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当前共找到 1426 篇文献,本页显示第 341 - 360 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
341 2026-02-24
ECM remodeling-associated immune signatures and hub proteins: predictive markers and therapeutic targets for metastatic gastric cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过蛋白质组学和单细胞RNA测序技术,揭示了胃癌转移中细胞外基质重塑相关的免疫特征和核心蛋白,并验证了RPS29在胃癌细胞转移机制中的功能作用 结合蛋白质组学和单细胞RNA测序技术,系统识别了胃癌转移相关的核心蛋白和肿瘤细胞亚型,并首次验证了RPS29在胃癌转移中的调控机制 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型的验证,且样本量可能有限 探索胃癌转移过程中细胞外基质重塑的分子机制,识别预测标志物和治疗靶点 胃癌细胞和细胞外基质蛋白 数字病理学 胃癌 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 NA 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
342 2026-02-24
Multi-omics comprehensive analysis identified KIF22 and KRAS as highly synthetic lethal pairs for triple-negative breast cancer
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过多组学分析识别出KIF22和KRAS作为三阴性乳腺癌的合成致死基因对 首次通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序等多组学数据,结合机器学习方法,系统性地鉴定出三阴性乳腺癌中具有高合成致死活性的新型细胞亚型,并实验验证了KIF22和KRAS作为合成致死基因对的功能 研究主要基于生物信息学分析和体外体内实验验证,临床转化潜力尚需进一步临床试验评估 探索三阴性乳腺癌的异质性,识别与疾病进展相关的合成致死基因对,为靶向治疗提供新策略 三阴性乳腺癌细胞及其微环境细胞亚群 生物信息学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 随机森林, 机器学习 RNA测序数据 未明确指定具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
343 2026-02-24
ESRP1 drives epithelial-mesenchymal transition by activating EPAC-RAP1A signaling axis
2026, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 本研究揭示了ESRP1通过激活EPAC-RAP1A信号轴驱动上皮-间质转化,从而促进特发性肺纤维化进展 首次在单细胞水平上识别ESRP1作为EMT的关键上游调控因子,并阐明其通过EPAC-RAP1A轴的新机制 研究主要基于小鼠模型和细胞系,人类样本验证不足,且未探讨其他潜在信号通路 探究特发性肺纤维化中上皮-间质转化的分子机制 小鼠肺组织、原代肺泡上皮细胞、MLE-12肺泡上皮细胞系 单细胞转录组学 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序、qPCR、Western blot、免疫荧光、Co-IP NA 单细胞转录组数据、基因表达数据、蛋白质互作数据 未明确样本数量,包括BLM处理的小鼠模型和细胞培养实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
344 2026-02-23
An integrated single-cell lung cancer atlas reveals distinct fibroblast phenotypes between adenocarcinoma and squamous cell carcinomas
2026-Jan-23, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过整合公共可用的单细胞RNA测序数据,构建了一个非小细胞肺癌的综合图谱,揭示了肺腺癌和肺鳞状细胞癌之间肿瘤微环境异质性、细胞组成以及癌症相关成纤维细胞亚型的显著差异 首次通过整合大规模公共单细胞RNA测序数据,系统比较了肺腺癌和肺鳞状细胞癌中肿瘤微环境的异质性,并明确了两种亚型中占主导地位的癌症相关成纤维细胞亚型及其与预后的不同关联 研究依赖于公共数据集,可能存在批次效应;研究结果主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;共培养实验在体外进行,可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 探究非小细胞肺癌中肺腺癌和肺鳞状细胞癌之间肿瘤微环境,特别是癌症相关成纤维细胞亚型的差异及其与预后的关系 非小细胞肺癌患者肿瘤组织中的细胞,特别是癌症相关成纤维细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 整合了公共可用的大规模单细胞RNA测序数据集(具体样本数量未在摘要中明确给出) NA 单细胞RNA-seq NA NA
345 2026-02-23
Expression Atlas in 2026: enabling FAIR and open expression data through community collaboration and integration
2026-Jan-06, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了Expression Atlas知识库在2026年的更新,包括内容扩展、功能增强和社区协作,以支持FAIR原则下的基因和蛋白质表达数据 新增了批量基线实验的标记基因分析模块,整合了单细胞RNA-seq数据集如Tabula Sapiens和GTEx单核图谱,并计划提供AI就绪数据格式 未明确提及具体的技术或数据局限性,主要关注资源更新和未来方向 通过社区协作和集成,实现FAIR和开放的表达数据,支持基础和转化研究 基因和蛋白质表达数据,涵盖组织、细胞类型、条件和多种物种 生物信息学 NA 单细胞RNA-seq,蛋白质组学 NA 基因表达数据,蛋白质表达数据 超过4500项研究,涉及67个物种,包括数百个单细胞RNA-seq实验 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
346 2026-02-23
Molecular interplay of ASNS and the PI3K-AKT-mTOR pathway in CMV and HIV co-infections: Therapeutic implications
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究揭示了天冬酰胺合成酶(ASNS)在CMV/HIV共感染中作为关键的代谢信号枢纽,并与PI3K-AKT-mTOR通路相互作用,为开发宿主导向的治疗策略提供了新靶点 首次将ASNS确定为CMV/HIV共感染发病机制中的关键代谢信号枢纽,并通过分子对接和动力学模拟发现抗病毒药物西多福韦能高亲和力结合ASNS,提出了靶向ASNS特定残基(VAL-51和ASN-74)的新型宿主导向治疗策略 研究主要基于生物信息学分析和计算模拟,需要进一步的实验验证来确认ASNS作为治疗靶点的有效性和安全性 阐明CMV/HIV共感染的分子机制,并寻找新的治疗靶点以改善患者预后 CMV和HIV共感染的分子相互作用网络,特别是ASNS与PI3K-AKT-mTOR通路的关系 生物信息学 HIV感染 转录组学分析、单细胞RNA测序、机器学习、分子对接、分子动力学模拟 机器学习模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
347 2026-02-22
Oxidative stress-associated genes TPPP3 and VEGFA in COPD revealed by bulk and single-cell sequencing analysis
2026-Jan-31, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合生物信息学和实验方法,识别并验证了慢性阻塞性肺疾病(COPD)中与氧化应激相关的关键基因和通路 结合批量测序和单细胞RNA测序分析,首次在COPD中鉴定出TPPP3和VEGFA作为上皮细胞中富集的关键氧化应激相关基因,并进行了实验验证 研究主要基于公共数据库和细胞模型,缺乏体内实验或临床样本的直接验证,可能限制其临床转化潜力 识别和验证COPD中与氧化应激相关的关键基因及通路,以探索新的治疗策略和潜在生物标志物 慢性阻塞性肺疾病(COPD)相关的基因表达数据及人支气管上皮细胞(BEAS-2B) 生物信息学 慢性阻塞性肺疾病 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 LASSO回归, 随机森林 基因表达数据 未明确指定具体样本数量,但使用了公共GEO数据库中的多个COPD数据集 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
348 2026-02-22
A Single-Cell and Spatial 3D Multi-omic Atlas of Developing Human Basal Ganglia and Inhibitory Neurons
2026-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究构建了发育中人类基底神经节和抑制性神经元的单细胞与空间3D多组学图谱 首次结合单核甲基-3C测序、高多重空间转录组学和染色质+RNA单分子成像技术,揭示了基底神经节发育中3D表观基因组的动态变化 研究主要关注围产期大脑,未涵盖更广泛的发育阶段或疾病状态 阐明基底神经节发育过程中表观基因组和3D基因组的动态变化 人类基底神经节、神经节隆起及其衍生的神经元 数字病理学 神经精神疾病 单核甲基-3C测序, 空间转录组学, 染色质+RNA单分子成像 NA 单细胞多组学数据, 空间转录组数据, 3D基因组数据 未明确说明样本数量,但涉及发育中的人类大脑组织 NA 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
349 2026-02-22
The clinical significance of the Mediterranean fever gene MEFV variants in Castleman disease
2026-Jan-29, Communications medicine IF:5.4Q1
研究论文 本研究探讨了地中海热基因MEFV变异在Castleman病(CD)中的临床意义,特别是在iMCD-TAFRO亚型中的作用 首次在较大队列中揭示MEFV变异在CD中的高流行率,并通过体外实验和单细胞RNA测序阐明了MEFV表达与IL-6通路激活的关联 样本量较小(37例患者),且为回顾性研究,可能限制结果的普遍性 阐明MEFV基因变异在Castleman病发病机制中的作用,特别是对iMCD-TAFRO亚型的影响 Castleman病患者(包括iMCD-TAFRO亚型)及其血液/淋巴结活检样本 单细胞组学 Castleman病 全外显子测序, 单细胞RNA测序, 定量PCR, Luminex细胞因子检测 NA 基因组数据, 转录组数据, 临床数据 37例CD患者,包括一名青少年TAFRO患者及其无症状父母和健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
350 2026-02-22
Machine learning identifies disulfidptosis-related gene signature for pancreatic cancer prognosis and immune infiltration
2026-Jan-27, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过生物信息学和单细胞分析,探索了与胰腺癌预后和免疫浸润相关的二硫死亡相关基因特征 首次将新型细胞死亡方式——二硫死亡相关基因特征应用于胰腺癌预后模型的构建,并结合单细胞RNA测序揭示了关键基因在肿瘤微环境中的表达模式 外部验证集的模型性能中等(C-index=0.6),表明模型有待进一步优化 识别胰腺癌的预后生物标志物和免疫浸润模式 胰腺癌患者 机器学习 胰腺癌 单细胞RNA测序,生物信息学分析 随机生存森林,StepCox 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
351 2026-02-22
Exploring the key molecular mechanisms and immune microenvironment of oxidative stress-related pathways in pancreatic neuroendocrine tumor combining scRNA-seq and bulk RNA
2026-Jan-27, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,系统探索了氧化应激相关通路在胰腺神经内分泌肿瘤中的关键分子机制和免疫微环境 首次结合单细胞和批量RNA测序数据,系统阐明氧化应激通路通过BCL2L1和PHGDH等关键基因调控pNET进展的分子机制和免疫微环境相互作用 研究主要基于公共数据集的分析,缺乏实验验证;单细胞数据样本量相对有限(20个样本) 阐明氧化应激相关通路如何驱动胰腺神经内分泌肿瘤进展的分子机制及其与肿瘤微环境的相互作用 胰腺神经内分泌肿瘤(pNET)样本 生物信息学 胰腺神经内分泌肿瘤 scRNA-seq, bulk RNA-seq, 差异表达分析, WGCNA, GO/KEGG富集分析, PPI网络, CIBERSORTx免疫浸润分析, ceRNA网络构建, 转录因子预测, 药物预测, 分子对接 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 蛋白质-蛋白质相互作用网络, 预后列线图模型, ROC分析 基因表达数据(RNA-seq) 批量RNA-seq数据集GSE73338包含63个pNET样本和5个对照样本;单细胞RNA-seq数据集GSE256136包含20个样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
352 2026-02-22
Unveiling the early defense response dynamics in grapevines against Plasmopara viticola by single-cell transcriptomics
2026-Jan-27, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和空间RNA测序技术,首次构建了葡萄叶片在霜霉病菌感染期间的单细胞转录组图谱,揭示了植物细胞在感染早期的动态防御响应 首次在单细胞水平上解析葡萄对霜霉病菌感染的防御响应,结合scRNA-seq和spRNA-seq技术,发现了保卫细胞转录组被病原体重编程以促进入侵的新机制 研究主要关注早期感染阶段,可能未覆盖整个感染过程的动态变化;样本数量虽大,但仅针对特定葡萄品种和感染条件 揭示葡萄在单细胞水平上对霜霉病菌感染的早期防御响应动态 葡萄叶片细胞在Plasmopara viticola感染下的转录组变化 数字病理学 植物病害 单细胞RNA测序, 空间RNA测序 NA 转录组数据 约100,000个单个细胞(约89,000个来自scRNA-seq,约11,000个来自spRNA-seq) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
353 2026-02-22
SCITO-seq2: ultra-high-throughput single-cell transcriptome and epitope sequencing
2026-Jan-27, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文介绍了SCITO-seq2,一种增强型单细胞转录组和表位测序平台,能够同时量化超过10万个细胞的转录本和表面蛋白 SCITO-seq2整合了基于探针的RNA检测与超高通量蛋白质分析,采用共享池条形码策略确保分子谱的精确匹配,并兼容细胞哈希技术以实现高效样本多重分析 NA 开发一个可扩展、简化且成本效益高的下一代单细胞多组学工作流程 自身免疫性疾病,包括儿童系统性红斑狼疮和CTLA4单倍体不足伴自身免疫浸润 单细胞测序 自身免疫性疾病 单细胞转录组测序,表位测序 NA RNA序列数据,蛋白质表达数据 超过100,000个细胞 NA 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 SCITO-seq2 整合探针RNA检测与超高通量蛋白质分析,采用共享池条形码策略和细胞哈希技术
354 2026-02-22
Deciphering stromal cell interactions in osteosarcoma highlights CDKN2A and MMP14 as novel diagnostic and therapeutic biomarkers
2026-Jan-27, European journal of medical research IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和转录组分析,揭示了骨肉瘤中基质细胞网络,并识别了CDKN2A和MMP14作为新型诊断标志物和治疗靶点 首次结合单细胞RNA测序和转录组数据集,利用hdWGCNA分析基质细胞基因模块,并识别出CDKN2A和MMP14作为骨肉瘤的潜在生物标志物,同时通过分子对接验证了白藜芦醇作为MMP14的候选治疗分子 研究主要基于公共数据库(GEO)数据,缺乏大规模临床样本验证,且功能实验仅限于骨肉瘤细胞系,未涉及体内模型 解析骨肉瘤中基质细胞相互作用网络,识别新的诊断标志物和治疗靶点 骨肉瘤(OS)及其基质微环境中的细胞亚群,包括巨噬细胞、基质细胞、T细胞等 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、转录组分析、WGCNA、DESeq2差异表达分析、分子对接 Seurat、CellChat、hdWGCNA 单细胞转录组数据、转录组数据集 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
355 2026-02-22
KIF5B-driven unfolded protein response reprograms breast cancer immunosuppressive microenvironment for single-cell guided therapeutic targeting
2026-Jan-26, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据,揭示了KIF5B在乳腺癌中作为预后生物标志物和治疗靶点的作用,并探讨了其对肿瘤免疫微环境的影响 首次通过多模态数据分析,将KIF5B与未折叠蛋白反应、免疫浸润和药物敏感性联系起来,为乳腺癌的精准治疗提供了新见解 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;数据来源于多个数据集,可能存在批次效应 探究KIF5B在乳腺癌预后、肿瘤微环境和治疗反应中的综合作用 乳腺癌患者及其肿瘤微环境 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 hdWGCNA, 共识聚类 RNA-seq数据 多个数据集的样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
356 2026-02-22
Exosome RAB10 inhibits JAK1/STAT1 to hinder macrophage M1 polarization and promote tumor immune escape
2026-Jan-26, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1
研究论文 本研究揭示了乳腺癌细胞通过外泌体递送RAB10蛋白,抑制巨噬细胞M1极化并促进其M2极化,从而促进肿瘤免疫逃逸的机制 首次发现外泌体RAB10通过与干扰素受体IFNAR1结合,抑制JAK1/STAT1通路磷酸化,从而调控巨噬细胞极化,并证明联合靶向RAB10和PD-L1具有协同抗肿瘤效应 研究主要基于乳腺癌模型,其他肿瘤类型中的普适性有待验证;临床样本验证相对有限 探究外泌体RAB10在调控巨噬细胞极化及肿瘤免疫逃逸中的作用机制 乳腺癌细胞、巨噬细胞、肿瘤微环境、CD8⁺ T细胞 肿瘤免疫学 乳腺癌 单细胞RNA测序、体外实验、动物模型 NA 基因表达数据、蛋白质数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
357 2026-02-22
Intermittent fasting inhibits Tp53-driven glioma through gut microbiota-mediated methionine-m6A regulation
2026-Jan-20, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了间歇性禁食(IF)通过肠道菌群介导的甲硫氨酸-m6A调控途径抑制Tp53驱动型胶质瘤的分子机制 首次发现IF的抗肿瘤效果与胶质母细胞瘤(GBM)亚型(Tp53型 vs CDKN2A型)相关,并通过多组学技术系统阐明了肠道菌群-甲硫氨酸-m6A修饰-TGF-β信号轴在其中的作用机制 研究主要基于小鼠模型,人体临床验证尚需开展;对CDKN2A亚型GBM中IF效果不显著的机制未深入探讨 探究间歇性禁食抑制胶质母细胞瘤的亚型特异性机制 Tp53驱动型和Cdkn2a驱动型胶质母细胞瘤小鼠模型 肿瘤生物学 胶质母细胞瘤 多组学测序(空间转录组、空间代谢组、单细胞转录组、单细胞RNA甲基化、代谢组、微生物组) 小鼠肿瘤模型 多组学数据 未明确说明 NA 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞转录组学, 单细胞RNA甲基化, 代谢组学, 微生物组学 NA NA
358 2026-02-22
Robust and interpretable prediction of gene markers and cell types from spatial transcriptomics data
2026-Jan-16, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一个名为STimage的综合模型套件,用于直接从标准H&E图像预测空间基因表达和分类细胞类型 通过估计基因表达分布并使用集成方法量化数据驱动和模型不确定性,增强了模型的鲁棒性;通过单细胞分辨率的归因分析结合组织病理学注释、功能基因和潜在表示,提高了可解释性 NA 提高空间转录组学数据中基因标记和细胞类型预测的鲁棒性和可解释性 空间转录组学数据中的基因表达和细胞类型 数字病理学 NA 空间转录组学 深度学习模型,集成方法 图像 NA NA 空间转录组学 NA NA
359 2026-02-22
Biologically interpretable deep learning-derived MRI phenotypes reveal lymph node involvement and neoadjuvant therapy response in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Jan-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究开发了一个名为SwinU-CliRad的深度学习模型,用于对肝内胆管癌的淋巴结受累风险进行分层,并评估其对新辅助治疗反应的预测能力 整合了基于Swin UNETR的MRI衍生输出与临床放射学特征,构建了可解释的深度学习模型,并探索了模型输出与肿瘤多组学特征的相关性 研究涉及多个队列,但外部验证队列样本量相对较小(n=88),且模型性能仍需在更广泛的多中心数据中进一步验证 开发一个模型以改进肝内胆管癌的淋巴结受累分层,并为治疗决策提供信息 肝内胆管癌患者 计算机视觉 肝内胆管癌 单细胞RNA测序,多组学分析 Swin UNETR,SwinU-CliRad框架 磁共振成像,临床放射学特征 发现队列682例,内部测试队列204例,外部多中心队列88例,新辅助治疗队列145例 NA 单细胞RNA测序 NA NA
360 2026-01-14
Decoding the tumor microenvironment remodeling orchestrated by CLEC3B+ inflammatory cancer-associated fibroblasts in lung adenocarcinoma immunotherapy: elucidation from pan-cancer spatially single-cell transcriptomics landscape
2026-Jan-12, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
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