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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2026-07-10 |
NAD+ metabolic collapse and arrest of epithelial development in Hirschsprung disease
2026, World journal of pediatric surgery
IF:0.8Q4
DOI:10.1136/wjps-2026-001222
PMID:42422596
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序探究先天性巨结肠症中NAD+代谢崩溃与上皮发育停滞的机制 | 首次在HSCR上皮中发现NAD+生物合成不足与过度消耗共同导致的代谢脆弱性,颠覆了以肠道神经系统为中心的传统疾病模型 | NA | 明确HSCR患者神经节段结肠的上皮状态及其代谢异常 | HSCR患者及非HSCR对照(HSCR相关疾病)的远端结肠组织 | 数字病理学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、图像 | HSCR患者与非HSCR对照的远端结肠组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 642 | 2026-07-10 |
Intestinal subepithelial myofibroblasts in inflammatory bowel disease: fibroblast heterogeneity, fibrosis, and therapeutic targeting
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1808431
PMID:42422813
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综述 | 综述肠上皮下肌成纤维细胞在炎症性肠病中的作用,包括成纤维细胞异质性、纤维化机制及治疗靶点 | 整合单细胞和空间转录组学最新进展,揭示成纤维细胞异质性与致病性成纤维细胞亚群,并系统总结靶向基质途径的治疗策略 | 作为综述,未提供原始实验数据,且部分新兴治疗策略尚未在临床试验中充分验证 | 全面总结肠上皮下肌成纤维细胞在炎症性肠病中的生理和病理作用,探讨纤维化机制及治疗靶点 | 肠上皮下肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒,10x Visium空间基因表达 |
| 643 | 2026-07-10 |
RBMS3 promotes ferroptosis in colorectal cancer and is suppressed by M2 tumor-associated macrophages via STAT3 activation
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1872659
PMID:42422878
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研究论文 | 本文研究了RBMS3在结直肠癌中促进铁死亡的作用,并发现M2型肿瘤相关巨噬细胞通过STAT3激活抑制RBMS3表达 | 首次揭示RBMS3通过铁死亡通路影响结直肠癌预后,并阐明M2巨噬细胞-STAT3-RBMS3轴的免疫调控机制 | 主要基于细胞系和公共数据库分析,缺乏体内动物模型验证和更大规模的临床队列数据 | 探索RBMS3在结直肠癌中的预后价值及其与铁死亡和免疫微环境的关系 | 结直肠癌患者样本、TCGA泛癌及COAD数据集、HCT116细胞系、THP-1来源的M2巨噬细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Cox比例风险模型, Kaplan-Meier分析 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA-COAD队列(约500例)及GEO多个验证数据集(具体样本数未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 644 | 2026-07-09 |
Microglia heterogeneity and therapeutic strategies in Parkinson's disease
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1739341
PMID:41727462
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综述 | 系统描述小胶质细胞在帕金森病中的生物学特性、功能异质性及靶向治疗策略 | 结合单细胞转录组学技术揭示小胶质细胞在帕金森病中的功能、空间、遗传和性别相关差异,并总结新兴靶向小胶质细胞的干预治疗策略 | 未详细讨论临床转化中的具体障碍及不同治疗策略的成本效益比较 | 阐明小胶质细胞异质性在帕金森病神经退行性变中的作用机制并指导精准治疗 | 小胶质细胞及帕金森病患者 | 数字病理学 | 帕金森病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 645 | 2026-07-09 |
Unique chicken B cell development: species-specific mechanisms and contradictory requirements of B cell receptor for post-hatched B cell development
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1755331
PMID:41727463
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综述 | 文章记录了鸡B细胞在三个发育阶段(前法氏囊期至法氏囊后阶段)的发育过程,并与人类B细胞发育进行比较 | 揭示了鸡B细胞发育的物种特异性机制,包括法氏囊作为主要B细胞受体依赖性发育器官的同时支持非依赖性早期定殖,以及通过激活诱导胞苷脱氨酶介导的基因转换而非V(D)J重组实现抗体多样化 | 未明确提及具体研究限制 | 探讨鸡B细胞发育的独特机制及其与哺乳动物发育的差异 | 鸡B细胞发育过程 | 基因组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序,基因敲除 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 646 | 2026-07-09 |
Blinatumomab-driven T-cell activation in αβ and γδ T-cell subsets: insights from in vitro assays
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1739493
PMID:41727470
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research paper | 该研究通过体外实验系统比较了博纳吐单抗驱动的αβ和γδ T细胞亚群活化效应,揭示了两种T细胞亚群对BLN反应的特异性差异 | 首次在健康供体来源的αβ和γδ T细胞中系统比较BLN驱动的效应功能,并发现唑来膦酸扩增的Vγ9Vδ2 γδ T细胞系在高肿瘤负荷下需要更高BLN浓度,同时γδ T细胞表现出更稳定的效应记忆表型 | 实验仅基于健康供体来源的T细胞,未涉及患者样本;单细胞转录组分析仅使用一个供体,样本量有限 | 阐明博纳吐单抗对αβ和γδ T细胞亚群免疫学机制的差异影响 | 健康成人供体的αβ和γδ T细胞 | machine learning | 急性淋巴细胞白血病 | NA | NA | 流式细胞术数据、单细胞转录组数据 | 健康供体(具体数量未明确);单细胞转录组分析使用1个供体 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 探索性靶向单细胞转录组分析(一个供体) |
| 647 | 2026-07-09 |
ECM remodeling-associated immune signatures and hub proteins: predictive markers and therapeutic targets for metastatic gastric cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1765095
PMID:41727482
|
研究论文 | 通过蛋白质组学和单细胞RNA测序鉴定与胃癌转移相关的细胞外基质重塑免疫特征和核心蛋白,验证RPS29在转移机制中的作用 | 整合蛋白质组学与单细胞转录组学,首次系统解析细胞外基质重塑在胃癌转移中的分子机制,并鉴定RPS29作为新的转移相关核心蛋白 | 未明确提及局限性,可能包括样本量有限、功能验证仅限体外实验等 | 探索细胞外基质重塑在胃癌转移中的分子机制,鉴定预测标志物和治疗靶点 | 胃癌患者样本、胃癌细胞系 | 机器学习 | 胃癌 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 未明确提及样本具体数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 648 | 2026-07-08 |
Identification and validation of platelet activation-related signatures in ulcerative colitis: a study based on machine learning and single-cell transcriptomic analysis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1855177
PMID:42404897
|
研究论文 | 基于机器学习与单细胞转录组分析鉴定溃疡性结肠炎中血小板活化相关分子特征并验证 | 首次整合多算法(LASSO、SVM-RFE、随机森林)与单细胞转录组解析溃疡性结肠炎中血小板活化相关基因(SPARC、TIMP1、SERPINA1),发现其主要在肠成纤维细胞中表达且与致病性免疫细胞浸润相关 | 缺乏大规模临床队列验证且未深入探究血小板活化基因调控溃疡性结肠炎免疫基质紊乱的具体分子机制 | 鉴定溃疡性结肠炎中血小板活化关键基因并解析其与免疫基质紊乱的转录关联 | 溃疡性结肠炎患者转录组数据及DSS诱导结肠炎小鼠模型 | 机器学习, 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | RNA-seq, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), qRT-PCR | LASSO, SVM-RFE, 随机森林, WGCNA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | GSE87466数据集(训练集)、GSE47908、GSE38713、GSE36807(验证集)及DSS诱导结肠炎小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 649 | 2026-07-08 |
Integrative genetic and expression profiling prioritizes LIPA in mononuclear phagocytes as a candidate regulator of carotid plaque
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1861490
PMID:42404895
|
研究论文 | 通过整合遗传和表达谱分析,将单核吞噬细胞中的LIPA基因确定为颈动脉斑块的候选调控因子 | 首次利用双样本孟德尔随机化和共定位分析,结合单细胞RNA测序和无偏倚方法,优先识别颈动脉斑块的候选基因并评估其治疗潜力 | LIPA在颈动脉斑块中的因果作用主要在体外实验中验证,需进一步体内验证;研究仅基于两个GWAS数据集,可能需要更多独立数据确认 | 无偏倚地识别颈动脉斑块的候选基因并评估其治疗潜力 | 颈动脉斑块相关的免疫细胞和基因,特别是单核吞噬细胞和T细胞 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 孟德尔随机化, 共定位分析, 单细胞RNA测序, 分子对接, 表型组关联分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, GWAS数据 | 14种外周血免疫细胞类型的数据,两个GWAS数据集,一个人颈动脉斑块单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 650 | 2026-07-06 |
Clonally expanded HSP-specific T cells contribute to glaucomatous neurodegeneration via the mTORC1 pathway
2026-Jan-16, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03693-7
PMID:41540471
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和TCR测序发现HSP特异性T细胞克隆扩增通过mTORC1通路促进青光眼神经退行性变 | 首次通过单细胞多组学揭示热休克蛋白HSP27作为青光眼自身抗原,驱动T细胞克隆扩增和mTORC1通路激活的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚需进一步验证人类青光眼患者中T细胞克隆与疾病进展的临床相关性 | 探究青光眼发病中自身抗原和T细胞驱动的神经退行性变机制 | 人类青光眼视网膜、健康视网膜、外周血以及小鼠模型 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序,AlphaFold2 | NA | 基因表达数据,TCR序列数据 | 人类青光眼和健康视网膜样本及相应外周血,以及在免疫缺陷小鼠模型中过继转移实验 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 5' Gene Expression and V(D)J Solution |
| 651 | 2026-07-05 |
Integrated multi-omics and machine learning identify an interaction between SLC39A11 and phosphoinositide metabolism in deep vein thrombosis
2026-01-22, BMC medical informatics and decision making
IF:3.3Q2
DOI:10.1186/s12911-026-03342-2
PMID:41566314
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研究论文 | 通过整合多组学和机器学习方法,识别深静脉血栓中SLC39A11与磷脂酰肌醇代谢之间的相互作用 | 首次通过多组学(代谢组学和转录组学)与机器学习结合,鉴定SLC39A11和磷脂酰肌醇在深静脉血栓中的关键作用,并利用单细胞RNA测序将SLC39A11定位到M1样巨噬细胞 | 样本量较小(代谢组学62例,转录组学17例,验证集18例,单细胞RNA测序6例),可能影响结果的泛化性;未提及因果关系验证 | 探索深静脉血栓的多组学特征及其调控机制 | 深静脉血栓患者和健康对照者的外周血样本 | 机器学习 | 深静脉血栓 | 非靶向代谢组学, 转录组学, 单细胞RNA测序, 电感耦合等离子体质谱 | 双向正交偏最小二乘法, 机器学习算法 | 代谢组学数据, 转录组学数据, 单细胞RNA测序数据 | 代谢组学62例, 转录组学17例, 验证集18例, 单细胞RNA测序6例 | 未提供 | 非靶向代谢组学, 转录组学, 单细胞RNA测序 | 未提供 | 未提供 |
| 652 | 2026-07-04 |
S100A8/A9 Promotes Fibrosis in Iatrogenic Laryngotracheal Stenosis
2026-01, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.70008
PMID:40776636
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光技术发现S100A8/A9在医源性喉气管狭窄中高表达,并在小鼠模型中证实其促进纤维化作用 | 首次通过体内实验明确S100A8/A9促进医源性喉气管狭窄纤维化的机制,并揭示其下游调控蛋白MYD88的参与 | 仅在小鼠模型验证,未在人样本中进行干预实验;样本量较小且未阐明S100A8/A9与其他免疫介质的相互作用 | 阐明S100A8/A9在医源性喉气管狭窄发病机制中的作用 | 人类喉气管狭窄组织标本及医源性喉气管狭窄诱导的小鼠模型 | 数字病理学 | 喉气管狭窄 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 基因表达分析 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 人类标本(具体数量未说明);小鼠模型(每组数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 653 | 2026-07-04 |
Artificial Intelligence in single-cell and spatial transcriptomics data analyses
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.011
PMID:41986013
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综述 | 探讨人工智能在单细胞和空间转录组学数据分析中的应用 | 系统综述了AI方法(如CNN、GNN和VAE)在预处理、降维、细胞分类、整合多组学及推断细胞轨迹中的应用,并聚焦于癌症生物学、免疫学和神经科学领域 | 存在可扩展性、可解释性和数据标准一致性不足的挑战 | 提供AI推动单细胞和空间转录组学数据解析的全面指南 | 单细胞和空间转录组学数据集及AI分析方法 | 机器学习 | 癌症、免疫疾病、神经疾病 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序 | 卷积神经网络、图神经网络、变分自编码器 | 基因表达数据、空间转录数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 654 | 2026-07-04 |
AI-driven gene-sets, networks, pathways, and interactions analyses of multi-omics data
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.023
PMID:41986006
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研究论文 | 介绍了PAGER 3.0知识生态系统,用于分析多组学数据中的基因集、网络、通路和相互作用 | PAGER 3.0在PAGER知识生态系统中实现了重大进步,提供扩展且精心策划的通路、注释基因列表和基因签名(PAGs)集合、本体感知的知识导航、加权富集分析和结构化基于网络的优先级排序工具 | NA | 介绍PAGER 3.0的概念基础、架构和分析工作流程,并通过白血病单细胞转录组学案例研究证明其实用性 | 多组学数据中的基因集、通路、网络和相互作用 | 生物信息学 | 白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 655 | 2026-07-03 |
MicroRNAs as potential prognostic biomarkers in acute lymphoblastic leukemia: a systematic review, meta-analysis, and bioinformatics study
2026-Jan-29, Systematic reviews
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s13643-026-03083-3
PMID:41612480
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系统综述与荟萃分析 | 通过系统综述、荟萃分析和生物信息学方法评估微小RNAs作为急性淋巴细胞白血病预后生物标志物的潜力 | 结合ceRNA网络和单细胞RNA测序分析验证的靶基因,扩展了miRNAs作为ALL预后标志物的研究 | 需要大型多中心试验确认,且miRNAs作用具有情境依赖性 | 评估微小RNAs作为急性淋巴细胞白血病预后生物标志物的价值 | ALL患者中miRNA表达与生存期的关联 | 生物信息学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序, ceRNA网络分析 | NA | 基因表达数据 | 22项研究,共计1974例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 656 | 2026-07-03 |
Exosome RAB10 inhibits JAK1/STAT1 to hinder macrophage M1 polarization and promote tumor immune escape
2026-Jan-26, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-026-02681-x
PMID:41588435
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研究论文 | 研究乳腺肿瘤细胞通过外泌体传递RAB10抑制JAK1/STAT1通路,阻碍巨噬细胞M1极化并促进肿瘤免疫逃逸的机制 | 首次揭示外泌体RAB10通过结合干扰素受体IFNAR1抑制JAK1/STAT1磷酸化,调控巨噬细胞极化方向,并发现联合靶向RAB10和PD-L1可产生协同抑瘤效应 | 未详细说明RAB10在耐药乳腺癌细胞中上调的具体机制,以及外泌体RAB10对其他免疫细胞的影响 | 探讨外泌体介导的肿瘤-巨噬细胞互作机制,特别是RAB10在巨噬细胞极化及肿瘤免疫逃逸中的作用 | 乳腺癌细胞(耐药与非耐药)、巨噬细胞、CD8⁺ T细胞、小鼠肿瘤模型 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 657 | 2026-07-03 |
A Transcriptional Map of Human Tonsil Architecture: Beyond the Sum of (Single Cell) Parts
2026-01, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70121
PMID:41518352
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研究论文 | 利用成像型空间转录组学绘制人类扁桃体结构转录图谱,超越单细胞RNA-seq的细胞组成分析 | 建立了一个强调空间组织、细胞相互作用和功能的通用分析流程,揭示了扁桃体中52个细胞亚群的空间分布和信号通路活性 | 数据仍面临分析挑战且缺乏标准化,未明确提及 | 展示成像型空间转录组学在研究组织微环境和免疫反应中的优势,并提供空间免疫学的分析框架 | 人类扁桃体组织中的200万个细胞和52个细胞亚群 | 计算病理学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组图像 | 人类扁桃体组织样本 | NA | 空间转录组学 | 成像型空间转录组学平台 | 基于成像的空间转录组学技术 |
| 658 | 2026-07-03 |
Single-Cell RNA Sequencing Revealing Dysregulated Perturbations of Tregs in Psoriasis and Construction of a Treg-Related Diagnostic Model via a 101- Combination Machine Learning Computational Framework
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示银屑病中调节性T细胞的失调扰动,并通过101种组合机器学习框架构建Treg相关诊断模型 | 首次整合单细胞转录组学与101种机器学习算法构建银屑病Treg相关诊断模型,揭示Treg在银屑病中的代谢重编程、分化停滞及IL-16-CD4自分泌信号等新机制 | 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限、体外模型验证的局限性及诊断模型需进一步临床验证 | 解析银屑病中Treg的细胞异质性和功能失调,并开发基于Treg相关基因的高准确度诊断模型 | 银屑病患者皮损及健康对照皮肤的Treg细胞单细胞转录组数据 | 机器学习 | 银屑病 | scRNA-seq, LASSO, XGBoost, hdWGCNA | LASSO, XGBoost, 多种机器学习算法 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本量,涉及银屑病患者和健康对照的皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 659 | 2026-07-03 |
Mechanistic Investigation of Nitidine Chloride-Mediated Anti-Colorectal Cancer Activity: Centromere-Associated Protein E Targeting via Integrated Molecular Dynamics, Spatial Transcriptomic and Single-Cell Approaches
2026 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70054
PMID:41607031
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研究论文 | 通过整合分子动力学模拟、空间转录组学和单细胞RNA测序技术,系统性研究氯化两面针碱通过靶向着丝粒相关蛋白E发挥抗结直肠癌活性的分子机制 | 首次综合运用单细胞RNA测序、空间转录组学、大规模mRNA队列分析和免疫组化等多种先进技术全面表征CENPE在结直肠癌中的表达模式,并结合分子动力学模拟阐明氯化两面针碱与CENPE的结合模式 | 氯化两面针碱下调CENPE mRNA和蛋白质水平的结果需在更多实验系统中进一步验证 | 阐明氯化两面针碱与着丝粒相关蛋白E之间的相互作用机制,为开发基于中药活性成分的结直肠癌精准治疗方法提供科学依据 | 氯化两面针碱与着丝粒相关蛋白E的相互作用及其在结直肠癌中的作用机制 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 分子动力学模拟, 实时定量聚合酶链反应, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 大规模mRNA队列分析(具体样本量未明确)、结直肠癌细胞系和异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 660 | 2026-07-03 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Prostate Cancer: Unraveling Mechanisms and Therapeutic Implications
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.073265
PMID:41613792
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综述 | 综述前列腺癌中癌症相关成纤维细胞(CAFs)的起源、异质性、功能机制及治疗意义,特别关注肿瘤微环境调控与治疗抵抗 | 整合单细胞和空间转录组学最新进展,系统阐述CAFs在前列腺肿瘤微环境中的表型异质性及空间分布,并提出基质重编程作为辅助治疗的新策略 | 未提及具体的数据分析限制或研究空白,可能缺乏对CAFs靶向策略临床转化挑战的深入讨论 | 全面解析前列腺癌中CAFs的生物学机制,为靶向CAFs的治疗提供理论基础 | 前列腺癌微环境中的癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 自然语言处理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |