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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2026-05-01 |
The 2026 Nucleic Acids Research database issue and the online molecular biology database collection
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1427
PMID:41431842
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评论 | 介绍2026年《核酸研究》数据库专刊内容及在线分子生物学数据库合集更新 | 专刊包含首个突破性论文JoGo,覆盖层级命名和背景化的人类单倍型,以及So3D提供真正三维空间转录组学数据 | 未提及具体研究局限性 | 总结和推广分子生物学数据库领域的新资源和更新 | 核酸、蛋白质结构、结构域和家族、酶、蛋白质组、人类单倍型、空间转录组学数据 | 机器学习 | NA | 三维空间转录组学 | NA | 数据库 | NA | NA | 三维空间转录组学 | NA | NA |
| 722 | 2026-05-01 |
Single cell RNA-sequencing reveals an association between testosterone treatment and reduced hormone signaling in the human mammary gland
2026-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.31.697241
PMID:41509433
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示睾酮治疗与人类乳腺激素信号减少之间的关联 | 首次利用单细胞RNA测序比较接受睾酮替代疗法的跨性别男性与顺性别女性的乳腺组织,发现睾酮治疗显著降低雌激素信号通路基因表达,提出睾酮可能通过抑制雌激素信号发挥保护作用 | 研究样本量有限,未深入探讨睾酮治疗对乳腺长期安全性及癌症风险的具体机制 | 探究睾酮替代疗法对人类乳腺生物学的影响及其对激素信号通路的调控 | 接受睾酮替代疗法的跨性别男性和顺性别女性的乳腺组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人口统计学匹配队列的顺性别女性和接受TRT的跨性别男性乳腺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 723 | 2026-05-01 |
Reduced Intestinal GLP-1+ Cell Numbers Are Associated With an Inflammation-related Epithelial Metabolic Signature
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101656
PMID:41047099
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研究论文 | 该研究探讨了肠道炎症中GLP-1+细胞数量减少与上皮代谢特征改变的关系 | 首次揭示GLP-1+细胞减少是肠道炎症的普遍特征,并发现其与上皮细胞代谢重编程相关,而非仅因功能受损 | 尚未明确GLP-1+细胞减少的具体分子机制及因果关系;人类数据仅来自Crohn病患者,未涵盖其他IBD亚型 | 探究肠内分泌细胞特别是GLP-1+细胞在肠道炎症中的作用机制 | 肠内分泌细胞(EECs)中的L细胞及GLP-1+细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、转录组分析、类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据、组织切片 | 4种小鼠炎症模型、IL-10缺乏小鼠、ClpPΔIEC小鼠、人类Crohn病患者黏膜活检、人类及小鼠肠道类器官 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序平台(具体产品未在摘要中明确) |
| 724 | 2026-05-01 |
Integrative single-cell and bulk RNA sequencing unravels the role of ACTN1 in promoting lung cancer with brain metastasis and epidermal growth factor receptor-tyrosine kinase inhibitor resistance
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1738641
PMID:42058147
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研究论文 | 整合单细胞和批量RNA测序揭示ACTN1在促进肺癌脑转移及EGFR-TKI耐药中的作用 | 首次通过整合scRNA-seq和批量RNA测序构建肺癌脑转移微环境图谱,并识别出ACTN1+上皮细胞亚群与EGFR-TKI耐药和脑转移的关联 | 基于公开数据集,可能未完全涵盖所有患者异质性;体外实验需进一步在体内模型中验证 | 探讨ACTN1在肺癌脑转移和EGFR-TKI耐药中的功能及机制 | 肺癌脑转移病灶中的肿瘤微环境细胞及EGFR-TKI耐药的肺癌细胞系 | 数字病理学,机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,高维加权基因共表达网络分析,机器学习 | NA | 基因表达数据 | 整合公开的scRNA-seq数据集及细胞系样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 725 | 2026-05-01 |
LGMN+ macrophage promotes the formation of a tumor-supportive microenvironment in gastric cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1810794
PMID:42058204
|
研究论文 | 发现LGMN+巨噬细胞通过促进血管生成和建立免疫抑制微环境驱动胃癌进展 | 通过单细胞RNA测序揭示LGMN+巨噬细胞在胃癌中的富集及其与不良预后的关联,并利用巨噬细胞特异性LGMN条件性敲除小鼠证实其促癌机制 | NA | 评估LGMN+巨噬细胞对胃癌进展的影响并阐明其潜在机制 | 胃癌组织中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 基因敲除 | NA | 基因表达数据 | 公共数据库中的胃癌样本及巨噬细胞特异性LGMN条件性敲除小鼠模型 | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 726 | 2026-05-01 |
The AhR-TLR4 axis in non-IgE-mediated Cow's milk allergy: a systematic review with integrated multi-omics corroboration
2026, Frontiers in allergy
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/falgy.2026.1789143
PMID:42058623
|
系统综述 | 系统综述结合多组学验证,探究非IgE介导的牛奶蛋白过敏中AhR-TLR4轴的作用及相关生物标志物和治疗策略 | 首次通过系统综述与单细胞RNA测序数据的整合分析,阐明非IgE介导的牛奶蛋白过敏中由肠道菌群失调驱动的AhR-TLR4致病轴,并验证B/E比值作为早期风险分层标志物的潜力 | 纳入研究的异质性可能影响结论的普适性,单细胞RNA测序数据来源为公开数据集且样本量有限 | 阐明非IgE介导的牛奶蛋白过敏中肠道菌群失调驱动的AhR-TLR4致病轴,并评估相关预测性生物标志物和潜在治疗方法 | 0-3岁经医生确诊的非IgE介导的牛奶蛋白过敏婴儿 | 机器学习和生物信息学 | 牛奶蛋白过敏 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床数据 | 39项研究汇总,单细胞RNA测序整合分析基于公开数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 727 | 2026-05-01 |
Molecular mechanisms underlying psoriasis and depression: an integrated analysis using mendelian randomization, transcriptomics, and single-cell sequencing
2026, Frontiers in molecular medicine
DOI:10.3389/fmmed.2026.1770665
PMID:42058679
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化、转录组学和单细胞测序的整合分析,探究银屑病与抑郁症共病的分子机制 | 首次整合孟德尔随机化、转录组学和单细胞组学三种方法,系统揭示银屑病与抑郁症共病的共享基因和通路 | 主要基于公开数据库分析,缺乏独立临床样本验证;孟德尔随机化结果需进一步实验验证 | 探究银屑病与抑郁症共病的分子机制,寻找潜在治疗靶点 | 银屑病和抑郁症患者 | 数字病理学 | 银屑病, 抑郁症 | 孟德尔随机化, 转录组学, 单细胞测序 | LASSO回归模型 | eQTL数据, 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 728 | 2026-02-26 |
Single-cell RNA sequencing reveals disease associated changes in brain endothelial cells in the 5XFAD mouse
2026-Jan-30, Fluids and barriers of the CNS
IF:5.9Q1
DOI:10.1186/s12987-026-00766-w
PMID:41618410
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 729 | 2026-04-30 |
Differential Hes1 activation defines neural stem cell lineage commitment and niche maintenance in embryonic and adult mouse cortex
2026-Jan-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2511800123
PMID:41557790
|
research paper | 利用单细胞转录组学和条件敲除小鼠模型,研究Hes1差异激活在胚胎和成年小鼠皮层神经干细胞谱系特化及生态位维持中的作用 | 首次区分了Notch非依赖性表达Hes1的神经干细胞与Notch依赖性表达的放射状胶质细胞,并证明了NIHes1神经干细胞是产生其他神经前体细胞的祖先前体细胞 | 未明确提及具体限制 | 阐明Hes1差异激活在神经干细胞谱系特化和生态位维持中的功能和机制 | 小鼠胚胎和成年皮层神经干细胞/祖细胞 | machine learning | NA | 单细胞转录组学, 条件敲除小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 胚胎和成年小鼠皮层样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 730 | 2026-04-30 |
EGFR-mutant transformed small cell lung cancer harbors intratumoral heterogeneity targetable with MEK inhibitor combination therapy
2026-Jan-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197008
PMID:41574603
|
研究论文 | 通过对EGFR突变小细胞肺癌转化患者的恶性胸腔积液进行单细胞RNA测序,发现肿瘤内存在可被MEK抑制剂联合疗法靶向的异质性 | 首次揭示EGFR突变小细胞肺癌由不同细胞状态混合组成,并发现非NE细胞对MEK抑制剂具有选择性敏感性,为靶向肿瘤异质性提供了新治疗策略 | 仅基于少量患者的胸水样本,需要更大样本量和更多模型验证;EZH2调控EGFR表达的机制及临床转化潜力需进一步研究 | 探究EGFR突变小细胞肺癌转化中的肿瘤异质性及其治疗靶点 | EGFR突变小细胞肺癌转化患者的恶性胸腔积液及患者来源细胞系 | 单细胞转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 多例EGFR突变小细胞肺癌转化患者的恶性胸腔积液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 731 | 2026-04-30 |
An integrated single-cell and spatial transcriptomic atlas of thyroid cancer progression identifies prognostic fibroblast subpopulations
2026-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191990
PMID:41480746
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析甲状腺癌进展,识别出预后相关的成纤维细胞亚群 | 首次整合单细胞与空间转录组学,在儿童与成人混合样本中揭示甲状腺癌进展的空间图谱,并鉴定出与预后不良相关的POSTN+肌成纤维细胞癌相关成纤维细胞亚群 | 未明确提及,可能包括样本量限制或功能验证不足 | 解析甲状腺癌在儿童与成人中的演化机制,并识别具有预后价值的细胞亚群 | 甲状腺癌样本(包括分化型甲状腺癌、间变性甲状腺癌及儿童弥漫硬化型甲状腺癌)中的细胞群体 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据 | 81个样本中的423,733个细胞的单细胞转录组,28个肿瘤的空间转录组,5个大型批量RNA测序队列 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium(推断), 10x Visium(推断) | NA |
| 732 | 2026-04-30 |
Identification of a distinctive gene signature associated with disease activity in granulomatous myositis
2026-01-08, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keaf543
PMID:41132132
|
研究论文 | 通过全转录组分析确定肉芽肿性肌炎疾病活动相关的特征基因标志 | 首次系统鉴定出肉芽肿性肌炎的特异性转录组特征(1293个上调基因和256个下调基因),并发现CHIT1基因表达与疾病严重程度强相关 | NA | 阐明肉芽肿性肌炎的病理生理机制,通过定义其特异性转录组特征 | 肉芽肿性肌炎患者及其它肌病患者和健康对照者的肌肉活检样本 | 转录组学 | 肉芽肿性肌炎 | RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组化 | 支持向量机 | 转录组数据 | 722例肌肉活检样本(包括38例GM患者) | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 733 | 2026-04-30 |
Indomethacin exerts both cyclooxygenase inhibition-dependent and independent mechanisms to enhance chemo-immunotherapy in mice
2026-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.07.698231
PMID:41542639
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研究论文 | 该论文研究了吲哚美辛通过COX抑制依赖和非依赖两种机制增强化疗联合免疫治疗在小鼠模型中的抗肿瘤效果 | 首次揭示吲哚美辛不仅通过抑制COX/PGE2通路增强化疗效果,还能通过抑制肿瘤内在的RAS信号通路发挥COX非依赖的联合增强作用 | 研究仅在小鼠肿瘤模型中进行,缺乏临床试验验证;且对不同肿瘤类型间的效果差异机制尚未完全阐明 | 探究吲哚美辛联合环磷酰胺化疗在多种小鼠肿瘤模型中的抗肿瘤效应及其免疫机制 | CT26、MC38、4T1、A20等多种小鼠肿瘤模型 | 免疫肿瘤学 | 多种癌症(结直肠癌、乳腺癌等) | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种小鼠肿瘤模型(CT26、MC38、4T1、A20) | 10x Genomics | 单细胞转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 734 | 2026-04-30 |
The single-cell landscape of the human vein after arteriovenous fistula creation and implications for maturation failure
2026-Jan, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.08.024
PMID:40992573
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术绘制动静脉瘘形成前后人静脉的单细胞图谱,揭示瘘管成熟失败的细胞和分子机制 | 首次在单细胞水平系统描绘人静脉在动静脉瘘形成后的细胞动态变化,发现巨噬细胞源性骨桥蛋白是驱动瘘管失败的关键旁分泌信号,并揭示Myddosome信号复合物、促炎性血管滋养管内皮细胞及过度活化的成纤维细胞在瘘管失败中的新作用 | 样本量相对有限(23例组织活检和20例单细胞样本),且未对不同种族或合并症患者进行分层分析 | 阐明动静脉瘘成熟过程的生物学机制,找出导致瘘管成熟失败的潜在治疗靶点 | 接受血液透析患者的动静脉瘘组织样本(包括术前静脉、早期切除标本、成熟及失败的瘘管) | 单细胞组学 | 肾病相关血管病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 23例组织活检标本和20例患者的70281个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 735 | 2026-04-30 |
Integrated single-cell transcriptomics and proteomics elucidate the molecular mechanisms and detoxification strategy of rifampicin-induced hepatotoxicity
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.109757
PMID:41362738
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研究论文 | 整合单细胞转录组学和蛋白质组学揭示了利福平诱导肝毒性的分子机制及解毒策略 | 首次结合单细胞RNA测序、批量RNA测序和基于质谱的蛋白质组学与代谢组学,系统揭示利福平诱导肝毒性的区域特异性肝细胞损伤机制,并发现维甲酸具有潜在治疗作用 | 基于小鼠模型,结论向人类转化的适用性需进一步验证 | 阐明利福平诱导肝毒性的细胞和分子机制,并寻找高效低毒的治疗干预措施 | 利福平诱导肝毒性的小鼠模型 | 机器学习 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 质谱蛋白质组学, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据 | 小鼠肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 736 | 2026-04-30 |
ZIC2 drives colorectal cancer progression by regulating QPRT-mediated cell migration
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1722707
PMID:41694394
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研究论文 | 本研究探讨了ZIC2通过调控QPRT介导的细胞迁移促进结直肠癌进展的机制 | 首次在泛癌及结直肠癌中系统分析ZIC2的临床意义,并发现ZIC2通过上调QPRT促进结直肠癌细胞迁移的新机制 | NA | 明确ZIC2在结直肠癌中的表达、临床意义及其通过QPRT促进肿瘤进展的分子机制 | 结直肠癌细胞系及公共数据集中的结直肠癌患者样本 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞转录组测序, 空间转录组测序 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | TCGA队列、GEO数据集(GSE39582和GSE139555)及CRC_10x空间转录组数据集中的多个样本 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | 10x Visium | 10x空间转录组芯片 |
| 737 | 2026-04-30 |
Integrated Machine Learning and Multi-Omics Analysis Identifies Mitophagy-Related Core Genes and Mechanisms in Non-Alcoholic Fatty Liver Disease
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S575586
PMID:41907204
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研究论文 | 通过整合机器学习和多组学分析,系统筛选非酒精性脂肪肝病(NAFLD)中线粒体自噬相关核心基因及其调控网络和免疫微环境机制 | 首次结合11种机器学习算法和SHAP模型可解释性分析,从多转录组和单细胞数据中筛选NAFLD线粒体自噬核心基因,并深入解析其与免疫微环境重塑的关联 | 缺乏大规模临床队列验证,体外实验仅使用细胞模型,未在动物体内验证核心基因功能及靶向治疗潜力 | 阐明NAFLD中线粒体自噬相关核心基因的分子调控网络及其在免疫微环境中的功能机制,为疾病诊断和治疗提供新靶点 | 非酒精性脂肪肝病(NAFLD)患者的转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 非酒精性脂肪肝病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 机器学习, SHAP模型解释, 分子对接, Western Blot, qRT-PCR, JC-1染色 | WGCNA, 11种机器学习算法, SHAP | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个NAFLD转录组数据集(GEO数据库)及单细胞RNA测序数据,具体样本数量未明确 | NA | NA | NA | NA |
| 738 | 2026-04-30 |
ECM remodeling features in reparative chondrocytes during knee osteoarthritis
2026, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2026.1773139
PMID:42051458
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据整合分析,揭示膝关节骨关节炎中修复性软骨细胞的细胞外基质重塑特征 | 首次从伪时间轨迹框架揭示KOA中修复性软骨细胞(RepC)在ECM重塑中的动态变化,并验证FN1和TGF-β1信号对其诱导作用 | 依赖公开数据集,体外实验仅验证部分信号通路,未在体内模型中验证RepC的功能 | 阐明膝关节骨关节炎中修复性软骨细胞的ECM重塑特征及其动态转变机制 | 人类膝关节软骨细胞(对照和KOA样本) | 单细胞转录组学 | 膝关节骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个公开单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 739 | 2026-04-30 |
The inhibitory effect of hepatic cancer energy metabolism on immune checkpoint therapy: perspectives from single-cell multi-omics analysis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1753670
PMID:42051493
|
研究论文 | 通过单细胞多组学分析研究肝细胞癌免疫检查点抑制剂治疗后代谢重编程,尤其是丙酮酸代谢变化,并构建代谢相关预后模型及评估LDHA靶向治疗潜力 | 首次从单细胞多组学层面揭示免疫检查点抑制剂治疗后肝癌细胞丙酮酸代谢重编程(LDHA上调)及其对免疫治疗耐药的影响,并验证LDHA抑制剂与PD-1抗体联合治疗的抗肿瘤效果 | 研究基于公共数据集和体外/体内实验,样本量和临床验证有限,且未深入探讨代谢重编程导致免疫耐药的具体分子机制 | 探究肝细胞癌免疫检查点抑制剂治疗前后的代谢重编程(尤其是丙酮酸代谢),构建预后模型并评估LDHA靶向治疗潜力 | 肝细胞癌肿瘤组织样本(GEO和Mendeley数据库来源的单细胞RNA-seq数据)及Huh7肝癌细胞系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | Cox回归, Lasso回归 | 基因表达数据, 文本 | GEO和Mendeley数据库中的单细胞RNA-seq样本,数量未明确说明;TCGA队列用于预后模型构建;Huh7细胞系用于体外实验,异种移植模型用于体内实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 740 | 2026-04-30 |
Genome to single-cell characterization of the MAPK family in bighead carp (Hypophthalmichthys nobilis) spleen during Aeromonas hydrophila challenge
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1777786
PMID:42051520
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研究论文 | 对大头鲤MAPK家族进行基因组到单细胞水平的表征,并探索其在嗜水气单胞菌感染下的脾脏免疫反应 | 首次在24个物种中比较基因组分析MAPK家族,并利用单细胞RNA测序揭示大头鲤脾脏中对细菌感染的早期免疫应答中mapk6和mapk11的潜在作用 | 未明确讨论局限性 | 解析大头鲤MAPK家族基因组组成及在细菌感染中的转录响应 | 大头鲤(Hypophthalmichthys nobilis)的脾脏组织及分离的细胞 | 数字病理学 | 鱼类细菌性疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 加权基因共表达网络分析, 细胞间通讯分析, 假时间分析 | NA | 基因序列、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 来自大头鲤脾脏的28,348个细胞 | Illumina(推断) | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | Illumina NovaSeq(推断) | 单细胞RNA测序(具体平台未提及) |