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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-05-12 |
Mapping the immune environment: spatiotemporal dynamics in cardiovascular events
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1809941
PMID:42112356
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综述 | 提出一个四维时空框架来描绘心血管事件中的免疫动态变化 | 将免疫反应从静态风险因素转变为可测量、可靶向的时空动态过程,整合分子成像、单细胞和空间转录组学等技术 | 未在真实患者队列中进行完整验证,缺乏多中心临床数据支持 | 构建心血管事件免疫环境的时空动态框架,实现精确免疫调节 | 心血管疾病中的免疫细胞、炎症介质和组织微环境 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 分子成像数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据、生物标志物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 622 | 2026-05-12 |
Nerve growth factor responsive elements modulate immune cell inflammation and are dysregulated in an Alzheimer's disease mouse model
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1722477
PMID:42112371
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研究论文 | 本研究通过多色流式细胞术和单细胞RNA测序,揭示神经生长因子受体在不同免疫细胞亚型中的表达模式,并发现阿尔茨海默病小鼠模型中NGF响应元件失调 | 首次全面绘制免疫细胞中NGF受体(TrkA和p75)的细胞类型依赖性表达图谱,并发现RNA与蛋白水平表达不一致,以及NGF补充可显著降低活化T细胞和B细胞的炎症细胞因子产生 | 研究主要基于小鼠模型和离体实验,缺乏人类样本验证;未深入探讨NGF信号调控炎症消退的具体分子机制 | 探究神经生长因子如何通过其受体调节免疫细胞炎症反应,并分析在阿尔茨海默病模型中的失调机制 | 未刺激小鼠脾脏中的多种免疫细胞亚型,包括树突状细胞、巨噬细胞、自然杀伤细胞及淋巴细胞(T细胞和B细胞) | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 多色流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白表达数据, 转录组数据 | 使用AD小鼠模型和未刺激小鼠脾脏样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 623 | 2026-05-12 |
Glioma-intrinsic SLC1A3 hijacks the vascular niche to establish an immunosuppressive microenvironment
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1824726
PMID:42112375
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研究论文 | 本研究揭示了胶质瘤固有基因SLC1A3劫持血管微环境建立免疫抑制微环境的机制 | 结合多组学分析、单细胞RNA测序、AI基础模型Geneformer进行虚拟遗传扰动,首次发现SLC1A3作为关键上游节点协调肿瘤-内皮-T细胞免疫抑制轴,而非仅作为内在驱动因子 | 未提及具体局限性 | 解析胶质瘤起始细胞从神经干细胞演化过程中的转录重编程和选择性剪接事件,以及这些细胞内状态变化如何驱动多细胞免疫抑制网络和检查点 | 神经干细胞和患者来源的胶质瘤起始细胞队列 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq, 选择性剪接分析, 单细胞RNA-seq, AI虚拟敲除, 体外共培养系统, qPCR, FACS | Geneformer | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 临床队列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 624 | 2026-05-12 |
Gut microbiota pathways linking primary sclerosing cholangitis to colorectal cancer: the Lachnospiraceae family and PCBP1
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1781475
PMID:42112443
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序探索原发性硬化性胆管炎通过肠道微生物群与结直肠癌关联的机制,发现毛螺菌科和PCBP1基因是关键中介 | 首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序揭示原发性硬化性胆管炎通过肠道微生物群(尤其是毛螺菌科)和PCBP1基因增加结直肠癌风险的因果通路,并鉴定了介导比例 | 分析基于遗传预测而非直接测量,潜在混杂因素未完全排除,PCBP1的功能特异性及临床实用性需独立队列和机制模型验证 | 探索原发性硬化性胆管炎与结直肠癌通过肠道微生物群信号的连接通路,并识别候选宿主基因 | 原发性硬化性胆管炎患者、结直肠癌患者及肠道微生物群 | 机器学习 | 结直肠癌, 原发性硬化性胆管炎 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 微生物群数据 | 利用公开GWAS汇总统计数据(非原始样本),单细胞RNA测序数据来自PSC和CRC患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 625 | 2026-05-12 |
Identification of Immune-Related Lactylation Genes in Rheumatoid Arthritis With Atherosclerosis: A Comprehensive Analysis Using Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/9969894
PMID:42112590
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研究论文 | 利用批量与单细胞RNA测序数据,综合分析类风湿关节炎合并动脉粥样硬化中的免疫相关乳酰化基因 | 首次系统研究乳酰化相关基因在类风湿关节炎合并动脉粥样硬化中的诊断潜力,并结合单细胞数据探讨免疫细胞中的乳酰化评分差异 | 研究基于公开数据集,样本量有限,且乳酰化在RA和AS中的具体调控机制尚未深入验证 | 探究乳酰化相关基因作为类风湿关节炎合并动脉粥样硬化潜在诊断标志物的价值 | 类风湿关节炎患者和动脉粥样硬化患者的基因表达数据及免疫细胞 | 机器学习 | 类风湿关节炎, 动脉粥样硬化 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的GSE89408(RA数据集)和GSE43292(AS数据集) | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 626 | 2026-05-10 |
miR-22-Galectin-1 as an integral signaling axis in regulating metabolism and immunity in HCC
2026-Jan-15, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00838-3
PMID:41540504
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研究论文 | 本研究探讨miR-22与半乳糖凝集素-1(Gal-1)的相互作用在肝细胞癌(HCC)发展和治疗中的作用 | 揭示了miR-22-Gal-1信号轴在调控HCC代谢和免疫中的双重作用,并证明了miR-22基因治疗依赖于Gal-1沉默 | 未提供明确的局限性说明 | 研究miR-22-Gal-1轴在HCC发展和治疗中的重要性 | 肝细胞癌(HCC)患者和小鼠模型 | NA | 肝细胞癌 | 基因治疗、RNA干扰、空间转录组学、转录组学分析 | NA | 转录组数据、空间转录组数据 | 人类HCC样本来自癌症基因组图谱数据库;小鼠模型为原位HCC小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 627 | 2026-05-09 |
Advances in Adipose Tissue Biology
2026-Jan-13, Endocrine reviews
IF:22.0Q1
DOI:10.1210/endrev/bnaf032
PMID:41071598
|
综述 | 综述脂肪组织生物学的最新进展及其在健康与疾病中的关键作用 | 强调脂肪组织作为人体生理中心调节器的新认识,以及单细胞RNA测序等新技术在揭示脂肪库特异性机制中的应用潜力 | 未明确提及局限性,但综述本身可能受限于现有研究范围和发表时间 | 阐述脂肪组织在健康和疾病中的重要角色的科学进展 | 脂肪组织和脂肪细胞 | 计算生物学 | 肥胖相关疾病, 2型糖尿病, 心血管疾病, 肝脏疾病, 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 628 | 2026-05-09 |
Leveraging AI for cell biology discovery
2026-01-08, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253023
PMID:41502213
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综述 | 探讨人工智能在细胞生物学中的应用,包括显微镜成像、药物发现和合成生物学等领域 | 系统总结了AI在单细胞分辨率细胞图像分析、复杂生物模式识别及细胞行为建模方面的最新进展 | 涉及数据质量要求、模型可解释性以及AI工具在生物领域普及化的挑战 | 概述AI在细胞生物学发现中的变革性作用,展望未来基础研究和治疗应用方向 | 细胞生物学中的AI应用场景,包括显微镜图像、转录组数据和蛋白质结构 | 机器学习 | NA | NA | 深度学习 | 图像, 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 629 | 2026-05-09 |
Microneedle Delivery of Small Extracellular Vesicles From Young Blood to Treat Endothelial Senescence
2026-Jan, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202418352
PMID:40765122
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研究论文 | 利用微针递送来自年轻血液的小细胞外囊泡治疗内皮的衰老 | 首次将微针递送技术与年轻血液来源的小细胞外囊泡结合,用于延缓内皮细胞衰老并减轻炎症,并通过单细胞RNA测序揭示其作用机制 | 未提及具体局限性 | 评估源自年轻血液的小细胞外囊泡在调节内皮细胞衰老中的作用,并探索其通过微针递送的可行性 | 脐带血浆中的小细胞外囊泡与老年人血浆中的小细胞外囊泡,以及老龄小鼠的内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 分离自脐带血浆(年轻)和老年人血浆(>70岁)的小细胞外囊泡,以及22-24个月大的老龄小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 630 | 2026-05-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune regulatory mechanisms and molecular therapeutic strategies in the microenvironment of multiple myeloma
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003306
PMID:40899849
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示多发性骨髓瘤微环境中的免疫调控机制和分子治疗策略 | 结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和分子对接分析,首次系统性揭示多发性骨髓瘤微环境中免疫相关信号通路及关键基因的因果作用 | 未提及具体样本来源和样本量,可能限制结论的普适性 | 探究多发性骨髓瘤微环境中的分子和细胞相互作用,发现新治疗靶点 | 多发性骨髓瘤微环境中的肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞 | 机器学习和数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、分子对接分析 | Seurat聚类分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 631 | 2026-05-09 |
Host biological sex directs immune control of the Plasmodium parasite liver stage in mice
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1734587
PMID:41846936
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研究论文 | 探究宿主生物性别和雄激素如何调控疟原虫肝脏期感染的免疫控制 | 首次揭示雄激素通过减少寄生虫感染肝细胞的清除来增加寄生虫存活率,并阐明性别差异在肝脏先天性免疫细胞组成和免疫反应中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,需在人类中验证性别差异的关联性;未深入探讨雄激素作用的具体分子机制 | 分析生物性别和雄激素对疟原虫肝脏期宿主-寄生虫相互作用的调节作用 | 雄性、雌性、去势及雄激素处理的BALB/cJ小鼠,感染伯氏疟原虫子孢子 | 机器学习 | 疟疾 | 空间转录组学 | NA | 图像、文本 | 雄性、雌性、去势及雄激素处理的小鼠样本,具体数量未说明 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于分析肝脏组织中的基因表达 |
| 632 | 2026-05-09 |
GSK3β as a potential regulator in AML: A pan-cancer multi-omics analysis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0344994
PMID:41915675
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研究论文 | 通过泛癌多组学分析揭示GSK3β在急性髓系白血病中的潜在调控作用 | 首次在31种癌症中系统比较GSK3α/β亚型的差异表达和功能,发现GSK3β在AML中具有独立的预后价值,并揭示了亚型特异性的免疫微环境调控机制 | 未涉及具体分子机制的深入验证,且THP-1细胞系的体外实验无法完全代表AML患者体内的复杂微环境 | 探究GSK3α/β亚型在多种癌症中的表达模式、预后价值和免疫调控作用 | 31种癌症的TCGA、GTEx和单细胞RNA-seq多组学数据,以及AML THP-1细胞系 | 机器学习和数字病理学 | 肺癌、前列腺癌、肝癌、急性髓系白血病等 | 多组学整合分析、单细胞RNA-seq、Cox回归、免疫浸润分析 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 31种癌症的泛癌样本,包含TCGA和GTEx数据库的多个队列 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 633 | 2026-05-09 |
B cells in anti-tRNA synthetase syndrome patients show an activated, interferon-responsive signature
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1770291
PMID:42023216
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析抗tRNA合成酶综合征患者B细胞的激活及干扰素响应特征 | 首次在单细胞水平揭示抗tRNA合成酶综合征患者活化与记忆B细胞中干扰素和应激通路上调,并发现FKBP5和MYADM基因表达变化与细胞骨架重排、代谢及抗原呈递通路相关 | 发现需进一步验证,未来需探究其作为新靶点减少组织损伤的实用性 | 识别抗tRNA合成酶综合征中的失调通路作为新型治疗靶点 | 抗tRNA合成酶综合征患者与健康参与者的外周血单个核细胞中的CD19+B细胞 | 数字病理学 | 抗tRNA合成酶综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 抗tRNA合成酶综合征患者与健康参与者,样本量未具体说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 对流式分选的CD19+细胞进行单细胞RNA测序 |
| 634 | 2026-05-09 |
Emodin Inhibitsg Hepatocellular Carcinoma Invasion and Migration by Regulating the HDAC4/NF-κB (p65)/CXCL12 Signaling Axis and Suppressing M2 Macrophage Polarization
2026, The American journal of Chinese medicine
DOI:10.1142/S0192415X26500369
PMID:42036631
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研究论文 | 研究大黄素通过调控HDAC4/NF-κB(p65)/CXCL12信号轴抑制肝细胞癌侵袭迁移及M2型巨噬细胞极化 | 首次揭示大黄素通过HDAC4/NF-κB/CXCL12通路调控巨噬细胞极化并抑制肝细胞癌进展的新机制 | NA | 探究大黄素如何通过HDAC4/NF-κB/CXCL12通路调控巨噬细胞极化并影响肝细胞癌进展 | HepG2肝癌细胞、巨噬细胞、肝细胞癌模型 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接、表面等离子体共振、Western blot | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 635 | 2026-05-09 |
Molecular regulation of spermatogenesis: Insights from spatial transcriptomics
2026, Current topics in developmental biology
DOI:10.1016/bs.ctdb.2026.01.004
PMID:42097820
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综述 | 通过空间转录组学揭示精子发生的分子调控机制 | 首次系统综述空间转录组学技术在睾丸细胞空间组织、不同生精细胞群和体细胞区室相互作用中的应用,提供了对精子发生过程中基因表达模式的新见解 | 主要聚焦于当前空间转录组学技术的应用,未深入讨论技术本身的局限性(如分辨率、通量等) | 探讨从原始生殖细胞发育到精原干细胞过程中的关键调控因子、体细胞与生殖细胞的相互作用,以及空间转录组技术在干细胞研究中的应用 | 睾丸生精细胞(包括精原细胞、精母细胞、精子细胞)和睾丸体细胞(如支持细胞、间质细胞等) | 数字病理学 | NA | 空间转录组学、单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 636 | 2026-05-09 |
Unraveling spermatogenesis: A single-cell genomics perspective
2026, Current topics in developmental biology
DOI:10.1016/bs.ctdb.2026.03.003
PMID:42097818
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综述 | 本文从单细胞基因组学角度综述了精子发生过程的技术演变、关键生物学争议及未来研究方向 | 系统整合了单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和单细胞DNA甲基化等技术在精子发生研究中的应用,并提出了多组学与空间转录组学的未来前景 | 未提及具体实验验证或定量比较不同技术的性能差异 | 综述单细胞基因组学技术对雄性生殖细胞研究带来的变革,并展望临床转化潜力 | 精子发生过程,包括精原干细胞、生殖细胞分化及表观遗传调控 | 单细胞基因组学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞DNA甲基化, 多组学, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞DNA甲基化, 多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 637 | 2026-05-09 |
Integrating single-cell and bulk RNA sequencing data reveals RGS4 as a functional driver in a proliferative subgroup of SF-1 lineage PitNETs
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1815682
PMID:42099385
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研究论文 | 整合单细胞和批量RNA测序数据揭示RGS4是SF-1谱系PitNETs增殖亚组的功能驱动因子 | 首次识别出一个高表达RGS4的SF-1谱系PitNETs亚组,并阐明RGS4通过促进p53泛素化降解驱动肿瘤增殖的机制 | 未提及具体局限性 | 探索SF-1谱系垂体神经内分泌肿瘤异质性和增殖行为的分子决定因素 | SF-1谱系垂体神经内分泌肿瘤 | 机器学习 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 638 | 2026-05-08 |
scDenorm: a denormalization tool for integrating single-cell transcriptomics data
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag032
PMID:41915012
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研究论文 | 提出一种名为scDenorm的去标准化工具,用于整合单细胞转录组学数据 | 首次提出能逆转delta方法标准化后的单细胞组学数据、恢复原始计数并保持数据完整性的算法 | 仅对delta方法标准化的数据进行验证,未评估其他标准化方法的适用性 | 解决单细胞组学数据整合中因不同标准化方法导致的批次效应和基因表达失真问题 | 单细胞转录组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 639 | 2026-05-08 |
Cell-type- and chromosome-specific chromatin landscapes and DNA replication programs of Drosophila testis tumor stem cell-like cells
2026-01-05, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280809.125
PMID:41371963
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研究论文 | 开发细胞类型特异性基因组技术,分析果蝇睾丸肿瘤干细胞样细胞的转录组、组蛋白修饰图谱和复制时序 | 首次在体内对成年干细胞进行细胞类型特异性全基因组分析,整合转录组、染色质和复制数据,揭示生殖系干细胞样细胞独特的复制程序 | 仅使用了果蝇睾丸肿瘤干细胞样细胞模型,可能无法完全代表正常干细胞状态 | 阐明体内成体干细胞的转录、染色质和复制时序特征及其细胞类型特异性差异 | 果蝇睾丸生殖系干细胞样细胞和体细胞囊肿干细胞样细胞 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 细胞类型特异性染色质分析, 复制时序分析 | NA | 单细胞转录组数据, 组蛋白修饰数据(H3K4me3, H3K27me3, H3K9me3), 复制时序数据 | 果蝇睾丸组织, 包含生殖系干细胞和体细胞囊肿干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 染色质免疫沉淀测序, 复制时序测序 | NA | NA |
| 640 | 2026-05-08 |
Recovering gene regulatory networks in single-cell multi-omics data with PRISM-GRN
2026-01-05, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280757.125
PMID:41067887
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研究论文 | 提出PRISM-GRN模型,利用贝叶斯框架整合scRNA-seq与scATAC-seq数据及已知调控网络,重建细胞类型特异性基因调控网络 | 创新性地将已知基因调控网络和生物可解释机制融入概率框架,通过机制驱动的生成过程和先验网络引导的推理过程实现精确稳健的GRN重建 | 具体局限未在摘要中提及 | 开发一种能够利用多组学数据和先验知识重建细胞类型特异性基因调控网络的方法 | 多组学单细胞数据中的基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | 贝叶斯模型 | 基因表达数据,染色质可及性数据 | 四个基准数据集及PBMC数据集 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | NA |