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当前共找到 1652 篇文献,本页显示第 701 - 720 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
701 2026-02-22
Exosome RAB10 inhibits JAK1/STAT1 to hinder macrophage M1 polarization and promote tumor immune escape
2026-Jan-26, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1
研究论文 本研究揭示了乳腺癌细胞通过外泌体递送RAB10蛋白,抑制巨噬细胞M1极化并促进其M2极化,从而促进肿瘤免疫逃逸的机制 首次发现外泌体RAB10通过与干扰素受体IFNAR1结合,抑制JAK1/STAT1通路磷酸化,从而调控巨噬细胞极化,并证明联合靶向RAB10和PD-L1具有协同抗肿瘤效应 研究主要基于乳腺癌模型,其他肿瘤类型中的普适性有待验证;临床样本验证相对有限 探究外泌体RAB10在调控巨噬细胞极化及肿瘤免疫逃逸中的作用机制 乳腺癌细胞、巨噬细胞、肿瘤微环境、CD8⁺ T细胞 肿瘤免疫学 乳腺癌 单细胞RNA测序、体外实验、动物模型 NA 基因表达数据、蛋白质数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
702 2026-02-22
Intermittent fasting inhibits Tp53-driven glioma through gut microbiota-mediated methionine-m6A regulation
2026-Jan-20, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了间歇性禁食(IF)通过肠道菌群介导的甲硫氨酸-m6A调控途径抑制Tp53驱动型胶质瘤的分子机制 首次发现IF的抗肿瘤效果与胶质母细胞瘤(GBM)亚型(Tp53型 vs CDKN2A型)相关,并通过多组学技术系统阐明了肠道菌群-甲硫氨酸-m6A修饰-TGF-β信号轴在其中的作用机制 研究主要基于小鼠模型,人体临床验证尚需开展;对CDKN2A亚型GBM中IF效果不显著的机制未深入探讨 探究间歇性禁食抑制胶质母细胞瘤的亚型特异性机制 Tp53驱动型和Cdkn2a驱动型胶质母细胞瘤小鼠模型 肿瘤生物学 胶质母细胞瘤 多组学测序(空间转录组、空间代谢组、单细胞转录组、单细胞RNA甲基化、代谢组、微生物组) 小鼠肿瘤模型 多组学数据 未明确说明 NA 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞转录组学, 单细胞RNA甲基化, 代谢组学, 微生物组学 NA NA
703 2026-02-22
Robust and interpretable prediction of gene markers and cell types from spatial transcriptomics data
2026-Jan-16, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一个名为STimage的综合模型套件,用于直接从标准H&E图像预测空间基因表达和分类细胞类型 通过估计基因表达分布并使用集成方法量化数据驱动和模型不确定性,增强了模型的鲁棒性;通过单细胞分辨率的归因分析结合组织病理学注释、功能基因和潜在表示,提高了可解释性 NA 提高空间转录组学数据中基因标记和细胞类型预测的鲁棒性和可解释性 空间转录组学数据中的基因表达和细胞类型 数字病理学 NA 空间转录组学 深度学习模型,集成方法 图像 NA NA 空间转录组学 NA NA
704 2026-02-22
Biologically interpretable deep learning-derived MRI phenotypes reveal lymph node involvement and neoadjuvant therapy response in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Jan-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究开发了一个名为SwinU-CliRad的深度学习模型,用于对肝内胆管癌的淋巴结受累风险进行分层,并评估其对新辅助治疗反应的预测能力 整合了基于Swin UNETR的MRI衍生输出与临床放射学特征,构建了可解释的深度学习模型,并探索了模型输出与肿瘤多组学特征的相关性 研究涉及多个队列,但外部验证队列样本量相对较小(n=88),且模型性能仍需在更广泛的多中心数据中进一步验证 开发一个模型以改进肝内胆管癌的淋巴结受累分层,并为治疗决策提供信息 肝内胆管癌患者 计算机视觉 肝内胆管癌 单细胞RNA测序,多组学分析 Swin UNETR,SwinU-CliRad框架 磁共振成像,临床放射学特征 发现队列682例,内部测试队列204例,外部多中心队列88例,新辅助治疗队列145例 NA 单细胞RNA测序 NA NA
705 2026-01-14
Decoding the tumor microenvironment remodeling orchestrated by CLEC3B+ inflammatory cancer-associated fibroblasts in lung adenocarcinoma immunotherapy: elucidation from pan-cancer spatially single-cell transcriptomics landscape
2026-Jan-12, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
706 2026-02-22
An unsupervised method for spatial transcriptomics analysis based on adversarial autoencoder
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出了一种基于对抗自编码器的无监督空间转录组学分析方法DACN,用于处理不同分辨率和通量的ST数据 首次将改进的对抗自编码器与图卷积网络集成,通过混合编码器结合多头注意力和残差连接,同时捕获局部表达模式和全局信息 未明确说明方法对特定组织类型或实验条件的适用性限制 开发鲁棒的空间转录组数据分析框架 空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 对抗自编码器, 图卷积网络 基因表达空间数据 多个ST数据集 NA 空间转录组学 NA NA
707 2026-02-21
Applications of Spatial Transcriptomics in Ischemic Stroke Research
2026-Jan-31, The American journal of pathology
综述 本文综述了空间转录组学在缺血性卒中研究中的应用,重点探讨了胶质细胞在卒中病理生物学中的复杂作用 通过结合空间转录组学与单细胞及多组学方法,识别了新的治疗靶点,如不同激活状态的胶质细胞及其关键信号通路 当前研究仍面临挑战,包括需要多时间点分析、三维重建和标准化数据集以推动临床应用 探讨空间转录组学如何促进对卒中后细胞变化的理解,并推动卒中研究与治疗 缺血性卒中后的脑组织,特别是小胶质细胞、星形胶质细胞和少突胶质细胞 数字病理学 缺血性卒中 空间转录组学,单细胞多组学 NA 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
708 2026-02-21
Diffusion-based Representation Integration for Foundation Models Improves Spatial Transcriptomics Analysis
2026-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出DRIFT框架,通过热核扩散在空间图上整合空间上下文到基础模型的输入表示中,以改进空间转录组学分析 利用热核扩散在空间图上传播嵌入,将ST数据的局部邻域上下文整合到现有单细胞基础模型中,弥补了空间信息利用的不足 未明确提及具体局限性,但可能依赖于基础模型的性能和数据质量 开发一个通用框架,将空间上下文整合到基础模型中,以提升空间转录组学数据的分析性能 空间转录组学数据及其在细胞类型注释、聚类和跨样本对齐等任务中的应用 数字病理学 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 基础模型(包括scRNA-seq和ST-based模型) 基因表达谱数据(空间转录组学和单细胞RNA测序数据) NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
709 2026-02-21
A tri-omics and machine learning framework identifies prognostic biomarkers and metabolic signatures in sepsis
2026-Jan-29, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合转录组学、蛋白质组学、代谢组学和单细胞转录组学数据,结合机器学习方法,识别了脓毒症相关的预后生物标志物和代谢特征 建立了一个结合多组学数据、机器学习算法和单细胞分析的综合分析框架,首次将TPR和ERN1基因与脓毒症的免疫代谢重塑联系起来,并构建了基因-代谢物联合分类模型 研究缺乏独立、多组学匹配队列的外部验证,且计算筛选的中药活性单体需后续实验验证 阐明脓毒症的分子机制并识别候选生物标志物,为下游机制和转化研究提供可测试的假设 脓毒症患者的多组学数据(转录组、蛋白质组、代谢组)及单细胞转录组数据 机器学习 脓毒症 转录组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞转录组学、非靶向代谢组学筛选 LASSO回归、SVM-RFE算法、逻辑回归、支持向量机、随机森林 组学数据(转录组、蛋白质组、代谢组)、单细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
710 2026-02-21
scAURA: Alignment- and Uniformity-based Graph Debiased Contrastive Representation Architecture for Self-Supervised Clustering of Single-Cell Transcriptomics
2026-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为scAURA的统一框架,结合图去偏对比学习和自监督聚类,用于单细胞转录组数据的细胞类型识别 scAURA通过整合图去偏对比学习与自监督聚类,解决了单细胞RNA测序数据中的高维性、稀疏性和噪声问题,在多个数据集上超越了现有最先进方法 NA 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性和鲁棒性 人类和小鼠的单细胞转录组数据 机器学习 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 图去偏对比学习架构 单细胞转录组数据 18个真实单细胞数据集,涵盖多种组织和细胞类型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
711 2026-02-21
HMGB1 affects the progression of neurofibromatosis type 1-associated malignant peripheral nerve sheath tumors through E2F2
2026-Jan-24, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究揭示了HMGB1通过直接转录激活E2F2,驱动神经纤维瘤病1型相关恶性外周神经鞘瘤的细胞周期进程和肿瘤恶性进展 首次在单细胞水平上整合分析NF1-MPNST和PNF组织,阐明了HMGB1通过直接结合并激活E2F2转录来驱动肿瘤进展的新机制 研究主要基于患者来源的组织和细胞系,体内模型为异种移植小鼠模型,未来需要在更接近人类肿瘤微环境的基因工程小鼠模型中进一步验证 探究HMGB1在神经纤维瘤病1型相关恶性外周神经鞘瘤进展中的功能作用和分子机制 患者来源的NF1-MPNST和丛状神经纤维瘤组织、NF1细胞系、异种移植小鼠模型 肿瘤生物学 恶性外周神经鞘瘤 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq、CUT&Tag、ChIP-qPCR、qPCR、Western blot NA RNA测序数据、蛋白质印迹数据、染色质免疫沉淀数据 患者来源的NF1-MPNST和PNF组织(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
712 2026-02-21
Spatially resolved transcriptome-metabolome integration reveals region-specific glial lipid dysregulation associated with Alzheimer's pathology
2026-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一个名为iMIST的集成平台,结合代谢物成像、组织学和空间转录组学,揭示了阿尔茨海默病小鼠模型中胶质细胞脂质代谢失调的区域特异性模式及其与病理的联系 首次开发了iMIST集成平台,能够在同一组织切片上整合MALDI代谢物成像、组织学和空间转录组学数据,直接展示了胶质细胞稳态失调如何在不同脑区和微环境中表现,并将局部病理与整体代谢失衡联系起来 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证;技术整合的复杂性可能限制其广泛推广 探究阿尔茨海默病中胶质细胞脂质代谢失调的空间分布特征及其与病理的关联 晚发性阿尔茨海默病小鼠模型的脑组织 空间转录组学 阿尔茨海默病 MALDI代谢物成像,空间转录组学,组织学分析 NA 空间多组学数据(代谢组、转录组、图像) NA NA 空间转录组学 NA NA
713 2026-02-21
Super-resolved, three-dimensional spatial transcriptomics reveals cell-type and brain-region-specific modulation of key epitranscriptomic switches following adolescent alcohol exposure
2026-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一种超分辨三维空间转录组学方法,用于量化大鼠脑内关键表观转录组开关在青少年酒精暴露后的细胞类型和脑区特异性变化 开发了首个超分辨三维空间转录组学方法,实现了在完整脑组织中以细胞类型和脑区特异性方式量化关键表观转录组调节因子 研究仅针对特定表观转录组调节因子(m6A甲基转移酶),且仅在啮齿动物模型中进行,尚未在人类样本或更广泛的表观转录组标记中验证 阐明表观转录组机制在神经精神疾病中的作用,特别是青少年酒精暴露对大脑表观转录组调控的影响 大鼠脑组织(包括杏仁核中央核、海马CA1区、齿状回、杏仁基底外侧核、海马CA3区)中的神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞 空间转录组学 神经精神疾病 空间转录组学,表观转录组分析 NA 空间转录组数据,RNA表达数据 青少年间歇性乙醇暴露(AIE)大鼠模型 NA 空间转录组学 NA 超分辨三维空间转录组学方法(作者自主研发)
714 2026-02-21
Integrative multi-omics reveal a CD4⁺ T cell-derived six-gene signature linking the immune-stromal ecosystem to prognosis and immunotherapy selection in pancreatic cancer
2026-Jan-22, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据,揭示了一个源自CD4⁺ T细胞的六基因特征,该特征将胰腺癌的免疫-基质生态系统与预后及免疫治疗选择联系起来 首次从CD4⁺ T细胞角度构建了一个六基因特征,用于连接胰腺癌的免疫-基质生态系统、预后分层和免疫治疗选择,并通过单细胞RNA测序和细胞通讯分析揭示了其细胞定位和相互作用网络 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床队列进一步验证;体外细胞系实验未能完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 开发用于胰腺癌风险分层和指导免疫治疗选择的稳健生物标志物 胰腺癌患者(来自TCGA、GTEx、GEO数据库)、胰腺癌细胞系(H6C7、CAPAN-1、PANC-1) 生物信息学 胰腺癌 单细胞RNA测序、定量实时聚合酶链反应、Western印迹、生物信息学分析 六基因特征模型 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 TCGA和GTEx数据集(训练集)、GEO数据集GSE57495(验证集)、单细胞RNA测序数据集GSE212966 NA 单细胞RNA-seq NA NA
715 2026-02-21
The Camellia sinensis var. sinensis cv. Fuding Dabaicha genome unveils structural variation-driven metabolic innovation
2026-Jan-14, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序结合PacBio HiFi和ONT超长测序技术,构建了福鼎大白茶的高质量单倍型基因组,揭示了结构变异如何驱动茶叶代谢多样性 首次利用单细胞测序技术对茶叶精子细胞进行测序,结合长读长测序实现高精度单倍型基因组组装,并建立了基于半同胞的QTL定位平台 研究主要聚焦于福鼎大白茶品种,其他茶叶品种的基因组变异和代谢多样性可能未被全面覆盖 探究茶叶基因组结构变异与代谢多样性之间的关联 福鼎大白茶(Camellia sinensis var. sinensis cv. Fuding Dabaicha)的基因组和代谢产物 基因组学 NA 单细胞测序, PacBio HiFi测序, ONT超长测序 NA 基因组序列数据, 代谢组数据 107个精子细胞 PacBio, Oxford Nanopore Technologies 单细胞测序, 长读长测序 PacBio HiFi, ONT PacBio HiFi测序和ONT超长测序技术
716 2026-02-21
Scar-associated macrophages and biliary epithelial cells interaction exacerbates hepatic fibrosis in biliary atresia
2026-Jan, Pediatric research IF:3.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间定位数据,揭示了胆道闭锁中疤痕相关巨噬细胞与胆道上皮细胞相互作用加剧肝纤维化的机制 首次结合单细胞和空间转录组技术,系统解析了胆道闭锁肝脏微环境异质性,并识别出促进纤维化的关键细胞互作及诊断标志物 样本量较小(仅8例组织),且缺乏长期随访数据验证治疗靶点的临床转化潜力 探究胆道闭锁肝纤维化的微环境机制并开发诊断模型 人类肝脏组织(包括正常组织、胆总管囊肿组织和胆道闭锁组织) 数字病理学 胆道闭锁 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学 诊断模型(基于基因特征) 单细胞转录组数据,空间定位数据 8例组织(2例正常邻近组织,2例胆总管囊肿组织,4例胆道闭锁组织) NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
717 2026-02-21
Identifying potential therapeutic targets in periodontitis: a multi-omics approach integrating bulk and single-cell RNA sequencing with Mendelian randomization
2026-Jan, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究通过整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和转录组学分析,识别了与牙周炎相关的关键基因特征 采用多组学方法结合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和转录组学分析,识别了牙周炎相关的关键基因,并发现了四个枢纽基因 研究依赖于GEO数据库的公开数据集,样本来源和数量可能有限,且未进行实验验证 识别牙周炎的潜在治疗靶点 牙周炎相关的基因表达数据 自然语言处理 牙周炎 单细胞RNA测序, 转录组学分析, 孟德尔随机化 LASSO, 随机森林 RNA测序数据 三个独立数据集(具体数量未明确) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
718 2026-02-21
Multi-omics genetic study revealing ferroptosis regulator CTSB driving prostate cancer progression by modulating the immune microenvironment
2026-Jan, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究利用多组学孟德尔随机化方法,揭示了铁死亡调控因子CTSB通过调节免疫微环境驱动前列腺癌进展的因果作用机制 首次提供了铁死亡-免疫相互作用在前列腺癌中因果作用的证据,并识别CTSB为关键风险因子 研究主要基于遗传学关联分析,需要进一步的实验验证来阐明具体的分子机制 探究铁死亡基因/蛋白表达与前列腺癌之间的遗传因果关系及免疫微环境的中介作用 前列腺癌 生物信息学 前列腺癌 多组学孟德尔随机化,单细胞RNA测序,基因集富集分析,免疫浸润分析 孟德尔随机化模型 基因组,转录组,蛋白组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
719 2026-02-21
Androgen Signaling in ILC2s Drives Sex Differences in Helicobacter-induced Gastric Inflammation and Atrophy
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究揭示了雄激素通过调节2型先天淋巴细胞(ILC2)的活化,在幽门螺杆菌诱导的胃部炎症中发挥保护作用,并阐明了ILC2在驱动胃部癌前病变性别差异中的关键角色 首次发现雄激素信号通过调控ILC2的活性来影响幽门螺杆菌感染的胃部炎症反应,并明确了ILC2是驱动胃部癌前病变性别差异的主要调节因子 研究主要基于小鼠模型,其在人类中的直接相关性仍需进一步验证;且未详细探讨其他性激素(如雌激素)的潜在影响 探究雄激素如何影响幽门螺杆菌感染后的胃部炎症反应,并阐明其在胃部癌前病变性别差异中的作用机制 感染幽门螺杆菌的雄性和雌性小鼠,以及经手术去势或二氢睾酮处理的模型小鼠 单细胞组学与免疫学 胃癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,但涉及多种性别和处理条件的小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
720 2026-02-21
The Glutamine Metabolic Switch Influences the Response of Neonatal Intestinal Macrophages to Breast Milk
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨了谷氨酰胺和谷氨酸在新生儿坏死性小肠结肠炎(NEC)中对肠道巨噬细胞代谢重编程的双重作用及其机制 揭示了谷氨酰胺代谢开关(从谷氨酰胺酶GLS转向谷氨酸脱氢酶GLUD1)如何决定巨噬细胞的促炎或抗炎表型,并阐明了其在疾病不同阶段(预防期与进展期)产生相反效果的机制 研究主要基于新生大鼠NEC模型和体外骨髓来源巨噬细胞实验,人类数据为对已发表scRNA-seq数据的再分析,缺乏直接的人类体内验证 探究谷氨酰胺和谷氨酸在新生儿肠道炎症中的作用机制,为新生儿肠道疾病的个性化营养干预提供依据 新生大鼠坏死性小肠结肠炎(NEC)模型、骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)、已发表的人类新生儿NEC单细胞RNA测序数据 NA 坏死性小肠结肠炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、转录组学分析 NA 基因表达数据、流式细胞数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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