单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202601] [清除筛选条件]
当前共找到 1426 篇文献,本页显示第 741 - 760 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
741 2026-01-30
Tumor microenvironment differences between diagnostic and relapsed classic Hodgkin lymphoma revealed by scRNA-seq
2026-Jan-13, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了经典霍奇金淋巴瘤诊断时与复发时肿瘤微环境的差异,并发现早期复发样本中富含具有免疫抑制潜能的galectin-9阳性幼稚B细胞 首次在早期复发经典霍奇金淋巴瘤中发现并表征了一群具有免疫调节潜能的galectin-9阳性幼稚B细胞,揭示了其在塑造免疫抑制微环境中的作用 样本量相对有限,且研究主要基于观察性分析,功能验证有待进一步深入 探究经典霍奇金淋巴瘤诊断与复发时肿瘤微环境的差异,特别是非恶性B细胞在复发中的作用 配对诊断和复发经典霍奇金淋巴瘤样本中的肿瘤微环境细胞 单细胞组学 经典霍奇金淋巴瘤 单细胞RNA测序,成像质谱流式细胞术,免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据,空间蛋白质组数据 配对诊断和复发CHL样本,并在独立验证队列中确认 NA 单细胞RNA-seq,空间蛋白质组学 NA NA
742 2026-01-30
PCID2 is essential for spermatogonial differentiation by regulating alternative splicing
2026-Jan-13, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 本研究揭示了PCID2通过调控选择性剪接在精子发生中的关键作用 首次证明PCID2通过调控选择性剪接影响精原细胞分化,并鉴定出四个关键剪接靶基因 研究主要基于小鼠模型,人类中的生理功能尚需进一步验证 探究PCID2在精子发生中的生理功能及其分子机制 小鼠精原细胞及精子发生过程 生殖生物学 男性不育症 单细胞转录组测序、RNA测序、免疫沉淀质谱、共免疫沉淀、PCR 条件性基因敲除小鼠模型 转录组数据、蛋白质相互作用数据 Pcid2条件性敲除小鼠及其对照 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
743 2026-01-30
Single-Cell Transcriptomic Atlas of Chicken Ovarian Aging and Cancer Drives Prognostic Model Development
2026-Jan-13, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了母鸡卵巢衰老和癌症的转录组图谱,并基于共同失调基因构建了人类卵巢癌的预后模型 首次对母鸡卵巢癌进行单细胞RNA测序研究,并利用卵巢衰老和癌变过程中免疫细胞显著变化的216个基因构建了20基因预后模型 研究基于母鸡模型,其与人类卵巢癌的完全等效性需进一步验证,样本量相对有限 探索卵巢衰老与癌变之间的免疫相关联系,并开发人类卵巢癌的预后预测工具 母鸡的卵巢组织,包括正常年轻卵巢、正常老年卵巢和老年卵巢癌组织 单细胞转录组学 卵巢癌 单细胞RNA测序 LASSO回归模型 单细胞转录组数据 三个母鸡组:35周龄正常卵巢、110周龄正常卵巢、110周龄卵巢癌组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
744 2026-01-30
Multi-Omics Evidence Linking Depression to MASLD Risk via Inflammatory Immune Signaling
2026-Jan-13, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合流行病学、遗传学、转录组学和单细胞RNA测序数据,提供了多组学证据,表明抑郁症通过炎症介导的免疫信号通路对代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)风险产生因果影响 首次采用多水平整合分析策略(流行病学、孟德尔随机化、转录组共表达网络、机器学习、单细胞测序)系统验证了抑郁症通过炎症免疫信号增加MASLD风险的因果通路,并识别出CCR1-CCL5轴作为潜在的性别特异性免疫机制 研究结果的稳定性受限于样本量,尤其是在单细胞数据分析部分 探索抑郁症是否增加MASLD风险,以及炎症是否介导这一效应 抑郁症与代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD) 生物信息学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 单细胞RNA测序, GWAS, 转录组分析, 孟德尔随机化, 机器学习 机器学习, 加权基因共表达网络分析 流行病学数据, 遗传数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 基于NHANES、GWAS、GEO和单细胞RNA测序数据集的多源数据,具体样本量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 转录组学 NA NA
745 2026-01-30
Cancer-Associated Fibroblast Heterogeneity Shapes Prognosis and Immune Landscapes in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2026-Jan-09, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了头颈部鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞的异质性,并评估了其与患者预后和免疫微环境的关系 首次在头颈部鳞状细胞癌中系统鉴定出6个CAF亚群,并发现炎症性CAF亚群相关的转录程序是患者生存的稳健标志物 进展无生存期预测显示出较大的队列依赖性,需要更多独立队列验证 表征CAF异质性并评估CAF亚群特异性转录程序的预后意义 头颈部鳞状细胞癌患者肿瘤样本 单细胞组学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 预后风险模型 单细胞RNA测序数据,bulk RNA测序数据 TCGA HNSCC队列及独立验证数据集 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
746 2026-01-30
Machine Learning Identifies Key Cells and Therapeutic Targets in Intervertebral Disc Degeneration: SASP-Driven Matrix Catabolism, Inflammation Amplification, and Metabolic Collapse
2026-Jan-07, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,揭示了衰老相关分泌表型(SASP)在椎间盘退变(IVDD)进展中的作用,并识别出BMP2和MMP3作为核心调控靶点 整合单细胞RNA测序与批量RNA-seq数据,利用WGCNA和机器学习算法(LASSO、随机森林、Boruta)识别出BMP2和MMP3作为SASP信号的核心调控网络,并开发了基于这两个基因的SASP评分模型,同时通过药物筛选发现辛伐他汀作为BMP2/MMP3的双重抑制剂 研究主要基于转录组数据,可能未涵盖所有分子机制;动物模型的结果需在人类中进一步验证 探究椎间盘退变的细胞和分子机制,特别是SASP信号的作用,并寻找潜在治疗靶点 椎间盘退变(IVDD)中的髓核细胞(NPCs)亚型 机器学习 椎间盘退变 单细胞RNA测序,批量RNA-seq LASSO,随机森林,Boruta 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
747 2026-01-30
Integrated Single-Cell and Bulk Transcriptomics Unveils Immune Profiles in Chick Erythroid Cells upon Avian Pathogenic Escherichia coli Infection
2026-Jan-07, Animals : an open access journal from MDPI IF:2.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组学技术,揭示了鸡红细胞在禽致病性大肠杆菌感染下的免疫特征和亚群异质性 首次在单细胞分辨率下系统描绘了鸡红细胞在感染状态下的免疫异质性,并识别了关键的免疫相关基因和转录因子调控网络 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平的功能验证;样本量相对有限;未深入探究不同亚群在免疫应答中的具体功能机制 探究鸡红细胞在禽致病性大肠杆菌感染下的免疫特征和细胞异质性 鸡红细胞 单细胞组学 禽致病性大肠杆菌感染 单细胞RNA测序 无监督聚类、伪时间分析、SCENIC分析 单细胞转录组数据、批量转录组数据 未明确说明具体样本数量,但包含感染组和对照组 NA 单细胞RNA-seq NA NA
748 2026-01-30
Plant bZIPs in Root Environmental Adaptation: From Single-Cell Expression Atlas to Functional Insights
2026-Jan-06, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文综述了植物bZIP转录因子在根环境适应中的作用,结合单细胞表达图谱与功能遗传学,揭示了其调控机制及在培育气候适应性作物中的潜力 通过整合单细胞RNA测序技术,构建了根bZIPs的高分辨率表达图谱,并结合功能遗传学阐明了其在环境信号响应中的调控模块 NA 探讨植物bZIP转录因子在根环境适应中的调控功能及其在作物改良中的应用潜力 植物根中的bZIP转录因子及其在单细胞水平上的表达模式 植物生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
749 2026-01-30
Chronic Kidney Disease in Metabolic Disease: Regulation of SGLT2 and Transcriptomic-Epigenetic Effects of Its Pharmacological Inhibition
2026-Jan-06, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文综述了SGLT2在健康和代谢疾病中的表达与调控,以及SGLT2抑制剂在转录组和表观遗传层面的药理作用 整合了单细胞RNA测序数据,首次在人类中揭示了SGLT2抑制剂与肾小管代谢重编程及mTORC1抑制的关联 分子机制尚未完全阐明,且人类数据有限,主要依赖动物模型研究 探讨SGLT2在代谢疾病相关慢性肾病中的调控机制及其抑制剂的分子作用 SGLT2的表达调控、SGLT2抑制剂的转录组与表观遗传效应 NA 慢性肾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
750 2026-01-30
Linking Skin and Joint Inflammation in Psoriatic Arthritis through Shared CD8+ T Cell Clones
2026-Jan, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了银屑病关节炎中皮肤和关节炎症通过共享CD8+ T细胞克隆相连的机制 首次在银屑病关节炎中结合单细胞RNA测序和空间转录组学,系统比较皮肤和关节中CD8+ T细胞的表型、克隆性和细胞微环境,发现共享的T细胞克隆 样本量较小(n=6皮肤样本,n=5配对滑膜组织/滑液样本),空间转录组学数据仅来自一个配对样本和四个非配对样本,可能限制统计普适性 验证银屑病关节炎中皮肤和关节炎症在CD8+ T细胞表型和克隆性上是否相连 银屑病关节炎患者的皮肤、滑膜组织和滑液样本中的T细胞 单细胞组学 银屑病关节炎 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 6个皮肤样本,5个配对滑膜组织样本,5个配对滑液样本,1个配对皮肤和滑膜活检样本,4个非配对活检样本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
751 2026-01-30
Monocyte-Derived Macrophages-Synovial Fibroblasts Crosstalk Unravels Oncostatin Signaling Network as a Driver of Synovitis in Osteoarthritis
2026-Jan, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示了骨关节炎中单核细胞来源巨噬细胞与滑膜成纤维细胞间的相互作用,并识别出Oncostatin M信号网络作为滑膜炎的关键驱动因素 识别了骨关节炎中三种具有不同基因特征和来源的巨噬细胞亚群,并首次将OSM/OSMR信号轴确定为招募巨噬细胞与成纤维细胞间交流的核心机制 研究样本量有限,仅包括小鼠模型和四名OA患者,且主要基于胶原酶诱导的OA模型,可能无法完全代表人类OA的复杂性 探究骨关节炎中巨噬细胞的异质性、起源、命运及其与基质微环境细胞的通讯网络 小鼠胶原酶诱导的OA模型中的滑膜细胞以及四名OA患者的CD14+巨噬细胞 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序,流式细胞术,遗传命运图谱,成像质谱流式细胞术 NA 单细胞转录组数据,图像数据 小鼠OA模型及四名OA患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
752 2026-01-30
A Single-Cell-Inspired Self-Enrichment Therapeutic Strategy Delays Intervertebral Disc Degeneration by Inhibiting Pyroptosis
2026-Jan, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
研究论文 本研究整合单细胞转录组学与临床验证,构建了椎间盘退变(IVDD)的全面细胞图谱,并开发了一种自富集纳米载体以靶向抑制细胞焦亡,从而延缓IVDD进展 结合单细胞测序发现纤维化屏障和STING介导的细胞焦亡关键机制,并创新性地设计了一种能催化过氧化氢产生不对称气泡推进、选择性穿透退变组织的自富集纳米载体 NA 阐明椎间盘退变的关键病理机制并开发靶向治疗策略 椎间盘退变组织、髓核细胞 数字病理学 椎间盘退行性疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
753 2026-01-30
Endothelial Heterogeneity in Pulmonary Hypertension
2026-Jan, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
综述 本文综述了单细胞RNA测序揭示的肺内皮细胞异质性在肺动脉高压发病机制中的作用及靶向治疗策略 整合前沿技术探讨内皮异质性如何塑造肺动脉高压的疾病轨迹,为靶向内皮功能障碍的新型治疗策略开辟新途径 NA 阐明肺内皮细胞异质性在肺动脉高压血管重构中的作用机制并探索治疗新靶点 肺内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
754 2026-01-30
A low-level Cdkn1c/p57kip2 expression in spinal progenitors drives the transition from proliferative to neurogenic modes of division
2026-Jan, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA-seq数据,揭示了细胞周期调节因子Cdkn1c在脊椎动物神经发生中调控从增殖性到神经源性分裂转变的关键作用 发现Cdkn1c在神经源性祖细胞中以低水平表达启动,并作为神经发生转变的双重驱动因子,其低表达控制祖细胞进入神经源性分裂模式,而高表达则介导子细胞周期退出 研究主要基于鸡胚胎神经管数据,可能需在其他脊椎动物模型中验证普遍性 探究脊椎动物神经发生过程中从对称增殖性到不对称神经源性分裂转变的调控机制 鸡胚胎神经管中的神经祖细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA-seq NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
755 2026-01-30
Single-Cell Transcriptome Meta-Analysis Reveals Epigenomic and Chromatin Dysregulation in Developing Neurons Derived From Human ESCs With 1q21.1 CNVs
2026-Jan, Autism research : official journal of the International Society for Autism Research IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组元分析,揭示了人类胚胎干细胞中1q21.1拷贝数变异导致发育神经元表观基因组和染色质失调的分子机制 首次在单细胞分辨率下,结合公共数据和内部疾病模型数据,通过元分析识别了与神经精神疾病相关的调控模块,并发现BPTF作为潜在治疗靶点 研究主要基于体外模型(如脑类器官),可能无法完全模拟体内神经发育的复杂性 阐明复杂人类神经精神疾病的分子基础,特别是1q21.1拷贝数变异对神经元发育的影响 来自人类胚胎干细胞模型的发育神经元,重点关注1q21.1区域拷贝数变异 单细胞组学 自闭症谱系障碍、双相情感障碍、精神分裂症 单细胞转录组分析 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
756 2026-01-30
Exploring leaf variegation in Arabidopsis yellow variegated2 by single-cell RNA sequencing
2026-Jan, The Plant journal : for cell and molecular biology
研究论文 本研究首次利用单细胞RNA测序技术探索拟南芥yellow variegated2突变体的叶片杂色现象,揭示了FtsH8基因的斑块表达模式及其与叶绿体命运、活性氧调控和细胞周期的关联 首次在单细胞水平应用scRNA-seq研究叶片杂色,证实了FtsH8的斑块表达支持阈值模型,并揭示了白色区域形成通过抑制光合基因减少活性氧以促进细胞周期进展的新机制 研究仅针对拟南芥var2突变体,结果可能不直接适用于其他植物或杂色类型,且scRNA-seq技术本身存在捕获效率和基因检测灵敏度的限制 探究拟南芥叶片杂色现象的细胞分子机制,特别是遗传相同细胞表现型差异的原因 拟南芥yellow variegated2 (var2)突变体的叶片细胞 植物生物学 NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
757 2026-01-30
Learning collective multicellular dynamics with an interacting mean field neural SDE model
2026-Jan, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为scIMF的单细胞深度生成交互平均场模型,用于从时序单细胞RNA测序数据中学习集体多细胞动力学 利用McKean-Vlasov随机微分方程框架,结合细胞级注意力机制,首次在单细胞水平上建模非局部和非对称的细胞间相互作用 未明确说明模型在处理极大规模细胞群体时的计算效率,也未讨论对特定细胞类型相互作用的验证方法 开发能够整合细胞间相互作用的动态模型,以研究异质性多细胞系统的集体行为 时序单细胞RNA测序数据中的多细胞系统 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度生成模型、随机微分方程、注意力机制 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
758 2026-01-29
IgA-Producing B Cells Exert Regulatory Function Through Granzyme B in Kidney Allograft Tolerance
2026-Jan-27, Kidney360 IF:3.2Q1
研究论文 本研究探讨了IgA+ B细胞通过Granzyme B在肾移植耐受中的调节功能 首次揭示了IgA+ B细胞与GZMB+调节性B细胞在肾移植耐受中的强关联性,并证明IgA+ B细胞具有高调节功能 样本量较小(共76名参与者),且为病例对照研究,可能限制结果的普遍性 研究IgA+ B细胞与GZMB+调节性B细胞在肾移植耐受中的关联及功能 健康志愿者和肾移植受者(包括稳定功能、抗体介导排斥和耐受患者) 免疫学 肾移植相关疾病 单细胞RNA测序,多参数光谱流式细胞术,ELISA,Western blot NA 单细胞转录组数据,流式细胞术数据,血清蛋白数据 76名参与者(45名健康志愿者,31名肾移植受者) NA 单细胞RNA-seq NA NA
759 2026-01-29
HFFST: A Hierarchical Feature Fusion Algorithm for Spatial Gene Expression Prediction Using Histopathology Images
2026-Jan-27, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本文提出了一种名为HFFST的层次特征融合算法,用于从H&E染色病理图像预测空间基因表达 提出了一种新的层次特征融合算法,充分利用病理图像的多层次信息,并采用从粗到细的回归框架来预测空间转录组图谱 未在摘要中明确说明 开发一种从H&E染色病理图像预测空间基因表达的方法,以克服空间转录组学技术成本高和复杂性大的限制 H&E染色病理图像和空间基因表达数据 数字病理学 NA 空间转录组学 层次特征融合算法 图像 五个公共数据集和高分辨率Visium数据 10X Genomics 空间转录组学 Visium 高分辨率Visium数据
760 2026-01-29
Mechanisms, precision therapies, and technological frontiers in coronary atherosclerosis: a comprehensive review
2026-Jan-27, Acta pharmacologica Sinica IF:6.9Q1
综述 本文全面综述了冠状动脉粥样硬化的机制、精准疗法及技术前沿,整合了疾病机制、新兴治疗策略以及多组学技术、高分辨率成像和人工智能在心血管风险评估中的应用 强调了精准医学、多组学技术、高分辨率成像和人工智能在心血管风险评估中的突破性应用,并探讨了针对PCSK、炎症通路、血管再生的新型干预措施,以及CRISPR-Cas9基因编辑、纳米技术药物递送和肠道微生物群调节等前沿技术 尽管这些创新有望实现个性化动脉粥样硬化管理,但在可及性、健康公平性和临床实施方面仍面临挑战 旨在通过整合多模态数据分析和靶向治疗,减少冠状动脉疾病的全球负担,推动精准心脏病学新时代 冠状动脉粥样硬化及其相关分子、细胞机制、治疗策略和技术应用 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学、多组学技术、高分辨率成像、人工智能 NA 多模态数据(包括分子、细胞、影像数据) NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部