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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2026-02-10 |
Circulating Ly6Chigh monocyte-derived S100A4+ macrophages exacerbate neuroinflammation and impede recovery of traumatic brain injury
2026-Jan-26, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106472
PMID:41605306
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了创伤性脑损伤后循环Ly6Chigh单核细胞衍生的S100A4+巨噬细胞通过CCL4-CCR1轴浸润脑组织,加剧神经炎症并阻碍功能恢复的机制 | 首次在TBI模型中识别出源自循环Ly6C单核细胞的S100A4巨噬细胞亚群,并阐明其通过CCL4-CCR1轴浸润脑组织、通过SPP1-CD44通路激活小胶质细胞,以及IRF7作为关键转录因子驱动该过程的分子机制 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床样本中验证;药物干预效果仅基于动物实验,需进一步临床试验确认 | 探究创伤性脑损伤后系统性免疫反应的细胞与分子机制,并寻找潜在治疗靶点 | 创伤性脑损伤小鼠模型的脑组织与外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 582 | 2026-02-10 |
Longitudinal spatial transcriptomics reveals the molecular dynamics of pulmonary artery remodeling in pulmonary arterial hypertension
2026-Jan-21, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.01.017
PMID:41577266
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研究论文 | 本文通过纵向空间转录组学分析,揭示了肺动脉高压中肺动脉重塑的分子动态变化 | 首次在肺动脉高压患者中进行纵向空间转录组学分析,比较了13年间两个时间点的血管病变,识别了严重受影响小肺动脉特有的115个基因重塑特征和25个核心基因特征 | 研究仅基于单一患者的样本,样本量较小,可能限制结果的普适性 | 揭示肺动脉高压中肺动脉重塑的分子机制和动态变化 | 肺动脉高压患者的肺组织样本,包括小和大肺动脉 | 空间转录组学 | 肺动脉高压 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 1名患者,两个时间点(13年间隔)的肺组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 583 | 2026-02-10 |
Hepatic Arterial Flow-induced Portal Tract Fibrosis in Portal Hypertension: The Role of VCAM-1 and Osteopontin-expressing Macrophages
2026-Jan-19, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101728
PMID:41565157
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研究论文 | 本研究揭示了在门脉高压中,肝动脉血流增加通过VCAM-1和骨桥蛋白阳性巨噬细胞驱动门管区纤维化的分子机制 | 首次将肝动脉缓冲反应与门管区纤维化直接联系起来,并明确了VCAM-1介导的巨噬细胞招募及Spp1+巨噬细胞在驱动纤维化中的核心作用 | 研究主要在啮齿动物模型中进行,其结论在人类门脉高压中的普适性有待进一步验证 | 探究门脉高压背景下肝动脉血流增加诱导病理性门管区重塑的分子机制 | Sprague-Dawley大鼠(门脉部分结扎模型)及从模型分离的巨噬细胞和门脉成纤维细胞 | NA | 门脉高压 | 单细胞RNA测序,RNA荧光原位杂交,微计算机断层扫描,免疫细胞分析,血流动力学测量,转录组分析 | NA | 图像数据,转录组数据,血流动力学数据 | 使用Sprague-Dawley大鼠建立门脉部分结扎模型,具体样本数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 584 | 2026-02-10 |
Aging-related Transcriptomic Changes with Spatial Resolution in the Human Prefrontal Cortex
2026-Jan-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.12.698703
PMID:41648412
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,在37名成年个体中分析了人前额叶皮层随年龄增长的转录组变化及其在不同皮层层次的差异 | 首次在人类前额叶皮层中,以空间分辨率(皮层层次特异性)系统地揭示了全生命周期范围内的年龄相关转录组变化,是目前该领域规模最大、最全面的空间转录组分析之一 | 研究基于死后脑组织样本,可能无法完全反映活体状态下的动态变化;样本量虽较大,但个体间的异质性可能影响结果的普适性 | 探究人前额叶皮层在衰老过程中转录组变化的时空特异性,以理解认知功能随年龄衰退的分子机制 | 人前额叶皮层组织 | 空间转录组学 | 衰老相关疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 37名成年个体(覆盖全生命周期)的死后前额叶皮层样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 585 | 2026-02-10 |
Comprehensive analysis of key palmitoylation-modifying enzymes in clear cell renal cell carcinoma: implications for prognosis and therapy
2026-Jan-10, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04155-5
PMID:41519750
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,系统识别并验证了透明细胞肾细胞癌中关键的棕榈酰化修饰酶,探讨了其临床意义 | 首次在ccRCC中系统评估棕榈酰化修饰酶的作用,并利用PalmScore系统结合机器学习算法识别出诊断和预后关键基因 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证,且临床样本的异质性可能影响结果 | 系统识别ccRCC中关键的棕榈酰化修饰酶,并探索其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者数据及细胞系 | 生物信息学 | 肾癌 | 多组学数据分析,单细胞RNA测序,siRNA敲低实验 | 机器学习算法 | 基因表达数据,临床数据 | 来自TCGA-KIRC和GEO数据集的ccRCC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 586 | 2026-02-10 |
Differential expression analysis for spatially correlated data using smiDE
2026-Jan-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03867-1
PMID:41519776
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研究论文 | 本文提出了一种用于空间相关数据的差异表达分析方法,解决了空间转录组学中因分割错误和邻近细胞相关性导致的统计偏差问题 | 开发了smiDE方法,专门针对空间转录组数据中的分割误差和空间相关性进行校正,减少了假阳性发现 | NA | 改进空间转录组数据的差异表达分析,提高统计准确性 | 空间转录组数据中的细胞状态响应 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 587 | 2026-02-10 |
Mapping the secondary response to traumatic brain injury using spatial transcriptomics shows acute 4-aminopyridine treatment mitigates axonal and molecular pathology
2026-Jan-08, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02219-1
PMID:41508250
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,结合神经病理学分析,探讨了急性4-氨基吡啶治疗对创伤性脑损伤后轴突损伤和分子病理的缓解作用 | 首次将空间转录组学与临床导向的神经病理学相结合,全面分析创伤性脑损伤的次级损伤过程,并评估4-氨基吡啶作为急性治疗药物的潜力 | 研究仅使用小鼠模型,未涉及人类样本,且高剂量4-氨基吡啶可能诱发癫痫行为,限制了其临床应用 | 评估4-氨基吡啶作为急性创伤性脑损伤治疗药物,以减轻轴突损伤和促进活动依赖性修复 | 成年雄性和雌性小鼠的创伤性脑损伤模型,重点关注胼胝体轴突和皮质区域 | 空间转录组学 | 创伤性脑损伤 | 空间转录组学,免疫标记 | NA | 空间转录组数据,免疫组织化学图像 | 成年雄性和雌性小鼠,具体数量未在摘要中明确说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 588 | 2026-02-10 |
Tight junction-high and CDH17-positive cell population is the source of colorectal cancer liver metastases
2026-Jan-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68169-3
PMID:41484106
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研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌肝转移的细胞来源,发现IKKα缺失通过稳定紧密连接成分促进转移,并鉴定出CDH17⁺/CLDN2⁺上皮亚群在转移灶中的主导作用 | 意外发现IKKα缺失促进结直肠癌转移,并首次将紧密连接重塑驱动的CDH17⁺/CLDN2⁺上皮亚群确定为转移能力的来源 | 研究主要基于患者来源的类器官模型,体内验证和临床相关性需进一步探索 | 探究结直肠癌转移的细胞特征和驱动机制 | 结直肠癌患者来源的类器官、转移性病变组织 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、组织染色 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 589 | 2026-02-10 |
Oxidative stress and GPX2 control pancreatic vs. non-pancreatic cell fate in human endoderm
2026-Jan-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68145-x
PMID:41484137
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研究论文 | 本研究揭示了氧化应激和GPX2在调控人类内胚层后前肠向胰腺与非胰腺细胞命运分化中的关键作用 | 首次发现谷胱甘肽过氧化物酶2(GPX2)通过调节氧化应激水平,决定人类后前肠细胞向胰腺或肝/肠谱系分化的命运选择 | 研究主要基于体外分化模型,体内生理环境中的验证尚需进一步研究 | 探究代谢产物在人类内胚层发育过程中细胞命运决定的作用机制 | 人类后前肠内胚层细胞 | 发育生物学 | NA | 批量转录组测序, 单细胞转录组测序, 染色质可及性分析 | NA | 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 590 | 2026-02-10 |
A pan-cancer single cell landscape reveals heterogeneity and functional diversity of double-negative T cells
2026-Jan-03, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02548-8
PMID:41484771
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,揭示了双阴性T细胞在肿瘤微环境中的异质性和功能多样性 | 首次在泛癌水平构建了双阴性T细胞的单细胞图谱,识别了14个不同的亚群,并阐明了它们在肿瘤免疫治疗中的关键作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,功能验证仍需进一步实验支持,且样本来源和癌症类型可能存在偏差 | 探究双阴性T细胞在肿瘤微环境中的异质性、功能多样性及其对免疫治疗反应的影响 | 双阴性T细胞(DNT细胞),包括αβ DNT和γδ T细胞亚群 | 单细胞组学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多重免疫荧光、空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 2,369个样本,涵盖23种癌症类型,包含157,025个高质量DNT细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 591 | 2026-02-10 |
Multi-omics analysis reveals STING activation mediates NLRP3-related pyroptosis and exacerbates myocardial ischemia-reperfusion injury
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0341839
PMID:41650015
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了STING激活通过介导NLRP3相关的细胞焦亡,从而加剧心肌缺血再灌注损伤 | 首次整合转录组学、蛋白质组学和单细胞转录组学,系统阐明了STING-NLRP3轴在心肌缺血再灌注损伤中调控细胞焦亡的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,其在人类患者中的直接适用性仍需进一步临床验证 | 探究心肌缺血再灌注损伤中细胞焦亡的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 小鼠心肌缺血再灌注模型、人心肌细胞缺氧/复氧模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组学, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及小鼠模型和人心肌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 592 | 2026-02-10 |
A multifaceted analysis of OTUD5 integrated MAVS in innate immunity of Primary Biliary Cholangitis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0342306
PMID:41650163
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,揭示了OTU去泛素化酶5(OTUD5)与线粒体抗病毒信号蛋白(MAVS)在原发性胆汁性胆管炎(PBC)先天免疫中的相互作用机制 | 首次结合微阵列、scRNA-seq和蛋白质组学分析,在PBC患者中鉴定出OTUD5与MAVS在单核巨噬细胞亚群11中的过表达及其相互作用,并验证了OTUD5敲低对MAVS表达的抑制作用 | 样本量相对较小(16例PBC患者组织,10例健康对照),且主要基于外周血和细胞系研究,缺乏更深入的体内功能验证 | 探索OTUD5在PBC发病机制中的作用,并开发靶向治疗策略 | 原发性胆汁性胆管炎(PBC)患者的外周血样本、肝组织以及RAW264.7细胞系 | 数字病理学 | 原发性胆汁性胆管炎 | 微阵列、RT-qPCR、免疫荧光、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、单细胞转录组数据 | 16例PBC患者组织样本,10例健康对照组织样本,以及PBC患者和健康对照的外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 593 | 2026-02-09 |
Cytoplasm-nucleus shuttling of TET2: an intrinsic brake in colorectal cancer progression
2026-Jan-28, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08418-5
PMID:41605908
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研究论文 | 本文研究了TET2蛋白在结直肠癌进展中的细胞质-细胞核穿梭机制及其作为内在刹车的作用 | 揭示了TET2核内增加在肿瘤转移起始阶段的关键作用,并发现EMT/WNT通路与TET2穿梭之间的负反馈环路 | 未明确提及具体实验方法或样本量的局限性 | 探讨TET2在结直肠癌进展中的功能机制及其作为治疗靶点的潜力 | 结直肠癌细胞及临床样本 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 594 | 2026-02-09 |
Integrated Transcriptomics Reveals Evolutionary Trajectories and Cell Density-Dependent Mechanisms in Aldosterone-Producing Adenomas
2026-Jan-21, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505410
PMID:41562146
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞/核与空间转录组学,揭示了醛固酮产生腺瘤(APAs)和微结节(APMs)的异质性、进化轨迹及细胞密度依赖性机制 | 首次利用整合单细胞/核和空间转录组学方法,揭示了APAs中两种不同的进化轨迹,并识别出KCNJ5突变APAs中的两种细胞状态,阐明了细胞密度如何通过TAZ激活调节铁死亡敏感性 | 研究主要基于转录组学数据,可能未涵盖所有分子机制;体外实验在人类肾上腺细胞中进行,但体内验证可能有限 | 探究醛固酮产生腺瘤和微结节在转录多样性、进化轨迹及细胞密度依赖性机制方面的病理发生 | 醛固酮产生腺瘤(APAs)和微结节(APMs),以及人类肾上腺细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞/核转录组学,空间转录组学 | NA | 转录组数据,空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 595 | 2026-02-09 |
Identifying Crucial Genes Associated with Pyroptosis in Lupus Nephritis
2026-Jan-16, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02402-5
PMID:41545631
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析识别狼疮性肾炎中与细胞焦亡相关的关键基因,并构建诊断模型 | 首次结合GEO数据库、WGCNA分析和单细胞RNA测序数据,系统性识别狼疮性肾炎中与细胞焦亡相关的关键基因GBP2和EIF2AK2,并通过细胞实验验证其功能 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,细胞实验验证仍需进一步在动物模型或临床样本中确认 | 识别狼疮性肾炎中与细胞焦亡相关的关键基因,探索其作为治疗靶点的潜力 | 狼疮性肾炎患者的肾小球、肾小管间质和全肾组织样本 | 生物信息学 | 狼疮性肾炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 细胞实验 | LASSO回归模型, 共识聚类, WGCNA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 来自GEO数据库的狼疮性肾炎患者组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 596 | 2026-02-07 |
Deciphering the cellular basis of heterosis in pigs through single-cell transcriptomics of growth axis-related tissues
2026-Jan-09, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12541-0
PMID:41514221
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 597 | 2026-02-09 |
Cross-dataset transcriptomic analyses identify a conserved ENPP2+ macrophage-fibroblast activation axis in hypertrophic cardiomyopathy
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag036
PMID:41642196
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研究论文 | 本研究通过跨数据集转录组分析,在肥厚型心肌病中鉴定了一个保守的ENPP2+巨噬细胞-成纤维细胞激活轴 | 首次通过整合最新的单核RNA测序和空间转录组数据集,揭示了ENPP2高表达的促炎巨噬细胞通过介导细胞间相互作用影响成纤维细胞激活,并发现其在不同遗传背景的HCM中具有普遍性 | 研究主要基于生物信息学分析和初步实验验证,需要更深入的体内外功能实验来证实机制 | 探究肥厚型心肌病中心肌纤维化的潜在调控机制 | 肥厚型心肌病患者的心脏组织样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 多个HCM相关数据集(具体数量未明确说明) | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 598 | 2026-02-09 |
Sbno2-mediated tissue-resident alveolar macrophages: a novel therapeutic axis for sepsis-induced acute lung injury
2026-Jan-05, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02772-7
PMID:41491997
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研究论文 | 本研究揭示了表达Sbno2的组织驻留肺泡巨噬细胞在脓毒症诱导的急性肺损伤中促进肺泡上皮细胞再生和屏障功能修复的作用 | 首次发现Sbno2在组织驻留肺泡巨噬细胞中的关键作用,并证明重组Sbno2可作为治疗急性肺损伤的潜在靶点 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 探究脓毒症诱导的急性肺损伤的修复机制并寻找新的治疗靶点 | 组织驻留肺泡巨噬细胞和肺泡上皮细胞 | 单细胞组学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 599 | 2026-02-09 |
Single-cell profiling reveals lineage-specific fibroblast stromal subtypes drive ECM remodeling and immune modulation in the hepatocellular carcinoma tumor microenvironment
2026-Jan-03, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-03220-3
PMID:41483290
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研究论文 | 本研究通过整合分析多个公共单细胞RNA测序数据集,揭示了肝细胞癌肿瘤微环境中具有转录和功能多样性的成纤维细胞亚型,并验证了COL1A1和COL3A1作为关键基质调控基因的作用 | 首次在肝细胞癌中系统识别了八个不同的ECM活性基质细胞亚型和五个功能多样的成纤维细胞状态,并通过空间转录组学和计算组织分析验证了亚型特异性功能与定位 | 研究主要基于公共数据集进行生物信息学分析,实验验证部分仅使用HepG2和HepB3细胞系,缺乏体内模型验证 | 解析肝细胞癌肿瘤微环境中成纤维细胞的转录多样性及其在ECM重塑和免疫调节中的作用 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的基质细胞,特别是癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,RT-qPCR,Western blot,细胞增殖、集落形成和伤口愈合实验 | CellChat分析 | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 六个公共肝细胞癌单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 600 | 2026-02-09 |
Enhancing cell subpopulation discovery in cancer by integrating single-cell transcriptome and expressed variants
2026-Jan, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2025.01.001
PMID:41647537
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研究论文 | 本文提出了一种名为scCluster的端到端深度聚类模型,通过整合单细胞基因表达谱和表达变异特征来增强癌症组织中细胞亚群的发现 | scCluster首次将单细胞基因表达谱与原始scRNA-seq数据中的表达变异特征相结合,采用基于零膨胀负二项模型的双模态自编码器和深度嵌入聚类的联合优化策略,显著提升了细胞亚群分层的准确性 | 未在摘要中明确提及 | 增强癌症单细胞研究中细胞亚群的发现能力 | 癌症组织中的单细胞 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 双模态自编码器, 深度嵌入聚类, 深度软K-means聚类, 跨实例引导对比聚类 | 基因表达谱, 表达变异特征 | 多个真实世界癌症scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |