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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2026-02-26 |
From polygenic risk to digital twins: the future of personalised cardiovascular medicine
2026, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2026.1735094
PMID:41736831
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综述 | 本文综述了个性化心血管医学在基因组学、多组学、数字技术和治疗领域的进展,并讨论了转化差距及伦理与实施挑战 | 整合多组学平台、人工智能及新兴技术(如CRISPR基因编辑、单细胞测序和数字孪生模型),推动心血管医学从通用策略转向个性化主动预防与治疗 | 实际应用受限于监管不确定性、数据整合挑战、成本问题以及公平性和可及性担忧 | 探讨精准心脏病学如何利用基因组、分子和计算创新实现个体化心血管疾病护理 | 心血管疾病(CVD)的个性化预防、诊断和治疗策略 | 机器学习 | 心血管疾病 | 多组学平台(转录组学、蛋白质组学、代谢组学)、人工智能、机器学习、CRISPR基因编辑、单细胞测序、数字孪生建模 | 数字孪生模型 | 基因组数据、多组学数据、心血管影像、电子健康记录、可穿戴设备数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 662 | 2026-02-26 |
Correction: Single-cell transcriptome analysis profiles cellular dynamics and transcriptional changes in diabetic wound tissues following ESWT treatment
2026, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2026.1772233
PMID:41736952
|
correction | 本文是对一篇关于单细胞转录组分析在糖尿病伤口组织中ESWT治疗后细胞动态和转录变化研究的文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 663 | 2026-02-26 |
Divergent CD45+ immune landscapes shape the lung tumor microenvironment
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1765833
PMID:41737220
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了两种不同肺癌模型中CD45+免疫细胞的组成、转录程序、代谢状态和细胞间通讯网络的差异 | 首次在单细胞分辨率下比较了两种不同基因型(LLC1和KrasLA2)肺癌模型中CD45+免疫细胞的免疫景观差异,并识别了基因型特异性的免疫脆弱性 | 研究仅基于小鼠模型,结果在人类肺癌中的适用性有待验证;样本量相对有限 | 阐明CD45+免疫细胞在肺癌肿瘤微环境中的异质性作用及其对肿瘤生物学的影响 | 来自健康肺、LLC1原位肿瘤和KrasLA2基因工程肿瘤的CD45+免疫细胞 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自三种条件(健康肺、LLC1肿瘤、KrasLA2肿瘤)的CD45+免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 664 | 2026-02-26 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics reveal the differentiation drivers of gastric epithelial lineage progression
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1712830
PMID:41737224
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了胃癌发展过程中胃上皮谱系分化的驱动因素,特别是UPP1在连接幽门螺杆菌驱动的炎症与WNT介导的分化中的关键作用 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学,系统描绘了从慢性胃炎到肠化生再到胃癌的谱系进展,并识别出UPP1作为上皮重编程和肠化生的关键调节因子 | 研究样本可能有限,且机制验证主要在细胞系和类器官中进行,需进一步在体内模型中确认 | 阐明胃癌发展过程中分子介导因子,特别是炎症与恶性转化之间的关联 | 胃黏膜样本,包括萎缩性胃炎、肠化生和胃癌病例,涵盖幽门螺杆菌阳性和阴性情况 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 来自萎缩性胃炎、肠化生和胃癌的胃黏膜样本,包括幽门螺杆菌阳性和阴性病例 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 665 | 2026-02-26 |
Identification of Monocyte CD11c as a Potential Biomarker for Distinguishing Sepsis From Non-Infectious Inflammation and Predicting the Outcome of Sepsis
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S557223
PMID:41737250
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研究论文 | 本研究探讨了单核细胞CD11c作为区分脓毒症与非感染性炎症及预测脓毒症预后的潜在生物标志物 | 首次通过CyTOF、单细胞RNA测序和流式细胞术多技术结合,验证了mCD11c在脓毒症诊断和预后中的优越性能,其AUC值(0.939)显著优于传统标志物 | 研究为单中心观察性队列,样本量有限,需更大规模的多中心研究验证结果并探索干预潜力 | 评估mCD11c作为脓毒症诊断和预后生物标志物的有效性 | 脓毒症患者、轻度感染患者、心血管手术后患者、康复脓毒症患者及健康对照者 | 数字病理学 | 脓毒症 | CyTOF, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 外周血样本 | 发现队列和验证队列(具体人数未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 666 | 2026-02-26 |
Single-cell RNA sequencing and integrated bioinformatics reveal new mitochondrial biomarkers in sarcopenia
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1694362
PMID:41737830
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研究论文 | 本研究通过整合分析公共转录组数据集和单细胞RNA测序,发现了一个与线粒体功能相关的三基因标志物(CHCHD10、SAMM50、MDH2),可作为肌少症的早期诊断生物标志物 | 首次通过整合多组学数据和机器学习方法,鉴定出一个在多个独立队列中保守的、与线粒体功能障碍相关的三基因标志物,并构建了具有高诊断准确性的列线图预测模型 | 研究主要基于公共数据集进行生物信息学分析,尽管进行了体外验证,但缺乏大规模临床队列的直接验证 | 发现肌少症的早期诊断生物标志物 | 肌少症患者及对照的转录组数据、C2C12成肌细胞 | 生物信息学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、差异基因表达分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、机器学习、定量PCR | 列线图预测模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 多个公共数据集(GSE1428, GSE117525, GSE167186, GSE111006, GSE111010, GSE111016),具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 667 | 2026-02-26 |
Integrative Multi-Omics Identifies S100A4 as a Translational Hub Linking Environmental Bis(2-Ethylhexyl) Phthalate (DEHP) Exposure to Glioblastoma Risk
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/2385129
PMID:41737848
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研究论文 | 本研究通过整合多组学计算框架,揭示了环境污染物DEHP通过S100A4蛋白及脂质代谢轴影响胶质母细胞瘤风险的潜在机制 | 首次整合网络毒理学、单细胞转录组学、全蛋白质组/代谢组孟德尔随机化及分子动力学模拟,系统性地将环境毒物DEHP暴露与胶质母细胞瘤风险联系起来,并识别出S100A4作为关键翻译枢纽 | 所提出的机制联系仍为推断性,需要未来体外和体内实验直接验证DEHP对S100A4表达、功能及下游代谢重编程的影响 | 系统研究环境污染物DEHP与胶质母细胞瘤风险之间的相互作用机制 | 胶质母细胞瘤(GBM)、环境污染物双(2-乙基己基)邻苯二甲酸酯(DEHP) | 计算生物学、生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 网络毒理学、单细胞转录组学、孟德尔随机化、分子动力学模拟 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、分子对接、分子动力学模拟 | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 | 来自TCGA、GTEx、GEO等11个独立队列的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 668 | 2026-02-24 |
Flexibility of cell fates and functions across sex determination systems revealed by comparative single-cell analyses
2026-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.29.701242
PMID:41659566
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学比较分析了温度依赖性性别决定(TSD)系统与遗传性别决定(GSD)系统在脊椎动物性腺细胞类型和遗传程序上的差异 | 揭示了脊椎动物性别决定系统中细胞命运和功能的广泛可塑性,并发现支持细胞谱系在TSD系统中表达雄激素合成基因,这与哺乳动物不同 | 研究主要基于特定龟类物种,可能无法完全代表所有TSD或GSD系统的多样性 | 比较不同性别决定系统下脊椎动物性腺细胞类型和遗传程序的保守性与差异 | 龟类(温度依赖性性别决定)、小鼠(XY遗传性别决定)和鸡(ZW遗传性别决定)的性腺组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 未明确指定样本数量,但涉及多个物种的性腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 669 | 2026-02-24 |
Multiplexed enrichment and tracking of lineages with CloneSweeper
2026-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.30.700779
PMID:41659616
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CloneSweeper的多重谱系追踪平台,用于高效捕获和富集稀有细胞谱系,以研究治疗抵抗机制 | 开发了CloneSweeper平台,利用双功能条形码同时实现活细胞分选和单细胞RNA测序检测,能够同时富集多个稀有谱系 | 未明确说明平台在更广泛疾病模型或样本类型中的适用性限制 | 研究治疗抵抗机制,区分预存细胞状态(“启动”)与药物诱导变化(“适应”) | BRAF V600E黑色素瘤模型中的细胞谱系 | 单细胞组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),Cas9 gRNA介导的活细胞分选 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及21个不同的稀有谱系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Genomics scRNA-seq | 未指定具体产品型号,但提及用于高回收率检测 |
| 670 | 2026-02-24 |
CytoVerse: Single-Cell AI Foundation Models in the Browser
2026-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.29.702554
PMID:41659670
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研究论文 | 本文介绍了CytoVerse框架,它能在浏览器中运行单细胞RNA测序基础模型,实现无需服务器计算的大规模单细胞数据映射 | 通过ONNX部署模型、使用压缩索引(IVFPQ)在客户端搜索超过2000万个细胞参考数据,以及轻量级协议共享嵌入而不暴露原始数据,实现了浏览器端的隐私保护单细胞分析 | 未提及具体性能瓶颈或兼容性限制 | 开发一个可扩展且隐私保护的分布式单细胞分析框架 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 基础模型(Foundation Models) | 单细胞基因表达数据 | 超过2000万个细胞参考数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 671 | 2026-02-24 |
Altered immune and treatment response gene expression signatures among poverty-exposed children with B-ALL
2026-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.27.702019
PMID:41659564
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析贫困暴露的B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)儿童患者的白血病母细胞及其微环境,揭示了其在诊断时表现出类固醇耐药和免疫细胞功能改变的转录特征 | 首次在单细胞水平上揭示了贫困暴露与B-ALL儿童患者白血病细胞类固醇耐药性及免疫微环境改变的关联 | 研究样本量有限,且机制性关联需要进一步实验验证 | 探究贫困暴露对B-ALL儿童患者治疗反应和免疫微环境的影响 | 标准风险B-ALL儿童患者(贫困暴露与非贫困暴露对比) | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,但涉及贫困暴露和非贫困暴露的B-ALL儿童患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 672 | 2026-02-24 |
MicroRNAs as potential prognostic biomarkers in acute lymphoblastic leukemia: a systematic review, meta-analysis, and bioinformatics study
2026-Jan-29, Systematic reviews
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s13643-026-03083-3
PMID:41612480
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系统综述、荟萃分析与生物信息学研究 | 本文通过系统综述、荟萃分析和生物信息学方法,评估miRNA作为急性淋巴细胞白血病预后生物标志物的潜力,并利用ceRNA网络和单细胞RNA测序分析验证靶基因 | 结合系统综述、荟萃分析和生物信息学方法,首次构建ceRNA网络并应用单细胞RNA测序分析miRNA靶基因在ALL中的表达模式,揭示了白血病原始细胞中靶基因表达的最一致和显著改变 | 需要大型多中心试验进一步确认miRNA的预后价值,研究结果可能受纳入研究的异质性和样本量限制 | 评估miRNA作为急性淋巴细胞白血病预后生物标志物的潜力,并探索其调控机制 | 急性淋巴细胞白血病患者,特别是涉及1974名患者的22项研究中的miRNA表达数据 | 生物信息学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序、ceRNA网络分析、荟萃分析 | NA | 文本数据、基因表达数据 | 1974名患者,来自22项研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 673 | 2026-02-24 |
Sod1 trisomy causes ENS developmental defects and susceptibility to Hirschsprung disease via neuronal Ret suppression and glial remodeling
2026-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.26.701837
PMID:41659476
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研究论文 | 本研究揭示了21号染色体基因SOD1剂量增加如何通过抑制神经元Ret表达和重塑胶质细胞状态,导致肠神经系统发育缺陷并增加先天性巨结肠症易感性 | 首次证明SOD1基因剂量单独增加足以扰乱肠神经系统发育,并阐明了其通过双重机制(抑制神经发生与促进胶质细胞反应性增殖)导致先天性巨结肠易感性的具体通路 | 研究基于人源化三体小鼠模型,与人类Down综合征的完整遗传背景存在差异;单细胞测序仅分析了出生后第0天的远端结肠组织 | 解析Down综合征患者先天性巨结肠症风险增高的特定染色体21基因机制 | 携带人源SOD1基因座的转基因小鼠肠神经系统细胞 | 单细胞组学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | 转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据,荧光图像数据 | 未明确样本数量(出生后第0天小鼠远端结肠组织) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 674 | 2026-02-24 |
Spatial transcriptomics reveals brain-wide circadian disruption in an Alzheimer's disease model
2026-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.26.701799
PMID:41659563
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,揭示了小鼠大脑中昼夜节律转录的空间组织架构,并发现阿尔茨海默病模型中存在早期、区域特异性的昼夜节律紊乱 | 首次在大规模空间转录组学层面,绘制了健康与阿尔茨海默病模型小鼠大脑中24小时节律转录的空间分布图,揭示了区域特异性节律紊乱作为疾病早期特征 | 研究基于小鼠模型(APP23),可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的复杂性;且主要关注转录水平,未深入探讨功能机制 | 探究健康与阿尔茨海默病状态下大脑昼夜节律转录的空间组织特征及其在疾病发病机制中的作用 | 小鼠大脑(包括皮质和皮质下区域),特别是APP23阿尔茨海默病模型小鼠 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及小鼠大脑多个区域的大规模空间转录组分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 675 | 2026-02-24 |
Substantial unannotated noncoding transcripts in tumors may transcriptionally regulate cancer-related genes
2026-Jan-28, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02524-8
PMID:41606598
|
研究论文 | 本研究通过泛癌分析识别了未注释的非编码转录本(UNTs),并利用CRISPR/Cas9技术验证了它们在癌症中转录调控基因的潜力 | 首次系统性地研究了肿瘤中未注释非编码转录本(UNTs)的广泛存在及其转录调控机制,揭示了其癌症和物种特异性 | 研究仅针对四种肿瘤的细胞系和组织样本,可能无法代表所有癌症类型;UNTs的功能验证仅限于三个具体例子 | 探究肿瘤中未注释非编码转录本(UNTs)的转录调控功能及其在癌症中的作用 | 四种肿瘤的细胞系和组织样本,以及三个具体的UNTs(MSTRG.2513.6、MSTRG.4401.1、MSTRG.34636.7) | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq、scRNA-seq、CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | RNA序列数据 | 四种肿瘤的细胞系和组织样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 676 | 2026-02-22 |
stGCL: a versatile cross-modality fusion method based on multi-modal graph contrastive learning for spatial transcriptomics
2026-Jan-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03896-w
PMID:41606649
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 677 | 2026-02-24 |
huSA: a comprehensive database for multi-dimensional resolution of bulk, single cell and spatial transcription profiles in skin diseases
2026-Jan-15, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baag009
PMID:41719583
|
研究论文 | 本研究构建了一个名为人类皮肤图谱(huSA)的综合性数据库,整合了多种皮肤疾病的批量、单细胞和空间转录组数据,并提供标准化分析和交互式可视化工具 | 首次构建了一个整合17种皮肤疾病、涵盖单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序等多种数据类型的综合性数据库,并提供标准化的分析流程和交互式可视化平台 | 数据库目前主要整合已发表的公开数据集,可能未包含所有最新的研究数据;分析流程的标准化可能无法完全适应所有特定研究问题 | 解决皮肤疾病转录组数据缺乏有效整合和标准化分析的问题,构建一个系统性的资源平台 | 皮肤疾病相关的转录组数据 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学,批量RNA测序(bulk RNA-seq) | NA | 转录组数据 | 总计2999个样本,包括1434个scRNA-seq样本、63个空间转录组样本和1502个bulk RNA-seq样本,来自63个独立数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 678 | 2026-02-24 |
Generation of human pineal gland organoids with melatonin production for disease modeling
2026-Jan-08, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.12.004
PMID:41475351
|
研究论文 | 本研究开发了人松果体类器官,用于模拟松果体发育和功能,并应用于疾病建模 | 首次从多能干细胞生成人松果体类器官,成功模拟松果体发育和褪黑素生产,并应用于Angelman综合征疾病模型 | 研究基于体外模型,可能无法完全复制体内复杂环境,且样本来源有限 | 开发人松果体类器官平台,用于研究松果体发育、昼夜节律调节及相关疾病 | 人松果体类器官、Angelman综合征患者来源的iPSCs、松果体切除小鼠 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 679 | 2026-02-24 |
SLC25A37 as a novel therapeutic target for benign prostatic hyperplasia: integrative analyses of single-cell RNA sequencing and genome-wide association studies
2026-Jan, Open medicine (Warsaw, Poland)
DOI:10.1515/med-2025-1371
PMID:41726128
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和全基因组关联分析,鉴定出SLC25A37是良性前列腺增生(BPH)的一个新型致病基因,并探索了其作为治疗靶点的潜力 | 首次将单细胞RNA测序与全基因组关联研究相结合,在BPH的经典单核细胞中鉴定出SLC25A37这一新的致病基因,并探索了靶向该基因的潜在治疗药物 | 未明确说明样本的具体数量,且体外实验验证可能不足以完全代表体内复杂的病理生理环境 | 识别良性前列腺增生(BPH)的致病基因并探索潜在的治疗靶点 | 良性前列腺增生(BPH)患者与健康对照者的前列腺组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),全基因组关联研究(GWAS),孟德尔随机化(MR),贝叶斯共定位,分子对接,流式细胞术,qRT-PCR,蛋白质印迹,免疫组织化学,免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据,基因组关联数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 680 | 2026-02-24 |
Multi-scale systems toxicology defines a KLF5-centered adverse outcome pathway linking DEHP exposure to pancreatic cancer progression and signaling programs relevant to therapy tolerance
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1769023
PMID:41727317
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研究论文 | 本研究通过多尺度系统毒理学框架,揭示了DEHP暴露通过KLF5中心的不良结局通路促进胰腺癌进展的机制 | 整合了异质集成机器学习、孟德尔随机化、分子对接与动力学、单细胞转录组学等多种方法,首次提出KLF5为中心的DEHP-PDAC关联通路 | 研究结果主要为假设生成性质,需要进一步实验验证 | 阐明DEHP暴露与胰腺癌进展之间的分子机制和不良结局通路 | 胰腺导管腺癌(PDAC)相关基因、KLF5蛋白、PANC-1细胞系 | 系统毒理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学、分子对接、分子动力学模拟、孟德尔随机化 | TabPFN增强集成模型、异质集成机器学习 | 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据、分子结构数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |