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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2026-08-16 |
Identification and validation of circadian rhythm and astrocyte-associated diagnostic and therapeutic model for cirrhosis encephalopathy patients via integrative bioinformatic pipelines and in vitro validation
2026, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2026.1897110
PMID:42597533
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研究论文 | 通过综合生物信息学流程和体外验证,识别并验证了与昼夜节律和星形胶质细胞相关的肝硬化脑病诊断和治疗模型 | 首次整合昼夜节律紊乱和星形胶质细胞功能障碍,揭示了它们在肝硬化脑病发病机制中的协同作用,并利用人工智能药物筛选框架发现潜在治疗化合物 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据,体外验证仅使用细胞系,缺乏体内实验和临床样本的进一步验证 | 识别与昼夜节律和星形胶质细胞相关的肝硬化脑病诊断和治疗的分子靶点 | 肝硬化脑病患者及认知障碍患者的转录组和单细胞数据 | 生物信息学 | 肝硬化脑病 | RNA测序、单细胞RNA测序 | 随机森林 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 多个公共数据集,包括GSE41919、GSE53808、GSE184220、GSE149741和GSE163577,具体样本数量未明确 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 422 | 2026-08-16 |
FN1 governs global protein lactylation in acute myocardial infarction: a metabolic-epigenetic axis driving cardiac injury and impeding stem cell repair
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1897810
PMID:42597643
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研究论文 | 本研究揭示纤维连接蛋白1(FN1)在急性心肌梗死中调控全局蛋白质乳酸化,通过代谢-表观遗传轴驱动心脏损伤并阻碍干细胞修复 | 首次发现FN1作为蛋白质乳酸化的关键上游调控因子,连接代谢应激与表观遗传修饰,并揭示靶向FN1-乳酸化轴结合干细胞治疗的新策略 | 研究主要基于细胞和动物模型,需要进一步临床验证;FN1的经典功能(如纤维化)可能独立于乳酸化作用,需深入区分 | 识别急性心肌梗死中蛋白质乳酸化的核心调控因子,并开发微环境重编程策略以增强干细胞治疗 | 急性心肌梗死患者转录组数据、氧糖剥夺细胞模型、小鼠梗死模型、人子宫内膜间充质干细胞 | 机器学习、单细胞RNA测序 | 急性心肌梗死 | 转录组测序、单细胞RNA测序、机器学习、基因沉默、乳酸补充 | 机器学习算法、单细胞RNA测序分析方法 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 急性心肌梗死患者样本及小鼠模型(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 423 | 2026-08-16 |
APOE-associated lipid-handling macrophages in hepatocellular carcinoma: ligand-receptor communication and host Apoe-linked myeloid remodeling
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1902143
PMID:42598100
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研究论文 | 本研究分析了10例肝细胞癌患者的配对肿瘤及邻近肝组织单细胞转录组数据,发现APOE相关脂质处理巨噬细胞在肿瘤中富集,并探讨了其配体-受体通讯及宿主Apoe连锁的髓系重塑。 | 首次在肝细胞癌中系统表征APOE阳性脂质处理巨噬细胞,并利用CellChat推断其介导的配体-受体相互作用,结合多种小鼠模型验证宿主Apoe缺陷对肿瘤微环境的影响。 | 研究主要基于单细胞转录组数据,缺乏蛋白质水平的验证;小鼠模型与人类HCC的差异可能限制结论的普适性;未深入探讨APOE信号通路的分子机制。 | 探究肝细胞癌中脂质处理巨噬细胞的状态富集及其与配体-受体通讯和肿瘤微环境重塑的关系,并验证宿主Apoe的作用。 | 10例肝细胞癌患者的肿瘤和邻近肝组织、Hepa1-6皮下肿瘤模型、Nras-Myc驱动的肝肿瘤模型、骨髓来源巨噬细胞。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | CellChat、模块评分 | 单细胞转录组数据 | 10例患者的配对样本;小鼠模型若干 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 424 | 2026-08-16 |
Nfe2l2-knockout mouse model exhibits oxidative stress-associated stromal degeneration and inflammatory activation resembling keratoconus pathology
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.21613
PMID:42598590
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研究论文 | 本研究利用CRISPR/Cas9技术生成Nfe2l2基因敲除小鼠模型,发现其角膜呈现与圆锥角膜相似的氧化应激相关基质变性和炎症激活特征 | 首次建立了NRF2缺失与圆锥角膜病理学关联的体内小鼠模型,并利用全角膜单细胞RNA测序揭示多种细胞类型的变化及细胞间信号重塑 | 摘要未提及具体局限性,如模型仅模拟部分病理特征,或需进一步验证人类相关性 | 探究NRF2缺失如何驱动氧化应激和炎症反应,导致角膜基质退化及神经改变,并验证NRF2激活剂RTA-408的潜在治疗效果 | Nfe2l2基因敲除小鼠的角膜组织,包括上皮、基质、神经及免疫细胞 | 数字病理学 | 圆锥角膜 | CRISPR/Cas9基因敲除、单细胞RNA测序、光学相干断层扫描、组织学、免疫荧光、透射电子显微镜、活性氧检测 | 基因敲除小鼠模型 | 图像、基因表达数据、组织学数据 | 4个月大的Nfe2l2敲除小鼠与对照小鼠,具体数量未在摘要中指明 | NA | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序,使用Seurat和CellChat进行数据分析 |
| 425 | 2026-08-16 |
ArchetypeShift: An R Package Integrating KEGG-Informed Pathway Analysis and IPA-Derived Functional Predictions for Validation of Single-Cell Archetypes
2026, Bioinformatics and biology insights
IF:2.3Q3
DOI:10.1177/11779322261477368
PMID:42591774
|
研究论文 | ArchetypeShift是一个R包,整合KEGG通路分析和IPA功能预测,用于验证单细胞RNA测序数据中的功能原型 | 整合现有原型分析方法与IPA和KEGG注释,提供一体化分析框架,自动化生成多种图形和轨迹分析,简化生物学解释 | 未提及 | 简化单细胞RNA测序数据中功能原型的分配和注释过程,提高效率 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 原型分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 426 | 2026-08-16 |
Regulatory effects of smoking cessation on the cellular microenvironment and differentially expressed genes in precancerous lesions of pulmonary nodules in mice based on single-cell RNA sequencing and immune repertoire-sequencing
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0356148
PMID:42594102
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序和免疫组库测序,探讨戒烟对小鼠肺结节癌前病变细胞微环境和差异表达基因的调控作用 | 首次利用单细胞RNA测序和免疫组库测序技术,在B[a]P诱导的小鼠肺结节癌前病变模型中,系统揭示戒烟(B[a]P撤除)对免疫细胞组成、信号通路和基因表达的调控机制 | 研究仅在动物模型中进行,尚未在人类样本中验证;且观察时间仅为8周,长期效果未知 | 阐明戒烟影响肺结节癌前病变发展的调控机制,为其临床益处提供机制见解 | B[a]P诱导的肺结节癌前病变小鼠模型 | 单细胞测序, 转录组学, 免疫组库测序 | 肺癌, 肺结节癌前病变 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 免疫组库测序(IR-seq), 微MRI, H&E染色 | 不适用 | 单细胞基因表达数据, 免疫组库序列数据, 影像数据, 组织病理图像 | 小鼠模型,具体样本数量未提供 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫组库测序 | NA | NA |
| 427 | 2026-08-14 |
Epithelial cell-based multi-omics integration identifies SPINK5 and SRI as novel diagnostic biomarkers for ulcerative colitis
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1797539
PMID:42358364
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,结合多种机器学习算法,识别出SPINK5和SRI作为溃疡性结肠炎的新型诊断生物标志物,并在临床样本中进行实验验证 | 首次从上皮细胞特异性角度整合多组学数据,利用四种机器学习算法交叉验证,确定SPINK5和SRI为UC的稳健诊断标志物,并通过多种实验方法在临床组织中验证其表达变化 | 研究基于公共数据集和有限临床样本,未进行大规模前瞻性验证,且免疫微环境分析采用估算方法(CIBERSORT),可能存在偏差 | 识别溃疡性结肠炎中上皮细胞来源的可靠诊断生物标志物,并评估其与免疫微环境的关系 | 溃疡性结肠炎患者的肠道上皮细胞和临床组织样本 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序、批量转录组测序 | LASSO、随机森林、支持向量机、K近邻 | 基因表达数据 | 多个公共数据集和若干临床UC组织样本(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 428 | 2026-08-14 |
Understanding the immune microenvironment of ovarian cancer
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1837496
PMID:42358534
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在揭示卵巢癌免疫微环境方面的进展,重点关注CD8 T细胞耗竭和免疫抑制机制,为精准免疫治疗提供转化框架 | 强调单细胞分辨率解析肿瘤免疫微环境中的免疫抑制屏障,揭示终末耗竭T细胞来自可塑性祖细胞群(如GZMK亚群),并阐明腹水作为免疫调节储库的作用 | 摘要中未提及具体局限性 | 总结单细胞RNA测序驱动的卵巢癌肿瘤免疫微环境研究进展,为精准免疫治疗策略提供依据 | 卵巢癌肿瘤免疫微环境中的免疫细胞,特别是CD8 T细胞、髓系细胞和淋巴样细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 429 | 2026-08-14 |
PRDM1 Drives a TIM3+ Macrophage Immunosuppressive Niche via LGALS9 Signaling in Prostate Cancer Progression
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.079316
PMID:42358835
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研究论文 | 本研究通过整合公共单细胞RNA-seq数据集,揭示了PRDM1驱动的TIM3+巨噬细胞免疫抑制微环境在前列腺癌进展中的作用,并验证了LGALS9-TIM3信号轴作为潜在治疗靶点 | 首次在前列腺癌中明确TIM3作为微环境检查点的髓系定位,并鉴定PRDM1为TIM3高表达巨噬细胞的上游转录调控因子,同时发现LGALS9-TIM3正反馈环路促进免疫抑制表型 | 主要基于公共数据集和体外实验,缺乏体内模型验证;未探讨TIM3阻断在联合治疗中的具体效果 | 阐明前列腺癌微环境中髓系检查点TIM3的谱系定位和调控机制,并评估其作为治疗靶点的潜力 | 前列腺癌微环境中的单核细胞/巨噬细胞,特别是TIM3高表达肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀-定量PCR、荧光素酶报告基因实验 | 不适用 | 基因表达数据、表观遗传数据 | 多个公共单细胞RNA-seq数据集(包括原发、转移性激素敏感和去势抵抗性前列腺癌)及TCGA-PRAD和独立队列(具体样本量未提供) | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 430 | 2026-08-14 |
The postpartum uterus reveals compartment-specific remodeling processes with distinct immune signatures
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1824792
PMID:42358955
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研究论文 | 本研究分析了产后子宫的区室特异性重塑过程及其免疫特征,揭示了肌层、内膜和子宫系膜三角区的独特重构机制。 | 首次通过单细胞RNA测序和动物模型,明确了产后子宫不同解剖区室(肌层、内膜、子宫系膜三角)的重塑过程及其独特的免疫细胞分布,特别是CD206neg巨噬细胞在损伤区域的浸润和胶原包膜对炎症的限制作用。 | 研究主要基于公开数据和动物模型,未直接验证人体组织中的免疫保护机制,且未完全阐明炎症消退与纤维化预防的因果关系。 | 探究产后子宫修复过程中不同区室的重塑机制及免疫微环境的作用,以理解组织再生与过度纤维化的平衡。 | 人类产后第7天和非妊娠个体的肌层单细胞RNA-seq数据,以及同种异体交配和未交配的C57/BL6雌性小鼠的子宫组织。 | 数字病理学 | 产后子宫修复相关疾病(如纤维化) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、免疫组织化学、免疫荧光、定量实时聚合酶链反应 | NA | 单细胞转录组数据、组织图像、基因表达数据 | 人类非妊娠和产后第7天的肌层样本(具体数量未说明),以及小鼠子宫组织(数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 431 | 2026-08-14 |
Cytotoxic lymphocyte heterogeneity in glioblastoma: insights from single-cell and spatial multiomics toward precision immunotherapeutic reprogramming
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1837084
PMID:42358950
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综述 | 这篇综述整合了单细胞和空间多组学数据,探讨胶质母细胞瘤中细胞毒性淋巴细胞的异质性及其免疫抑制机制,并提出了精准免疫治疗策略。 | 创新性地从单细胞和空间多组学角度,系统比较CD8 T细胞和自然杀伤细胞的耗竭机制差异,并提出针对中枢神经系统肿瘤微环境的空间和细胞解析的精准免疫治疗框架。 | 由于是综述,未提供原始实验数据,且所引用的研究主要基于有限样本,可能无法全面代表胶质母细胞瘤的异质性。 | 旨在阐明胶质母细胞瘤中细胞毒性淋巴细胞异质性的免疫学机制,并为开发针对性的精准免疫治疗提供理论基础。 | 胶质母细胞瘤中的细胞毒性淋巴细胞(包括CD8 T细胞和自然杀伤细胞)及其肿瘤微环境。 | 单细胞组学、空间转录组学、免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、空间多组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 432 | 2026-08-14 |
A Novel CAF-Related Signature for Precise Prediction of Clinical Outcomes and Immunotherapy Response for Breast Cancer Patients: Based on Multiomics Analyses and Experimental Validation
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/9934495
PMID:42359574
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研究论文 | 开发了一种基于癌症相关成纤维细胞(CAFs)的基因签名,通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,预测乳腺癌患者的临床结局和免疫治疗反应,并进行了实验验证。 | 首次整合单细胞RNA测序与批量RNA测序数据,构建包含11个基因的CAF相关风险评分模型,用于预测乳腺癌预后和免疫治疗反应,并通过多种实验方法验证了高风险基因的表达及CAF丰度与CD8+ T细胞浸润的相关性。 | 仍需在大型多中心队列中进一步验证,并扩展到其他恶性肿瘤以促进临床转化应用。 | 开发CAF相关基因签名,以预测乳腺癌患者的临床结局和免疫治疗反应,探索CAF在肿瘤微环境中的作用机制。 | 乳腺癌患者,包括来自TCGA和GEO数据库的基因表达谱和临床数据,以及临床乳腺癌组织样本。 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA-seq,qPCR,免疫组织化学(IHC),多重免疫荧光(mIF),Western blot | Cox回归,LASSO回归,风险评分模型 | 基因表达数据,临床数据,组织样本 | 未明确指定具体样本数量,包括TCGA和GEO数据库中的乳腺癌患者数据及临床组织样本。 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,qPCR,免疫组织化学,多重免疫荧光,免疫印迹 | NA | NA |
| 433 | 2026-08-14 |
Integrated NEK7-inflammasome and platelet transcriptomic signature generates mechanistic hypotheses in heart failure
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0352124
PMID:42361012
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研究论文 | 通过整合人类心力衰竭样本的 bulk RNA-Seq 和 scRNA-Seq 数据,识别与 NEK7 炎症小体和血小板活化相关的四基因特征,并生成心脏纤维化的发病机制假说 | 首次将 NEK7 炎症小体、血小板活化和心脏纤维化联系起来,通过整合转录组数据和机器学习方法识别新的四基因特征,并结合分子对接预测潜在治疗化合物 | 初步判别模型需在前瞻性多中心队列中进一步验证,部分基因(如 ISLR)在小鼠模型中表达增加不显著 | 探索心力衰竭中 NEK7 炎症小体、血小板活化和心脏纤维化之间的转录组关联,生成发病机制假说 | 人类心力衰竭样本和血管紧张素II诱导的小鼠心力衰竭模型 | 生物信息学 | 心力衰竭 | RNA-seq, 单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 分子对接 | LASSO, SVM-RFE, WGCNA | 转录组数据(bulk和单细胞) | 多个公共数据集(GSE116250, GSE57338, GSE183852)及小鼠模型样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 434 | 2026-08-14 |
Integrated single-cell RNA sequencing and Bulk-RNA technologies reveal the immunological characteristics of lactylation related-genes in glioblastoma
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0351849
PMID:42361107
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示胶质母细胞瘤中乳酸化相关基因的免疫特征,并构建预后模型 | 首次利用单细胞与批量测序整合分析,聚焦乳酸化修饰相关基因在胶质母细胞瘤中的免疫微环境特征,并构建预后模型及验证关键基因CD93的功能 | 研究主要基于公共数据库和细胞实验,缺乏临床样本验证及体内实验数据,且预后模型的临床适用性需进一步评估 | 探索乳酸化相关基因在胶质母细胞瘤中的免疫特征及预后价值,并构建预后模型 | 胶质母细胞瘤组织样本、细胞系U87和U251,以及多组学数据(TCGA和GEO队列) | 生物信息学、机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 包含TCGA和GEO队列(GSE141383, GSE162631)的批量转录组数据及单细胞RNA测序数据,细胞实验使用U87和U251细胞系 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 435 | 2026-08-14 |
Identification of Chemokine-Related Genes Derived From T and NK Cells in the Tumour Microenvironment of Ovarian Cancer Based on scRNA-Seq
2026 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70069
PMID:42362198
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据,识别卵巢癌肿瘤微环境中T细胞和NK细胞来源的趋化因子相关基因,并分析其表达和功能 | 首次通过单细胞RNA测序数据系统识别卵巢癌微环境中T细胞和NK细胞来源的趋化因子相关关键基因,并结合细胞通讯、伪时间分析和转录因子调控网络等多维度分析 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据,缺乏更大队列的临床验证;功能实验仅涉及免疫组化和伤口愈合实验,未进行体内实验验证 | 筛选卵巢癌微环境中T细胞和NK细胞来源的趋化因子相关基因,为卵巢癌治疗提供新见解 | 卵巢癌肿瘤微环境中的T细胞、NK细胞及趋化因子相关基因 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 436 | 2026-08-14 |
Antigen-scaffolds loaded with hyper-stable neoleukin-2/15 expand antigen-specific T cells with a favorable phenotype for adoptive cell therapy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1804678
PMID:42367764
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研究论文 | 该研究比较了负载超稳定Neoleukin-2/15的抗原支架与IL2/IL21支架在体外扩增抗原特异性T细胞的效果,发现前者能产生具有更优表型的细胞,适用于过继细胞疗法 | 首次将超稳定Neoleukin-2/15工程细胞因子整合到人工抗原呈递支架中,通过选择性信号传导增强CD8+ T细胞增殖并限制调节性T细胞扩增,从而改善体外扩增T细胞的功能质量 | 未提及 | 评估Ag-Neo2/15支架在过继细胞疗法中体外扩增抗原特异性T细胞的效果,优化平衡扩增能力与持久效应功能 | 抗原特异性CD8+ T细胞 | 免疫治疗 | 癌症 | 单细胞测序, TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 未具体说明平台配置 |
| 437 | 2026-08-14 |
Deciphering immune-inflammatory dysregulation in the endometriotic microenvironment: insights from single-cell omics and artificial intelligence
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1848643
PMID:42367786
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综述 | 本文综述了单细胞组学和人工智能在解析子宫内膜异位症微环境中免疫炎症失调方面的最新研究进展 | 将单细胞组学技术与人工智能方法结合,系统分析了子宫内膜异位症微环境中多种免疫细胞亚群的异质性和功能失调,并探讨了AI在生物标志物发现、药物重定位和网络药理学中的应用 | 临床转化仍面临实际限制,具体局限性未在摘要中详细说明 | 总结单细胞组学和人工智能在解析子宫内膜异位症微环境中免疫炎症失调方面的最新研究,并评估其临床应用的潜在价值 | 子宫内膜异位症微环境中的免疫细胞,包括巨噬细胞、自然杀伤细胞、T细胞、B细胞、树突状细胞和肥大细胞 | 单细胞组学、人工智能 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、质谱流式细胞术、多组学整合 | 单细胞基础模型、深度学习、大型语言模型 | 单细胞组学数据、空间转录组数据、质谱流式数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、质谱流式细胞术 | 不适用 | 不适用 |
| 438 | 2026-08-14 |
Nucleo-mitochondrial asymmetry profiles the proliferative engine and spatial niche reconstruction in clear cell renal cell carcinoma
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1838182
PMID:42367801
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研究论文 | 本研究通过多组学方法识别出透明细胞肾细胞癌中核线粒体表达不对称性(NMA)的恶性亚群,揭示其作为增殖引擎和空间生态位重塑的作用,并验证了MT-CO1作为预后标志物的潜力 | 首次定义并表征核线粒体表达不对称性(NMA)作为ccRCC进展的标志,结合单细胞、空间转录组和质谱成像多组学揭示其机制,并提供MT-CO1作为临床可操作的预后标志物 | 未提及明显局限性 | 阐明NMA在ccRCC肿瘤异质性和空间重构中的角色,并探索其临床预后价值 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤组织及转移灶中的恶性细胞亚群 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,质谱成像,免疫组化 | 高斯混合模型,CytoTRACE 2,scFEA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,质谱成像代谢组数据,免疫组化图像 | TJ-RCC队列及独立队列53例患者 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 439 | 2026-08-14 |
Immunological profiling of rheumatoid factor-positive primary Sjögren's syndrome by single-cell RNA sequencing
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1822615
PMID:42367820
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序对类风湿因子阳性原发性干燥综合征患者进行免疫学特征分析,揭示了RF状态相关的特定免疫细胞谱。 | 首次利用scRNA-seq对RF阳性和阴性pSS患者进行全面的免疫细胞亚群、BCR/TCR库及细胞间通讯的比较分析,提供了RF状态作为pSS免疫异质性分层标志的新见解。 | 样本量较小,且研究仅基于外周血单个核细胞,未涵盖其他组织如唾液腺,可能限制结论的普适性。 | 阐明RF阳性pSS患者的潜在生物学机制,包括免疫细胞组成、功能状态和受体库特征。 | 3名健康对照、6名RF阴性pSS患者和6名RF阳性pSS患者的外周血单个核细胞。 | 单细胞组学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 15名受试者的外周血单个核细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 440 | 2026-08-14 |
Systems-level analyses and clinical validation highlight CD53 as a diagnostic and prognostic marker in lung adenocarcinoma
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1806566
PMID:42368459
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研究论文 | 通过系统级分析和临床验证,发现CD53在肺腺癌中下调,并可作为诊断和预后的潜在生物标志物 | 整合多个GEO数据集并进行批次校正,结合机器学习、单细胞RNA-seq、孟德尔随机化和共定位分析,首次强调CD53作为肺腺癌免疫微环境相关的诊断和预后标志物,并通过IHC和PCR临床验证 | 共定位分析未支持CD53与肺腺癌之间的共享因果变异,且CD53的直接肿瘤抑制功能需进一步机制研究 | 评估CD53在肺腺癌中的表达水平及其作为诊断和预后标志物的潜力,并探索其与免疫浸润的关系 | 肺腺癌患者的肿瘤组织和相邻正常组织样本,以及多个公共转录组数据集 | 机器学习和数字病理学 | 肺腺癌 | 转录组测序,单细胞RNA-seq,免疫组化,PCR,孟德尔随机化 | Elastic Net | 基因表达数据和临床病理数据 | 30对肺腺癌及相邻正常组织样本,以及多个GEO和TCGA数据集 | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |