单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202601] [清除筛选条件]
当前共找到 1652 篇文献,本页显示第 381 - 400 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
381 2026-04-01
PFKFB2-Induced Glycolysis and Ferroptosis in Diabetic Nephropathy by HIF-1α
2026, Critical reviews in eukaryotic gene expression IF:1.5Q4
研究论文 本研究探讨了PFKFB2在糖尿病肾病中的作用及其通过HIF-1α调控糖酵解和铁死亡的分子机制 首次揭示了PFKFB2通过抑制HIF-1α泛素化来调控线粒体ROS诱导的铁死亡,从而影响糖尿病肾病进程 研究主要基于动物模型和细胞实验,缺乏临床样本的直接验证 探究PFKFB2在糖尿病肾病中的保护作用及其分子机制 糖尿病肾病小鼠模型和高糖刺激的人肾近端小管HK-2细胞 NA 糖尿病肾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 DN小鼠模型和HK-2细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
382 2026-04-01
Syntaxin 4 protects islet β-cells from cytokine-induced senescence
2026, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究探讨了Syntaxin 4(STX4)在保护胰岛β细胞免受细胞因子诱导的衰老中的作用 首次揭示了STX4通过抑制衰老相关转录程序和重塑β细胞分泌组来保护β细胞免受衰老影响 研究主要基于体外细胞模型和动物模型,人类样本的直接验证有限 探究STX4是否能够减轻糖尿病应激下β细胞的衰老 MIN6细胞、人类胰岛、小鼠胰岛以及非肥胖糖尿病(NOD)小鼠 细胞生物学 1型糖尿病 单细胞RNA测序、条件培养基蛋白质组学 NA RNA测序数据、蛋白质组学数据 MIN6细胞、人类胰岛、小鼠胰岛及NOD小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
383 2026-04-01
Single-cell and multi-omics analyses identify CAMP-associated neutrophil remodeling during radiochemotherapy in cervical cancer
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞和多组学分析,探讨了CAMP在宫颈癌进展及放化疗期间对中性粒细胞重塑的关键调控作用 首次在单细胞水平揭示了CAMP介导的中性粒细胞亚群在宫颈癌放化疗过程中的动态变化及其对肿瘤免疫微环境的重塑机制 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏大规模临床队列验证,且体内功能机制仍需进一步探索 探究宫颈癌进展及放化疗过程中关键基因及免疫微环境动态,特别关注CAMP介导的中性粒细胞调控 宫颈癌组织、中性粒细胞亚群、肿瘤微环境中的细胞间通讯网络 单细胞组学 宫颈癌 单细胞RNA测序、转录组数据分析、功能富集分析、伪时间轨迹分析、细胞间通讯分析 Cox回归模型、差异表达分析模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据 整合TCGA、GTEx和GEO数据库的转录组数据,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
384 2026-04-01
Integrative Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis Reveals MAIT Cell Dysfunction in Relapsed HCC
2026, Journal of hepatocellular carcinoma IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了复发肝细胞癌中MAIT细胞的功能失调及其与恶性肝细胞表型的关联 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统性地描述了复发肝细胞癌中MAIT细胞的转录组和空间特征,并发现其与恶性肝细胞干性增强及患者不良预后相关 样本量较小(原发性HCC n=3,复发性HCC n=2),且为观察性研究,需要进一步的功能实验验证MAIT细胞在复发HCC中的具体作用机制 旨在表征复发肝细胞癌中MAIT细胞的转录组和空间特征,并探讨其与恶性肝细胞表型的关联 肝细胞癌患者的肿瘤样本,包括原发性(n=3)和复发性(n=2)HCC 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 Seurat, Harmony 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 5例HCC患者肿瘤样本(原发性3例,复发性2例),共49,229个细胞,35个感兴趣区域 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
385 2026-04-01
Metabolic profiling of the TME uncovers the contrasting impacts of CKMT2 and PDE2A in CRC progression and therapeutic response
2026, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过转录组数据和生物信息学方法,探索了结直肠癌中代谢重编程与肿瘤微环境的相互作用,识别了基于代谢和微环境的CRC亚型及候选生物标志物 首次将PDE2A和CKMT2鉴定为区分CRC亚型的关键代谢生物标志物,揭示了它们与不同肿瘤微环境组成和预后的关联 研究主要基于公共数据库和生物信息学分析,实验验证仅限于免疫组化,缺乏更深入的体内外功能验证 探索结直肠癌中代谢重编程与肿瘤微环境的相互作用,识别CRC亚型及候选生物标志物 结直肠癌组织样本和公共转录组数据集 生物信息学 结直肠癌 转录组测序、免疫组化、单细胞RNA测序 共识聚类分析 基因表达数据、临床数据 来自TCGA COAD、READ及六个GEO CRC数据集的多中心样本 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
386 2026-04-01
AI-derived prognostic model identifies high-risk gene signatures in pediatric gliomas
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究应用AI衍生的预后指数模型分析儿童胶质瘤转录组数据,识别关键基因特征以改进预后预测 首次将AIDPI模型应用于儿童胶质瘤,识别出9个跨数据集一致的关键预后基因,并构建了优于30个现有模型的机器学习预后模型 研究主要基于转录组数据,临床验证和功能机制研究尚需进一步深入 通过AI和转录组数据整合,改进儿童胶质瘤的预后模型,指导个性化治疗策略 儿童胶质瘤患者,包括低级别和高级别胶质瘤 机器学习 儿童胶质瘤 转录组分析,单细胞RNA-seq 机器学习模型 转录组数据,单细胞RNA-seq数据 多个儿童胶质瘤数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
387 2026-04-01
Dysregulated NK-cell gene expression defines the enduring symptoms of long COVID-19
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了长新冠患者中NK细胞的失调及其与持久症状的关联 首次通过单细胞转录组学结合流式细胞术,系统性地鉴定了长新冠患者中NK细胞的定量和功能缺陷,并发现了与神经感觉通路抑制相关的转录重编程 样本量相对有限,且主要为观察性研究,需要更大规模的前瞻性队列验证 探究长新冠综合征的免疫学机制,特别是NK细胞在其中的作用 健康对照、新冠康复者及长新冠患者的血浆抗体、细胞因子和外周血单个核细胞 免疫学 长新冠综合征 多参数流式细胞术、单细胞RNA测序 NA 蛋白质组数据、转录组数据 血浆样本:健康对照66例、康复者24例、长新冠患者94例;流式细胞术:健康对照9例、康复者6例、长新冠患者23例;单细胞RNA测序:健康对照8例、康复者6例、长新冠患者32例 NA 单细胞RNA测序 NA NA
388 2026-04-01
Identification of PANoptosis hub genes driving immune activation and tubulointerstitial injury in diabetic kidney disease by integrative bioinformatics and machine learning
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法,识别了驱动糖尿病肾病免疫激活和肾小管间质损伤的PANoptosis枢纽基因 首次在糖尿病肾病中系统性地定义了PANoptosis(整合焦亡、凋亡和坏死性凋亡的协调程序)的作用,并利用多算法机器学习识别了关键枢纽基因和风险评分 研究主要基于转录组数据,功能验证主要在动物模型中进行,临床转化需要进一步验证 阐明PANoptosis在糖尿病肾病肾小管间质损伤中的作用,并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 糖尿病肾病患者的肾小管间质转录组数据、单细胞RNA-seq数据以及糖尿病小鼠模型 生物信息学 糖尿病肾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq 加权基因共表达网络分析, 机器学习算法 转录组数据 多个糖尿病肾病和对照队列的肾小管间质转录组数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
389 2026-04-01
Integrative single-cell, spatial, and bulk transcriptomics reveal an FMR1-FTO axis linked to the immune-excluded phenotype in gastric cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和功能实验,揭示了胃癌中FMR1-FTO轴与免疫排斥表型的关联 首次整合单细胞、空间和批量转录组学数据,量化m6A调节因子评分,并发现FMR1-FTO轴在驱动免疫排斥中的关键作用 研究主要基于转录组学数据,功能验证实验有限,且样本来源和数量未明确说明 阐明胃癌中免疫排斥的空间机制,并探索m6A调节因子在其中的作用 胃癌微环境,包括CAFs、T细胞和m6A调节因子如FTO和FMR1 数字病理学 胃癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量转录组学, 免疫组化, 多重免疫荧光 NA 转录组数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
390 2026-03-31
Loss of Intestinal Endosome-associated Protein Sorting Nexin 27 Disrupts Epithelial Barrier and Promotes Inflammation
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨了分选连接蛋白SNX27在肠道稳态中的作用,发现其缺失会破坏上皮屏障并促进炎症 首次揭示了SNX27在肠道上皮细胞中的关键作用,并建立了肠道上皮细胞特异性SNX27敲除小鼠模型 研究主要基于小鼠模型,人类样本分析依赖于现有数据库,需要进一步验证SNX27在人类IBD中的具体机制 确定SNX27在调节肠道稳态、上皮屏障完整性和炎症反应中的未知作用 人类炎症性肠病(IBD)样本、肠道上皮细胞特异性SNX27敲除小鼠 分子生物学与病理学 炎症性肠病(包括溃疡性结肠炎和克罗恩病) 单细胞RNA测序、基因表达分析、小鼠模型构建 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达数据、组织病理学数据 未明确具体样本数量,使用了NCBI GEO数据库和单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
391 2026-03-31
Adoptive cellular therapy prevents reconstitution of myeloid-derived suppressor cells in the glioma tumor microenvironment
2026 Jan-Dec, Neuro-oncology advances IF:3.7Q2
研究论文 本研究探讨了针对胶质母细胞瘤的过继细胞疗法如何通过调节CCL12信号通路,阻止髓源性抑制细胞在肿瘤微环境中的积累,从而增强抗肿瘤免疫反应 首次揭示了过继细胞疗法通过减少肿瘤相关巨噬细胞来源的CCL12,抑制髓源性抑制细胞向胶质瘤肿瘤微环境的迁移,这一机制先前未被认识 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证;CCL12在MDSC招募中的因果作用需要未来体内研究进一步确认 探究过继细胞疗法如何影响免疫恢复,特别是对髓源性抑制细胞在胶质瘤肿瘤微环境中积累的调控机制 胶质母细胞瘤(GBM)模型小鼠,重点关注髓源性抑制细胞(MDSCs)和肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) 数字病理学 胶质母细胞瘤 流式细胞术、空间基因组学、多重蛋白分析、单细胞转录组学、Trans-well迁移实验 NA 细胞表型数据、空间转录组数据、蛋白质表达数据、单细胞RNA测序数据 使用KR158B胶质瘤荷瘤小鼠模型进行研究,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
392 2026-03-30
Isolation of Pericytes from Mouse Cortical Tissue Using FACS for Single-cell Sequencing
2026-01-30, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文建立了一种优化的FACS方法,用于从小鼠皮层组织中分离周细胞,适用于单细胞RNA测序 在已建立的CD13/CD31分选策略基础上,引入了20% BSA溶液重悬细胞的关键步骤,以最小化应激和聚集,从而最大化测序所需的细胞活力和RNA质量 NA 研究周细胞的异质性,并阐明其在神经血管疾病中的机制 小鼠大脑周细胞 单细胞测序 神经血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 3只成年C57BL/6小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
393 2026-03-30
AUTOENCODIX: a generalized and versatile framework to train and evaluate autoencoders for biological representation learning and beyond
2026-01, Nature computational science IF:12.0Q1
研究论文 本文介绍了AUTOENCODIX,一个用于训练和评估自编码器的开源框架,旨在标准化和灵活处理生物表示学习任务 提出一个标准化、灵活且可比较的自编码器框架,支持基于本体和跨模态的自编码器,增强了表示学习的可解释性和数据模态转换能力 未明确说明框架在特定数据集或应用场景中的性能限制或潜在偏差 开发一个通用框架以标准化自编码器的训练和评估,促进生物表示学习的研究 自编码器架构及其在生物数据表示学习中的应用 机器学习 NA 自编码器深度学习 自编码器(包括基于本体和跨模态的自编码器) 多模态数据(包括基因组、单细胞测序和成像数据) NA NA NA NA NA
394 2026-03-29
Single-cell omics for nutrition research: an emerging opportunity for human-centric investigations
2026, Critical reviews in food science and nutrition IF:7.3Q1
综述 本文综述了单细胞组学技术在营养研究中的新兴应用及其潜力 提出了将单细胞组学技术与类器官、器官芯片等先进人体衍生系统相结合,以在生理相关背景下进行机制研究的新框架 讨论了该领域面临的技术限制、模型选择困难和机构偏见等关键挑战 推进以人为中心的营养研究,揭示饮食化合物对人类健康的影响机制 饮食化合物与人体细胞的相互作用 NA NA 单细胞RNA测序,单细胞蛋白质组学,单细胞代谢组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
395 2026-03-29
Resveratrol Alleviates Intervertebral Disc Degeneration by Targeting NCOA4-Mediated Ferritinophagy Through Dual Antioxidant and Anti-Inflammatory Effects
2026, Drug design, development and therapy
研究论文 本研究通过多组学分析和实验模型,揭示了NCOA4介导的铁蛋白自噬在椎间盘退变中的关键作用,并发现白藜芦醇通过靶向NCOA4发挥双重抗氧化和抗炎效应来缓解退变 首次将铁蛋白自噬确立为椎间盘退变的新型病理机制,并阐明NCOA4作为协调铁死亡与自噬交互作用的关键节点,同时验证了天然化合物白藜芦醇通过多靶点调控炎症和铁稳态通路治疗椎间盘退变的潜力 研究主要基于大鼠模型和细胞实验,临床转化仍需进一步验证;铁蛋白自噬的具体调控网络及其与其他细胞死亡方式的相互作用尚未完全阐明 探究铁蛋白自噬在椎间盘退变中的作用机制,并评估白藜芦醇的治疗效果 椎间盘退变患者样本、大鼠椎间盘退变模型、髓核细胞 生物信息学与分子生物学 椎间盘退变 生物信息学分析、单细胞测序、转录组分析、实验模型验证 NA 临床转录组数据、单细胞测序数据、实验数据 未明确具体样本数量,涉及临床样本、大鼠模型和细胞研究 NA 单细胞测序 NA NA
396 2026-03-29
Cell Differentiation of DPSCs Infected With Different Periodontal Pathogens
2026-Jan, Oral diseases IF:2.9Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探究了两种牙周病原体(牙龈卟啉单胞菌和牙周二氧化碳嗜纤维菌)对人牙髓干细胞亚群分化的不同影响 首次在单细胞分辨率下揭示了不同牙周病原体对牙髓干细胞亚群分化的特异性调控作用,并识别出对特定病原体有独特反应的细胞亚群 研究样本来源于健康供体,未考虑临床患者个体差异;体外感染模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 探究牙周病原体感染对牙髓干细胞分化的影响机制 人牙髓干细胞 单细胞组学 牙周病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 健康供体来源的牙髓干细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
397 2026-03-28
Integration of imaging-based and sequencing-based spatial omics mapping on the same tissue section via DBiTplus
2026-Jan-15, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为DBiTplus的新型整合多模态空间组学方法,可在同一组织切片上结合测序型空间转录组学与多重蛋白成像技术 开发了DBiTplus整合工作流程,首次实现同一组织切片上测序型空间转录组与多重蛋白成像的同步分析,并采用RNase H介导的cDNA回收技术以保留组织架构 方法在极具挑战性的临床样本(如FFPE组织)中的全面性能仍需进一步验证 开发一种整合成像与测序的空间组学映射技术,以在单细胞分辨率下探索细胞异质性和功能 冷冻小鼠胚胎、福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的人体淋巴结及淋巴瘤组织 空间组学 淋巴瘤 空间条形码技术、RNase H介导的cDNA回收、多重蛋白成像、空间转录组学 NA 空间转录组数据、蛋白成像数据 多种样本类型,包括小鼠胚胎和人类淋巴组织 NA 空间转录组学, 多重蛋白成像 DBiTplus DBiTplus整合工作流程,支持测序型空间转录组学与成像型蛋白分析在同一组织切片上进行
398 2026-03-27
LLOT: application of Laplacian Linear Optimal Transport in spatial transcriptome reconstruction
2026-Jan-06, Biometrics IF:1.4Q2
研究论文 本文提出了一种名为LLOT的可解释方法,用于整合单细胞和空间转录组学数据,以在全基因组和单细胞分辨率下重建缺失的空间信息 LLOT通过迭代校正平台效应并利用拉普拉斯最优传输,将空间转录组学数据中的每个点分解为空间平滑的单细胞概率混合,提供了一种可解释且通用的框架 NA 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,以重建组织中的空间基因表达和推断细胞位置 单细胞RNA测序数据和空间转录组学数据(如原位杂交、Slide-seq、10x Visium和Visium HD) 空间转录组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学技术(如原位杂交、Slide-seq、10x Visium、Visium HD) 拉普拉斯线性最优传输(LLOT) 基因表达数据(包括单细胞和空间数据) NA 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium, Visium HD 10x Visium和Visium HD用于空间转录组学测量
399 2026-03-27
Screening and molecular functional analysis of telomere-related genes in abdominal aortic aneurysms based on bioinformatics
2026, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过生物信息学方法筛选并分析了腹主动脉瘤中端粒相关基因的分子特征,以识别潜在的治疗靶点 结合WGCNA、LASSO、SVM算法及单细胞RNA-seq数据,系统鉴定出KLF15和ZBTB16作为腹主动脉瘤的关键生物标志物,并验证了其在免疫炎症调控中的作用 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,实验验证仅限于体外细胞模型,缺乏体内动物模型或临床样本的进一步验证 探究腹主动脉瘤中端粒相关分子的特征,为开发治疗药物提供潜在靶点 腹主动脉瘤患者与正常对照的RNA表达数据及单细胞RNA-seq数据 生物信息学 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, Western blot, ELISA, 流式细胞术, Trans-well实验 WGCNA, LASSO, SVM 基因表达数据, 单细胞数据 基于公共数据集GSE57691和GSE237230,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
400 2026-03-27
Cochlear macrophage CD74 enhances the apoptosis of senescent cochlear hair cells by down-regulating MIF
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过分析小鼠耳蜗单细胞测序数据,揭示了巨噬细胞CD74通过下调MIF促进衰老耳蜗毛细胞凋亡的新机制 首次发现衰老耳蜗中巨噬细胞CD74表达上调,并通过与MIF相互作用降低局部MIF水平,从而削弱MIF对衰老听觉细胞的保护作用,促进其凋亡 研究主要基于HEI-OC1细胞模型和小鼠数据,尚未在人体组织中得到验证,且具体信号通路机制有待进一步阐明 探究年龄相关性听力损失的细胞分子机制,特别是巨噬细胞在耳蜗衰老过程中的作用 C57BL/6J小鼠的耳蜗组织、HEI-OC1听觉细胞系、BV2小胶质细胞系 单细胞生物学 年龄相关性听力损失 单细胞RNA测序 细胞共培养模型 单细胞转录组数据、细胞实验数据 不同年龄段的C57BL/6J小鼠耳蜗组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部