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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-07-18 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Suggests That JUN May Regulate BAMBI to Promote Osteosarcoma Cell Migration and Invasion
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/9261651
PMID:42211757
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research paper | 通过单细胞RNA测序分析揭示JUN可能通过调控BAMBI促进骨肉瘤细胞迁移和侵袭的机制 | 首次利用单细胞转录组学分析揭示JUN调控BAMBI进而激活TGF-β信号通路促进骨肉瘤转移的新机制 | 尚未在更大样本或体内模型中验证该调控机制,且具体分子相互作用细节需进一步实验探索 | 探究骨肉瘤转移相关的分子机制,识别免疫诊断和治疗标记物 | 骨肉瘤细胞及其微环境中的免疫细胞 | machine learning, digital pathology | 骨肉瘤 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 骨肉瘤样本中的单细胞测序数据(具体数量未提及) | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2026-07-18 |
Integrative Multiomics Analysis Reveals Tumor-Associated Macrophage Heterogeneity and a Prognostic Signature in Gastric Cancer
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/6130883
PMID:42211756
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、批量转录组学和空间转录组学,系统表征胃癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性并识别预后生物标志物 | 首次通过多组学整合分析(scRNA-seq、批量转录组和空间转录组)全面描绘胃癌TAM异质性图谱,并利用机器学习构建具有稳健预后价值的七基因签名 | NA | 系统表征胃癌肿瘤相关巨噬细胞的异质性并识别预后生物标志物 | 胃癌肿瘤组织中的巨噬细胞及其它免疫细胞 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组学 | CoxBoost | 单细胞RNA测序数据, 批量转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2026-07-18 |
Lactylation-mediated remodelling of the breast cancer microenvironment: single-cell multidimensional analysis and prognostic model construction
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1747043
PMID:42212139
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research paper | 整合单细胞多维分析,研究乳酸化修饰对乳腺癌微环境的重塑作用并构建预后模型 | 首次结合单细胞RNA测序与TCGA数据,系统分析乳酸化相关转录程序在乳腺癌上皮细胞中的异质性及其与肿瘤微环境免疫重塑的关联,并开发14基因预后模型 | 乳酸化评分是基于转录模块的间接替代指标,并非对乳酸化本身的直接测量,需进一步机制和临床验证 | 阐明乳酸化修饰在乳腺癌微环境中的细胞类型分布及临床相关性 | 乳腺癌患者的肿瘤组织和细胞 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归 | 基因表达数据 | 26个单细胞RNA测序样本,共98,572个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2026-07-18 |
Integrated single-cell and bulk transcriptomic analyses reveal a stem-like epithelial subpopulation in adenocarcinoma of the esophagogastric junction and identify VASN as a novel regulator of tumor stemness
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1817030
PMID:42212140
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研究论文 | 基于单细胞和批量转录组分析,鉴定食管胃交界腺癌中的干细胞样上皮亚群并发现VASN作为肿瘤干性的新型调控因子 | 首次通过整合单细胞和批量转录组学数据系统鉴定食管胃交界腺癌中干细胞样恶性上皮亚群,并揭示VASN通过Wnt/β-catenin信号通路调控肿瘤干性的新机制 | 研究主要依赖公共数据集和体外实验,缺乏体内模型验证;VASN调控干性的具体分子机制尚需进一步深入 | 阐明食管胃交界腺癌中干细胞样上皮亚群的特性及其对肿瘤免疫微环境的影响,并发现潜在治疗靶点 | 食管胃交界腺癌肿瘤组织样本 | 机器学习, 数字病理学 | 食管胃交界腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, LASSO Cox回归, 随机生存森林 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 未明确提及具体样本数量,但涉及多个单细胞和批量转录组队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-07-18 |
dNK3 cells in normal pregnancy and recurrent pregnancy loss: from molecular identity to functional imbalance
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1822205
PMID:42212143
|
研究论文 | 研究正常妊娠和复发性流产中dNK3细胞的分子特性和功能失衡 | 首次系统阐述dNK3细胞在正常妊娠和复发性流产中的分子身份、功能特征及其失衡机制 | 现有证据不足以支撑临床转化,因果关系、跨研究可比性和dNK3/ieILC1发育关系需进一步验证 | 明确dNK3细胞在正常妊娠和复发性流产中的分子身份与功能失衡 | 蜕膜自然杀伤细胞,特别是dNK3亚群 | 机器学习 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2026-07-18 |
Gallic acid exerts therapeutic effects on sciatica by reducing inflammatory responses through the regulation of NOX4-mediated oxidative stress
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1748652
PMID:42212156
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和动物实验,探讨没食子酸通过调节NOX4介导的氧化应激减轻坐骨神经痛炎症反应的治疗作用 | 首次揭示没食子酸通过调控NOX4介导的氧化应激促进M1型巨噬细胞向M2型极化,从而缓解坐骨神经痛 | 仅基于大鼠模型和RAW264.7细胞实验,缺乏人体临床验证,且未深入探讨NOX4上游调控机制 | 探究没食子酸是否通过调节NOX4介导的氧化应激减少神经炎症来缓解坐骨神经痛 | 32只SD大鼠和RAW264.7巨噬细胞 | 机器学习 | 坐骨神经痛 | scRNA-seq, ELISA, western blotting, 免疫荧光, 流式细胞术, PCR | NA | 基因表达数据, 图像, 分子生物学数据 | 32只SD大鼠和RAW264.7细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2026-07-18 |
Metabolic reprogramming of cholesterol biosynthesis drives macrophage-mediated immune suppression in HPV-negative cervical adenocarcinoma
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1808107
PMID:42212157
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研究论文 | 系统分析HPV阴性宫颈腺癌中胆固醇生物合成代谢重编程驱动巨噬细胞介导免疫抑制的机制 | 首次揭示DHCR7-27-HC-SPP1代谢-免疫轴在HPV阴性宫颈腺癌免疫逃逸中的关键作用,并发现该轴通过正反馈环路增强免疫抑制 | 主要基于公开单细胞数据集和体外实验验证,缺乏体内动物模型及临床样本的多中心验证 | 阐明HPV阴性与阳性宫颈腺癌免疫微环境差异的分子机制 | HPV阴性宫颈腺癌、HPV阳性宫颈腺癌及正常宫颈组织 | 数字化病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、酶联免疫吸附试验(ELISA)、免疫荧光、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、细胞系实验数据 | 公开单细胞RNA测序数据集(具体数量未提及)及宫颈癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2026-07-18 |
Mesenchymal stem cell alleviate concanavalin A-induced hepatitis via immune reprogramming and complement regulation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1809194
PMID:42212165
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析了间充质干细胞在ConA诱导的急性肝炎模型中通过免疫重编程和补体调节缓解肝损伤的细胞与分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示间充质干细胞在急性肝损伤中通过选择性重塑肝脏免疫微环境,特别是单核细胞来源巨噬细胞状态和补体相关信号通路发挥保护作用 | 研究基于小鼠模型,结论向人类转化需进一步验证;单细胞测序数据未结合功能实验验证关键分子机制 | 阐明间充质干细胞在急性免疫介导肝损伤中重塑肝脏免疫微环境的细胞和分子机制 | ConA诱导的急性肝炎小鼠肝脏组织 | digital pathology | geriatric disease | scRNA-seq, multiplex immunohistochemistry | NA | single-cell RNA sequencing, multiplex immunohistochemistry images | ConA诱导急性肝炎小鼠和MSC处理组小鼠肝脏样本 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics平台构建单细胞RNA测序文库 |
| 49 | 2026-07-18 |
B3GNT6-Linked Multimodal Signatures Integrate Tissue Morphology and PTM-Related Transcriptomics to Stratify Tumor
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.134004
PMID:42212317
|
研究论文 | 开发了一种基于翻译后修饰的多模态框架,整合组织形态学和转录组学数据,用于结肠腺癌的预后分层和机制分析 | 首次将翻译后修饰相关的转录组特征与组织病理学图像通过自编码器潜在空间融合,构建多模态预后模型,并识别出关键基因B3GNT6 | 未提及具体局限性 | 开发基于翻译后修饰的多模态预后分层框架,用于结肠腺癌的预后评估和机制分析 | 结肠腺癌患者的组织病理学图像、转录组数据和临床信息 | 数字病理学 | 结肠腺癌 | RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | 自编码器 | 图像, 文本 | TCGA-COAD队列(未提及具体样本量) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 50 | 2026-07-18 |
Endothelial Klf9 fine-tunes Akt signaling to act as a transcriptional brake restraining retinal angiogenesis
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.133293
PMID:42212336
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研究论文 | 本研究揭示了内皮转录因子Klf9作为转录刹车通过精细调控Akt信号限制视网膜血管生成的作用机制 | 首次发现Klf9是视网膜血管稳态的关键转录调控因子,阐明其通过染色质重塑抑制PI3K-Akt通路从而调控血管生成的分子机制 | 主要依赖小鼠模型和体外细胞实验,缺乏临床样本验证;Klf9调控染色质可及性的具体分子机制尚待深入阐明 | 研究Klf9在视网膜血管发育和新生血管疾病中的功能及分子机制 | 视网膜内皮细胞、新生小鼠视网膜、氧诱导视网膜病变模型 | 数字病理学 | 视网膜血管疾病 | RNA-seq, ATAC-seq, 单细胞RNA测序, 时空转录组学 | NA | 转录组数据, 染色质可及性数据, 单细胞转录组数据 | 人视网膜微血管内皮细胞、不同基因型小鼠视网膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 时空转录组学 | NA | NA |
| 51 | 2026-07-18 |
Fractional Order Total Variation Low-Rank Representation on Single-Cell RNA Sequencing Clustering
2026 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70070
PMID:42213461
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研究论文 | 提出一种自适应分数阶全变分低秩表示模型用于单细胞RNA测序聚类分析 | 将自适应分数阶全变分融入低秩表示框架,通过分数阶梯度学习保留细粒度细胞特征,解决scRNA-seq数据高维噪声和缺失值问题 | 未提及模型在大规模数据集上的计算效率及对极端稀疏数据的适应性 | 提出改进单细胞聚类准确性和可靠性的计算方法 | 11个公开单细胞RNA测序数据集,包括小鼠胚胎数据集 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩表示模型 | 基因表达数据 | 11个公开单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 52 | 2026-07-15 |
NEXT-scASV: a Nextflow pipeline for allele-specific variant calling from single-cell RNA-seq data
2026-01-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag042
PMID:41947412
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研究论文 | 提出了一个用于从单细胞RNA-seq数据进行等位基因特异性变异检测的可扩展Nextflow流程 | 自动化整个流程,从读段比对到等位基因失衡统计评估,无需先验基因型即可进行从头检测,并支持大规模并行化处理现代图谱级研究 | 未明确提及局限性 | 开发一个可重复、可扩展的NEXT-scASV流程,用于从单细胞RNA测序数据中识别等位基因特异性变异 | 外周血单核细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 序列数据 | 135,000个PBMC细胞来自57名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 5'单细胞RNA测序 |
| 53 | 2026-07-15 |
GEfetch2R: fetching single-cell/bulk RNA-seq data from public repositories to R and benchmarking the subsequent format conversion tools
2026-01-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag039
PMID:41964930
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研究论文 | 介绍GEfetch2R,一个能从公共存储库获取单细胞/批量RNA-seq数据并转换格式的R包 | 首次提供能获取多种单细胞RNA-seq数据类型(原始数据、计数矩阵、处理对象)并加载到R、转换对象格式以及基准测试格式转换工具的综合工具 | NA | 开发一个R包以简化从公共存储库获取和探索基因表达数据的过程 | 单细胞RNA-seq和批量RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq | NA | 数值数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2026-07-15 |
Unraveling the indolence of papillary thyroid carcinoma: an exploratory study on B-cell subsets based on genetic predisposition and tumor immunity
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1769020
PMID:41929497
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研究论文 | 本研究整合孟德尔随机化、流式细胞术、单细胞转录组学和临床验证,探究特定B细胞亚群在甲状腺乳头状癌惰性行为中的因果作用及潜在生物标志物价值 | 首次通过孟德尔随机化确立外周B细胞亚群与甲状腺癌易感性的因果关系,并联合多组学方法验证其与肿瘤惰性行为的关联 | 研究为探索性,样本量有限,需进一步在更大队列中验证;孟德尔随机化结果需谨慎解释因果方向 | 探究特定B细胞亚群在区分惰性和进展性甲状腺乳头状癌中的潜在价值 | 甲状腺乳头状癌患者的外周血和肿瘤组织B细胞亚群 | 机器学习 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据 | 33例甲状腺乳头状癌患者(流式细胞术);公共数据库(TCGA-THCA)队列 | Illumina | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序;TCGA RNA测序数据 |
| 55 | 2026-07-15 |
Dual role of icaritin in attenuating allograft rejection and exerting antitumor effects in mice
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1762553
PMID:41929489
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研究论文 | 该文章研究了淫羊藿苷在减轻小鼠同种异体移植排斥反应和发挥抗肿瘤作用中的双重角色 | 首次证实淫羊藿苷能减轻同种异体移植排斥反应,并揭示其通过靶向CEBPB/PIM1轴抑制CD4+ T细胞活化、增殖和Th1分化的机制 | 未提及明显的局限性 | 开发具有抗肿瘤疗效的免疫抑制剂,以解决器官移植后长期免疫抑制导致的恶性肿瘤风险升高问题 | BALB/c小鼠到C57BL/6J小鼠的异位心脏移植模型,以及荷瘤小鼠移植模型 | 机器学习 | 癌症(恶性肿瘤)、移植排斥反应 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、分子对接、分子动力学模拟、细胞热转变分析 | NA | 基因表达数据(scRNA-seq) | 小鼠模型,具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)用于受者脾细胞分析 |
| 56 | 2026-07-15 |
Multi-omics and experimental validation identify USP54 as a prognostic deubiquitinase promoting pancreatic ductal adenocarcinoma progression within the immune microenvironment
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1791707
PMID:41929495
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研究论文 | 通过多组学分析和实验验证,鉴定去泛素酶USP54在胰腺导管腺癌免疫微环境中促进肿瘤进展的预后标志物作用 | 首次揭示USP54作为去泛素酶在胰腺导管腺癌免疫微环境中的促癌作用,并通过单细胞RNA测序、空间转录组学与机器学习联合分析阐明其调控机制 | 未明确说明样本来源和数量;部分机制如KLF5转录调控USP54的详细通路有待进一步验证 | 探究去泛素酶在胰腺导管腺癌免疫微环境中的整体活性及其驱动肿瘤进展的作用 | 胰腺导管腺癌患者肿瘤组织、BxPC-3和PANC-1细胞系、小鼠模型 | 机器学习, 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 多组学分析、机器学习、单细胞RNA测序、空间转录组学、实时定量PCR、蛋白质印迹、免疫组化 | Coxnet, Fuzzy SVM, SCENIC, LIANA+, cell2location | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 57 | 2026-07-15 |
Single-cell sequencing reveals dynamic immune features of paraneoplastic pemphigus in a patient with follicular lymphoma
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1733718
PMID:41929499
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示一例滤泡性淋巴瘤伴副肿瘤性天疱疮患者的动态免疫特征 | 首次利用单细胞转录组和TCR测序,纵向分析滤泡性淋巴瘤伴副肿瘤性天疱疮患者治疗过程中外周血和骨髓的免疫动态变化,发现ITGAL+ T细胞、TRDV1偏向γδT细胞簇和BCL2+ B细胞相对丰度,以及治疗后TCR克隆扩增与免疫重塑 | 仅基于单一患者样本,描述性和假设生成性质,无法建立因果关系且结果不具普适性 | 阐明副肿瘤性天疱疮(尤其继发于淋巴瘤时)的细胞和分子机制 | 一例滤泡性淋巴瘤伴副肿瘤性天疱疮患者的外周血单核细胞和骨髓细胞 | 数字病理学 | 滤泡性淋巴瘤 | 单细胞转录组测序, 单细胞TCR分析 | NA | 文本 | 1名患者,3个时间点(治疗前、治疗中、治疗后)的外周血和骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2026-07-15 |
CX3CR1 identifies a potent effector CD8+ T cell subset associated with anti-PD-1 therapeutic efficacy in colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1770119
PMID:41929510
|
研究论文 | 本研究通过多维度方法鉴定出CX3CR1+CD8+ T细胞亚群是结直肠癌中与抗PD-1治疗效果相关的强效效应细胞 | 首次发现CX3CR1标记的CD8+ T细胞亚群具有Temra样终末效应表型,表现出强细胞毒性和低耗竭特征,并识别出ETS1、PRDM1和STAT1驱动的调控网络 | 未明确说明,但需进一步验证CX3CR1+CD8+ T细胞亚群作为生物标志物的临床转化可行性及调控网络的具体机制 | 解码结直肠癌中肿瘤浸润CD8+ T细胞的异质性,鉴定驱动肿瘤控制的效应亚群,以优化患者分层和治疗策略 | 结直肠癌患者的肿瘤浸润CX3CR1+CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多重免疫组化(mIHC)、临床数据挖掘、体内小鼠模型 | NA | 基因表达数据、组织切片图像、临床数据 | 涉及结直肠癌患者的样本,具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 59 | 2026-07-15 |
Comprehensive Bioinformatics Analysis and Experimental Verification RNF186 Is a Recurrence Signature Gene of Hepatocellular Carcinoma that Promotes Cell Proliferation
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.071617
PMID:41930175
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研究论文 | 通过综合分析单细胞RNA测序数据及实验验证,发现RNF186是肝细胞癌复发特征基因,可促进细胞增殖,并构建了复发相关风险模型用于预测预后和免疫治疗效果 | 首次在单细胞分辨率水平上识别复发相关基因,并发现RNF186以SESN2依赖方式促进肝细胞癌细胞增殖,为HCC复发机制和精准治疗提供了新靶点 | 本研究基于公开数据,样本量有限;RNF186功能验证仅在细胞水平进行,尚未在动物模型或临床队列中验证 | 识别肝细胞癌复发相关基因,构建预后模型以预测生存结局和免疫治疗反应,并探究RNF186在复发中的作用 | 12例原发性和6例复发性肝细胞癌样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, LASSO-Cox回归分析 | Cox比例风险模型 | 基因表达数据, 临床预后数据 | 18例肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2026-07-15 |
Molecular modulation of cell migration via chitosan-based hydrogels: Toward smart biomaterial for wound regeneration
2026 Jan-Dec, Journal of applied biomaterials & functional materials
IF:3.1Q3
DOI:10.1177/22808000261431513
PMID:41930473
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综述 | 综述了基于壳聚糖的水凝胶通过分子调控细胞迁移实现智能伤口再生生物材料的设计策略 | 整合了生化和物理信号对细胞-基质相互作用的调控机制,提出利用单细胞转录组学、先进成像和AI驱动建模克服转化挑战的路线图 | 体内机械与分子影响的定量解耦、改性壳聚糖衍生物的长期生物相容性以及高通量筛选数据向临床转化的挑战 | 开发下一代个性化伤口治疗生物材料 | 基于壳聚糖的水凝胶及其对细胞迁移的分子调控 | 机器学习 | 伤口修复 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |