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当前共找到 1921 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2026-05-29 |
In Vivo CRISPR Interference Screen Reveals Long Noncoding RNA Portfolio Crucial for Cutaneous Squamous Cell Carcinoma Tumor Growth
2026-Jan, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.038
PMID:40441291
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研究论文 | 通过体内CRISPR干扰筛选，揭示了长链非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌肿瘤生长中的关键作用 | 首次利用体内CRISPR干扰筛选结合单细胞测序数据，系统鉴定出影响皮肤鳞状细胞癌生长的长链非编码RNA谱系 | NA | 探索长链非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌生长中的作用 | 皮肤鳞状细胞癌细胞系和异种移植模型 | 机器学习和数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌 | CRISPR干扰筛选、单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 正常和皮肤鳞状细胞癌人类皮肤组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 522 | 2026-05-29 |
Pharmacovigilance-Based Identification and Mechanistic Exploration of Periodontitis-Related Drugs
2026-01, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70040
PMID:40957584
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研究论文 | 基于药物警戒数据挖掘与单细胞RNA测序分析，识别与牙周炎相关的药物及其潜在分子机制 | 首次利用大型真实世界FAERS数据库联合四种信号检测算法及逻辑回归，系统识别与牙周炎显著相关的药物，并通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序验证候选基因VEGFA的因果作用及细胞类型特异性表达 | 因果关系需进一步验证，且数据来源可能受报告偏倚影响 | 从真实世界数据中识别牙周炎相关药物的潜在风险并探索其分子机制 | 牙周炎患者及药物相关蛋白靶点 | 自然语言处理 | 牙周炎 | FAERS数据挖掘、孟德尔随机化、单细胞RNA测序 | 逻辑回归、信号检测算法 | 文本（药物不良反应报告）、基因表达数据 | FAERS数据库大量报告，UKB-PPP和deCODE队列，牙龈及外周血单细胞RNA测序样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 523 | 2026-05-29 |
Spatial Transcriptomic Assessments of Gene Expression Profiles in Human Peri-Implant Lesions
2026-01, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70008
PMID:41077421
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研究论文 | 通过空间转录组学、RNA测序和免疫组化分析人类种植体周围病变组织的基因表达谱 | 首次采用空间转录组学技术研究人类种植体周围炎病变的组织特异性基因表达模式，结合RNA测序和免疫组化进行多维度验证 | 样本量较小（空间转录组学n=4，RNA测序n=20），可能限制发现的广泛适用性 | 分析种植体周围炎和健康种植体部位人类组织样本的基因表达差异及其生物学通路 | 人类种植体周围软组织活检样本，包括严重种植体周围炎患者和相邻无炎症对照种植体 | 数字病理学 | 种植体周围炎 | 空间转录组学, RNA-seq, 免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 空间转录组学4例，RNA测序20例，免疫组化38例 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 524 | 2026-05-29 |
Advancing lupus nephritis research through multi-omics and predictive modeling
2026 Jan-Dec, Innate immunity
IF:2.8Q3
DOI:10.1177/17534259261426818
PMID:42041246
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，结合机器学习模型，揭示狼疮性肾炎的细胞和分子驱动因素 | 首次通过非负矩阵分解识别免疫元程序，并利用细胞间通讯网络分析，结合399种机器学习预测模型，实现高精度诊断 | 样本量限制可能影响模型泛化性，分子对接模拟结果仍需实验验证 | 解析狼疮性肾炎的细胞异质性和分子机制，构建精准诊断模型 | 狼疮性肾炎患者的肾活检组织及外部验证队列的批量转录组数据 | 机器学习 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、非负矩阵分解、细胞通讯分析、分子对接 | 机器学习预测模型（399种） | 基因表达数据 | 狼疮性肾炎活检样本（具体数量未说明）及大规模批量RNA测序队列 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 525 | 2026-05-29 |
Identification of Gene Signatures and Molecular Mechanisms for Diagnosing Parkinson's Disease and Nonalcoholic Fatty Liver Disease Using Machine Learning
2026, Parkinson's disease
DOI:10.1155/padi/8731032
PMID:42205493
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研究论文 | 利用机器学习方法识别帕金森病与非酒精性脂肪肝病共病相关的基因标志物和分子机制 | 首次通过整合转录组数据、机器学习和单细胞RNA测序，系统揭示了NAFLD与PD在分子层面的关联，并筛选出核心候选基因及治疗药物 | 研究主要依赖公开数据库的转录组数据，未进行实验验证，且样本量有限可能影响结果的普适性 | 探索非酒精性脂肪肝病与帕金森病之间的分子联系，识别共病诊断的生物标志物和潜在治疗靶点 | 非酒精性脂肪肝病和帕金森病患者的转录组数据以及相关分子特征 | 机器学习 | 帕金森病, 非酒精性脂肪肝病 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | LASSO, 神经网络, 随机森林 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 526 | 2026-05-29 |
Nitidine chloride suppresses polo-like kinase 1 via MYCN-associated transcriptional regulation in colorectal cancer: a multi-omics and spatial transcriptomics study
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1824796
PMID:42205755
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研究论文 | 本研究结合多组学和空间转录组学，揭示了氯化两面针碱通过MYCN相关转录调控抑制结直肠癌中PLK1的机制 | 首次通过多组学整合、单细胞和空间转录组学分析，系统阐明氯化两面针碱靶向PLK1并通过MYCN-PLK1轴发挥抗结直肠癌作用 | 尚未明确PLK1与MYCN之间的直接转录调控关系，以及NC在CRC中的其他潜在靶点 | 阐明氯化两面针碱在结直肠癌中的分子靶点及其作用机制 | 结直肠癌组织和细胞系（HCT116），以及异种移植肿瘤模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序、单细胞转录组学、空间转录组学、分子动力学模拟、ChIP-seq、AlphaFold-Multimer对接、RT-qPCR、免疫组化 | GROMACS分子动力学模拟、AlphaFold-Multimer | 基因表达数据、测序数据、分子结构数据、图像数据 | 3,513个标本（2,256个肿瘤和1,257个非肿瘤样本） | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 527 | 2026-05-29 |
Identification and preliminary clinical validation of type 2 diabetes signature genes through machine learning analysis of scRNA-seq data
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1801737
PMID:42205842
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和机器学习分析，识别并验证了2型糖尿病的四个关键特征基因 | 首次将单细胞RNA测序与机器学习（LASSO回归）结合，在单细胞水平上识别2型糖尿病的特征基因，并揭示了Alpha和Beta细胞在糖尿病信号网络中的潜在核心作用 | 未提及 | 识别并验证2型糖尿病的关键特征基因，为疾病机制和生物标志物提供新见解 | 10种不同细胞类型的外周血样本，包括15名2型糖尿病患者和20名对照者 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, LASSO回归 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 15名2型糖尿病患者和20名对照者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 528 | 2026-05-29 |
Cell membrane-coated nanoparticles against non-alcoholic fatty liver disease via regulating endoplasmic reticulum stress
2026, Regenerative biomaterials
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/rb/rbag084
PMID:42206191
|
研究论文 | 开发了一种细胞膜包被的纳米颗粒，通过调节内质网应激来治疗非酒精性脂肪性肝病 | 利用生物信息学分析单细胞RNA测序数据，识别出肝细胞是内质网应激的主要细胞类型，并设计了工程化巨噬细胞膜包被的纳米颗粒，通过GalNAc修饰增强对肝细胞的靶向性，利用褪黑素抑制内质网应激通路及其下游NF-κB信号级联，从而减轻炎症和脂质积累 | 未提及 | 开发一种针对非酒精性脂肪性肝病的纳米颗粒治疗策略，通过调节内质网应激来改善疾病进展 | 非酒精性脂肪性肝病动物模型中的肝细胞 | 机器学习 | 非酒精性脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 动物模型样本（数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 529 | 2026-05-28 |
SCALE: unsupervised multiscale domain identification in spatial omics data
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1456
PMID:41495880
|
研究论文 | 提出一种无监督多尺度空间域识别算法SCALE，用于空间组学数据中功能域的分层检测 | 首次将深度学习图表示学习与熵基搜索算法结合，实现无需预先指定尺度的空间域层次化识别 | 未明确提及局限性，但算法性能可能受数据稀疏性和组织类型差异影响 | 开发能够自动识别空间转录组数据中多尺度功能域的计算方法 | 模拟数据及小鼠脑组织（Xenium和MERFISH平台）与患者肾组织样本 | 计算生物学, 深度学习 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络（GNN） | 空间基因表达数据 | 模拟数据、小鼠脑组织及患者肾组织样本（具体数量未说明） | NA | 空间转录组学 | Xenium, MERFISH | Xenium平台和MERFISH平台用于小鼠脑组织空间转录组数据采集 |
| 530 | 2026-05-27 |
SpaGene: A Deep Adversarial Framework for Spatial Gene Imputation
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0102
PMID:42146899
|
research paper | 提出一种名为 SpaGene 的深度学习框架，用于整合单细胞RNA测序数据和空间转录组数据，以预测空间转录组中缺失的基因表达 | 采用两个编码器-解码器对、两个转换器和两个判别器的对抗框架，有效填补空间转录组数据中的基因表达缺失 | 在受控基因保留评估协议下测试，可能未充分反映真实场景中的噪声和批次效应 | 开发一种方法整合单细胞和空间转录组数据，提高空间基因表达预测的准确性 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | machine learning | 肺癌 | scRNA-seq， 空间转录组学 | GAN | 基因表达数据 | 多个数据集对，包括肺癌组织样本 | NA | scRNA-seq， spatial transcriptomics | NA | NA |
| 531 | 2026-05-27 |
Trophoblast Fusion Deficiency in Placenta-Related Pregnancy Disorders
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-22637-2_6
PMID:42168741
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综述 | 本文综述了滋养层细胞融合在胎盘相关妊娠疾病中的缺陷及其分子机制 | 整合了多组学技术（如单细胞和空间转录组学）对滋养层融合的时空动态和分子复杂性进行了深入分析，并系统总结了从转录因子到代谢调控的多个层面的最新发现 | 缺乏能完全再现人类母胎界面结构和功能特征的模型，对翻译后修饰和时空调控机制的理解有限 | 阐明滋养层细胞融合缺陷在胎盘相关妊娠疾病（如子痫前期和胎儿生长受限）中的作用，并探索潜在的诊断和治疗创新 | 滋养层细胞融合过程及其相关分子机制，包括转录因子、融合蛋白、细胞骨架重塑、代谢重编程和免疫调节 | NA | 子痫前期, 胎儿生长受限 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 表观基因组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 532 | 2026-05-27 |
Autoencoder Denoising for Network-Based Spatial Transcriptomics Data with Applications for Cell Signaling Estimation
2026, Complex networks & their applications. International Conference on Complex Networks and Their Applications
DOI:10.1007/978-3-032-16719-4_16
PMID:42181748
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研究论文 | 提出一种基于自编码器的去噪框架，用于从空间转录组学数据中估计细胞信号，并通过网络邻接矩阵去噪和细胞信号估计两个组件进行验证 | 首次将神经网络应用于空间转录组学数据中基于网络的细胞信号估计，并系统比较了自编码器与奇异值分解在不同图模型下的去噪性能 | 未提及 | 开发一种去噪框架以改善从空间转录组学数据中估计细胞信号的准确性 | 空间转录组学数据中的网络邻接矩阵和细胞信号相互作用 | 机器学习 | 不适用 | 空间转录组学 | 自编码器 | 网络数据 | 不适用 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 533 | 2026-05-27 |
Identification and validation of a seven-gene metastasis-associated prognostic model in breast cancer
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1770418
PMID:42186460
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研究论文 | 基于转移相关差异表达基因构建并验证了乳腺癌七基因预后模型，并发现了新的潜在治疗靶点 | 识别了两个此前未被充分研究的基因（RTN1和TLR10）作为肿瘤进展的潜在新驱动因子，并利用单细胞转录组学揭示了其细胞类型特异性表达模式 | 未在摘要中明确说明局限性 | 构建基于转移和癌症相关差异表达基因的预后特征，并识别潜在的新型治疗基因 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | Cox比例风险模型, LASSO回归 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 来自TCGA-BRCA、AURORA US Network、SCAN-B和GEO数据库的多组数据集 | 未在摘要中明确提及 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 未在摘要中明确提及 | 未在摘要中明确提及 |
| 534 | 2026-05-25 |
Claudin 18.2 as a Biomarker for Imaging and Radiopharmaceutical Therapy in Gastric and Pancreatic Tumors
2026-01-02, Journal of nuclear medicine : official publication, Society of Nuclear Medicine
IF:9.1Q1
DOI:10.2967/jnumed.125.270568
PMID:41266253
|
研究论文 | 探究Claudin 18.2作为胃癌和胰腺癌中分子成像与靶向放射性药物治疗的生物标志物的潜力 | 首次在胃癌和胰腺癌模型中系统评估CLDN18.2用于PET成像和放射性核素治疗的可行性，展示了[Zr]Zr-DFO-zolbetuximab的高肿瘤摄取和[Lu]Lu-DOTA-zolbetuximab的抗肿瘤效果 | 研究基于小鼠异种移植模型，尚未在人体中进行验证；样本量较小（31例PDAC患者） | 评估CLDN18.2作为胃癌和胰腺癌分子成像和靶向放射性药物治疗的生物标志物的潜力 | 胃癌（GSU细胞系）和胰腺导管腺癌（HUPT-4和PATU8988S细胞系）的小鼠皮下异种移植模型 | 数字病理学 | 胃癌, 胰腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, PET成像, 放射性药物治疗 | NA | 测序数据, 影像数据 | 31名胰腺癌患者, 裸鼠异种移植模型（GSU、HUPT-4、PATU8988S细胞系） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 535 | 2026-05-25 |
Ubiquitous and Brain Cell-Type-Specific Promoters and Enhancers in Lentiviral Vectors
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4807-0_7
PMID:41273642
|
综述 | 讨论了在慢病毒载体中构建和运用组成型及脑细胞类型特异性启动子和增强子以实现精准高效基因递送的方法 | 利用单细胞转录组学和ATAC测序新技术发现新型增强子区域，为开发更精准的靶向慢病毒载体铺平道路 | 未明确说明 | 开发用于慢病毒载体的脑细胞类型特异性启动子和增强子，提高转基因在脑细胞中的表达特异性和效率 | 脑细胞类型包括兴奋性和抑制性神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学, ATAC测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 536 | 2026-01-18 |
Neighborhood nonnegative matrix factorization identifies patterns and spatially-variable genes in large-scale spatial transcriptomics data
2026-Jan-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03846-6
PMID:41546049
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 537 | 2026-05-21 |
BDCD: a comprehensive Brain Disease Cell-cell communication Database
2026-Jan-15, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baag017
PMID:41925140
|
研究论文 | BDCD是首个专注于脑疾病细胞间通讯网络的综合数据库，整合了来自单细胞RNA-seq和空间转录组学的大量数据 | 首次构建了覆盖多种脑疾病的特异性细胞间通讯资源，整合了配体-受体相互作用与遗传关联、通路和药物调节剂等多维度数据，支持跨疾病比较和动态假说生成 | 现有资源在脑部特异性、区域覆盖和功能注释方面仍存在局限，且数据库可能尚未涵盖所有已知脑疾病或最新研究数据 | 为脑疾病病理机制和治疗发现提供综合性的细胞间通讯资源 | 脑疾病中涉及的单细胞和空间转录组数据，覆盖阿尔茨海默病、帕金森病、精神分裂症、双相情感障碍和多发性硬化症 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病, 帕金森病, 精神分裂症, 双相情感障碍, 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 8519425个单细胞和140744个空间转录组点，来自38个手动整理的数据集，涵盖14个脑区和13种经典细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 538 | 2026-01-20 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals metabolic reprogramming and tumor microenvironment remodeling in aldosterone-producing adenoma
2026-01, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111164
PMID:41317749
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了醛固酮瘤（APA）中的代谢重编程和肿瘤微环境重塑 | 首次构建了APA的单细胞图谱，揭示了CAPS zona glomerulosa样细胞的代谢重编程特征、分化轨迹紊乱以及肿瘤微环境中免疫浸润和基质重塑的关键机制 | 样本量较小（仅3例APA患者和3例对照），且为单中心研究，需要更大规模队列验证 | 阐明醛固酮瘤的细胞异质性、肿瘤发生机制及潜在治疗靶点 | 肾上腺组织（来自APA患者和对照个体） | 数字病理学 | 肾上腺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例APA患者和3例对照的肾上腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 539 | 2026-05-21 |
Single-cell RNA sequencing reveals a cellular atlas of the sheep testis
2026-01, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111159
PMID:41325971
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序构建绵羊睾丸细胞图谱，揭示精子发生过程中的细胞异质性和分化轨迹 | 首次在绵羊中通过单细胞转录组分析鉴定出六种体细胞亚型和五种生殖细胞亚型，并发现Leydig细胞和管周肌样细胞可能起源于共同祖细胞谱系 | 仅分析了6月龄性成熟湖羊的睾丸组织，缺乏不同发育阶段或病理状态的比较 | 解析绵羊睾丸中不同细胞类型的转录组特征及精子发生的分化轨迹 | 3只6月龄性成熟湖羊的睾丸细胞 | 机器学习和生物信息学 | NA | scRNA-seq（单细胞RNA测序） | NA | 单细胞转录组数据 | 3只绵羊，共15,826个睾丸细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium™ 单细胞3'转录组测序 |
| 540 | 2026-05-21 |
TOGAR: Token-gated generative refinement for high-fidelity spatial transcriptomics and robust spatial domain clustering
2026-01, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111179
PMID:41422986
|
研究论文 | 提出TOGAR模型，一种基于令牌门控生成式细化的空间转录组学方法，统一去噪、空间增强和聚类，实现高保真空间转录组分析和稳健的空间域聚类 | 创新性地提出令牌门控（token gating）与门控线性注意力（gated linear attention）结合的扩散骨干网络（UGate-based diffusion backbone），并整合图卷积网络损失与零膨胀负二项分布损失以处理稀疏计数数据噪声，同时利用扩散轨迹上的相似性引导平均生成稳定的点级估计 | 标题和摘要未提及方法局限性信息 | 解决空间转录组学数据稀疏性和噪声对长程依赖建模的限制，提高空间域划分的准确性 | 空间转录组学数据中的组织切片的空间域聚类及生物结构识别 | 计算机视觉, 机器学习 | 癌症 | 空间转录组学 | 图卷积网络, 扩散模型, 门控线性注意力 | 基因表达数据 | 12个切片（来自三个空间转录组学平台） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |