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当前共找到 1426 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2026-02-15 |
The transcription factor HHEX maintains glucocorticoid levels and protects adrenals from androgen-induced lipid depletion
2026-Jan-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68257-4
PMID:41519914
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析了肾上腺皮质类固醇生成谱系的转录组，并揭示了转录因子HHEX在维持糖皮质激素水平和保护肾上腺免受雄激素诱导的脂质耗竭中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定HHEX为糖皮质激素生成细胞中最富集的转录因子，并阐明其作为雄激素受体靶基因，在肾上腺性别二态性和脂质稳态中的多功能调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类肾上腺中的HHEX功能尚未验证；雄激素诱导脂噬的具体分子通路仍需进一步探索 | 探究维持肾上腺皮质糖皮质激素生成细胞异质性和应激响应能力的分子机制 | Sf1-Cre; Rosa报告基因小鼠的肾上腺皮质类固醇生成谱系细胞 | 单细胞组学 | 肾上腺功能障碍 | 单细胞RNA测序 | 遗传小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，使用遗传工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 502 | 2026-02-15 |
Genital herpes shedding episodes associate with altered spatial organization and activation of mucosal immune cells
2026-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197491
PMID:41252205
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研究论文 | 本研究探讨了HSV-2感染期间病毒脱落对宫颈阴道黏膜免疫细胞空间组织和活化的影响 | 首次结合空间转录组学、流式细胞术和免疫荧光成像，系统揭示了活动性HSV-2脱落期间阴道黏膜免疫细胞的空间重编程和激活状态变化 | 研究为横断面设计，无法确定观察到的免疫变化与病毒脱落之间的因果关系；样本量虽大但可能未涵盖所有临床亚群 | 探究HSV-2感染对宫颈阴道黏膜免疫的影响机制 | HSV-2血清阳性和阴性参与者的宫颈阴道组织和血液样本 | 空间转录组学 | 生殖器疱疹 | 流式细胞术、免疫荧光成像、可溶性免疫因子分析、空间转录组学 | NA | 组织样本、血液样本、空间转录组数据、成像数据 | 232名参与者（包括HSV-2血清阳性和阴性个体） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 503 | 2026-02-15 |
Fecal microbiota transplantation promotes type 2 mucosal immune responses with colonic epithelium proliferation in patients with recurrent Clostridioides difficile
2026-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195678
PMID:41252206
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研究论文 | 本研究通过分析复发性艰难梭菌感染患者在接受粪菌移植治疗前后的样本，揭示了FMT通过促进结肠上皮细胞增殖和2型免疫反应来发挥治疗作用的机制 | 首次结合空间转录组学和单细胞基因集分析，明确了FMT诱导的基因表达变化定位于结肠上皮，并揭示了IL-33和双调蛋白在介导增殖通路激活中的潜在作用 | 样本量较小（n=16），随访时间较短（2个月），且缺乏长期疗效和机制验证数据 | 探究粪菌移植治疗复发性艰难梭菌感染的分子和免疫学机制 | 复发性艰难梭菌感染患者（n=16）和健康对照的结肠活检组织、血浆、外周血单个核细胞及粪便样本 | 微生物组学与免疫学 | 感染性疾病（艰难梭菌感染） | 高通量测序、流式细胞术免疫分型、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、微生物组数据、免疫表型数据 | 16名rCDI患者及健康对照 | NA | 空间转录组学, 单细胞基因集分析 | NA | NA |
| 504 | 2026-02-15 |
Spatial transcriptomics reveals immune-stromal crosstalk within the synovium of patients with juvenile idiopathic arthritis
2026-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198074
PMID:41269758
|
研究论文 | 本研究利用亚细胞分辨率空间转录组学技术，解析了活动性幼年特发性关节炎患者滑膜组织中免疫细胞与基质细胞的空间组织与相互作用 | 开发了新的空间共定位分析流程，首次在JIA滑膜中揭示了NOTCH信号介导的内皮细胞-成纤维细胞相互作用、CXCL9/CXCR3信号轴调控的巨噬细胞-CD8+ T细胞互作，并鉴定了JIA特有的细胞状态 | 研究样本仅来自活动期患者，缺乏疾病不同阶段或治疗后的纵向比较数据 | 解析幼年特发性关节炎滑膜组织的空间分子结构及细胞间相互作用网络 | 活动性幼年特发性关节炎患者的滑膜组织样本 | 空间转录组学 | 幼年特发性关节炎 | 空间转录组测序 | 空间共定位分析流程 | 空间转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | 亚细胞分辨率空间转录组分析 |
| 505 | 2026-02-15 |
Cellular immune endophenotypes separating early and late-onset myasthenia gravis
2026-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.199679
PMID:41307955
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研究论文 | 本研究通过多模态技术（包括深度光谱流式细胞术和单细胞测序）区分了早发型和晚发型重症肌无力的细胞免疫表型，识别了三种主要淋巴细胞群体的差异 | 首次应用深度光谱流式细胞术和单细胞测序技术，揭示了早发型和晚发型重症肌无力在黏膜相关恒定T细胞、初始CD8+ T细胞和经典NK细胞频率上的显著差异，并实现了90%准确率的亚型预测 | 研究基于两个独立队列，但样本量可能有限，且未详细探讨免疫衰老机制与疾病进展的因果关系 | 区分早发型和晚发型重症肌无力的细胞免疫表型，以改进临床分类 | 重症肌无力患者的淋巴细胞群体 | 数字病理学 | 重症肌无力 | 深度光谱流式细胞术, 单细胞测序 | NA | 细胞表型数据, 测序数据 | 两个独立队列的患者样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 506 | 2026-02-15 |
An integrated single-cell and spatial transcriptomic atlas of thyroid cancer progression identifies prognostic fibroblast subpopulations
2026-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191990
PMID:41480746
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据，构建了甲状腺癌进展的图谱，并识别了与预后相关的成纤维细胞亚群 | 首次在混合WDTC/ATC组织病理学样本中，结合单细胞和空间转录组学技术，系统性地描绘了甲状腺癌的进化过程，并鉴定出POSTN+肌成纤维细胞癌症相关成纤维细胞（myCAFs）这一与侵袭性肿瘤细胞密切相关的预后亚型 | 样本量相对有限（81个单细胞样本和28个空间转录组肿瘤），且主要基于转录组数据，可能未涵盖其他分子层面的变化 | 理解甲状腺癌在儿童和成人中的进化机制，并识别与疾病进展和预后相关的关键细胞亚群 | 甲状腺癌样本，包括分化良好的甲状腺癌（WDTC）、间变性甲状腺癌（ATC）、罕见的混合WDTC/ATC肿瘤以及儿童弥漫性硬化性甲状腺癌 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，bulk RNA测序 | NA | 转录组数据，空间数据 | 423,733个细胞来自81个样本，28个肿瘤进行空间转录组分析，5个大型bulk RNA测序队列 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 507 | 2026-02-15 |
Altered MDC1 Interactions and Dysfunctional DNA Repair in Lobular Breast Cancer Confers Sensitivity to PARP Inhibition
2026-Jan-09, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1217
PMID:41512199
|
研究论文 | 本文研究了浸润性小叶乳腺癌中MDC1与ER的相互作用如何导致DNA修复功能失调，并揭示了PARP抑制剂在该癌症中的治疗潜力 | 发现ILC中MDC1与ER的特异性共调控导致了一种独特的“BRCA样”但非经典“BRCAness”的同源重组功能失调状态，并首次证明PARP抑制剂talazoparib在ILC模型中具有持久生长抑制效果 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型，缺乏大规模临床样本验证；未详细探讨MDC1-ER相互作用的分子机制细节 | 探究浸润性小叶乳腺癌中MDC1如何调控ER活性及DNA修复功能，并评估PARP抑制剂的治疗潜力 | 浸润性小叶乳腺癌细胞、ILC异种移植模型 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析、DNA修复活性分析、蛋白质相互作用组分析 | NA | 转录组数据、蛋白质相互作用数据、功能实验数据 | 多个ILC细胞系及异种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 508 | 2026-02-15 |
VISTA uncovers missing gene expression and spatial-induced information for spatial transcriptomic data analysis
2026-Jan-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09479-6
PMID:41507434
|
研究论文 | 本文提出了一种名为VISTA的模型，通过整合单细胞RNA测序和亚细胞空间转录组学数据，预测空间转录组数据中未测量的基因表达 | VISTA结合了变分推断、几何深度学习和不确定性量化，首次实现了在空间转录组数据中准确预测未测量基因表达，并支持多种下游分析 | 未明确提及模型在处理高度异质性组织或大规模数据集时的具体限制 | 克服空间转录组技术基因覆盖有限的缺陷，提升空间转录组数据的解释性和应用价值 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 变分推断, 几何深度学习 | 基因表达数据, 空间数据 | 四个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 509 | 2026-02-15 |
Resolving Single-Cell Gene Expression by Pseudotemporal Integration of Transcriptomic and Proteomic Datasets
2026-Jan, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2025.101475
PMID:41317903
|
研究论文 | 本研究提出了一种利用伪时间细胞排序整合单细胞RNA-Seq和单细胞蛋白质组学数据的新方法，以分析缺氧条件下的转录-翻译表达动态 | 通过伪时间轨迹整合单细胞转录组和蛋白质组数据，揭示转录和翻译响应的时间差异，如即时转录组响应和延迟蛋白质组表达 | NA | 整合单细胞转录组和蛋白质组数据，构建全面的转录-翻译图谱，以理解缺氧应激下的细胞表型 | 单细胞样本（在缺氧条件下采集的纵向样本） | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-Seq, 单细胞蛋白质组学（质谱分析） | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 510 | 2026-02-15 |
TMEM106C, BSG, COPE, CDCA8, KPNA2, LIG1, UQCRH, and CCT5: Predictive of Survival and Immunotherapy Resistance in Hepatocellular Carcinoma
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/1465989
PMID:41674779
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和转录组分析，构建了一个基于衰老相关基因的预后模型，用于预测肝细胞癌患者的生存和免疫治疗反应 | 整合单细胞RNA测序和转录组数据，识别并验证了一个由八个基因（TMEM106C, BSG, COPE, CDCA8, KPNA2, LIG1, UQCRH, CCT5）组成的衰老相关基因特征，该特征可作为预测HCC预后和免疫治疗耐药性的稳健工具 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，实验验证主要在细胞系中进行，缺乏体内模型或大规模前瞻性临床队列的验证 | 识别肝细胞癌中与衰老相关的基因特征，构建预后模型以预测患者生存和免疫治疗反应 | 肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的细胞，特别是自然杀伤细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，qRT-PCR，CCK-8，伤口愈合实验，Transwell实验 | LASSO Cox回归风险模型 | 单细胞RNA测序数据，批量转录组数据 | 来自GEO和TCGA数据库的样本，共识别了80,997个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 511 | 2026-02-15 |
Gut Microbiota-Derived Metabolites Regulate CASP3 and Neuroimmune Pathways in Multiple Sclerosis: An Integrative Multiomics Study
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/3572399
PMID:41674923
|
研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、机器学习和单细胞转录组分析，揭示了肠道菌群代谢物通过调节CASP3及神经免疫通路在多发性硬化症中的作用 | 首次将网络药理学、机器学习（SHAP方法）和单细胞转录组分析结合，识别出CASP3作为肠道菌群代谢物的核心靶点，并通过孟德尔随机化验证因果关系 | 研究结果需要进一步的实验验证来确认机制和转化潜力 | 探究肠道菌群代谢物在多发性硬化症发病机制中的作用，识别潜在治疗靶点 | 多发性硬化症相关的差异表达基因、肠道菌群代谢物及其靶点 | 机器学习 | 多发性硬化症 | 网络药理学、机器学习、单细胞转录组分析、孟德尔随机化、分子对接 | 机器学习模型（未指定具体类型，但使用了SHAP方法） | 转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA |
| 512 | 2026-02-15 |
Causal Association Between Plasma Proteins and Pericarditis: A Mendelian Randomization Study With Therapeutic Target Identification
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/4659271
PMID:41674924
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析探讨了血浆蛋白与心包炎之间的因果关系，并识别了潜在的治疗靶点 | 首次利用大规模血浆蛋白组GWAS数据，结合孟德尔随机化方法系统评估了血浆蛋白与心包炎的因果关联，并整合了单细胞RNA测序分析和分子对接技术来识别潜在治疗靶点和化合物 | 研究人群仅限于欧洲血统个体，可能限制了结果在其他人群中的普适性；孟德尔随机化分析依赖于遗传变异作为工具变量，可能存在残留混杂或水平多效性 | 评估血浆蛋白与心包炎之间的因果关系，并探索潜在的治疗靶点 | 35,559名欧洲血统个体的遗传和血浆蛋白数据，以及心包炎的遗传关联数据 | 生物信息学与遗传流行病学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究（GWAS）、孟德尔随机化（MR）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、分子对接 | 逆方差加权中位数法、方差加权法、MR-Egger回归 | 遗传变异数据、血浆蛋白定量数据、单细胞基因表达数据 | 35,559名欧洲血统个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 513 | 2026-02-15 |
Development and validation of an interpretable machine learning model identify the lactylation-related protein SUSD3 as a prognostic and therapeutic biomarker for breast cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1701978
PMID:41676158
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研究论文 | 本研究开发并验证了一个可解释的机器学习模型，用于识别乳酸化相关蛋白SUSD3作为乳腺癌的预后和治疗生物标志物 | 首次结合多种机器学习算法构建了与免疫细胞浸润、趋化因子表达和肿瘤突变负荷相关的乳酸化相关特征，并实验验证了枢纽基因SUSD3的作用 | NA | 探究乳酸化在乳腺癌发生发展中的作用，并开发用于预测恶性进展和免疫逃逸的风险模型 | 乳腺癌 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组学、空间转录组学 | 多种机器学习算法组合 | 基因组数据、转录组数据 | 来自公共数据库（TISCH、TCGA、GEO）的大量数据集 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 514 | 2026-02-15 |
Integrated single-cell analysis with experimental validation reveals ANXA2 as a therapeutic target for ferroptosis in inflammatory bowel disease
2026, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/IQQX1658
PMID:41676267
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析与实验验证，揭示了ANXA2作为炎症性肠病中铁死亡的关键治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序与实验验证，识别出ANXA2作为IBD中铁死亡的核心靶点，并验证其在体外和体内模型中的调控作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类样本验证有限，且铁死亡机制在IBD中的具体通路仍需进一步探索 | 识别与炎症性肠病中铁死亡相关的潜在治疗靶点 | 炎症性肠病（IBD）患者和DSS诱导的IBD小鼠模型中的结肠组织细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序，RT-qPCR，Western blotting，流式细胞术，ELISA，免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据，蛋白质表达数据 | 28,974个细胞（来自GSE134809数据集） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 515 | 2026-02-15 |
Utilisation of spatial methodologies for the investigation of the tumour microenvironment
2026, Methods in cell biology
DOI:10.1016/bs.mcb.2025.10.012
PMID:41688158
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综述 | 本章节为研究人员提供了关于空间转录组学技术的实用指南，重点介绍了三种主流平台及其在肿瘤微环境研究中的应用 | 系统比较了Merscope、CosMx和Xenium三种前沿空间转录组学平台的原理与差异，并提供了从样本制备到数据分析的详细实验方案与实用技巧 | 作为技术指南章节，未报告新的实验数据或临床验证结果，主要基于现有技术和作者经验进行总结 | 为研究人员提供实施空间转录组学技术的实用指导，以促进肿瘤微环境表征和精准肿瘤学研究 | 肿瘤微环境中的空间组织特征，特别是巨噬细胞、细胞毒性T淋巴细胞等免疫细胞的分布与相互作用 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学、多重成像 | NA | 空间转录组数据、成像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | Merscope, CosMx, Xenium | 三种主流空间转录组学分析平台 |
| 516 | 2026-02-14 |
Nectin-4 reduces T cell effector function and is a therapeutic target in pancreatic cancer
2026-Jan-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.194290
PMID:41364531
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研究论文 | 本研究通过分析胰腺导管腺癌（PDAC）中TIGIT轴配体和受体，发现Nectin-4在肿瘤细胞中特异性表达，与不良预后相关，并能抑制T细胞效应功能，而抗体药物偶联物enfortumab vedotin靶向Nectin-4可抑制肿瘤生长 | 首次在PDAC中揭示Nectin-4作为T细胞功能抑制因子和潜在治疗靶点，并通过患者来源的类器官模型验证了靶向Nectin-4的治疗效果 | 研究主要基于体外实验和类器官模型，缺乏体内临床试验验证，且样本来源和规模可能有限 | 探索PDAC中TIGIT轴相关分子在肿瘤免疫微环境中的作用，并寻找新的治疗靶点 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者肿瘤组织、血液样本、患者来源的PDAC类器官 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 多色流式细胞术、免疫组化（IHC）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 图像、文本（基因表达数据） | 来自不同阶段PDAC患者的肿瘤和血液样本、原发性肿瘤和肝转移样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 517 | 2026-02-14 |
EGFR-mutant transformed small cell lung cancer harbors intratumoral heterogeneity targetable with MEK inhibitor combination therapy
2026-Jan-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197008
PMID:41574603
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了EGFR突变型小细胞肺癌的瘤内异质性，并提出了针对MEK抑制剂的联合治疗策略 | 首次在EGFR突变型小细胞肺癌中通过单细胞RNA测序识别出神经内分泌和非神经内分泌细胞亚群，并发现MEK抑制剂对非神经内分泌细胞具有选择性敏感性 | 研究样本来源于恶性胸腔积液，可能无法完全代表原发肿瘤的异质性；体外和体内实验的样本量有限 | 探索EGFR突变型小细胞肺癌的瘤内异质性及其治疗靶点 | EGFR突变型小细胞肺癌患者恶性胸腔积液中的癌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自经历SCLC转化的患者的恶性胸腔积液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 518 | 2026-02-14 |
Small molecule inhibition rescues the skeletal dysplasia phenotype of Trpv4 mutant mice
2026-Jan-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182439
PMID:41574606
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研究论文 | 本研究通过构建表达TRPV4 p.R594H突变的敲入小鼠模型，探究TRPV4骨骼发育不良的机制，并测试TRPV4特异性抑制剂GSK2798745的治疗效果 | 首次在TRPV4骨骼发育不良小鼠模型中，通过体内实验证明TRPV4特异性抑制剂能显著改善骨骼表型并挽救生长板组织学异常，为靶向治疗提供了临床前证据 | 研究基于小鼠模型，其治疗结果向人类转化的有效性尚需进一步验证，且长期安全性和剂量优化未在本文中探讨 | 探究TRPV4骨骼发育不良的疾病机制，并验证TRPV4通道抑制作为治疗策略的可行性 | 表达p.R594H Trpv4突变的敲入小鼠模型及其软骨细胞 | 数字病理学 | 骨骼发育不良 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | 敲入小鼠模型 | 转录组数据 | 未在摘要中明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 519 | 2026-02-14 |
Transcriptomic characters of cochlear vascular cells with pericyte-driven angiogenetic activity
2026-Jan-23, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8535400/v1
PMID:41646339
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了成年小鼠耳蜗的内皮细胞和周细胞，揭示了耳蜗血管的分子特征和周细胞在血管生成中的关键作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术全面解析耳蜗血管细胞的转录组特征，并发现周细胞具有向尖端细胞转化的能力，这为耳蜗血管再生提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证，且体外实验模型可能无法完全模拟体内复杂环境 | 探究耳蜗血管细胞的遗传和分子特性，以理解其在听觉功能维持和血管再生中的作用 | 成年小鼠耳蜗的内皮细胞和周细胞 | 单细胞转录组学 | 听力障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 成年小鼠耳蜗细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 520 | 2026-02-14 |
SAGE-FM: A lightweight and interpretable spatial transcriptomics foundation model
2026-Jan-21, ArXiv
PMID:41647237
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研究论文 | 本文提出了一种轻量级且可解释的空间转录组学基础模型SAGE-FM，该模型基于图卷积网络，通过掩码中心点预测目标进行训练 | 开发了首个基于图卷积网络的轻量级空间转录组学基础模型，能够学习空间一致的嵌入表示，并在下游任务中表现出良好的泛化能力 | 模型仅在人类Visium样本上进行训练，尚未在其他平台或物种数据上验证其通用性 | 构建一个参数高效、可解释且具有空间感知能力的空间转录组学基础模型 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | 口咽鳞状细胞癌、胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | 图卷积网络（GCN） | 空间基因表达数据 | 416个人类Visium样本，涵盖15个器官 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间基因表达平台 |