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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2026-04-02 |
Gut Microbiome, Immune Cells, and Heart Failure: A Multi-Omics Mendelian Randomization Study
2026-Jan-23, Cardiology
IF:1.9Q3
DOI:10.1159/000550655
PMID:41915616
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研究论文 | 本研究通过多组学孟德尔随机化分析,探讨了肠道微生物组通过免疫细胞对心力衰竭的因果影响 | 首次结合肠道微生物组、免疫细胞和心力衰竭的GWAS数据,利用单细胞RNA测序和单核RNA测序技术,通过eQTL孟德尔随机化分析揭示微生物与免疫互作在心力衰竭中的因果机制 | 研究依赖于公开的GWAS摘要数据,可能受限于样本异质性和潜在混杂因素,且因果推断基于遗传工具变量,需实验验证 | 探究肠道微生物组通过免疫调节对心力衰竭发病的因果关系 | 肠道微生物分类群、免疫细胞(如CD4+T细胞、NK/T细胞)和心力衰竭患者及健康对照 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究(GWAS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单核RNA测序(snRNA-seq)、表达数量性状位点(eQTL)分析 | 孟德尔随机化(MR)模型 | 遗传摘要数据、单细胞转录组数据 | 基于公开GWAS和单细胞测序数据,具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 362 | 2026-04-02 |
Loss of HOXA10 activates NLRP3 for epithelial plasticity and pyroptosis in endometrium during embryo implantation
2026-01-15, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1093/reprod/xaaf007
PMID:41575153
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子HOXA10通过抑制NLRP3来维持子宫内膜上皮细胞特性,其下调会激活NLRP3介导的炎症小体形成和细胞焦亡,从而为胚胎植入创造条件的分子机制 | 首次发现HOXA10通过直接调控NLRP3表达来控制胚胎植入过程中的上皮重塑,并阐明了NLRP3在诱导上皮可塑性(pEMT)和细胞焦亡中的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型,在人类子宫内膜中的验证尚需进一步研究;NLRP3抑制剂MCC950的具体作用机制和长期影响有待深入探索 | 探究胚胎植入过程中子宫内膜上皮细胞重塑的分子调控机制 | 小鼠子宫内膜(特别是腔上皮细胞) | 生殖生物学/发育生物学 | 生殖系统疾病(胚胎植入相关) | CUT&RUN测序,单细胞RNA-seq,免疫染色 | NA | 基因组学数据,转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 363 | 2026-04-02 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals hepatocyte heterogeneity in response to radiation-induced liver injury and regeneration
2026-01, Radiotherapy and oncology : journal of the European Society for Therapeutic Radiology and Oncology
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.radonc.2025.111225
PMID:41429723
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了辐射诱导肝损伤后肝细胞的异质性反应与再生机制 | 首次在辐射诱导肝损伤模型中,结合单细胞和单核RNA测序以及蛋白质组学分析,系统描绘了肝细胞亚群在空间和时间上的动态响应,并验证了人类肝组织中的保守通路激活 | 研究主要基于大鼠模型,人类样本验证有限;未深入探讨长期再生效果或临床转化潜力 | 阐明辐射诱导肝损伤的分子机制及肝细胞再生过程 | 大鼠肝细胞及人类肝组织 | 数字病理学 | 肝损伤 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 蛋白质组学分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 大鼠模型及人类肝组织样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 364 | 2026-04-02 |
Integrated transcriptome and single-cell sequencing analysis identify blood-pancreas shared lncRNA biomarkers in new-onset T2DM
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0345359
PMID:41915667
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研究论文 | 本研究通过整合转录组测序和单细胞RNA测序,识别了初发2型糖尿病患者血液与胰腺共享的lncRNA作为早期生物标志物 | 首次整合外周血转录组与胰岛单细胞测序数据,识别血液与胰腺共享的lncRNA作为T2DM早期系统性生物标志物 | 样本量相对较小,且为横断面研究,需进一步纵向验证 | 识别初发2型糖尿病患者血液与胰腺共享的lncRNA作为早期生物标志物 | 初发2型糖尿病患者的外周血样本和胰岛组织 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | RNA-seq数据 | 初始队列:8名T2DM患者和8名对照;单细胞队列:17名T2DM供体;验证队列:85名T2DM患者和85名对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 365 | 2026-04-02 |
Single-Cell/Nucleus RNA-Sequencing for Phytohormone Signaling in Plants
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5214-5_10
PMID:41917663
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综述 | 本文详细介绍了单细胞/单核RNA测序技术在植物激素信号研究中的应用方法 | 利用scRNA-seq和snRNA-seq技术,在转录组水平实现细胞异质性的高分辨率映射,为植物激素信号研究提供了新方法 | NA | 研究植物激素信号传导的基因调控网络 | 植物细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 366 | 2026-04-02 |
Single-Cell Transcriptomics in Arabidopsis in Response to Salicylic Acid and Jasmonic Acid
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5214-5_11
PMID:41917664
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研究论文 | 本文提供了针对拟南芥水杨酸和茉莉酸响应的单细胞核RNA测序实验方案及生物信息学分析流程 | 开发了针对植物激素处理的单细胞核RNA测序端到端实验方案,并结合计算流程实现细胞类型分辨的激素免疫响应解析 | NA | 解析水杨酸和茉莉酸在植物免疫中的细胞类型特异性响应机制 | 拟南芥 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 367 | 2026-04-02 |
Stereo-Seq Transcriptomics in Arabidopsis Leaves in Response to Salicylic Acid
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5214-5_12
PMID:41917665
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研究论文 | 本文描述了一个完整的Stereo-seq工作流程,用于研究拟南芥叶片在响应水杨酸处理时的空间转录组变化 | 首次将Stereo-seq技术应用于拟南芥叶片响应水杨酸的空间转录组研究,并提供了从样本制备到数据分析的完整工作流程 | 未明确说明样本数量,且工作流程可能受特定平台限制 | 研究拟南芥叶片在响应水杨酸处理时的空间转录组变化 | 拟南芥叶片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | STOmics, MGI | 空间转录组学 | STOmics V1.3 1 × 1 cm芯片, DNBSEQ平台 | STOmics V1.3 1 × 1 cm芯片用于文库构建,DNBSEQ平台用于测序 |
| 368 | 2026-04-02 |
APOE and CCR2: Potential Macrophage-Specific Biomarkers in the Rheumatoid Arthritis Synovial Microenvironment Identified by Bioinformatics and Experimental Verification in Murine Models
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S587712
PMID:41918589
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,在类风湿关节炎滑膜微环境中识别出APOE和CCR2作为潜在的巨噬细胞特异性生物标志物 | 结合批量与单细胞RNA-seq数据,识别出在滑膜巨噬细胞中特异性高表达并与炎症反应相关的枢纽基因APOE和CCR2,并通过实验验证了其表达调控 | 需要进一步研究以阐明APOE和CCR2在类风湿关节炎中的具体作用机制 | 识别类风湿关节炎中巨噬细胞特异性的枢纽基因并研究其生物学功能 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织及小鼠RAW264.7细胞系 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, ELISA, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 369 | 2026-04-02 |
Editorial: Unraveling breast cancer complexity: insights from single-cell sequencing and spatial transcriptomics
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1816191
PMID:41918756
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 370 | 2026-04-02 |
Identification of a GPR182-postive stem cell population that drives polyp progression in familial adenomatous polyposis
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20704
PMID:41918858
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据分析,识别了家族性腺瘤性息肉病中驱动息肉异质性的关键细胞亚群——GPR182阳性息肉干细胞 | 首次在家族性腺瘤性息肉病中鉴定出GPR182阳性息肉干细胞,并揭示其在驱动息肉异质性、免疫逃逸及预后和药物反应预测中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据分析,缺乏前瞻性临床验证,且功能验证实验可能有限 | 解析家族性腺瘤性息肉病中息肉进展的异质性,以识别新的治疗靶点和生物标志物 | 家族性腺瘤性息肉病患者的单细胞和批量转录组数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞测序,批量转录组测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 涉及多个公共数据集(GSE109308等),具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 371 | 2026-04-02 |
Elevated growth differentiation factor-15 in sepsis: clinical associations and immune cell context
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1789747
PMID:41918885
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研究论文 | 本研究探讨了脓毒症患者血清中生长分化因子-15(GDF-15)水平的升高情况,及其与疾病严重程度、器官功能障碍和炎症活动的关联,并利用单细胞RNA测序数据分析了GDF15在免疫细胞中的表达模式 | 首次在脓毒症中结合临床血清GDF-15测量与公开的单细胞转录组数据,系统描述了GDF-15与疾病严重程度的关联及其在特定免疫细胞(浆细胞和单核细胞)中的表达富集,为理解其在危重疾病中的生物学背景提供了新见解 | 研究样本量较小(脓毒症患者n=19,健康对照n=23),为探索性观察研究,需要更大规模、特征明确的队列进行验证 | 阐明脓毒症中GDF-15的临床关联及其在免疫细胞中的表达背景,评估其作为反映系统生物应激的潜在生物标志物的价值 | 成人脓毒症患者和健康对照者的血清样本,以及公开的单细胞RNA测序数据集(GSE217906)中的免疫细胞 | NA | 脓毒症 | 酶联免疫吸附试验(ELISA),单细胞RNA测序数据分析 | NA | 血清蛋白浓度数据,单细胞转录组数据 | 临床队列:脓毒症患者19例,健康对照23例;生物信息学分析:公开数据集GSE217906 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 372 | 2026-04-02 |
Noninvasive assessment of core metastatic genes in lung adenocarcinoma: development of a predictive model integrating single-cell transcriptomics and radiomics
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1784914
PMID:41919253
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和CT影像组学,识别了肺腺癌转移的关键分子驱动基因,并开发了一个非侵入性的影像预测模型 | 创新性地结合单细胞RNA测序和CT影像组学来识别肺腺癌转移的核心基因并构建预测模型,实现了分子表型与影像特征的关联 | 研究基于公共数据库数据,可能需要进一步的前瞻性临床验证来确认模型的泛化能力 | 开发一个非侵入性的预测模型,用于评估肺腺癌的转移潜能和预后 | 肺腺癌(LUAD)患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CT影像组学、免疫组织化学(IHC)、RT-qPCR | LASSO回归、影像组学模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、CT影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 373 | 2026-04-01 |
Integrative microRNA and transcriptome analysis reveals sex-specific molecular divergence in human bladder cancer
2026-Jan-23, Biology of sex differences
IF:4.9Q1
DOI:10.1186/s13293-026-00829-5
PMID:41578372
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研究论文 | 本研究通过整合miRNA与转录组分析,揭示了膀胱癌中性别特异的分子差异及其对肿瘤生物学和预后的影响 | 首次结合bulk mRNA/miRNA表达、生存建模和单细胞转录组分析,系统识别了膀胱癌中性别特异的分子特征和调控网络,并强调了常染色体基因的转录后调控在性别差异中的主导作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性验证;单细胞分析样本量有限,可能影响细胞类型特异性结论的普适性 | 阐明膀胱癌性别差异的生物学机制,识别性别特异的分子特征和调控相互作用 | 人类膀胱癌组织样本,包括肿瘤和正常组织 | 生物信息学 | 膀胱癌 | bulk mRNA测序, microRNA测序, 单细胞RNA测序 | 差异表达分析, 生存分析(Kaplan-Meier, Cox模型), 相关性分析 | 基因表达数据, 生存数据 | 数据来源于TCGA、GEO和GSA等公共数据库,具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 374 | 2026-01-23 |
Building consensus: construction of a juvenile and adult scRNA-seq meta-atlas for dataset comparisons and harmonizing transcriptomic definitions of enteric neuron subtypes
2026-Jan-22, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12283-5
PMID:41566221
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 375 | 2026-04-01 |
Ovarian hormone deficiency enhances wood smoke-induced immune dysfunction via transcriptomic and metabolic alterations
2026-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.14.699504
PMID:41648465
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探究了卵巢激素缺乏如何加剧木材烟雾暴露诱导的骨髓免疫功能障碍,揭示了相关的转录组学和代谢改变机制 | 首次在卵巢激素缺乏背景下,结合单细胞RNA测序和功能验证,系统揭示了木材烟雾暴露对骨髓免疫细胞的特定影响,并发现了免疫-代谢解耦这一新机制 | 研究主要聚焦于卵巢切除小鼠模型,未涉及其他激素缺乏状态或人类样本;功能验证主要在骨髓来源巨噬细胞中进行,体内整体免疫表型验证有限 | 探究卵巢激素缺乏是否增加对木材烟雾诱导的免疫功能障碍的易感性,并阐明其分子机制 | 卵巢切除(OVX)小鼠和假手术(Sham)小鼠的骨髓免疫细胞及骨髓来源巨噬细胞 | 单细胞组学 | 免疫功能障碍 | 单细胞RNA测序,代谢功能测定,巨噬细胞极化分析 | NA | 单细胞转录组数据,功能测定数据 | 卵巢切除和假手术小鼠,暴露于过滤空气或木材烟雾 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 376 | 2026-04-01 |
Endothelial CEPT1 Promotes Angiogenesis Through PPARα and VEGF-A Signaling
2026-Jan, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323302
PMID:41263082
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研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞CEPT1通过PPARα和VEGF-A信号通路促进血管生成的作用 | 首次揭示了CEPT1在糖尿病背景下通过PPARα和VEGF-A信号通路促进缺血后血管生成和恢复的机制,并利用单细胞RNA测序技术进行了验证 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,在人体中的直接功能验证尚不充分,且糖尿病模型的复杂性可能影响结果的普适性 | 探究CEPT1在糖尿病背景下促进缺血后血管生成和恢复的分子机制 | 人类外周动脉疾病患者的外周动脉样本、条件性内皮细胞特异性Cept1过表达小鼠、小鼠主动脉和内皮细胞 | 分子生物学与血管生物学 | 糖尿病与心血管疾病 | 单细胞RNA测序、分子通路分析、基因工程小鼠模型 | 条件性基因过表达小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、功能实验数据 | 人类患者外周动脉样本(具体数量未明确)、C57BL/6J背景的基因工程小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 377 | 2026-04-01 |
A unique microglia subset associated with aggressive α-synucleinopathy uncovered in a rapidly progressive multiple system atrophy cerebellar type model
2026-01, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.107206
PMID:41325908
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研究论文 | 本研究通过建立快速进展型多系统萎缩小脑型小鼠模型,发现了一种与侵袭性α-突触核蛋白病相关的独特小胶质细胞亚群 | 首次在快速进展的MSA-C模型中鉴定出一个表达Tlr2、Tgm2、Msr1等基因的独特促炎性小胶质细胞亚群,该亚群位于p-α-syn聚集物附近,且不同于以往报道的保护性疾病相关小胶质细胞和边界相关巨噬细胞 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本仅来自6例尸检病例,样本量较小;CSF1R抑制剂BLZ945的预防性给药加剧了疾病表型,其治疗时间窗和剂量效应需进一步探索 | 探究多系统萎缩小脑型(MSA-C)的病理机制,特别是小胶质细胞在疾病进展中的作用 | MSA-C小鼠模型(Tet-Off系统诱导少突胶质细胞特异性过表达人A53T α-syn)以及6例人类MSA-C尸检病例 | 数字病理学 | 多系统萎缩 | 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型(Tet-Off诱导型) | 单细胞转录组数据、组织病理学数据 | 小鼠模型队列及6例人类MSA-C尸检病例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 378 | 2026-04-01 |
Identification of CXCL12 as a key gene of trophoblast and endometrial stromal cell decidualization in pregnancy via scRNA-seq and experimental validation
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1768015
PMID:41696581
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和实验验证,探讨了CXCL12在复发性流产中母胎界面的作用及其机制 | 利用单细胞RNA测序技术构建正常与复发性流产样本的母胎界面单细胞图谱,首次系统分析了CXCL12在滋养层细胞和子宫内膜基质细胞蜕膜化中的关键作用 | 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;样本量可能有限,需要更大规模临床样本验证 | 探究CXCL12在复发性流产发病机制中的作用,为潜在诊断和治疗策略提供实验依据 | 正常和复发性流产妊娠早期母胎界面组织样本、HTR-8/SVneo滋养层细胞系、子宫内膜基质细胞 | 单细胞组学 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序、MTT法、细胞划痕实验、Transwell侵袭实验 | NA | 单细胞RNA测序数据、细胞功能实验数据 | 正常和复发性流产妊娠早期母胎界面组织样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 379 | 2026-04-01 |
Single-cell transcriptomic profiling of C. elegans Q neuroblast lineage during migration and differentiation
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0343734
PMID:41774717
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,对秀丽隐杆线虫Q神经母细胞谱系在迁移和分化过程中的转录组进行剖析 | 首次构建了Q神经母细胞谱系的高分辨率转录组分化图谱,揭示了新的基因表达模式,包括上皮-间质转化过程和Wnt信号通路的不对称表达 | 研究基于线虫模型,结果在哺乳动物系统中的普适性有待验证,且单细胞测序可能无法完全捕获所有低丰度转录本 | 探究神经母细胞迁移和分化的分子机制,以理解神经系统发育 | 秀丽隐杆线虫的Q神经母细胞谱系细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 不同发育阶段的Q谱系细胞,通过FACS分离 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 380 | 2026-04-01 |
GenX-associated molecular signatures overlap with testicular aging and male infertility: a multi-omics integration analysis
2026, Journal of environmental science and health. Part A, Toxic/hazardous substances & environmental engineering
DOI:10.1080/10934529.2026.2640332
PMID:41797399
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析,揭示了GenX(一种PFAS替代物)暴露与睾丸衰老及男性不育相关的分子特征重叠 | 首次将GenX相关基因与衰老相关基因整合构建基因集,并结合单细胞RNA测序、机器学习算法及分子对接技术,系统揭示了GenX诱导生殖毒性的关键分子机制和候选生物标志物 | 研究主要基于公共数据集和动物模型验证,缺乏大规模人群队列的直接证据;分子对接结果需进一步实验验证 | 探究GenX暴露对男性生殖系统的毒性作用机制,并寻找相关的生物标志物 | 人类睾丸衰老的单细胞RNA测序数据、男性不育转录组数据集、GenX暴露的大鼠睾丸组织 | 生物信息学 | 男性不育 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组分析、RT-qPCR、分子对接 | LASSO回归、支持向量机递归特征消除(SVM-RFE) | 基因表达数据 | 人类睾丸衰老数据集(GSE254315)、男性不育数据集(GSE45885/GSE45887)、GenX暴露的大鼠睾丸组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |