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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
461 2026-08-12
Integrative machine learning and single-cell analysis identifies nicotine-related diagnostic genes and myeloid remodeling in COPD
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合机器学习和单细胞分析,鉴定慢性阻塞性肺疾病(COPD)中与尼古丁相关的诊断基因及髓系细胞重塑 首次将尼古丁相关靶基因与COPD转录组数据结合,利用多种机器学习算法构建诊断模型,并整合单细胞测序揭示髓系细胞状态转变 尼古丁相关信号仅为香烟烟雾相关COPD生物学的一个组成部分,且样本量有限 识别COPD中尼古丁相关的转录组特征,并探讨其免疫和单细胞层面的相关性 COPD患者和对照样本的转录组数据及单细胞RNA测序数据 机器学习、单细胞分析 慢性阻塞性肺疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq SVM, LASSO回归, 共识聚类 转录组数据, 单细胞表达数据 GSE57148包含COPD和对照样本;GSE173896包含单细胞数据,具体样本数未提及 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
462 2026-08-12
The causal role of plasma protein ratios in ulcerative colitis: insights from mendelian randomization and single-cell sequencing
2026-Jan, Open medicine (Warsaw, Poland)
研究论文 本研究通过孟德尔随机化和单细胞测序探究血浆蛋白比率与溃疡性结肠炎之间的因果关系。 首次利用大规模孟德尔随机化和单细胞测序结合的方法系统评估血浆蛋白比率与溃疡性结肠炎的因果关系。 局限性未在摘要中明确提及。 探究血浆蛋白比率对溃疡性结肠炎易感性的因果影响,并验证潜在生物标志物。 溃疡性结肠炎患者及健康对照的血液样本和遗传数据。 遗传流行病学、单细胞测序 溃疡性结肠炎 孟德尔随机化、单细胞测序、ELISA 逆方差加权法 基因组数据、单细胞转录组数据、蛋白质比率数据 26对溃疡性结肠炎患者和健康对照 NA 单细胞测序 NA NA
463 2026-08-12
Technological advances in axonal regeneration and structural plasticity: optogenetics, single-cell omics, and tissue clearing
2026, Frontiers in cellular neuroscience IF:4.2Q2
综述 本文综述了光遗传学、单细胞组学和组织透明化技术在中枢神经系统损伤后轴突再生和结构可塑性研究中的应用进展 结合光遗传学、单细胞测序和组织透明化技术,提供了对轴突从变性到再生动态过程的高分辨率、高灵敏度观察,并识别了新的再生相关基因 未提及 探讨现代技术如何揭示中枢神经系统损伤后轴突的动态结构和功能行为,并促进功能恢复 中枢神经系统中的神经元和胶质细胞,特别是脊髓和视神经损伤后的轴突 神经科学 中枢神经系统损伤 光遗传学、单细胞RNA测序、组织透明化 NA 图像、基因表达数据、三维影像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
464 2026-08-12
Characterization of Peripheral Blood Immune Cell Features in SSA/SSB Double‑Positive Primary Sjögren's Disease Based on Single‑Cell RNA Sequencing
2026, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 基于单细胞RNA测序,表征SSA/SSB双阳性原发性干燥综合征患者外周血免疫细胞特征 首次在单细胞水平探讨抗SSA和抗SSB抗体共存是否定义免疫学上不同的pSjD亚型 样本量较小,且未对功能机制进行深入验证 探究SSA/SSB双阳性pSjD是否具有独特的免疫细胞转录特征,以解释其更高的疾病活动性 原发性干燥综合征患者外周血单个核细胞,包括3名健康对照、5名SSA+/SSB-患者和5名SSA+/SSB+患者 单细胞RNA测序 原发性干燥综合征 单细胞RNA测序、流式细胞术 无 基因表达数据 13例外周血单个核细胞样本(3例健康对照、5例SSA+/SSB-患者、5例SSA+/SSB+患者) NA 单细胞RNA测序 NA NA
465 2026-08-11
ChatMDV: reducing technical barriers in bioinformatics analysis using large language models
2026-Jan-21, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 ChatMDV是一个集成于MDV的自然语言界面,利用大型语言模型将用户查询转化为可执行代码,实现高质量、可交互的生物信息学可视化与分析 结合检索增强生成(RAG)与大型语言模型,实现自然语言到Python代码的自动转换,降低生物信息学分析的技术门槛,并遵循FAIR原则提高可重复性 未明确提及局限性,但可能依赖模型性能且语义成功率在79%至97%之间,存在失败案例 通过自然语言界面降低生物信息学可视化和分析的技术障碍,提高可及性和可重复性 三个单细胞RNA测序数据集:外周血单核细胞3K、肺癌图谱(人类细胞图谱)及纵向TAURUS研究数据 生物信息学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 大型语言模型(LLM) 文本(自然语言查询)及单细胞基因表达数据 三个数据集,具体样本量未说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
466 2026-08-11
A Deep Learning Approach to Assessing Cell Identity in Stem Cell-Based Embryo Models
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 利用深度学习模型对干细胞来源的胚胎模型中的细胞身份进行评估,结合单细胞RNA测序数据整合与分类细胞类型 将深度学习与单细胞RNA测序相结合,开发了集成模型来评估体外细胞类型与胚胎生成细胞的相似度,并为每个细胞类型分配身份及熵值作为分类可靠性指标 未提及具体限制 开发一个深度学习模型,用于评估干细胞来源的胚胎模型中的细胞身份,并探究其与体内发育过程的一致性 胚胎干细胞来源的拟胚体及其他体外分化模型 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度学习模型(基于scvi-tools) 单细胞基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
467 2026-08-09
Screening of Anti-Atherosclerosis Targets of Ce-Bai-Si-Wei Decoction Based on Multidimensional Data and Study on Cellular Distribution
2026, Journal of diabetes research IF:3.6Q2
研究论文 基于多维数据筛选策百思维汤抗动脉粥样硬化的靶点并研究其细胞分布 整合网络药理学、微阵列数据和单细胞转录组学等多维数据,识别出HMOX1、SELE、CD4和FLT1四个核心基因,并通过分子对接、分子动力学模拟及体外实验验证了CSD通过NRF2/HMOX1通路发挥抗AS作用 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证,且分子机制探索可能不够全面 探究策百思维汤治疗动脉粥样硬化的分子机制及核心作用靶点 巨噬细胞泡沫细胞和受损内皮细胞 生物信息学、网络药理学 动脉粥样硬化、心血管疾病 RNA-seq、单细胞转录组学、分子对接、分子动力学模拟、RT-qPCR、Western blot NA 基因表达数据、文本数据 NA(未提及具体样本量,涉及体外细胞模型和多维数据整合) NA bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq NA NA
468 2026-08-09
Artesunate Alleviates Inflammatory Injury in Neonatal Acute Respiratory Distress Syndrome Through CCL5-Mediated Pyroptosis of M2 Macrophage Subsets
2026, Journal of immunology research IF:3.5Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序探究新生儿急性呼吸窘迫综合征微环境中细胞焦亡的分子机制,并发现青蒿素通过抑制CCL5介导的M2巨噬细胞焦亡减轻炎症损伤并促进组织修复 首次通过单细胞RNA测序揭示CCL5在M2巨噬细胞中作为焦亡调控因子,并利用网络药理学识别青蒿素作为潜在的CCL5抑制剂,突显其双重抗炎和促修复作用 主要基于体外和生物信息学分析,缺乏体内动物模型的验证,且临床样本量有限 探究NARDS微环境中焦亡的分子机制,并评估青蒿素作为治疗药物的潜力 新生儿急性呼吸窘迫综合征患者及相关的巨噬细胞亚群 单细胞测序,网络药理学 新生儿急性呼吸窘迫综合征 单细胞RNA测序,网络药理学分析 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
469 2026-08-09
NTMT1 (METTL11A) promotes MYC-dependent proliferation and downstream HLA-A suppression in cervical cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了NTMT1在宫颈癌中促进MYC依赖性增殖并抑制HLA-A表达,从而影响CD8+ T细胞功能。 首次将NTMT1与宫颈癌中MYC激活和HLA-A抑制联系起来,并利用空间转录组学揭示了其在不同肿瘤微环境中的上下文特异性作用。 精确的分子机制尚未阐明,且实验结果仅限于体外共培养条件,需要进一步的体内研究验证。 识别连接肿瘤增殖与免疫相关改变的上游分子调控因子,并评估NTMT1在宫颈癌中的作用。 宫颈癌组织中的上皮细胞和免疫细胞,重点关注NTMT1表达及其功能。 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, RT-qPCR, Western blotting, 多重免疫荧光, 流式细胞术 NA 基因表达数据, 空间转录组数据, 图像 包括GSE208653和GSE208654数据集,具体样本数量未在摘要中提供 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
470 2026-08-09
The airway epithelial-immune axis: mechanisms and therapeutic implications
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文全面综述了气道上皮-免疫轴的结构和功能基础及其在慢性呼吸道疾病中的关键作用,并探讨了靶向该轴的治疗策略。 强调气道上皮作为黏膜免疫的主动调节者,聚焦警报素(TSLP、IL-33、IL-25)介导的上皮-免疫回路,并整合新兴技术(如单细胞RNA测序、空间转录组学、类器官模型)以推动精准医学。 未提及具体局限性。 总结气道上皮-免疫轴的机制,并探讨其在哮喘、慢性阻塞性肺病和上气道炎症性疾病中的治疗意义。 气道上皮细胞、固有免疫细胞(ILC2s)、适应性免疫细胞(Th2细胞)及相关的细胞因子和信号通路。 免疫学、呼吸医学 哮喘、慢性阻塞性肺病、上气道炎症性疾病 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合(据摘要推断,原文未明确指定具体技术) NA 生物医学数据(如基因表达、空间转录组数据) NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
471 2026-08-09
Spatial immune programs associated with nodal status differ between lymphoid follicular regions and peritumoral tonsillar tissue in HPV-positive oropharyngeal cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学和批量转录组学分析了HPV阳性口咽癌中淋巴滤泡区域和肿瘤周围扁桃体组织的免疫程序,并探讨其与淋巴结状态的关系 首次区分淋巴滤泡区域和肿瘤周围扁桃体组织,揭示相同免疫通路在不同空间位置具有不同的生物学关联 空间转录组学分析的患者数量有限,研究结果属于探索性发现,需在更大规模的独立队列中验证 探究HPV阳性口咽癌中与淋巴结状态相关的空间免疫程序差异 HPV阳性口咽癌患者的扁桃体组织,包括淋巴滤泡区域和肿瘤周围扁桃体组织 空间转录组学 HPV阳性口咽癌 空间转录组学, 批量转录组学, 基因集富集分析 NA 转录组数据, 空间转录组数据, 批量微阵列数据 有限数量的患者(具体数量未提供) NanoString 空间转录组学 GeoMx Digital Spatial Profiler GeoMx Digital Spatial Profiler用于空间转录组分析
472 2026-08-09
Spatial transcriptomic mapping of early immune responses to an adjuvanted recombinant hemagglutinin vaccine
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 利用空间转录组学绘制了含佐剂重组血凝素疫苗早期免疫反应的空间图谱,揭示了注射部位和引流淋巴结中的时空转录程序 首次提供了佐剂疫苗早期反应中局部炎症与淋巴结组织在空间和时间上关联的高分辨率视图 未提及 绘制含佐剂重组血凝素疫苗早期免疫反应的空间转录组图谱,以理解注射部位信号与引流淋巴结转录程序的耦合 小鼠肌肉注射部位和引流淋巴结 空间转录组学 NA 空间转录组学,GeoMx数字空间 profiling,CosMx空间分子成像 NA 空间转录组数据,单细胞成像数据 小鼠,具体数量未提及 NanoString 空间转录组学,单细胞成像 GeoMx Digital Spatial Profiling, CosMx Spatial Molecular Imaging GeoMx DSP和CosMx SMI用于单细胞成像,注射部位使用20x20 µm空间网格
473 2026-08-09
Decoding benign prostatic hyperplasia at single-cell resolution: heterogeneity, inflammation, and beyond androgen-driven pathogenesis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在良性前列腺增生(BPH)研究中的应用,强调从均质、激素中心视角向复杂、异质性细胞-免疫相互作用驱动的过程转变 通过scRNA-seq识别出增生移行带中新的基底上皮亚型和活化成纤维细胞群,并揭示慢性炎症、SASP在维持增殖微环境中的作用,提出超越雄激素轴的新型治疗靶点如CXCL13/CD4T细胞轴和颗粒酶K通路 未明确提及具体局限性,但作为综述,可能受限于现有研究的样本量和异质性 总结scRNA-seq在BPH研究中的最新进展,探讨其如何揭示BPH的异质性、炎症机制及非雄激素驱动的发病机制,并为精准治疗提供方向 良性前列腺增生(BPH)组织中的细胞类型,包括基底上皮亚型、活化成纤维细胞、免疫细胞等 数字病理学 良性前列腺增生 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
474 2026-08-09
Integrated peripheral immune profiling reveals B-cell dysregulation and CD8 effector signatures in chronic inflammatory demyelinating polyneuropathy
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合外周免疫分析,揭示了慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病中B细胞失调和CD8效应T细胞特征 首次采用多模式整合方法(单细胞RNA测序、细胞因子谱分析和流式细胞术验证)定义CIDP的外周免疫结构,并与多发性硬化症进行跨疾病对比,发现CIDP特有的I型干扰素和炎症小体相关程序及B细胞激活与细胞数量解离的现象 样本量较小(20例患者和20例对照),单细胞分析仅在发现子集中进行,需在更大、治疗分层队列中验证 定义CIDP的外周免疫架构,识别其独特的免疫特征,并与MS进行对比,以理解其免疫机制差异 慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病(CIDP)患者和多发性硬化症(MS)患者的外周血免疫细胞 免疫学 慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病 单细胞RNA测序、细胞因子谱分析、流式细胞术 NA 单细胞转录组数据、细胞因子数据、流式细胞术数据 20例CIDP患者和20例年龄性别匹配的健康对照 NA 单细胞RNA测序、流式细胞术 NA NA
475 2026-08-08
<em>IGHG1, HLA-DOB, </em>and <em>GABBR1</em>: Genetic Insights into Rheumatoid Arthritis Using Mendelian Randomisation and Single-Cell RNA Sequencing
2026-Jan, Journal of the College of Physicians and Surgeons--Pakistan : JCPSP
研究论文 利用孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术,识别类风湿关节炎相关关键基因并探讨其发病机制。 首次将孟德尔随机化与单细胞RNA测序相结合,发现GABBR1作为G蛋白偶联受体与类风湿关节炎的新关联。 摘要中未提及研究局限性。 识别类风湿关节炎的关键基因,并探索其在疾病发病机制中的作用,以提出新的治疗靶点。 类风湿关节炎患者与健康对照的基因表达数据及滑膜组织单细胞数据。 生物信息学 类风湿关节炎 差异基因表达分析, 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
476 2026-08-08
Fumarate-associated immunometabolic network in Periodontitis revealed by integrated transcriptomic and single-cell RNA sequencing analysis
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合批量转录组和单细胞RNA测序数据,揭示了牙周炎中与富马酸相关的免疫代谢网络,并鉴定了潜在的诊断标志物和治疗靶点。 首次将富马酸相关的转录程序与牙周炎的免疫代谢变化联系起来,通过整合多种数据源识别了新的转录标志物和药物候选。 研究主要基于计算分析,缺乏实验验证,且样本来源可能有限,结果需进一步功能实验确认。 探讨富马酸相关基因表达在牙周炎发病机制中的作用,并识别潜在诊断和治疗靶点。 人类牙周组织样本和牙周炎小鼠模型的组织样本。 转录组学、单细胞测序 牙周炎 批量RNA测序、单细胞RNA测序 计算模型(基因表达分析、药物筛选) 转录组数据、单细胞表达数据 人牙周组织样本(具体数量未提供)和小鼠模型样本。 NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA NA
477 2026-08-08
Purine Metabolism-Related Pathogenic Genes in Trigeminal Neuralgia: A Multiomics Mendelian Randomization Study
2026, Pain research & management IF:2.5Q2
研究论文 本研究采用多组学孟德尔随机化方法,探讨嘌呤代谢相关基因与三叉神经痛(TN)之间的关联,并识别潜在的治疗靶点。 创新性地整合多组学数据(mQTL、eQTL、pQTL)与孟德尔随机化,结合共定位、药物靶点MR和单细胞RNA测序,全面分析嘌呤代谢基因与TN的因果关系,并发现多个新的候选基因及药物靶点。 研究主要基于欧洲人群的GWAS数据,可能限制结果的普适性;未进行体外或体内功能实验验证;药物靶点MR结果需进一步临床验证。 利用多组学孟德尔随机化方法,识别嘌呤代谢相关基因中与三叉神经痛相关的致病基因,并评估其作为治疗靶点的潜力。 三叉神经痛患者及对照样本,包括血液、脑组织、三叉神经节组织及转录组和单细胞数据。 机器学习 三叉神经痛 多组学孟德尔随机化、全基因组关联分析、甲基化定量性状位点、表达定量性状位点、蛋白质定量性状位点、共定位分析、药物靶点孟德尔随机化、单细胞RNA测序、功能富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络 孟德尔随机化模型 基因组数据、表观遗传数据、转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 多组学数据集,包括FinnGen R10和R12、UKBB、GEO转录组和scRNA-seq数据集、GTEx脑组织eQTL数据;具体样本量未提供。 NA 单细胞RNA测序 NA 使用GEO数据库中的scRNA-seq数据集,但未提供具体平台信息。
478 2026-08-08
Post-transcriptional regulation via alternative polyadenylation and piRNA shapes macrophage responses in psoriasis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究采用多组学整合方法,系统解析了可变多聚腺苷酸化和piRNA介导的转录后调控在银屑病发病机制中的作用 首次揭示TDRKH-piRNA轴在银屑病巨噬细胞炎症反应中的转录后调控网络,结合长读长测序和单细胞测序,并利用孟德尔随机化验证因果关联 样本量较小,功能验证仅在体外细胞模型中进行,缺乏体内实验证据 阐明可变多聚腺苷酸化和piRNA在银屑病发病中的转录后调控机制 银屑病患者外周血单核细胞、皮损组织及极化巨噬细胞(THP-1) 转录组学 银屑病 长读长测序、单细胞RNA测序、小RNA测序、全转录组关联研究、孟德尔随机化 NA 长读长测序数据、单细胞RNA测序数据、小RNA测序数据、遗传变异数据 15例健康对照和10例银屑病患者用于APA分析;4例患者皮损组织用于单细胞测序(17,734个细胞);THP-1巨噬细胞用于功能实验 NA 单细胞RNA测序、长读长测序、小RNA测序 NA NA
479 2026-08-08
A single-cell sequencing-based prognostic model reveals HLA-DRA, NPC2, and PRPF38B as immune-regulatory tumor suppressors in non-small cell lung cancer
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 基于单细胞测序数据构建非小细胞肺癌预后模型,并验证HLA-DRA、NPC2和PRPF38B作为免疫调节性肿瘤抑制因子的作用 首次利用单细胞RNA测序数据构建基于肿瘤浸润淋巴细胞的9基因风险评分模型,并鉴定HLA-DRA、NPC2和PRPF38B为具有肿瘤抑制功能的免疫调节靶点 未提及具体局限性 构建非小细胞肺癌的预后风险模型并探索免疫调节性肿瘤抑制因子 非小细胞肺癌患者肿瘤组织及肿瘤浸润淋巴细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blotting、共培养实验 LASSO回归 基因表达数据、临床数据 来自GEO和TCGA数据库的非小细胞肺癌样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
480 2026-08-08
Tumor organoid-immune cell co-culture systems for precision oncology
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
综述 本文批判性评估了肿瘤类器官与免疫细胞共培养系统,包括还原论、整体论和类器官芯片方法,并讨论了其在精准肿瘤学中的应用与挑战 对共培养方法进行了定量基准测试,并分析了新兴的“类器官+”技术,如空间转录组学、AI辅助成像和机器学习 现有系统存在批次变异性、天然异质性丧失、血管化不足和缺乏系统性免疫建模等主要限制,阻碍临床转化 评估肿瘤类器官-免疫细胞共培养系统的现有方法,并探讨其在精准肿瘤学和个性化免疫治疗中的应用前景 肿瘤类器官(特别是患者来源的类器官)和免疫细胞共培养系统 数字病理学 肿瘤 共培养技术 类器官模型 图像 不适用 不适用 空间转录组学 不适用 不适用
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