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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2026-03-01 |
Field-Evolved Resistance to Bt Cry Toxins in Lepidopteran Pests: Insights into Multilayered Regulatory Mechanisms and Next-Generation Management Strategies
2026-Jan-25, Toxins
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxins18020060
PMID:41745726
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综述 | 本文综述了鳞翅目害虫对Bt Cry毒素田间进化抗性的多层次调控机制,并探讨了下一代管理策略 | 提出了一个综合统一的机制框架,整合了Bt毒素作用模式、多层抗性调控机制(包括信号转导、免疫逃避、微生物群互作)以及基于CRISPR、AlphaFold3和AI的下一代抗性管理策略 | 这是一篇综述文章,主要总结现有研究,未报告新的原始实验数据 | 阐明鳞翅目害虫对Bt Cry毒素田间进化抗性的机制,并提出可持续的管理策略 | 鳞翅目害虫及其对Bt Cry毒素的抗性 | NA | NA | 单细胞转录组学、CRISPR/Cas9基因编辑、噬菌体辅助连续进化(PACE)、AlphaFold3结构预测、AI加速蛋白质设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 282 | 2026-03-01 |
Multimodal single-cell protein and RNA profiling unveils dysregulated immature neutrophil dynamics in gestational diabetes mellitus
2026-Jan-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09468-9
PMID:41501166
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研究论文 | 本研究通过多模态单细胞蛋白质和RNA分析,揭示了妊娠期糖尿病中未成熟中性粒细胞动态的失调 | 首次结合InfinityFlow表面标记分析和单细胞RNA测序,在妊娠期糖尿病中识别出低密度未成熟中性粒细胞亚群及其与胰岛素敏感性的关联 | 研究样本量有限,且未深入探讨未成熟中性粒细胞功能机制 | 探究妊娠期糖尿病中中性粒细胞的异质性及其与疾病的关系 | 健康孕妇和妊娠期糖尿病孕妇的外周血中性粒细胞 | 数字病理学 | 妊娠期糖尿病 | InfinityFlow表面标记分析, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质表达数据, RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 283 | 2026-03-01 |
Extracellular Matrix-Associated Biomarkers for Hepatocellular Carcinoma: Insights From Machine Learning and Single-Cell Analysis
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/6654142
PMID:41755885
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研究论文 | 本研究通过整合组学数据和机器学习,识别了肝细胞癌中与细胞外基质相关的关键生物标志物,并利用单细胞RNA测序验证了其表达模式 | 结合系统生物学框架、机器学习与单细胞分析,首次识别出八个上调的ECM相关基因作为诊断生物标志物,并揭示了它们在单细胞水平上的表达特异性 | 研究主要基于公共数据库(如TCGA)的数据,可能需要进一步实验验证这些生物标志物的功能机制和临床适用性 | 识别肝细胞癌中与细胞外基质相关的生物标志物,以改善早期检测、预后评估和治疗靶向 | 肝细胞癌患者的基因表达和调控网络 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 基于TCGA、GSE104310和GSE144269数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 284 | 2026-03-01 |
Machine learning and single-cell RNA sequencing analyses identify MS-related monocytes and a five-gene candidate biomarker signature
2026, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2026.1739231
PMID:41756175
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研究论文 | 本研究结合机器学习与单细胞RNA测序分析,识别了与多发性硬化相关的单核细胞及一个五基因候选生物标志物签名 | 首次整合机器学习算法与单细胞RNA测序数据,系统性识别并验证了五个关键基因作为多发性硬化的候选生物标志物 | 研究主要基于实验性自身免疫性脑脊髓炎模型数据,临床样本验证有限 | 识别与多发性硬化相关的单核细胞生物标志物,以改善疾病诊断和风险分层 | 多发性硬化相关的单核细胞及基因表达 | 机器学习 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫荧光 | 逻辑回归, LDA, SVM, 朴素贝叶斯, KNN, Rpart, 随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 285 | 2026-03-01 |
Repurposed Acarbose Targets Nidogen-1 to Remodel the Tumor Stroma and Suppress Portal Vein Tumor Thrombus in Hepatocellular Carcinoma
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1161
PMID:41756725
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肝细胞癌门静脉癌栓的免疫-基质特征,并发现阿卡波糖可通过靶向Nidogen-1重塑肿瘤基质,抑制癌栓进展 | 首次构建了PVTT微环境的空间图谱,揭示了巨噬细胞向肌成纤维样癌症相关成纤维细胞的转化过程,并首次将已获批药物阿卡波糖重新用于靶向NID1轴以改善免疫治疗反应 | 样本量相对有限(99个样本来自47名患者),且临床队列为回顾性分析,需要进一步的前瞻性临床试验验证 | 探究肝细胞癌门静脉癌栓的分子机制和免疫特征,并开发新的治疗策略 | 肝细胞癌患者样本(包括肿瘤组织和门静脉癌栓) | 数字病理学 | 肝细胞癌 | nCounter分析、单细胞RNA测序、数字空间分析、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质数据 | 99个样本来自47名患者,另有一个独立临床队列包含810名肝细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学 | NA | NA |
| 286 | 2026-02-28 |
RNA2seg: a generalist model for cell segmentation in image-based spatial transcriptomics
2026-Jan-30, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03908-9
PMID:41618375
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为RNA2seg的通用细胞分割模型,用于基于成像的空间转录组学中的细胞分割 | 提出了一种新颖的细胞分割算法RNA2seg,它整合了RNA点云及所有可用的膜和核染色信息,并采用师生训练方案在超过400万个细胞上进行训练 | NA | 开发一种通用模型,用于在基于成像的空间转录组学中实现准确的细胞分割,以将每个RNA分子正确分配到细胞中 | 来自MERFISH和CosMx数据集的超过400万个细胞,涵盖七个器官 | 数字病理学 | NA | 基于成像的空间转录组学 | 师生训练方案 | 图像、RNA点云、膜和核染色数据 | 超过400万个细胞 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 287 | 2026-02-28 |
Differentiation in the human urothelia is defined by distinct alternative polyadenylation
2026-Jan-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116839
PMID:41533515
|
研究论文 | 本研究揭示了在人类输尿管尿路上皮分化过程中,选择性多聚腺苷酸化(APA)作为转录组多样性的主要来源,独立于mRNA水平变化 | 首次在人类尿路上皮分化中系统性地将APA与细胞状态特异性转录组多样性联系起来,并通过单细胞成像和报告基因实验验证了APA对蛋白质表达的空间特异性调控 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,可能未完全捕捉到所有APA事件的动态变化,且机制研究仍处于初步阶段 | 探究人类尿路上皮分化过程中转录组多样性的产生机制 | 人类输尿管尿路上皮细胞,包括基底祖细胞、中间细胞和终末分化的伞状细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞成像,报告基因实验 | NA | 单细胞RNA测序数据,图像数据 | 13,544个尿路上皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 288 | 2026-02-28 |
Histone demethylase KDM7A negatively regulates fibrotic macrophage polarization and lung fibrosis progression
2026-Jan-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09610-1
PMID:41578150
|
研究论文 | 本研究揭示了组蛋白去甲基化酶KDM7A通过调控TLR8表达来抑制促纤维化巨噬细胞极化,从而限制肺纤维化进展的表观遗传机制 | 首次发现KDM7A-TLR8轴作为抑制促纤维化巨噬细胞极化的关键表观遗传调控通路,并揭示其表达随年龄下降与临床风险模式的关联 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限;性别差异的机制尚未完全阐明 | 探究表观遗传机制在调控巨噬细胞极化及肺纤维化进展中的作用 | Kdm7a基因敲除小鼠、肺纤维化患者肺组织、巨噬细胞体外培养体系 | 表观遗传学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、巨噬细胞功能实验、表观遗传分析 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、组织样本数据 | 基因敲除小鼠模型及肺纤维化患者组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 289 | 2026-02-28 |
Single-cell transcriptomics reveals diversity and conservation of chicken lymphocytes
2026-Jan-18, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106475
PMID:41719991
|
研究论文 | 本研究构建了鸡三种主要免疫器官的高分辨率单细胞转录组图谱,揭示了淋巴细胞多样性及其进化保守性 | 首次建立了鸡免疫器官的单细胞转录组图谱,系统鉴定了24种免疫和基质细胞类型,揭示了性二态性免疫成熟特征,并通过跨物种比较证明了核心免疫调控回路的进化保守性 | 研究仅基于转录组数据,缺乏蛋白质水平和功能验证;样本来源限于特定发育阶段;未涉及病原感染等免疫激活状态 | 解析鸡免疫系统的细胞组成、发育轨迹和进化特征 | 家鸡(Gallus gallus)的胸腺、法氏囊和脾脏三种主要免疫器官 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种免疫器官(具体样本数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 290 | 2026-02-28 |
Single-cell transcriptome analysis reveals critical causative candidates for Down syndrome-related lung diseases
2026-Jan, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.05.009
PMID:40451386
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了唐氏综合征相关肺部疾病的关键致病候选因素 | 利用Dp16小鼠模型结合单细胞RNA测序技术,首次系统性地探索了染色体21三体对肺部疾病的影响,并发现了APP相关相互作用增强、MHC-II信号上调等新机制 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的直接适用性需进一步验证;样本量相对有限 | 探究唐氏综合征相关肺部疾病的致病机制 | Dp16小鼠模型的肺部细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Dp16小鼠模型(雄性和雌性)的肺部细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 291 | 2026-02-28 |
Fibroblast-driven MMP-9/TIMP-1 imbalance in bronchoalveolar lavage reflects fibrotic progression in interstitial lung disease
2026-Jan, European journal of clinical investigation
IF:4.4Q2
DOI:10.1111/eci.70162
PMID:41354972
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研究论文 | 本研究评估了间质性肺疾病患者支气管肺泡灌洗液中MMP-9/TIMP-1比值与纤维化严重程度的关系,并确定了成纤维细胞/肌成纤维细胞是导致该失衡的主要细胞来源 | 首次在人类ILD患者中系统评估BAL液中MMP-9/TIMP-1比值与纤维化进展的关联,并结合原代细胞培养和单细胞RNA测序数据分析,明确了成纤维细胞是驱动该失衡的关键细胞类型 | 样本量较小(48例),为单中心研究,需要更大规模的多中心研究进行验证 | 阐明MMP-9/TIMP-1平衡在间质性肺疾病纤维化进展中的作用,并探索其作为生物标志物的潜力 | 间质性肺疾病患者(包括非纤维化ILD、纤维化ILD和特发性肺纤维化患者)的支气管肺泡灌洗液样本及从中分离的成纤维细胞/肌成纤维细胞 | NA | 间质性肺疾病 | 酶联免疫吸附试验、明胶酶谱法、免疫荧光、单细胞RNA测序数据分析 | NA | 蛋白质浓度数据、酶活性数据、免疫荧光图像、单细胞RNA测序数据 | 48例连续入组的ILD患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 292 | 2026-02-28 |
Microglial heterogeneity: influence of human 2D, 3D, and co-culture models on gene expression and immune function
2026, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2026.1770518
PMID:41757348
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人类单核细胞来源的小胶质细胞在不同培养模型(2D、3D单培养及3D神经胶质共培养)中的基因表达和免疫功能异质性 | 首次系统比较了不同培养维度(2D vs 3D)和细胞环境(单培养 vs 共培养)对人类小胶质细胞状态组成的影响,揭示了培养架构对小胶质细胞身份和免疫反应性的决定性作用 | 研究基于体外培养模型,可能无法完全模拟体内复杂的微环境;样本来源和培养条件的具体细节未明确说明 | 探究培养模型的维度(2D/3D)和细胞环境对小胶质细胞状态异质性和功能的影响 | 人类单核细胞来源的小胶质细胞(MDMi) | 单细胞组学 | 神经免疫疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 293 | 2026-02-27 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing unravels neutrophil heterogeneity and validates SPP1 as a prognostic biomarker in cervical cancer
2026-Jan-30, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15636-9
PMID:41612311
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,揭示了宫颈癌中中性粒细胞的异质性,并验证了SPP1作为预后生物标志物的作用 | 首次在宫颈癌中系统表征了四种功能不同的中性粒细胞亚型,并确定了SPP1-CD44轴作为中性粒细胞-肿瘤细胞相互作用的关键介质 | 研究样本量相对较小(单细胞数据来自5个样本),且主要基于转录组数据,需要进一步的功能验证和更大规模的临床队列验证 | 解析宫颈癌肿瘤微环境中中性粒细胞的异质性及其在肿瘤进展中的作用,并开发预后生物标志物 | 宫颈癌组织样本、TCGA-CESC和GTEx数据库中的批量RNA测序数据 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫组织化学、免疫荧光分析、体外功能实验 | LASSO-Cox回归模型 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、图像数据 | 单细胞数据:5个宫颈癌组织样本;批量数据:TCGA-CESC和GTEx数据库中的多个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 294 | 2026-02-27 |
Phylogenomic tree of Cercozoa based on single-cell transcriptomes from 100 uncultured cells
2026-Jan-30, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02536-4
PMID:41618358
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术,对100个未培养的Cercozoa细胞进行采样,构建了基于系统基因组学的Cercozoa系统发育树 | 通过单细胞转录组学广泛采样未培养的Cercozoa多样性,将分类单元采样增加了300%以上,并报告了五个新的未知谱系和两个仅从环境序列中已知的谱系 | 某些先前建立的类群(如Imbricatea类)在系统发育树中未被恢复,表明采样或方法可能存在局限性 | 研究Cercozoa的系统发育关系和多样性,以增进对其基本生物学的理解 | 单细胞真核生物Cercozoa(原生生物),包括土壤和海洋沉积物中的捕食性原生生物、海洋浮游生物等 | 系统发育学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据、形态图像数据 | 100个未培养的Cercozoa细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 295 | 2026-02-27 |
Peroxiredoxin 1 mediates bleomycin-induced acute lung injury in mice via macrophage NOD1/NF-κB axis
2026-Jan-30, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-026-03533-5
PMID:41618391
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研究论文 | 本研究揭示了过氧化物还原酶1(Prdx1)通过激活巨噬细胞中的NOD1/NF-κB信号通路,在博来霉素诱导的急性肺损伤中起关键作用 | 首次发现Prdx1作为损伤相关分子模式在博来霉素诱导的急性肺损伤中的作用机制,并证实其通过巨噬细胞NOD1/NF-κB轴介导炎症反应 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证;Prdx1中和抗体的临床应用潜力需进一步评估 | 探究Prdx1在博来霉素诱导的急性肺损伤中的作用机制,寻找潜在治疗靶点 | 小鼠(包括Prdx1基因敲除小鼠) | 病理生理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 296 | 2026-02-27 |
From origins to nomenclature: illuminating the landscape of CNS fibroblasts and fibroblast-like cells
2026-Jan-30, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-026-02236-8
PMID:41618474
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综述 | 本文综述了中枢神经系统成纤维细胞及其类似细胞的起源、亚型、功能和命名问题 | 系统梳理了CNS成纤维细胞与血管软脑膜细胞、A型周细胞等类似细胞之间的重叠特征与命名混乱,强调了单细胞测序技术带来的新见解 | 作为综述文章,未提出新的实验数据或模型,主要依赖现有文献分析 | 阐明中枢神经系统成纤维细胞及其类似细胞的亚型、功能、发育起源和命名规范,以减少该领域的混淆 | 中枢神经系统成纤维细胞、血管软脑膜细胞、A型周细胞等基质细胞 | 神经生物学 | NA | 单细胞测序、组织学分析、功能分析、转录组学分析 | NA | 转录组数据、组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 297 | 2026-02-27 |
Granzyme A-producing type 1 innate lymphoid cells promote salivary secretion in the aged submandibular gland
2026-Jan-29, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-026-00407-7
PMID:41606670
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研究论文 | 本文探讨了衰老过程中颌下腺唾液分泌的维持机制,发现GZMA+ ILC1细胞通过GZMA-Pard3轴促进上皮细胞功能 | 首次揭示了GZMA+ ILC1细胞在衰老颌下腺中通过GZMA-Pard3轴维持唾液分泌的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性需进一步验证;机制细节如GZMA-Pard3轴的具体作用途径仍需深入探究 | 探究衰老过程中唾液腺分泌功能维持的细胞机制 | 小鼠颌下腺组织、淋巴细胞簇、上皮细胞 | 单细胞生物学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序、显微切割、共培养系统、体内耗竭实验 | NA | 单细胞转录组数据、组织学图像 | 按衰老阶段分层的小鼠群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 298 | 2026-02-27 |
Translating spatial transcriptomic signatures in adenosquamous carcinoma into bulk prognostic biomarkers in lung adenocarcinoma: a bottom-up approach
2026-Jan-23, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01297-1
PMID:41571939
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析肺腺鳞癌,识别出TTF-1/p40阴性肿瘤细胞群,并将其基因特征转化为肺腺癌的预后生物标志物 | 开发了一种自下而上的生物标志物发现策略,利用空间转录组学从腺鳞癌中识别罕见肿瘤状态,并成功将其转化为适用于肺腺癌的批量预后分层工具 | 研究主要基于肺腺鳞癌模型,其发现向肺腺癌的转化需进一步验证,且样本量可能有限 | 将空间转录组学定义的罕见肿瘤状态转化为临床相关的预后生物标志物 | 肺腺鳞癌和肺腺癌患者样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学、免疫组化 | RGB-UMAP | 空间转录组数据、批量转录组数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 299 | 2026-02-27 |
Mitochondrial pyruvate metabolism in club cells drives airway inflammation
2026-Jan-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102742
PMID:41418787
|
研究论文 | 本文研究了气道club细胞中线粒体丙酮酸代谢如何控制上皮分化和过敏性气道炎症 | 揭示了线粒体丙酮酸代谢在哮喘发病机制中的关键作用,并识别了Mpc2基因通过调节Cxcl17-Cxcr4信号通路与肺泡巨噬细胞互作,从而抑制2型炎症的新机制 | 研究主要基于OVA诱导的哮喘模型,可能不完全反映人类哮喘的复杂性;未详细探讨其他代谢途径的潜在贡献 | 探究哮喘中气道club细胞代谢失调如何驱动上皮修复缺陷和炎症反应 | 哮喘患者的气道club细胞和杯状细胞,以及OVA诱导的哮喘小鼠模型 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 哮喘患者和OVA诱导哮喘模型的小鼠样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 300 | 2026-02-27 |
An innovative in vitro system unveils IGF1R signaling regulating Merkel cell generation
2026-Jan-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102756
PMID:41455470
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研究论文 | 本研究开发了包括短期离体触须外植体、小鼠皮肤类器官和人干细胞衍生皮肤类器官在内的新型体外培养系统,用于研究Merkel细胞的发育,并揭示了IGF1R信号通路在其中的调控作用 | 首次建立了能够有效研究Merkel细胞发育的多种体外培养系统,并发现PRC抑制剂能促进Merkel细胞生成,同时鉴定出IGF1R作为新的调控因子 | 研究主要基于体外培养系统,体内验证和临床转化仍需进一步探索 | 研究Merkel细胞的发育机制及其调控信号通路 | Merkel细胞、小鼠触须、小鼠皮肤类器官、人干细胞衍生皮肤类器官 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学、药物筛选 | 类器官模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |