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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-05-12 |
WSTF-associated regulation of GLYCTK and metabolic adaptation in colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1819148
PMID:42112339
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研究论文 | 本研究整合多组学数据,探索WSTF调控GLYCTK及代谢重编程在结直肠癌进展中的作用 | 首次通过多组学SMR分析揭示WSTF与GLYCTK的甲基化依赖性调控关系,并鉴定出潜在靶向化合物 | 未在体内模型或临床样本中验证WSTF-GLYCTK轴的因果关系;药物筛选仅基于计算模拟 | 阐明WSTF通过转录和表观遗传调控代谢适应促进结直肠癌进展的分子机制 | 结直肠癌细胞系及患者队列 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq, LC-MS代谢组学, ChIP-seq, 全基因组关联研究, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组、代谢组、表观基因组、基因组关联数据 | 结直肠癌细胞系及多个公开队列数据 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ChIP-seq, 代谢组学 | NA | NA |
| 42 | 2026-05-12 |
Pan-cancer analysis of OSR2 with a focus on underlying mechanisms and therapeutic implications in lung adenocarcinoma
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1769446
PMID:42112349
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研究论文 | 对OSR2进行泛癌分析,重点探讨其在肺腺癌中的潜在机制和治疗意义 | 首次通过整合多组学数据系统分析OSR2在多种癌症中的表达模式、预后价值及其与肿瘤微环境中癌相关成纤维细胞的关联 | OSR2在肺腺癌中的功能验证仅限于体外实验,缺乏体内模型和临床队列的进一步确认 | 探讨OSR2在不同癌症类型中的表达特征、预后意义及其在免疫治疗反应预测中的潜力 | OSR2转录因子及其在多种癌症(特别是肺腺癌)中的作用机制 | 计算机视觉 | 肺癌 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 泛癌数据库(TCGA和GEO)中的多个癌症样本 | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2026-05-12 |
Diabetic neuropathy's immune-metabolic network: mechanistic complexity, therapeutic challenges, and the path forward
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1804076
PMID:42112353
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综述 | 本文提出了糖尿病神经病变从“代谢毒性”向“免疫-代谢网络”功能障碍的病理进展转变,分析了核心机制并探讨了治疗挑战 | 提出糖尿病神经病变是免疫-代谢网络整体功能障碍,而非单纯代谢毒性,并识别了施万细胞在免疫反应和代谢支持中的“零和游戏”,以及ZBP1作为关键分子开关的新机制 | 未提及明确局限性,但指出了动物模型与临床现实之间的差距 | 重新定义糖尿病神经病变的病理机制,提出从代谢毒性到免疫-代谢网络功能障碍的转变,并探讨新的治疗方向 | 糖尿病神经病变的免疫-代谢网络,包括免疫细胞、施万细胞和神经元 | 机器学习 | 糖尿病神经病变 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 44 | 2026-05-12 |
Mapping the immune environment: spatiotemporal dynamics in cardiovascular events
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1809941
PMID:42112356
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综述 | 提出一个四维时空框架来描绘心血管事件中的免疫动态变化 | 将免疫反应从静态风险因素转变为可测量、可靶向的时空动态过程,整合分子成像、单细胞和空间转录组学等技术 | 未在真实患者队列中进行完整验证,缺乏多中心临床数据支持 | 构建心血管事件免疫环境的时空动态框架,实现精确免疫调节 | 心血管疾病中的免疫细胞、炎症介质和组织微环境 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 分子成像数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据、生物标志物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 45 | 2026-05-12 |
Nerve growth factor responsive elements modulate immune cell inflammation and are dysregulated in an Alzheimer's disease mouse model
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1722477
PMID:42112371
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研究论文 | 本研究通过多色流式细胞术和单细胞RNA测序,揭示神经生长因子受体在不同免疫细胞亚型中的表达模式,并发现阿尔茨海默病小鼠模型中NGF响应元件失调 | 首次全面绘制免疫细胞中NGF受体(TrkA和p75)的细胞类型依赖性表达图谱,并发现RNA与蛋白水平表达不一致,以及NGF补充可显著降低活化T细胞和B细胞的炎症细胞因子产生 | 研究主要基于小鼠模型和离体实验,缺乏人类样本验证;未深入探讨NGF信号调控炎症消退的具体分子机制 | 探究神经生长因子如何通过其受体调节免疫细胞炎症反应,并分析在阿尔茨海默病模型中的失调机制 | 未刺激小鼠脾脏中的多种免疫细胞亚型,包括树突状细胞、巨噬细胞、自然杀伤细胞及淋巴细胞(T细胞和B细胞) | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 多色流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白表达数据, 转录组数据 | 使用AD小鼠模型和未刺激小鼠脾脏样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 46 | 2026-05-12 |
Glioma-intrinsic SLC1A3 hijacks the vascular niche to establish an immunosuppressive microenvironment
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1824726
PMID:42112375
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研究论文 | 本研究揭示了胶质瘤固有基因SLC1A3劫持血管微环境建立免疫抑制微环境的机制 | 结合多组学分析、单细胞RNA测序、AI基础模型Geneformer进行虚拟遗传扰动,首次发现SLC1A3作为关键上游节点协调肿瘤-内皮-T细胞免疫抑制轴,而非仅作为内在驱动因子 | 未提及具体局限性 | 解析胶质瘤起始细胞从神经干细胞演化过程中的转录重编程和选择性剪接事件,以及这些细胞内状态变化如何驱动多细胞免疫抑制网络和检查点 | 神经干细胞和患者来源的胶质瘤起始细胞队列 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq, 选择性剪接分析, 单细胞RNA-seq, AI虚拟敲除, 体外共培养系统, qPCR, FACS | Geneformer | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 临床队列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2026-05-12 |
Gut microbiota pathways linking primary sclerosing cholangitis to colorectal cancer: the Lachnospiraceae family and PCBP1
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1781475
PMID:42112443
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序探索原发性硬化性胆管炎通过肠道微生物群与结直肠癌关联的机制,发现毛螺菌科和PCBP1基因是关键中介 | 首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序揭示原发性硬化性胆管炎通过肠道微生物群(尤其是毛螺菌科)和PCBP1基因增加结直肠癌风险的因果通路,并鉴定了介导比例 | 分析基于遗传预测而非直接测量,潜在混杂因素未完全排除,PCBP1的功能特异性及临床实用性需独立队列和机制模型验证 | 探索原发性硬化性胆管炎与结直肠癌通过肠道微生物群信号的连接通路,并识别候选宿主基因 | 原发性硬化性胆管炎患者、结直肠癌患者及肠道微生物群 | 机器学习 | 结直肠癌, 原发性硬化性胆管炎 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 微生物群数据 | 利用公开GWAS汇总统计数据(非原始样本),单细胞RNA测序数据来自PSC和CRC患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2026-05-12 |
Identification of Immune-Related Lactylation Genes in Rheumatoid Arthritis With Atherosclerosis: A Comprehensive Analysis Using Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/9969894
PMID:42112590
|
研究论文 | 利用批量与单细胞RNA测序数据,综合分析类风湿关节炎合并动脉粥样硬化中的免疫相关乳酰化基因 | 首次系统研究乳酰化相关基因在类风湿关节炎合并动脉粥样硬化中的诊断潜力,并结合单细胞数据探讨免疫细胞中的乳酰化评分差异 | 研究基于公开数据集,样本量有限,且乳酰化在RA和AS中的具体调控机制尚未深入验证 | 探究乳酰化相关基因作为类风湿关节炎合并动脉粥样硬化潜在诊断标志物的价值 | 类风湿关节炎患者和动脉粥样硬化患者的基因表达数据及免疫细胞 | 机器学习 | 类风湿关节炎, 动脉粥样硬化 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的GSE89408(RA数据集)和GSE43292(AS数据集) | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2026-05-10 |
miR-22-Galectin-1 as an integral signaling axis in regulating metabolism and immunity in HCC
2026-Jan-15, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00838-3
PMID:41540504
|
研究论文 | 本研究探讨miR-22与半乳糖凝集素-1(Gal-1)的相互作用在肝细胞癌(HCC)发展和治疗中的作用 | 揭示了miR-22-Gal-1信号轴在调控HCC代谢和免疫中的双重作用,并证明了miR-22基因治疗依赖于Gal-1沉默 | 未提供明确的局限性说明 | 研究miR-22-Gal-1轴在HCC发展和治疗中的重要性 | 肝细胞癌(HCC)患者和小鼠模型 | NA | 肝细胞癌 | 基因治疗、RNA干扰、空间转录组学、转录组学分析 | NA | 转录组数据、空间转录组数据 | 人类HCC样本来自癌症基因组图谱数据库;小鼠模型为原位HCC小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 50 | 2026-05-09 |
NEXT-scASV: a Nextflow pipeline for allele-specific variant calling from single-cell RNA-seq data
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag042
PMID:41947412
|
研究论文 | 提出NEXT-scASV,一个用于从单细胞RNA测序数据中检测等位基因特异性变异的可扩展Nextflow流程 | 自动化整个等位基因特异性变异检测流程,无需预先基因分型即可进行从头检测,具有模块化设计支持大规模并行化处理 | 未明确提及局限性 | 开发一个可重复、易部署且高效处理大规模单细胞数据的等位基因特异性变异检测流程 | 来自57个供体的135,000个外周血单核细胞的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 135,000个外周血单核细胞,来自57个供体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 5'单细胞RNA测序 |
| 51 | 2026-05-09 |
GEfetch2R: fetching single-cell/bulk RNA-seq data from public repositories to R and benchmarking the subsequent format conversion tools
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag039
PMID:41964930
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研究论文 | GEfetch2R是一个R包,用于从多个公共数据库获取单细胞/批量RNA-seq数据,并基准测试后续格式转换工具 | 首个能够同时下载多种单细胞RNA-seq数据类型(原始数据、计数矩阵、处理对象)、流程化加载到R环境、进行对象格式转换并基准测试转换工具的综合工具 | 未明确指出局限性 | 开发一个整合数据下载、处理和格式转换功能的R包,方便研究人员访问和探索公共基因表达数据 | 单细胞RNA-seq和批量RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2026-05-09 |
Advances in Adipose Tissue Biology
2026-Jan-13, Endocrine reviews
IF:22.0Q1
DOI:10.1210/endrev/bnaf032
PMID:41071598
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综述 | 综述脂肪组织生物学的最新进展及其在健康与疾病中的关键作用 | 强调脂肪组织作为人体生理中心调节器的新认识,以及单细胞RNA测序等新技术在揭示脂肪库特异性机制中的应用潜力 | 未明确提及局限性,但综述本身可能受限于现有研究范围和发表时间 | 阐述脂肪组织在健康和疾病中的重要角色的科学进展 | 脂肪组织和脂肪细胞 | 计算生物学 | 肥胖相关疾病, 2型糖尿病, 心血管疾病, 肝脏疾病, 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2026-05-09 |
Leveraging AI for cell biology discovery
2026-01-08, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253023
PMID:41502213
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综述 | 探讨人工智能在细胞生物学中的应用,包括显微镜成像、药物发现和合成生物学等领域 | 系统总结了AI在单细胞分辨率细胞图像分析、复杂生物模式识别及细胞行为建模方面的最新进展 | 涉及数据质量要求、模型可解释性以及AI工具在生物领域普及化的挑战 | 概述AI在细胞生物学发现中的变革性作用,展望未来基础研究和治疗应用方向 | 细胞生物学中的AI应用场景,包括显微镜图像、转录组数据和蛋白质结构 | 机器学习 | NA | NA | 深度学习 | 图像, 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2026-05-09 |
Microneedle Delivery of Small Extracellular Vesicles From Young Blood to Treat Endothelial Senescence
2026-Jan, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202418352
PMID:40765122
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研究论文 | 利用微针递送来自年轻血液的小细胞外囊泡治疗内皮的衰老 | 首次将微针递送技术与年轻血液来源的小细胞外囊泡结合,用于延缓内皮细胞衰老并减轻炎症,并通过单细胞RNA测序揭示其作用机制 | 未提及具体局限性 | 评估源自年轻血液的小细胞外囊泡在调节内皮细胞衰老中的作用,并探索其通过微针递送的可行性 | 脐带血浆中的小细胞外囊泡与老年人血浆中的小细胞外囊泡,以及老龄小鼠的内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 分离自脐带血浆(年轻)和老年人血浆(>70岁)的小细胞外囊泡,以及22-24个月大的老龄小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2026-05-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune regulatory mechanisms and molecular therapeutic strategies in the microenvironment of multiple myeloma
2026-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003306
PMID:40899849
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示多发性骨髓瘤微环境中的免疫调控机制和分子治疗策略 | 结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和分子对接分析,首次系统性揭示多发性骨髓瘤微环境中免疫相关信号通路及关键基因的因果作用 | 未提及具体样本来源和样本量,可能限制结论的普适性 | 探究多发性骨髓瘤微环境中的分子和细胞相互作用,发现新治疗靶点 | 多发性骨髓瘤微环境中的肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞 | 机器学习和数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、分子对接分析 | Seurat聚类分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 56 | 2026-05-09 |
Host biological sex directs immune control of the Plasmodium parasite liver stage in mice
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1734587
PMID:41846936
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研究论文 | 探究宿主生物性别和雄激素如何调控疟原虫肝脏期感染的免疫控制 | 首次揭示雄激素通过减少寄生虫感染肝细胞的清除来增加寄生虫存活率,并阐明性别差异在肝脏先天性免疫细胞组成和免疫反应中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,需在人类中验证性别差异的关联性;未深入探讨雄激素作用的具体分子机制 | 分析生物性别和雄激素对疟原虫肝脏期宿主-寄生虫相互作用的调节作用 | 雄性、雌性、去势及雄激素处理的BALB/cJ小鼠,感染伯氏疟原虫子孢子 | 机器学习 | 疟疾 | 空间转录组学 | NA | 图像、文本 | 雄性、雌性、去势及雄激素处理的小鼠样本,具体数量未说明 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于分析肝脏组织中的基因表达 |
| 57 | 2026-05-09 |
GSK3β as a potential regulator in AML: A pan-cancer multi-omics analysis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0344994
PMID:41915675
|
研究论文 | 通过泛癌多组学分析揭示GSK3β在急性髓系白血病中的潜在调控作用 | 首次在31种癌症中系统比较GSK3α/β亚型的差异表达和功能,发现GSK3β在AML中具有独立的预后价值,并揭示了亚型特异性的免疫微环境调控机制 | 未涉及具体分子机制的深入验证,且THP-1细胞系的体外实验无法完全代表AML患者体内的复杂微环境 | 探究GSK3α/β亚型在多种癌症中的表达模式、预后价值和免疫调控作用 | 31种癌症的TCGA、GTEx和单细胞RNA-seq多组学数据,以及AML THP-1细胞系 | 机器学习和数字病理学 | 肺癌、前列腺癌、肝癌、急性髓系白血病等 | 多组学整合分析、单细胞RNA-seq、Cox回归、免疫浸润分析 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 31种癌症的泛癌样本,包含TCGA和GTEx数据库的多个队列 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2026-05-09 |
B cells in anti-tRNA synthetase syndrome patients show an activated, interferon-responsive signature
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1770291
PMID:42023216
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析抗tRNA合成酶综合征患者B细胞的激活及干扰素响应特征 | 首次在单细胞水平揭示抗tRNA合成酶综合征患者活化与记忆B细胞中干扰素和应激通路上调,并发现FKBP5和MYADM基因表达变化与细胞骨架重排、代谢及抗原呈递通路相关 | 发现需进一步验证,未来需探究其作为新靶点减少组织损伤的实用性 | 识别抗tRNA合成酶综合征中的失调通路作为新型治疗靶点 | 抗tRNA合成酶综合征患者与健康参与者的外周血单个核细胞中的CD19+B细胞 | 数字病理学 | 抗tRNA合成酶综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 抗tRNA合成酶综合征患者与健康参与者,样本量未具体说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 对流式分选的CD19+细胞进行单细胞RNA测序 |
| 59 | 2026-05-09 |
Emodin Inhibitsg Hepatocellular Carcinoma Invasion and Migration by Regulating the HDAC4/NF-κB (p65)/CXCL12 Signaling Axis and Suppressing M2 Macrophage Polarization
2026, The American journal of Chinese medicine
DOI:10.1142/S0192415X26500369
PMID:42036631
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研究论文 | 研究大黄素通过调控HDAC4/NF-κB(p65)/CXCL12信号轴抑制肝细胞癌侵袭迁移及M2型巨噬细胞极化 | 首次揭示大黄素通过HDAC4/NF-κB/CXCL12通路调控巨噬细胞极化并抑制肝细胞癌进展的新机制 | NA | 探究大黄素如何通过HDAC4/NF-κB/CXCL12通路调控巨噬细胞极化并影响肝细胞癌进展 | HepG2肝癌细胞、巨噬细胞、肝细胞癌模型 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接、表面等离子体共振、Western blot | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2026-05-09 |
Molecular regulation of spermatogenesis: Insights from spatial transcriptomics
2026, Current topics in developmental biology
DOI:10.1016/bs.ctdb.2026.01.004
PMID:42097820
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综述 | 通过空间转录组学揭示精子发生的分子调控机制 | 首次系统综述空间转录组学技术在睾丸细胞空间组织、不同生精细胞群和体细胞区室相互作用中的应用,提供了对精子发生过程中基因表达模式的新见解 | 主要聚焦于当前空间转录组学技术的应用,未深入讨论技术本身的局限性(如分辨率、通量等) | 探讨从原始生殖细胞发育到精原干细胞过程中的关键调控因子、体细胞与生殖细胞的相互作用,以及空间转录组技术在干细胞研究中的应用 | 睾丸生精细胞(包括精原细胞、精母细胞、精子细胞)和睾丸体细胞(如支持细胞、间质细胞等) | 数字病理学 | NA | 空间转录组学、单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |