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当前共找到 1921 篇文献,本页显示第 321 - 340 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
321 2026-06-11
Spatial transcriptomics reveals the mechanistic role of lactate metabolism in the pancreatic ductal adenocarcinoma microenvironment
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过空间转录组学揭示乳酸代谢在胰腺导管腺癌微环境中的机制作用 首次结合高通量转录组测序和单细胞转录组分析,系统探讨乳酸代谢在胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的作用,并建立基于机器学习的预后模型,识别出溶菌酶和聚合免疫球蛋白受体作为潜在临床生物标志物 样本量相对较小(8个PDAC样本,50795个细胞),且主要依赖公开数据集,缺乏独立外部验证队列 阐明乳酸代谢在胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的作用机制,并建立基于乳酸代谢基因的预后模型以指导早期诊断和个性化治疗 胰腺导管腺癌患者的肿瘤细胞及其微环境 数字病理学 胰腺导管腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,高通量转录组测序 机器学习(StepCox + Enet,α=0.5) 基因表达数据 8个PDAC样本中的50795个细胞,以及多个队列共345个患者(ICGC:92;GSE28735:45;GSE62452:69;GSE183795:139) NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
322 2026-06-11
Identification and validation of prognostic genes related to glycolysis and M2 macrophage in hepatocellular carcinoma: an integrated analysis of bulk RNA sequencing and single-cell RNA sequencing
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,鉴定与肝细胞癌中糖酵解和M2巨噬细胞相关的预后基因 首次通过整合糖酵解相关基因、M2巨噬细胞相关基因和差异表达基因,系统筛选出8个与两者交叉相关的预后基因,并构建风险模型 研究基于公共数据库数据,缺乏多中心外部验证队列,且RT-qPCR验证样本量有限 鉴定肝细胞癌中同时与糖酵解和M2巨噬细胞相关的预后基因并阐明其机制 肝细胞癌肿瘤组织和细胞样本 生物信息学 肝细胞癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR 回归分析风险模型 转录组数据, 单细胞表达数据 公共数据库数据(TCGA-LIHC等)+ RT-qPCR验证样本(具体数量未说明) NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
323 2026-06-11
Reprogramming the immunosuppressive breast cancer microenvironment: integrating cellular, metabolic, and stromal targets for rational immunotherapy
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 这篇综述整合了关于乳腺癌肿瘤免疫微环境在细胞、分子和代谢层面复杂性的最新进展,并强调了阻碍持久治疗效果的免疫抑制机制 提出了将免疫“冷”肿瘤转化为免疫“热”肿瘤的新策略,包括代谢调节、基质重编程和精准联合疗法,并整合了空间转录组学和液体活检等新型生物标志物策略 未明确提及具体局限性 总结乳腺癌肿瘤免疫微环境的最新研究进展,并探讨克服免疫抑制的合理免疫治疗策略 乳腺癌肿瘤免疫微环境 machine learning 乳腺癌 空间转录组学 NA 文本 NA NA 空间转录组学 NA NA
324 2026-06-11
Integrative omics and experimental validation reveal METTL17 and SLC27A1 as biomarkers and potential therapeutic targets in chronic kidney disease
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
research paper 通过整合分析转录组、单细胞测序和实验验证,发现METTL17和SLC27A1是慢性肾病中连接线粒体功能障碍和巨噬细胞极化的关键基因,可作为生物标志物和潜在治疗靶点 首次整合多组学数据与实验验证,揭示METTL17和SLC27A1在慢性肾病中调节线粒体功能和免疫失衡的双重作用,并明确其细胞来源为近端肾小管细胞和平滑肌细胞 研究仅在体外和动物模型中进行验证,缺乏大规模临床队列验证,且样本量有限 鉴定慢性肾病中连接线粒体调节与巨噬细胞极化的关键基因及潜在治疗靶点 慢性肾病患者外周血样本和单侧输尿管梗阻小鼠模型 machine learning chronic kidney disease bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, qPCR, immunohistochemistry, Western blotting, machine learning machine learning models (unspecified specific type) gene expression data (RNA-seq), single-cell transcriptomic data, clinical data CKD患者外周血样本(具体数量未提及)和UUO小鼠模型 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
325 2026-06-11
Single-cell transcriptomic profiling of C. elegans Q neuroblast lineage during migration and differentiation
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示秀丽隐杆线虫Q神经母细胞在迁移和分化过程中的分子机制 首次构建了Q神经母细胞谱系的高分辨率转录组分化图谱,发现亲代Q细胞初始具有上皮样特性并经历上皮-间充质转化,以及Wnt相关基因的左右不对称表达 未在摘要中明确说明局限性 研究Q神经母细胞迁移和分化的分子机制 秀丽隐杆线虫Q神经母细胞谱系 数字病理学 NA 单细胞RNA测序、流式细胞分选 NA 转录组数据 Q谱系细胞在不同发育阶段分离 NA 单细胞RNA测序 NA 通过FACS分离Q谱系细胞进行单细胞RNA测序
326 2026-06-11
Mass spectrometry-based multi-omics analysis elucidates immune microenvironmental characteristics and the risk of distant metastasis in N1c colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 基于质谱的多组学分析阐明了N1c结直肠癌的免疫微环境特征及远处转移风险 首次通过DIA-MS蛋白质组学技术系统研究了N1c结直肠癌的分子特征,并基于机器学习算法鉴定了10个肿瘤沉积相关转移基因(TDRGs),用于预测无病生存期和免疫治疗反应 样本量较小(13例),缺乏独立外部验证队列,且PLOD1的功能验证仅限于体外实验 揭示N1c结直肠癌的生物学特征、免疫微环境及其与远处转移的关系 N1c结直肠癌患者的FFPE样本(13例T1-T4N1cM1)及多个公共数据集的1582例结直肠癌患者 机器学习 结直肠癌 DIA-MS蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, Masson三色染色, 伤口愈合实验, Transwell实验 9种机器学习算法(具体未列出) 蛋白质组学数据, 单细胞RNA测序数据, 组织病理图像 13例N1c结直肠癌患者的FFPE组织样本;单细胞RNA测序及公共数据集共1582例结直肠癌患者样本 NA 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 NA NA
327 2026-06-11
Multi-dimensional evidence establishing the causal association between metabolic syndrome and gout and the molecular mechanisms of comorbidity
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过多维方法系统证明代谢综合征与痛风的因果关系,并揭示其共病的分子机制 首次整合真实世界队列、孟德尔随机化和单细胞转录组等多维证据,建立代谢综合征与痛风的因果关系链,并提出TAP2-UPR-Th17病理轴 研究可能受到观察性研究的混杂因素影响,且样本量和数据集的代表性存在一定局限 系统评估代谢综合征及其组分与痛风的因果关系,揭示共病的遗传基础和转录组特征 代谢综合征、痛风及共病患者,包括真实世界临床队列、遗传数据和转录组样本 机器学习 代谢综合征, 痛风 倾向性评分匹配, 限制性立方样条, 潜类别轨迹建模, 孟德尔随机化, 连锁不平衡分数回归 NA 临床数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 真实世界临床队列样本量8,853人,转录组数据GSE160170和GSE98895,单细胞数据GSE217561 NA 单细胞RNA-seq NA NA
328 2026-06-11
Integrating multi-omics and machine learning to unravel mechanisms of lymph node metastasis in papillary carcinoma with and without thyroiditis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 整合多组学与机器学习方法,揭示伴或不伴甲状腺炎的乳头状甲状腺癌淋巴结转移的不同机制 首次比较PTC-blank和PTC-thyroiditis两种亚型淋巴结转移的分子和细胞异质性,发现PI16+成纤维细胞亚群在PTC-blank中与ECM重塑相关,并利用机器学习和孟德尔随机化鉴定出SHISA5作为新的因果基因和潜在治疗靶点 未明确说明,但可推测单细胞数据仅来自一个公开数据集,且预测模型的外部验证可能有限 比较PTC-blank和PTC-thyroiditis的分子和细胞异质性,识别淋巴结转移的关键驱动因素,并开发临床预测模型 乳头状甲状腺癌(PTC)患者,分为伴甲状腺炎(PTC-thyroiditis)和不伴甲状腺炎(PTC-blank)两类 机器学习 甲状腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq LASSO, 随机森林, KNN 基因表达数据 TCGA数据库的bulk RNA-seq数据和GSE184362的单细胞RNA-seq数据 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
329 2026-06-10
huSA: a comprehensive database for multi-dimensional resolution of bulk, single cell and spatial transcription profiles in skin diseases
2026-Jan-15, Database : the journal of biological databases and curation
研究论文 构建了一个名为人类皮肤图谱(huSA)的综合数据库,整合了多维度皮肤转录组数据,包括批量、单细胞和空间转录数据,以促进皮肤疾病研究 首次构建了涵盖17种皮肤疾病、63个独立数据集、超过3000个样本的多维度转录组数据库,提供标准化细胞类型注释、跨数据集整合分析和交互式可视化平台 未在摘要中明确说明局限性 构建一个全面、整合且用户友好的皮肤转录组数据图谱,实现多疾病、多模态数据的系统探索 皮肤疾病转录组数据,包括单细胞RNA测序、空间转录组和批量RNA-seq数据 数字病理学 皮肤疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA 图像, 文本, 基因表达数据 1434个单细胞RNA-seq样本、63个空间转录组样本、1502个批量RNA-seq样本,共17种皮肤疾病 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
330 2026-06-10
An unsupervised method for spatial transcriptomics analysis based on adversarial autoencoder
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出一种基于对抗自编码器的无监督空间转录组学分析方法DACN,整合改进的对抗自编码器与图卷积网络,以鲁棒分析不同分辨率和通量的空间转录组数据 创新性地将改进的对抗自编码器与图卷积网络集成在统一框架中,通过混合编码器(多注意力机制与残差连接)捕获精细局部表达模式同时保留关键全局信息,实现去噪与稳定潜在表征学习 未在文中明确提及局限性 开发一种无监督方法用于空间转录组学分析,以应对数据噪声和复杂性挑战 空间转录组学数据集 机器学习 NA 空间转录组学 对抗自编码器(AAE),图卷积网络(GCN) 基因表达数据 多个空间转录组学数据集 NA 空间转录组学 NA NA
331 2026-06-10
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals ISG15 as a Key Regulator of Macrophage-Mediated Inflammation Driving Primary Sjögren's Syndrome Progression
2026, Critical reviews in immunology IF:0.8Q4
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示ISG15作为巨噬细胞介导的炎症驱动原发性干燥综合征进展的关键调控因子 整合批量RNA-seq与单细胞RNA-seq数据,结合三种机器学习算法筛选免疫代谢生物标志物,并首次实验验证ISG15在pSS中通过NF-κB通路调控炎症的功能 未提及明确的局限性 识别原发性干燥综合征的诊断生物标志物并表征单核-巨噬细胞分化轨迹 原发性干燥综合征患者的唾液腺细胞和THP-1巨噬细胞 机器学习 干燥综合征 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 伪时间分析, 机器学习 LASSO回归, SVM-RFE, 随机森林, Monocle3, CellChat 基因表达数据 42,157个唾液腺细胞 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
332 2026-06-10
Single-Cell Sequencing Combined with RNA Sequencing Reveals the Role of Natural Killer Cells in Prognosis and Immunotherapy Response in Cervical Squamous Cell Carcinoma
2026, Critical reviews in immunology IF:0.8Q4
研究论文 结合单细胞测序和RNA测序揭示自然杀伤细胞在宫颈鳞状细胞癌预后和免疫疗法反应中的作用 首次通过整合单细胞测序和转录组测序数据,鉴定高活性NK细胞相关基因并构建预后风险模型,为宫颈鳞状细胞癌的免疫治疗提供新靶点 未说明明确的局限性(需根据全文推断,但摘要未提及) 探究高活性NK细胞相关基因在宫颈鳞状细胞癌预后和免疫治疗中的潜在价值 宫颈鳞状细胞癌患者的转录组和单细胞测序数据 机器学习 宫颈鳞状细胞癌 RNA-seq, 单细胞测序 Cox回归, LASSO回归, WGCNA 基因表达数据 NA(摘要未明确样本数量) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
333 2026-06-10
Integrated single-cell and transcriptomic profiling identifies machine-learning-based pyroptosis biomarkers in IBD
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合单细胞和转录组数据,利用机器学习方法识别炎症性肠病中与细胞焦亡相关的生物标志物 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法(LASSO、GBM、SVM、Boruta、随机森林)筛选出六种具有诊断潜力的细胞焦亡关键基因,并鉴定出巨噬细胞、上皮细胞和中性粒细胞是焦亡最活跃的细胞类型 未提及样本间异质性验证和纵向队列数据支持;单细胞分析仅限于肠道黏膜样本,可能无法完全代表全身性焦亡动态 探索炎症性肠病中细胞焦亡的关键细胞类型和调控基因,并筛选非侵入性诊断生物标志物 炎症性肠病患者的肠道黏膜样本和外周血转录组数据 生物信息学 炎症性肠病 单细胞RNA测序、RNA-seq LASSO, GBM, SVM, Boruta, Random Forest 基因表达数据 未明确提及样本数量(依据单细胞和bulk转录组数据集) NA 单细胞RNA测序 NA NA
334 2026-06-10
UNC93B1 promotes pancreatic cancer progression through modulation of cGAS-STING signaling
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过多组学整合分析,发现UNC93B1通过调控cGAS-STING信号通路促进胰腺癌进展,并验证其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 首次结合单细胞转录组、空间转录组、GWAS和机器学习框架系统鉴定UNC93B1在胰腺癌中的关键作用,并阐明其通过抑制cGAS-STING通路促进免疫抑制微环境和转移的机制 依赖公开数据集中有限的样本量,体外功能验证仅采用部分细胞系,体内模型为皮下移植瘤,未涉及原位模型或患者来源异种移植模型(PDX) 揭示胰腺导管腺癌(PDAC)的分子驱动因素,阐明UNC93B1在肿瘤微环境中的功能及其机制,为精准治疗策略提供依据 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤组织、PDAC细胞系及异种移植瘤模型 数字病理学, 机器学习 胰腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 基因组关联研究(GWAS), 基因敲低, 蛋白质印迹, 流式细胞术 Seurat, Harmony, scPagwas, hdWGCNA, LASSO回归, 随机森林, 支持向量机, GSVA, Monocle2, CellChat 单细胞转录组数据、批量转录组数据、空间转录组数据、GWAS数据、蛋白质表达数据 单细胞RNA测序:22个PDAC样本(GSE154778, GSE212966);批量转录组队列:GSE28735、GSE62452;TCGA-PAAD项目:172例生存数据;GWAS数据:196,187例;体外验证:4个PDAC细胞系;体内模型:皮下异种移植瘤 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
335 2026-06-10
Single-cell and spatial transcriptomics reveal transplant-associated T cells and myeloid cells in human liver transplantation
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序和空间转录组学分析人类肝移植中的移植相关T细胞和髓系细胞 首次整合单细胞RNA测序与空间转录组学,高分辨率揭示肝移植排斥反应中免疫细胞的动态变化及空间分布 样本量有限,未提供具体样本数量;机制验证缺乏体内功能实验支持 探究肝移植排斥反应中肝内免疫细胞的动态变化及相互作用 人类肝移植术后不同阶段的移植物组织 数字病理学 肝病 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据,空间转录组数据 未明确说明 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
336 2026-06-10
Molecular interplay of ASNS and the PI3K-AKT-mTOR pathway in CMV and HIV co-infections: Therapeutic implications
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究揭示了天冬酰胺合成酶(ASNS)在巨细胞病毒(CMV)和HIV共感染中的关键代谢信号枢纽作用及其与PI3K-AKT-mTOR通路的相互作用,为共感染治疗提供了新靶点 首次发现ASNS作为CMV/HIV共感染中的代谢信号枢纽,并验证其与PI3K-AKT-mTOR通路的相互作用,通过分子对接发现西多福韦以高亲和力结合ASNS 研究主要基于生物信息学分析和计算模拟,缺乏体外或体内实验验证,结论尚需进一步实验确认 探究CMV/HIV共感染中ASNS与PI3K-AKT-mTOR通路的分子相互作用及其治疗意义 CMV/HIV共感染患者,转录组数据及单细胞RNA测序数据 计算机视觉 感染性疾病 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 分子对接 NA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
337 2026-06-10
Single-cell transcriptome delineating asymmetric dynamics of CD4+ T and CD8+ T cell lineage commitment in human prenatal thymus
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合单细胞转录组数据,解析人类产前胸腺中CD4+和CD8+ T细胞谱系定型的不对称多阶段动态过程 揭示了人类产前胸腺中CD4/CD8细胞谱系定型并非单一事件,而是信号水平、时间维度和微环境水平三个维度上的不对称多阶段动态过程 NA 表征人类产前胸腺中T细胞发育的细胞异质性和分子动力学 人类产前胸腺细胞(7至23孕周) 机器学习 NA 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 来自5个已发表数据集的整合数据,覆盖7至23孕周样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
338 2026-06-10
Exosomal POSTN from cancer-associated fibroblasts drives progression of microinvasive lung adenocarcinoma: insights from single-cell and tissue exosome sequencing analysis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞和胞外体RNA测序分析,发现来源于癌症相关成纤维细胞的胞外POSTN驱动微浸润肺腺癌进展 首次结合单细胞RNA测序和组织胞外体RNA测序,揭示POSTN阳性成纤维细胞及其胞外体在微浸润肺腺癌向侵袭性肺腺癌进展中的关键作用 样本量较小,仅涉及4例MIA病灶;功能验证主要依赖体外和异种移植模型,缺乏体内原位模型验证 阐明微浸润肺腺癌的肿瘤微环境细胞生态系统,以及POSTN阳性成纤维细胞及其胞外体在早期肺腺癌进展中的作用和机制 微浸润肺腺癌(MIA)及其配对癌旁组织、肺腺癌细胞系、异种移植小鼠模型 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序, 组织胞外体RNA测序 NA 基因表达数据 4例MIA病灶及其配对癌旁组织 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 胞外体RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒用于单细胞RNA测序,组织胞外体RNA测序在Illumina NovaSeq平台上进行
339 2026-06-10
Primary Cilium Forces Neuroendocrine Shift in Prostate Cancer through YAP1 Repression and Reduced Mitochondrial Activity
2026, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本研究探讨了初级纤毛在前列腺癌神经内分泌转化中的作用,通过YAP1抑制和线粒体活性降低介导这一过程 首次揭示初级纤毛与前列腺癌神经内分泌转化和代谢重编程之间的直接关联,提出GLI1/IFT20或GLI1/IFT80阳性特征作为纤毛化神经内分泌亚群的标志物 YAP1抑制单独不足以诱导纤毛发生,且神经内分泌转化仅为部分实现 探究初级纤毛在前列腺癌神经内分泌转化中的分布及其功能相关性 去势抵抗性前列腺癌样本和神经内分泌样细胞 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序 NA 图像, 文本 去势抵抗性前列腺癌样本中FDG-PET阳性和神经内分泌特征阳性的肿瘤细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
340 2026-06-10
Multi-Omics and Single-Cell Dissection Reveals EXT1 as a Glycosylation-Linked Therapeutic Target in Cancer
2026, Oncology research IF:2.0Q3
研究论文 通过多组学和单细胞分析揭示EXT1作为糖基化相关癌症治疗靶点的作用 首次发现EXT1是连接糖基化和炎症的关键酶,并在泛癌水平验证其作为基质激活、免疫检查点参与和肿瘤进展驱动因子的作用 未提供具体实验验证(如敲除或药物抑制)的体内外功能确认 探究糖基转移酶EXT1在炎症、基质重塑和免疫逃逸驱动的癌症中的机制桥梁作用 泛癌队列(TCGA)、胰腺腺癌和肺腺癌组织微阵列 机器学习 胰腺癌, 肺腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析, 分子对接, 免疫组化 LASSO Cox回归 转录组数据, 单细胞转录组数据, DNA甲基化数据, 组织微阵列图像 TCGA泛癌队列(包含多种癌症类型),PAAD和LUAD组织微阵列(具体样本数未提及) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
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