单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1921 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2026-06-06 |
GSTO1 as a Potential Risk Factor for Diabetic Nephropathy: Evidence From Mendelian Randomisation and Multi-Omics Analyses
2026-Jan, Nephrology (Carlton, Vic.)
DOI:10.1111/nep.70165
PMID:41549440
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和多组学分析探讨GSTO1与糖尿病肾病的潜在因果关系 | 首次利用孟德尔随机化联合单细胞RNA测序和多组学数据揭示GSTO1在糖尿病肾病中的因果作用 | 研究结果基于公共数据库和体外实验，尚需更大样本量和体内实验验证 | 探究GSTO1与糖尿病肾病风险之间的潜在因果关系 | GSTO1基因变异、糖尿病肾病样本及高糖处理HK-2细胞 | 机器学习和生物信息学 | 糖尿病肾病 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、表达分析 | NA | 基因型数据、表达谱数据、单细胞RNA测序数据 | MR分析包含GWAS汇总数据，表达分析涉及Nephroseq、GEO数据集及人肾小管上皮细胞系HK-2 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 442 | 2026-06-06 |
Increased mROS Generation Associates With Cardiovascular Risk in BioHEART-CT PBMCs
2026-Jan, Clinical and translational science
DOI:10.1111/cts.70469
PMID:41549547
|
研究论文 | 研究外周血单核细胞线粒体活性氧生成与冠心病风险的关系 | 通过联合MitoSOX流式细胞术和单细胞RNA测序，初步探索CCBE1基因在PBMC中的表达差异 | 样本量较小（40例），未发现PBMC线粒体活性氧与冠心病状态的一致关联，且亚组分析结果探索性且不稳健 | 评估PBMC线粒体活性氧作为冠心病血液生物标志物的潜力 | BioHEART-CT队列参与者外周血单核细胞（PBMCs） | 医学影像学，数字病理学 | 冠心病，心血管疾病 | 流式细胞术（MitoSOX），单细胞RNA-seq | NA | 流式细胞术数据，单细胞转录组数据 | 40例BioHEART-CT参与者（不同冠心病状态） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于分析PBMC中CCBE1差异表达 |
| 443 | 2026-06-06 |
LncRNA ZFAS1 Promotes Alveolar Bone Resorption by Enhancing Osteoclastogenesis in Periodontitis
2026-Jan, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70134
PMID:41549697
|
研究论文 | 探究长链非编码RNA ZFAS1在牙周炎中通过增强破骨细胞生成促进牙槽骨吸收的机制 | 首次揭示lncRNA ZFAS1在牙周炎微环境中作为双重路径调控因子，同时促进破骨细胞生成和抑制成骨细胞生成，并通过单细胞和bulk RNA测序技术验证其与早期破骨标志基因的强相关性 | 未提供具体局限性信息 | 阐明lncRNA ZFAS1在牙周炎骨重塑失调中的机制作用 | 牙周炎患者和健康者的牙周组织，以及RAW264.7和MC3T3-E1细胞系 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、qPCR、组织学、免疫组化 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 包含健康和患病牙周组织样本，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 444 | 2026-06-06 |
IL-21 mediates crosstalk between T cells and NK cells during the remission of type 1 diabetes
2026-Jan, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-025-01439-y
PMID:41566069
|
研究论文 | 揭示IL-21介导T细胞与NK细胞在1型糖尿病缓解期中的相互作用机制 | 首次鉴定出在1型糖尿病发病时扩增的CD226+CD56-CD16+ NK细胞亚群，并证明其通过IL-21和mTOR信号通路受到CD161+CD4+ T细胞调控，连接适应性免疫与先天免疫 | 主要在雌性小鼠模型中验证机制，人类纵向样本量有限 | 阐明自然杀伤细胞在1型糖尿病进展和缓解中的作用及免疫调节机制 | 1型糖尿病患者及雌性小鼠模型中的NK细胞和T细胞 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1型糖尿病患者样本（横断面和纵向分析）及雌性小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 445 | 2026-06-06 |
Spatiotemporal Evolution of Malignant Hepatocyte Clones Unveils Immune Evasion Features and Therapeutic Vulnerabilities in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jan, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70181
PMID:41566770
|
研究论文 | 整合单细胞和空间转录组学分析揭示肝细胞癌中恶性肝细胞克隆的时空演化特征、免疫逃逸机制及治疗脆弱性 | 通过整合单细胞和空间转录组学数据，首次系统揭示了Scissor细胞（主要为肝细胞）向恶性细胞演化过程中的免疫逃逸特征和关键信号通路（如MDK-SDC4和COL4A-SDC）驱动机制 | 未提及具体限制 | 探究肝癌发生和进展过程中的多细胞生态系统分子特征 | 肝细胞癌患者样本中的多种细胞类型，特别是Scissor肝细胞及其演化过程中的恶性克隆 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据（单细胞和空间转录组） | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium空间转录组学 |
| 446 | 2026-06-06 |
Single-cell RNA-seq reveals the piperlongumine is a potential drug for ischemic stroke
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0340725
PMID:41575950
|
研究论文 | 使用单细胞RNA测序揭示胡椒碱是缺血性中风的潜在治疗药物 | 首次通过单细胞RNA测序结合Connectivity Map分析和分子对接，发现胡椒碱可通过结合Actb和Cflar编码的蛋白治疗缺血性中风 | 仅基于一个公共单细胞数据集（GSE174574）进行分析，需更多样本验证 | 探索缺血性中风的潜在分子机制和有效治疗药物 | 缺血性中风的细胞类型和分子机制 | 机器学习 | 脑血管疾病，缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 一个公共数据集（GSE174574） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 447 | 2026-06-06 |
AugGCL: Multimodal graph learning for spatial transcriptomics analysis with enhanced gene and morphological data
2026-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013912
PMID:41576146
|
研究论文 | 提出AugGCL框架，通过增强基因和形态学数据的图卷积学习来改进空间转录组学分析 | 采用双流加权图卷积网络联合建模基因特征与图像形态信息，并引入图像感知辅助重建以增强弱空间信号和锐化边界 | 未提及具体局限性 | 提升空间转录组学中空间域重建的准确性和边界清晰度 | 人类背外侧前额叶皮层、乳腺癌和小鼠胚胎的组织样本 | 机器学习， 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 加权图卷积网络 | 基因表达数据和图像数据 | 多个数据集（包括人类背外侧前额叶皮层、乳腺癌和小鼠胚胎） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 448 | 2026-06-06 |
Differential Roles of Notch Receptors in Regulating Activation of Intact Adult Mouse Spinal Cord-Derived NSCs
2026-Jan, Developmental neurobiology
IF:2.7Q3
DOI:10.1002/dneu.70013
PMID:41581227
|
research paper | 研究成年小鼠脊髓来源神经干细胞中Notch受体在调控其激活中的差异角色 | 首次揭示Notch1和Notch2在成年脊髓神经干细胞激活和静息状态中的不同调控作用 | 研究对象仅局限于8周龄C57/BL6小鼠的脊髓神经干细胞，且未涉及体内环境验证 | 探究Notch受体在调控成年脊髓神经干细胞激活中的具体作用机制 | 8周龄C57/BL6小鼠脊髓来源的神经干细胞 | digital pathology | spinal cord injury | single-cell RNA sequencing, lentiviral vector infection, Western blot analysis | NA | single-cell transcriptome data | 8周龄C57/BL6小鼠脊髓来源的神经干细胞 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 449 | 2026-06-06 |
Intrahepatic Lymphangiogenesis Is Associated with Early Post-Hepatectomy Liver Regeneration, in Part via IL-6/STAT3 Signaling
2026, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.106849
PMID:41583514
|
研究论文 | 研究揭示肝内淋巴管生成通过IL-6/STAT3信号通路部分促进肝切除术后早期肝脏再生 | 首次阐明肝内淋巴管生成在肝脏再生中的具体作用及其通过IL-6/STAT3信号通路的机制 | 研究基于小鼠模型，需在人类样本中进一步验证；部分依赖于IL-6/STAT3信号，可能还有其他通路参与 | 探讨肝内淋巴管生成在肝脏再生中的作用及潜在机制 | 肝内淋巴管内皮细胞（LyECs）以及肝切除术后的小鼠肝脏组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，Western blotting，免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型（70%肝切除术后），具体样本量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 450 | 2026-06-06 |
Exploring the Dynamic Changes of Intercellular Connections in Cervical Cancer: Insights From Transcriptomic Data Combined With Single-Cell Sequencing
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/8140041
PMID:41584728
|
研究论文 | 利用转录组数据和单细胞测序探索宫颈癌细胞间连接的动态变化 | 通过单细胞测序揭示宫颈癌上皮细胞亚群间的相互作用，鉴定出低CNV评分的细胞簇，并构建基于标志基因的预后模型，发现COL4A1作为潜在治疗靶点 | 需要进一步验证模型和靶点在更大样本和临床实践中的有效性 | 研究宫颈癌肿瘤微环境中上皮细胞亚群间的相互作用并构建预后模型 | 宫颈癌上皮细胞亚群及其细胞间相互作用 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据和单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 451 | 2026-06-06 |
Unveiling the molecular mechanisms of burn injury through integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0341725
PMID:41592030
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组分析揭示烧伤的分子机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统解析烧伤微环境的细胞图谱，并结合机器学习方法鉴定关键标记基因 | 样本量有限且缺乏实验验证 | 探究烧伤损伤的免疫学微环境及其分子机制 | 烧伤微环境中的细胞亚群，特别是巨噬细胞和其他免疫细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 烧伤 | 单细胞RNA测序, LASSO回归, 随机森林 | UMAP | 基因表达数据 | 9248个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 452 | 2026-06-06 |
Exploring key genes related to air pollutants in polycystic ovary syndrome: A comprehensive analysis from transcriptome and single-cell analysis combined with network toxicology
2026-Jan-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119623
PMID:41601053
|
研究论文 | 结合转录组和单细胞分析以及网络毒理学，探索空气污染物与多囊卵巢综合征相关的关键基因 | 首次整合批量RNA-seq、单细胞RNA-seq数据与空气污染物相关分子靶点，采用差异表达、机器学习、功能富集和分子对接分析，鉴定了ESR2、FAAH和MAOB三个关键基因，并揭示其与污染物诱导内分泌紊乱的关联 | NA | 探讨空气污染物与多囊卵巢综合征的关联机制并识别潜在的分子生物标志物 | 多囊卵巢综合征患者与健康对照的转录组和单细胞数据 | 机器学习 | 多囊卵巢综合征 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 453 | 2026-06-06 |
SpaConTDS: A multimodal contrastive learning framework for identifying spatial domains by applying tuple disturbing strategy
2026-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013893
PMID:41610146
|
research paper | 提出了一种名为SpaConTDS的多模态对比学习框架，通过应用元组扰动策略来识别空间域 | 将强化学习与自监督多模态对比学习相结合，通过数据增强和伪标签元组扰动策略生成正负样本，动态优化模型超参数，无需先验对齐即可整合多个组织切片并校正批次效应 | 未在摘要中明确提及 | 准确识别空间域，探索细胞结构和功能 | 多模态空间转录组学数据 | machine learning | NA | 空间转录组学 | 多模态对比学习框架 | 空间转录组学数据 | NA | NA | spatial transcriptomics | NA | NA |
| 454 | 2026-06-06 |
Associations Between Immune Senescence and Immune Reconstitution Among People Living With HIV Undergoing Antiretroviral Therapy
2026, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/8683624
PMID:42227661
|
研究论文 | 本研究探讨了免疫衰老与HIV感染者接受抗逆转录病毒治疗后免疫重建失败之间的关联 | 首次利用公共单细胞RNA测序数据中SenMayo基因集评分，结合前瞻性队列研究，系统评估了基线免疫衰老特征对ART治疗后免疫重建失败的影响 | 未明确提及，但可能包括样本量有限、观察周期仅为48周、未深入机制验证等 | 探究ART治疗前免疫衰老特征在免疫重建失败中的作用 | 510名开始ART治疗的HIV感染者 | 免疫学 | 艾滋病 | 单细胞RNA测序、免疫表型分析、细胞因子检测、细胞衰老标志物评估 | 逻辑回归 | 基因表达数据、免疫表型数据、细胞因子数据 | 510名HIV感染者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 来源于公共数据库的CD4+ T细胞单细胞RNA测序数据 |
| 455 | 2026-06-06 |
Immune Cell Infiltration and Kynurenine Pathway Activation Define Early Injury and Progression in Diabetic Nephropathy
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.122164
PMID:41608614
|
研究论文 | 整合单细胞RNA测序、体内糖尿病模型和2型糖尿病患者临床样本，研究糖尿病肾病不同阶段免疫炎症动态变化 | 首次揭示CCL4⁺髓源性抑制细胞在早期糖尿病肾病中的主导浸润作用，发现MALAT1维持其功能，并阐明犬尿氨酸途径代谢物与MDSC诱导和不良肾结局的关联 | 未提供明显局限性信息 | 阐明糖尿病肾病进展过程中的免疫炎症动态变化及关键分子机制 | 糖尿病肾病小鼠模型和2型糖尿病患者 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 多个小鼠模型和2型糖尿病患者临床样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 456 | 2026-06-06 |
Integrating network toxicology, machine learning, and single-cell sequencing to reveal the FASN-mediated role of phenolic endocrine disruptors in water in promoting prostate cancer
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0350638
PMID:42228706
|
研究论文 | 整合网络毒理学、机器学习和单细胞测序揭示水中酚类内分泌干扰物通过FASN促进前列腺癌的作用 | 首次利用网络毒理学、机器学习和单细胞测序多维框架，系统揭示酚类内分泌干扰物（NP/OP）通过FASN基因促进前列腺癌的潜在分子机制 | 研究基于计算分析和已有数据集，缺乏实验验证；FASN作为分子枢纽的因果关系仍需进一步实验确认 | 探究水中酚类内分泌干扰物（NP/OP）促进前列腺癌的分子机制 | 前列腺癌相关基因和酚类内分泌干扰物靶点 | 机器学习, 生物信息学, 网络毒理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | ANN, LASSO, SVM-RFE, GSVA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | GSE46602数据集（36个肿瘤样本 vs 14个良性样本），GSE137829数据集（6个前列腺癌样本） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 457 | 2026-06-06 |
The Research Progress of Tumor-Associated Macrophages in Prostate Cancer
2026, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/6287638
PMID:42244152
|
综述 | 文章综述了肿瘤相关巨噬细胞在前列腺癌中的研究进展，包括其促进肿瘤进展和免疫治疗耐药的机制，以及靶向TAMs的精准治疗策略 | 基于单细胞RNA测序细化了TAMs的经典M1/M2分型，提出增殖性TAM和免疫调节性TAM等新亚型，并探讨了巨噬细胞胞外陷阱在转移中的作用 | 靶向治疗面临肿瘤微环境复杂性、TAM异质性、药物生产和递送障碍以及毒性管理等挑战 | 基于患者肿瘤内TAM亚群的组成、功能状态和信号依赖性开发个性化靶向策略，实现从“一刀切”方法向精准医学的转变 | 肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学习教育 | 前列腺癌 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 458 | 2026-06-06 |
Multisystem regulation of reward and addiction: beyond the dopaminergic system
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1840096
PMID:42244883
|
综述 | 综述了奖赏与成瘾的多系统调控机制，超越了多巴胺能系统的单一视角 | 提出奖赏和厌恶应在一个统一的价处理框架下理解，并鉴定出下丘脑被盖核（SVTg）作为新的脑干节点，整合多系统信号 | 未提供具体实验数据，主要基于现有文献的综合分析 | 阐述奖赏和成瘾的多系统、网络基础模型，强调超越多巴胺能系统的调控机制 | 奖赏与成瘾相关神经环路及分子机制 | 机器学习 | 成瘾 | 单细胞转录组学、实时神经影像学、计算精神病学、药物基因组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 459 | 2026-06-06 |
Epigenetic subtypes of high-grade T1 bladder cancer reveal intra-tumor heterogeneity and distinct interactions with tumor microenvironment
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.129729
PMID:42244999
|
研究论文 | 该研究通过整合染色质图谱、单核RNA-seq、免疫组化和空间转录组学，定义了高级别T1期膀胱癌的表观遗传亚型，揭示了肿瘤内异质性及其与肿瘤微环境的相互作用 | 首次通过整合多种技术定义了高级别T1期膀胱癌的表观遗传亚型，并揭示了其与微环境的特异性相互作用及空间分布特征 | 研究中未提及明显的局限性信息 | 定义高级别T1期膀胱癌的表观遗传亚型，表征异质性，并探索肿瘤-微环境相互作用 | 高级别T1期膀胱癌患者肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 批量染色质分析、单核RNA测序、免疫组化、空间转录组学 | NA | 图像、文本 | 未明确说明具体样本数量，但涉及高级别T1期膀胱癌患者 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 460 | 2026-06-06 |
Scalable differentiation of human cardiac organoids from iPSCs generates cardiac tissues for cardiac cell therapy
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.127654
PMID:42245001
|
研究论文 | 本研究提出了一种可扩展的方法，从iPSC分化出心脏类器官，用于心脏细胞治疗，并在猪心肌梗死模型中验证了其移植效果 | 首次在20天内从iPSC分化出含有心肌细胞、心脏成纤维细胞和内皮细胞的成熟心脏类器官，并验证了生物反应器辅助放大策略和猪体内移植可行性 | 仅使用了少量类器官（3500个），且随访时间较短（8-30天），长期效果和安全性需进一步评估 | 开发可扩展的心脏类器官分化技术，用于改善心肌梗死细胞治疗的细胞植入效果 | 人诱导多能干细胞（iPSC）衍生的心脏类器官 | 数字病理学 | 心血管疾病 | NA | NA | 图像 | 3500个心脏类器官，移植到猪心肌梗死模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |