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当前共找到 1234 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-01-23 |
Campylobacter jejuni infection impacts host-derived miRNAs targeting bacterial and host genes
2026-Jan-22, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03184-25
PMID:41569044
|
研究论文 | 本研究探讨了空肠弯曲菌感染如何影响宿主来源的miRNAs，这些miRNAs靶向细菌和宿主基因 | 首次揭示了特定细菌物种（空肠弯曲菌）如何显著改变宿主细胞外囊泡来源的miRNA表达谱，并发现这些miRNAs可能同时靶向细菌毒力基因和宿主上皮基因 | 研究仅在无菌小鼠模型中进行，未在人类或更复杂的微生物群落环境中验证；miRNA靶向预测为计算预测，缺乏实验验证 | 探究空肠弯曲菌感染对宿主细胞外囊泡来源miRNA表达谱的影响及其在宿主-病原体相互作用中的作用 | 无菌小鼠、定植13种细菌的小鼠、定植13种细菌并感染空肠弯曲菌的小鼠 | 微生物组学与宿主-病原体相互作用 | 肠道感染 | miRNA测序、空间转录组学 | NA | miRNA表达数据、空间转录组数据 | 三组小鼠（无菌组、C13组、C13+空肠弯曲菌组），具体样本数未明确说明 | NA | miRNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 562 | 2026-01-23 |
ClusterGVis: An Advanced Visualization and Clustering Tool for Gene Expression Analysis
2026-Jan-22, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag005
PMID:41569346
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研究论文 | 本文介绍了ClusterGVis，一款用于简化基因表达数据分析和可视化的高级生物信息学软件 | 开发了集成了模糊c均值和k均值聚类算法以及热图可视化功能的用户友好界面，有效揭示复杂基因表达谱中的模式和关系 | NA | 简化基因表达数据的分析和可视化，以识别潜在生物标志物并增强对基因功能和调控机制的理解 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 模糊c均值聚类, k均值聚类 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 563 | 2026-01-23 |
Molecular Features of Response and Resistance to Glofitamab, a T-Cell Engager for treatment of Large B-Cell Lymphoma
2026-Jan-22, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025016925
PMID:41569641
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了glofitamab治疗大B细胞淋巴瘤中T细胞状态与临床反应的关系 | 揭示了早期维持“新鲜”样T细胞状态（特别是新鲜细胞毒性T细胞）与临床疗效的关联，并探索了4-1BB共刺激增强治疗效果的潜力 | 研究样本可能有限，且主要基于R/R B-NHL患者，结果可能不适用于其他淋巴瘤亚型或早期疾病阶段 | 深入理解glofitamab治疗大B细胞淋巴瘤中驱动疗效和耐药性的分子机制 | 复发或难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤（R/R B-NHL）患者的外周血免疫细胞（PBMC）及临床前肿瘤模型中的肿瘤内T细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 来自glofitamab治疗的R/R B-NHL患者的PBMC样本，包括完全代谢应答者（CMR）和进展性代谢疾病（PMD）患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 564 | 2026-01-23 |
SAMSN1 restrains NK cell mediated anti-tumor immunity in hepatocellular carcinoma
2026-Jan-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68661-4
PMID:41565668
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研究论文 | 本研究识别了SAMSN1作为肝细胞癌中NK细胞功能的新型免疫检查点 | 首次发现SAMSN1作为NK细胞特异性免疫检查点，在肝细胞癌中抑制NK细胞功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究SAMSN1在肝细胞癌NK细胞免疫调节中的作用 | 肝细胞癌患者样本及小鼠模型中的NK细胞 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 肝细胞癌患者样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 565 | 2026-01-23 |
ZNF683+ NK cells govern chemotherapy sensitivity in advanced HPSCC via reshaping immune microenvironment
2026-Jan-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68676-x
PMID:41565699
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术，揭示了ZNF683+ NK细胞通过重塑免疫微环境调控晚期下咽鳞状细胞癌化疗敏感性的机制 | 首次通过纵向单细胞测序揭示HPSCC化疗耐药中的免疫细胞动态变化，并鉴定出ZNF683+ NK细胞作为化疗疗效的关键调控者及其与CD8 T细胞的相互作用机制 | 研究样本量有限，且机制验证主要在体外共培养体系中进行，需要更多临床样本和体内实验进一步验证 | 探究下咽鳞状细胞癌化疗耐药的免疫学机制并寻找预测生物标志物和治疗靶点 | 配对的TPF化疗前后晚期下咽鳞状细胞癌患者标本 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序，空间多重免疫组化，生物信息学分析，体外共培养 | NA | 单细胞转录组数据，空间蛋白质表达数据 | 配对的化疗前后HPSCC标本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 566 | 2026-01-23 |
IL-21 mediates crosstalk between T cells and NK cells during the remission of type 1 diabetes
2026-Jan-21, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-025-01439-y
PMID:41566069
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研究论文 | 本研究揭示了在1型糖尿病进展和缓解过程中，CD161+ CD4+ T细胞通过IL-21和mTOR信号通路促进致病性NK细胞生成的机制 | 首次发现CD226+ CD56+ CD16+ NK细胞亚群在T1D发病时扩增并在缓解时收缩，并揭示了IL-21介导的T细胞与NK细胞间串扰机制 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本的横断面分析，长期临床转化效果尚需进一步验证 | 探究自然杀伤细胞在1型糖尿病发病和缓解过程中的作用机制 | 1型糖尿病患者样本和雌性小鼠模型 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者横断面和纵向样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 567 | 2026-01-23 |
Evaluating deconvolution methods using real bulk RNA-expression data for robust prognostic insights across cancer types
2026-Jan-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03942-1
PMID:41566530
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研究论文 | 本研究通过一个新颖的真实数据框架，利用18个真实批量RNA表达队列评估五种去卷积方法，并识别出稳健的去卷积方法ReCIDE和BayesPrism，进一步发现基质癌相关成纤维细胞作为跨癌症的预后标志物 | 引入基于真实批量RNA表达数据的新框架，通过三种创新基准场景（与scRNA-seq一致性、跨队列可重复性、预后相关性可重复性）评估去卷积方法，并应用泛癌症分析识别出mCAF作为跨癌症预后标志物 | 传统伪批量基准在真实世界设置中可能不可靠，且绝对细胞比例未知 | 评估去卷积方法在真实批量RNA表达数据中的性能，为精准肿瘤学提供工具并指导转化研究中的方法选择 | 18个真实批量RNA表达队列（5,891个样本）覆盖九种癌症类型，以及TCGA和GEO队列 | 自然语言处理 | 肺癌 | 批量RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 5,891个样本 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 568 | 2026-01-23 |
scSemiPLC: a semi-supervised learning framework for annotating single-cell RNA-Seq data by generating pseudo-labels through clustering
2026-Jan-20, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00223-25
PMID:41358754
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scSemiPLC的半监督学习框架，用于通过聚类生成伪标签来注释单细胞RNA-Seq数据 | scSemiPLC利用现有标签信息指导未标记数据的聚类，通过一致性正则化约束扰动数据的预测与伪标签相似，解决了固定高阈值伪标签范式导致的未标记数据利用率低的问题 | NA | 开发一个高效便捷的自动化细胞注释方法，以应对传统手动标记基因匹配方法的繁琐和耗时问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 半监督学习框架 | RNA-Seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 569 | 2026-01-23 |
Inhibition of PFKFB3 in macrophages ameliorates intestinal inflammation by modulating gut microbiota in DSS-induced colitis
2026-Jan-20, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00632-25
PMID:41378888
|
研究论文 | 本研究探讨了糖酵解关键酶PFKFB3在巨噬细胞中的作用，发现抑制PFKFB3可通过调节肠道菌群减轻DSS诱导的结肠炎 | 首次揭示了巨噬细胞中PFKFB3缺陷通过调节肠道菌群（特别是增强Akkermansia菌属）改善结肠炎的机制，并证明该菌群可水平传播产生治疗效应 | 研究主要基于小鼠模型，人体验证尚不充分；抗生素处理实验表明菌群介导效应，但具体菌种功能机制需进一步解析 | 阐明PFKFB3在溃疡性结肠炎中的作用机制，探索通过靶向巨噬细胞代谢调节肠道菌群的治疗策略 | 溃疡性结肠炎患者组织样本、DSS诱导的结肠炎小鼠模型、巨噬细胞特异性PFKFB3缺陷小鼠 | 免疫代谢与微生物组学 | 溃疡性结肠炎 | 免疫组化染色、单细胞RNA测序、流式分析、高通量转录组数据分析、Spearman相关性分析 | 小鼠基因缺陷模型（LysM-Cre介导的巨噬细胞PFKFB3敲除） | 转录组数据、单细胞测序数据、临床病理数据 | 人类UC队列组织样本、结肠炎小鼠模型、基因工程小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 570 | 2026-01-23 |
Piezo1 dictates K+ homeostasis through coordinated regulation of the ubiquitin ligase Kelch-like 3 in RBCs and the kidney
2026-Jan-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2513222123
PMID:41533447
|
研究论文 | 本文揭示了机械传感器Piezo1通过协调红细胞和肾脏中泛素连接酶Kelch-like 3 (KLHL3)的活性，调控细胞外钾离子稳态的机制 | 首次发现Piezo1-KLHL3相互作用作为红细胞与肾脏之间的关键组织间信号机制，调控钾离子稳态，并提出了该通路作为治疗钾离子紊乱的潜在靶点 | 研究主要基于小鼠模型和人类遗传数据，需要进一步实验验证该通路在人类疾病中的具体作用机制 | 探究组织间信号在钾离子稳态中的作用，特别是Piezo1-KLHL3通路的功能 | 红细胞、肾脏、人类遗传数据（UK Biobank参与者） | 分子生物学 | 钾离子紊乱 | CRISPR基因编辑、单细胞转录组学、遗传关联分析 | NA | 遗传数据、转录组数据、生理参数 | 200,367名UK Biobank参与者、KLHL3敲入小鼠模型 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 571 | 2026-01-23 |
Glycolytic heterogeneity drives metabolic-targeted therapy in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Jan-20, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02546-8
PMID:41554705
|
研究论文 | 本研究揭示了胰腺导管腺癌中显著的糖酵解异质性，并探索了其与临床预后和治疗反应的关系 | 首次通过空间转录组学结合多组学方法系统描绘了胰腺导管腺癌的糖酵解异质性，并建立了基于糖酵解表型的患者分层框架 | 研究主要基于体外模型和测序数据，需要进一步的体内实验和临床验证 | 探究胰腺导管腺癌的代谢异质性及其对靶向治疗的影响 | 胰腺导管腺癌患者样本、患者来源的细胞模型和类器官 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、批量RNA测序、代谢组学、蛋白质组学、脂质组学 | NA | 空间转录组数据、单细胞RNA-seq数据、批量RNA-seq数据、多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 572 | 2026-01-23 |
Pyrroloquinoline quinone ameliorates inflammatory responses by modulating macrophage polarization in murine models of SLE and lupus-associated diffuse alveolar hemorrhage
2026-Jan-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116219
PMID:41564475
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研究论文 | 本研究评估了吡咯喹啉醌（PQQ）在系统性红斑狼疮（SLE）及其相关弥漫性肺泡出血（DAH）中的治疗效果，并探讨了其通过调节巨噬细胞极化发挥抗炎作用的机制 | 首次在SLE和SLE相关DAH模型中评估PQQ的治疗效果，并利用单细胞RNA测序和批量RNA测序技术揭示其通过调节巨噬细胞极化及ERK/MAPK信号通路发挥免疫调节作用的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，尚未在人体中进行验证，且具体分子机制细节有待进一步深入探究 | 评估PQQ对SLE及其并发症DAH的治疗效果，并探究其对巨噬细胞极化的调节作用 | 使用Pristane诱导的DAH小鼠、狼疮易感MRL/lpr小鼠以及RAW264.7巨噬细胞系 | NA | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq），流式细胞术 | NA | RNA测序数据，流式细胞术数据 | 涉及两种小鼠模型（Pristane诱导DAH小鼠和MRL/lpr小鼠）及RAW264.7细胞系，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 573 | 2026-01-23 |
Parasympathetic nerves in the kidney pelvis contribute to blood pressure regulation
2026-Jan-19, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2026.01.002
PMID:41565024
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研究论文 | 本文通过解剖学和功能实验证实肾脏骨盆存在副交感神经支配，并探讨其在血压调节中的作用 | 首次在肾脏骨盆中鉴定出副交感神经通路，并通过光遗传学激活证实迷走神经-肾脏传入通路能降低血压 | 研究主要聚焦于肾脏骨盆区域，未全面评估整个肾脏的神经支配；功能实验基于动物模型，人类中的相关性尚待验证 | 探究肾脏骨盆的副交感神经支配及其在血压调节中的生理功能 | 肾脏骨盆的神经支配、乙酰胆碱释放及迷走神经-肾脏通路 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR、荧光原位杂交、光纤光度法、光遗传学 | NA | 基因表达数据、神经信号数据、生理参数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 574 | 2026-01-23 |
Strategies for resolving cellular phylogenies from sequential lineage tracing data
2026-Jan-17, Theoretical population biology
IF:1.2Q4
DOI:10.1016/j.tpb.2026.01.001
PMID:41554460
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研究论文 | 本文通过建模和理论分析，探讨了基于顺序编辑的细胞谱系追踪数据中精确重建系统发育树的条件和方法 | 首次对顺序编辑的分子记录系统进行建模，并理论分析了在何种实验条件下能高概率实现精确的细胞谱系重建，为实验设计提供了理论指导 | 研究基于模拟和理论分析，可能未完全覆盖实际实验中的复杂生物变异和技术噪声 | 分析顺序编辑的细胞谱系追踪数据的信息内容，并确定能准确重建细胞系统发育树的实验条件 | 基于CRISPR的分子记录系统和单细胞RNA测序数据 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 距离基于的重建方法 | 序列数据 | 数千个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 575 | 2026-01-23 |
Thyroid hormone signaling causally influences pancreatic disease risk: Evidence from Mendelian randomization and multi-omics integration
2026-Jan-15, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和多组学整合分析，揭示了甲状腺功能与胰腺疾病风险之间的因果关系及潜在机制 | 首次利用大规模遗传数据证实甲状腺功能对胰腺炎风险的因果影响，并通过单细胞和空间转录组学揭示了细胞类型特异性机制和局部甲状腺激素失活现象 | 研究主要基于欧洲人群的遗传数据，结论在其他人群中的普适性有待验证；空间转录组学样本量相对有限 | 探究甲状腺功能与胰腺疾病（特别是胰腺炎）之间的因果关系及分子机制 | 人类遗传数据、胰腺组织样本（包括腺癌、急慢性胰腺炎） | 多组学整合分析 | 胰腺疾病（胰腺炎、胰腺癌） | 孟德尔随机化、RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | 孟德尔随机化模型、生存分析模型 | 遗传数据、转录组数据、空间转录组数据 | 超过500,000人的全基因组关联研究数据、172例胰腺腺癌的RNA测序数据、159,007个单细胞（急慢性胰腺炎和胰腺癌）、253个空间转录组区域 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组学平台 |
| 576 | 2026-01-23 |
Interpretable trajectory inference with single-cell linear adaptive negative-binomial expression (scLANE) testing
2026-Jan-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1494
PMID:41533563
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研究论文 | 本文提出了一种名为scLANE的可解释轨迹推断方法，用于单细胞RNA-seq数据中的基因表达动态分析 | scLANE方法基于可解释的广义线性模型，通过经验选择的基样条处理非线性，并扩展至估计方程和混合模型，以支持复杂实验设计下的可靠轨迹测试 | NA | 开发一种可解释的轨迹推断方法，以识别与单细胞RNA-seq数据中轨迹进展显著相关的基因表达变化 | 单细胞RNA-seq数据中的基因表达动态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | 广义线性模型（GLM） | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 577 | 2026-01-23 |
Unstressed cells are alike, but stressed cells differ: Environmental and single-cell heterogeneity in yeast stress responses
2026-Jan-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.12.642837
PMID:41542409
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研究论文 | 本研究通过高通量单细胞RNA测序技术，分析了酵母细胞在多种压力条件下的转录组异质性，揭示了压力响应中平均信号与单细胞水平差异之间的关键区别 | 首次在单细胞水平上系统比较了酵母压力响应中激活与抑制程序的预测能力，发现压力抑制程序（以核糖体相关基因为主）具有跨数据集的稳定预测性，而压力激活程序则高度条件特异性；同时揭示了压力细胞中经典压力程序与转座元件转录之间的互斥性细胞亚群行为 | 研究仅针对酵母模型系统，结果在更复杂生物体中的普适性有待验证；单细胞测序技术本身存在技术噪音和捕获效率限制 | 探究细胞压力响应的异质性本质，比较平均群体水平与单细胞水平在压力响应特征识别上的差异 | 酿酒酵母细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约13,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 578 | 2026-01-23 |
Advancing adoptive T cell therapy in ovarian cancer: barriers, innovations, and emerging platforms
2026-Jan-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013285
PMID:41513408
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综述 | 本文全面分析了卵巢癌中过继性T细胞疗法的现状、障碍、创新策略及新兴技术平台 | 系统整合了从传统TIL、TCR-T、CAR-T到新兴的双特异性T细胞衔接器分泌型T细胞、双靶向平台及合成抗原受体等多种疗法，并强调了空间转录组学、单细胞分析和机器学习等工具在优化疗法设计中的作用 | NA | 克服卵巢癌中过继性T细胞疗法的免疫障碍，加速开发更有效、持久和个性化的T细胞策略 | 卵巢癌及其他实体瘤 | NA | 卵巢癌 | 空间转录组学，单细胞分析，机器学习 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学，单细胞分析 | NA | NA |
| 579 | 2026-01-23 |
Fishing with Two Lines: A Hybrid Approach to Spatial Transcriptomic Discovery
2026-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.07.698201
PMID:41542551
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研究论文 | 本文开发了一种结合高灵敏度和广覆盖的空间转录组学双重化学方法 | 提出了一种创新的双重化学方法，将10X Genomics Xenium V1定制面板的高灵敏度与Prime 5K面板的广覆盖结合在同一组织切片上 | NA | 解决空间转录组学中基因检测数量与每个基因灵敏度之间的权衡问题 | 人类肺组织微阵列 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10X Genomics Xenium V1, Prime 5K | 10X Genomics Xenium V1定制面板（最多480个基因）与Prime 5K面板（5001个基因） |
| 580 | 2026-01-23 |
Revealing hidden regulatory dependencies: multi-perspective graph learning for single-cell gene regulatory network inference
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf733
PMID:41554051
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研究论文 | 本研究提出了一种名为ATFGRN的自适应拓扑-特征融合图神经网络框架，用于从单细胞转录组数据中准确推断基因调控网络 | 提出了一种多视角融合策略，整合了子图结构编码、表达引导和相似性结构三个互补视角的特征，通过注意力机制进行加权融合，实现了结构、表达和相似性信息的互补集成 | NA | 提高从复杂高维单细胞转录组数据中推断基因调控网络的准确性 | 基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 图神经网络，图卷积网络，注意力机制 | 单细胞转录组数据，基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |