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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2026-03-06 |
CeLLTra: aligning cell names with gene expression via a pathway-informed transformer
2026-Jan-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf655
PMID:41652996
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研究论文 | 本文提出了一种名为CeLLTra的新型对比学习框架,通过整合生物通路信息来改进单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | CeLLTra首次将Transformer模型与生物通路信息结合,通过将基因分组为超级标记来捕获全面的基因表达,并利用预训练的领域特定语言模型准确对齐细胞类型注释与基因表达谱 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种能够准确对齐细胞类型注释与基因表达谱的自动化方法,以改进单细胞RNA测序数据的细胞类型预测 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 自然语言处理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | Transformer | 基因表达数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 602 | 2026-03-06 |
Integrative Multi-omics Analysis and Mendelian Randomization Reveal Potential Therapeutic Targets and their Stratification in Lung Squamous Cell Carcinoma
2026, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和孟德尔随机化方法,识别了肺鳞状细胞癌的潜在治疗靶点及其分层 | 结合bulk RNA测序、WGCNA、生存分析、孟德尔随机化、LASSO回归、PPI网络分析、免疫浸润评估、单细胞RNA测序和伪时间分析,系统性地识别并分层了LUSC的预后相关治疗靶点 | NA | 识别新的治疗靶点以改善肺鳞状细胞癌的治疗策略 | 肺鳞状细胞癌 | 生物信息学 | 肺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | WGCNA, LASSO回归, 孟德尔随机化 | RNA测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 603 | 2026-03-06 |
Systematic Pan-Cancer Analysis of the Oncogenic and Immunological Function of Stanniocalcin-1 (STC1)
2026, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证,系统评估了STC1在泛癌中的致癌和免疫学功能,并重点验证了其在胃腺癌发病机制中的作用 | 首次系统性地揭示了STC1作为新型泛癌致癌因子的双重作用,既调控肿瘤进展(通过EMT和干性调控),又重塑免疫微环境,并明确了其与免疫检查点蛋白和T细胞浸润的强关联 | 研究主要基于TCGA等公共数据集和有限的实验验证(如30例胃腺癌组织芯片),未来需要更大规模的临床队列和体内实验进一步验证其机制和临床转化潜力 | 确立STC1在泛癌中的预后意义,阐明其与免疫学特征(如免疫检查点蛋白、TMB、MSI、免疫细胞浸润)的关联,并重点验证其在胃腺癌发病机制中的作用 | TCGA泛癌数据集中的多种癌症类型,以及胃腺癌组织样本和细胞系 | 生物信息学 | 泛癌(特别是胃腺癌) | 多组学分析、多重荧光染色、Western blot、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、组织图像数据 | TCGA泛癌数据集(33种癌症类型)、30例胃腺癌组织芯片、胃腺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序、组织芯片技术 | NA | NA |
| 604 | 2026-03-06 |
A New Model of Gastric Pre-neoplasia Induced by Aberrant ADAR1-mediated Double-stranded RNA Signaling
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101673
PMID:41197768
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研究论文 | 本文通过在小鼠胃壁细胞中特异性删除ADAR1基因,建立了一个新的胃前瘤变模型,揭示了内源性双链RNA信号在胃上皮损伤和癌前病变中的作用 | 首次在胃壁细胞中特异性删除ADAR1基因,建立了不依赖外源性损伤的自发性胃前瘤变模型,并发现线粒体双链RNA的富集是驱动这一过程的关键因素 | 研究基于小鼠模型,结果在人类胃前瘤变中的直接适用性尚需进一步验证 | 明确双链RNA信号在胃上皮细胞中的失调如何影响胃前瘤变的发生 | Adar1ΔPC小鼠及其对照组的胃组织,以及干扰素信号缺陷的基因工程小鼠 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、双链RNA免疫沉淀、免疫电子显微镜 | 基因工程小鼠模型 | 组织学图像、转录组数据、免疫学数据 | 未明确具体样本数量,涉及多种基因型小鼠的胃组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 605 | 2026-03-06 |
NAMPT inhibition uncovers therapeutic vulnerabilities to venetoclax and chemotherapy in acute myelogenous leukemia
2026-Jan, Leukemia & lymphoma
IF:2.2Q3
DOI:10.1080/10428194.2025.2571199
PMID:41401031
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研究论文 | 本研究探讨了通过抑制NAMPT来揭示急性髓系白血病(AML)细胞对venetoclax和化疗的脆弱性 | 首次结合单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,揭示了NAMPT抑制诱导BCL2适应性上调的生存机制,并验证了NAMPT与BCL2双重抑制的协同效应 | 研究为临床前实验,尚未在人体临床试验中验证,且具体亚型或患者群体的异质性可能影响结果 | 探索NAMPT抑制作为增强venetoclax和标准化疗疗效的策略,以靶向AML细胞的代谢和DNA修复脆弱性 | 急性髓系白血病(AML)细胞 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学分析,BH3分析 | NA | RNA测序数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 606 | 2026-03-06 |
Integrating computational engines to identify TSPAN6 as a migrasome-associated target for immunotherapy sensitization
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1782717
PMID:41782878
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研究论文 | 本研究通过整合计算引擎识别TSPAN6作为迁移体相关靶点,用于免疫治疗增敏 | 首次将迁移体与癌症免疫治疗抵抗联系起来,并利用大规模计算分析识别TSPAN6作为关键调控因子,同时通过药物筛选发现米托蒽醌作为潜在抑制剂 | 研究主要基于计算分析和体外实验,缺乏体内实验验证;样本量相对有限,特别是血清验证队列仅44例患者 | 探索迁移体在癌症免疫治疗抵抗中的作用,并寻找相关治疗靶点 | 癌症患者样本(包括TCGA、ICGC、CPTAC队列数据)和体外共培养模型 | 计算生物学 | 癌症 | 空间转录组学、计算分析、药物筛选 | NA | 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 5,957名患者(17种肿瘤类型)、超过440万个细胞、44例配对血清样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 607 | 2026-03-06 |
Inflammatory and neurotoxic risk of atorvastatin in diabetic peripheral neuropathy: TNF-centered evidence integrating network toxicology, scRNA-Seq, and cell validation
2026, Frontiers in chemistry
IF:3.8Q2
DOI:10.3389/fchem.2026.1739085
PMID:41783408
|
研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟和体外实验,探讨了阿托伐他汀在糖尿病周围神经病变中的炎症和神经毒性风险,重点关注TNFα的作用 | 首次整合网络毒理学、单细胞RNA测序和体外验证,系统揭示阿托伐他汀在糖尿病周围神经病变中可能通过TNFα介导的炎症反应导致细胞损伤的机制 | 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内验证;TNFα与阿托伐他汀毒性之间的因果关系尚未通过阻断或敲除实验证实 | 阐明阿托伐他汀在糖尿病周围神经病变中争议性的神经保护与神经毒性作用,特别是其潜在的炎症和神经毒性风险 | 高糖诱导的RSC 96雪旺细胞 | 生物信息学与计算生物学 | 糖尿病周围神经病变 | 单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟、CCK-8、ELISA | NA | 基因表达数据、分子结构数据、细胞实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 608 | 2026-03-06 |
Single-cell atlas reveals a pro-metastatic RELB+ neutrophil-myeloid subset underlying lymph node metastasis in EGFR-wildtype LUAD
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1766211
PMID:41783590
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了EGFR野生型肺腺癌中驱动淋巴结转移的促转移性ELANE阳性中性粒细胞亚群及其关键转录调控因子RELB | 首次在EGFR野生型肺腺癌中鉴定出与淋巴结转移相关的促转移性ELANE阳性中性粒细胞亚群,并发现RELB作为其核心转录调控因子 | 研究主要基于回顾性数据分析,功能验证在体外共培养系统中进行,缺乏体内实验验证 | 阐明EGFR野生型肺腺癌淋巴结转移的细胞驱动因素和分子机制 | EGFR野生型肺腺癌患者样本中的髓系细胞,特别是中性粒细胞亚群 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,qPCR,增殖、克隆形成、迁移和侵袭实验 | UCell算法,pySCENIC | 单细胞转录组数据,bulk转录组数据 | 多队列EGFR野生型肺腺癌患者样本,包括TCGA数据 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 609 | 2026-02-02 |
Revealing FPR1 as a potential pathogenic biomarker for aortic dissection based on Mendelian randomization, single-cell transcriptome and clinical data analysis
2026-Jan-31, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00732-4
PMID:41620799
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 610 | 2026-03-05 |
Fibroblast-derived alarmin promotes oral wound healing by activating regulatory T cells that relay pro-angiogenic and anti-inflammatory responses
2026-Jan-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116829
PMID:41533514
|
研究论文 | 本研究通过口腔损伤模型揭示了表达IL-33的成纤维细胞通过激活调节性T细胞促进伤口愈合的机制 | 首次鉴定出口腔黏膜中表达IL-33的PI16网状成纤维细胞,并阐明其通过激活Treg细胞分泌MIF和TGF-β1来协调血管生成和炎症消退的新通路 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且具体信号通路细节仍需进一步探索 | 探究成纤维细胞在口腔伤口愈合中的免疫调节功能及其分子机制 | 小鼠口腔伤口模型及人类口腔黏膜组织 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 611 | 2026-03-05 |
MOMHCA-SG: a multi-head cross-attention and similar graph convolutional network framework for Alzheimer's disease cell type classification
2026, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2026.1728558
PMID:41777739
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研究论文 | 本文提出了一种名为MOMHCA-SG的新型多组学整合框架,用于阿尔茨海默病的细胞类型分类 | 结合多头交叉注意力机制与基于相似性网络融合的图卷积网络,动态整合异质多组学数据并捕获跨模态关系 | NA | 通过多组学数据整合提升阿尔茨海默病的细胞类型分类精度,以促进疾病机制解析 | 阿尔茨海默病相关的scRNA-seq和scATAC-seq数据集 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq, scATAC-seq | 多头交叉注意力机制, 图卷积网络, 自编码器 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 612 | 2026-03-04 |
Chimeric brain models to study human glial-neuronal and macroglial-microglial interactions
2026-Jan-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116794
PMID:41499239
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研究论文 | 本研究通过将人源多能干细胞衍生的神经前体细胞和巨噬细胞前体细胞共移植到新生小鼠大脑中,构建了包含人类小胶质细胞、大胶质细胞和神经元的嵌合大脑模型,用于研究人类胶质细胞-神经元以及胶质细胞间的相互作用 | 开发了一种新型共移植嵌合大脑模型,首次在体内同时整合了人类神经元、大胶质细胞和小胶质细胞,并利用单细胞RNA测序和细胞间通讯分析揭示了人类神经细胞间特异的信号通路 | 模型基于小鼠宿主环境,可能无法完全模拟人类大脑的完整微环境;研究主要关注发育早期阶段,成年期相互作用的长期效应尚不明确 | 研究人类胶质细胞与神经元之间以及不同类型胶质细胞之间的相互作用机制 | 人类多能干细胞衍生的神经前体细胞和巨噬细胞前体细胞,移植到新生小鼠大脑中形成的嵌合组织 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,超分辨率成像,3D重建,细胞间通讯分析 | 嵌合大脑模型 | 单细胞转录组数据,成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 613 | 2026-03-04 |
LncRNA ZFAS1 Promotes Alveolar Bone Resorption by Enhancing Osteoclastogenesis in Periodontitis
2026-01, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70134
PMID:41549697
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研究论文 | 本研究探讨了长链非编码RNA ZFAS1在牙周炎微环境中骨重塑失调的机制作用 | 揭示了lncRNA ZFAS1作为炎症性骨丢失的关键驱动因子,通过促进破骨细胞生成和抑制成骨细胞生成发挥双重调控作用 | 研究主要基于体外细胞模型(RAW264.7和MC3T3-E1细胞),体内验证和临床转化潜力需进一步探索 | 阐明牙周炎中骨吸收的分子机制,特别是lncRNA ZFAS1在病理骨丢失中的作用 | 牙周组织(健康与患病)、RAW264.7破骨前体细胞、MC3T3-E1成骨前体细胞 | 分子生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、qPCR、组织学、免疫组织化学 | NA | RNA测序数据、基因表达数据、组织图像 | 未明确具体样本数量,涉及健康与患病牙周组织样本及细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 614 | 2026-03-04 |
The Ly6ghigh Neutrophil Subset Dictates Breast Cancer Lung Metastasis via CD8+ T Cell Death
2026, Cancer communications (London, England)
DOI:10.34133/cancomm.0003
PMID:41625479
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研究论文 | 本研究揭示了Ly6g高表达中性粒细胞亚群通过NETs中的cathelicidin诱导CD8+ T细胞凋亡,从而促进乳腺癌肺转移的机制 | 首次鉴定出Ly6g高表达中性粒细胞亚群在乳腺癌肺转移中的关键作用,并阐明其通过NETs释放cathelicidin直接结合CD8+ T细胞线粒体蛋白Ant1触发凋亡的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证尚不充分;机制研究集中在cathelicidin-Ant1轴,可能存在其他调控途径 | 解析乳腺癌肺转移微环境中中性粒细胞与CD8+ T细胞的相互作用机制及其在免疫逃逸中的作用 | 小鼠乳腺癌肺转移模型中的肺组织、中性粒细胞亚群、CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、多重免疫荧光、蛋白质结合实验 | NA | 单细胞转录组数据、流式数据、免疫荧光图像、蛋白质互作数据 | 小鼠乳腺癌肺转移模型肺组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 615 | 2026-03-03 |
Exploring the mechanism and therapeutic potential of BUB1 in regulating esophageal cancer progression based on 5-FU target prediction
2026-Jan-31, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04486-3
PMID:41618008
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探索BUB1作为5-FU潜在靶点在食管癌进展中的机制及治疗潜力 | 结合生物信息学分析和实验验证,首次系统性地将BUB1鉴定为5-FU在食管癌中的潜在治疗靶点,并揭示其通过调控细胞周期影响肿瘤侵袭迁移能力 | 研究主要基于细胞系实验,缺乏体内动物模型验证;临床相关性分析中BUB1表达与TNM分期无显著关联,其临床转化价值需进一步评估 | 从现有化疗方案中识别新的药物靶点,为食管癌治疗开发新策略 | 食管癌组织、KYSE150/TE1人食管癌细胞系 | 生物信息学 | 食管癌 | 多组学分析、单细胞测序、Western blot、细胞划痕/Transwell实验、克隆形成实验 | WGCNA共表达网络、PPI网络、MCODE分析 | 基因表达数据、单细胞测序数据、蛋白质印迹数据 | GEO数据集GSE17351、GSE196756单细胞测序数据、TCGA食管癌数据、KYSE150/TE1细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 616 | 2026-03-03 |
A spatially resolved atlas of gastric cancer characterises a lymphocyte-aggregated region
2026-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68612-z
PMID:41593079
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术,揭示了胃癌肿瘤微环境的空间组织特征,特别是淋巴细胞聚集区域的结构和功能 | 首次在胃癌中结合单细胞和空间转录组学技术,识别出淋巴细胞聚集区域,并揭示了其与T细胞激活和免疫治疗生物标志物的空间关联 | NA | 探索胃癌肿瘤微环境的细胞组成和空间组织,以寻找免疫治疗生物标志物 | 胃癌组织样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 空间转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 617 | 2026-03-03 |
Spatial FBA reveals heterogeneous Warburg niches in renal tumors and lactate consumption in colorectal cancer
2026-Jan-27, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00654-x
PMID:41593100
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研究论文 | 本研究开发了一种空间通量平衡分析(spFBA)框架,用于从空间转录组数据中估计代谢通量,揭示了结直肠癌和肾癌中的异质性代谢特征 | 提出了spFBA框架,首次将空间约束整合到代谢通量分析中,能够从空间转录组数据中推断相对代谢通量,揭示了传统基因表达分析无法检测的代谢程序 | 该方法依赖于相对代谢通量估计,可能无法提供绝对通量值;且需要空间转录组数据作为输入,限制了其在非空间数据中的应用 | 研究空间约束如何塑造癌症代谢,并开发新方法从空间转录组数据中揭示代谢异质性 | 结直肠癌(CRC)的原发肿瘤和肝转移样本,以及肾癌样本 | 空间转录组学 | 结直肠癌,肾癌 | 空间转录组学,通量平衡分析(FBA) | 空间通量平衡分析(spFBA)框架 | 空间转录组数据 | 新生成的高分辨率配对结直肠癌原发肿瘤和肝转移数据集,以及独立的公共数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 618 | 2026-03-03 |
Single nuclei and spatial profiling of sacrococcygeal teratomas reveals cellular composition and X inactivation heterogeneity
2026-Jan-21, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01262-4
PMID:41565739
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研究论文 | 本研究通过单细胞核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了骶尾部畸胎瘤的细胞组成、异质性以及X染色体失活状态与细胞身份之间的联系 | 首次在骶尾部畸胎瘤中结合单细胞核RNA测序与空间转录组学进行分析,揭示了肿瘤的细胞谱系异质性,并发现了女性肿瘤细胞中存在X染色体双等位基因表达现象及其与细胞身份和免疫景观的关联 | 样本量较小(仅8例肿瘤),且未能在研究中检测到假定的多能性细胞群 | 探究骶尾部畸胎瘤的细胞起源、临床分层机制以及性别偏好的分子基础 | 骶尾部畸胎瘤组织样本 | 数字病理学 | 畸胎瘤 | 单细胞核RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 8例骶尾部畸胎瘤样本(6例产后:1例男性,5例女性;2例产前:均为女性) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 619 | 2026-03-03 |
Age-dependent immune responses and resident cell dynamics in young mice following pneumonia
2026-Jan-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114219
PMID:41488789
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序,揭示了幼鼠肺炎后年龄依赖的免疫反应和肺驻留细胞动态,强调了早期免疫发育对疾病易感性的影响 | 首次在幼鼠模型中,结合单细胞和批量RNA测序技术,全面绘制了新生儿与幼年鼠肺驻留细胞的转录组图谱,并揭示了年龄特异性免疫动态与健康结局的关联 | 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本,且未探讨长期免疫后果或具体治疗干预 | 探究年龄特异性免疫动态与未成熟肺健康结局差异的关联 | 新生和幼年小鼠的肺组织 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,但涉及新生和幼年小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 620 | 2026-03-03 |
Spatial transcriptomics reveals molecular heterogeneity and subtype-specific therapeutic targets in small cell lung cancer
2026-Jan-16, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01243-7
PMID:41545500
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了小细胞肺癌的分子异质性,并识别了亚型特异性治疗靶点 | 引入了Edgeindex指标定量评估肿瘤空间结构,并开发了专门的人工神经网络模型进行精确肿瘤注释 | NA | 解析小细胞肺癌的异质性并探索其分子机制 | 小细胞肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | 人工神经网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |