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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2026-01-30 |
A Single-Cell-Inspired Self-Enrichment Therapeutic Strategy Delays Intervertebral Disc Degeneration by Inhibiting Pyroptosis
2026-Jan, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202516405
PMID:41190793
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学与临床验证,构建了椎间盘退变(IVDD)的全面细胞图谱,并开发了一种自富集纳米载体以靶向抑制细胞焦亡,从而延缓IVDD进展 | 结合单细胞测序发现纤维化屏障和STING介导的细胞焦亡关键机制,并创新性地设计了一种能催化过氧化氢产生不对称气泡推进、选择性穿透退变组织的自富集纳米载体 | NA | 阐明椎间盘退变的关键病理机制并开发靶向治疗策略 | 椎间盘退变组织、髓核细胞 | 数字病理学 | 椎间盘退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 322 | 2026-01-30 |
Endothelial Heterogeneity in Pulmonary Hypertension
2026-Jan, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.322482
PMID:41230600
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序揭示的肺内皮细胞异质性在肺动脉高压发病机制中的作用及靶向治疗策略 | 整合前沿技术探讨内皮异质性如何塑造肺动脉高压的疾病轨迹,为靶向内皮功能障碍的新型治疗策略开辟新途径 | NA | 阐明肺内皮细胞异质性在肺动脉高压血管重构中的作用机制并探索治疗新靶点 | 肺内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 323 | 2026-01-30 |
A low-level Cdkn1c/p57kip2 expression in spinal progenitors drives the transition from proliferative to neurogenic modes of division
2026-Jan, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00653-9
PMID:41361693
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq数据,揭示了细胞周期调节因子Cdkn1c在脊椎动物神经发生中调控从增殖性到神经源性分裂转变的关键作用 | 发现Cdkn1c在神经源性祖细胞中以低水平表达启动,并作为神经发生转变的双重驱动因子,其低表达控制祖细胞进入神经源性分裂模式,而高表达则介导子细胞周期退出 | 研究主要基于鸡胚胎神经管数据,可能需在其他脊椎动物模型中验证普遍性 | 探究脊椎动物神经发生过程中从对称增殖性到不对称神经源性分裂转变的调控机制 | 鸡胚胎神经管中的神经祖细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 324 | 2026-01-30 |
Single-Cell Transcriptome Meta-Analysis Reveals Epigenomic and Chromatin Dysregulation in Developing Neurons Derived From Human ESCs With 1q21.1 CNVs
2026-Jan, Autism research : official journal of the International Society for Autism Research
IF:5.3Q1
DOI:10.1002/aur.70156
PMID:41437869
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组元分析,揭示了人类胚胎干细胞中1q21.1拷贝数变异导致发育神经元表观基因组和染色质失调的分子机制 | 首次在单细胞分辨率下,结合公共数据和内部疾病模型数据,通过元分析识别了与神经精神疾病相关的调控模块,并发现BPTF作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于体外模型(如脑类器官),可能无法完全模拟体内神经发育的复杂性 | 阐明复杂人类神经精神疾病的分子基础,特别是1q21.1拷贝数变异对神经元发育的影响 | 来自人类胚胎干细胞模型的发育神经元,重点关注1q21.1区域拷贝数变异 | 单细胞组学 | 自闭症谱系障碍、双相情感障碍、精神分裂症 | 单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 325 | 2026-01-30 |
Exploring leaf variegation in Arabidopsis yellow variegated2 by single-cell RNA sequencing
2026-Jan, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70659
PMID:41557962
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研究论文 | 本研究首次利用单细胞RNA测序技术探索拟南芥yellow variegated2突变体的叶片杂色现象,揭示了FtsH8基因的斑块表达模式及其与叶绿体命运、活性氧调控和细胞周期的关联 | 首次在单细胞水平应用scRNA-seq研究叶片杂色,证实了FtsH8的斑块表达支持阈值模型,并揭示了白色区域形成通过抑制光合基因减少活性氧以促进细胞周期进展的新机制 | 研究仅针对拟南芥var2突变体,结果可能不直接适用于其他植物或杂色类型,且scRNA-seq技术本身存在捕获效率和基因检测灵敏度的限制 | 探究拟南芥叶片杂色现象的细胞分子机制,特别是遗传相同细胞表现型差异的原因 | 拟南芥yellow variegated2 (var2)突变体的叶片细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 326 | 2026-01-30 |
Learning collective multicellular dynamics with an interacting mean field neural SDE model
2026-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013916
PMID:41564117
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研究论文 | 本文提出了一种名为scIMF的单细胞深度生成交互平均场模型,用于从时序单细胞RNA测序数据中学习集体多细胞动力学 | 利用McKean-Vlasov随机微分方程框架,结合细胞级注意力机制,首次在单细胞水平上建模非局部和非对称的细胞间相互作用 | 未明确说明模型在处理极大规模细胞群体时的计算效率,也未讨论对特定细胞类型相互作用的验证方法 | 开发能够整合细胞间相互作用的动态模型,以研究异质性多细胞系统的集体行为 | 时序单细胞RNA测序数据中的多细胞系统 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度生成模型、随机微分方程、注意力机制 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 327 | 2026-01-29 |
An integrative multi-omics study reveals glutamine metabolism dysregulation connecting Alzheimer's disease and age-related macular degeneration
2026-Jan-28, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877261418263
PMID:41603341
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法揭示了阿尔茨海默病和年龄相关性黄斑变性之间共享的谷氨酰胺代谢失调机制 | 首次采用孟德尔随机化、转录组学和靶向代谢组学整合策略,系统探索AD与AMD之间的代谢联系,并发现眼部代谢变化可能作为神经退行性疾病的早期指标 | 研究主要基于动物模型(APP/PS1小鼠)和遗传推断数据,人类样本验证有限,且代谢变化的因果机制尚未完全阐明 | 探索阿尔茨海默病和年龄相关性黄斑变性之间的共享代谢通路 | 阿尔茨海默病和年龄相关性黄斑变性患者及APP/PS1小鼠模型 | 多组学整合分析 | 阿尔茨海默病, 年龄相关性黄斑变性 | 孟德尔随机化, 转录组学, 单细胞RNA测序, 靶向代谢组学 | NA | 遗传数据, 转录组数据, 代谢组数据 | APP/PS1小鼠(5月龄)及公共数据库中的转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 靶向代谢组学 | NA | NA |
| 328 | 2026-01-29 |
IgA-Producing B Cells Exert Regulatory Function Through Granzyme B in Kidney Allograft Tolerance
2026-Jan-27, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0000001054
PMID:41591822
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研究论文 | 本研究探讨了IgA+ B细胞通过Granzyme B在肾移植耐受中的调节功能 | 首次揭示了IgA+ B细胞与GZMB+调节性B细胞在肾移植耐受中的强关联性,并证明IgA+ B细胞具有高调节功能 | 样本量较小(共76名参与者),且为病例对照研究,可能限制结果的普遍性 | 研究IgA+ B细胞与GZMB+调节性B细胞在肾移植耐受中的关联及功能 | 健康志愿者和肾移植受者(包括稳定功能、抗体介导排斥和耐受患者) | 免疫学 | 肾移植相关疾病 | 单细胞RNA测序,多参数光谱流式细胞术,ELISA,Western blot | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞术数据,血清蛋白数据 | 76名参与者(45名健康志愿者,31名肾移植受者) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 329 | 2026-01-29 |
HFFST: A Hierarchical Feature Fusion Algorithm for Spatial Gene Expression Prediction Using Histopathology Images
2026-Jan-27, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3658320
PMID:41591852
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研究论文 | 本文提出了一种名为HFFST的层次特征融合算法,用于从H&E染色病理图像预测空间基因表达 | 提出了一种新的层次特征融合算法,充分利用病理图像的多层次信息,并采用从粗到细的回归框架来预测空间转录组图谱 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种从H&E染色病理图像预测空间基因表达的方法,以克服空间转录组学技术成本高和复杂性大的限制 | H&E染色病理图像和空间基因表达数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 层次特征融合算法 | 图像 | 五个公共数据集和高分辨率Visium数据 | 10X Genomics | 空间转录组学 | Visium | 高分辨率Visium数据 |
| 330 | 2026-01-29 |
RPS14 as an aging-related biomarker for early-onset alterations of testicular senescence-associated genes in spermatogenic dysfunction at childbearing age
2026-Jan-27, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glag020
PMID:41592225
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和微阵列数据分析,识别出RPS14作为与衰老相关的生物标志物,用于早期检测年轻男性生精功能障碍中睾丸衰老相关基因的改变 | 首次将RPS14鉴定为年轻男性生精功能障碍中睾丸衰老相关基因早期改变的生物标志物,并揭示了其与睾丸免疫微环境及肥大细胞的关联 | 研究样本量有限,且机制研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证 | 识别年轻男性生精功能障碍中睾丸衰老相关基因早期改变的生物标志物 | 年轻男性生精功能障碍患者的睾丸组织、老年小鼠和老年男性的睾丸组织 | 数字病理学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、微阵列分析、免疫荧光 | NA | RNA测序数据、微阵列数据、图像数据 | 两个单细胞RNA测序数据集、三个批量微阵列数据集、老年小鼠、老年男性、具有完全生精功能或生精功能障碍的育龄患者睾丸组织 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 331 | 2026-01-29 |
Kynurenine mediates the chemotherapy-induced intestinal toxicity through modulation of gut microbiota
2026-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68741-5
PMID:41593057
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研究论文 | 本研究揭示了L-犬尿氨酸通过调节肠道菌群介导化疗诱导的肠道毒性的机制 | 首次发现L-犬尿氨酸通过驱动肠道菌群失调(特别是约翰逊乳杆菌的减少)并激活TNFα/JNK通路,从而介导化疗诱导的肠道毒性 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证相对有限,且具体菌群变化的机制细节有待进一步阐明 | 探究化疗诱导肠道毒性的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 化疗患者(特别是奥沙利铂治疗者)和小鼠模型 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 332 | 2026-01-29 |
A spatially resolved atlas of gastric cancer characterises a lymphocyte-aggregated region
2026-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68612-z
PMID:41593079
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研究论文 | 本研究整合单细胞和空间转录组学,揭示了胃癌肿瘤微环境中的空间区域特征,特别是淋巴细胞聚集区的细胞分布与免疫治疗生物标志物的关联 | 通过整合单细胞和空间转录组学技术,首次在胃癌中识别出淋巴细胞聚集区等四个空间区域,并揭示了淋巴细胞空间分布与T细胞激活途径的关联,为免疫治疗生物标志物探索提供了新视角 | NA | 研究胃癌肿瘤微环境的细胞组成和空间组织,以探索免疫治疗生物标志物 | 胃癌肿瘤微环境中的细胞,特别是淋巴细胞和树突状细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 333 | 2026-01-29 |
Spatial FBA reveals heterogeneous Warburg niches in renal tumors and lactate consumption in colorectal cancer
2026-Jan-27, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00654-x
PMID:41593100
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研究论文 | 本研究开发了空间通量平衡分析(spFBA)框架,用于从空间转录组数据中估计代谢通量,揭示了结直肠癌和肾癌中代谢异质性 | 开发了spFBA框架,首次将空间约束整合到代谢通量分析中,能够从空间转录组数据中识别代谢程序,如乳酸消耗和Warburg表型 | 未明确说明样本量或数据集的详细统计信息,可能依赖于公共数据的质量和可用性 | 研究空间约束如何塑造癌症代谢,并开发工具来揭示代谢异质性 | 结直肠癌(CRC)的原发肿瘤和肝转移,以及肾癌 | 空间转录组学 | 结直肠癌,肾癌 | 空间转录组学,通量平衡分析(FBA) | 空间通量平衡分析(spFBA) | 空间转录组数据 | 新生成的高分辨率数据集(配对原发结直肠肿瘤和肝转移),以及独立公共数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 334 | 2026-01-29 |
Humoral IgG1 responses to tumor antigens underpin clinical outcomes in immune checkpoint blockade
2026-Jan-27, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-04177-6
PMID:41593194
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研究论文 | 本研究揭示了在接受免疫检查点阻断治疗的肝细胞癌患者中,肿瘤特异性IgG1浆细胞反应与临床获益之间的关键联系 | 首次系统性地证明了PD-1阻断治疗能诱导肿瘤特异性IgG1浆细胞反应,该反应与细胞免疫协同作用,共同促进临床获益,揭示了体液-细胞免疫协调轴在抗肿瘤免疫中的重要作用 | 研究主要聚焦于肝细胞癌患者,其他癌症类型的普适性有待进一步验证;样本量相对有限(38例主要队列) | 探究B细胞和浆细胞在免疫检查点阻断治疗反应中的作用机制 | 接受新辅助抗PD-1治疗的肝细胞癌患者 | 免疫肿瘤学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序、批量测序、空间转录组学 | NA | 单细胞测序数据、批量测序数据、空间转录组数据、临床生存数据 | 主要队列38例肝细胞癌患者,验证队列共500例患者(单细胞和批量测序数据)、7例患者(空间转录组学)、1,582例患者(生存分析) | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、批量RNA-seq | NA | NA |
| 335 | 2026-01-29 |
Mechanisms, precision therapies, and technological frontiers in coronary atherosclerosis: a comprehensive review
2026-Jan-27, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-025-01729-x
PMID:41593207
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综述 | 本文全面综述了冠状动脉粥样硬化的机制、精准疗法及技术前沿,整合了疾病机制、新兴治疗策略以及多组学技术、高分辨率成像和人工智能在心血管风险评估中的应用 | 强调了精准医学、多组学技术、高分辨率成像和人工智能在心血管风险评估中的突破性应用,并探讨了针对PCSK、炎症通路、血管再生的新型干预措施,以及CRISPR-Cas9基因编辑、纳米技术药物递送和肠道微生物群调节等前沿技术 | 尽管这些创新有望实现个性化动脉粥样硬化管理,但在可及性、健康公平性和临床实施方面仍面临挑战 | 旨在通过整合多模态数据分析和靶向治疗,减少冠状动脉疾病的全球负担,推动精准心脏病学新时代 | 冠状动脉粥样硬化及其相关分子、细胞机制、治疗策略和技术应用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、多组学技术、高分辨率成像、人工智能 | NA | 多模态数据(包括分子、细胞、影像数据) | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 336 | 2026-01-29 |
Unveiling the early defense response dynamics in grapevines against Plasmopara viticola by single-cell transcriptomics
2026-Jan-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03904-z
PMID:41593733
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间RNA测序技术,揭示了葡萄叶片在霜霉病感染早期的细胞水平防御响应动态 | 首次构建了葡萄叶片在霜霉病感染期间的单细胞转录组图谱,揭示了植物细胞在卵菌感染早期的动态和特异性防御响应,特别是在保卫细胞转录组重编程方面的发现 | 研究主要关注早期感染阶段,可能未涵盖整个感染周期的防御响应动态 | 探究葡萄对霜霉病的细胞水平防御机制 | 葡萄叶片细胞 | 数字病理学 | 植物病害 | 单细胞RNA测序, 空间RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约100,000个单个细胞(其中约89,000个来自scRNA-seq,约11,000个来自spRNA-seq) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 337 | 2026-01-29 |
SCITO-seq2: ultra-high-throughput single-cell transcriptome and epitope sequencing
2026-Jan-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03954-x
PMID:41593779
|
研究论文 | 本文介绍了SCITO-seq2,一种增强型单细胞转录组和表位测序平台,能够实现超高通量的RNA和蛋白质同时检测 | SCITO-seq2整合了基于探针的RNA检测与已建立的超高通量蛋白质分析,采用共享池条形码策略确保分子谱的精确匹配,并兼容细胞哈希技术以实现高效样本复用 | NA | 开发一种可扩展、简化且经济高效的单细胞多组学工作流程,用于疾病研究 | 自身免疫性疾病,包括儿童系统性红斑狼疮和CTLA4单倍体不足伴自身免疫浸润 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞转录组测序,表位测序 | NA | RNA序列数据,蛋白质表达数据 | 超过100,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 | SCITO-seq2 | SCITO-seq2平台,集成超高通量蛋白质分析和共享池条形码策略 |
| 338 | 2026-01-29 |
Deciphering stromal cell interactions in osteosarcoma highlights CDKN2A and MMP14 as novel diagnostic and therapeutic biomarkers
2026-Jan-27, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-026-03902-2
PMID:41593799
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和转录组学分析,揭示了骨肉瘤中基质细胞网络,并鉴定出CDKN2A和MMP14作为新型诊断标志物和治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序和高维加权基因共表达网络分析,系统解析骨肉瘤基质细胞互作网络,并发现CD99-CD99互作机制及白藜芦醇作为MMP14靶向治疗候选分子 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,实验验证仅限于细胞系模型,缺乏临床样本和体内实验的进一步验证 | 解析骨肉瘤基质微环境中的细胞互作网络,寻找可靠的诊断生物标志物和治疗靶点 | 骨肉瘤的基质细胞、巨噬细胞、T细胞、浆细胞、内皮细胞、浆细胞样树突状细胞和肥大细胞等七种主要细胞亚群 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、转录组学分析、加权基因共表达网络分析、分子对接 | Seurat、CellChat、DESeq2、hdWGCNA | 单细胞RNA测序数据、转录组数据集 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 339 | 2026-01-29 |
STransfer: A Transfer Learning-Enhanced Graph Convolutional Network for Clustering Spatial Transcriptomics Data
2026-Jan-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag049
PMID:41601194
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研究论文 | 提出了一种名为STransfer的迁移学习框架,结合图卷积网络和正点互信息来聚类空间转录组数据 | 首次将迁移学习与图卷积网络结合用于多切片空间转录组数据的聚类分析,通过注意力机制融合多图特征,并实现跨切片知识迁移 | 未提供 | 提高空间转录组数据的聚类准确性并减少人工标注成本 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | 图卷积网络(GCN)、注意力机制 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 340 | 2026-01-29 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Crosstalk Between MuSCs and FAPs in Ruminant Skeletal Muscle Development
2026-Jan-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15020206
PMID:41597280
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序首次构建了山羊骨骼肌发育的单细胞图谱,揭示了肌卫星细胞与纤维脂肪祖细胞之间的相互作用 | 首次构建了反刍动物(山羊)骨骼肌从胚胎期到成年期14个发育阶段的单细胞转录组图谱,并发现了DLK1-NOTCH3配体-受体对在维持肌卫星细胞静息状态中的关键作用 | 研究仅针对山羊的长背肌,未涵盖其他肌肉类型;功能验证实验相对有限 | 阐明反刍动物骨骼肌发育过程中肌卫星细胞与纤维脂肪祖细胞的相互作用机制 | 山羊长背肌组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 120,944个细胞,覆盖胚胎第30天至出生后11年共14个发育阶段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |