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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2026-07-31 |
Toward a cell-type-specific lung HOX code
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1839422
PMID:42523700
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研究论文 | 通过全局基因表达分析和单细胞RNA测序数据,研究了成年人类肺部HOX基因的细胞类型特异性表达模式 | 首次全面描绘了成年人类肺部HOX基因的细胞类型特异性表达图谱,并利用肺类器官分化模型验证了发育过程中的表达模式 | 未明确说明研究局限性(摘要中未提及) | 明确成年人类呼吸系统中HOX基因的细胞类型特异性作用 | 正常肺组织标本、公开的单细胞RNA测序数据集、诱导多能干细胞来源的肺类器官 | 数字病理学 | 肺部疾病 | qRT-PCR, 单细胞RNA测序(scRNAseq), 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据 | 正常肺组织标本及公开数据集(未提供具体样本数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 502 | 2026-07-31 |
Advances in single-cell transcriptomic sequencing in hepatic echinococcosis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1829801
PMID:42523976
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综述 | 综述单细胞转录组测序在肝棘球蚴病研究中的应用 | 汇总了近年来单细胞RNA测序在肝脏棘球蚴病中的研究进展,重点关注病变周围免疫细胞异质性、细胞亚群分类和免疫微环境 | 该领域尚缺乏足够的化疗药物和靶向治疗,临床治疗存在局限 | 探讨肝脏棘球蚴病的分子免疫机制和生物学特性,为新药治疗靶点提供参考 | 肝脏棘球蚴病及其免疫细胞异质性 | 机器学习 | 肝脏棘球蚴病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 503 | 2026-07-31 |
Single-cell Transcriptomics Uncovers the Tumor Microenvironment and Collagen-CD44 Axis in HIV Positive Cervical Squamous Cell Carcinoma
2026, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.134138
PMID:42524145
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示HIV阳性宫颈鳞癌中肿瘤微环境和胶原-CD44轴的作用 | 首次分析了HIV阳性宫颈鳞癌的单细胞RNA测序数据,揭示了CAF通过胶原-CD44轴介导的细胞间交流,并发现CD44可作为潜在治疗靶点 | 仅包含3个HIV阳性CSCC样本和3个阴性对照,样本量较小,且未涉及术前放化疗患者的异质性 | 探究HIV阳性CSCC与阴性CSCC在肿瘤微环境中的细胞和分子差异 | HIV阳性宫颈鳞癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 宫颈鳞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3个HIV阳性CSCC样本和3个HIV阴性CSCC公共数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 504 | 2026-07-31 |
Single-Cell-Derived Malignant Epithelial Programs Define Prognostic Risk and Therapeutic Vulnerability in Ovarian Cancer
2026, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.135548
PMID:42524312
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示卵巢癌恶性上皮细胞异质性,构建预后风险模型并验证PSMB1作为治疗靶点的潜力 | 利用单细胞RNA测序技术解析恶性上皮细胞的转录异质性和演化轨迹,建立基于亚群特异基因的预后风险模型,突破了传统bulk转录组模型忽视细胞来源的局限 | 需要进一步在更大队列中验证模型的临床适用性,以及PSMB1的功能机制尚未完全阐明 | 构建基于恶性上皮细胞异质性的预后框架,实现卵巢癌风险分层并识别治疗靶点 | 卵巢癌恶性上皮细胞的亚群及其基因特征 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,拷贝数变异推断,生存分析,LASSO回归 | Cox回归,LASSO模型 | 单细胞转录组数据,bulk RNA-seq数据 | 多个卵巢癌队列(具体数量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 505 | 2026-07-31 |
Integrative bulk and single-cell transcriptomic analysis identify an ac4C-related signature in lung adenocarcinoma
2026, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.135531
PMID:42524437
|
研究论文 | 通过整合批量与单细胞转录组分析,识别肺腺癌中与ac4C相关的特征 | 首次将ac4C RNA修饰与肺腺癌肿瘤微环境中的恶性和通讯模式联系起来,并建立六基因预后模型 | 结果主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探讨ac4C相关特征在肺腺癌肿瘤微环境中的临床意义和调控模式 | 肺腺癌患者肿瘤组织及单细胞数据 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO、随机森林、SVM-RFE | 批量RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA和GEO数据集中的肺腺癌样本 | Illumina | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 506 | 2026-07-31 |
Targeting Kupffer Cell CD44-Mediated Ammonia Death via the ELAVL1-GLS Metabolic Circuit in Radiation-Induced Liver Disease
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.136823
PMID:42524520
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research paper | 本研究揭示了放射诱导肝病中Kupffer细胞通过CD44-ELAVL1-GLS免疫代谢环路介导氨死亡的新机制 | 首次发现CD44通过稳定ELAVL1蛋白上调谷氨酰胺酶GLS,导致氨积累和Kupffer细胞死亡,提出RILD免疫代谢重编程新机制 | 机制仅在Kupffer细胞中验证,未涉及其他肝细胞类型;氨死亡的具体下游效应分子仍需进一步阐明 | 阐明放射诱导肝病中Kupffer细胞免疫代谢重编程的分子机制 | 放射诱导肝病小鼠模型中的Kupffer细胞 | 机器学习 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肝组织样本,具体数量未明确 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3‘基因表达方案 |
| 507 | 2026-07-31 |
Neutrophils in Kidney Disease: Linking Neutrophil Function and Microenvironment to Therapeutic Targets
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S605349
PMID:42524556
|
综述 | 综述中性粒细胞在肾脏疾病中的功能,连接其作用与微环境以探讨治疗靶点 | 整合空间转录组学、单细胞技术和活体成像等先进技术,强调中性粒细胞功能的区室特异性及其在感染、无菌和自身免疫性肾脏疾病中的不同作用,并提出靶向中性粒细胞激活通路的新治疗策略 | 未明确提及本文自身局限性,可能包括综述范围有限或依赖现有文献数据 | 总结中性粒细胞在感染、无菌和自身免疫性肾脏疾病中的生物学知识,聚焦补体特异性中性粒细胞功能和效应机制,并讨论新兴治疗策略 | 中性粒细胞在肾脏疾病中的功能及其微环境 | NA | 肾脏疾病 | 空间转录组学, 单细胞技术, 活体成像 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞技术 | NA | NA |
| 508 | 2026-07-31 |
VASN Enhances IGF2BP3 Stability via USP10 Deubiquitination to Promote Triple-negative Breast Cancer Paclitaxel Resistance
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.136403
PMID:42524640
|
研究论文 | 本研究整合转录组和单细胞RNA测序数据,发现VASN通过USP10去泛素化稳定IGF2BP3,促进三阴性乳腺癌紫杉醇耐药 | 首次揭示CEBPB-VASN/IGF2BP3/USP10-ABCB1信号轴在TNBC紫杉醇耐药中的机制,并提出曲美替尼联合紫杉醇的潜在治疗策略 | 主要基于细胞系和异种移植模型,临床样本验证有限,且未在更多耐药模型或患者队列中进一步验证 | 探索VASN在TNBC紫杉醇耐药中的功能和分子机制,并寻找克服耐药的潜在治疗策略 | 三阴性乳腺癌细胞系(MDA-MB-231R和CAL-51R)及异种移植小鼠模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | NGS, 单细胞RNA测序, RNA-seq | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床样本 | 公共数据库和临床样本(具体数量未说明) | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 转录组 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3', Illumina NovaSeq测序平台 |
| 509 | 2026-07-31 |
Mechanical stress-induced STAT3/YAP signaling in fibroblasts programs immunosuppressive lymph node remodeling in lung squamous carcinoma
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.132656
PMID:42524647
|
研究论文 | 揭示肿瘤机械应力通过成纤维细胞STAT3/YAP信号重塑免疫抑制性淋巴结微环境,促进肺鳞癌转移 | 首次阐明实体瘤产生的固体机械应力通过成纤维细胞中的STAT3/YAP信号通路驱动淋巴结预转移龛形成 | 未提及具体局限 | 探索肿瘤内在生物力学线索如何影响淋巴结免疫环境,为肺鳞癌早期淋巴转移提供干预靶点 | 肺鳞状细胞癌(LUSC)及肿瘤引流淋巴结(TDLNs)中的成纤维细胞和髓系细胞 | 机器学, 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 染色质可及性分析, ChIP实验 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据, 染色质可及性数据 | 小鼠模型及人类肺鳞癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 510 | 2026-07-31 |
A latent factor framework to organize regulatory and metabolic programs inferred from scRNA-seq
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag185
PMID:42524695
|
研究论文 | 提出一个潜在因子框架,用于组织从单细胞RNA测序中推断出的调控和代谢程序 | 首次联合建模基因表达、转录因子调控活性、代谢物水平特征和预测代谢通量四种转录组功能投影,通过潜在因子组织策略实现协调变异轴的功能解释 | 未说明该框架在不同组织或疾病类型中的泛化能力,且依赖单细胞RNA测序数据的推断准确性 | 开发一种潜在因子组织策略,从单细胞RNA测序数据中整合并解析调控和代谢功能程序 | 乳腺癌细胞系数据集中的细胞状态 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 潜在因子模型 | 单细胞RNA测序数据 | 乳腺癌细胞系数据集(具体样本量未明确) | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 511 | 2026-07-31 |
GLA is associated with ESCC progression and chemotherapy response via DNA damage repair-related pathways
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1900889
PMID:42528606
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研究论文 | 揭示GLA通过DNA损伤修复相关通路促进食管鳞癌进展并影响化疗应答 | 首次在食管鳞癌中鉴定GLA的上调表达及其通过DNA损伤修复通路影响化疗敏感性的机制,发现Migalastat联合化疗具有协同增敏作用 | 机制研究和体内验证尚待进一步开展 | 探究GLA在食管鳞癌进展和化疗应答中的作用及分子机制 | 食管鳞状细胞癌 | 机器学习 | 食管癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫组化, qRT-PCR, Western blot, siRNA敲低 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 两个独立ESCC数据集(GSE161533, GSE38129)及一个独立验证集(GSE20347),整合单细胞RNA-seq图谱,两个ESCC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 512 | 2026-07-31 |
Bioinformatics-driven single-cell sequencing analysis of angiogenesis-related genes in rheumatoid arthritis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1789899
PMID:42528732
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研究论文 | 基于生物信息学驱动单细胞测序分析类风湿性关节炎中血管生成相关基因 | 通过单细胞测序和生物信息学分析,首次系统鉴定类风湿性关节炎中HIF1、VEGFA、E2F7、E2F8和IL10等关键血管生成基因,并揭示其与疾病活动度的相关性 | 样本量有限,且仅基于公共数据库和少数临床样本验证 | 探索类风湿性关节炎中血管生成相关基因和免疫细胞谱,评估其临床相关性 | 类风湿性关节炎患者滑膜组织和外周血单核细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞测序、定量实时PCR | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 来自公共数据库和临床样本的类风湿性关节炎患者与健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 513 | 2026-07-31 |
Analysis of senescence in pituitary tumors from different lineages and the potential role of senolytic drugs as targeted therapies
2026, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2026.1836525
PMID:42528724
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研究论文 | 通过空间转录组学和单核RNA测序分析不同谱系垂体瘤的衰老特征,并探索抗衰老药物靶向治疗的潜力 | 首次结合空间转录组学和单核RNA测序技术全面解析垂体瘤的衰老、增殖和干性景观,并验证达沙替尼对垂体瘤原代细胞的抗衰老效应 | 样本量有限且仅包含药物治疗抵抗的垂体瘤亚型,未涵盖所有垂体瘤谱系 | 探究不同谱系垂体瘤中细胞衰老、上皮-间质转化和干性特征,以及抗衰老药物的潜在治疗价值 | 多巴胺激动剂抵抗的泌乳素分泌型垂体瘤、生长激素分泌型和非功能性促性腺分化型垂体瘤 | 数字病理学 | 垂体瘤 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单核转录组数据 | 多巴胺激动剂抵抗的泌乳素分泌型垂体瘤、生长激素分泌型和非功能性促性腺分化型垂体瘤样本 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 514 | 2026-07-31 |
Metabolic-immunoregulatory subtypes reveal prognostic and therapeutic insights in multiple primary lung cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1827965
PMID:42528797
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多原发肺癌的代谢免疫调控亚型,揭示其预后和治疗意义 | 首次系统描绘多原发肺癌中代谢重编程和免疫调控特征,鉴定出代谢异常的恶性上皮亚群,并构建基于代谢的八基因预后模型 | 样本量有限(4例多原发肺癌患者),功能验证主要依赖体外实验,缺乏体内模型验证 | 探索多原发肺癌的肿瘤内在代谢特征和免疫调控相互作用,建立代谢相关的预后分层和治疗策略 | 多原发肺癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | Lasso-Cox回归 | 基因表达数据 | 11个单原发肺癌肿瘤和4例多原发肺癌患者的8个样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 515 | 2026-07-31 |
Gut microbiota induces immune-related alterations in gene expression, RNA methylation, and metabolism in glioblastoma revealed by single-cell and spatial multi-omics
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1899954
PMID:42528818
|
研究论文 | 利用单细胞和空间多组学揭示肠道微生物通过免疫相关改变影响胶质母细胞瘤的基因表达、RNA甲基化和代谢 | 首次综合运用单细胞转录组、空间转录组、宏基因组、代谢组和m6A-seq等多种组学手段,系统探究抗生素扰动肠道微生物对胶质瘤进程的影响机制 | 主要基于小鼠模型,人类样本验证不足;具体机制如肠道微生物如何精确调控EPHA信号通路仍需进一步阐明 | 阐明肠道微生物通过肠-脑轴影响胶质母细胞瘤进程的分子机制 | 抗生素处理的小鼠胶质母细胞瘤模型 | 机器学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序, 宏基因组测序, 代谢组学, m6A-seq | NA | 转录组数据, 空间转录组数据, 宏基因组数据, 代谢组数据, 表观转录组数据 | 小鼠胶质瘤样本(实验组和对照组各若干只,具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 宏基因组学, 代谢组学, m6A-seq | NA | NA |
| 516 | 2026-07-31 |
Spatiotemporal orchestration of the salivary gland immune microenvironment in Sjögren's disease: a multidimensional framework of epithelial licensing, lymphoid neogenesis, and stromal remodeling
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1863280
PMID:42528857
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综述 | 提出一种以组织为中心的诠释框架,用于解释干燥综合征中唾液腺免疫微环境的时空演变 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学和纵向组织学研究证据,提出包含上皮激活、淋巴新生和基质重塑三个重叠维度的组织中心框架,挑战传统将干燥综合征视为均一炎症性疾病的观点 | 该框架仅作为诠释性构建,尚未经过验证的临床分期分类,相关生物标志物的应用仍需前瞻性验证 | 弥合干燥综合征生物学靶点参与和临床获益之间的差距,提出基于组织状态和疾病分期的精准医学策略 | 干燥综合征患者唾液腺免疫微环境 | 数字病理学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 组织数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 517 | 2026-07-31 |
Single-cell transcriptomic profiling of bronchial lymph nodes reveals mechanisms of PRRSV escape from host adaptive immunity
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1869357
PMID:42529228
|
研究论文 | 通过支气管淋巴结单细胞转录组分析揭示PRRSV逃逸宿主适应性免疫的机制 | 首次发现PRRSV感染相关的RAG1+ CD4+CD8+双阳性T细胞亚群,并揭示该病毒通过破坏Tfh细胞与生发中心B细胞间的相互作用等途径抑制抗体产生 | 本研究仅使用猪模型,结果是否适用于其他物种需进一步验证;且主要关注支气管淋巴结,其他组织中的免疫逃逸机制未探讨 | 解析高致病性PRRSV感染如何通过调控支气管淋巴结免疫细胞组成和互作来逃逸宿主适应性免疫 | 感染高致病性PRRSV(HV株)及其减毒衍生株(N29株)的仔猪支气管淋巴结细胞 | 数字病理学 | 猪繁殖与呼吸综合征(PRRS) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量(来自感染HP-PRRSV HV株或N29株的仔猪支气管淋巴结) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 518 | 2026-07-31 |
Single-cell profiling uncovers extracellular vesicle-associated malignant plasma cell subpopulations driving multiple myeloma progression
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1848792
PMID:42529293
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤患者的骨髓样本,揭示了与细胞外囊泡相关的恶性浆细胞亚群及其在疾病进展中的作用 | 首次在单细胞水平上鉴定出ASS1+浆细胞亚群具有高细胞外囊泡特征和干性,并与复发/难治性MM密切相关,揭示了其通过转录因子调控网络、代谢重编程及与骨髓微环境串扰驱动疾病进展的新机制 | 样本量较小(12例患者),且未提及功能验证实验存在离体模型限制,需进一步在更大队列和体内模型中验证 | 解析多发性骨髓瘤的异质性、进展机制及恶性浆细胞亚群的特征 | 12例多发性骨髓瘤患者(包括SMM、NDMM和RRMM亚型)的骨髓样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | CytoTRACE, Monocle, Slingshot, CellChat, SCENIC | 单细胞基因表达数据 | 12例多发性骨髓瘤患者的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 519 | 2026-07-28 |
[Recent Advances in the Interorgan Regulatory Roles of Adipose Tissue]
2026-Jan-20, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
DOI:10.12182/20260160201
PMID:41834951
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综述 | 综述了脂肪组织作为关键信号中枢与肝、肠、脑、骨等器官的间质调节作用及其与肿瘤进展的关联 | 系统回顾了以脂肪组织为中心的调节网络,突破了单一器官研究的局限性,并重点介绍了单细胞测序和人工智能等前沿技术在脂肪组织研究中的应用 | 未提及具体研究限制,可能受限于现有文献的覆盖范围和技术的应用成熟度 | 探讨脂肪组织在器官间通讯中的调控作用及其在疾病治疗和健康管理中的潜力 | 脂肪组织及其与肝、肠、脑、骨的互动关系,以及与肿瘤进展的相关性 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 520 | 2026-07-28 |
Workshop Introduction: Advances of AI Methods in Single Cell Spatial Omics
2026, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
DOI:10.1142/9789819824755_0061
PMID:41758189
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workshop介绍 | 介绍AI方法在单细胞空间组学中的最新进展 | 聚焦人工智能和机器学习在空间转录组学、蛋白质组学和代谢组学中的应用,涵盖数据整合、细胞间相互作用建模及疾病和精准医学的转化应用 | NA | 展示AI在单细胞空间组学中的新方法和应用 | 空间组学数据、细胞间相互作用、疾病和精准医学 | 机器学习 | NA | 空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |