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当前共找到 1426 篇文献,本页显示第 381 - 400 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
381 2026-02-21
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals ISG15 as a Key Regulator of Macrophage-Mediated Inflammation Driving Primary Sjögren's Syndrome Progression
2026, Critical reviews in immunology IF:0.8Q4
研究论文 本研究通过整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq分析,揭示了ISG15作为原发性干燥综合征中巨噬细胞介导炎症的关键调节因子 结合批量转录组学、单细胞转录组学和机器学习算法,系统识别了pSS中的免疫代谢生物标志物,并首次在体外验证了ISG15在巨噬细胞炎症反应中的关键作用 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;体外实验仅使用THP-1细胞系,可能无法完全反映体内复杂微环境 识别原发性干燥综合征的诊断生物标志物并表征单核-巨噬细胞分化轨迹 原发性干燥综合征患者的唾液腺细胞 数字病理学 自身免疫性疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq LASSO回归, SVM-RFE, 随机森林 转录组数据 42,157个唾液腺细胞 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
382 2026-02-21
Single-Cell Sequencing Combined with RNA Sequencing Reveals the Role of Natural Killer Cells in Prognosis and Immunotherapy Response in Cervical Squamous Cell Carcinoma
2026, Critical reviews in immunology IF:0.8Q4
研究论文 本研究结合单细胞测序和RNA测序,揭示了自然杀伤细胞在宫颈鳞状细胞癌预后和免疫治疗反应中的作用 整合单细胞测序和RNA测序数据,识别高活性NK细胞及其相关基因,并构建基于六种关键基因的预后风险模型 NA 阐明高活性NK细胞相关基因在CSCC预后和免疫治疗中的潜在价值 宫颈鳞状细胞癌患者 数字病理学 宫颈鳞状细胞癌 单细胞测序, RNA测序 Cox回归, LASSO回归 转录组数据, 单细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
383 2026-02-21
DeepCE: a deep learning framework for correlation-enhanced gene regulatory network inference in single-cell RNA sequencing data
2026, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 本文提出了一种名为DeepCE的深度学习框架,用于增强单细胞RNA测序数据中的基因调控网络推断 DeepCE通过整合双向门控循环单元和卷积神经网络,强化了动态调控的提取,能捕获时间依赖性和局部空间模式,从而提高基因调控网络推断的准确性和鲁棒性 NA 开发一种新的深度学习算法,以增强单细胞RNA测序数据中基因调控网络推断的有效性和可靠性 小鼠和人类数据集中的单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 双向门控循环单元, 卷积神经网络 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
384 2026-02-21
Integrated single-cell and transcriptomic profiling identifies machine-learning-based pyroptosis biomarkers in IBD
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和转录组分析,识别了IBD中基于机器学习的焦亡生物标志物 结合单细胞RNA-seq和批量转录组数据,利用多种机器学习方法识别了IBD中焦亡相关的关键诊断基因 研究主要基于现有数据,未进行实验验证,且样本来源可能有限 识别IBD中焦亡相关的关键细胞类型和调控基因,并开发非侵入性诊断生物标志物 IBD患者的肠道黏膜单细胞RNA-seq数据和批量外周血转录组数据 机器学习 炎症性肠病 单细胞RNA-seq, 转录组分析 LASSO, GBM, SVM, Boruta, Random Forest RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
385 2026-02-21
UNC93B1 promotes pancreatic cancer progression through modulation of cGAS-STING signaling
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,揭示了UNC93B1通过抑制cGAS-STING信号通路促进胰腺癌进展的机制 首次将GWAS、空间转录组学与单细胞转录组学整合,系统性地将遗传易感性映射到单细胞数据,并利用机器学习框架识别出UNC93B1作为关键驱动基因,阐明了其通过抑制cGAS-STING通路促进肿瘤进展的新机制 研究主要基于体外细胞系和异种移植模型,缺乏体内免疫微环境的全面验证;临床样本量相对有限;cGAS-STING通路下游的具体效应分子网络有待进一步解析 阐明胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境(TME)的遗传决定因素,识别核心分子驱动因子,并为开发精准治疗策略提供依据 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本、PDAC细胞系(PANC-1, BxPC-3, Capan-1, SW1990)及小鼠异种移植模型 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 全基因组关联研究(GWAS), 批量转录组测序, qPCR, 流式细胞术 LASSO回归, 随机森林, 支持向量机 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 基因组数据, 蛋白质组数据, 临床生存数据 22个PDAC样本的单细胞RNA-seq数据, 172例TCGA-PAAD生存数据, 196,187例GWAS数据, 4种PDAC细胞系 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
386 2026-02-21
Single-cell and spatial transcriptomics reveal transplant-associated T cells and myeloid cells in human liver transplantation
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示了人类肝移植中移植相关T细胞和髓系细胞的动态变化及空间分布 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统解析肝移植排斥反应中免疫细胞的亚群特征、功能状态和空间定位 样本量相对有限,且主要关注移植后早期阶段,长期动态变化和临床治疗应用仍需进一步验证 探究肝移植排斥反应中肝内免疫细胞的动态变化和空间分布机制 人类肝移植患者的移植肝组织样本 数字病理学 肝移植排斥反应 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 多阶段人类肝移植的移植组织样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
387 2026-02-21
ScRNA-seq Identifies High CXCL8 Linked to Liver Fibrosis in HBeAg-negative Chronic Hepatitis B Patients With Low HBsAg
2026, Gastro hep advances
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现,在HBeAg阴性慢性乙型肝炎患者中,低HBsAg水平与高CXCL8表达相关,且与肝纤维化程度增加有关 首次在低HBsAg水平的HBeAg阴性慢性乙型肝炎患者中,通过单细胞RNA测序揭示了CXCL8在血浆、外周和肝内单核-巨噬细胞群体中的高表达与肝纤维化的关联,并识别了独特的CD8 T细胞簇 样本量较小(仅35名患者,其中6名进行单细胞RNA测序),且为单中心研究,可能限制结果的普遍性 探讨CXCL8在HBeAg阴性慢性乙型肝炎患者肝纤维化中的作用,特别是在不同HBsAg水平下的表达差异 HBeAg阴性、未接受治疗的慢性乙型肝炎患者,根据HBsAg水平分为低(<2000 IU/mL)和高(>2000 IU/mL)两组 单细胞组学 慢性乙型肝炎 单细胞RNA测序,组织病理学分析,血浆细胞因子分析 NA 单细胞RNA测序数据,血浆细胞因子数据,组织病理学数据 35名患者(12名低HBsAg,23名高HBsAg),其中6名进行单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA-seq NA NA
388 2026-02-21
Changes in the brain [NAD+]/[NADH] and [NADPH]/[NADP+] with aging and anti-aging dietary restriction
2026, Frontiers in aging neuroscience IF:4.1Q2
研究论文 本研究探讨了小鼠和人类大脑中NAD+/NADH和NADPH/NADP+比值随衰老和抗衰老饮食限制的变化,并分析了相关代谢通路 揭示了不同小鼠品系(C57BL/6J vs C57BL/6N)和人类大脑在衰老过程中呈现相反的氧化还原变化,并比较了禁食与生酮饮食对脑氧化还原状态的不同影响 研究主要基于代谢物比值作为间接指标,未直接测量NAD+/NADH和NADPH/NADP+的绝对浓度,且人类数据可能有限 探究大脑氧化还原状态在衰老过程中的变化机制及饮食干预(如禁食和生酮饮食)的影响 C57BL/6J和C57BL/6N小鼠大脑、人类大脑 NA 衰老相关疾病 单细胞RNA测序、批量RNA测序、蛋白质组学分析 NA 代谢物数据、转录组数据、蛋白质组数据 未明确指定样本数量,涉及小鼠和人类大脑数据 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
389 2026-02-21
Association of Increased Nasal Fluids-Serum Concordance of Protein Profile with Prognosis in Nasal Polyps
2026, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究首次探讨了鼻液与血清蛋白质谱一致性作为鼻息肉术后复发的预测指标 首次提出并验证了鼻液与血清蛋白质谱一致性作为鼻息肉术后复发的整合预后标志物 样本量相对较小(54例患者),且随访时间至少为6个月,可能影响长期复发预测的准确性 预测鼻息肉术后复发,通过多室分析提供更整合的预后标志 54名鼻息肉患者(包括18名复发和36名未复发)的鼻液和血清样本 数字病理学 鼻息肉 邻近延伸分析(PEA)、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq(scRNAseq)、免疫荧光、公共数据库分析 NA 蛋白质组学数据、RNA-seq数据、免疫荧光图像 54名鼻息肉患者 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
390 2026-02-20
The Effects of Hypertension on Signaling Dynamics in Rare Renal Cell Types
2026-Jan-26, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析高血压对小鼠肾脏中罕见细胞类型(淋巴管内皮细胞、髓系免疫细胞和支持细胞)信号动态的影响 首次在高血压模型中系统比较了肾脏罕见细胞类型间的基线信号传导差异,并发现了一种新型多能性支持细胞群体 研究基于小鼠模型,尚未在人体样本中验证;信号网络分析为计算预测,需要实验验证 探究高血压对肾脏罕见细胞类型信号传导动态的影响机制 小鼠肾脏中的淋巴管内皮细胞、髓系免疫细胞和新发现的支持细胞 单细胞组学 高血压相关肾损伤 单细胞RNA测序 NicheNet信号网络分析 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,但包含血管紧张素II诱导和盐敏感性两种高血压模型小鼠及其对照组 NA 单细胞RNA测序 NA NA
391 2026-02-20
Single-cell transcriptomics uncover RNF130-mediated TNF-α pathway activation and worenine synergy with paclitaxel in breast cancer
2026-Jan-24, Clinical epigenetics IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了RNF130在乳腺癌中通过激活TNF-α通路促进肿瘤进展,并发现中药成分沃瑞宁与紫杉醇具有协同抗肿瘤作用 首次系统性地揭示了E3泛素连接酶RNF130在TNBC中的具体功能和分子机制,特别是通过单细胞转录组学发现其在恶性上皮细胞群中的富集以及与肿瘤免疫逃逸表型的关联,并创新性地筛选了中药成分沃瑞宁作为RNF130的靶向抑制剂 研究主要基于数据库分析和体外/体内实验,缺乏大规模临床样本验证,且沃瑞宁的具体作用机制和安全性需进一步探索 探究RNF130在三阴性乳腺癌中的表达模式、预后意义、分子机制及其作为治疗靶点的潜力 三阴性乳腺癌细胞、小鼠模型、TCGA和GEO数据库中的转录组数据、单细胞RNA测序数据 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序、转录组数据分析、体外细胞实验、体内小鼠模型 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 多个乳腺癌样本及其肝转移样本的单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
392 2026-01-26
Single-cell sequencing analysis and machine learning model reveal aberrant TIM-3 expression in microglia during Alzheimer's disease progression
2026-Jan-24, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
393 2026-02-20
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Commensal Microbes Amplify Sex-Specific Immune Programming in the Murine Lung
2026-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序揭示了共生微生物如何放大小鼠肺部性别特异性免疫编程 首次探索了共生微生物在塑造性别特异性肺部免疫中的作用,并揭示了微生物暴露如何放大固有的免疫性别二态性 研究仅在小鼠模型中进行,结果需在人类中进一步验证;未具体鉴定影响性别差异的关键微生物种类 探究共生微生物在塑造性别特异性肺部免疫中的作用机制 雄性及雌性小鼠的肺部免疫细胞 单细胞组学 呼吸系统疾病 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 雄性及雌性小鼠,分别在SPF(无特定病原体)和GF(无菌)条件下饲养 NA 单细胞RNA-seq NA NA
394 2026-02-20
zDUR: reference-free FASTQ compressor with high compression ratio and speed
2026-Jan-23, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 本文介绍了一种名为zDUR的无参考FASTQ压缩器,旨在高效处理来自不同平台和测序数据类型的新一代测序数据 zDUR在压缩比和速度之间实现了良好的整体平衡,并在单细胞RNA-seq和空间转录组学数据集上表现出显著的运行时性能提升 NA 开发一种高效且可扩展的无参考FASTQ压缩器,以减轻存储和传输负担 FASTQ数据,包括核苷酸序列、质量分数和读取标识符 机器学习 NA 高通量测序 NA FASTQ文件 15个代表性数据集,涵盖四种测序数据类型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
395 2026-02-20
Integrative microRNA and transcriptome analysis reveals sex-specific molecular divergence in human bladder cancer
2026-Jan-23, Biology of sex differences IF:4.9Q1
研究论文 本研究通过整合miRNA和转录组分析,揭示了人类膀胱癌中性别特异的分子差异及其调控机制 首次系统性地结合bulk mRNA/miRNA表达、生存模型和单细胞转录组分析,揭示了膀胱癌性别差异主要由常染色体基因的转录后调控驱动,而非性染色体剂量效应,并发现了与生存相关的性别特异性调控互作 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步实验验证所识别的调控机制;单细胞数据样本量相对有限 识别膀胱癌中性别特异的分子特征和调控互作,以阐明肿瘤生物学和临床结局性别差异的生物学机制 人类膀胱癌组织样本 生物信息学 膀胱癌 bulk mRNA测序, microRNA测序, 单细胞RNA-seq 差异表达分析, Kaplan-Meier生存分析, Cox比例风险模型 基因表达数据, 生存数据 数据来源于TCGA、GEO和GSA数据库,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
396 2026-02-20
Senescence-induced endothelial-to-mesenchymal transition accelerates the subretinal fibrosis in neovascualr age-related macular degeneration
2026-Jan-22, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究探讨了衰老诱导的内皮-间质转化在新生血管性年龄相关性黄斑变性中加速视网膜下纤维化的机制 首次通过单细胞RNA测序数据揭示了衰老脉络膜毛细血管内皮细胞在视网膜下纤维化中的作用,并验证了衰老与内皮-间质转化的关联 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未在人类患者中进行直接验证 研究衰老内皮细胞如何通过内皮-间质转化促进新生血管性年龄相关性黄斑变性中的视网膜下纤维化 脉络膜毛细血管内皮细胞、Brown-Norway大鼠、INK-ATTAC小鼠、C57BL/6J小鼠、人脐静脉内皮细胞 数字病理学 年龄相关性黄斑变性 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 年轻(2-3个月)和老年(18个月)C57BL/6J小鼠,激光诱导纤维化模型的Brown-Norway大鼠和INK-ATTAC小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
397 2026-02-20
Identification of Lupus Immune Complex-Driven Pathogenic Pro-inflammatory Monocytes and Macrophages in Systemic Lupus Erythematosus
2026-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了狼疮免疫复合物驱动促炎性单核细胞和巨噬细胞在系统性红斑狼疮中的异质性和功能 首次在单细胞水平上系统描述了狼疮免疫复合物刺激下促炎性单核细胞的转录组特征,并发现这些细胞在狼疮患者多个组织中的存在与扩增 研究主要基于体外刺激实验和已有数据集分析,需要进一步体内功能验证 探究系统性红斑狼疮中单核吞噬细胞的异质性及其在疾病发病机制中的作用 人类单核细胞、巨噬细胞、狼疮患者皮肤、肾脏和外周血样本 单细胞组学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析 NA 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 人类单核细胞体外培养样本及公开狼疮患者scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
398 2026-02-20
Genetic and embryonic transcriptome analyses reveal the molecular and developmental basis of Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser syndrome
2026-Jan-20, Journal of medical genetics IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过基因和胚胎转录组分析揭示了Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征的分子和发育基础 整合外显子测序/基因组测序与单细胞RNA测序数据,识别了新的候选基因并揭示了潜在的双基因遗传模式 MRKHS的遗传病因仍不完全清楚,研究样本量有限 探究MRKHS的遗传病因和发育机制 727名MRKHS患者和2504名女性对照个体,以及人类和小鼠胚胎后肾组织 遗传学与发育生物学 Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征 外显子测序,基因组测序,单细胞RNA测序 NA 基因组数据,转录组数据 727名MRKHS患者和2504名女性对照个体,以及人类和小鼠胚胎后肾组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
399 2026-02-20
Tissue-specific and sex-biased glycoproteomic landscape of Schistosoma mansoni
2026-Jan-16, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学,对曼氏血吸虫成虫进行N-和O-糖蛋白组学及完整糖肽分析,揭示了组织特异性和性别偏向的糖基化模式 首次建立了曼氏血吸虫的糖基化数据库,识别了未分类糖链和HexA修饰,并通过RNA干扰靶向四种糖基转移酶证明了糖基化对寄生虫生存的关键作用 NA 解析曼氏血吸虫的糖蛋白组学特征,以支持基于糖链和糖蛋白的血吸虫病控制策略开发 曼氏血吸虫成虫(雄性和雌性) 糖蛋白组学 血吸虫病 N-和O-糖蛋白组学分析、完整糖肽分析、单细胞转录组学、RNA干扰 NA 蛋白质组学数据、转录组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
400 2026-02-20
3D reconstruction of spatial transcriptomics with spatial pattern enhanced graph convolutional neural network
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为Spa3D的新方法,利用抗泄漏傅里叶变换和图卷积神经网络从多个2D空间转录组切片重建3D空间结构,以提升空间域识别、细胞通讯分析和发育轨迹建模的准确性 首次提出结合抗泄漏傅里叶变换和图卷积神经网络进行3D空间转录组重建,克服了现有方法仅依赖2D坐标的局限,实现了在3D空间中的更精确分析 未明确提及方法在计算资源需求、处理大规模数据时的效率或对不同组织类型的适用性限制 开发一种能从2D空间转录组数据重建3D空间结构的方法,以更准确地分析空间域、空间可变基因、细胞间通讯和发育轨迹 空间转录组数据,特别是来自多个2D切片的数据 空间转录组学 NA 抗泄漏傅里叶变换,图卷积神经网络 图卷积神经网络 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
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