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当前共找到 1234 篇文献,本页显示第 461 - 480 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
461 2026-01-26
Multi-Scale Transcriptomics Redefining the Tumor Immune Microenvironment
2026-Jan-15, Biotech (Basel (Switzerland))
综述 本文综述了批量、单细胞和空间转录组学方法在肿瘤免疫微环境研究中的原理、应用和局限性,并强调了整合分析的新兴策略 提出了多尺度转录组学框架,整合批量、单细胞和空间转录组数据,以更详细和机制性地理解肿瘤免疫微环境 综述文章未进行原始数据分析,主要总结现有方法,可能未涵盖最新技术进展 重新定义肿瘤免疫微环境,以支持更精确的生物技术和免疫治疗策略的开发 肿瘤免疫微环境 数字病理学 肿瘤 高通量测序技术 NA 转录组数据 NA NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
462 2026-01-26
Integrated human and mouse single-cell profiling reveals immune-stromal niche driving silicosis
2026-Jan-09, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过整合人类和小鼠的单细胞RNA测序数据,揭示了驱动矽肺病发展的免疫-基质微环境中的关键细胞群和相互作用 开发了一种使用微型支气管镜的位点特异性矽肺病小鼠模型,并结合单细胞测序与细胞间通讯建模,首次系统性地揭示了CCL2-hi单核样巨噬细胞(MLM)及其分化亚群与基质细胞(如Sfrp1-hi/Spp1-hi成纤维细胞)在矽肺纤维化中的动态互作网络 研究主要基于单细胞转录组数据,功能验证和机制深入解析有待后续实验补充,且小鼠模型与人类疾病在病理进程上可能存在差异 阐明矽肺病中巨噬细胞与基质细胞相互作用的分子机制,以发现潜在的治疗靶点 矽肺病患者(人类)和小鼠模型中的肺组织细胞 数字病理学 肺纤维化/矽肺病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 细胞-细胞通讯建模 单细胞转录组数据 矽肺患者的全肺灌洗液样本及小鼠模型肺组织样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
463 2026-01-26
Discovery of New Markers for Haemogenic Endothelium and Haematopoietic Progenitors in the Mouse Yolk Sac
2026-Jan-06, Journal of developmental biology IF:2.2Q3
研究论文 本研究通过重新注释小鼠卵黄囊单细胞RNA测序数据,发现了造血内皮和红系-髓系祖细胞的新分子标记物 通过亚聚类和拟时序分析,鉴定了造血内皮细胞和红系-髓系祖细胞的新型细胞表面标记物(FXYD5、SCARF1、FCER1G),并揭示了可能调控卵黄囊造血发生的候选信号和代谢通路 研究基于公开可用的单细胞RNA测序数据集,可能受限于原始数据的质量和覆盖度;研究结果主要在小鼠模型中验证,在人类或其他哺乳动物中的适用性有待进一步确认 阐明小鼠卵黄囊中造血内皮和红系-髓系祖细胞的起源、身份和分化动力学 小鼠胚胎卵黄囊中的造血-血管细胞群体 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 拟时序分析 单细胞转录组数据 公开可用的单细胞RNA测序数据集(未指定具体样本数量) NA 单细胞RNA-seq NA NA
464 2026-01-26
GDF3 promotes adipose tissue macrophage-mediated inflammation via altered chromatin accessibility during aging
2026-Jan, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本文揭示了巨噬细胞通过自分泌GDF3-SMAD2/3信号维持炎症表型并加剧内毒素血症的机制 发现GDF3-SMAD2/3轴通过限制甲基化依赖性染色质压缩驱动年龄相关染色质重塑和巨噬细胞炎症 NA 探究衰老过程中巨噬细胞炎症表型维持的机制及其与内毒素血症的关系 小鼠巨噬细胞、人类脂肪组织样本及11,084名社区动脉粥样硬化风险研究参与者 NA NA 单细胞RNA测序、转座酶可及染色质测序分析 NA RNA测序数据、染色质可及性数据 人类脂肪组织样本及11,084名参与者 NA 单细胞RNA-seq, ATAC-seq NA NA
465 2026-01-26
Dynamics of lung-infiltrating virus-specific T cells associated with age-dependent SARS-CoV-2 pneumonia severity
2026-Jan, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 本研究利用Nr4a3-Tocky小鼠模型,探究了年龄相关的T细胞功能障碍与SARS-CoV-2肺炎严重程度之间的关联 建立了一种新型的鼠适应SARS-CoV-2毒株感染Nr4a3-Tocky小鼠模型,该模型能够通过荧光Timer蛋白在体内实时分析抗原反应性T细胞的动态和诱导过程 研究基于小鼠模型,其结果向人类临床的转化需要进一步验证 阐明SARS-CoV-2肺炎年龄依赖性发病的免疫学机制 成年和老年Nr4a3-Tocky小鼠 免疫学 COVID-19肺炎 单细胞RNA测序,Timer蛋白荧光分析,细胞因子检测 NA RNA序列数据,荧光成像数据,细胞因子浓度数据 未明确说明具体数量,但涉及成年和老年两组小鼠,并在感染后多个时间点(1-8 d.p.i.)进行分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
466 2026-01-26
Immune checkpoint TIM-3 defines hyperactivated NK cells and predicts fatal outcome in severe fever with thrombocytopenia syndrome
2026-Jan, PLoS neglected tropical diseases IF:3.4Q1
研究论文 本研究探讨了TIM-3在严重发热伴血小板减少综合征患者外周血NK细胞上的表达特征及其与疾病预后的关系 首次在SFTS中系统表征TIM-3⁺ NK细胞的表达谱,发现其与致死结局相关,并鉴定sTIM-3和sGalectin-9作为新型预后生物标志物 样本量较小(21例患者),单中心研究,需要更大规模队列验证 阐明TIM-3在SFTS免疫失调中的作用机制并寻找预后生物标志物 严重发热伴血小板减少综合征患者的外周血NK细胞及血清样本 免疫学 病毒感染性疾病 单细胞RNA测序,流式细胞术,细胞因子检测 加权基因共表达网络分析 单细胞转录组数据,流式细胞数据,血清蛋白数据 21例SFTS患者和14例健康供者的外周血样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
467 2026-01-26
Integrative Multiomics Nominate GGCT as a Crucial Regulator of Immunosuppression in Colorectal Cancer
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,系统探索了结直肠癌中的免疫逃逸相关特征,并鉴定出GGCT作为一个关键的免疫抑制调节因子和预后生物标志物 首次在单细胞水平上系统表征结直肠癌的免疫逃逸机制,并通过多组学整合和高维加权基因共表达网络分析鉴定出GGCT作为新的预后生物标志物和治疗靶点 研究主要基于公共队列数据,缺乏实验验证;单细胞数据分析可能受样本异质性和批次效应影响 探索结直肠癌中免疫逃逸机制并鉴定关键调控因子 结直肠癌肿瘤微环境中的细胞群体 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 高维加权基因共表达网络分析 基因表达数据 多个公共队列数据(具体样本数未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
468 2026-01-25
Deficiency of SMARCB1 drives an immunosuppressive microenvironment in meningioma
2026-Jan-24, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1
研究论文 本研究揭示了SMARCB1缺陷通过调控IL-17/CSF1轴驱动脑膜瘤免疫抑制微环境中CD163+巨噬细胞浸润的机制 首次将SMARCB1突变与脑膜瘤免疫原性亚型及IL-17/CSF1轴调控的免疫抑制微环境联系起来,并确定了14个基因特征标志物 样本量相对有限(共148例患者),机制验证主要依赖公共数据库分析,需要进一步实验验证 探究脑膜瘤免疫抑制微环境的生物学驱动因素及其与SMARCB1缺陷的关联 脑膜瘤患者(包括不同WHO分级和疾病状态)的肿瘤组织、血清样本及公共数据库数据 肿瘤免疫学 脑膜瘤 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 全外显子测序, 免疫组织化学染色, 多重免疫荧光染色 NA 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质表达数据, 临床数据 148例患者(113例预后队列 + 35例验证队列) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 全外显子测序 NA NA
469 2026-01-25
Downregulation of SLC12A5 in glioblastoma multiforme: a novel prognostic biomarker associated with brain edema and radiomic features
2026-Jan-24, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究通过整合生物信息学、影像组学和实验验证,鉴定出SLC12A5作为胶质母细胞瘤的新型预后生物标志物,其下调与脑水肿、特定信号通路及影像特征相关 首次将SLC12A5的下调与胶质母细胞瘤的脑水肿体积、MMP9/STAT3信号通路激活及MRI影像组学特征相关联,并验证其作为独立预后因子的价值 研究主要基于公共数据集和回顾性分析,需要前瞻性临床研究进一步验证SLC12A5的预后和靶向治疗价值 识别胶质母细胞瘤的新型预后生物标志物,并探索其与脑水肿、分子通路及影像特征的关系 胶质母细胞瘤患者样本及相关基因表达数据 生物信息学 胶质母细胞瘤 整合生物信息学分析、Western blotting、免疫组织化学、单细胞测序、影像组学分析 多变量Cox回归分析 基因表达数据、蛋白质印迹数据、免疫组化图像、MRI影像数据 基于GEO、TCGA和CGGA数据集的样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞测序 NA NA
470 2026-01-25
Decoding the tumor immune landscape: emerging TIL subsets as prognostic biomarkers and therapeutic targets
2026-Jan-24, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
综述 本文综述了肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)中除传统CD3+和CD8+T细胞外的新兴亚群(如CD4+辅助T细胞、调节性T细胞、组织驻留记忆T细胞、γδ T细胞等)的功能、预后价值及其作为免疫治疗生物标志物和治疗靶点的潜力 系统性地探讨了传统TIL标志物(CD3、CD8)之外的新兴TIL亚群在肿瘤免疫微环境中的多样化作用及其与免疫治疗反应和预后的关联,强调了单细胞测序和空间转录组学技术对解析TIL异质性的推动作用 作为一篇综述文章,主要基于现有文献进行总结和分析,未涉及原始实验数据或新模型的验证 探讨不同TIL亚群在肿瘤免疫中的作用机制,评估其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)的各种亚群,包括CD4+辅助T细胞、调节性T细胞(Tregs)、组织驻留记忆T细胞(TRM细胞)、γδ T细胞和先天样T细胞等 肿瘤免疫学 癌症 单细胞测序、空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
471 2026-01-25
Development of an in situ small intestinal injection technique for targeted macromolecule delivery and in vivo functional studies in mice
2026-Jan-23, Animal models and experimental medicine IF:3.8Q2
研究论文 本研究开发了一种小鼠小肠原位注射技术,用于靶向大分子递送和体内功能研究 提出了一种微创、原位的小肠注射技术,能够绕过胃部屏障,实现局部腔内递送,避免了传统口服灌胃导致的大分子降解问题 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在更大动物或人体中验证;长期效应和潜在并发症需进一步评估 开发一种靶向递送生物大分子至小肠的技术,并评估其在生理环境中的功能应用 小鼠小肠,特别是十二指肠区域 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据,组织病理学图像 小鼠模型,具体数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
472 2026-01-25
Chemically guided single-cell transcriptomics reveals sulfotransferase-mediated scaffold remodeling in securinine biosynthesis
2026-Jan-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究结合化学逻辑、稳定同位素标记喂养实验和单细胞转录组学,揭示了Flueggea suffruticosa中一叶萩碱生物合成的核心途径,并发现磺基转移酶在支架重塑中的新作用 揭示了磺基转移酶作为支架重塑关键介导者的非传统生物合成角色,而非常规的修饰酶 NA 阐明一叶萩碱生物合成的核心途径 Flueggea suffruticosa植物中的一叶萩碱生物合成 单细胞转录组学 NA 稳定同位素标记喂养实验,单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
473 2026-01-25
An integrated single-cell lung cancer atlas reveals distinct fibroblast phenotypes between adenocarcinoma and squamous cell carcinomas
2026-Jan-23, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本文通过整合公开可用的单细胞RNA测序数据,构建了一个非小细胞肺癌的单细胞图谱,揭示了肺腺癌和肺鳞状细胞癌之间肿瘤微环境异质性和细胞组成的差异,特别是癌症相关成纤维细胞亚型的显著不同 首次大规模整合单细胞RNA测序数据,系统比较了肺腺癌和肺鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞亚型的差异,并通过共培养实验验证了不同肺癌细胞对成纤维细胞表型的诱导作用 研究依赖于公开数据集,可能受数据质量和批次效应影响;共培养实验可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 探究非小细胞肺癌中肿瘤微环境的异质性,特别是癌症相关成纤维细胞亚型在肺腺癌和肺鳞状细胞癌中的差异及其与预后的关系 非小细胞肺癌组织样本,包括肺腺癌和肺鳞状细胞癌 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
474 2026-01-25
LMTK3 regulates breast cancer angiogenesis via a context-dependent mesenchymal-epithelial transition program
2026-Jan-23, Cancer gene therapy IF:4.8Q1
研究论文 本文揭示了LMTK3通过调控间充质-上皮转化程序在乳腺癌血管生成中的关键作用 发现了LMTK3在乳腺癌血管生成中的“辛普森悖论”现象,即在间充质样三阴性乳腺癌中促进血管生成,而在管腔样细胞中抑制血管生成 研究主要基于细胞模型和单细胞测序数据,缺乏体内实验验证和临床样本的直接证据 探索乳腺癌血管生成的上游分子调控机制 乳腺癌细胞,特别是三阴性乳腺癌和管腔样乳腺癌细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
475 2026-01-25
Single-cell atlas of the transcriptome and chromatin accessibility in the human retina
2026-Jan-23, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 本研究构建了一个整合了转录组和染色质可及性数据的人类视网膜单细胞图谱 整合了多模态(转录组和染色质可及性)、多供体、多实验室的数据,创建了迄今为止最全面的人类视网膜细胞图谱,并鉴定了超过130种细胞类型 未在摘要中明确说明 创建全面的人类视网膜细胞参考图谱,以促进对视网膜功能和病理的理解 人类视网膜细胞 单细胞组学 NA 单细胞测序 NA 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 约390万个细胞,来自125名具有不同祖先背景的供体 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
476 2026-01-25
Aberrant cellular communities underlying disease heterogeneity in chronic obstructive pulmonary disease
2026-Jan-23, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 本研究通过单核RNA测序分析了141名参与者的肺组织,揭示了慢性阻塞性肺疾病(COPD)的细胞组成变化和疾病异质性,并识别了与疾病进展相关的细胞状态和生物标志物 首次在COPD中大规模应用单核RNA测序结合空间转录组学,系统揭示了疾病异质性的细胞群落基础,并发现了与疾病进展动态相关的上皮再生状态和炎症/纤维化状态 研究主要基于组织样本,未涉及疾病早期或不同治疗阶段的动态变化;样本量虽大但可能无法覆盖所有COPD亚型 研究慢性阻塞性肺疾病(COPD)的临床和分子异质性,揭示其潜在的细胞群落变化 141名研究参与者的肺组织样本(1,516,727个细胞核) 数字病理学 慢性阻塞性肺疾病 单核RNA测序,空间转录组学,蛋白质组学分析 聚类分析,细胞通讯网络分析 单细胞转录组数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 141名参与者,1,516,727个细胞核 NA 单核RNA测序,空间转录组学 NA NA
477 2026-01-25
Histone demethylase KDM7A negatively regulates fibrotic macrophage polarization and lung fibrosis progression
2026-Jan-23, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本文揭示了组蛋白去甲基化酶KDM7A通过调控TLR8表达来抑制促纤维化巨噬细胞极化,从而限制肺纤维化进展的表观遗传机制 首次发现KDM7A-TLR8轴作为抑制促纤维化巨噬细胞极化的关键表观遗传调控通路,并揭示其与年龄相关表达下降的临床关联 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限;性别差异的机制尚未完全阐明 探究表观遗传机制在调控巨噬细胞极化及肺纤维化进展中的作用 巨噬细胞、Kdm7a基因敲除小鼠、肺纤维化患者的肺组织 表观遗传学 肺纤维化 单细胞RNA测序 基因敲除小鼠模型 基因表达数据、组织样本 Kdm7a敲除小鼠及对照小鼠、肺纤维化患者组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
478 2026-01-25
zDUR: reference-free FASTQ compressor with high compression ratio and speed
2026-Jan-23, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 本文介绍了一种名为zDUR的无参考FASTQ压缩器,旨在高效处理多平台和测序数据类型的下一代测序数据 zDUR在压缩比和速度之间实现了良好的整体平衡,特别是在单细胞RNA-seq和空间转录组学数据集上,相比现有先进压缩器SPRING,运行时性能提升超过十倍,同时保持更高的压缩比 NA 开发一种高效、可扩展的无参考FASTQ压缩器,以减轻高通量测序数据存储和传输的负担 FASTQ数据,包括核苷酸序列、质量分数和读取标识符 机器学习 NA 高通量测序 NA FASTQ文件 15个代表性数据集,涵盖四种测序数据类型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
479 2026-01-25
Integrative microRNA and transcriptome analysis reveals sex-specific molecular divergence in human bladder cancer
2026-Jan-23, Biology of sex differences IF:4.9Q1
研究论文 本研究通过整合miRNA和转录组分析,揭示了膀胱癌中性别特异的分子差异及其调控机制 首次系统性地结合bulk mRNA、microRNA表达、生存模型和单细胞转录组分析,识别了性别特异的miRNA-mRNA调控对,并揭示了这些特征与生存率的性别依赖性关联 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性验证;单细胞分析样本量有限,可能影响统计效力 旨在识别膀胱癌中性别特异的分子特征和调控相互作用,以解释性别差异的生物学机制 人类膀胱癌组织样本,包括男性和女性患者的数据 生物信息学 膀胱癌 bulk mRNA表达分析,microRNA表达分析,单细胞RNA-seq 差异表达分析,生存分析(Kaplan-Meier和Cox模型),相关性分析 基因表达数据,生存数据,单细胞转录组数据 数据来源于TCGA、GEO和GSA数据库,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
480 2026-01-25
Defining the cellular and molecular identities of histologic subtypes in lung adenocarcinoma
2026-Jan-23, Experimental hematology & oncology IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了肺腺癌不同组织学亚型的细胞和分子特征,特别是实体亚型中的免疫抑制微环境 首次整合单细胞转录组学和空间信息,识别出组织学亚型特异的癌细胞亚群和免疫抑制表型,并发现HMGA1作为实体亚型的潜在生物标志物和治疗靶点 样本量相对较小(18例患者),且仅针对初治肺腺癌,可能无法完全代表所有临床情况 探究肺腺癌组织学亚型的细胞和分子基础,以理解疾病异质性和开发亚型特异性治疗策略 肺腺癌患者肿瘤组织中的细胞,包括癌细胞和肿瘤微环境中的免疫细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学分析 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 18例初治肺腺癌患者,共117,266个细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq,空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组平台
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