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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
521 2026-07-28
Multiomics Profiling Identifies Tlr4 as a Therapeutic Target of Necroptosis in Spinal Cord Injury
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 通过多组学分析识别Tlr4为脊髓损伤中坏死性凋亡的治疗靶点 备注:由于“坏死性凋亡”是标准译名,而“necroptosis”在中文中也常用“坏死性凋亡”(非“坏死性凋亡”),保持准确性,用“坏死性凋亡”。但原文有误,应为Necroptosis=坏死性凋亡(程序性坏死),中文常用“坏死性凋亡”或“程序性坏死”,这里按标准“坏死性凋亡”。 输出:通过多组学分析识别Tlr4为脊髓损伤中坏死性凋亡的治疗靶点 首次建立Tlr4作为脊髓损伤中pRIPK1/pRIPK3/pMLKL坏死性凋亡轴的上游直接调控因子,区别于其作为一般炎症介质的作用 研究仅限于大鼠脊髓损伤模型,在人类样本中的验证尚不明确 识别并验证脊髓损伤中与坏死性凋亡相关的关键基因,探索Tlr4作为治疗靶点的潜力 脊髓损伤大鼠模型的组织样本和细胞 机器学习 脊髓损伤 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、RT-qPCR、蛋白质印迹 加权基因共表达网络分析、最小绝对值收敛和选择算子回归 RNA测序数据和空间转录组数据 包含多个大鼠脊髓损伤样本,具体数量未在摘要中说明 Illumina 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 Illumina Novaseq 未提供具体配置细节
522 2026-07-28
Reframing thymic epithelial tumors through single-cell transcriptomics: a narrative review
2026, Mediastinum (Hong Kong, China)
综述文章 通过单细胞转录组学重新审视胸腺上皮肿瘤的叙事性综述 整合了近期单细胞研究,揭示了胸腺上皮肿瘤中上皮亚群、瘤内免疫景观和重症肌无力相关表型 基于三项关键研究,可能存在选择偏倚 综合单细胞转录组学在胸腺上皮肿瘤中的应用,解析细胞异质性 胸腺上皮肿瘤及其相关细胞亚群和免疫微环境 数字病理学 胸腺上皮肿瘤 scRNA-seq NA 文本 三项主要研究 NA 单细胞RNA测序 NA NA
523 2026-07-28
Single-Cell Analysis Delineates Glutathione Metabolism-Related Gene Signatures in the Glioblastoma Microenvironment and Identifies GSTA4 as a Regulator of Malignant Behaviors
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示胶质母细胞瘤微环境中谷胱甘肽代谢相关基因特征,并鉴定GSTA4为恶性行为调控因子 首次在单细胞水平揭示胶质母细胞瘤微环境中的谷胱甘肽代谢重编程特征,并首次证明GSTA4通过Wnt/β-catenin信号通路促进肿瘤发生和侵袭表型 未明确说明局限性 阐明胶质母细胞瘤微环境的细胞景观和谷胱甘肽代谢特征,并明确GSTA4在胶质母细胞瘤进展中的作用 胶质母细胞瘤细胞(U87 MG、LN229、U251)和正常人类星形胶质细胞(SVG p12) 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 104,789个胶质母细胞瘤细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
524 2026-07-28
Plantaricin BM-1 enhances anti-colorectal cancer effects by inhibiting CD8+ cytotoxic T cell apoptosis via the ERK/AP1/Bim signaling pathway
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 揭示plantaricin BM-1通过抑制CD8+细胞毒性T细胞凋亡增强抗结直肠癌效果的分子机制 首次揭示plantaricin BM-1在体内通过ERK/AP1/Bim信号通路抑制CD8+ T细胞凋亡从而增强抗结直肠癌效果,并利用单细胞RNA测序阐明机制 未提及具体局限,但可能包括样本量有限或机制验证主要基于小鼠模型 探究plantaricin BM-1对结直肠癌的体内抗肿瘤效果及其分子机制 AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型以及CD8+细胞毒性T细胞 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 免疫组化, 流式细胞术, Western blot NA 基因表达数据, 图像 AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
525 2026-07-28
Enterococcus-driven metabolite-host gene networks in IBD-associated colorectal carcinogenesis: integrative multi-omics and experimental validation
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 通过多组学整合与实验验证,阐明肠球菌在炎症性肠病相关结直肠癌发生中的代谢物-宿主基因网络调控作用 首次系统揭示肠球菌通过代谢物胍基丁胺和左旋多巴调控MAPK3等宿主基因的双重致癌机制,并鉴定雌二醇和亚砷酸钠为潜在辅助治疗药物 未详细说明体外实验验证的具体细胞系类型及动物模型验证缺失,仅依赖数据库挖掘和有限样本分析 探究肠球菌在炎症性肠病向结直肠癌进展中的作用机制 肠球菌驱动的代谢物-宿主基因网络 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
526 2026-07-28
A deep learning representation and spatial Bayesian cell-type deconvolution for spatial transcriptomics
2026, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 提出了名为SDDGP的计算框架,通过深度高斯过程与贝叶斯推断实现空间转录组数据的细胞类型反卷积,并在两个数据集上验证了其准确性 将深度高斯过程与贝叶斯推断结合,为空间转录组数据提供空间感知的反卷积及不确定性量化 论文摘要未明确提及局限性 提出一种能同时进行空间反卷积和不确定性量化的计算方法,以改进对空间转录组数据的分析 胰腺导管腺癌(PDAC)数据集和人类胸腺数据集 机器学习 胰腺癌 空间转录组学 深度高斯过程 基因表达数据 两个数据集:PDAC数据集(匹配单细胞RNA测序和空间转录组数据)和人类胸腺数据集 NA 空间转录组学 NA NA
527 2026-07-27
Identification of MTFR1 as a Novel Prognostic Biomarker and Putative Oncogene for Breast Cancer: A Multi-Omics Analysis and in Vitro Experimental Validation
2026 Jan-Dec, IET systems biology IF:1.9Q3
研究论文 通过整合多组学数据、空间转录组学和单细胞测序,结合体外实验验证,系统鉴定MTFR1在乳腺癌中的预后生物标志物和潜在致癌基因作用 首次系统揭示MTFR1在乳腺癌中的多维作用,包括空间转录组和单细胞测序的整合分析,以及交叉癌症免疫治疗中的预测性能评估 未提及具体局限性信息 探究MTFR1在乳腺癌中的表达特征、临床意义和功能机制 乳腺癌组织和细胞系 数字病理学 乳腺癌 多组学分析, 空间转录组学, 单细胞测序, 体外实验验证 NA 多组学数据, 空间转录组数据, 单细胞测序数据, 实验数据 多组学数据集(具体样本量未提及)及体外细胞实验样本 NA 空间转录组学, 单细胞测序 NA NA
528 2026-07-27
Investigating tryptophan metabolism in colorectal cancer using Single-cell RNA sequencing based on machine learning techniques
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序和机器学习技术研究结直肠癌中的色氨酸代谢模式 首次揭示结直肠癌中色氨酸代谢的细胞模式,并发现巨噬细胞和潘氏细胞在肿瘤发展中起主要作用 未在具体摘要中明确说明局限性 阐明结直肠癌中色氨酸代谢在细胞水平的模式,并识别关键特征基因 结直肠癌细胞类型,特别是巨噬细胞和潘氏细胞 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序 随机森林、Boruta、LASSO、梯度提升机 基因表达数据 未在摘要中明确说明样本量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
529 2026-07-27
YAP1 depletion enhances TAZ and its complexation with TEAD4 and AP-1 heterodimer C-JUN/FOSB in gastric cancer progression and metastasis
2026, Cancer heterogeneity and plasticity
研究论文 探究YAP1缺失通过TAZ与TEAD4及AP-1异二聚体c-JUN/FOSB的复合作用促进胃癌进展和转移 首次揭示在胃癌腹膜转移中YAP1抑制会引发TAZ代偿性上调,并发现TAZ与TEAD4及AP-1异二聚体的复合作用增强,强调联合靶向YAP1和TAZ的潜在治疗价值 研究主要集中在体内外模型和PDX模型,尚未在大型临床试验中验证联合抑制的安全性和疗效 评估YAP1和TAZ在胃癌腹膜转移中的表达状态及联合靶向的抗肿瘤活性 胃癌腹膜转移样本、细胞系、小鼠模型和患者来源异种移植模型 机器学习 胃癌 单细胞RNA测序、共免疫荧光染色、基因敲除、反义寡核苷酸抑制、免疫共沉淀、荧光素酶报告实验 NA 单细胞转录组数据、蛋白质互作数据 包括胃癌腹膜转移组织样本、细胞系、实验小鼠和PDX模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
530 2026-07-27
Transcriptomic characterization of key psoriasis-associated genes based on single-cell RNA-seq and machine learning
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 基于单细胞RNA测序和机器学习鉴定银屑病关键基因并进行转录组特征分析 首次结合单细胞RNA测序和机器学习方法,识别出四个新银屑病相关关键基因(DEFB4A、GJB2、SERPINB3、SERPINB13),并探索其病灶调控作用和靶向治疗策略 研究基于公开数据库,样本量有限;功能验证主要依赖生物信息学分析,缺乏体内或体外实验的直接验证 解析银屑病的转录组特征,识别关键驱动基因并探索潜在治疗靶点 银屑病患者和健康对照的皮肤组织样本 机器学习 银屑病 单细胞RNA测序、批量RNA测序 机器学习算法(具体模型类型未明确) 基因表达数据 来自GEO数据库的银屑病和健康样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
531 2026-07-27
Key molecular mechanisms of mitochondrial metabolic pathways in specific cell subpopulations of pancreatic cancer based on scRNA-seq and bulk RNA-seq
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,探究胰腺癌细胞亚群中线粒体代谢通路的关键分子机制 首次通过整合scRNA-seq和bulk RNA-seq揭示胰腺癌不同细胞亚群中线粒体代谢重编程的分子机制,并鉴定出三个关键基因(IFI27、PKM和RSAD2) 本研究依赖公共数据库数据,缺乏实验验证,且样本量有限 探究胰腺癌细胞亚群中线粒体代谢的分子机制并鉴定潜在治疗靶点 胰腺癌细胞亚群中的线粒体代谢相关基因及其调控网络 数字病理学 胰腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 WGCNA, 机器学习算法(如LASSO等) 转录组测序数据(scRNA-seq和bulk RNA-seq) 使用GSE183795、GSE16515、GSE197177和TCGA-PAAD四个公共数据集 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
532 2026-07-27
Discovery of hub genes linking oxidative stress to type 2 diabetic sarcopenia using single-cell sequencing and machine learning
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过单细胞测序和机器学习识别2型糖尿病肌肉减少症中与氧化应激相关的核心基因 首次整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,结合127种机器学习算法组合,系统鉴定了2型糖尿病相关肌肉减少症中与氧化应激相关的7个核心基因,揭示了TNFRSF1B介导的炎症信号激活泛素-蛋白酶体系统导致肌肉萎缩的新机制 研究主要基于公开数据集分析,缺乏动物模型或临床样本的验证,且核心基因在2型糖尿病肌肉减少症中的具体功能机制仍需进一步实验证实 探究2型糖尿病与肌肉减少症共病机制中氧化应激相关的分子机制 2型糖尿病相关肌肉减少症患者 机器学习和单细胞组学 2型糖尿病,肌肉减少症 单细胞RNA测序,批量RNA测序 Lasso,Stepglm(逐步逻辑回归) 基因表达数据 本研究中分析了四个公开数据集(GSE244515, GSE268953, GSE202295, GSE226151),具体样本量未详细说明 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
533 2026-07-27
An integrated multi-omics study of key mediators and therapeutic targets for doxorubicin-induced atrial fibrillation
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过整合多组学策略研究多柔比星诱发房颤的关键介质与治疗靶点 首次将药物警戒分析、网络毒理学与多组学数据(转录组、单细胞RNA测序)相结合,系统识别并验证CCR2和PDE5A作为多柔比星诱导房颤的中枢介质和潜在治疗靶点 发现需进一步的实验验证 阐明多柔比星诱导房颤的分子与细胞机制并识别关键靶点 多柔比星相关房颤事件的患者数据及心房转录组数据集 机器学习 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 分子对接 MCC算法 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 多个独立数据集(具体数量未提及) NA 单细胞RNA-seq NA NA
534 2026-07-27
Dysregulated glucocorticoid-responsive immune genes in peripheral blood mononuclear cells as a shared molecular signature of autism spectrum disorder and irritable bowel syndrome
2026, PloS one IF:2.9Q1
research paper 通过整合转录组分析,发现自闭症谱系障碍和肠易激综合征在外周血单核细胞中共享糖皮质激素响应免疫基因的失调分子特征 首次揭示ASD和IBS在GRI相关转录活性上的共享分子特征,并鉴定出LRFN1、NUAK2、TMEM154和GAPT四个核心基因作为潜在生物标志物,整合了机器学习、单细胞测序和药物预测等多层次分析 研究样本量可能有限,且未验证因果机制,未来需进一步在独立队列中验证生物标志物和药物靶点 阐明ASD与IBS之间共享的糖皮质激素响应免疫信号分子机制及潜在生物标志物和治疗靶点 自闭症谱系障碍患者和肠易激综合征患者的外周血单核细胞 machine learning 自闭症谱系障碍, 肠易激综合征 RNA-seq, single-cell RNA-seq ssGSEA, WGCNA, machine learning 转录组数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
535 2026-07-27
LDHA, BIK, and CNIH4 Are Diagnostic Markers of Endoplasmic Reticulum Stress in Lung Cancer Comorbid With Sepsis: Integrating Machine Learning and Single-Cell Analysis of Immune Signaling
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 通过整合机器学习和单细胞分析,鉴定LDHA、BIK和CNIH4作为肺癌合并脓毒症的内质网应激诊断标志物,并实验验证其功能 首次将内质网应激与肺癌合并脓毒症的免疫调控相结合,利用机器学习筛选出三个新的诊断标志物,并通过单细胞测序和体外实验验证其细胞类型特异性表达和功能 未提供具体局限性信息,但基于摘要推断可能包括样本量有限、单细胞数据仅用于验证、PC9细胞系不能完全代表体内环境 探究内质网应激与肺癌合并脓毒症中免疫反应的相互作用机制,并发现潜在的诊断标志物 肺癌合并脓毒症患者的内质网应激相关基因和免疫信号 机器学习 肺癌, 脓毒症 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 西方印迹, 伤口愈合实验, Transwell实验, 分子对接 机器学习算法(具体类型未明确,但描述为穷举机器学习算法) 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 临床组织样本, 细胞系实验数据 数据集来自GEO,包含肺癌和脓毒症队列;临床组织队列包括癌旁正常组织、肺癌组织和肺癌合并脓毒症组织 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
536 2026-07-27
Correction to "Single-Cell Sequencing Data Revealed Mechanisms of Interactions Between Tumor Cells and Cancer-Associated Fibroblasts in Metastatic Colorectal Cancer"
2026, BioMed research international IF:2.6Q3
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
537 2026-07-27
Gene expression profiling of recipient immune cells induced by 7 × 19 CAR-T cell dosing in a syngeneic mouse model
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过同基因小鼠模型分析7×19 CAR-T细胞输注后宿主免疫细胞的基因表达谱 首次探索7×19 CAR-T细胞通过招募和激活宿主免疫细胞对抗实体瘤的早期机制 仅在小鼠模型中研究,未在人类临床样本中验证;仅分析输注后4天的早期反应 阐明7×19 CAR-T细胞在实体瘤微环境中通过内源性免疫细胞介导的抗肿瘤机制 接受7×19 CAR-T细胞治疗的同基因小鼠模型中的宿主免疫细胞 机器学习 肿瘤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, AmpliSeq NA 基因表达数据 C57BL/6N小鼠皮下MC38肿瘤模型,数量未明确 Illumina 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq AmpliSeq, 10x Chromium AmpliSeq用于批量基因表达分析,10x Chromium用于单细胞RNA-seq
538 2026-07-27
A Potential miR-1246-5p-H3K27ac-NOL12 Regulatory Axis and Its Putative Tumour-Promoting Function in Hepatocellular Carcinoma
2026 Jan-Dec, IET systems biology IF:1.9Q3
研究论文 通过多组学数据分析,探讨miR-1246-5p-H3K27ac-NOL12调控轴在肝细胞癌中的潜在促癌作用 首次整合bulk RNA-seq、scRNA-seq、空间转录组学、ChIP-seq和CRISPR筛选等多维度数据,揭示NOL12受miR-1246-5p和H3K27ac修饰增强子调控的机制 未明确说明研究局限性 分析NOL12在肝细胞癌中的表达模式、临床意义及其受miR-1246-5p和H3K27ac调控的潜在机制 肝细胞癌组织样本、非肿瘤肝组织样本及公共数据库中HCC相关转录组数据 机器学习 肝细胞癌 bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, ChIP-seq, CRISPR筛选, 免疫组化 NA 转录组数据、空间转录组数据、免疫组化图像、ChIP-seq数据 4264例HCC vs 3145例非HCC(bulk RNA-seq);12例HCC样本(scRNA-seq);394对HCC与癌旁组织(IHC) Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, ChIP-seq Illumina NovaSeq 公共数据库来源:GEO、TCGA、GTEx;Cistrome DB用于ChIP-seq分析
539 2026-07-27
Serum IL2Rα as a Diagnostic Biomarker and Its Functional Interplay With IL-2 in Breast Cancer
2026, The breast journal
研究论文 本研究探讨了血清IL2Rα作为乳腺癌诊断生物标志物的潜力及其与IL-2的功能相互作用 首次系统评估了IL2Rα在乳腺癌中的血清表达、诊断和预后价值,并揭示了IL2RA与IL-2在乳腺癌病理生理中的功能性拮抗关系 样本量相对较小,且为单中心回顾性研究,血清IL2Rα的诊断效能仅为中等(AUC=0.650) 评估血清IL2Rα作为乳腺癌诊断生物标志物的价值,并探究IL-2/IL2RA轴在乳腺癌中的功能作用 252例接受乳腺手术的连续患者(99例乳腺癌和153例良性乳腺疾病) 机器学习 乳腺癌 电化学发光免疫分析、单细胞测序、RNA-seq NA 血清细胞因子数据、单细胞测序数据、转录组数据 252例患者(99例乳腺癌,153例良性乳腺疾病) NA 单细胞测序、bulk RNA-seq NA NA
540 2026-07-27
Single-Cell and Machine Learning Analyses Identify MYDGF as an Immune-Related Biomarker Associated With the Tumor Microenvironment in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2026, Human mutation IF:3.3Q2
研究论文 通过单细胞转录组学和机器学习方法,识别MYDGF作为透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中与免疫相关的生物标志物 首次将单细胞 profiling、批量多组学和功能验证相结合,系统性揭示MYDGF在ccRCC中的生物学和临床意义,并利用机器学习进行生物标志物发现 初步的19基因MYDGF相关预后基因集需进一步验证,且研究主要依赖公共数据集,可能限制结果的普适性 探究MYDGF在透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中的免疫相关作用和预后价值 透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤组织样本及细胞系 计算机视觉 肾细胞癌 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 批量RNA测序 LASSO Cox回归 单细胞转录组数据、批量转录组数据、临床数据 GSE156632数据集(scRNA-seq)和TCGA-KIRC数据集(批量转录组及临床数据) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
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