单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1234 篇文献，本页显示第 761 - 780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2026-01-17 |
Transient ER stress cell-autonomously promotes beta cell cycling in mice
2026-Jan-15, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06649-3
PMID:41537777
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型发现，短暂的内质网应激可自主促进β细胞增殖，为糖尿病治疗提供了新的潜在策略 | 首次揭示了转基因过表达、内质网应激、葡萄糖与β细胞周期激活之间的关联，并证明短暂内质网应激可独立于血管恢复促进β细胞增殖 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；且内质网应激诱导的长期效应和安全性仍需进一步评估 | 探究内分泌胰腺实验性低血管化恢复是否能触发小鼠β细胞增殖 | 转基因小鼠模型中的胰腺β细胞 | 糖尿病研究 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序，定量RT-PCR，免疫染色，BrdU/Edu标记 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据，图像数据 | 未明确指定样本数量，但使用了转基因小鼠模型和体外胰岛实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 762 | 2026-01-17 |
Single-cell atlas of axial skeletal immune-matrix interaction in spondylitis
2026-Jan-15, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-025-09743-1
PMID:41537924
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术，构建了强直性脊柱炎患者中轴骨骼的免疫-基质相互作用图谱，揭示了致病性细胞毒性T淋巴细胞与基质成纤维细胞之间的相互作用轴 | 首次在强直性脊柱炎患者的中轴骨骼组织中，通过整合单细胞RNA-seq和ATAC-seq技术，在空间和基质背景下解析了细胞毒性T淋巴细胞与骨基质微环境的原位相互作用 | 研究样本来源于手术患者，可能无法完全代表疾病早期阶段；研究为横断面设计，因果关系需进一步验证 | 解析强直性脊柱炎中轴骨骼受累的免疫-基质相互作用机制 | 强直性脊柱炎患者和年龄匹配对照者的中轴骨骼组织（椎体骨髓、附着点纤维软骨、邻近终板基质组织） | 单细胞多组学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 整合聚类分析、差异基因表达分析、染色质可及性分析、拟时序轨迹分析、配体-受体网络推断 | 单细胞转录组数据、单细胞表观基因组数据 | 24名活动性强直性脊柱炎患者和12名年龄匹配对照者，共108,752个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 763 | 2026-01-17 |
Subventricular zone radial glial cells maintain inhibitory neuron production in the human brain
2026-Jan-15, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adw1803
PMID:41538440
|
研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组学分析人脑中内侧神经节隆起，揭示了抑制性神经元生成的进化独特性机制 | 发现了人脑室下区存在一种进化上独特的放射状胶质细胞祖细胞类型，该细胞在整个大脑发育过程中持续产生抑制性神经元和胶质细胞 | NA | 探究人类抑制性神经元生成的机制及其在脑进化中的独特性 | 人脑中内侧神经节隆起（hMGE）及其衍生的细胞 | 单细胞组学 | NA | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 764 | 2026-01-17 |
Targeting the CMKLR1-Mediated Signaling Rebalances Immunometabolism State in Middle-Age Testicular Macrophages
2026-Jan-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202515166
PMID:41538650
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CMKLR1介导的巨噬细胞代谢重编程在中年睾丸免疫代谢失衡中的作用，并验证了CMKLR1作为治疗靶点 | 首次在人和小鼠睾丸中鉴定出保守的CD206MHCII巨噬细胞亚群，并发现CMKLR1介导的代谢重编程导致其向糖酵解和促炎状态转变，进而损害精子发生 | NA | 探究脂肪介导的信号如何与局部睾丸免疫相互作用，以及CMKLR1在调节睾丸免疫代谢平衡中的作用 | 人和小鼠的睾丸组织，特别是其中的巨噬细胞亚群 | NA | 男性性腺功能减退症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 765 | 2026-01-17 |
DPM: A Deep Learning and Optimal Transport Framework for Cost-Effective Spatial Metabolomics
2026-Jan-15, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c06903
PMID:41538726
|
研究论文 | 本文提出了一种基于深度学习与最优传输理论的框架DPM，用于从相邻切片数据中准确预测空间代谢组学中代谢物的空间分布 | 首次将最优传输理论引入空间代谢组学数据预测，提出了一种优化的映射策略，在配准和预测精度上超越了传统的基于特征相似性的方法 | NA | 开发一种成本效益高的空间代谢组学数据预测方法，以降低高分辨率、多切片质谱成像的高昂成本 | 组织切片中的空间代谢物分布 | 空间代谢组学 | NA | 质谱成像（MSI） | 深度学习 | 图像 | NA | NA | 空间代谢组学 | NA | NA |
| 766 | 2026-01-17 |
Combined inhibition of FACT and BET disrupts transcription to suppress tumor growth in mouse models of diffuse midline glioma
2026-Jan-14, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adr1557
PMID:41533777
|
研究论文 | 本研究探索了联合抑制FACT和BET蛋白在治疗弥漫性中线胶质瘤中的疗效和机制 | 首次提出并验证了联合靶向FACT和BET蛋白在DMG中的协同治疗效果，揭示了其通过诱导转录崩溃和激活免疫反应的双重作用机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外培养，临床转化效果尚需进一步验证 | 开发针对弥漫性中线胶质瘤的新型联合治疗策略 | 弥漫性中线胶质瘤细胞、小鼠异种移植模型 | 肿瘤生物学 | 弥漫性中线胶质瘤 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据、表观遗传数据 | 三个独立的患者来源异种移植模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 767 | 2026-01-17 |
Analysis Camellia sinensis var. sinensis cv. Fuding Dabaicha genome unveils structural variation-driven metabolic innovation
2026-Jan-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68463-8
PMID:41535305
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序结合PacBio HiFi和ONT超长测序技术，构建了福鼎大白茶的单倍型解析基因组，揭示了结构变异如何驱动茶叶代谢多样性 | 首次利用单细胞测序技术对茶树精子细胞进行测序，结合长读长测序实现高精度单倍型解析基因组组装，并建立了基于半同胞的QTL定位平台 | 研究主要聚焦于福鼎大白茶品种，结果可能不直接适用于其他茶树品种，且样本量相对有限 | 探究茶树基因组结构变异与代谢多样性之间的关联 | 茶树（Camellia sinensis var. sinensis cv. Fuding Dabaicha） | 基因组学 | NA | 单细胞测序, PacBio HiFi测序, ONT超长测序 | NA | 基因组序列数据 | 107个精子细胞 | PacBio, Oxford Nanopore Technologies | 单细胞测序, 长读长测序 | PacBio HiFi, ONT | PacBio HiFi测序和Oxford Nanopore Technologies超长测序技术 |
| 768 | 2026-01-17 |
The circ_0042103/TAF15/NER axis regulates inflammation and DNA damage in pulpitis
2026-Jan-13, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04817-1
PMID:41530875
|
研究论文 | 本研究探讨了环状RNA circ_0042103通过结合TAF15蛋白，降低NER修复蛋白ERCC1和PCNA水平，从而增加DNA损伤和炎症，在牙髓炎进展中形成circ_0042103/TAF15/NER轴的作用机制 | 首次揭示了circ_0042103/TAF15/NER轴在牙髓炎中的调控作用，阐明了环状RNA通过影响DNA损伤修复通路加剧炎症的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证；样本量较小，临床相关性需进一步确认 | 探究环状RNA在牙髓炎进展中的功能及其调控DNA损伤和炎症的分子机制 | 炎症牙髓组织、人牙髓干细胞（hDPSCs） | 分子生物学 | 牙髓炎 | 微阵列、单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blot、生物信息学分析、RNA FISH、pull-down实验、核质分离实验 | NA | RNA测序数据、基因表达数据、蛋白质印迹数据 | 未明确具体样本数量，涉及炎症牙髓组织和hDPSCs细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 769 | 2026-01-17 |
Fibroblast-derived alarmin promotes oral wound healing by activating regulatory T cells that relay pro-angiogenic and anti-inflammatory responses
2026-Jan-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116829
PMID:41533514
|
研究论文 | 本研究揭示了口腔成纤维细胞通过分泌警报素IL-33激活调节性T细胞，从而促进血管生成和抗炎反应，加速口腔伤口愈合的机制 | 首次在小鼠口腔损伤模型中鉴定出PI16网状成纤维细胞富含IL-33，并证明其通过激活Treg细胞分泌MIF和TGF-β1来调控伤口愈合过程 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限，且具体信号通路细节有待进一步阐明 | 探究成纤维细胞在口腔伤口愈合中的免疫调节功能及其分子机制 | 小鼠口腔损伤模型、人类口腔黏膜组织 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 770 | 2026-01-17 |
Differentiation in the human urothelia is defined by distinct alternative polyadenylation
2026-Jan-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116839
PMID:41533515
|
研究论文 | 本研究揭示了在人类尿路上皮分化过程中，选择性多聚腺苷酸化（APA）是转录组多样性的主要来源，独立于mRNA水平变化 | 首次在人类尿路上皮分化中系统性地将APA与细胞状态特异性转录组多样性联系起来，并通过单细胞成像和报告基因实验验证了APA对蛋白质表达的调控作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，APA事件的直接功能验证和具体分子机制仍需进一步探索 | 探究人类尿路上皮分化过程中转录组多样性的生成机制 | 人类输尿管尿路上皮细胞，包括基底祖细胞、中间细胞和终末分化的伞状细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞成像，报告基因实验 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 13,544个尿路上皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 771 | 2026-01-17 |
A brain-driven neural circuit contributes to tissue regeneration in joint cartilage
2026-Jan-13, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.004
PMID:41535204
|
研究论文 | 本文通过多学科方法揭示了大脑通过神经回路调控关节软骨再生的机制 | 首次实验证实大脑通过特定神经回路（PVNCRH神经元至交感神经）调控组织再生，并识别了ADRB2受体在其中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和人类关节软骨外植体，临床转化需进一步验证 | 探究大脑是否及如何调控组织再生，以关节软骨为例 | 人类骨关节炎患者和小鼠模型的关节软骨组织 | 神经科学 | 骨关节炎 | 磁共振成像、多突触逆行追踪、化学遗传学/光遗传学操作、单细胞RNA测序 | NA | 图像、序列数据 | 人类患者和小鼠模型，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 772 | 2026-01-17 |
Prenatal glucocorticoids exposure disrupts maturation of a cluster of microglia, causing poor social memory and more repetitive behaviors
2026-Jan-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116820
PMID:41538329
|
研究论文 | 本研究揭示了产前糖皮质激素暴露通过破坏MRC1小胶质细胞的成熟，导致后代出现社交记忆缺陷和重复行为增加的机制 | 首次发现产前糖皮质激素暴露会特异性导致MRC1小胶质细胞成熟停滞，并鉴定出F13a1作为关键调控因子和潜在治疗靶点 | 研究主要基于动物模型，人类样本证据仅来自脐带血检测，需要进一步临床验证 | 探究产前糖皮质激素暴露导致自闭症谱系障碍风险的分子机制 | 产前暴露于地塞米松的后代大鼠及其海马组织、人类脐带血样本 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | 动物行为学模型 | 基因表达数据、行为学数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及大鼠后代和人类脐带血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 773 | 2026-01-17 |
RAS/MEK/PI3K pathway inhibition augments response to CD40 agonism by targeting CD11b+ Bregs thereby overcoming melanoma PD1-resistance
2026-Jan-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67315-1
PMID:41526341
|
研究论文 | 本研究探讨了通过联合RAS/MEK/PI3K通路抑制剂与CD40激动剂，靶向CD11b+ Bregs以克服黑色素瘤PD1耐药性的治疗策略 | 首次揭示RAS/MEK/PI3K通路抑制剂能抑制CD40激动剂诱导的CD11b+ PD-L1 Bregs，从而增强CD8 T细胞介导的肿瘤杀伤，为ICB耐药黑色素瘤提供新治疗选择 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证；样本量有限，未涵盖所有黑色素瘤亚型 | 开发针对ICB耐药BRAF/NRAS突变黑色素瘤的有效二线治疗方案 | BRAF/NRAS突变黑色素瘤肿瘤细胞、CD11b+ Bregs、CD8 T细胞 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | scRNA-Seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | C57BL/6小鼠模型及患者样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 774 | 2026-01-17 |
The non-metabolic role of MTHFD2 in regulating mitochondrial fission-dependent mitophagy via stabilizing TOP2A mRNA in glioblastoma
2026-Jan-12, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究揭示了代谢酶MTHFD2在胶质母细胞瘤中通过稳定TOP2A mRNA来调控线粒体分裂依赖性线粒体自噬的非代谢功能 | 首次发现代谢酶MTHFD2具有RNA结合功能，能直接结合并稳定TOP2A mRNA，从而调控线粒体分裂和线粒体自噬，这超出了其已知的代谢功能 | NA | 探究MTHFD2在胶质母细胞瘤中是否具有调控线粒体完整性和动力学的非代谢功能 | 胶质母细胞瘤细胞及原位小鼠模型 | 分子生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，mt-Keima线粒体自噬流测定，RNA免疫沉淀测序，荧光素酶报告基因检测 | NA | RNA测序数据，荧光信号数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 775 | 2026-01-17 |
GCLSC: Single-cell clustering model based on graph contrastive learning
2026-Jan-11, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种基于图对比学习的单细胞聚类模型GCLSC，用于解决单细胞RNA测序数据的高维、稀疏和技术噪声带来的聚类挑战 | 首次将图Transformer与图注意力网络（GAT）结合，共同建模局部细胞相互作用和全局拓扑依赖关系，并采用四种数据增强策略提升模型鲁棒性 | 未明确说明模型在超大规模数据集上的计算效率，也未讨论对特定技术批次效应的专门处理策略 | 开发一种能够有效处理单细胞RNA测序数据高维稀疏特性的鲁棒聚类方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 图对比学习模型（结合Graph Transformer和GAT） | 单细胞基因表达数据 | 九个真实世界scRNA-seq数据集（具体样本数未说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 776 | 2026-01-17 |
3D culture reveals dual role of ICAM-1 in mediating tissue-specific human MSC spheroid formation & enhanced immunomodulation
2026-Jan-09, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本研究探讨了3D培养对骨髓和胎盘来源间充质干细胞免疫调节能力的影响，揭示了ICAM-1在球体形成和免疫调节中的双重作用 | 首次通过3D培养系统比较不同来源MSCs的免疫调节差异，并识别ICAM-1在球体形成和免疫增强中的关键机制 | 研究主要基于体外实验，体内验证有限；样本来源和数量可能影响结论的普适性 | 评估3D培养对人间充质干细胞免疫调节能力的影响，并阐明其分子机制 | 骨髓来源和胎盘来源的人间充质干细胞 | 细胞生物学 | NA | qPCR, 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 两种来源的MSCs（骨髓和胎盘） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 777 | 2026-01-17 |
Curriculum-guided divergence scheduling improves single-cell clustering robustness
2026-Jan-09, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.neunet.2026.108592
PMID:41534329
|
研究论文 | 本文提出了一种名为DAGCL的动态图嵌入框架，通过课程学习引导的调度机制，提高了单细胞RNA-seq数据聚类的鲁棒性 | 提出动态注意力增强图嵌入框架，将表示学习重构为从粗到细的进化过程，采用课程引导的调度机制动态调节注意力强度和监督严格度 | 未在摘要中明确说明 | 提高单细胞RNA-seq数据深度聚类的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 动态图嵌入框架（DAGCL） | 基因表达数据 | 27个基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 778 | 2026-01-17 |
Adaptive multi-view information bottleneck for multi-omics data clustering
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf717
PMID:41527852
|
研究论文 | 本文提出了一种基于信息瓶颈原理的自适应多视图聚类框架（scAMVIB），用于解决多组学数据聚类任务 | 利用信息瓶颈原理学习多视图组学表示，同时捕获组学间关联和组学特定模式，并通过自适应权重分配优化聚类性能 | NA | 解决多组学数据聚类中互补信息有效整合与权重分配的挑战 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 自适应多视图信息瓶颈框架 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学 | NA | NA |
| 779 | 2026-01-17 |
CSRefiner: a lightweight framework for fine-tuning cell segmentation models with small datasets
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf718
PMID:41527855
|
研究论文 | 本文提出了一个名为CSRefiner的轻量级框架，用于在小数据集上微调细胞分割模型，以提升全组织单细胞空间表达分析的精度 | CSRefiner是一个轻量级且高效的微调框架，支持微调空间组学领域广泛使用的分割模型，并能在标注数据非常有限的情况下实现高精度，同时兼容多种主流模型 | 未在摘要中明确说明 | 解决现有微调方法通常需要大量重新训练或局限于特定模型架构的问题，为实际应用中的全组织单细胞空间表达分析提供一种实用解决方案 | 细胞分割模型 | 数字病理学 | NA | 空间组学技术 | 深度学习分割模型 | 图像（核或膜染色图像） | 小数据集（具体数量未在摘要中说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 780 | 2026-01-17 |
Integrating single-cell and bulk transcriptomes identifies B cell features associated with neoadjuvant chemoradiotherapy sensitivity in rectal cancer
2026-Jan-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-31068-0
PMID:41484196
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，识别了与直肠癌新辅助放化疗敏感性相关的B细胞亚群及其特征基因 | 应用Scissor算法整合单细胞RNA-seq和批量转录组数据，首次在直肠癌中鉴定出与nCRT反应相关的特定B细胞亚群，并基于此开发了机器学习预测模型 | 研究样本量有限，验证队列仅64例样本，且未进行实验验证B细胞亚群的功能机制 | 探究B细胞在直肠癌新辅助放化疗反应中的作用，并开发预测模型 | 直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 直肠癌 | 单细胞RNA-seq，批量转录组测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 未明确总样本数，验证队列包含64例样本 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |