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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2026-05-05 |
Identification of a migrasome-related lncRNA signature and its prognostic and immunological role in bladder cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1763443
PMID:42079608
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研究论文 | 建立了一个与迁移体相关的长链非编码RNA签名,用于预测膀胱癌患者的预后和免疫特征 | 首次识别并构建了基于迁移体相关lncRNA的预后签名,并整合单细胞RNA测序分析揭示其在膀胱癌微环境中的细胞异质性和细胞间通讯模式 | 未提及具体局限性 | 识别与膀胱癌预后相关的迁移体相关lncRNA,并评估其与免疫微环境和药物敏感性的关系 | 膀胱癌患者 | 机器学习 | 膀胱癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Cox回归, LASSO回归 | 转录组数据, 临床数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA的膀胱癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 682 | 2026-05-05 |
Innate immune profiling reveals a specific reduction of CD57+CD62L+CD161+ NK cells in CMV-positive males with hypertension
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1749702
PMID:42079601
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研究论文 | 利用质谱流式和单细胞RNA测序揭示高血压男性患者中CMV阳性状态下CD57+CD62L+CD161+ NK细胞特异性减少及其亚群重塑机制 | 首次发现高血压导致CD57+CD62L+CD161+ NK细胞整体减少及致病性亚群重塑,即KLRC2high适应性亚群特异性丧失,而FCER1Ghigh细胞毒性亚群相对保留并成为优势群体 | 样本量较小(仅男性),机制验证依赖IL-15信号通路关联分析,缺乏直接因果实验 | 探究高血压中先天免疫细胞(特别是NK细胞)的失调机制及致病作用 | 高血压和血压正常男性的外周血单个核细胞(PBMC)中的NK细胞 | 机器学习和生物信息学 | 高血压 | 质谱流式(CyTOF)、全谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 质谱流式数据、流式细胞术数据、单细胞转录组数据 | 初始队列10例高血压和10例血压正常男性;验证队列10例高血压和6例血压正常男性 | Fluidigm | 质谱流式, 单细胞RNA测序 | CyTOF, 10x Chromium | CyTOF用于先天免疫谱分析;10x Chromium用于单细胞RNA测序 |
| 683 | 2026-05-05 |
Single-cell landscape of melanoma reveals ETV5-driven C3 ID4+ tumor subpopulation with extracellular vesicle-associated immunosuppressive and pro-metastatic potential
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1795778
PMID:42079653
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组分析,在黑色素瘤中鉴定出ETV5驱动的C3 ID4+肿瘤亚群,该亚群具有细胞外囊泡相关的免疫抑制和促转移潜力 | 首次通过单细胞转录组整合分析揭示ETV5作为关键转录调控因子驱动C3 ID4+肿瘤亚群,并阐明其通过TGF-β相关细胞间通讯和细胞外囊泡信号促进黑色素瘤进展和免疫逃逸的机制 | 缺乏大规模临床样本验证及功能实验的体内模型支持,且ETV5下游具体调控网络和细胞外囊泡的详细机制尚未完全解析 | 探究黑色素瘤中未分化的肿瘤亚群及其在恶性进展和免疫逃逸中的作用 | 10例I/III期黑色素瘤标本的肿瘤微环境和肿瘤异质性 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | CytoTRACE, CellChat, SCENIC, CRISPR/Cas9 | 单细胞转录组数据 | 10例I/III期黑色素瘤标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 684 | 2026-05-05 |
scRNA sequencing revealed HIV-associated inflammation-mediated lung epithelial dysregulation and fibroblast remodeling
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1789140
PMID:42079650
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示HIV感染导致肺部上皮失调和成纤维细胞重塑的机制 | 首次在单细胞水平上系统描绘HIV感染对肺上皮、免疫和基质细胞群的转录重组影响,发现肺泡上皮细胞向间质表型转变及成纤维细胞促炎应激反应增强 | 未探讨这些通路在HIV相关肺部病理中的治疗相关性,且样本量可能有限 | 表征HIV感染在肺部的细胞和分子景观,评估上皮重塑和HIV驱动的肺细胞组成及转录程序变化 | 来自HIV感染者和未感染个体的肺组织,包括吸烟者和非吸烟者 | 单细胞转录组学 | HIV相关肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | UMAP聚类 | 单细胞转录组数据 | 总共54,230个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 685 | 2026-05-05 |
Tumor reactivity assessment using clonal expression reveals tumor reactive CD8+ T cell heterogeneity across solid tumors
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1815974
PMID:42079667
|
研究论文 | 利用克隆表达评估肿瘤反应性,揭示实体瘤中肿瘤反应性CD8+ T细胞的异质性 | 提出一种无需数据集预处理的克隆型水平CD8+ TRT分类器TRACE,克服了单数据集、供体或适应症训练的局限性,并可在新测试数据集上直接应用 | 未在论文中明确提及局限性 | 构建并验证一种基于单细胞RNA测序的肿瘤反应性T细胞预测算法,以评估不同实体瘤中TRT的频率 | 肿瘤浸润淋巴细胞和血液T细胞克隆型 | 机器学习 | 肺癌,结直肠癌,胰腺癌,黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自多个肿瘤图谱的数百名患者样本(涵盖肺癌、结直肠癌和胰腺癌) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 686 | 2026-05-05 |
Application of multi-omics in systemic autoimmune rheumatic diseases: a bibliometric and visualization analysis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1759610
PMID:42079670
|
综述 | 利用文献计量学和可视化分析,系统回顾2005至2025年间多组学技术在系统性自身免疫性风湿病中的应用现状、发展趋势及主题演变 | 首次通过文献计量学方法,系统描绘了多组学在SARD研究中从体液分子表征向单细胞免疫细胞层面高分辨率分析的转化路径及国际合作模式 | 仅依赖Web of Science核心合集数据库,可能存在文献覆盖不全;操作化定义仅纳入至少两个组学层面的研究,可能排除了单一组学但有重要贡献的工作 | 系统综述多组学技术在系统性自身免疫性风湿病研究中的应用现状与发展趋势,指导未来研究方向 | 2005至2025年间Web of Science核心合集中关于多组学在SARD应用的英文文献 | 自然语言处理 | 风湿性自身免疫疾病 | NA | NA | 文本 | 2576篇文献(2072篇研究论文和504篇综述) | NA | NA | NA | NA |
| 687 | 2026-05-05 |
Integrated analysis identifies a palmitoylation-associated prognostic model (ACSM5/SKA3) for lung adenocarcinoma across multiple cohorts
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.21160
PMID:42079738
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研究论文 | 通过整合分析确定了肺腺癌中一个棕榈酰化相关预后模型(ACSM5/SKA3),并在多个队列中验证其预后价值 | 首次构建了基于棕榈酰化相关基因的ACSM5/SKA3双基因预后模型,该模型能够分层患者预后并反映代谢、增殖和免疫微环境状态,为肺腺癌风险分层和治疗设计提供棕榈酰化相关基础 | 模型区分性能中等(TCGA中1年、3年、5年AUC分别为0.717、0.733、0.697),可能需进一步优化 | 探究棕榈酰化相关基因在肺腺癌中的预后价值及其与肿瘤微环境的关系 | 肺腺癌患者 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR | LASSO-Cox回归模型 | 转录组数据(RNA-seq), 单细胞RNA测序数据(scRNA-seq) | TCGA-LUAD队列及三个GEO外部验证队列,包含单细胞RNA测序数据集和配对的LUAD及相邻组织 | NA | NA | NA | NA |
| 688 | 2026-05-05 |
An optimization framework for hierarchical clustering
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag107
PMID:42079811
|
研究论文 | 提出一种基于平均链接的层次聚类优化框架,通过集成多视图相似性度量提升聚类质量 | 首次将局部与全局视角结合,通过多视图数据生成与集成学习优化层次聚类,克服贪心算法的结构性次优问题 | 未明确提及计算复杂度及大规模数据集上的扩展性 | 改进层次聚类的结构最优性 | 合成数据集、经典基准数据集及单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 平均链接层次聚类、集成学习 | 数值数据 | 多种合成及经典数据集,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 689 | 2026-05-04 |
Nanoparticle-Mediated PPAR Modulation of Macrophage Polarization in Radiation Enteritis: A Narrative Review
2026, Drug design, development and therapy
DOI:10.2147/DDDT.S595650
PMID:41913737
|
综述 | 本文探讨了巨噬细胞极化与PPAR信号在放射性肠炎中的分子机制,综述了PPAR靶向治疗及纳米递送策略 | 系统整合了放射性肠炎中PPAR调节巨噬细胞极化的分子机制、纳米递送技术和多组学方法,提出了精准纳米药物的开发方向 | 作为叙述性综述,缺乏原始实验数据验证,未对纳入文献进行系统性偏倚评估 | 阐明放射性肠炎中PPAR信号调控巨噬细胞极化的机制,并综述靶向治疗与纳米递送策略 | 放射性肠炎中的巨噬细胞和PPAR信号通路 | 机器学习 | 放射性肠炎 | 单细胞转录组学、空间组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 690 | 2026-05-04 |
Gut-Brain Axis Dysregulation in Inflammatory Bowel Disease: Implications for Coagulation Abnormalities and Extraintestinal Manifestations
2026, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S590621
PMID:41913906
|
综述 | 探讨炎症性肠病中肠-脑轴失调对凝血异常及肠外表现的影响 | 提出通过整合多组学分析和人工智能辅助系统来管理IBD相关凝血功能障碍的新范式 | 缺乏严格随机对照试验的验证,肠-脑-肝轴对凝血的调控机制尚未阐明 | 阐明肠-脑轴在IBD相关凝血异常和肠外表现中的作用机制并探索新的管理策略 | 炎症性肠病(IBD)患者 | 机器学习 | 炎症性肠病 | 多组学分析,宏基因组学,代谢组学,单细胞转录组学 | NA | 宏基因组数据,代谢组数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 691 | 2026-05-03 |
Identification of Lupus Immune Complex-Driven Pathogenic Pro-inflammatory Monocytes and Macrophages in Systemic Lupus Erythematosus
2026-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.21.700902
PMID:41648138
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析,揭示狼疮免疫复合物驱动的促炎性单核细胞和巨噬细胞在系统性红斑狼疮发病机制中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合蛋白组学分析,系统阐明狼疮免疫复合物(如U1-snRNP、dsDNA、Ro60)刺激下促炎性单核/巨噬细胞的转录组和蛋白表达变化,并发现这些细胞在狼疮患者皮肤、肾脏和外周血中扩增,且与I型干扰素信号独立作用 | 未明确说明局限性,但可能包括样本量有限、仅基于体外刺激实验和公共数据集分析,缺乏直接体内验证机制 | 探究狼疮免疫复合物刺激驱动的单核吞噬细胞(单核细胞和巨噬细胞)的异质性和功能,阐明其在系统性红斑狼疮发病中的作用 | 系统性红斑狼疮患者的单核细胞、巨噬细胞,以及狼疮免疫复合物(U1-snRNP、dsDNA、Ro60)刺激的人单核细胞 | 单细胞转录组学,免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序,蛋白组学分析 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白表达数据 | 涉及狼疮患者皮肤、肾脏和外周血样本,以及体外培养的人单核细胞,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 692 | 2026-05-03 |
Exploring Vitamin D Signaling-Associated Biomarkers and Their Diagnostic Value in Diabetic Retinopathy: A Combined Transcriptomic and Single-Cell Analysis With Experimental Validation
2026, Journal of diabetes research
IF:3.6Q2
DOI:10.1155/jdr/7240252
PMID:42059276
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研究论文 | 通过转录组和单细胞分析结合实验验证,探索糖尿病视网膜病变中维生素D信号相关的生物标志物及其诊断价值 | 首次系统识别出DR中VD信号相关的下游候选基因SLC36A1和RAB23,并通过单细胞分析揭示其细胞异质性和免疫细胞互作网络 | 生物标志物表达验证仅基于临床样本的RT-qPCR,尚缺乏更大样本量和功能研究的支持 | 识别糖尿病视网膜病变中与维生素D信号相关的生物标志物,并评估其诊断价值 | 糖尿病视网膜病变患者样本及公开数据库中的基因表达数据 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | 支持向量机递归特征消除(SVM-RFE) | 基因表达数据 | 包含公开数据集及临床样本,临床样本中DR组与对照组各若干例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 693 | 2026-05-03 |
The Role of Chemokine-Related Genes in Diffuse Large B-Cell Lymphoma Prognosis and Tumor Microenvironment Characteristics
2026, Analytical cellular pathology (Amsterdam)
DOI:10.1155/ancp/6659091
PMID:42060374
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研究论文 | 该研究探讨了趋化因子相关基因在弥漫大B细胞淋巴瘤预后及肿瘤微环境特征中的作用 | 首次基于趋化因子相关基因构建预后风险模型,并揭示其与肿瘤免疫微环境的关联 | NA | 研究趋化因子相关基因与弥漫大B细胞淋巴瘤预后及免疫微环境的潜在关联 | 弥漫大B细胞淋巴瘤患者 | 机器学习 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | Lasso-Cox回归分析 | Lasso-Cox | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 694 | 2026-05-03 |
Single-cell RNA sequencing of healthy and diseased rat temporomandibular joint condyle cartilage
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0348175
PMID:42060618
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析健康与骨关节炎大鼠颞下颌关节髁状突软骨的细胞组成和变化 | 首次在单细胞水平解析颞下颌关节软骨的细胞异质性,揭示纤维软骨细胞样群体来源的三种细胞命运及共享祖细胞来源的两种软骨细胞命运,发现多效蛋白在增殖区软骨细胞祖细胞中特异性表达 | 未明确提及具体局限性,但可推测大鼠模型与人类TMJOA的差异可能限制临床转化 | 阐明颞下颌关节骨关节炎的细胞病理变化机制,为疾病治疗提供潜在靶点 | 成年大鼠的健康与骨关节炎诱导的髁状突软骨 | 单细胞转录组学 | 颞下颌关节骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 成年大鼠髁状突软骨样本(健康组与OA诱导组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 695 | 2026-05-02 |
Temporal and Spatial Gene Expression Dynamics in Neonatal HI Hippocampus with Focus on Arginase
2026-Jan-28, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15030253
PMID:41677619
|
研究论文 | 利用空间单细胞转录组学分析新生小鼠缺氧缺血后海马中与精氨酸酶相关的时间与空间基因表达动态 | 首次在新生小鼠缺氧缺血模型中通过空间分辨单细胞转录组学(seqFISH)揭示微胶质细胞从早期效应吞噬到晚期的纤维化重塑转变,并发现精氨酸酶-1(ARG1)相关信号通路的关键调控作用 | 未提及 | 表征新生小鼠缺氧缺血后微胶质细胞中精氨酸酶-1相关的通路,识别不同阶段的效应吞噬和纤维化进程 | 新生小鼠(P9)海马组织 | 空间转录组学, 计算生物学 | 缺氧缺血性脑损伤 | seqFISH(空间分辨单细胞转录组学) | NA | 基因表达数据 | 新生小鼠(P9)脑样本,评估时间点为缺氧缺血后24小时(D1)和5天(D5) | NA | 单细胞RNA测序(空间转录组学) | NA | NA |
| 696 | 2026-05-02 |
Tumor-infiltrating natural killer cell profiling for therapeutic stratification in patients with resectable non-small cell lung cancer
2026-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.01.696292
PMID:41509400
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research paper | 通过对肿瘤浸润自然杀伤细胞的单细胞RNA测序分析,研究吸烟相关的免疫细胞特征在可切除非小细胞肺癌患者治疗分层中的作用 | 首次鉴定出两种与吸烟和慢性阻塞性肺病严重程度相关的自然杀伤细胞亚型(应激反应性NK细胞和适应性免疫调节NK细胞),并揭示它们在不同治疗策略中的预测价值 | 样本量相对较小,且为回顾性研究,需要前瞻性队列验证;此外,未明确NK细胞亚型的功能机制 | 寻找吸烟相关的免疫细胞决定因素,以指导非小细胞肺癌患者的治疗策略优化 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织和免疫细胞 | machine learning | lung cancer | single-cell RNA sequencing, bulk RNA sequencing | NA | sequencing data | 61份肺组织用于单细胞RNA测序,19份浸润性肺腺癌样本用于验证,102份手术切除的非小细胞肺癌和24例新辅助化疗免疫治疗患者样本用于反卷积和结果分析 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 697 | 2026-05-02 |
Integrated Mendelian Randomization and Single-Cell RNA Sequencing Analyses Reveal Lactate Metabolism as a Key Pathway in COVID-19-Induced Pulmonary Fibrosis
2026, Canadian respiratory journal
IF:2.1Q3
DOI:10.1155/carj/1049336
PMID:41532065
|
研究论文 | 本研究整合孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序技术,揭示乳酸代谢是COVID-19诱发肺纤维化的关键通路 | 首次通过MR和scRNA-seq联合分析揭示乳酸代谢在COVID-19相关肺纤维化中的中介作用,并鉴定SLC16A4为关键乳酸转运基因 | 未明确提及具体局限性,但可能包括样本量有限、因果推断需进一步验证等常见限制 | 探究COVID-19诱发肺纤维化的分子机制及潜在治疗靶点 | COVID-19患者与特发性肺纤维化(IPF)的因果关系及肺上皮细胞中的乳酸代谢机制 | 机器学习 | 肺纤维化 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 698 | 2026-05-02 |
Research Progress of Interstitial Lung Disease Based on Single-Cell Sequencing Technology
2026, Canadian respiratory journal
IF:2.1Q3
DOI:10.1155/carj/8863968
PMID:41641446
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综述 | 基于单细胞测序技术的间质性肺疾病研究进展综述 | 利用单细胞测序技术揭示间质性肺疾病发生发展的复杂机制,为传统研究方法无法完全解析的领域提供新思路 | NA | 总结单细胞测序技术在特发性肺纤维化、尘肺病和结缔组织病相关间质性肺疾病中的最新研究进展,并概述未来研究重点 | 间质性肺疾病,包括特发性肺纤维化、尘肺病和结缔组织病相关间质性肺疾病 | 机器学习 | 间质性肺疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 699 | 2026-05-02 |
Role of dual specificity phosphatase 1 in influencing inflammatory pathways in macrophages modulated by Borrelia burgdorferi lipoproteins
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1766756
PMID:42023246
|
研究论文 | 本研究利用多组学方法揭示了博氏疏螺旋体脂蛋白通过调节双特异性磷酸酶1影响巨噬细胞炎症通路的机制 | 首次整合单细胞RNA测序和蛋白质组学方法系统解析博氏疏螺旋体脂蛋白诱导的巨噬细胞信号网络,并发现DUSP1是脂蛋白驱动先天免疫反应的关键调节因子 | 研究仅使用了纯化脂蛋白刺激的鼠源骨髓来源巨噬细胞,未考虑完整病原体感染的复杂性 | 阐明博氏疏螺旋体脂蛋白在巨噬细胞中激活的信号通路及其调控机制 | 鼠源骨髓来源巨噬细胞 | 机器学习和数字病理学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、药理学抑制、海马细胞外通量分析 | NA | 基因表达数据和蛋白质组数据 | 不同浓度脂蛋白处理的鼠源骨髓来源巨噬细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium平台用于单细胞RNA测序建库 |
| 700 | 2026-05-02 |
Single-cell transcriptomics of bronchoalveolar lavage reveals divergent macrophage subpopulations and trajectories in interstitial lung disease
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0347852
PMID:42054404
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析支气管肺泡灌洗液,揭示间质性肺疾病中不同的巨噬细胞亚群及其分化轨迹 | 首次在单细胞分辨率下全面表征了不同间质性肺疾病亚型的支气管肺泡灌洗液免疫细胞组成,并揭示了与端粒长度相关的巨噬细胞亚群变化 | 样本量较小(24例男性患者),且仅包括男性,可能限制结果的普适性 | 表征不同间质性肺疾病中支气管肺泡灌洗液的免疫细胞群体,并探究外周血白细胞端粒长度缩短对免疫谱的影响 | 来自间质性肺疾病患者的支气管肺泡灌洗液样本 | 单细胞转录组学 | 间质性肺疾病(包括特发性肺纤维化、过敏性肺炎、结节病和矽肺) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 24例男性患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |