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当前共找到 2200 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2026-08-31 |
Radiotherapy Reprograms Intermediate Monocytes Into Proinflammatory Drivers of Systemic Inflammation in Radiation-Induced Heart Disease
2026, Cardiology research and practice
IF:1.8Q3
DOI:10.1155/crp/1117746
PMID:42004243
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胸放疗前后患者外周血单核细胞，揭示放疗重编程中间单核细胞为促炎驱动因素，导致系统性炎症和辐射诱导心脏病 | 首次通过单细胞转录组学结合流式细胞术和ELISA验证，发现放疗选择性扩增高度可塑的中间单核细胞亚群，并揭示其沿伪时间轨迹分化为成熟经典单核细胞且上调促炎效应基因，同时展示炎症激活和氧化应激反应的双向功能分化 | 摘要未提及明确局限性 | 阐明放疗诱导心脏病的发病机制，特别是系统性免疫改变中中间单核细胞的作用 | 胸放疗患者放疗前后的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | 辐射诱导心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、ELISA数据 | 未明确样本数量，涉及胸放疗患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 322 | 2026-08-31 |
Single-Cell Transcriptomic Atlas Reveals Metabolic Reprogramming and Transdifferentiation Trajectories in Tubular Epithelial Cells During Chronic Kidney Disease Progression
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/9747425
PMID:42004979
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建了慢性肾脏病进展中肾小管上皮细胞的转录组图谱，揭示了代谢重编程和转分化轨迹 | 首次在单细胞水平系统描绘了CKD中肾小管上皮细胞的代谢状态异质性，并结合伪时间轨迹推断和机器学习分类，识别了从氧化磷酸化到糖酵解的代谢重编程及关键基因驱动的细胞转分化轨迹 | 样本量有限，机器学习分类结果中等（ROC AUC = 0.673），需进一步验证 | 阐明慢性肾脏病进展中肾小管上皮细胞的细胞异质性和潜在分子机制，为精准医学治疗提供依据 | 慢性肾脏病患者的肾细胞，重点关注肾小管上皮细胞群体 | 单细胞转录组学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习分类模型（具体类型未提及） | 单细胞转录组数据 | 未明确提及具体样本数量，但包括多名CKD患者的肾细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 323 | 2026-08-31 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Potential Role of GZMK+ CD8+ T Cells in Cell Senescence of Triple-Negative Breast Cancer
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/4215646
PMID:42004980
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研究论文 | 本研究结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序，揭示GZMK+ CD8+ T细胞在三阴性乳腺癌细胞衰老中的潜在作用 | 首次将孟德尔随机化与单细胞转录组学相结合，鉴定GZMK为TNBC风险相关关键基因，并揭示GZMK+中央记忆CD8+ T细胞与巨噬细胞、单核细胞和上皮细胞的复杂配体-受体互作网络 | 摘要未提及具体局限性 | 阐明关键基因在基因表达对细胞衰老和TNBC进展影响中的中介作用，评估GZMK作为治疗靶点的潜力 | 三阴性乳腺癌细胞系、衰老和TNBC单细胞数据集 | 单细胞转录组学 | 三阴性乳腺癌 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 324 | 2026-08-31 |
SPP1 as a Critical Regulator of Cardiac Cell Reprogramming Following Myocardial Infarction Through Single-Cell Transcriptomic Analysis
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/3656018
PMID:42006146
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析，本研究识别出SPP1作为心肌梗死后心脏细胞重编程的关键调控因子，并利用机器学习算法揭示了与心脏修复相关的基因特征 | 整合了26种机器学习算法和单细胞转录组数据，首次系统性地识别出SPP1作为心肌修复的潜在生物标志物和治疗靶点，并验证了其促进细胞存活和分泌心脏保护因子的功能 | 发现需要在更接近生理状态的实验系统和独立临床队列中进行验证，且目前结果主要基于细胞模型 | 阐明心肌梗死后心肌细胞重编程的分子机制，并识别新的预后生物标志物和治疗靶点 | 急性心肌梗死患者的心脏组织样本及H9c2心肌母细胞系 | 自然语言处理, 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 机器学习算法（具体模型未指定） | 基因表达数据（批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据集） | 来自AMI患者的批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据集，具体样本量未在摘要中说明 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 325 | 2026-08-31 |
Metabolic reprogramming-associated genomic instability drives colorectal cancer progression via the UBXN1-NF-κB axis
2026, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/IWGB8367
PMID:42007143
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据构建结直肠癌的单细胞图谱，揭示代谢重编程与基因组不稳定性之间的关联，并确定UBXN1作为潜在治疗靶点 | 首次通过整合多个单细胞数据集，系统阐明结直肠癌代谢特征与拷贝数变异定义的恶性状态之间的预测关系，并发现UBXN1通过NF-κB信号通路调控癌细胞恶性表型 | 研究主要基于公开数据库的分析，缺乏体外或体内功能验证实验 | 探讨结直肠癌中代谢重编程与拷贝数变异之间的关联，并识别潜在治疗靶点 | 结直肠癌患者的上皮细胞及恶性细胞亚群 | 机器学习和数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，InferCNV分析，共识非负矩阵分解，AUCell方法 | 共识非负矩阵分解和机器学习算法 | 单细胞转录组数据 | 四个公开的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 326 | 2026-08-31 |
Multi-omics screening and functional validation identify SLC5A6 as a candidate disulfidptosis-related gene and prognostic biomarker in hepatocellular carcinoma
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1918635
PMID:42666251
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研究论文 | 本研究通过多组学筛选和功能验证，确定SLC5A6为肝细胞癌中潜在的二硫化物死亡相关基因和预后生物标志物 | 首次将SLC5A6与二硫化物死亡联系起来，并利用单细胞RNA测序、TCGA数据和多种功能实验进行验证 | SLC5A6在调节二硫化物死亡中的直接作用仍需进一步确认，其与免疫排斥相关特征的关联也需要更多功能验证 | 识别与肝细胞癌进展相关的二硫化物死亡相关基因，并探究SLC5A6的潜在生物学作用 | 肝细胞癌组织和细胞系，包括SLC7A11高表达的HCC细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、ssGSEA、inferCNV、WGCNA、GSVA、细胞增殖/迁移/侵袭/凋亡实验、异种移植实验 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、实验数据 | 单细胞RNA测序数据（具体数量未提供），TCGA-LIHC转录组数据（具体病例数未提供），功能实验涉及多个HCC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 327 | 2026-08-31 |
Type 17 T-cell subset divergence in hidradenitis suppurativa versus psoriasis: a comparative single-cell transcriptomic analysis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1835460
PMID:42666328
|
研究论文 | 比较银屑病与化脓性汗腺炎中Type 17 T细胞亚群差异的单细胞转录组分析 | 首次在单细胞分辨率下系统比较银屑病与化脓性汗腺炎中T17细胞亚群组成及Treg转录程序，揭示疾病特异性免疫架构 | 样本量有限，未对功能差异进行体内验证，且缺乏对治疗反应的直接比较 | 定义银屑病和化脓性汗腺炎中疾病特异性T17细胞亚群组成及Treg转录程序，为治疗反应差异提供假说框架 | 银屑病（n=20）、化脓性汗腺炎（n=8）、特应性皮炎（n=4）及健康对照（n=19）的皮损组织 | 转录组学 | 银屑病、化脓性汗腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 51例皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 328 | 2026-08-31 |
PLAC8 participates in the prognosis regulation of breast cancer by regulating the infiltration of immune cells in the tumor microenvironment
2026, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2026.1814907
PMID:42666350
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据，研究PLAC8在乳腺癌肿瘤微环境中免疫细胞浸润的作用及其预后调控机制 | 首次在乳腺癌肿瘤微环境中发现PLAC8在B细胞中特异性高表达，并揭示其通过核心转录网络重塑免疫稳态、介导异质性免疫协同预后效应 | 主要依赖公共数据集进行分析，缺乏实验验证；PLAC8在B细胞中的具体功能机制尚未完全阐明 | 探讨PLAC8在乳腺癌肿瘤微环境中的作用机制及其预后调控功能 | 乳腺癌原发灶和软脑膜转移灶的免疫细胞，特别是B细胞、单核细胞/巨噬细胞和CD8+ T细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 生存分析 | NA | 基因表达数据, 临床数据 | 两个单细胞RNA测序数据集（GSE161529和GSE150660）及TCGA-BRCA队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 329 | 2026-08-31 |
MicroRNA cluster 7/17/155 as a potential driver for high-grade breast tumors transformation through EGFR-associated EMT
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1899163
PMID:42666385
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研究论文 | 本研究旨在通过重新分析微阵列数据和高通量转录组数据集，识别与乳腺癌干细胞特性相关的miRNA簇，并探讨其在肿瘤去分化中的作用 | 首次将miRNA簇7/17/155与EGFR介导的上皮-间质转化及乳腺肿瘤去分化联系起来，并利用单细胞RNA测序和伪时间轨迹分析揭示其作为肿瘤异质性和干性潜在驱动因子的作用 | 未明确提及，可能受限于样本量和数据来源的多样性 | 识别与乳腺癌干细胞特性相关的miRNA簇，并研究其调控功能，以期为乳腺癌去分化逆转提供治疗靶点和分子分型生物标志物 | 乳腺癌组织样本，包括不同分级肿瘤的转录组数据及单细胞RNA测序数据 | 基因组学、转录组学、生物信息学 | 乳腺癌 | 微阵列、高通量转录组测序、单细胞RNA测序、q-PCR、免疫组化、伪时间轨迹分析 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、图像数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 微阵列、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 330 | 2026-08-31 |
Integrative single-cell and bulk transcriptomic analyses identify a microglia-associated NAGLU signature linked to disulfidptosis-associated transcriptional patterns after spinal cord injury
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1899070
PMID:42666489
|
研究论文 | 整合单细胞和批量转录组分析，鉴定与脊髓损伤后二硫键死亡相关转录模式相关的微胶质细胞NAGLU特征 | 首次将二硫键死亡相关基因与脊髓损伤后的细胞异质性联系起来，并通过整合分析鉴定出微胶质细胞相关的NAGLU作为关键基因 | 未在功能层面验证NAGLU在脊髓损伤中的具体作用机制，且验证仅限于大鼠模型3天时间点 | 探究脊髓损伤后二硫键死亡相关基因的转录特征及其与细胞微环境的关联，并鉴定关键候选基因 | 脊髓损伤后的细胞类型，特别是微胶质细胞 | 转录组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、加权基因共表达网络分析、随机森林算法 | 随机森林 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | GSE162610（单细胞）、GSE47681（批量）、GSE45006（独立验证）、大鼠脊髓组织（每组若干只，具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 331 | 2026-08-31 |
Integrative analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq with machine learning develops a nucleotide metabolism-based prognostic model for ccRCC and reveals the function of IFI30
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1881692
PMID:42666649
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研究论文 | 整合单细胞和 bulk RNA-seq 数据并利用机器学习构建基于核苷酸代谢的肾透明细胞癌预后模型，验证关键基因 IFI30 的功能 | 首次揭示 IFI30 通过调节核苷酸代谢促进 ccRCC 恶性进展，并构建了优于现有模型的预后模型 | 未提及 | 阐明核苷酸代谢在 ccRCC 中的异质性特征和关键基因，为预后评估和靶向治疗提供新见解 | 肾透明细胞癌 (ccRCC) 患者样本及细胞系 | 机器学习 | 肾细胞癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, 机器学习, 免疫组化, 体外实验, 体内实验 | 机器学习算法 | 基因表达数据（单细胞和 bulk RNA-seq）及临床数据 | 多个独立队列（具体样本量未提及） | NA | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 332 | 2026-08-31 |
Transcriptomics and single-cell RNA sequencing uncover prognostic characteristics and immune regulatory mechanisms of lactylation in cervical cancer
2026, BioImpacts : BI
IF:2.2Q3
DOI:10.34172/bi.33527
PMID:42666969
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研究论文 | 本研究通过整合转录组数据和单细胞RNA测序，识别宫颈癌中乳酸化相关的预后特征，并探讨其免疫调控机制。 | 首次将乳酸化修饰与宫颈癌的预后特征及CD8+ T细胞分化轨迹相结合，揭示乳酸化在肿瘤微环境中的免疫调节作用。 | 依赖于公共数据集，缺乏实验验证。 | 识别宫颈癌中乳酸化相关预后基因并阐明其免疫调控机制。 | 宫颈鳞状细胞癌（CESC）患者样本。 | 转录组学，单细胞转录组学 | 宫颈癌 | RNA-seq，scRNA-seq | 风险模型 | 转录组数据 | 未具体报告，使用公共数据集 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 333 | 2026-08-31 |
scGraphVerse: a modular workflow for single-cell gene network inference
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag208
PMID:42667051
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研究论文 | scGraphVerse是一个R包，用于从单细胞RNA测序数据推断基因网络，集成了多种算法并提供综合评估与可视化工具 | 提出了模块化工作流程，支持早期、晚期和联合整合策略进行多数据集分析，并提供标准化的输入输出接口和生物解释工具 | 未明确说明，但可能依赖于模拟数据的基准测试和单一PBMC案例研究 | 开发一个整合多算法和综合后处理分析的单细胞基因网络推断流程 | 模拟数据及PBMC单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成学习（GENIE3, GRNBoost2, ZILGM, PCzinb, JRF） | 基因表达数据（scRNA-seq） | 模拟数据及一个PBMC案例研究（具体样本量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 334 | 2026-08-29 |
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneity of mucosaassociated invariant T cells in donor grafts and its diagnostic relevance in gastrointestinal graft-versus-host disease
2026-01-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.287114
PMID:40820727
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究供体移植物中黏膜相关恒定T细胞的异质性，并评估其在胃肠道移植物抗宿主病中的诊断价值 | 首次揭示G-CSF通过受体CSF3R增强MAIT细胞的免疫抑制和组织修复功能，并鉴定CXCR6-CXCR16轴在MAIT细胞向肠道迁移中的关键作用，开发了基于MAIT细胞频率和功能标志物的流式细胞术预测模型，将aGVHD预测提前至移植前阶段 | 未提及 | 探究G-CSF动员对MAIT细胞的影响及其在肠道移植物抗宿主病中的保护机制，并开发预测模型 | 供体G-CSF动员外周血干细胞移植物中的MAIT细胞及受体小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 胃肠道移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 335 | 2026-08-27 |
Antibody Generation Using Cancer-Derived Small Extracellular Vesicles (sEVs): A Platform for Targeted Cancer Therapy and Potential Personalized Applications
2026-Jan, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506918
PMID:41311345
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研究论文 | 开发了一种利用癌症来源的小细胞外囊泡（sEVs）生成肿瘤靶向单克隆抗体的新方法，并评估了抗体功能化的sEVs在靶向癌症治疗中的潜力。 | 首次利用癌症来源的sEVs作为免疫原生成肿瘤靶向单克隆抗体，这些抗体具有高特异性或细胞毒性，并能通过功能化sEVs增强肿瘤靶向递送，同时诱导免疫激活和肿瘤抑制相关的转录变化。 | 摘要未明确提及局限性。 | 开发一种基于癌症来源sEVs的抗体生成平台，以提高肿瘤靶向治疗的药物递送效率。 | 人卵巢癌细胞系（OVCAR-8）来源的sEVs及生成的单克隆抗体。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单克隆抗体生成（杂交瘤技术）、RNA测序、空间转录组学 | NA | RNA测序数据、空间转录组数据 | OVCAR-8荷瘤小鼠（具体样本量未报告） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 336 | 2026-08-25 |
A Genetic Perspective to Reveal the Impact of Mitochondrial Dysfunction-related Genes on Diabetic Kidney Disease: A Multi-omics Study
2026, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了线粒体功能障碍相关基因在糖尿病肾病进展中的作用，并识别出具有显著遗传因果效应的基因，为治疗提供理论基础 | 本研究首次结合SMR和MR分析、共定位、单细胞RNA测序及分子动力学模拟，系统探讨了线粒体功能障碍相关基因在糖尿病肾病中的因果作用，并预测了二氢麦角隐亭作为潜在靶向化合物 | 未提及具体局限性 | 探究线粒体功能障碍在糖尿病肾病进展中的因果关系，并识别相关基因作为治疗靶点 | 线粒体功能障碍相关基因及其在糖尿病肾病中的表达和功能 | 基因组学、转录组学、蛋白质组学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序、SMR分析、MR分析、共定位分析、分子动力学模拟、免疫荧光 | 预测模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据、蛋白质结构数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 337 | 2026-08-25 |
Allogeneic hematopoietic stem cell transplantation for the treatment of chronic active Epstein-Barr virus infection
2026 Jan-Dec, Cell transplantation
IF:3.2Q2
DOI:10.1177/09636897251414206
PMID:41618712
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综述 | 本文综述了异基因造血干细胞移植（allo-HSCT）治疗慢性活动性EB病毒（CAEBV）感染的现状，强调其作为唯一可能根治策略的地位，并讨论了移植时机、供者选择、预处理强度及并发症管理等因素对预后的影响 | 基于单细胞测序和嵌合体研究，明确EBV感染的造血干细胞是CAEBV起始和维持的“种子”细胞，从而论证allo-HSCT的根治潜力，并提出结合移植前后策略的综合治疗方案 | 未提供具体的临床试验数据或荟萃分析结果，缺乏对移植方案个体化决策的量化指导，且对新兴疗法的讨论较为初步 | 探讨allo-HSCT在CAEBV治疗中的价值、现有挑战及未来研究方向，以改善患者长期生存 | 慢性活动性EB病毒（CAEBV）感染患者及其移植治疗过程 | 数字病理学 | 淋巴增殖性疾病 | 单细胞测序、嵌合体研究 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 338 | 2026-08-25 |
Pre-plaque glutamatergic hyperexcitability, mitochondrial dysfunction, and dendritic remodeling in the hippocampus of one-month-old 5xFAD mice
2026, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2026.1804332
PMID:42528726
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研究论文 | 本研究探究了5xFAD小鼠在斑块形成前一个月龄时海马区的谷氨酸能超兴奋性、线粒体功能障碍和树突重塑，揭示了早期细胞事件先于明显淀粉样斑块沉积 | 首次在5xFAD小鼠模型中定义了斑块前窗口期，该时期以GluN2B相关谷氨酸能超兴奋性、早期线粒体破坏及选择性树突和转录组脆弱性为特征，并通过空间转录组学将线粒体转录组抑制定位到CA1锥体神经元，建立了细胞类型特异性的生物能量特征 | 观察性质的研究，详细的机制尚未确立 | 验证突触超兴奋性和亚细胞代谢功能障碍在5xFAD小鼠模型中早期出现并导致区域特异性神经元脆弱性的假说 | 5xFAD杂合小鼠的海马组织，包括CA1、CA3和齿状回区域 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 电生理学、空间转录组学、单细胞去卷积、形态学分析 | 5xFAD小鼠模型 | 电生理数据、空间转录组数据、形态学图像 | 未明确说明具体数量，但涉及多个时间点的5xFAD杂合小鼠（至少包括出生后15天、1个月、4个月） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 339 | 2026-08-25 |
Beyond subsets: single cell transcriptomics reveals multidimensional regulation of iNKT cells cross tissues and species
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1874403
PMID:42528823
|
综述 | 本文通过单细胞转录组学综述了iNKT细胞在不同组织和物种间的多维调控机制，挑战了传统的亚群分类框架 | 利用单细胞RNA测序揭示iNKT细胞发育的非线性轨迹、早期表观遗传启动及外周组织重塑，并比较小鼠与人类之间的物种特异性差异 | 未提及具体局限性 | 重新定义iNKT细胞作为动态、环境依赖的转录状态，强调发育历史、组织环境、抗原暴露和物种特异性调控程序的作用 | iNKT细胞，涉及小鼠和人类的不同组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提供具体样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 340 | 2026-08-25 |
Inferring spatial single-cell-level interactions through interpreting cell state and niche correlations learned by self-supervised graph transformer
2026-Jan, Nature machine intelligence
IF:18.8Q1
DOI:10.1038/s42256-025-01161-0
PMID:42529556
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研究论文 | 提出了一种基于自监督图变换器的轻量级可解释模型GITIII，用于从成像空间转录组数据中推断单细胞水平上的细胞间相互作用 | 通过将细胞视为词、周围微环境视为上下文的自监督图变换器，将细胞状态与生态位关联以推断细胞间相互作用，同时克服了配体-受体对测量有限、空间编码不足和低可解释性的问题 | 未在摘要中明确提及，但可能受限于特定数据集和平台，需要更多验证 | 开发一种可解释的计算方法，从空间转录组数据中推断单细胞分辨率的细胞间相互作用 | 来自多个物种、器官和平台的空间转录组数据集，涵盖大脑和肿瘤微环境 | 基因组学、空间转录组学 | 不适用（研究大脑和肿瘤微环境，但未指定具体疾病） | 空间转录组学 | 自监督图变换器 | 空间转录组数据 | 四个空间转录组数据集（涉及多个物种和器官） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |