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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
481 2026-08-08
Shared glycosylation-related molecular mechanism and immune infiltration patterns of fetal growth restriction and preeclampsia
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究揭示了胎儿生长受限和子痫前期共享的糖基化相关分子机制及免疫浸润模式,并构建了诊断模型 首次系统分析FGR和PE中糖基化相关基因的表达模式,并结合多种机器学习算法构建诊断模型,单细胞测序验证关键基因在不同滋养层亚群的表达,及细胞间通讯网络分析 未在更大规模或不同人群中验证诊断模型,蛋白水平验证仅针对两个基因,机制验证略显不足 探讨FGR和PE中糖基化相关基因的表达模式及其在母胎界面免疫失衡中的作用,并构建诊断模型 胎盘和蜕膜组织样本,包括对照、PE、FGR和PE+FGR患者,以及单细胞RNA测序数据中的滋养层细胞亚群 生物信息学,机器学习 胎儿生长受限,子痫前期 基因表达谱分析,WGCNA,机器学习(LASSO、随机森林、支持向量机),CIBERSORT,单细胞RNA测序 LASSO,随机森林,支持向量机 基因表达数据,单细胞转录组数据,临床样本表达验证数据 104个样本,包括对照(n=26),PE(n=28),FGR(n=23),PE+FGR(n=27),另有独立临床样本用于验证 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序(微阵列) NA NA
482 2026-08-08
DUSP5 contributes to platinum resistance in ovarian cancer: single-cell discovery and functional validation
2026, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验,发现DUSP5在卵巢癌铂类药物耐药中发挥关键作用,并验证其作为潜在生物标志物和治疗靶点的价值 首次在单细胞水平整合治疗前后卵巢癌数据,揭示化疗相关的上皮细胞状态,并创新性地将DUSP5与应激适应程序及肿瘤微环境特征联系起来,通过功能实验验证其促进铂耐药的机制 尚未在临床样本中验证DUSP5作为生物标志物的可靠性,且DUSP5相关的下游信号通路和临床转化机制仍需进一步探究 阐明卵巢癌铂类药物敏感性和耐药性的细胞药理学机制,并鉴定DUSP5作为潜在的治疗靶点和生物标志物 卵巢癌肿瘤组织(包括治疗前和新辅助化疗后)以及OVCAR8和SKOV3卵巢癌细胞系 数字病理学,单细胞生物学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据,功能实验数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'试剂盒
483 2026-08-08
Multiomics Integration Reveals Coexpression Regulatory Networks in Osteoporosis and Osteosarcoma
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 本研究整合多组学数据,比较骨质疏松症和骨肉瘤的转录组景观,识别共表达调控网络并构建诊断分类器 首次系统比较骨质疏松症和骨肉瘤的转录组,结合批量转录组、共表达网络、免疫去卷积、单细胞RNA测序及诊断分类器构建的多组学整合方法,并通过体外实验验证关键枢纽基因 模块与性状相关性弱、部分交叉验证折中分类器性能低于随机基线、使用循环血单核细胞研究骨特异性基因表达需谨慎解读 比较骨质疏松症和骨肉瘤的转录组景观,识别与骨密度相关的共表达模块和关键基因,并建立可复用的生物标志物发现分析框架 骨质疏松症和骨肉瘤患者样本(循环血单核细胞、骨肉瘤肿瘤样本)及小鼠MC3T3-E1成骨前体细胞和RAW264.7破骨前体细胞 多组学整合,转录组学 骨质疏松症,骨肉瘤 批量转录组测序,单细胞RNA测序,qRT-PCR,DNA甲基化分析,拷贝数分析 逻辑回归分类器 转录组数据,单细胞转录组数据,DNA甲基化数据,拷贝数数据 80例循环血单核细胞样本(40低骨密度/40高骨密度),88例骨肉瘤肿瘤样本,86例DNA甲基化样本,81例拷贝数样本,3658个单细胞(骨肉瘤标本) NA 批量RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
484 2026-08-08
FAP as a Clinical Biomarker: FAP+ CAFs Orchestrate an Immunosuppressive Stem Cell Niche via the COL1A1/2-CD44 Axis in Colon Cancer
2026, Stem cells international IF:3.8Q2
研究论文 该研究整合多组学数据,揭示FAP+癌症相关成纤维细胞通过COL1A1/2-CD44轴在结肠癌中形成免疫抑制干细胞微环境,并建立预后模型和潜在治疗药物 首次阐明FAP+ CAFs通过COL1A1/2-CD44轴协调免疫逃逸和肿瘤干性的双重功能,并构建14基因预后风险模型及筛选潜在治疗药物 研究主要基于公共数据库和多组学分析,缺乏体内外实验验证,且预后模型的临床应用价值需要进一步前瞻性研究确认 阐明FAP在结肠癌肿瘤微环境中的作用机制,特别是其调控免疫抑制和肿瘤干性的分子机制,并寻找潜在治疗靶点 结肠癌患者的肿瘤组织样本及公共数据库中的结肠癌多组学数据 数字病理学 结肠癌 RNA测序、单细胞RNA测序、免疫组织化学 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据、组织芯片图像 未明确说明,涉及TCGA和GEO数据库中的结肠癌样本及组织芯片样本 NA NA NA NA
485 2026-08-08
Performance of deep learning methods for spatial gene expression prediction from histology images: a comprehensive assessment
2026, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 对深度学习从组织学图像预测空间基因表达的方法进行了全面评估 首次对七种算法在六个数据集、四种癌症类型及一种非癌症疾病上进行系统比较,并分析了与疾病功能相关基因的可预测性 未提及具体局限性 评估现有深度学习方法在从组织学图像预测空间基因表达中的性能与局限性 七种深度学习算法,用于预测空间基因表达 计算机视觉 癌症、非癌症疾病 空间转录组学 深度学习模型 组织学图像、基因表达数据 六个数据集 NA 空间转录组学 NA NA
486 2026-08-08
CMA-associated cellular state remodeling defines prognostic heterogeneity and identifies ARRDC3 as a protective functional gene in small cell lung cancer
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,揭示了小细胞肺癌中伴侣介导自噬相关的细胞异质性,并构建了预后风险评分,验证了ARRDC3的保护性功能 首次在单细胞水平上系统表征小细胞肺癌中伴侣介导自噬的细胞异质性,并基于机器学习构建了新的预后风险评分模型,同时实验验证了ARRDC3作为保护性功能基因的作用 文章未明确提及研究局限性 探究小细胞肺癌中伴侣介导自噬相关的细胞异质性及其预后意义,并建立可靠的分子分层工具以反映肿瘤异质性和生存风险 小细胞肺癌患者样本、细胞系(H446细胞)及相关转录组和临床数据 机器学习、生物信息学 小细胞肺癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、加权基因共表达网络分析、机器学习 机器学习模型(具体类型未明确) 基因表达数据、临床数据、图像数据(如细胞实验图像) 未明确具体样本数量,但涉及多个队列(综合队列、GSE60052队列、cBioPortal队列) 未明确 单细胞RNA测序、批量RNA测序 未明确 未明确
487 2026-08-08
[Ethical and clinical aspects of genetic analysis in neurodegenerative diseases]
2026, Zhurnal nevrologii i psikhiatrii imeni S.S. Korsakova
综述 对传统遗传学方法与单细胞和单核RNA测序等高分辨率技术在神经退行性疾病中的应用进行综合分析,探讨LRRK2和GBA1基因不完全外显率的机制及其对特定细胞类型的影响 整合全基因组关联研究与单细胞表达图谱,揭示LRRK2和GBA1突变在胶质细胞中的细胞特异性作用,并系统分析不完全外显率的异质性 未提供原始实验数据,基于文献综述,可能受限于已有研究的覆盖范围 比较传统遗传学方法与单细胞测序技术的局限性,阐明神经退行性疾病中关键风险基因的细胞特异性机制及其不完全外显率的临床意义 LRRK2和GBA1基因突变相关的神经退行性疾病,涉及小胶质细胞、星形胶质细胞、少突胶质细胞和特定脆弱神经元 自然语言处理 神经退行性疾病 单细胞RNA测序、单核RNA测序、全基因组关联研究 NA 转录组数据、基因组数据、临床数据 NA NA 单细胞RNA测序、单核RNA测序 NA NA
488 2026-08-06
Generation of Porcine Blastoids from Embryonic Stem Cells
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 该论文描述了一种从胚胎干细胞生成猪胚泡样结构(blastoids)的三维两步分化方案,并验证其形态、细胞谱系组成和单细胞转录组特征与猪囊胚相似。 首次开发了从猪胚胎干细胞生成胚泡样结构的三维两步分化策略,该胚泡样结构能在体外存活并扩展超过两周。 未提及具体局限性,但可能包括体外培养条件与体内环境的差异以及长期发育能力的验证不足。 开发一种从猪胚胎干细胞生成胚泡样结构的方法,以用于研究胚胎发生和早期发育事件,并可能为大型动物育种提供工具。 猪胚胎干细胞及其生成的胚泡样结构(blastoids),并与猪囊胚进行比较。 干细胞生物学 NA 单细胞转录组测序,三维细胞培养 NA 单细胞转录组数据,图像(形态学) 未明确说明样本数量,但涉及猪胚胎干细胞系及生成的胚泡样结构。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
489 2026-08-03
Leveraging expression quantitative trait loci information in single-cell resolution to identify cell-specific genes for gestational diabetes
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究整合GWAS与单细胞eQTL数据,通过scTWAS分析识别妊娠期糖尿病相关的细胞特异性基因 利用单细胞分辨率下的表达数量性状位点信息,首次在免疫细胞类型层面识别妊娠期糖尿病的关联基因,克服了bulk组织分析的局限性 未提及明显的局限性,但可能受限于单细胞eQTL数据的细胞类型覆盖和样本来源 识别妊娠期糖尿病相关的细胞特异性基因,揭示其遗传 architecture 在免疫细胞中的表现 12种免疫细胞类型中的基因表达与妊娠期糖尿病的关联 机器学习 妊娠期糖尿病 scTWAS、GWAS、eQTL分析、基因本体富集分析 OTTERS框架、ACAT-O检验 基因型数据、单细胞表达数据、GWAS汇总统计 GDM病例12,332例,对照131,109例,来自OneK1K队列的12种免疫细胞类型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
490 2026-08-03
Integrative multi-omics and machine learning identify CHRNA1 putative circadian-immune hub in COPD
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合公共转录组数据和多组学分析,结合机器学习方法,鉴定了慢性阻塞性肺疾病(COPD)中与昼夜节律相关的生物标志物CHRNA1,并探讨了其诊断价值、免疫相关性及治疗潜力 首次通过整合多组学数据和机器学习算法,识别出CHRNA1作为COPD中假定的昼夜节律-免疫枢纽基因,并利用单细胞RNA测序定位其在肺B细胞中的表达,预测了潜在治疗药物和调控网络 研究依赖于公共数据库的转录组数据,缺乏独立的大规模前瞻性验证;风险分层模型为探索性,需进一步临床验证;昼夜节律与COPD的因果关系未直接证明 识别COPD中与昼夜节律相关的生物标志物,探索其诊断价值、免疫相关性及治疗潜力 来自公共GEO数据库的四个人肺转录组数据集(GSE151052、GSE38974、GSE76925和GSE47460)以及COPD患者和健康对照的外周血样本 机器学习和多组学 慢性阻塞性肺疾病 转录组测序、单细胞RNA测序、qRT-PCR 多元逻辑回归、机器学习算法(具体未指定) 基因表达数据、单细胞转录组数据、临床样本数据 四个公共数据集(发现集和验证集)以及少量外周血样本(具体数量未提及) NA NA NA NA
491 2026-08-03
Integrated Multi-Omics Analysis Identifies PDK4 and ACOT1 as Metabolic Hub Genes Associated With Myocardial Fibrosis in Diabetic Cardiomyopathy
2026, Journal of diabetes research IF:3.6Q2
研究论文 通过整合多组学分析,识别PDK4和ACOT1作为糖尿病心肌病心肌纤维化的代谢枢纽基因 首次将体内外实验与生物信息学结合,发现PDK4和ACOT1在心肌成纤维细胞中的上调,并提出“代谢-纤维化轴”概念 仅通过分子对接预测PDK4和ACOT1的相互作用,缺乏实验验证 阐明糖尿病心肌病中代谢失调与心肌纤维化之间的分子网络,寻找潜在治疗靶点 高脂饮食诱导的糖尿病心肌纤维化小鼠模型、两个独立DCM数据集、人原代心肌成纤维细胞 生物信息学 糖尿病心肌病 转录组测序,单细胞RNA测序,分子对接 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 小鼠模型(数量未明确),两个独立DCM数据集,人原代心肌成纤维细胞 NA 单细胞RNA测序,转录组测序 NA NA
492 2026-08-03
Spatial transcriptomic analysis of kidney biopsies identifies activation of complement and SPP1 networks in Staphylococcus infection-associated glomerulonephritis
2026, Frontiers in nephrology
研究论文 利用单细胞空间转录组学分析金黄色葡萄球菌感染相关性肾小球肾炎(SAGN)的肾活检组织,发现补体激活和SPP1信号网络在疾病发病机制中起关键作用 首次将单细胞空间转录组学应用于SAGN肾活检组织,揭示了SPP1和补体信号网络在疾病中的特异性激活及保护性信号抑制 样本量小(仅3例SAGN和1例正常对照),且缺乏动物模型验证 阐明SAGN的分子病理机制,寻找潜在治疗靶点 3例SAGN患者和1例正常对照的肾活检组织 数字病理学 感染相关性肾小球肾炎 单细胞空间转录组学 NA 基因表达数据 3例SAGN肾活检组织,1例正常对照肾组织,共3,993个细胞转录组 NA 单细胞空间转录组学 NA NA
493 2026-08-03
Single-cell-derived ferroptosis signature predicts prognosis and therapy response in esophageal squamous cell carcinoma
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和转录组数据,构建了食管鳞状细胞癌的铁死亡相关预后模型,并验证了其预后和治疗反应预测价值 首次利用单细胞分辨率下的铁死亡基因特征构建食管鳞状细胞癌预后模型,并通过体外实验和临床样本验证,为铁死亡靶向治疗提供基础 未提及 开发食管鳞状细胞癌的铁死亡相关预后模型,并探讨其与免疫浸润、治疗反应及药物敏感性的关联 食管鳞状细胞癌患者及其肿瘤微环境中的细胞亚群,以及ESCC细胞系 机器学习 食管鳞状细胞癌 单细胞RNA测序和批量转录组测序 LASSO-Cox回归 基因表达数据 多个独立队列(TCGA和GEO)及临床组织样本,具体数量未提供 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
494 2026-08-03
Case Report: Schwann cell reprogramming and PDGF-driven nerve hypertrophy in an NF1 patient with CIDP-like autoimmunity
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
病例报告 报道一例NF1缺失患者伴有CIDP样自身免疫,通过单细胞RNA测序揭示施万细胞重编程和PDGF驱动的神经肥大机制 首次在NF1患者中揭示自身免疫触发的施万细胞重编程和PDGF双轴信号网络驱动神经肥大,提出PDGF通路作为难治性肥厚性神经病的潜在治疗靶点 初步评估,样本量有限,需进一步验证 阐明NF1患者周围神经肥大的内膜纤维化机制,重点关注施万细胞与成纤维细胞之间的信号网络 一名NF1缺失且伴有CIDP样自身免疫的患者腓肠神经活检样本 数字病理学 神经纤维瘤病1型(NF1)、慢性炎性脱髓鞘性多发性神经病(CIDP) 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 1例患者腓肠神经活检样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
495 2026-08-03
Divergent cytotoxic and inflammatory functions of intratumoral Vδ2+ γδ T cells in renal cell carcinoma
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过流式细胞术和单细胞转录组分析,全面表征了肾细胞癌患者外周血和肿瘤组织中Vδ2 γδ T细胞的功能异质性,揭示了CD16阳性和阴性亚群分别具有细胞毒性和炎症性效应功能 首次在肾细胞癌中系统解析了肿瘤浸润Vδ2 γδ T细胞的异质性,确定了CD16表达区分细胞毒性与炎症性亚群,并揭示其分化轨迹及空间分布特征 样本量有限,未进行功能验证实验或体内研究,且未探讨Vδ2 γδ T细胞亚群在肾细胞癌预后中的临床意义 探究肾细胞癌中肿瘤浸润Vδ2 γδ T细胞的功能异质性及其抗肿瘤或促肿瘤作用 肾细胞癌患者的外周血和肿瘤组织中的Vδ2 γδ T细胞 单细胞转录组学 肾细胞癌 流式细胞术,单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据,流式细胞术数据 肾细胞癌患者的外周血和肿瘤配对样本(具体数量未在摘要中提供) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台,用于肿瘤浸润Vδ2 γδ T细胞的单细胞转录组分析
496 2026-08-03
Cross-scale modeling reveals a TFRC-driven immunosuppressive macrophage niche in cervical cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过跨尺度建模,在宫颈癌中建立了一个以肿瘤相关巨噬细胞极化为核心的预后模型,并揭示了TFRC驱动的免疫抑制性巨噬细胞生态位及其机制 创新性地将批量转录组与单细胞RNA测序数据结合,通过加权基因共表达网络分析和多算法机器学习框架构建了可解释的预后模型,并首次鉴定TFRC为连接肿瘤内在铁代谢与免疫抑制性巨噬细胞极化的关键节点 体外实验基于细胞系共培养系统,可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境,且临床验证样本量较小(n=39),需要更大规模的前瞻性研究进一步验证 建立以巨噬细胞极化为中心的预后模型,并阐明宫颈癌中肿瘤-免疫相互作用的机制 宫颈癌肿瘤相关巨噬细胞及其极化状态,以及肿瘤内在因子TFRC在免疫抑制微环境中的作用 机器学习, 数字病理学 宫颈癌 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 多重免疫荧光, 实时荧光定量PCR, 蛋白质印迹, 酶联免疫吸附测定, 流式细胞术 加权基因共表达网络分析, 多算法机器学习框架, 预后签名模型 转录组数据, 单细胞表达数据, 蛋白质表达数据, 临床病理数据 TCGA批量转录组数据, GSE208653单细胞数据, GSE52903验证队列, 39例配对临床样本, 40例临床标本 NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
497 2026-08-02
Unraveling Cardiovascular Development and Function: Insights From Single-Cell Omics
2026-Jan-02, Circulation research IF:16.5Q1
综述 本文综述了单细胞组学技术如何在心血管发育和功能研究中揭示细胞异质性,并展望了空间转录组学等新兴技术。 系统总结了单细胞组学在心血管发育生物学中的新见解,重点介绍了先进分析工具、临床前模型以及空间转录组学和克隆条形码等新兴技术。 当前单细胞技术存在性别差异研究不足的问题,且空间转录组学等新技术仍在发展中。 探讨单细胞组学如何重塑对心血管发育和功能的理解,并展望未来研究方向。 心血管系统(心脏和血管)的发育与功能,包括细胞亚群和祖细胞。 单细胞组学 心血管疾病 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
498 2026-08-02
Technology-enabled integration of single-cell transcriptomics and microbiome data identifies RNA-targetable host-microbiota networks in colorectal adenoma
2026-Jan, SLAS technology IF:2.5Q3
研究论文 本研究开发了一个可重复的计算流程,整合单细胞转录组和微生物组数据,以识别结直肠腺瘤中可被RNA靶向的宿主-微生物互作网络 构建了整合MaAsLin2、QIIME2/DADA2和Seurat/Harmony的可重复计算流程,将单细胞转录组与微生物组数据结合,并系统筛选出25个RNA可靶向的候选靶点 未提及具体局限性 整合单细胞转录组和微生物组数据,识别结直肠腺瘤中宿主-微生物互作网络,并系统筛选RNA治疗靶点 结直肠腺瘤相关的宿主细胞和微生物 生物信息学 结直肠腺瘤 单细胞RNA测序、微生物组测序 MaAsLin2、QIIME2/DADA2、Seurat/Harmony 单细胞转录组数据、微生物组数据 三个单细胞数据集共426,425个细胞;三个微生物组数据集共975个样本 NA 单细胞RNA-seq、微生物组测序 NA NA
499 2026-08-02
Machine Learning Modelling, Single-Cell Landscape Profiling and Spatial Transcriptomics Provide New Insights Into SUMOylation in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2026 Jan-Dec, IET systems biology IF:1.9Q3
研究论文 通过整合批量RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组数据,系统研究SUMOylation在头颈部鳞状细胞癌中的作用,并建立识别模型及验证SAE1作为潜在生物标志物 首次全面描绘HNSCC中SUMOylation的单细胞景观和空间转录组特征,并建立基于SUMOylation特征的识别模型,通过体外实验验证SAE1的功能 未提及 探究SUMOylation在HNSCC中的生物学相关性,并建立识别模型和潜在生物标志物 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)患者样本及SAS和SCC-9细胞系 机器学习、数字病理 头颈部鳞状细胞癌 RNA-seq, scRNA-seq, stRNA-seq, 体外功能实验 识别模型(具体类型未指定,可能为机器学习模型) 基因表达数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 692个HNSCC样本和178个非HNSCC样本,以及八个外部验证数据集 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
500 2026-08-01
Regulatory T cells in vitiligo: a review of functional disequilibrium between peripheral blood and lesional tissue
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了白癜风患者外周血与皮损组织中调节性T细胞的功能失衡,探讨其免疫调节机制、治疗潜力及生物标志物。 首次系统性地比较外周血与皮损组织中Treg的调节性失衡,提出解剖层级概念,并探讨新兴Treg亚群作为生物标志物的潜力。 综述基于现有文献,可能缺乏原始数据支持,且部分结论需进一步临床验证。 整合白癜风中Treg生物学和免疫调节功能的证据,重点关注外周血与皮损组织的比较,并评估Treg靶向治疗和生物标志物。 白癜风患者的外周血和皮损组织中的调节性T细胞,及Treg-黑色素细胞互作网络。 免疫学 白癜风 NA NA 文本(文献数据) NA NA NA NA NA
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