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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2026-01-18 |
POSTN+ cancer-associated fibroblasts promote bladder cancer progression via angiogenesis and immune modulation: an analysis based on single-cell Transcriptomics
2026-Jan-16, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1093/intbio/zyag001
PMID:41544201
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了POSTN+癌症相关成纤维细胞通过促进血管生成和免疫抑制驱动膀胱癌进展的机制 | 首次在膀胱癌中系统性地鉴定并表征了POSTN+ CAFs亚群,揭示了其通过IL1B/IL1R1轴增强CAF-单核细胞通讯并促进免疫抑制微环境的新机制 | 研究主要基于公开数据库的二次分析,实验验证部分仅使用了T24细胞系和CAFs共培养系统,样本量有限且缺乏体内实验验证 | 探究POSTN+癌症相关成纤维细胞在膀胱癌进展中的作用及其分子机制 | 膀胱癌组织样本、癌症相关成纤维细胞、单核细胞、T24膀胱癌细胞系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、差异基因表达分析、GSVA、KEGG通路分析、CellChat、NicheNet、TCGA数据分析、细胞划痕实验、侵袭实验 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、实验数据 | 4个膀胱癌样本和4个对照样本的单细胞数据,TCGA数据库的批量转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 722 | 2026-01-18 |
LY6D identifies persistent stem-like cells driving pancreatic tumourigenesis
2026-Jan-16, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-336460
PMID:41545197
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,识别了LY6D作为胰腺导管腺癌早期持续存在的干细胞样细胞标志物,并揭示了其在肿瘤发生中的关键驱动作用 | 首次将LY6D识别为连接早期癌前异质性与胰腺导管腺癌发生发展的关键驱动因子,并阐明了其通过脂筏相关激酶网络驱动表观遗传-转录重编程的机制 | 研究主要基于小鼠模型和临床队列数据,需要进一步在人类原代样本中进行功能验证 | 识别和功能表征胰腺导管腺癌中的关键癌前细胞状态,以定义早期干预的新生物标志物和治疗靶点 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的早期细胞异质性,特别是LY6D+胃样细胞状态 | 数字病理学 | 胰腺癌 | scRNA-seq, TurboID邻近蛋白质组学, 表观遗传分析, 代谢测定 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组学数据, 表观遗传数据, 临床队列数据 | 公共和内部胰腺肿瘤模型的scRNA-seq数据,以及人类PDAC队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 723 | 2026-01-18 |
Tissue-specific and sex-biased glycoproteomic landscape of Schistosoma mansoni
2026-Jan-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68400-9
PMID:41545360
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研究论文 | 本文通过N-和O-糖蛋白质组学、完整糖肽分析及单细胞转录组学整合,揭示了曼氏血吸虫成虫的组织特异性和性别偏向性糖基化模式,并建立了相关糖数据库 | 首次系统性地整合糖蛋白质组学和单细胞转录组学,揭示了曼氏血吸虫的组织特异性和性别偏向性糖基化模式,并建立了首个曼氏血吸虫糖数据库,包括未分类糖和HexA修饰的识别 | 研究主要基于体外分析,未直接验证糖基化模式在宿主感染环境中的功能影响 | 研究曼氏血吸虫的糖基化景观,以支持基于糖和糖蛋白的血吸虫病控制策略开发 | 曼氏血吸虫成虫(雄性和雌性) | 数字病理学 | 血吸虫病 | N-和O-糖蛋白质组学、完整糖肽分析、单细胞转录组学、RNA干扰 | NA | 蛋白质组学数据、转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 724 | 2026-01-18 |
Robust and interpretable prediction of gene markers and cell types from spatial transcriptomics data
2026-Jan-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68487-0
PMID:41545411
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研究论文 | 本研究提出了一个名为STimage的综合模型套件,可直接从标准H&E图像预测空间基因表达和分类细胞类型 | 通过集成基础模型和集成方法,估计基因表达分布并量化数据驱动和模型不确定性,从而增强鲁棒性;通过整合组织病理学注释、功能基因和潜在表征,在单细胞分辨率下实现可解释性 | 未在摘要中明确说明 | 提高从组织学图像预测基因表达和细胞类型分类的模型的鲁棒性和可解释性 | 空间转录组学数据与H&E组织学图像 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习模型,集成方法,基础模型 | 图像,基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 725 | 2026-01-18 |
Spatial transcriptomics reveals molecular heterogeneity and subtype-specific therapeutic targets in small cell lung cancer
2026-Jan-16, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01243-7
PMID:41545500
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了小细胞肺癌的分子异质性及亚型特异性治疗靶点 | 引入了Edgeindex指标定量评估肿瘤空间结构,并开发了专用人工神经网络模型进行精确肿瘤注释 | NA | 解析小细胞肺癌的异质性并探索其治疗靶点 | 小细胞肺癌样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | 人工神经网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 726 | 2026-01-18 |
Discovery of disease-associated cellular states using ResidPCA in single-cell RNA and ATAC sequencing data
2026-Jan-15, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2025.100538
PMID:41157948
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ResidPCA的稳健方法,用于从单细胞RNA和ATAC测序数据中发现与疾病相关的细胞状态 | ResidPCA通过显式建模细胞类型异质性,在检测跨多种细胞类型表达的状态方面,比传统PCA和非负矩阵分解方法具有更高的准确性 | NA | 推进对单细胞测序数据中疾病相关细胞异质性的理解 | 小鼠视觉皮层细胞和阿尔茨海默病队列的单核数据集 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序 | ResidPCA | 单细胞RNA测序数据, 单核ATAC测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核ATAC-seq | NA | NA |
| 727 | 2026-01-18 |
Single-cell sequencing-based analysis of CD4 + T-cell and B-cell heterogeneity in patients with lupus nephritis
2026-Jan-15, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02277-3
PMID:41540405
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 728 | 2026-01-18 |
Efficient stem cell-derived mouse embryo models for environmental studies
2026-Jan-14, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.08.004
PMID:40882624
|
研究论文 | 本研究开发了一种模块化方法,通过聚集三种小鼠干细胞类型来高效生成模拟天然囊胚的类囊胚结构,用于环境因素研究 | 提出了一种通过聚集胚胎干细胞、诱导性GATA4表达胚胎干细胞和滋养层干细胞来高效生成具有完整谱系和空腔的类囊胚结构的新方法 | 研究主要基于小鼠干细胞模型,尚未在人类系统中验证;体外培养的形态发生效率约为12%,仍有提升空间 | 开发高效的干细胞衍生胚胎模型,用于研究环境因素对胚胎发育的影响 | 小鼠胚胎干细胞、诱导性GATA4表达胚胎干细胞、滋养层干细胞及其生成的类囊胚结构 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、体外培养 | 干细胞衍生胚胎模型 | 基因表达数据、形态学数据 | 未明确具体样本数量,但提及生成效率约为80% | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 729 | 2026-01-17 |
Correction to 'inDrops-2: a flexible, versatile and cost-efficient droplet microfluidic approach for high-throughput scRNA-seq of fresh and preserved clinical samples'
2026-Jan-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag009
PMID:41533593
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 730 | 2026-01-18 |
NNMT inhibition counteracts tubular senescence and fibrosis in early stages of chronic kidney disease
2026-Jan-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116823
PMID:41543936
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研究论文 | 本文发现NNMT是肾小管衰老和肾纤维化的关键介质,并证明其抑制可减少早期慢性肾病中的衰老和纤维化 | 首次将NNMT鉴定为肾小管衰老和纤维化的关键介质,并通过空间转录组学揭示其在人类活检组织中的表达模式,同时展示选择性NNMT抑制在细胞、类器官和体内模型中的保护作用 | 研究主要基于早期慢性肾病模型,未涉及晚期疾病阶段;体内实验主要在动物模型中进行,人类临床验证有限 | 探索NNMT在慢性肾病肾小管衰老和纤维化中的作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 | 人类慢性肾病微阵列、糖尿病肾病活检组织、小鼠模型、肾小管上皮细胞、肾脏类器官 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 微阵列、空间转录组学、蛋白质分析 | NA | 转录组数据、蛋白质数据、空间转录组数据 | 人类活检组织、小鼠模型、细胞和类器官样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 731 | 2026-01-18 |
Myeloid-Driven Inflammation Highlights ADGRE2 as a Biomarker in Prurigo Nodularis: Integrated Multi-Omics Analysis
2026-Jan-14, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.12.023
PMID:41544890
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析,揭示了痒疹结节病(PN)中髓系细胞驱动的炎症特征,并鉴定出ADGRE2作为与临床瘙痒严重程度相关的生物标志物 | 首次在蛋白水平上系统比较PN与特应性皮炎(AD),并整合单细胞RNA测序数据,识别出PN特异的髓系富集分子ADGRE2,其表达与瘙痒严重程度显著相关 | 样本量相对有限,且部分数据依赖公开数据集,需要进一步功能验证和更大规模队列研究 | 阐明痒疹结节病的病理机制,特别是在蛋白水平和与特应性皮炎的对比中,寻找潜在的生物标志物和治疗靶点 | 痒疹结节病(PN)、特应性皮炎(AD)患者及健康对照(HC)的皮肤病变组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 4D-DIA蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | PN、AD和HC的病变组织样本(具体数量未明确),整合公开数据集如GSE222840 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 732 | 2026-01-18 |
Mitochondrial pyruvate metabolism in club cells drives airway inflammation
2026-Jan-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102742
PMID:41418787
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研究论文 | 本研究揭示了线粒体丙酮酸代谢在气道棒状细胞中如何调控上皮分化和过敏性气道炎症,并发现了一种代谢-免疫交互作用在哮喘发病机制中的作用 | 首次发现棒状细胞中线粒体丙酮酸载体Mpc2(而非Ldha)缺失会通过增加Cxcl17表达,促进与肺泡巨噬细胞的Cxcl17-Cxcr4信号传导,从而抑制CCL17介导的2型炎症,这为哮喘治疗提供了新的代谢靶点 | 研究主要基于OVA诱导的哮喘模型,人类样本的验证仍需进一步深入;且具体代谢通路下游的分子机制有待更详细阐明 | 探究气道棒状细胞中丙酮酸代谢如何调控上皮分化和过敏性气道炎症,以揭示哮喘发病的代谢-免疫机制 | 哮喘患者的气道棒状细胞和杯状细胞,以及OVA诱导的哮喘小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 哮喘患者和OVA诱导哮喘模型的小鼠样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 733 | 2026-01-18 |
Electrocorticographic, Astrocytic and Transcriptomic Signatures in the Triple Transgenic Mouse Model of Alzheimer's Disease submitted to Stearoyl-CoA Desaturase Inhibition
2026-Jan-13, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2026.110835
PMID:41539386
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研究论文 | 本研究探讨了抑制硬脂酰辅酶A去饱和酶(SCD)对阿尔茨海默病(AD)三转基因小鼠模型睡眠、脑电图活动、星形胶质细胞功能、脂质代谢及转录组的影响 | 首次在AD动物模型中结合了脑电图记录、星形胶质细胞标记物分析、脂滴染色和空间转录组学技术,系统评估SCD抑制对睡眠障碍和神经病理的多维度影响 | 研究仅使用了雌性小鼠,未评估性别差异;SCD抑制未能恢复AD小鼠的睡眠时间改变;机制关联性仍需进一步验证 | 探究SCD抑制是否能改善AD模型小鼠的睡眠障碍,并分析其与脂质代谢、星形胶质细胞功能和转录组变化的关系 | 野生型(WT)和三转基因(3xTg-AD)雌性小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 脑电图记录、免疫组织化学染色、空间转录组学 | 三转基因(3xTg-AD)小鼠模型 | 脑电信号、图像数据、转录组数据 | 野生型和3xTg-AD雌性小鼠(具体数量未明确说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 734 | 2026-01-18 |
SegJointGene: joint cell segmentation and spatial gene prioritization by information entropy guided convolutional neural networks
2026-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.08.698474
PMID:41542426
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SegJointGene的深度学习框架,该框架通过整合核图像与空间基因或蛋白质表达数据,联合执行细胞分割和空间基因优先级排序 | SegJointGene创新性地设计了一个信息熵引导的卷积神经网络,并结合计算信息丢弃评分,以识别对细胞类型特异性分割重要的基因,从而迭代优化基因优先级和细胞边界 | NA | 旨在通过整合分子信息改进复杂组织中密集细胞堆积的细胞分割准确性 | 小鼠海马体、全脑不同区域的空间转录组数据以及人类扁桃体的空间蛋白质组数据 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | CNN | 图像、基因表达数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 735 | 2026-01-18 |
Zebrafish neural regeneration: mechanistic insights into human nervous system repair
2026-Jan-10, Neuroscience
IF:2.9Q2
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综述 | 本文综述了斑马鱼在神经再生研究中的关键发现,强调其作为人类神经系统修复模型的转化意义 | 整合了斑马鱼在视网膜、脊髓和大脑中神经再生的机制,并突出了其在单细胞测序、CRISPR-Cas9等多组学技术中的应用进展 | 作为一篇综述文章,未涉及原始实验数据,且主要基于斑马鱼模型,其发现向人类转化的直接应用仍需进一步验证 | 解码脊椎动物中枢神经系统再生的机制,以指导人类神经修复的治疗策略 | 斑马鱼(Danio rerio)作为研究模型,聚焦其视网膜、脊髓和大脑的神经再生过程 | 再生医学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9, 谱系追踪, 多组学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 736 | 2026-01-18 |
Single-cell and Bulk RNA-Seq Analyses Reveal TOMM7-mediated Multi-cell Death Mechanisms Driving Muscle-invasive Bladder Cancer Progression
2026-Jan-08, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA-Seq分析,揭示了TOMM7介导的多细胞死亡机制在肌层浸润性膀胱癌进展中的关键作用 | 整合单细胞与批量RNA-Seq数据,结合机器学习算法构建了基于MIBC相关细胞死亡基因的预后模型,并首次发现TOMM7作为核心基因调控多种细胞死亡通路 | 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证,且临床样本队列的多样性和规模可能有限 | 探究肌层浸润性膀胱癌的分子异质性、进展机制及潜在治疗靶点 | 膀胱癌患者样本(特别是肌层浸润性亚型)及T24细胞系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,机器学习算法,分子对接分析 | 机器学习算法(未指定具体模型) | RNA-seq数据(单细胞和批量) | 多个患者队列(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 737 | 2026-01-18 |
A single-cell transcriptomic atlas of the periventricular proliferative zone in the late gestation fetal brain in the pigtail macaque
2026-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.08.698393
PMID:41542632
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研究论文 | 本研究构建了猪尾猕猴晚期妊娠胎儿脑室周围增殖区的单细胞转录组图谱 | 首次在非人灵长类动物(猪尾猕猴)中创建了晚期妊娠胎儿脑室周围增殖区的单细胞转录组图谱,为灵长类神经发育关键窗口期的细胞状态提供了独特参考 | 研究仅基于单一物种(猪尾猕猴)的样本,且样本数量有限,可能无法完全代表人类胎儿脑的全部复杂性 | 构建晚期妊娠胎儿脑室周围增殖区的单细胞转录组图谱,以研究灵长类神经发育关键期的细胞状态 | 猪尾猕猴(Macaca nemestrina)晚期妊娠胎儿脑室周围增殖区的细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | Seurat, Monocle3 | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及猪尾猕猴晚期妊娠胎儿脑室周围增殖区的单细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10X Genomics pipeline | 10X Genomics单细胞测序流程,具体配置未详细说明 |
| 738 | 2026-01-18 |
Indomethacin exerts both cyclooxygenase inhibition-dependent and independent mechanisms to enhance chemo-immunotherapy in mice
2026-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.07.698231
PMID:41542639
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研究论文 | 本研究探讨了非甾体抗炎药吲哚美辛与化疗药物环磷酰胺联用在小鼠肿瘤模型中的抗肿瘤效果及其机制 | 揭示了吲哚美辛通过环氧化酶依赖和非依赖(特别是抑制肿瘤内在RAS信号通路)的双重机制增强化疗免疫治疗效果 | 研究基于小鼠模型,其结论在人体中的适用性尚需进一步验证 | 探究NSAIDs(特别是吲哚美辛)与化疗药物联用增强抗肿瘤疗效的机制 | 小鼠肿瘤模型(CT26、MC38、4T1和A20) | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 多个小鼠肿瘤模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 739 | 2026-01-18 |
IL-33 blockade attenuates vascular inflammation in a mouse model of Kawasaki disease vasculitis
2026-Jan-06, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxaf086
PMID:41533763
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研究论文 | 本研究使用小鼠模型探究了IL-33在川崎病血管炎发病机制中的作用 | 首次在川崎病模型中系统证实IL-33通过多细胞亚群冗余机制促进血管炎症,并提示其作为治疗靶点的潜力 | 研究基于小鼠模型,需在人类患者中进一步验证 | 阐明IL-33在川崎病血管炎发病机制中的具体作用 | 乳酸杆菌细胞壁提取物诱导的川崎病小鼠模型 | NA | 川崎病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、流式细胞术 | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 740 | 2026-01-18 |
Predicting Immunotherapy Outcomes in NSCLC Using RNA and Pathology from Multicenter Clinical Trials
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502037
PMID:41159493
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研究论文 | 本研究开发了一个基于RNA的模型LIRA,用于预测非小细胞肺癌患者的免疫治疗结果,并结合深度学习分析病理图像 | 开发了LIRA模型,通过交互分析和随机森林算法预测免疫治疗结果,优于PD-L1表达和肿瘤突变负荷,并能识别早期进展风险 | 研究基于多中心临床试验数据,但可能存在样本选择偏倚,且模型在更广泛人群中的验证尚需进一步研究 | 预测非小细胞肺癌患者的免疫治疗结果,识别可能无法受益的患者并探索联合治疗策略 | 1127名晚期非小细胞肺癌患者,来自多中心随机临床试验(OAK、POPLAR、ORIENT-11)和内部队列 | 数字病理学 | 肺癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | 随机森林, 深度学习模型 | RNA-seq转录组数据, 全切片图像 | 1127名晚期非小细胞肺癌患者 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |