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当前共找到 1234 篇文献,本页显示第 41 - 60 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2026-02-11
Single-cell and immune-context integration identifies basement-membrane/metastasis signatures that sharpen bladder-cancer diagnosis and prognosis
2026-Jan-14, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和免疫背景分析,开发了一个基于转移-基底膜相关基因的、可解释的膀胱癌预后模型,以增强临床和个性化治疗策略 整合了单细胞RNA测序和空间转录组学数据来定位关键基因在癌症相关成纤维细胞中的表达,并使用SHAP分析量化了特征贡献,构建了一个可解释的六基因预后特征 模型在外部验证队列中的AUC值范围较宽(0.602-0.742),表明其预测性能在不同数据集中存在一定波动,且研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证 开发一个可解释的预后模型,以改善膀胱癌的诊断和预后评估,并整合基底膜重塑、上皮间质转化和免疫抑制的机制 膀胱癌患者 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组化 LASSO回归, Cox回归, 风险模型, 列线图 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 来自TCGA和GEO队列的膀胱癌样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
42 2026-01-16
stRGAT: identifying spatial domains in spatial transcriptomics via a relational graph attention network
2026-Jan-14, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
43 2026-02-11
Decoding the Role of H19 in Cholestatic Liver Injury Using snRNA-seq, Spatial Transcriptomics, and Machine Learning-Based Disease Prediction
2026-Jan-14, Research square
研究论文 本研究通过单核RNA测序、空间转录组学和机器学习模型,揭示了长链非编码RNA H19在胆汁淤积性肝损伤中的作用机制 首次结合单核RNA测序、空间转录组学和机器学习方法,系统解析了H19在细胞类型特异性和空间分辨率上对胆汁淤积性肝损伤的调控机制 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证仅使用公开数据集,需要进一步实验验证 阐明H19在原发性硬化性胆管炎(PSC)进展中的细胞类型特异性和空间调控机制 野生型、H19敲除、Mdr2敲除及双敲除小鼠的肝组织,以及人类数据集GSE243981 数字病理学 肝病 单核RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 逻辑回归, XGBoost, 神经网络, 随机森林 基因表达数据, 空间转录组数据 年龄和性别匹配的野生型、H19敲除、Mdr2敲除及双敲除小鼠肝组织 NanoString 单核RNA测序, 空间转录组学 NanoString GeoMx NanoString GeoMx空间转录组学平台
44 2026-02-11
[The consensus of genetic detection in multiple myeloma in China (2026)]
2026-Jan-14, Zhonghua xue ye xue za zhi = Zhonghua xueyexue zazhi
共识 本文介绍了中国多发性骨髓瘤遗传学检测共识(2026版)的更新内容,旨在规范检测流程、统一高风险遗传学异常的解读与报告,并讨论将新兴分子标志物纳入风险分层 基于最新证据对2019年共识进行修订,重点关注检测工作流程的优化、高风险遗传学异常解读与报告的标准化,并探讨将新兴分子标志物(如全基因组测序和单细胞测序发现的标志物)整合到风险分层框架中 共识性文件主要基于现有证据和专家意见,可能未涵盖所有最新技术或临床场景,且其实施效果需在实际临床应用中进一步验证 制定和更新中国多发性骨髓瘤遗传学检测的标准化共识,以促进精准医疗并改善高风险患者的识别与管理 多发性骨髓瘤患者及其遗传学异常 临床医学与遗传学 多发性骨髓瘤 细胞遗传学核型分析、荧光原位杂交、下一代测序、全基因组测序、单细胞测序 NA 遗传学数据 NA NA NA NA NA
45 2026-02-11
A novel anoikis resistance-associated gene model for prognostic prediction and immune microenvironment characterization in lung squamous cell carcinoma
2026-Jan-13, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究构建并验证了一个基于失巢凋亡抵抗相关基因的新型预后模型,用于预测肺鳞状细胞癌患者的生存结局并表征其免疫微环境特征 首次将失巢凋亡抵抗与肺鳞癌的免疫微环境及临床预后联系起来,构建了一个独立的预后模型,并通过单细胞转录组学和实验验证了关键基因的生物学功能 研究主要基于回顾性队列数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能和临床应用价值 开发一个有效的预后预测模型,并阐明失巢凋亡抵抗在肺鳞癌免疫微环境调控和免疫治疗反应中的作用 肺鳞状细胞癌患者 数字病理学 肺癌 LASSO回归、单变量Cox比例风险分析、单细胞转录组学、通路富集分析、免疫谱分析 预后风险模型 转录组数据、临床数据 内部验证队列(TCGA-LUSC)和外部验证队列(GSE73403, GSE74777) NA 单细胞RNA-seq NA NA
46 2026-02-11
A technical comparison of spatial transcriptomics platforms across six cancer types
2026-Jan-12, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本研究系统性地比较了五种商业空间转录组学平台在六种癌症类型FFPE样本中的技术性能 首次在相同FFPE临床样本上同时评估测序型和成像型空间转录组学平台,并首次对Xenium Multi-Tissue和Xenium Prime进行同样本比较 研究主要基于FFPE临床样本,可能不适用于新鲜或冷冻组织;平台比较范围限于五种商业平台 评估不同空间转录组学平台在FFPE肿瘤样本中的技术性能差异 六种癌症类型的FFPE人类肿瘤切片 空间转录组学 多种癌症 空间转录组学 NA 空间转录组数据、蛋白质数据 六种癌症类型的匹配FFPE肿瘤切片 10x Genomics, NanoString 空间转录组学, 空间多组学 Visium v1, Visium v2/CytAssist, Visium HD, Xenium, CosMx Visium v1, Visium v2/CytAssist, Visium HD, Xenium Multi-Tissue (377基因), Xenium Prime (5,000基因), CosMx
47 2026-02-11
Intracellular microbial signals in the gastrointestinal tract of dairy cattle
2026-Jan-12, Microbiome IF:13.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞分析揭示了奶牛胃肠道上皮细胞中存在细胞内微生物信号,并探讨了其与瘤胃发育的潜在关联 首次在奶牛胃肠道中应用单细胞分析技术(SAHMI)系统检测细胞内微生物信号,并识别出与特定微生物物种相关的基因功能 研究样本量有限,仅包括新生和成年奶牛,且微生物信号的功能验证仍需进一步实验 探究奶牛胃肠道上皮细胞中细胞内微生物的存在及其在瘤胃发育中的作用 奶牛胃肠道组织,包括十种组织类型,从新生和成年奶牛中采集 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序,细菌荧光原位杂交(FISH) NA 单细胞RNA测序数据,图像数据 来自新生和成年奶牛的十种胃肠道组织类型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
48 2026-02-11
IL-25-ILC2-IL-13 axis improves traumatic brain injury by mediating CXCL-10-dependent regulation of blood brain barrier integrity
2026-Jan-12, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究探讨了IL-25通过激活ILC2分泌IL-13,进而抑制CXCL-10和内皮细胞焦亡,从而改善创伤性脑损伤后血脑屏障完整性和神经功能的机制 首次揭示了IL-25-ILC2-IL-13轴在创伤性脑损伤后血脑屏障修复中的作用,并发现其通过抑制CXCL-10和内皮细胞焦亡来发挥保护作用 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证,且具体信号通路的详细调控机制仍需进一步探索 探究IL-25在创伤性脑损伤后血脑屏障修复和神经功能恢复中的作用及机制 小鼠创伤性脑损伤模型、脑微血管内皮细胞、神经元和2型固有淋巴细胞 神经科学 创伤性脑损伤 酶联免疫吸附试验、免疫荧光染色、流式细胞术、细胞因子阵列、Western印迹、单细胞RNA测序、磁共振成像 NA 生物分子数据、影像数据、行为学数据 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠模型和体外细胞模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
49 2026-02-11
Disruption of bile acid homeostasis potentiates Paneth cell ablation by activating the intestinal Farnesoid X receptor in necrotizing enterocolitis
2026-Jan-08, NPJ biofilms and microbiomes IF:7.8Q1
研究论文 本研究揭示了胆汁酸稳态失衡通过激活肠道法尼醇X受体导致潘氏细胞丢失,从而在坏死性小肠结肠炎发病机制中的作用 首次阐明严重NEC中次级胆汁酸积累通过激活肠道FXR抑制Wnt/PCP信号通路,进而导致潘氏细胞丢失的具体分子机制,并发现通过下调FGFR4破坏肠-肝轴可改善这一过程 研究主要基于动物模型和单细胞测序数据,尚未在临床患者中进行大规模验证;FGFR4抑制的具体治疗策略和安全性需进一步评估 探究胆汁酸稳态失衡在坏死性小肠结肠炎发病机制中的作用,特别是其对潘氏细胞的影响 坏死性小肠结肠炎模型中的肠道组织、潘氏细胞、肠道干细胞 单细胞组学 坏死性小肠结肠炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
50 2026-02-11
Chronic macrophage activation derails muscle repair by disrupting mannose-receptor-linked plasticity revealed by endogenous irg1/acod1 tracking
2026-Jan-07, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用转基因斑马鱼模型,揭示了慢性炎症状态下巨噬细胞持续活化如何通过下调甘露糖受体mrc1b/cd206来破坏肌肉修复过程 首次在活体动物中实时追踪巨噬细胞活化动态,发现传统M1/M2二元分类之外的混合状态,并阐明慢性炎症通过MyD88通路抑制mrc1b表达导致修复性巨噬细胞亚型缺失的机制 研究主要基于斑马鱼模型,在哺乳动物系统中的普适性需进一步验证;慢性炎症模型为基因突变诱导,与人类疾病自然病程存在差异 探究慢性炎症如何改变巨噬细胞功能并影响肌肉组织修复 斑马鱼巨噬细胞在肌肉损伤修复过程中的动态变化 发育生物学与免疫学 肌肉损伤与慢性炎症 GFP基因敲入、单细胞转录组测序、遗传突变模型 斑马鱼遗传学模型 活体成像数据、单细胞RNA测序数据、基因表达数据 转基因斑马鱼模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
51 2026-02-11
Organoid Modeling and Single-Cell Profiling Reveal Smooth Muscle Cell Migration in Moyamoya Disease
2026-Jan-07, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过蛋白质组学、类器官模型和单细胞RNA测序揭示了烟雾病中血管平滑肌细胞迁移的机制 首次结合血清蛋白质组学、iPSC来源的血管类器官和单细胞RNA测序,系统阐明了TUBA4A和TUBB4B通过GJA1/PI3K/AKT/KLF4通路促进血管平滑肌细胞病理重塑的机制 样本量相对有限(40例患者和20例对照),且主要基于体外模型,缺乏体内验证 探究烟雾病的发病机制,寻找潜在的治疗靶点 烟雾病患者血清样本、诱导多能干细胞衍生的血管类器官、颞浅动脉组织 数字病理学 脑血管疾病 数据非依赖性采集蛋白质组学、单细胞RNA测序、ELISA、组织学染色、转录组学 NA 蛋白质组数据、RNA测序数据、图像数据 40例烟雾病患者和20例健康对照的血清样本,另加45例队列用于ELISA验证 NA 单细胞RNA测序 NA NA
52 2026-02-11
Macrophage AMPK activated by oxidative stress drives profibrotic crosstalk with tubular cells to accelerate renal fibrosis after ischemic and reperfusion injury
2026-Jan-03, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本研究揭示了巨噬细胞中AMPK在氧化应激激活下,通过驱动与肾小管细胞的促纤维化相互作用,加速缺血再灌注损伤后肾纤维化的机制 首次发现巨噬细胞AMPK作为关键氧化还原传感器,在氧化应激下激活后,通过TWEAK-Fn14信号通路促进巨噬细胞与肾小管细胞间的异常互作,驱动肾纤维化 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;机制细节如钙依赖性AMPK激活的具体通路尚未完全阐明 探究氧化应激在缺血再灌注损伤诱导的急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的分子机制 小鼠肾脏巨噬细胞与肾小管上皮细胞 分子病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达数据 Lyz2-Cre; Prkaa1-fl/fl基因敲除小鼠及对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
53 2026-02-11
CeLLTra: aligning cell names with gene expression via a pathway-informed transformer
2026-Jan-03, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种名为CeLLTra的新型对比学习框架,该框架利用整合生物通路信息的Transformer模型,将基因分组为超级令牌,以有效捕获单细胞RNA测序数据中的基因表达信息,从而实现细胞类型注释与基因表达谱的准确对齐 开发了首个结合通路信息Transformer与预训练领域特定语言模型的对比学习框架,用于细胞类型注释,显著提升了监督和零样本细胞类型预测的性能,并能更好地表征癌症细胞状态 未明确提及模型在极低质量数据或高度异质性样本中的鲁棒性,且依赖于公开可用的参考数据集 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性和效率 单细胞RNA测序数据,特别是来自人类和非小细胞肺癌患者的肿瘤浸润髓系细胞 自然语言处理 肺癌 单细胞RNA测序 Transformer 基因表达数据 基于GSE201333和GSE127465两个大规模人类单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
54 2026-02-11
TrajLens: Visual Analysis for Constructing Cell Developmental Trajectories in Cross-Sample Exploration
2026-Jan, IEEE transactions on visualization and computer graphics IF:4.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为TrajLens的可视化分析系统,用于构建跨样本的细胞发育轨迹 首次提出基于GNN的模型来预测跨样本细胞发育轨迹,并开发了集成细胞分布和发育方向特征的可视化分析系统 未在摘要中明确说明 解决单细胞RNA测序分析中跨样本细胞发育轨迹构建的挑战 单细胞RNA测序数据中的细胞发育轨迹 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 GNN 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
55 2026-02-11
Can LLMs Bridge Domain and Visualization? A Case Study on High-Dimension Data Visualization in Single-Cell Transcriptomics
2026-Jan, IEEE transactions on visualization and computer graphics IF:4.7Q1
研究论文 本文探讨了使用大型语言模型分析领域文献中可视化使用情况的潜力,并以单细胞转录组学中的高维数据可视化为案例进行研究 提出了结合图像处理、传统NLP方法和LLM的人机协同工作流程,用于大规模分析领域文献中的可视化使用情况,并将领域特定术语转化为标准化的数据和任务抽象 研究仅针对单细胞转录组学领域的高维数据可视化,分析结果可能无法直接推广到其他领域 探索LLM在弥合可视化设计与领域特定使用之间差距方面的潜力 单细胞转录组学领域文献中的高维数据可视化 自然语言处理 NA 大型语言模型、图像处理、传统NLP方法 LLM 文本、图像 1,203篇论文,包含2,056个高维可视化 NA 单细胞RNA-seq NA NA
56 2026-02-11
Single-cell RNA sequencing of platelets: challenges and potential
2026-Jan, Journal of thrombosis and thrombolysis IF:2.3Q2
研究论文 本研究首次使用10X Genomics平台对全血来源的血小板进行单细胞RNA测序,探索了血小板转录组学的可行性 首次在全血来源的血小板富集血浆上应用10X Genomics平台进行单细胞RNA测序,成功识别出血小板特异性标记基因簇 血小板RNA含量有限、细胞尺寸小、高反应性易激活、处理敏感性高以及技术挑战如高耗竭潜力 克服技术障碍,实现血小板单细胞转录组测序,以深入理解血小板生物学 健康供体的全血来源的血小板 单细胞转录组学 血管疾病 单细胞RNA测序 UMAP聚类分析 RNA序列数据 一名健康供体的全血样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10X Genomics平台 10X Genomics单细胞RNA测序平台,具体配置未详细说明
57 2026-02-11
Unveiling Endothelial Cell Expression Profiles in FEVR: Identification of Key Genes Associated With Pathological Neovascularisation in a FZD4M105V Mouse Model
2026 Jan-Feb, Clinical & experimental ophthalmology
研究论文 本研究通过建立FZD4M105V小鼠模型,揭示了家族性渗出性玻璃体视网膜病变中内皮细胞的表达谱,并鉴定了与病理性新生血管相关的关键基因 首次利用CRISPR/Cas9技术构建FZD4M105V小鼠模型,并通过单细胞RNA测序揭示了病理性内皮细胞簇和尖端细胞的独特转录谱,鉴定了四个新的候选生物标志物 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;单细胞测序样本量有限,可能未完全覆盖所有内皮细胞亚群 阐明家族性渗出性玻璃体视网膜病变中病理性新生血管的分子机制 FZD4M105V突变小鼠的视网膜内皮细胞 数字病理学 视网膜血管疾病 CRISPR/Cas9基因编辑、流式细胞分选、单细胞RNA测序 小鼠疾病模型 单细胞转录组数据、图像数据 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠模型和单细胞测序样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
58 2026-02-10
Microenvironmental niches dictate divergent fibroblast fates in reversible versus progressive lung fibrosis
2026-Jan-30, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术,比较了不同间质性肺疾病中微环境生态位如何决定成纤维细胞命运,揭示了可逆性修复与进行性纤维化的机制差异 首次在疾病原位比较了不同ILD表型中疾病特异性细胞生态位如何塑造成纤维细胞命运,并整合了高分辨率空间转录组学与单细胞图谱进行验证 研究主要基于体外实验验证预测的配体-受体机制,体内复杂微环境的完全模拟可能存在局限 阐明间质性肺疾病中成纤维细胞行为从可逆修复转向进行性纤维化的微环境调控机制 对照、机化性肺炎、结缔组织病相关ILD和特发性肺纤维化患者的外周肺组织 数字病理学 肺纤维化 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, 免疫荧光 NA 空间转录组数据, 单细胞RNA-seq数据, 图像数据 NA 10x Genomics 空间转录组学, 单细胞RNA-seq 10x Visium 高分辨率Visium空间转录组学
59 2026-02-10
Flexibility of cell fates and functions across sex determination systems revealed by comparative single-cell analyses
2026-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过比较单细胞转录组分析,揭示了脊椎动物性别决定系统中细胞命运和功能的灵活性 首次在温度依赖性性别决定的龟类物种中进行单细胞转录组分析,并与遗传性别决定系统(如小鼠和鸡)进行比较,揭示了细胞类型库和功能的显著差异 研究主要基于龟类、小鼠和鸡的物种比较,可能未涵盖所有脊椎动物性别决定系统 探究脊椎动物性别决定系统中细胞类型和遗传程序的保守性与可塑性 龟类(温度依赖性性别决定)、小鼠(XY遗传性别决定)和鸡(ZW遗传性别决定)的性腺细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
60 2026-02-10
Multiplexed enrichment and tracking of lineages with CloneSweeper
2026-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为CloneSweeper的多重谱系追踪平台,用于高效富集和追踪稀有细胞谱系,并应用于研究BRAF V600E黑色素瘤靶向治疗耐药性的起源 开发了CloneSweeper平台,利用双功能条形码同时实现活细胞分选和高回收率检测,能够同时富集多个稀有谱系,克服了现有方法在捕获稀有谱系和同时分离多个特定谱系方面的局限性 目前仅应用于BRAF V600E黑色素瘤模型,在其他疾病模型或治疗场景中的普适性有待验证 研究靶向治疗耐药性是由预先存在的细胞状态(“启动”)还是药物诱导的变化(“适应”)引起的 BRAF V600E黑色素瘤细胞 单细胞组学 黑色素瘤 谱系条形码技术,单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 涉及21个不同的稀有谱系 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Genomics scRNA-seq平台 用于高回收率检测的3' UTR转录本
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