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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2026-06-09 |
The miR-30c-5p/SOCS3 axis is a potential driver of inflammation and metabolic imbalance in Duchenne muscular dystrophy
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1841851
PMID:42255483
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据鉴定miR-30c-5p/SOCS3轴在杜氏肌营养不良症中驱动炎症和代谢失衡的作用 | 首次通过整合bulk RNA-seq、small RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,系统鉴定并验证miR-30c-5p/SOCS3轴在DMD中驱动炎症和代谢失衡的关键作用 | 未提供明确的局限性信息 | 探究miRNA-mRNA调控网络在DMD发病机制中的关键驱动因子 | DMD患者肌肉组织、mdx小鼠、C2C12肌母细胞和原代骨骼肌细胞 | 机器学习 | 杜氏肌营养不良症 | RNA-seq, 小RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 差异表达分析, 靶基因预测, 功能通路富集, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析, 双荧光素酶报告基因实验 | NA | 基因表达数据 | 整合GSE38417、GSE109178、GSE157668和GSE213925数据集,具体样本量未明确 | NA | bulk RNA-seq, small RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 362 | 2026-06-09 |
Network Pharmacology and Single-Cell Transcriptomic Investigation of Molecular Mechanisms Underlying Erigeron breviscapus Treatment in Acute Myocardial Infarction
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/7715750
PMID:42255489
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研究论文 | 结合网络药理学和单细胞转录组学,建立预测性计算框架,探究灯盏细辛治疗急性心肌梗死的分子机制 | 首次将网络药理学与单细胞转录组学系统整合,构建多组分、多靶点、多通路机制的计算建模框架,揭示灯盏细辛在急性心肌梗死中的细胞特异性靶向作用 | 研究基于计算预测和公共数据库数据,缺乏大规模临床试验验证;单细胞转录组数据来源有限,可能无法完全反映人体复杂性;结论需要进一步实验验证 | 建立预测性计算框架,阐明灯盏细辛治疗急性心肌梗死的多靶点分子机制 | 灯盏细辛的活性化合物及其治疗靶点、急性心肌梗死相关基因、心脏细胞群(心肌细胞、心脏成纤维细胞、内皮细胞、巨噬细胞和T淋巴细胞) | 生物信息学、网络药理学、单细胞转录组学 | 急性心肌梗死、心血管疾病 | 网络药理学、单细胞RNA测序、UMAP降维、Monocle 3拟时序分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 小鼠AMI模型样本、公共数据库基因集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 363 | 2026-06-09 |
Identification of genes associated with smell dysfunction in Parkinson's disease
2026, Clinical parkinsonism & related disorders
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.prdoa.2026.100453
PMID:42255497
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研究论文 | 整合临床和转录组数据分析帕金森病嗅觉功能障碍相关基因 | 通过机器学习特征排序确定嗅觉功能丧失是区分帕金森病与健康对照的最有价值临床指标,并整合WGCNA、DNA甲基化和单细胞RNA测序数据揭示其分子机制 | 研究主要依赖外周血转录组数据,可能无法完全反映大脑嗅觉区域的分子变化;缺乏独立队列验证 | 探究帕金森病中嗅觉功能障碍的遗传基础及其作为早期诊断标志物的潜力 | 帕金森病患者和健康对照个体 | 机器学习 | 帕金森病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析 | 加权基因共表达网络分析 (WGCNA) | 临床数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | 来自PPMI数据库的外周血样本及独立单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 364 | 2026-06-09 |
Integrative Analysis of Genetic Risk Factors for Acute Myeloid Leukemia Using Mendelian Randomization and Single-Cell RNA Sequencing Validation
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/5584620
PMID:42255490
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序验证,综合分析急性髓系白血病的遗传风险因素 | 将孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序验证相结合,全面评估遗传暴露与AML风险之间的因果关系,并揭示风险基因在造血谱系中的细胞特异性表达模式 | 未明确提及,但基于描述,可能受限于MR分析中的潜在混杂因素和单细胞测序样本量有限 | 评估遗传因素与急性髓系白血病风险之间的因果关系,并验证基因表达模式 | 急性髓系白血病相关的遗传因素和造血细胞群体 | 机器学习和计算生物学 | 急性髓系白血病 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据和遗传变异数据 | NA(未明确说明样本量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 365 | 2026-06-09 |
Correction: Detection of differentially expressed genes in spatial transcriptomics data by spatial analysis of spatial transcriptomics: A novel method based on spatial statistics
2026, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2026.1867303
PMID:42255936
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更正 | 对前期发表的关于通过空间转录组学数据的空间分析检测差异表达基因的文章进行更正 | 更正本身不具备创新性 | 更正内容局限于对原文错误的修正 | 修正空间转录组学数据中差异表达基因检测方法的错误 | 更正通知本身无研究对象 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 366 | 2026-06-09 |
Immunoengineering in the field of tendon and bone regeneration: immunomodulatory biomaterials, delivery platforms, and preclinical models for chronic diseases
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1844904
PMID:42256713
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综述 | 系统总结了旨在克服肌腱-骨界面再生挑战的“骨免疫工程”最新范式转变 | 提出下一代智能生物物理和化学干预策略,包括压电纳米水凝胶、Janus不对称微流体接口和精准空间递送平台,并强调闭环动态自适应生物材料与人工智能的深度融合 | NA | 综述骨免疫工程在肌腱和骨再生中的最新进展,旨在克服慢性疾病导致的再生微环境破坏问题 | 肌腱-骨界面及其在慢性退行性病变(如衰老、糖尿病和类风湿关节炎)下的再生 | 机器学习 | 肌腱和骨损伤 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 367 | 2026-06-08 |
Identification of potential drug targets for Alzheimer's disease from genetic insights: A Mendelian randomization study
2026-Jan-30, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045715
PMID:41630303
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研究论文 | 通过孟德尔随机化研究从遗传学角度识别阿尔茨海默病的潜在药物靶点 | 首次联合孟德尔随机化分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络、分子对接和单细胞测序分析系统识别阿尔茨海默病的关键基因和潜在药物 | 研究依赖于公开的GWAS汇总统计数据,可能受限于原始数据的样本特征和混杂因素 | 探索血浆蛋白与阿尔茨海默病之间的因果关系并预测潜在药物靶点 | 阿尔茨海默病患者和对照组的血浆蛋白质组数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | NA | NA | 图像、文本 | 4907个血浆蛋白作为暴露因素,阿尔茨海默病作为结局 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 368 | 2026-06-08 |
Calcified Artery Preparation and Processing with Preserved Morphology and RNA for Digital Spatial Profiling
2026-Jan-23, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69159
PMID:41662190
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研究论文 | 提出一种针对钙化动脉的样本处理流程,保留形态和RNA完整性,用于数字空间分析 | 专门优化了钙化血管组织的处理流程,包括脱钙方法、组织微阵列构建和感兴趣区域选择策略,以克服血管组织用于空间转录组学的技术障碍 | 主要基于人类胫骨动脉样本,可能不适用于其他血管类型或钙化程度不同的样本 | 建立适用于钙化血管的空间转录组学样本制备协议,使科研人员能够获得层特异性基因表达数据 | 人类胫骨动脉(具有晚期病变) | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 图像 | 人类胫骨动脉样本(具体数量未提及) | NanoString Technologies | 空间转录组学 | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler | NanoString GeoMx DSP系统,结合组织微阵列和感兴趣区域选择策略 |
| 369 | 2026-06-08 |
BayesRare: Bayesian mixture model for population-level rare cell type detection in multi-subject single-cell RNA sequencing data
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag024
PMID:41632592
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研究论文 | 提出BayesRare层次贝叶斯框架,用于多受试者单细胞RNA测序数据中群体水平稀有细胞类型的检测 | 首次将贝叶斯混合模型与稀有簇指示器结合,实现跨受试者信息整合的稀有细胞类型联合聚类与识别,并量化不确定性 | 未明确说明具体局限性 | 开发一种能够利用跨受试者信息进行群体水平稀有细胞类型检测的统计方法 | 单细胞RNA测序数据中的稀有细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯混合模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 370 | 2026-06-08 |
Cross-dataset transcriptomic analyses identify a conserved ENPP2+ macrophage-fibroblast activation axis in hypertrophic cardiomyopathy
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag036
PMID:41642196
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研究论文 | 本研究通过跨数据集转录组分析,在肥厚型心肌病中鉴定出一个保守的ENPP2+巨噬细胞-成纤维细胞活化轴 | 首次通过跨数据集单核RNA测序和空间转录组学分析,揭示肥厚型心肌病中巨噬细胞向促炎表型转化并由ENPP2高表达驱动成纤维细胞活化的保守机制 | 机制验证主要基于初步的组织病理学和分子生物学实验,需要进一步功能研究确定ENPP2下游信号及其作为治疗靶点的可行性 | 阐明肥厚型心肌病中心肌纤维化的分子机制,特别是巨噬细胞转化为成纤维细胞活化的调控机制 | 肥厚型心肌病患者的心肌组织样本 | 数字病理学 | 肥厚型心肌病 | snRNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多个公开数据集(包括两种最常见突变类型的snRNA-seq数据、最大现有snRNA-seq和空间转录组学数据集) | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 371 | 2026-06-08 |
High-Resolution Laser Microdissection to Investigate Transcriptional States in Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Samples
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5154-4_5
PMID:41629710
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研究论文 | 本文描述了如何利用高分辨率激光显微切割结合RNA测序分析福尔马林固定石蜡包埋样本中的转录状态 | 强调激光显微切割在空间转录组学中仍具有高空间分辨率和成本效益的优势,尤其适用于FFPE样本和回顾性研究 | 未明确提及,但可推断其通量低于新兴高通量空间转录组技术,且依赖精确的形态学注释 | 提供一种针对常规组织学样本(如FFPE)的稳健LMD-RNA-seq协议,用于揭示临床上相关的特定分子信息 | 福尔马林固定石蜡包埋的组织样本 | 数字病理学 | 未明确指定,但适用于多种疾病(如癌症) | 激光显微切割、RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 372 | 2026-06-08 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Immunosuppressive Trajectory in the Tumor Microenvironment of Human Giant Cell Tumor of Bone
2026, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/bmri/9855803
PMID:41635288
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示人骨巨细胞瘤肿瘤微环境中的免疫抑制轨迹 | 首次通过单细胞测序全面解析骨巨细胞瘤肿瘤微环境中的细胞异质性和免疫抑制机制,识别出肿瘤相关巨噬细胞、CD8+ T细胞和CD4+ T细胞的新亚型及其相互作用网络 | 样本量较小(7091个细胞),且未进行功能验证实验 | 阐明骨巨细胞瘤肿瘤微环境中的免疫抑制机制及细胞间相互作用 | 骨巨细胞瘤肿瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞 | 单细胞测序 | 骨巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 7091个细胞,来源于骨巨细胞瘤手术切除样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 373 | 2026-06-08 |
Spatial Analysis of Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms Defines a Paradoxical Keratin 17-Positive, Low-Grade Epithelial Population Harboring Malignant Features
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101749
PMID:41638478
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研究论文 | 通过对导管内乳头状黏液性肿瘤进行空间转录组学分析,发现了一个表达恶性特征的角蛋白17阳性低级别上皮细胞亚群 | 首次在组织学低级别IPMN中发现一个表达恶性转录特征(包括KRT17、S100A10和CEACAM5)的上皮细胞亚群,并验证了该高风险基因特征 | NA | 研究IPMN进展过程中的转录变化,寻找更准确的风险分层标志物 | 包含从低级别不典型增生到癌变完整病程的IPMN患者组织样本,以及分支导管和主胰管IPMN活检样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学,单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | NA | 图像数据,空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 包含完整病程的IPMN患者样本和外部空间转录组数据集中的多个IPMN样本 | Nanostring | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | Nanostring GeoMx | 使用Nanostring GeoMx进行空间转录组学分析,并对分支导管和主胰管IPMN活检样本进行单细胞RNA测序 |
| 374 | 2026-06-08 |
TIMELESS Promotes LUAD Growth via Suppressing Transferrin-Mediated Ferroptosis and Reprograms the Tumor Microenvironment against Anti-PD-1 Immunotherapy
2026, Cancer communications (London, England)
DOI:10.34133/cancomm.0009
PMID:41641368
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研究论文 | 本研究揭示TIMELESS通过抑制转铁蛋白介导的铁死亡促进肺腺癌生长并重编程肿瘤微环境对抗PD-1免疫治疗 | 首次阐明TIMELESS通过招募CNOT3加速TF mRNA降解抑制铁死亡、促进肺腺癌进展的分子机制,并发现TIMELESS/TF调控轴可作为潜在治疗靶点 | NA | 探讨高表达RBP TIMELESS在肺腺癌中的分子网络及其在肿瘤进展中的机制作用 | 肺腺癌细胞系及原位肺癌小鼠模型 | 机器学习和数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 光激活核糖核苷增强交联免疫沉淀测序, 免疫共沉淀-质谱, GST pull-down, RNA免疫沉淀, 流式细胞术, 多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 组织微阵列图像 | TCGA-LUAD, GEO, scRNA-seq数据集;组织微阵列样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 375 | 2026-06-08 |
Multi-omics analysis reveals STING activation mediates NLRP3-related pyroptosis and exacerbates myocardial ischemia-reperfusion injury
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0341839
PMID:41650015
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研究论文 | 通过多组学分析揭示STING激活介导NLRP3相关细胞焦亡并加重心肌缺血再灌注损伤 | 首次结合转录组学、蛋白质组学和单细胞转录组学,全面解析STING激活在心肌缺血再灌注损伤中通过NLRP3炎症小体介导细胞焦亡的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,需进一步在临床样本中验证STING-NLRP3轴的病理作用 | 阐明STING激活在心肌缺血再灌注损伤中促进NLRP3相关细胞焦亡的分子机制 | 小鼠心肌缺血再灌注模型和人心肌细胞缺氧/复氧模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 转录组学, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 氧化应激检测 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠心肌组织样本和人类心肌细胞培养样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 376 | 2026-06-08 |
A multifaceted analysis of OTUD5 integrated MAVS in innate immunity of Primary Biliary Cholangitis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0342306
PMID:41650163
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研究论文 | 通过多层面分析揭示了OTUD5整合MAVS在原发性胆汁性胆管炎先天免疫中的作用 | 首次系统探讨OTUD5与MAVS在PBC免疫机制中的相互作用,结合单细胞转录组和蛋白组学分析,识别出单核巨噬细胞亚群11作为关键效应细胞 | RNA干扰实验仅在RAW264.7细胞系进行,未在人体原代细胞或动物模型中验证;样本量较小(16例患者vs 10例对照),可能限制结果的普适性 | 阐明OTUD5在PBC发病机制中的分子作用,为靶向治疗策略开发提供依据 | 原发性胆汁性胆管炎(PBC)患者的外周血和肝组织样本 | 生物信息学、免疫学 | 原发性胆汁性胆管炎 | 微阵列芯片、RT-qPCR、免疫荧光、蛋白组学分析(STRING/InBio Discover)、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据、单细胞转录组数据 | 16例PBC患者和10例健康对照的外周血和肝组织样本 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina测序平台 | 基于GEO数据集的微阵列芯片平台,单细胞RNA测序平台(未明确具体型号) |
| 377 | 2026-06-08 |
Aberrant IL-21/STAT3 signaling disrupts regulatory T cell function and CD4+ T cell homeostasis in children with type 1 diabetes
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1791993
PMID:42233023
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研究论文 | 本研究揭示了IL-21/STAT3信号通路异常激活导致1型糖尿病儿童调节性T细胞功能受损和CD4+ T细胞稳态失衡的机制 | 首次在单细胞水平解析IL-21/STAT3通路在儿童1型糖尿病T细胞亚群失衡中的免疫调节作用,并验证STAT3抑制剂的治疗潜力 | 体外实验主要基于原代细胞,体内实验仅使用NOD小鼠模型,尚需在人体中进一步验证临床转化价值 | 阐明IL-21/STAT3信号通路在儿童1型糖尿病T细胞免疫失衡中的分子机制 | 儿童1型糖尿病患者的外周血单核细胞及非肥胖糖尿病小鼠 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序、药理学抑制实验 | 无特定模型类型 | 单细胞转录组数据 | 儿童1型糖尿病患者样本(具体数量未提供),NOD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 378 | 2026-06-08 |
Regulatory T cells in vitiligo: a review of functional disequilibrium between peripheral blood and lesional tissue
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1844106
PMID:42233009
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综述 | 综述白癜风中调节性T细胞在外周血和病变组织之间的功能失衡 | 从系统到局部的解剖学层级角度综合分析了Treg功能失调,并提出了Treg-黑素细胞相互作用网络及新兴生物标志物 | 未详细提及综述方法的具体搜索策略或偏倚评估,实际证据来源尚缺乏系统量化分析 | 综合白癜风中Treg生物学和免疫调节功能的现有证据,重点关注外周血与病变皮肤的对比分析 | 白癜风患者的外周血和病变皮肤中的调节性T细胞 | 自然语言处理 | 白癜风 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 379 | 2026-06-07 |
Neoadjuvant modified FOLFIRINOX plus nivolumab in borderline-resectable pancreatic ductal adenocarcinoma: a pilot phase 1 trial
2026-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68976-2
PMID:41620440
|
研究论文 | 一项评估新辅助改良FOLFIRINOX联合纳武利尤单抗治疗临界可切除胰腺导管腺癌的单臂1b/2期临床试验 | 首次在临界可切除胰腺导管腺癌中评估新辅助化疗联合免疫检查点抑制剂的安全性和病理学缓解率,并通过空间转录组学揭示治疗诱导的肿瘤微环境变化 | 单臂设计、样本量较小(28例患者)、缺乏随机对照,且主要终点为安全性和病理学缓解率,生存数据为事后分析 | 评估新辅助改良FOLFIRINOX联合纳武利尤单抗在临界可切除胰腺导管腺癌患者中的安全性和疗效 | 28例临界可切除胰腺导管腺癌患者 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、免疫组化图像、空间转录组数据 | 28例患者(其中22例接受手术) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 380 | 2026-06-07 |
Oxidative stress-associated genes TPPP3 and VEGFA in COPD revealed by bulk and single-cell sequencing analysis
2026-Jan-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37375-4
PMID:41620539
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研究论文 | 通过整体和单细胞测序分析,揭示氧化应激相关基因TPPP3和VEGFA在慢性阻塞性肺疾病中的作用 | 首次整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,结合机器学习算法筛选出12个与氧化应激相关的COPD核心基因,并实验验证TPPP3和VEGFA在上皮细胞中的高表达及其在组织重塑中的潜在作用 | 基于公开数据库的二次分析,缺乏大规模临床队列验证;实验验证仅在细胞模型中进行,未在动物或人体组织中进一步确认 | 识别并验证COPD中关键的氧化应激相关基因和通路 | COPD患者样本数据(来自GEO数据库)以及人支气管上皮细胞(BEAS-2B) | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO回归, 随机森林 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的COPD公共数据集(具体数量未披露) | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |