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当前共找到 1234 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-01-22 |
CBX3 confers ferroptosis resistance during blood-borne metastasis
2026-Jan-15, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-025-01777-0
PMID:41540451
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了循环肿瘤细胞（CTCs）通过上调CBX3和GPX4抵抗铁死亡，从而促进血行转移的机制 | 首次在单细胞水平上发现CTCs通过CBX3-EP300轴上调GPX4来抵抗铁死亡，并证实了CBX3与GPX4共表达的CTCs与转移进展的临床关联 | 研究主要基于肺癌和黑色素瘤患者，其他癌症类型中的普适性有待验证，且体内功能验证的模型数量有限 | 探究循环肿瘤细胞在血行转移过程中抵抗细胞死亡的生存机制 | 肺癌和黑色素瘤患者的循环肿瘤细胞及脑转移肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、全外显子组测序、转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据、基因组数据 | 肺癌和黑色素瘤患者的前瞻性队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 微流控富集的CTCs单细胞RNA测序 |
| 622 | 2026-01-22 |
Multi-omic Longitudinal Analysis of Canine Osteosarcoma Identifies Inter-Patient Heterogeneity and Immune Enrichment in Metastatic Lesions
2026-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.05.696411
PMID:41542617
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研究论文 | 本研究通过多组学纵向分析犬骨肉瘤，揭示了患者间异质性以及转移病灶中的免疫富集特征 | 首次在犬骨肉瘤中进行了配对原发和转移肿瘤样本的纵向多组学分析，强调了患者特异性基因组变化在肿瘤进展中的作用 | 样本量相对较小，且研究基于犬模型，可能不完全适用于人类骨肉瘤 | 理解骨肉瘤在肿瘤进化过程中获得的特征，特别是患者特异性耐药机制 | 犬自发性骨肉瘤的配对原发和转移肿瘤样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 配对原发和转移肿瘤样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 623 | 2026-01-22 |
Tumor-associated macrophages educated by IGSF9 exhibit a senescence-associated secretory phenotype to promote tumor immune escape
2026-Jan-14, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012889
PMID:41534903
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研究论文 | 本研究揭示了免疫球蛋白超家族成员9（IGSF9）通过结合TMUB1蛋白激活IL-6/STAT3信号通路，诱导肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）发生衰老并呈现衰老相关分泌表型，从而抑制T细胞活性、形成免疫抑制性肿瘤微环境并促进肿瘤免疫逃逸的过程，并证明抗IGSF9抗体治疗可逆转此过程并抑制肿瘤生长 | 首次发现TMUB1是IGSF9的结合蛋白，并阐明IGSF9通过诱导TAMs衰老和呈现衰老相关分泌表型来促进肿瘤免疫逃逸的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，其在人类肿瘤中的普适性及临床转化潜力仍需进一步验证 | 探究IGSF9如何影响肿瘤相关巨噬细胞的功能及其在肿瘤免疫逃逸中的作用机制 | 肿瘤相关巨噬细胞、T细胞、IGSF9蛋白、TMUB1蛋白 | 肿瘤免疫学 | 肿瘤 | 空间转录组学、RNA-seq、流式细胞术、膜系统酵母双杂交筛选、GST pull-down、免疫共沉淀、免疫荧光 | NA | 空间转录组数据、RNA-seq数据、流式细胞数据、免疫荧光图像 | 使用了来自公共数据集GSE189487的空间转录组数据，并进行了小鼠体内实验（C57BL/6、NSG、OT-II等品系） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 624 | 2026-01-22 |
Mutant calreticulin enables potent and selective CAR-T cell therapy in preclinical models of myeloproliferative neoplasms
2026-Jan-13, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012706
PMID:41529908
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研究论文 | 本研究首次展示了利用靶向突变钙网蛋白（mCALR）的CAR-T细胞治疗骨髓增殖性肿瘤（MPNs）的临床前有效性 | 首次成功将CAR-T细胞疗法应用于靶向mCALR突变治疗MPNs，并揭示了凋亡抵抗机制及与venetoclax联合治疗的协同策略 | 研究处于临床前阶段，需进一步临床验证；样本量有限，主要基于细胞系和小鼠模型 | 开发针对BCR::ABL1阴性MPNs的新型CAR-T细胞疗法 | 突变钙网蛋白（mCALR）阳性的骨髓增殖性肿瘤细胞 | 免疫治疗 | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | CAR-T细胞 | 基因表达数据，细胞功能数据 | 细胞系、患者来源细胞及小鼠异种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 625 | 2026-01-22 |
Serum cytokines predict response and survival in esophageal squamous cell carcinoma receiving chemoradiotherapy combined with anti-PD-1 antibody: analyses of two phase II clinical trials
2026-Jan-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013065
PMID:41526165
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研究论文 | 本研究通过分析血清细胞因子，构建了CYTOscore风险评分模型，用于预测食管鳞状细胞癌患者在接受放化疗联合抗PD-1抗体治疗后的反应和生存 | 首次在食管鳞状细胞癌中，基于血清细胞因子IL-8、CCL3和CCL4构建了预测放化疗联合免疫治疗疗效和生存的风险评分模型（CYTOscore），并进行了多组学分析以探索肿瘤微环境的差异 | 研究样本量相对较小（探索队列81例，验证队列61例），且为回顾性分析和单中心验证，需要更大规模的前瞻性研究进一步验证 | 识别能够预测食管鳞状细胞癌患者接受放化疗联合抗PD-1抗体治疗反应和生存的细胞因子生物标志物 | 局部晚期食管鳞状细胞癌患者 | 肿瘤免疫学 | 食管鳞状细胞癌 | 血清细胞因子检测、RNA-seq、全外显子组测序、空间转录组学 | 风险评分模型（CYTOscore）、诺模图 | 血清样本、肿瘤组织样本 | 探索队列81例患者，独立验证队列61例患者 | NA | RNA-seq, WES, 空间转录组学 | NA | NA |
| 626 | 2026-01-22 |
Non-neuronal cell microenvironment control retinal vascular remodeling by CST3 in the oxygen-induced retinopathy in mice
2026-Jan-12, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2026.110860
PMID:41534651
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠氧诱导视网膜病变模型中视网膜血管微环境的细胞组成及其在血管生成调控中的关键作用，并发现CST3在ROP发展中的潜在治疗靶点价值 | 首次在OIR模型中通过scRNA-seq系统解析五种视网膜血管微环境细胞类型的动态调控网络，并发现Müller胶质细胞通过CST3表达调控缺氧适应期血管形态发生的新机制 | 研究局限于小鼠动物模型，尚未在人类临床样本中验证；单细胞测序数据仅反映转录组水平变化，缺乏蛋白功能验证 | 阐明早产儿视网膜病变（ROP）中视网膜血管异常发育的分子机制 | 氧诱导视网膜病变（OIR）小鼠模型中的视网膜血管微环境细胞 | 数字病理学 | 视网膜病变 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 动物模型（小鼠OIR模型） | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量（基于OIR小鼠模型） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 627 | 2026-01-22 |
Beyond the Cell Atlas: Functional Communities as the Essential Pathological Units Driving Kidney Disease
2026-Jan-09, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000001023
PMID:41563353
|
综述 | 本文提出“功能社区”作为肾脏疾病的关键病理单元，并综述了空间多组学技术和人工智能在解析这些社区中的应用 | 引入“功能社区”概念作为肾脏疾病的决定性病理单元，强调空间约束的多细胞邻域交互，超越了传统单细胞图谱的局限 | NA | 推动对肾脏疾病病理生理学的更深入理解，并指导新一代诊断和靶向治疗的发展 | 肾脏疾病中的功能社区，包括适应不良修复微环境、促纤维化微环境和组织破坏性免疫微环境 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间多组学技术、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞测序、空间多组学 | NA | NA |
| 628 | 2026-01-22 |
Single-Cell Resolution Drug Effects of Renin-Angiotensin-Aldosterone Blockade in ZSF1 Rat Diabetic Kidney Disease
2026-Jan-07, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000995
PMID:41563360
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，在ZSF1肥胖大鼠模型中探究了依那普利对糖尿病肾病的作用机制，并揭示了远端肾单位与TREM2+驻留巨噬细胞之间的相互作用 | 首次在单细胞分辨率下揭示了依那普利对糖尿病肾病的药物作用机制，并发现远端肾单位损伤状态及CTSD作为重要调节因子 | 研究主要基于大鼠模型，人类样本验证尚需进一步扩大样本量 | 探究依那普利在糖尿病肾病中的细胞作用靶点及分子机制 | ZSF1肥胖大鼠的肾脏细胞及人类肾脏样本 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 629 | 2026-01-22 |
Divergent role of CD8 T cells with distinct metabolic phenotypes during curative radio-immunotherapy in hot versus cold tumors
2026-Jan-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.24.684274
PMID:41279819
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研究论文 | 本研究探讨了CD8 T细胞在热肿瘤与冷肿瘤中，在治愈性放疗-免疫疗法中的不同作用 | 开发了一种能治愈大型热和冷小鼠肿瘤的放疗-免疫疗法方案，并利用表达mCherry的CD8 T细胞免疫活性小鼠模型进行细胞追踪 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；未详细探讨其他免疫细胞类型的作用 | 改善免疫疗法在免疫学冷肿瘤中的反应 | 热结肠癌与冷黑色素瘤小鼠模型中的CD8 T细胞 | 免疫肿瘤学 | 结肠癌, 黑色素瘤 | 流式细胞术, 多光子成像, 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 630 | 2026-01-22 |
Designing 5' UTR sequences improves the capacity of mRNA therapeutics in preclinical models of aging and obesity
2026-Jan-02, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.12.060
PMID:41485049
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研究论文 | 本研究通过设计5' UTR序列，在衰老和肥胖小鼠模型中提高了mRNA疗法的治疗潜力 | 发现RPL18、RPL35和RPS9的5' UTR能增强合成mRNA的蛋白质输出，特别是在高活性氧水平细胞中，且独立于其末端寡嘧啶基序 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探索5' UTR序列设计对mRNA疗法在衰老和肥胖模型中的治疗潜力提升 | 小鼠模型（衰老和肥胖）、人类和小鼠细胞 | 生物信息学 | 衰老和肥胖 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、核糖体分析、交联免疫沉淀测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 631 | 2026-01-22 |
Multi-omics data mining reveals macrophage-mediated effects of cathepsin B on esophageal adenocarcinoma risk
2026-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149423
PMID:41349740
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法，揭示了组织蛋白酶B通过调节巨噬细胞表型影响食管腺癌风险的因果机制 | 首次采用整合多组学方法（包括孟德尔随机化、转录组关联研究、单细胞RNA测序和单细胞表达数量性状位点分析）系统阐明CTSB通过巨噬细胞清道夫受体调控巨噬细胞表型从而影响食管腺癌风险的因果路径 | 研究主要基于西方人群数据，结论在其他人群中的普适性有待验证；实验验证部分主要依赖免疫组化，后续需要更多功能实验支持 | 探究组织蛋白酶家族与食管腺癌的因果关系及潜在发病机制 | 食管腺癌患者样本及相关的多组学数据 | 生物信息学与计算生物学 | 食管腺癌 | 孟德尔随机化, 转录组关联研究, 单细胞RNA测序, 单细胞表达数量性状位点分析, 免疫组化, 蛋白质对接 | 多组学整合分析模型 | 基因组, 转录组, 单细胞表达, 蛋白质互作 | 未明确提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 632 | 2026-01-22 |
Protrichocysts: a hybrid defense extrusive organelle bridging mechanical projection and chemical secretion in ciliates
2026, Current research in microbial sciences
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.crmicr.2025.100539
PMID:41551587
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研究论文 | 本研究通过综合方法探究了纤毛虫中原毛囊的结构与功能，揭示了其作为一种结合机械投射与化学分泌的混合防御细胞器的新机制 | 首次系统揭示了原毛囊的三阶段喷射过程、生化成分及其作为混合防御细胞器的多功能性，提出了其在细胞间通讯中的潜在作用 | 研究主要基于特定纤毛虫物种，其机制在其他原生生物中的普适性仍需验证；单细胞转录组分析的样本量有限 | 探究纤毛虫中原毛囊这一喷射细胞器的结构、功能及其在真核生物分泌系统进化中的意义 | 纤毛虫中的原毛囊（一种喷射细胞器） | 细胞生物学 | NA | 捕食者-猎物互作实验、电子显微镜、组织化学分析、SDS-PAGE、HPLC-MS/MS、单细胞转录组分析 | NA | 显微图像、蛋白质电泳数据、质谱数据、转录组数据 | 未明确具体样本数量，但涉及捕食互作实验、显微观察及单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA |
| 633 | 2026-01-22 |
Lymph Node Metastasis-Associated Spatiotemporal Mapping of the TFF3-Linked Niche in Breast Cancer: Integrating Radiogenomic Signatures with Immune-Ecosystem Remodeling
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1016
PMID:41551914
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间多组学分析和放射基因组学模型，揭示了TFF3在乳腺癌淋巴结转移中的核心调控作用及其与免疫微环境重塑和MAPK-EMT轴的关系 | 首次通过淋巴结转移分层单细胞测序鉴定出ALNM+乳腺癌的三种标志性免疫亚群，并整合孟德尔共定位分析与空间图谱，将TFF3确立为空间EMT程序的核心调控因子，同时开发了基于TFF3的放射组学风险评分，并发现6-巯基嘌呤可作为新型TFF3拮抗剂 | 研究主要基于回顾性队列（TCGA/佛山队列），需要前瞻性临床验证；体内模型为异种移植模型，与人体微环境存在差异；药物6-巯基嘌呤的临床转化潜力需进一步评估 | 阐明乳腺癌淋巴结转移的分子机制，并探索基于TFF3的诊疗新策略 | 原发性乳腺癌（PBC）伴腋窝淋巴结转移（ALNM+）的肿瘤组织、免疫细胞及转移生态位 | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学、孟德尔共定位分析、放射组学建模、蛋白质组学、批量RNA测序 | 机器学习模型（用于CT特征提取） | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据、CT影像数据、基因组数据 | 来自TCGA和佛山队列的乳腺癌样本（具体数量未明确说明），包含ALNM+和ALNM-亚群 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 634 | 2026-01-22 |
Integrative Bioinformatics and Machine Learning Identify Novel Diagnostic Biomarkers and Molecular Mechanisms in Sjögren's Syndrome
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/5044551
PMID:41551935
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法，识别了干燥综合征的新型诊断生物标志物并阐明了其分子机制 | 结合12种机器学习算法、加权基因共表达网络分析及单细胞RNA测序数据验证，识别出12个具有卓越诊断性能的枢纽基因，并进行了药物重定位分析 | 研究主要基于公共转录组数据集，缺乏独立的前瞻性临床队列验证，且未进行实验验证 | 识别干燥综合征的新型诊断生物标志物并阐明其分子机制 | 干燥综合征患者和健康对照者的外周血转录组数据 | 机器学习 | 干燥综合征 | 转录组测序，单细胞RNA测序 | 多种机器学习算法 | 基因表达数据 | 351名干燥综合征患者和91名健康对照者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 635 | 2026-01-21 |
RUNX1 N6-methyladenosine methylation enhances cytoskeleton remodeling and boosts cardiac fibrosis
2026-Jan-20, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag010
PMID:41555207
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研究论文 | 本研究揭示了YTHDF1通过识别m6A修饰的Runx1 mRNA增强其翻译，进而驱动RUNX1介导的Ctgf转录，从而促进心脏成纤维细胞增殖和纤维化的新表观转录组学通路 | 首次阐明了m6A介导的YTHDF1-RUNX1轴在心脏纤维化中的调控机制，特别是发现了peak_21317位点特异性m6A修饰对于YTHDF1结合和促进Runx1翻译的关键作用 | 当前转录因子结合模型很少整合RNA修饰，且包含这些修饰的最新方法仍然有限，这阻碍了转录因子亲和力的准确分析 | 探究m6A介导的机制在心脏纤维化过程中调控RUNX转录因子的作用 | 人心房颤动组织、心脏成纤维细胞特异性Ythdf1条件性敲除小鼠、ISO/TAC诱导的心脏纤维化模型、TGF-β1刺激的心脏成纤维细胞 | 表观转录组学 | 心血管疾病 | MeRIP-seq, 单细胞RNA-seq, RNA-seq, ChIP-seq, RNA测序, 组织学和生化分析 | 条件性敲除小鼠模型, AAV9介导的基因敲低模型 | RNA测序数据, 单细胞RNA-seq数据, ChIP-seq数据, 组织学图像, 生化数据 | 人心房颤动组织样本、多组小鼠模型（包括Ythdf1条件性敲除鼠、Cre对照、野生型对照） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 636 | 2026-01-21 |
Integrated multi-omics identifies MCRS1 as a causal hub linking aging, metabolic syndrome, and breast cancer progression
2026-Jan-20, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004592
PMID:41556158
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，识别出MCRS1是连接衰老、代谢综合征和乳腺癌进展的核心因果枢纽 | 首次通过整合乳腺癌、代谢综合征和衰老队列的转录组数据集，结合机器学习、孟德尔随机化和单细胞RNA测序，识别并验证了MCRS1作为连接这些状态的核心因果驱动因子 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要在人类患者中进行进一步验证 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 637 | 2026-01-21 |
S3RL: Enhancing Spatial Single-Cell Transcriptomics With Separable Representation Learning
2026-Jan-20, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516178
PMID:41556263
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研究论文 | 本文提出了一种名为S3RL的可分离表示学习框架，用于增强空间单细胞转录组数据的保真度，以解码复杂的组织微环境 | S3RL通过有效去噪稀疏测量和放大生物学相关信号，能够恢复原本会丢失的细粒度空间表达模式和调控关系，在空间域识别和多切片对齐方面实现了高达170%的调整兰德指数改进 | 未在摘要中明确说明 | 增强空间转录组数据的保真度，以更好地解码复杂的组织微环境 | 人类、小鼠和植物等多种组织的空间转录组数据 | 空间转录组学 | 肿瘤免疫交互 | 空间转录组学 | 可分离表示学习框架 | 空间转录组数据 | 多种人类、小鼠和植物组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 638 | 2026-01-21 |
Single-cell characterization of the adult male hippocampus suggests a prominent, and cell-type specific, role for Nrgn and Sgk1 in response to a social stressor
2026-Jan-19, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03417-y
PMID:41554902
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序，对成年雄性小鼠海马体在基础状态和急性应激条件下的分子特征进行了全面表征，并利用基因敲除模型探索了糖皮质激素受体和盐皮质激素受体在应激反应中的作用 | 首次在单细胞水平上揭示了成年雄性小鼠海马体对单一延长社交挫败应激的细胞类型特异性分子特征，并鉴定出Nrgn和Sgk1作为应激反应性神经元的关键调控因子 | 研究仅针对成年雄性小鼠，未涵盖雌性或不同年龄阶段的动物，且仅关注了海马体这一特定脑区 | 探究应激相关精神障碍的分子机制，特别是海马体在应激反应中的细胞类型特异性调控网络 | 成年雄性小鼠海马体细胞，包括谷氨酸能神经元、GABA能神经元、少突胶质细胞、星形胶质细胞和内皮细胞 | 单细胞组学 | 应激相关精神障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 639 | 2026-01-21 |
Deciphering CD4+ Naive T cell-mediated divergent pathogenic links between type 2 diabetes and pathologic scarring via an integrated multi-omics approach
2026-Jan-19, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004905
PMID:41556164
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法，揭示了2型糖尿病通过CD4+初始T细胞介导的免疫微环境调控，对增生性瘢痕和瘢痕疙瘩产生相反因果效应的潜在机制 | 首次采用表型范围孟德尔随机化结合单细胞RNA测序等多组学技术，系统阐明了2型糖尿病与不同病理性瘢痕之间的因果关联及CD4+初始T细胞的介导作用 | 研究主要基于遗传学和转录组学数据，缺乏直接的体内功能验证实验 | 探究糖尿病与病理性瘢痕（增生性瘢痕和瘢痕疙瘩）之间的因果关系及免疫细胞机制 | 糖尿病（1型和2型）与病理性瘢痕（增生性瘢痕和瘢痕疙瘩） | 多组学整合分析 | 糖尿病与皮肤纤维化疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、细胞间通讯推断、代谢通路分析、转录组差异表达分析 | 孟德尔随机化模型、伪时间轨迹分析 | 遗传数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 640 | 2026-01-21 |
scPlantAnnotate: an accurate and robust transformer-based model for plant cell type annotation
2026-Jan-17, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.01.035
PMID:41554477
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研究论文 | 开发并评估了scPlantAnnotate，一种基于Transformer的植物单细胞RNA测序数据注释框架 | 首次提出针对植物数据的Transformer模型，在标准评估和更严格的留一数据集评估中均优于现有方法，提高了对数据集偏移的鲁棒性 | 模型主要针对特定植物物种（拟南芥、玉米、水稻、大豆），可能未涵盖所有植物类型；在留一数据集评估中，所有方法性能均因批次效应和数据集异质性而下降 | 开发一个植物专用的单细胞RNA测序数据细胞类型注释框架，以支持植物细胞图谱构建和下游生物学发现 | 拟南芥、玉米、水稻和大豆的植物单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer | 单细胞RNA测序数据 | 使用来自拟南芥、玉米、水稻和大豆的精选数据集进行训练 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |