGI | 空间转录组学 | MERFISH/Vizgen, Xenium, CosMx, Visium HD, Slide-seqV2, open-ST | MERFISH/Vizgen平台, 10x Xenium平台, NanoString CosMx平台, 10x Visium HD平台, Slide-seqV2平台, open-ST平台 |
| 68 | 2026-05-08 |
Chemical Perturbations Impacting Histone Acetylation Govern Colorectal Cancer Differentiation
2026-Jan, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.07.003
PMID:40633623
|
研究论文 | 研究通过化学扰动组蛋白乙酰化调控结直肠癌分化，揭示了HDAC1/2抑制和H3K27ac的关键作用 | 首次发现HDAC1/2催化结构域抑制可促进结直肠癌分化并抑制肿瘤生长，鉴定H3K27ac和H3K9ac为关键调控标记，并通过遗传筛选发现死亡相关蛋白激酶3参与H3K27ac介导的分化过程 | 未提及具体局限性 | 鉴定并表征结直肠癌分化的表观遗传调控因子，揭示重编程癌细胞状态的机制 | 小鼠和人类结直肠癌模型、患者来源的结直肠癌类器官 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、质谱组蛋白修饰分析、遗传筛选、组蛋白去乙酰化酶抑制 | NA | 基因表达数据、组蛋白修饰数据、单细胞转录组数据 | 小鼠和人类结直肠癌模型以及患者来源类器官（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2026-05-08 |
Normal cardiac lymphatics and their mimics
2026-Jan-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00549.2025
PMID:41285409
|
研究论文 | 利用Prox1-tdTomato淋巴报告小鼠模型，结合光片显微镜、免疫染色和单细胞RNA测序，详细描绘了心脏各解剖部位正常淋巴管的分布模式 | 首次使用淋巴报告小鼠模型、多种标记物和现代成像技术，系统描述了正常心脏各解剖部位的淋巴管分布，并通过单细胞RNA测序揭示了心脏淋巴内皮细胞的六种亚型 | 未明确说明局限性，但可能仅限于小鼠模型，且缺乏功能验证 | 定义心脏各解剖部位淋巴管的正常分布模式 | Prox1-tdTomato淋巴报告小鼠的心脏淋巴管 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 光片显微镜、免疫染色、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 使用Prox1-tdTomato淋巴报告小鼠，具体样本数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 单细胞RNA测序 |
| 70 | 2026-05-08 |
VST-DAVis: an R Shiny application and web-browser for spatial transcriptomics data analysis and visualization
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag007
PMID:41640624
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研究论文 | VST-DAVis是一款基于R Shiny的交互式网络应用，用于10x Genomics Visium HD平台生成的空间转录组数据分析和可视化 | 提供了一个无需编程技能即可进行端到端空间转录组分析的图形界面，集成多个常用R包并支持多样本比较分析 | 依赖特定平台输入格式，目前仅支持10x Genomics Visium HD平台数据 | 开发一个用户友好的空间转录组数据分析和可视化工具 | 空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 支持单个和多个样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium HD | 10x Visium HD空间转录组平台 |
| 71 | 2026-05-08 |
AJUBA: The Master Regulator Bridging EMT and Immune Evasion in Colorectal Cancer
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/7828477
PMID:41814682
|
研究论文 | 本研究鉴定AJUBA为连接结直肠癌上皮间质转化与免疫逃逸的关键调控因子 | 首次阐明AJUBA在结直肠癌中同时调控EMT与免疫微环境的双重作用机制，并通过空间转录组学揭示其与癌症相关成纤维细胞在免疫排斥微环境中的共定位 | 研究主要依赖公开数据集和相对有限的样本量（90例），需更大规模前瞻性队列验证；AJUBA上游调控机制尚未完全阐明 | 探索连接结直肠癌上皮间质转化与免疫调控的分子机制 | 结直肠癌患者肿瘤组织及细胞样本 | 机器学习, 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, qPCR, Western blot, 免疫组化 | 机器学习, 深度学习 | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据, 临床病理数据 | 90例结直肠癌患者样本（用于mRNA和蛋白验证）及多个公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 72 | 2026-05-08 |
Luteolin Disrupts Keratinocyte-Dendritic Cell Communication in Psoriasis by Targeting Rh Family C Glycoprotein
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/9564209
PMID:41814938
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研究论文 | 木犀草素通过靶向Rh家族C糖蛋白破坏银屑病中角质形成细胞与树突状细胞的通讯 | 首次发现木犀草素直接靶向RHCG蛋白，并通过多模式作用（包括抑制CXCL14分泌和恢复桥粒蛋白表达）破坏角质形成细胞与树突状细胞的通讯，结合空间转录组学揭示其调控组织微环境的新机制 | 未明确提及 | 探究木犀草素在银屑病中通过靶向RHCG破坏角质形成细胞与树突状细胞通讯的作用机制 | 银屑病患者的角质形成细胞与树突状细胞互作模型 | 数字病理学 | 银屑病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 73 | 2026-05-08 |
Single-Cell Sequencing Data Revealed Mechanisms of Interactions Between Tumor Cells and Cancer-Associated Fibroblasts in Metastatic Colorectal Cancer
2026, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/bmri/8830690
PMID:41823347
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research paper | 通过单细胞测序数据揭示转移性结直肠癌中肿瘤细胞与癌相关成纤维细胞的相互作用机制，并构建预后模型 | 首次利用单细胞数据鉴定了转移性和原发性结直肠癌中的特征细胞亚群，并基于肿瘤细胞与CAF之间的互作基因构建了预后模型，为理解结直肠癌转移机制提供了新视角 | 未明确指出局限性，但可能存在数据集来源有限、模型外部验证不足等潜在问题 | 研究结直肠癌转移中肿瘤细胞与微环境成分的相互作用及其对患者预后的影响 | 转移性和原发性结直肠癌患者 | machine learning | colorectal cancer | 单细胞测序 | Cox比例风险模型 | 单细胞转录组数据 | GSE225857（转移性患者）和GSE166555（非转移性患者）两个数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2026-05-08 |
Low PTGDS Expression Facilitates HNSCC by Suppressing Programmed Cell Death and Reducing B Cell-Mediated Immune Responses
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/4521847
PMID:41866775
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研究论文 | 研究了低表达的前列腺素D2合成酶（PTGDS）如何通过抑制程序性细胞死亡和减少B细胞介导的免疫反应促进头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）进展 | 首次揭示PTGDS作为连接成纤维细胞介导的程序性细胞死亡抵抗和B细胞免疫调节的关键调控因子，并阐明其通过上调CXCL13增强免疫浸润的机制 | 未明确说明研究局限性 | 探索癌症相关成纤维细胞在HNSCC中导致程序性细胞死亡抵抗的机制 | 头颈部鳞状细胞癌样本及癌症相关成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞测序、空间转录组学、Seurat聚类、Monocle2伪时间轨迹分析、随机森林算法、ssGSEA、CIBERSORT、功能获得实验、Western blotting、免疫组化 | 随机森林 | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、TCGA转录组数据 | 24例单细胞测序样本及TCGA和空间转录组数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序、10x Visium空间转录组学 |
| 75 | 2026-05-08 |
CFMF: A Clustering-Free Cell Marker Finder for Single-Cell Transcriptomic Data
2026 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70065
PMID:41911006
|
研究论文 | 开发了一种无需细胞聚类的单细胞转录组数据细胞标志物发现方法CFMF | 提出无需细胞聚类的标志基因发现框架，避免了传统方法中参数选择的非平凡性和主观性，能够发现稀有细胞类型且对低丰度细胞具有高灵敏度 | 未提及，但可能依赖高质量单细胞数据且验证数据集规模有限 | 开发无需聚类的细胞标志物发现方法，分析肿瘤异质性和复杂生物系统 | 单细胞RNA测序数据中的细胞标志物 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | PBMC3K数据集、多形性胶质母细胞瘤数据集、人正常肺scRNA-seq数据集、结直肠癌scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2026-05-08 |
Screening macrophage polarization genes in spinal cord injury as therapeutic targets
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0347599
PMID:42081466
|
研究论文 | 筛选脊髓损伤中巨噬细胞极化基因作为治疗靶点 | 首次鉴定Soat1、Comt和Myo1f三个与巨噬细胞极化相关的关键基因在脊髓损伤中的诊断和治疗潜力，并结合机器学习算法和单细胞RNA测序进行多维验证 | 研究主要在动物模型和生物信息学分析基础上进行，缺少临床样本的大规模验证 | 探索巨噬细胞极化相关基因在脊髓损伤中的诊断、预后和治疗潜力 | 脊髓损伤样本中的巨噬细胞极化相关基因 | 机器学习 | 脊髓损伤 | RNA测序，单细胞RNA测序，RT-qPCR | LASSO，随机森林，XGBoost | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 77 | 2026-05-08 |
Integrating multi-omics and machine learning to decipher the molecular pathways of bisphenol a-associated lactylation-related genes driving bladder cancer
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0347134
PMID:42085381
|
研究论文 | 通过整合多组学数据和机器学习方法，系统研究双酚A相关的乳酸化修饰基因在膀胱癌中的分子机制 | 首次将毒理基因组学与乳酸化相关基因集结合，通过多组学整合和机器学习筛选出4个BPA-乳酸化关联候选基因 | 未提及具体局限性 | 利用毒理基因组学框架系统解析双酚A暴露通过乳酸化修饰驱动膀胱癌的分子通路 | 膀胱癌相关基因及双酚A-乳酸化关联候选基因（ENO1、WBP11、GTF2F1、SPR） | 机器学习 | 膀胱癌 | NA | LASSO、SVM、随机森林 | 多组学数据（基因表达、单细胞转录组、蛋白质组） | NA | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2026-05-08 |
[Comprehensive characterization of primary ciliated cells in inflammatory skin diseases]
2026, Nihon yakurigaku zasshi. Folia pharmacologica Japonica
DOI:10.1254/fpj.25073
PMID:42091477
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研究论文 | 综合表征炎性皮肤病中的初级纤毛细胞及其功能作用 | 通过结合免疫荧光染色和空间转录组学（Visium HD），首次揭示特应性皮炎和银屑病中纤毛细胞显著增加，且光疗后仍保持较高数量，并发现其保留未分化角质形成细胞特征并上调代谢、细胞周期和信号通路 | 未明确提及，但可能包括样本量有限或功能验证不足 | 探究初级纤毛在炎性皮肤病中的作用及其潜在治疗策略 | 健康皮肤、特应性皮炎和银屑病病变组织 | 数字病理学 | 皮炎, 银屑病 | 空间转录组学, 免疫荧光染色 | NA | 图像, 转录组数据 | 健康皮肤、特应性皮炎和银屑病病变样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | 10x Genomics Visium HD 空间转录组学平台，提供单细胞级空间分辨率 |
| 79 | 2026-05-08 |
Salidroside and Hongjingtian Injection Inhibit the Onset and Progression of Asthma via Pyroptosis in the Ozone-Exposed Inflammation Environment
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/9618148
PMID:42093379
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研究论文 | 通过网络毒理学、RNA-seq和多组学方法，研究红景天苷和红景天注射液通过焦亡途径抑制臭氧暴露炎症环境下哮喘的起始和进展 | 首次通过网络毒理学和转录组学分析识别臭氧相关的焦亡基因，并利用多组学方法和动物模型验证红景天苷及其类似物通过靶向GSDMD抑制臭氧诱导的哮喘加重 | NA（标题和摘要未提及） | 识别臭氧相关的焦亡基因，探讨其在哮喘中的作用，并筛选靶向这些基因的中药成分以治疗臭氧暴露下的哮喘 | 臭氧暴露下的哮喘动物模型及哮喘组织样本 | 机器学习 | 哮喘 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 网络毒理学, 网络药理学, 分子对接, 分子聚类 | 机器学习（用于诊断预测） | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、动物模型实验数据 | 多份哮喘组织样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2026-05-08 |
Insights gained from single-cell sequencing analysis of ischemic stroke
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1784660
PMID:42093724
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review | 本文综述了基于单细胞RNA测序技术的缺血性中风研究，总结了细胞类型、异质性、相互作用及技术进展 | 系统整理了22种脑细胞类型和7种血细胞类型，总结了13种频繁报道的细胞类型的异质性研究，并探讨了免疫细胞与非免疫细胞的相互作用 | 未明确提及具体局限性，但隐含单细胞测序分析虽然名为“单细胞”，实际上整合了数千个细胞的信息，可能忽略个体细胞变异 | 总结单细胞RNA测序在缺血性中风研究中的应用，提供新靶点和生物标志物的见解 | 缺血性中风相关的脑细胞和血细胞 | machine learning | cardiovascular disease | single-cell RNA sequencing | NA | gene expression data | 超过50项研究 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |