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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2026-05-08 |
Galectin-3 promotes FBXL5-dependent ubiquitination and degradation of YAP1 to constrain colorectal cancer growth
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1769656
PMID:42093989
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研究论文 | 本研究探讨了Galectin-3通过FBXL5依赖性泛素化降解YAP1以抑制结直肠癌生长的机制 | 首次揭示Gal-3通过FBXL5介导的泛素化途径促进YAP1蛋白降解,构成Gal-3-FBXL5-YAP1信号轴,并提出该轴在抑制结直肠癌进展中的新角色 | 需通过TEAD报告基因实验及YAP1拯救或突变分析进一步验证该信号轴的因果框架 | 阐明Gal-3在结直肠癌中的临床相关性及其调控FBXL5和YAP1的分子机制 | 结直肠癌患者组织样本及细胞系 | 分子生物学 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫共沉淀, 泛素化检测 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据, 小鼠模型数据 | TCGA及单细胞RNA测序数据集;细胞实验及小鼠异种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 大量RNA-seq | NA | NA |
| 662 | 2026-05-08 |
Loss of SHP-1 in CD11c+ cells impairs anti-tumor immunity
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1710547
PMID:42093998
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研究论文 | 通过条件性基因敲除小鼠模型,研究SHP-1在CD11c+细胞(包括树突状细胞和巨噬细胞)中缺失对抗肿瘤免疫的影响 | 首次揭示SHP-1在抗原呈递细胞而非CD8+ T细胞中发挥关键免疫调节作用,并证明其在cDC1和巨噬细胞中通过不同机制影响抗肿瘤免疫 | 未具体说明研究样本量、临床相关性验证及具体分子机制细节 | 探究SHP-1在CD11c+抗原呈递细胞中缺失对抗肿瘤免疫应答的影响 | ItgaxΔPtpn6、Xcr1ΔPtpn6和Lyz2ΔPtpn6条件性基因敲除小鼠及其MC38肿瘤模型 | 免疫学 | 癌症 | 条件性基因敲除、单细胞RNA测序、流式细胞术 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | 多种基因型小鼠及肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 663 | 2026-05-08 |
Multi-functional Small Molecule for Regenerative Healing of Avascular Meniscus Tears: Modulation of Inflammation, Differentiation, and Multi-Tissue Crosstalk
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.132326
PMID:42094591
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研究论文 | 本研究报道了一种新型小分子4-PPBP,作为σ1受体激动剂,通过调节炎症、分化和多组织串扰促进无血管半月板撕裂的再生愈合 | 首次发现4-PPBP通过激活滑膜间充质干细胞和调节巨噬细胞介导的炎症,经多组织串扰促进无血管半月板愈合,并利用单细胞RNA测序揭示细胞间通讯机制 | NA | 开发可促进无血管半月板撕裂愈合的多功能小分子治疗药物 | 半月板细胞、滑膜间充质干细胞、巨噬细胞、成纤维细胞、软骨细胞、纤维软骨细胞、脂肪细胞 | NA | 骨关节炎 | scRNA-seq, CellChat分析 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 664 | 2026-05-08 |
Cell type-specific alterations in fatty acid metabolism in neuronal subpopulations of schizophrenia and construction of a diagnostic model
2026, Frontiers in psychiatry
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fpsyt.2026.1770038
PMID:42094829
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研究论文 | 本研究整合单细胞和批量RNA测序,探究精神分裂症患者背外侧前额叶皮层中脂肪酸代谢相关基因的细胞类型特异性改变,并构建诊断模型 | 首次结合单细胞与批量RNA测序揭示精神分裂症神经元亚群中脂肪酸代谢的细胞类型特异性失调,并基于关键基因构建了具有转化潜力的五基因诊断模型 | 模型在外部验证队列中的AUC为0.779,提示泛化性能可能有限;仅使用MK-801诱导的小鼠模型进行验证,未在人体组织中进行直接验证 | 研究精神分裂症患者背外侧前额叶皮层中脂肪酸代谢相关基因的细胞类型特异性变化及其作为诊断生物标志物的潜力 | 精神分裂症患者和对照的背外侧前额叶皮层组织样本 | 机器学习 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、qPCR | LASSO回归 | 基因表达数据 | 9例精神分裂症患者和14例对照的单细胞测序样本,以及两个批量RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 665 | 2026-05-08 |
Association of the CXCL-ACKR1 Signaling Axis with the Angiogenic Microenvironment in Endometrial Cancer: A Single-Cell Transcriptomic Analysis
2026, International journal of women's health
DOI:10.2147/IJWH.S582387
PMID:42094869
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,探讨CXCL信号通路在子宫内膜癌血管生成中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次在单细胞水平揭示CXCL-ACKR1信号轴与子宫内膜癌血管生成微环境的关联,并鉴定出ACKR1作为抗血管生成治疗的新靶点 | 未提及具体局限性,但可能包括样本量较小或缺乏功能验证实验 | 研究子宫内膜癌中CXCL信号通路在血管生成中的作用,评估其作为治疗靶点的潜力 | 18例子宫内膜癌和正常对照组织的单细胞RNA测序数据 | 癌症研究 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18个样本(子宫内膜癌和正常对照组织) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 666 | 2026-05-08 |
The Role of COQ10B in Tumor Progression and Its Association with Immune Escape in Esophageal Squamous Cell Carcinoma: A Multi-Omics and Functional Analysis
2026, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S581929
PMID:42095211
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研究论文 | 本研究通过多组学和功能分析,探讨COQ10B在食管鳞状细胞癌进展中的作用及其与免疫逃逸的关联 | 首次系统揭示COQ10B在食管鳞癌中通过激活PI3K/AKT/HIF-1A信号通路促进肿瘤进展和免疫逃逸的机制 | 未提及具体局限性 | 阐明COQ10B在食管鳞状细胞癌中的功能及其调控肿瘤免疫微环境的潜在机制 | 食管鳞状细胞癌(ESCC),TE-1细胞,C57BL/6小鼠皮下异种移植模型 | 机器学习 | 肺癌 | NGS, RNA-seq | NA | 文本 | TCGA和GEO数据库样本,单细胞测序数据,TE-1细胞,C57BL/6小鼠 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | TCGA和GEO数据库的批量RNA-seq及单细胞RNA-seq数据 |
| 667 | 2026-05-06 |
DeepSpaceDB: a spatial transcriptomics atlas for interactive in-depth analysis of tissues and tissue microenvironments
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1117
PMID:41160880
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研究论文 | 介绍DeepSpaceDB——一个用于交互式深度分析组织及组织微环境的空间转录组图谱数据库 | 该数据库专注于10X Genomics Visium样本,提供高级交互式分析工具与跨样本比较功能,区别于仅注重平台覆盖而忽视功能的数据库 | 当前版本仅支持10X Genomics Visium样本,且分析需依赖用户上传或已有的数据集 | 构建一个用户友好的空间转录组数据库,支持灵活探索、交互式比较及高级分析 | 健康及疾病状态下的组织样本,如阿尔茨海默病模型小鼠的海马区域 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明具体数量,但包含多个组织和疾病模型的样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium FFPE或新鲜冰冻组织分析 |
| 668 | 2026-05-06 |
Antibody Generation Using Cancer-Derived Small Extracellular Vesicles (sEVs): A Platform for Targeted Cancer Therapy and Potential Personalized Applications
2026-Jan, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506918
PMID:41311345
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研究论文 | 利用癌症来源的小细胞外囊泡生成靶向单克隆抗体,并将其功能化于T细胞来源的小细胞外囊泡上,用于靶向癌症治疗 | 首次利用癌症来源的小细胞外囊泡作为免疫原,生成高特异性或细胞毒性单克隆抗体,并通过抗体功能化T细胞来源的小细胞外囊泡实现肿瘤靶向药物递送 | 未提及研究的局限性,如样本类型单一(仅卵巢癌细胞系)或临床转化潜力的评估不足 | 开发一种基于癌症来源小细胞外囊泡的抗体生成平台,用于靶向癌症治疗和个性化医学 | 人卵巢癌细胞系OVCAR-8来源的小细胞外囊泡及CD8⁺ T细胞来源的小细胞外囊泡 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录数据, 空间转录数据 | 小鼠模型(具体数量未提及),OVCAR-8肿瘤样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium 空间转录组学平台用于分析抗体功能化小细胞外囊泡诱导的转录变化 |
| 669 | 2026-05-06 |
DrugSurvPlot: A Novel Web-Based Platform Harnessing Drug Sensitivity Scores as Molecular Biomarkers for Pan-Cancer Survival Prognosis
2026, Current gene therapy
IF:3.8Q2
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研究论文 | 介绍DrugSurvPlot,一种利用药物敏感性评分作为泛癌症生存预后分子生物标志物的新型网络平台 | 建立药物敏感性评分作为肿瘤生存分析的新型预后生物标志物,整合大规模多癌种数据集并提供无需登录的交互式分析工具 | 药物覆盖范围有限,数据集多样性不足,未来需扩展药理学数据库并整合新兴数据模态(如单细胞转录组学) | 利用预测药物敏感性评分作为生存生物标志物,提高精准医学水平并克服基因组指导方法在临床试验中的局限性 | 189个GEO数据集(含10个免疫检查点抑制剂治疗数据集)和33个TCGA数据集,共85,531条记录,覆盖52种癌症类型和13种生存状态数据类型,以及GDSC2中的198种抗癌药物 | 计算肿瘤学 | 泛癌症 | NA | NA | 药物敏感性评分数据 | 85,531条记录,涵盖189个GEO数据集和33个TCGA数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 670 | 2026-05-06 |
Tumor-Promoting Crosstalk of MMP11⁺ Fibroblasts and SPP1⁺ Macrophages Drive Poor Prognosis in Breast Cancer: Integrated Multi-Omics Analysis
2026, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S564498
PMID:42083565
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研究论文 | 通过多组学分析揭示了MMP11阳性的癌症相关成纤维细胞与SPP1阳性巨噬细胞之间的相互作用对乳腺癌预后不良的驱动作用 | 首次发现MMP11+ CAFs和SPP1+巨噬细胞的相互作用与乳腺癌患者不良预后及免疫治疗反应受损相关 | 仅基于公共数据库和有限样本分析,需更多临床样本验证,且机制研究缺乏直接功能实验 | 探索乳腺癌肿瘤微环境中基质-免疫相互作用及其对预后的影响 | 乳腺癌肿瘤微环境中的MMP11+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 671 | 2026-05-05 |
Single-cell transcriptome defines cell-type repertoire of adult Daphnia magna
2026-01-07, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyaf234
PMID:41145233
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析成年雌雄大型溞的细胞类型图谱 | 首次在大型溞中基于单细胞转录组鉴定超过25种细胞类型,并与果蝇细胞图谱进行跨物种比较,发现非循环血细胞群体 | 未进行功能验证实验,部分细胞类型功能注释基于同源性推断 | 建立大型溞成体细胞类型转录组参考图谱,以支撑生态生理学、毒理学和进化基因组学研究 | 成年雌性和雄性大型溞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2个单细胞RNAseq实验(雌性和雄性个体) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'测序 |
| 672 | 2026-05-05 |
Advances in Massive Parallel Sequencing: From Genomics to Spatial Transcriptomics
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-18966-0_3
PMID:42071139
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综述 | 综述大规模并行测序从基因组学到空间转录组学的技术进步 | 系统梳理了测序技术从桑格测序到下一代测序再到单细胞和空间转录组学的演进脉络,突出概念创新如大规模并行化、克隆扩增和循环检测化学 | 未对具体技术细节进行比较或分析局限性 | 回顾测序技术的发展历程及其对生物学研究的影响 | 测序技术及其在基因组学、单细胞和空间转录组学中的应用 | 基因组学 | NA | 桑格测序、下一代测序、单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 673 | 2026-05-05 |
Key Concepts in Transcriptomics Data Analysis in the Era of Next-Gen Sequencing
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-18966-0_11
PMID:42071147
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综述 | 讨论二代测序时代转录组学数据分析的关键概念与方法 | 整合了批量与单细胞转录组学的基本及高级分析方法 | 未提供具体实验数据或验证结果,仅为方法概述 | 介绍转录组学数据分析的核心概念与技术 | RNA测序数据及分析方法 | 机器学习 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 674 | 2026-05-05 |
The Gut-Brain Axis in Alzheimer's: From Microbiota Genetics to Stigmasterol's Neuroprotection Mechanism
2026, Degenerative neurological and neuromuscular disease
IF:2.1Q3
DOI:10.2147/DNND.S580890
PMID:42077232
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研究论文 | 通过肠道菌群遗传学分析,发现豆甾醇通过STIM1/Orai1通路发挥神经保护作用的机制 | 首次整合孟德尔随机化、单细胞和空间转录组学揭示肠道菌群与阿尔茨海默病的因果关系,并鉴定豆甾醇作为靶向STIM1/Orai1通路的天然化合物 | 实验验证仅限于体外SH-SY5Y细胞模型,缺乏体内动物实验和临床样本验证 | 利用肠-脑轴探究肠道菌群在阿尔茨海默病中的治疗靶点,并预测潜在天然化合物及其作用机制 | 阿尔茨海默病相关基因、肠道菌群遗传变异、豆甾醇 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化、SMR分析、单细胞转录组学、空间转录组学、网络药理学、分子对接 | CNN(未明确提及,基于上下文推测),但更准确为因果推断和药物预测模型 | 基因组数据、转录组数据、空间转录组数据、分子结构数据 | 未明确提及样本量 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 675 | 2026-05-05 |
Advances in multi-omics research on neuroblastoma
2026, Frontiers in pediatrics
IF:2.1Q2
DOI:10.3389/fped.2026.1739376
PMID:42078544
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综述 | 综述转录组学、放射组学和数字病理学等多组学方法在神经母细胞瘤诊断和治疗中的作用 | 强调多组学融合策略克服单一数据类型的局限,构建更精确的疾病分类模型并推动个性化治疗方案开发 | 未提及具体研究方法或数据,可能缺乏实证支持 | 探讨多组学方法在提高神经母细胞瘤诊断精度和优化治疗决策中的应用 | 神经母细胞瘤的转录组、放射组学和病理组学数据 | 计算机视觉, 自然语言处理, 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 转录组测序, 单细胞测序, 放射组学分析, 数字病理学分析, 人工智能 | NA | 基因表达数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 676 | 2026-05-05 |
Ubiquitination-Associated Ductal-Fibroblast Crosstalk Shapes Tumor Progression and Prognosis in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/1665552
PMID:42079345
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研究论文 | 探讨泛素化在胰腺导管腺癌中调控导管-成纤维细胞通讯及其对肿瘤进展和预后的影响 | 首次在单细胞和空间层面揭示泛素化活性在PDAC微环境中的细胞类型特异性和空间组织模式,并建立相关预后模型 | 泛素化活性评分基于基因集算法,可能需要进一步实验验证;功能验证仅限于体外实验 | 阐明泛素化在胰腺导管腺癌微环境中的细胞特异性活动及其对肿瘤进展和预后的作用 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤组织及癌旁正常组织 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 基因沉默功能实验 | NA | 基因表达数据, 空间转录数据 | 整合多个公开数据集(具体样本量未在摘要中说明) | 未在摘要中明确提及 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | 未在摘要中明确提及 | NA |
| 677 | 2026-05-05 |
Spatial transcriptomics identifies fibroblast-T cell crosstalk as a driver of Th2 polarization in allergic rhinitis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1788288
PMID:42079570
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研究论文 | 利用空间转录组学绘制过敏性鼻炎患者鼻黏膜图谱,发现成纤维细胞与T细胞的串扰驱动Th2极化 | 首次通过10x Genomics Xenium原位空间转录组学结合配体-受体模型,系统性揭示成纤维细胞- T细胞串扰在过敏性鼻炎Th2极化中的核心驱动作用 | 样本量有限(10例患者与10例对照),且主要依赖于空间转录组数据,需要进一步的功能验证研究 | 阐明过敏性鼻炎发病机制中空间基质-免疫细胞相互作用 | 10例过敏性鼻炎患者和10例非过敏性对照的鼻黏膜组织 | 空间转录组学 | 过敏性鼻炎 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 20例鼻黏膜样本(10例AR,10例对照) | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium In Situ | 10x Genomics Xenium原位空间转录组学平台 |
| 678 | 2026-05-05 |
B cell-mediated immune surveillance defines the favorable prognosis of occult breast cancer: a multi-omics study
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1813674
PMID:42079576
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研究论文 | 通过多组学方法研究隐秘性乳腺癌的免疫微环境,揭示B细胞介导的免疫监视与良好预后的关联 | 首次利用多组学整合分析(蛋白质组学、转录组学、单细胞RNA测序)阐明隐秘性乳腺癌中B细胞作为免疫中枢细胞清除原发肿瘤的机制 | 结果基于探索性分析,需在更大队列中进行功能验证 | 揭示隐秘性乳腺癌原发肿瘤清除的免疫机制 | 隐秘性乳腺癌与非隐秘性乳腺癌的淋巴结和肿瘤组织样本 | 基因组学与免疫学 | 乳腺癌 | 定量蛋白质组学、批量转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | SEER数据库12162例患者用于生存分析 | Illumina | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | Illumina测序平台 | 单细胞RNA测序使用10x Genomics平台 |
| 679 | 2026-05-05 |
Single-cell RNA sequencing of leukocytes at the maternal-fetal interface in physiological and pathological Nodal-deficient pregnancies
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1611813
PMID:42079595
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析生理和病理Nodal缺陷妊娠中母胎界面白细胞的特征 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统表征了Nodal缺陷妊娠中母胎界面白细胞的转录组特征,揭示了髓系细胞在胎盘发育中的新功能 | NA | 阐明白细胞在胎盘发育中的作用,理解生理妊娠和生殖失败的机制 | 小鼠母胎界面白细胞(包括巨噬细胞和中性粒细胞等) | NA | 生殖疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 680 | 2026-05-05 |
Single-cell RNA sequencing unravels T cell exhaustion underlying the chronicity of chromoblastomycosis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1784450
PMID:42079606
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示CD4+ T细胞耗竭是着色芽生菌病慢性化的关键机制 | 首次从单细胞水平揭示CD4+ T细胞耗竭是着色芽生菌病慢性化的核心免疫机制,并阐明单核/巨噬细胞通过持续抗原呈递和配体-受体相互作用驱动该过程 | 样本量有限(仅1例患者病变皮肤),需要更大规模队列及更多慢性感染模型验证 | 探究着色芽生菌病慢性化的免疫病理机制 | 着色芽生菌病患者的病变皮肤组织及Fonsecaea pedrosoi感染小鼠模型 | 数字病理学 | 真菌感染性疾病 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者病变皮肤样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |