单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 1426 篇文献,本页显示第 681 - 700 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
681 2026-02-06
Single-Cell Transcriptomics Reveals Biomarkers for NK Cell Dysfunction in Endometriosis-Associated Immune Dysregulation
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了子宫内膜异位症中NK细胞功能障碍的生物标志物,并提出了GNLY、PRF1和ENTPD1作为潜在的分子诊断标志物 整合单细胞RNA测序与批量RNA测序数据,结合机器学习方法识别出三个关键基因,并发现ENTPD1在免疫调节和基质细胞迁移中的双重功能 样本量较小(仅3名患者和3个正常样本),且验证队列的AUC值在外部验证中有所下降 探究子宫内膜异位症中NK细胞功能障碍的生物标志物及其在免疫失调中的作用机制 子宫内膜异位症患者的病变组织和正常子宫内膜样本 数字病理学 子宫内膜异位症 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qPCR, 伤口愈合实验, Transwell实验 LASSO, SVM-RFE RNA测序数据, 基因表达数据 3名子宫内膜异位症患者的病变组织, 3个正常子宫内膜样本, 以及来自GEO的三个批量RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
682 2026-02-06
VST-DAVis: an R Shiny application and web-browser for spatial transcriptomics data analysis and visualization
2026, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 本文介绍了一个名为VST-DAVis的交互式R Shiny应用程序和网络浏览器,专为分析10x Genomics Visium HD平台生成的空间转录组学数据而设计 开发了一个用户友好的交互式工具,使无编程背景的研究者也能通过图形界面进行端到端的空间转录组学分析,并整合了多种流行的R分析包 NA 为空间转录组学数据分析提供一个直观、易用的分析平台 空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组学数据 NA 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium HD 10x Genomics Visium HD平台
683 2026-02-06
Engineering scalable vascularized kidney organoids for in vivo glomerular filtration with human endothelial integration
2026, npj biomedical innovations
研究论文 本文开发了一种可扩展的血管化肾脏类器官生产方法,用于体内肾小球滤过功能研究 通过动态培养环境和三角翼搅拌生物反应器,将血管化肾脏类器官的生产效率提高了50倍以上,并实现了人类内皮细胞整合的肾小球滤过功能 NA 开发可扩展的血管化肾脏类器官生产系统,用于肾脏疾病模型和再生医学应用 人类多能干细胞衍生的肾脏类器官 组织工程与再生医学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
684 2026-02-06
Single-cell RNA sequencing revealed cell heterogeneity in sagittal suture mesenchyme
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过整合10x Genomics和Smart-seq3单细胞转录组测序技术,首次识别了矢状缝间充质中的增殖性祖细胞群,揭示了其在颅骨快速发育中的关键作用 首次在发育中的颅缝生态位中识别出具有瞬时扩增细胞特征的增殖性祖细胞群,并阐明了SuSCs和TACs中的关键调控基因和信号网络 NA 探索颅缝间充质中细胞异质性及其在颅骨发育和稳态维持中的作用机制 矢状缝间充质细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序, 5-乙炔基-2'-脱氧尿苷检测, 原位杂交, 谱系追踪 NA 转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium, Smart-seq3 10x Genomics单细胞转录组测序与Smart-seq3技术整合
685 2026-02-06
TIMELESS Promotes LUAD Growth via Suppressing Transferrin-Mediated Ferroptosis and Reprograms the Tumor Microenvironment against Anti-PD-1 Immunotherapy
2026, Cancer communications (London, England)
研究论文 本研究揭示了RNA结合蛋白TIMELESS通过招募CNOT3加速转铁蛋白mRNA降解,从而抑制铁死亡并促进肺腺癌生长,并重塑肿瘤微环境以抵抗抗PD-1免疫治疗的分子机制 首次发现TIMELESS通过招募CNOT3复合物降解转铁蛋白mRNA来调控铁死亡,并阐明了其在肺腺癌生长和抗PD-1免疫治疗抵抗中的双重作用 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证相对有限;TIMELESS/TF轴在其他癌症类型中的普适性未探讨 阐明高表达的RNA结合蛋白TIMELESS在肺腺癌进展中的分子网络和机制作用 肺腺癌细胞、小鼠原位肺癌模型、临床组织微阵列样本 肿瘤生物学 肺癌 PAR-CLIP测序, RNA测序, 免疫沉淀-质谱, GST pull-down, 免疫荧光-荧光原位杂交, RNA免疫沉淀, poly(A)尾分析, RNA稳定性检测, 流式细胞术, 多重免疫荧光 NA 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质互作数据, 组织图像数据 来自TCGA-LUAD、GEO和单细胞RNA测序数据集的多个数据集,以及组织微阵列样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
686 2026-02-06
Research Progress of Interstitial Lung Disease Based on Single-Cell Sequencing Technology
2026, Canadian respiratory journal IF:2.1Q3
综述 本文总结了基于单细胞测序技术在间质性肺病(ILD)研究中的最新进展,重点聚焦于特发性肺纤维化、尘肺病和结缔组织病相关ILD 利用单细胞测序技术为揭示ILD的复杂发病机制提供了新视角,克服了传统研究方法的局限 NA 总结单细胞测序在ILD研究中的应用进展并展望未来研究方向 间质性肺病(ILD),包括特发性肺纤维化、尘肺病和结缔组织病相关ILD 数字病理学 肺病 单细胞测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
687 2026-02-05
Targeting PKMYT1 enhances antitumor immune responses to PD-L1 blockade in castration-resistant prostate cancer
2026-Jan-30, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了PKMYT1在去势抵抗性前列腺癌(CRPC)中作为肿瘤进展和免疫逃逸的关键双重调节因子,并证明靶向PKMYT1可增强抗PD-L1免疫治疗的疗效 首次将PKMYT1鉴定为CRPC中调节肿瘤免疫微环境的关键靶点,并阐明其通过激活cGAS-STING通路和干扰素信号来增强抗肿瘤免疫应答的机制 研究主要基于临床前模型(细胞系和小鼠模型),尚未在人体临床试验中得到验证 克服CRPC对免疫治疗的耐药性,开发新的联合治疗策略 去势抵抗性前列腺癌(CRPC) 肿瘤免疫学 前列腺癌 生物信息学分析、免疫组织化学、单细胞RNA测序、小鼠模型 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据、单细胞转录组数据 公共数据库中的前列腺癌样本、临床前列腺癌标本队列、前列腺癌细胞系、同基因小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
688 2026-02-05
Preventing surgery-induced natural killer cell suppression and metastases by inhibiting PI3K-gamma signaling in myeloid-derived suppressor cells
2026-Jan-29, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究探讨了手术诱导的髓源性抑制细胞(sx-MDSCs)通过PI3K-γ信号通路抑制自然杀伤细胞活性并促进术后转移的机制,并提出了PI3K-γ抑制剂作为潜在治疗策略 首次通过单细胞RNA测序和功能筛选,揭示了手术诱导的MDSCs中PI3K-γ信号通路的激活及其在术后免疫抑制和转移中的关键作用,并验证了PI3K-γ抑制剂在临床前模型中的治疗效果 研究样本量有限(n=55),且临床前模型结果需进一步在更大规模临床试验中验证 旨在功能表征手术诱导的MDSCs,并探索减轻其免疫抑制作用的潜在治疗策略 癌症患者(n=55)的手术样本和临床前小鼠模型 数字病理学 癌症 多色流式细胞术, 单细胞RNA测序, 小分子筛选 NA 细胞表型数据, 基因表达数据 55名癌症患者的手术样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
689 2026-02-05
Cellular and molecular mechanisms of nasolacrimal duct obstruction: New insights into CD4+ T cell-MIF-fibroblast pathways
2026-Jan-27, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了鼻泪管阻塞(NLDO)的细胞转录组图谱,并阐明了以巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)为中心的CD4+ T细胞-成纤维细胞通路在纤维化过程中的关键作用 首次在NLDO中应用单细胞RNA测序技术,识别了CD4+ T细胞通过MIF激活成纤维细胞并形成自持性反馈循环的新机制 样本量较小(4例用于单细胞测序,13例用于功能验证),且仅针对绝经后女性患者,可能限制结果的普适性 阐明鼻泪管阻塞的免疫调控机制,特别是纤维化过程的细胞和分子基础 鼻泪管阻塞患者的鼻泪管组织、体液样本 数字病理学 鼻泪管阻塞 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 4例患者用于单细胞RNA测序(67,658个细胞),13例患者用于组织学和体外功能实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
690 2026-02-05
Developmental single-cell atlas of coronary vessel growth and cardiomyocyte interaction in zebrafish
2026-Jan-15, Development (Cambridge, England)
研究论文 本研究结合高分辨率成像与单细胞RNA测序技术,系统描绘了斑马鱼冠状动脉血管发育的细胞与分子图谱,揭示了血管与心肌细胞相互作用的动态过程 首次构建斑马鱼冠状动脉发育的单细胞时空图谱,定义了四个发育阶段里程碑,并发现血管支架引导心肌细胞生长的新机制 研究局限于斑马鱼模型,哺乳动物冠状动脉发育可能存在物种特异性差异 解析冠状动脉血管发育的细胞分子机制及其与心肌细胞生长的协同关系 斑马鱼心脏发育过程中的冠状动脉血管网络与心室细胞 发育生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序、高分辨率成像、遗传操作技术 NA 单细胞转录组数据、显微图像数据 37,554个心室细胞,涵盖7-30mm体长范围的发育阶段 NA 单细胞RNA-seq NA NA
691 2026-02-05
Leveraging AI for cell biology discovery
2026-Jan-08, Biochemical Society transactions IF:3.8Q2
综述 本文综述了人工智能在细胞生物学中的多样化应用及其对显微镜、成像、药物发现和合成生物学等领域的影响 系统性地探讨了AI在单细胞分辨率图像分析、复杂生物数据模式识别、细胞行为建模以及蛋白质结构预测等方面的创新应用,并强调了AI工具民主化的未来方向 NA 探索人工智能在细胞生物学中的变革性作用及其对基础研究和治疗应用的潜在推动 细胞生物学中的复杂生物数据,包括细胞图像、单细胞转录组学数据、蛋白质结构和细胞行为 机器学习 NA 深度学习 NA 图像、生物数据 NA NA NA NA NA
692 2026-02-05
S2potAE: multimodal spatial spot autoencoder integrating image and transcriptomic features for deconvolution
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为S2potAE的多模态空间点自编码器框架,通过整合基因表达数据、空间坐标和组织学图像的形态特征,用于精确的空间转录组学点水平反卷积 S2potAE创新性地采用多级特征聚合策略,结合基于图的空间编码器和组织学图像的感知嵌入,并引入辅助病理分类任务以增强生物相关性和模型可解释性 NA 解决空间转录组学中由于粒度差异、批次效应和空间异质性导致的细胞类型比例准确确定难题 人类乳腺癌、小鼠大脑前部和人类背外侧前额叶皮层的模拟与真实数据集 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学 自编码器 基因表达数据、空间坐标、组织学图像 NA NA 空间转录组学 NA NA
693 2026-02-05
Advances and challenges in single-cell RNA sequencing data analysis: a comprehensive review
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
综述 本文全面回顾了单细胞RNA测序数据分析的进展与挑战,包括预处理、注释工具和多模态整合等计算策略 综述了新兴的计算策略,如SCTransform和Harmony用于预处理与批次整合,基于transformer的注释工具scGPT和CellTypist,以及多模态整合方法,并提出了促进临床应用的路线图 临床转化仍受数据稀疏性、批次效应和缺乏标准化基准等挑战限制,且存在罕见患者来源克隆再识别的伦理风险 回顾单细胞RNA测序数据分析的进展与挑战,并促进其临床转化 单细胞RNA测序数据及其分析计算策略 自然语言处理 胶质母细胞瘤, 严重COVID-19 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞ATAC测序 transformer, scGPT, CellTypist, scANVI 基因表达数据, 空间转录组数据, 表观遗传数据 超过100,000个细胞的队列, 预训练模型使用3,300万个细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞ATAC测序 10x Visium 10x Visium空间转录组平台
694 2026-02-05
Advancing single-cell omics and cell-based therapeutics with quantum computing
2026-Jan-02, Nature reviews. Molecular cell biology
路线图文章 本文探讨了量子计算如何与单细胞组学技术结合,以克服计算瓶颈并推动细胞行为建模和细胞疗法的发展 提出了量子计算作为新型计算范式,用于解决单细胞分析中的计算挑战,并展示了其在细胞疗法中的潜在应用案例 NA 探索量子计算在单细胞组学和细胞疗法中的整合潜力,以生成变革性的细胞行为模型 单细胞和空间转录组学、多组学技术以及细胞群体 机器学习和计算生物学 NA 单细胞转录组学、空间转录组学、多组学技术 NA 单细胞组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
695 2026-02-05
AugGCL: Multimodal graph learning for spatial transcriptomics analysis with enhanced gene and morphological data
2026-Jan, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为AugGCL的增强图卷积学习框架,用于空间转录组学分析,通过增强基因和形态学数据来改善空间结构解码和基因表达重建 AugGCL引入了邻域信息聚合机制,整合表达相似性和空间邻近性构建加权图和增强表达矩阵,同时采用双流加权图卷积网络联合建模基因特征和图像衍生形态信息,增强弱空间信号并锐化边界 NA 旨在解决空间转录组学中表达稀疏性、复杂组织结构和弱空间信号等挑战,以重建解剖学准确的空间域 人类背外侧前额叶皮层、乳腺癌和小鼠胚胎数据集 空间转录组学 乳腺癌 空间转录组学 图卷积网络(GCN) 基因表达数据和图像数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
696 2026-02-05
Single-cell multi-omics sequencing reveals the immunological disturbance underlying Kawasaki disease
2026, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术,揭示了川崎病中免疫细胞群的异质性及其潜在的免疫失调机制 首次在单细胞水平上整合多组学数据(scRNA-seq和scATAC-seq)系统描绘川崎病的免疫细胞异质性和染色质可及性变化,并识别出与静脉注射免疫球蛋白耐药相关的特定NK细胞亚群 样本量较小(仅2名川崎病患儿和2名健康对照),且为横断面研究,无法评估疾病进程中的动态变化 阐明川崎病的免疫失调细胞异质性和调控机制 川崎病患儿和健康对照儿童的外周血单个核细胞 单细胞多组学 川崎病 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 NA 单细胞转录组数据,单细胞染色质可及性数据 4例样本(2名川崎病患儿,2名年龄匹配的健康对照儿童) NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq,单细胞多组学 NA NA
697 2026-02-05
Hypoxia-Induced Osteopontin-Positive Glioma-Associated Macrophages Facilitate Glioma Mesenchymal Transition via NF-κB Pathway Activation
2026, Cancer communications (London, England)
研究论文 本研究揭示了缺氧诱导的骨桥蛋白阳性胶质瘤相关巨噬细胞通过NF-κB通路促进胶质母细胞瘤间质转化的机制 首次发现缺氧通过H3K4me3-WDR5表观遗传轴诱导巨噬细胞表达骨桥蛋白,并阐明这些OPN阳性GAMs通过分泌OPN激活CD44/NF-κB/PD-L1通路促进胶质瘤间质转化 研究主要基于体外和动物模型,临床样本验证相对有限,且未深入探讨其他缺氧相关因子在GAMs调控中的作用 阐明缺氧条件下胶质瘤相关巨噬细胞促进胶质母细胞瘤进展的分子机制 胶质母细胞瘤细胞、胶质瘤相关巨噬细胞、临床胶质瘤样本 数字病理学 胶质母细胞瘤 转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组分析、染色质免疫沉淀、实时定量PCR、Western印迹、免疫荧光 NA RNA测序数据、空间转录组数据、蛋白质印迹数据、免疫荧光图像 未明确说明具体样本数量,但包含临床样本和体内模型 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
698 2026-02-05
CXCL8/SDC1 axis mediates tumor stem cell interactions to drive remote transfer in thyroid cancer
2026-Jan, Journal of pharmaceutical analysis IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组测序,揭示了CXCL8/SDC1轴通过激活JAK-STAT信号通路驱动甲状腺癌干细胞自我更新和远处转移的分子机制 首次在甲状腺癌中利用单细胞和空间转录组测序技术,结合功能实验和动物模型,系统阐明了CXCL8/SDC1轴介导肿瘤干细胞与单细胞互作网络促进远处转移的新机制 研究主要基于体外细胞系和动物模型,临床样本验证的队列规模未明确说明,且缺乏对CXCL8/SDC1轴靶向治疗的深入药效学评估 探究甲状腺癌远处转移的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 甲状腺癌患者肿瘤样本、FTC-238细胞系、裸鼠模型 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组测序、肿瘤组织转录组分析、ELISA、Western blotting、球体形成实验、集落形成实验、CCK-8实验、Transwell实验 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、批量转录组数据、临床数据 甲状腺癌患者肿瘤样本(具体数量未明确)、FTC-238细胞系、裸鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
699 2026-02-05
IER3 Promotes Malignant Progression of Colorectal Cancer Through the NF-κB Pathway
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 本研究揭示了应激反应基因IER3通过激活NF-κB通路,驱动结直肠癌恶性进展并重塑免疫抑制性肿瘤免疫微环境 首次在单细胞分辨率上鉴定出与侵袭性疾病和不良预后相关的IER3表达恶性亚群,并阐明IER3通过FN1-CD44轴重塑免疫微环境的机制 未明确IER3表达调控的具体上游机制,临床样本量可能有限,动物模型验证需进一步扩展 探究IER3在结直肠癌发病机制和免疫调节中的功能作用 结直肠癌临床样本及体外/体内模型 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 临床样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
700 2026-02-05
Construction of a Mitochondria-Related Gene Diagnostic Model Based on Integrated Multiomics Data and Functional Validation of ANK2 as a Key Regulator in Colorectal Cancer
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据,构建了一个基于线粒体相关基因的结直肠癌诊断模型,并验证了ANK2作为关键调控因子的功能 整合TCGA和多个GEO公共数据集的转录组数据与MitoCarta3.0数据库的线粒体相关基因数据,利用LASSO回归和SVM-RFE两种机器学习算法识别关键基因并构建诊断模型,并结合单细胞RNA测序数据和分子生物学实验进行功能验证 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床队列进一步验证模型的诊断效能 开发一种基于线粒体相关基因的新型、高效的结直肠癌分子诊断方法 结直肠癌组织和细胞系 生物信息学 结直肠癌 转录组测序,单细胞RNA测序,qRT-PCR,Western blotting,免疫组化 LASSO回归,SVM-RFE 基因表达数据,单细胞数据 1174个样本(来自TCGA和GEO数据集:GSE21510,GSE44076,GSE9348),以及单细胞数据集GSE245552 NA bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
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