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当前共找到 1234 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2026-02-02 |
Injured epithelial cell states impact kidney allograft survival after T-cell-mediated rejection
2026-Jan-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68397-1
PMID:41605921
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学技术，揭示了T细胞介导的排斥反应（TCMR）诱导的肾脏上皮细胞损伤状态及其对移植生存的影响 | 首次在跨物种（小鼠和人类）水平上，结合单核RNA测序、空间转录组学和免疫荧光技术，系统性地识别了TCMR中上皮细胞损伤状态作为移植结果的决定因素，并发现这些状态在TCMR缓解后仍持续存在 | 研究主要基于实验模型和有限的人类样本数据，可能无法完全反映所有临床情境的复杂性，且空间转录组学的分辨率限制可能影响细胞互作的精确解析 | 探究T细胞介导的排斥反应（TCMR）在肾脏移植中的分子机制及其对移植生存的临床影响 | 小鼠肾脏移植模型和人类肾脏移植活检样本，特别是近端小管和厚升支的上皮细胞 | 数字病理学 | 肾脏移植排斥 | 单核RNA测序（snRNA-seq）、空间转录组学、免疫荧光、单细胞反卷积分析 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、图像数据 | 小鼠模型和人类TCMR及稳定移植样本，具体数量未在摘要中明确 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 282 | 2026-02-02 |
Generation of thymus-reconstituting T cell progenitors from human pluripotent stem cells
2026-Jan-26, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101272
PMID:41512861
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研究论文 | 本文描述了从人类多能干细胞生成能够直接并长期重建胸腺的T细胞祖细胞的方法 | 首次在体外从人类多能干细胞工程化出具有胸腺重建能力的T细胞祖细胞，为研究T细胞发育机制和CAR-T细胞疗法提供了新模型 | 未明确提及实验的局限性，可能包括体内功能验证的深度或长期安全性评估 | 旨在生成大量能够重建受体免疫系统的T细胞祖细胞，以推进癌症免疫治疗 | 人类多能干细胞（hPSC）及其衍生的T细胞祖细胞 | 再生医学 | 癌症 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 283 | 2026-02-02 |
Integrative single‑cell multi‑omics network analysis to elucidate epigenetic regulation in neurodevelopmental disorders
2026-Jan-22, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100395
PMID:41580083
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研究论文 | 本研究提出了一种整合单细胞多组学网络分析框架，用于阐明神经发育障碍中的表观遗传调控机制 | 整合scRNA-seq、scATAC-seq和单细胞DNA甲基化数据，通过相关分析、流形对齐和网络推断构建细胞类型特异性表观遗传调控网络，揭示多模态失调 | 未明确提及具体样本量限制或技术重复性验证细节 | 阐明神经发育障碍中表观遗传和转录失调的分子机制 | 发育中的人和小鼠脑组织以及患者来源的神经祖细胞模型 | 单细胞多组学 | 神经发育障碍 | scRNA-seq, scATAC-seq, 单细胞DNA甲基化测序 | 典型相关分析、流形对齐、潜变量模型、网络推断 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 284 | 2026-02-02 |
Integrative functional genomics and fine-mapping identify regulatory mechanisms of multivariate obesity GWAS and its cardiometabolic implications
2026-Jan-20, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2026.156509
PMID:41570977
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研究论文 | 本研究通过整合多变量肥胖GWAS数据与功能基因组学方法，揭示了肥胖与心脏代谢性状的共享遗传机制和关键调控基因 | 采用基因组结构方程模型构建多变量肥胖表型，并结合多组学数据进行精细定位与共定位分析，识别了先前未报告的遗传信号和跨组织神经-脂肪调控轴 | 研究主要基于欧洲人群数据，可能限制了在其他人群中的普适性，且功能验证实验不足 | 解析肥胖的复杂遗传结构及其与心脏代谢疾病的共享机制 | 五种肥胖相关性状（体重指数、腰围、内脏脂肪、肝脏脂肪和体脂百分比）的遗传数据 | 基因组学 | 肥胖症 | GWAS、基因组结构方程建模、表达数量性状位点分析、转录组范围关联研究、蛋白质组范围关联研究、单细胞RNA测序 | 基因组结构方程模型、MAGMA、scPagwas | 基因组、表观基因组、转录组、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 285 | 2026-02-02 |
IL-6 drives chemoimmunotherapy resistance in NSCLC by reprogramming myeloid cells and impairing cytotoxic lymphocyte function
2026-Jan-17, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218259
PMID:41554474
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研究论文 | 本研究探讨了基线血浆IL-6水平在预测晚期非小细胞肺癌患者对化疗免疫联合治疗原发性耐药及生存预后中的价值，并通过小鼠模型和单细胞RNA测序揭示了IL-6通过重塑肿瘤免疫微环境驱动耐药的机制 | 首次将基线血浆IL-6水平确立为晚期NSCLC患者化疗免疫联合治疗原发性耐药和不良生存的独立预测因子，并利用单细胞RNA测序阐明了IL-6通过促进巨噬细胞向免疫抑制表型极化、抑制CD8 T细胞浸润、增加Treg比例以及损害NK细胞功能来驱动免疫抑制性肿瘤微环境形成的具体机制 | 研究为回顾性分析，样本量相对有限（123例患者），且小鼠模型可能无法完全模拟人类肿瘤的复杂性，需要前瞻性研究和更大样本验证 | 探究IL-6在晚期非小细胞肺癌化疗免疫联合治疗耐药中的作用及机制 | 晚期非小细胞肺癌患者（123例）及小鼠肺腺癌（LLC）和鳞状细胞癌（KLN205）模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | ELISA, 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 血浆生物标志物数据、单细胞转录组数据 | 123例晚期NSCLC患者，以及建立IL-6过表达或抑制的小鼠LLC和KLN205肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 286 | 2026-02-02 |
Advancing spatial cellular communication inference with ligand diffusion and transport model
2026-Jan-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09413-w
PMID:41501529
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研究论文 | 本研究提出了一种名为SCILD的基于优化框架，用于从空间转录组学数据中以单细胞分辨率推断空间细胞通讯 | SCILD整合了配体扩散、竞争性配体-受体结合和浓度衰减，构建了一个统一的优化模型，并利用神经网络建模和计算机扰动预测下游靶基因 | NA | 开发一种工具以从空间转录组学数据中推断单细胞水平的空间细胞通讯 | 细胞通讯中的配体-受体相互作用 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 优化框架与神经网络 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 287 | 2026-02-02 |
Biological and prognostic relevance of A-to-I RNA editing across consensus molecular subtypes of colon cancer
2026-Jan-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34043-x
PMID:41491064
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研究论文 | 本研究探讨了A-to-I RNA编辑在结肠癌共识分子亚型（CMS）中的生物学和预后相关性 | 首次在结肠癌CMS亚型中系统分析RNA编辑事件，揭示了亚型特异性编辑特征、ceRNA网络及其与肿瘤微环境和化疗耐药性的关联 | 研究基于100例患者的bulk RNA-seq数据，样本量相对有限；单细胞分析仅来自独立队列的II期患者，可能未覆盖所有疾病阶段 | 阐明RNA编辑在结肠癌发生发展中的调控作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 100例不同疾病阶段的结肠癌患者，以及独立队列的II期结肠癌患者单细胞数据 | 生物信息学 | 结肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 多变量Cox比例风险模型, ceRNA网络分析 | 转录组数据 | 100例结肠癌患者（bulk RNA-seq）和独立队列的II期结肠癌患者（单细胞RNA-seq） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 288 | 2026-02-02 |
CellCraft: an extensible visual programming application for gene regulatory network inference
2026-Jan-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf684
PMID:41452748
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研究论文 | 本文介绍了一个名为CellCraft的基于Web的应用程序，旨在简化从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络的工作流程 | CellCraft提供了直观的图形用户界面和可视化编程接口，简化了复杂多步骤分析的设计与执行，并采用模块化插件架构确保可扩展性 | NA | 开发一个用户友好且可扩展的应用程序，用于单细胞RNA测序数据集的整合基因调控网络分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络推断工具（包括TENET等） | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 289 | 2026-02-02 |
Unravelling the progression of the zebrafish primary body axis with reconstructed spatiotemporal transcriptomics
2026-Jan-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03917-8
PMID:41484648
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研究论文 | 本研究提出了一个名为Palette的流程，用于从bulk RNA-seq数据推断详细的空间基因表达模式，并构建了斑马鱼时空表达谱（zSTEP）资源 | 开发了Palette流程，通过平滑、插值和调整基因表达，利用现有空间转录组数据作为唯一参考，从bulk RNA-seq数据重建高分辨率时空表达谱 | 方法依赖于现有空间转录组数据作为参考，且当前空间转录组技术本身存在测序深度低和基因检测有限的问题 | 研究斑马鱼胚胎发育过程中基因表达的时空动态，特别是前后轴发育的调控机制 | 斑马鱼胚胎 | 空间转录组学 | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | 机器学习 | RNA-seq数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 三个发育阶段的53个连续切片bulk RNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 290 | 2026-02-02 |
AUTOENCODIX: a generalized and versatile framework to train and evaluate autoencoders for biological representation learning and beyond
2026-Jan, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00916-4
PMID:41366150
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研究论文 | 本文介绍了一个名为AUTOENCODIX的开源框架，旨在为自编码器的预处理、训练和评估提供标准化且灵活的流程 | 提出了一个标准化、多功能且可比较的自编码器训练与评估框架，支持基于本体和跨模态的自编码器架构，增强了嵌入的可解释性和数据模态间的转换能力 | 未在摘要中明确说明具体局限性 | 开发一个通用框架以改进自编码器在生物表示学习中的应用，促进数据驱动研究 | 泛癌研究数据集（如The Cancer Genome Atlas）、单细胞测序数据以及成像数据 | 机器学习 | 癌症 | 自编码器、深度学习方法 | 自编码器（包括基于本体和跨模态的自编码器） | 多模态数据（包括测序数据和成像数据） | NA | NA | NA | NA | NA |
| 291 | 2026-02-02 |
Tumor-associated macrophage-specific SERPING1 contributes to M1-phenotype transition and suppress colorectal cancer tumorigenesis via NF-κB pathway
2026-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150144
PMID:41513188
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研究论文 | 本研究探讨了丝氨酸蛋白酶抑制剂SERPING1通过抑制NF-κB通路，促进肿瘤相关巨噬细胞向M1表型极化，从而抑制结直肠癌发生发展的机制 | 首次揭示了SERPING1在肿瘤相关巨噬细胞中的特异性表达及其通过调控NF-κB通路影响巨噬细胞表型转换的新机制 | 研究主要基于细胞实验和小鼠模型，临床样本验证和具体信号通路细节有待进一步深入 | 阐明巨噬细胞在结直肠癌发生发展中的作用机制，特别是SERPING1对肿瘤相关巨噬细胞表型调控的功能 | 结直肠癌组织、肿瘤相关巨噬细胞、HCT116细胞系、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞功能实验数据 | 基于公共单细胞RNA-seq数据集和细胞系实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 292 | 2026-02-02 |
Multi-omics integration defines an ECM-associated intratumoral heterogeneity signature enabling prognosis assessment and therapeutic stratification in hepatocellular carcinoma
2026-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150143
PMID:41513193
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研究论文 | 本研究开发了一个基于多组学的肿瘤内异质性评分系统，用于改善肝细胞癌患者的风险分层和指导精准治疗 | 通过整合体细胞突变数据和单细胞RNA测序数据，建立了一个转录组为基础的肿瘤内异质性特征，并揭示了细胞外基质重塑与高异质性肿瘤的关联 | 样本量相对有限，单细胞RNA测序仅涉及20个样本，且主要依赖公共数据库和回顾性数据，需要进一步的前瞻性验证 | 量化肝细胞癌的肿瘤内异质性，以改善患者预后评估和治疗分层 | 肝细胞癌患者，包括来自TCGA数据库的361例患者和单细胞RNA测序的20个样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，体细胞突变分析，转录组分析 | 稳健排序聚合 | 基因组数据，转录组数据 | 361例TCGA患者和20个单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 293 | 2026-02-02 |
Mechanistic Investigation of Nitidine Chloride-Mediated Anti-Colorectal Cancer Activity: Centromere-Associated Protein E Targeting via Integrated Molecular Dynamics, Spatial Transcriptomic and Single-Cell Approaches
2026 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70054
PMID:41607031
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研究论文 | 本研究通过整合分子动力学模拟、空间转录组学和单细胞方法，探讨了氯化两面针碱靶向着丝粒相关蛋白E在抗结直肠癌活性中的分子机制 | 首次整合分子动力学模拟、空间转录组学和单细胞RNA测序技术，系统阐明氯化两面针碱通过靶向CENPE发挥抗结直肠癌作用的分子机制，为中药活性成分的精准治疗提供新方向 | 研究结果需要在更多实验体系中进一步验证，且对NC-CENPE复合物的结合模式预测需实验确认 | 阐明氯化两面针碱抗结直肠癌活性的分子机制，特别关注其与着丝粒相关蛋白E的相互作用，为基于中药活性成分的精准治疗提供科学依据 | 结直肠癌组织、细胞系及异种移植模型，着重研究CENPE蛋白的表达与功能 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、分子动力学模拟、实时定量PCR、免疫组化、CRISPR筛选 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、分子模拟数据、图像数据 | 涉及大规模mRNA队列分析，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 294 | 2026-02-02 |
Exploring the relationship between metabolism and immune microenvironment in breast cancer bone metastasis based on metabolic pathways
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0341270
PMID:41610108
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研究论文 | 本研究基于代谢通路探索乳腺癌骨转移中代谢与免疫微环境的关系 | 从代谢-免疫相互作用角度揭示乳腺癌骨转移的预后代谢通路和关键靶基因，并构建了代谢相关风险模型作为预后预测工具 | 研究主要依赖于公共数据库的回顾性数据，缺乏实验验证，且样本量有限 | 阐明乳腺癌骨转移中代谢通路与免疫微环境之间的动态相互作用及其对预后的影响 | 乳腺癌骨转移患者的RNA-seq数据和临床信息 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 风险模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的乳腺癌骨转移患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 295 | 2026-02-02 |
SpaConTDS: A multimodal contrastive learning framework for identifying spatial domains by applying tuple disturbing strategy
2026-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013893
PMID:41610146
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研究论文 | 本研究提出了一个名为SpaConTDS的新型多模态对比学习框架，用于准确识别空间转录组学数据中的空间域 | 该框架创新性地将强化学习与自监督多模态对比学习相结合，并通过数据增强和伪标签元组扰动策略生成正负样本，以学习捕获全局语义和跨模态交互的融合表示 | NA | 开发一个能够准确识别空间域并整合多模态空间转录组学数据的计算框架 | 多模态空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 多模态对比学习框架，结合强化学习 | 多模态空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 296 | 2026-02-02 |
THBS3 Functions as a Novel Biomarker for Prognosis and Immunotherapeutic Response in Colorectal Cancer: An Integrative Analysis and Validation of the Thrombospondin Gene Family
2026, Cancer informatics
IF:2.4Q3
DOI:10.1177/11769351251412614
PMID:41613418
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和实验验证，揭示了THBS3在结直肠癌中作为预后生物标志物和免疫治疗反应新靶点的作用 | 首次系统性地将THBS基因家族与结直肠癌的预后和免疫微环境联系起来，并确定THBS3为关键致癌基因，通过激活PI3K-AKT和EMT通路促进癌症进展 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证，且临床样本的具体来源和数量未详细说明 | 探究THBS基因家族在结直肠癌中的具体作用，并评估THBS3作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 | 结直肠癌患者的多组学数据、细胞系以及THBS基因家族，特别是THBS3 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学数据分析、单细胞RNA测序、GO/KEGG/GSEA富集分析、分子对接、体外实验 | NA | mRNA表达数据、临床病理特征数据、生存数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 297 | 2026-02-02 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Prostate Cancer: Unraveling Mechanisms and Therapeutic Implications
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.073265
PMID:41613792
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综述 | 本文全面总结了前列腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的细胞起源、表型和功能异质性、空间分布及其在肿瘤进展和治疗抵抗中的分子机制，并评估了靶向CAFs的治疗策略 | 整合了单细胞和空间转录组学的最新进展，为理解CAF生物学提供了一个整体框架，并强调了基质重编程作为当前前列腺癌疗法辅助手段的潜在途径 | NA | 阐明前列腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的作用机制及其治疗意义 | 前列腺癌（PCa）及其肿瘤微环境（TME）中的癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 298 | 2026-02-02 |
PIK3R1 as a Gastric Cancer Biomarker Linked to CD73 + Treg-Mediated Immunosuppression
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.069453
PMID:41613810
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研究论文 | 本研究探讨了PIK3R1作为胃癌生物标志物的预后意义及其与CD73+ Treg介导的免疫抑制的关联 | 首次将PIK3R1过表达与胃癌中CD73+ Treg细胞浸润增加及不良预后联系起来，并构建了一个整合PIK3R1和CD73表达与临床参数的新型预后模型 | 研究主要基于回顾性队列数据，需要前瞻性研究验证；体外实验未能完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 研究PIK3R1在胃癌中的预后意义及其与肿瘤免疫微环境的关联 | 胃癌患者组织样本及胃癌细胞系 | 癌症生物标志物研究 | 胃癌 | 免疫组织化学、单细胞RNA测序、体外细胞功能实验 | 预后模型（列线图） | 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据、图像数据 | 来自TCGA和SYSUCC队列的胃癌患者数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 299 | 2026-01-30 |
omnideconv: a unifying framework for using and benchmarking single-cell-informed deconvolution of bulk RNA-seq data
2026-Jan-26, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03955-w
PMID:41582216
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研究论文 | 本文提出了omnideconv框架，用于统一和基准测试基于单细胞RNA测序数据的批量RNA-seq数据去卷积方法 | 开发了一个统一的框架omnideconv，用于简化去卷积方法的应用、基准测试和优化，并全面评估了第二代工具的准确性、可扩展性和鲁棒性 | NA | 评估和优化基于单细胞RNA测序数据的批量RNA-seq数据去卷积方法的性能 | 批量RNA-seq数据的细胞类型去卷积 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 300 | 2026-01-30 |
Busulfan plus cyclophosphamide induced spermatogenic dysfunction and recovery: A dynamic change perspective
2026-Jan-24, Toxicology letters
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.toxlet.2026.111833
PMID:41587595
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型，系统描述了白消安联合环磷酰胺（BuCy）诱导的睾丸损伤与恢复的长期动态变化 | 首次在小鼠中应用BuCy联合治疗方案，并利用单细胞转录组测序（scRNA-seq）进行纵向多时间点分析，揭示了生殖细胞群体的逐步减少及差异表达基因的动态变化 | 研究基于小鼠模型，可能无法完全模拟人类临床情况，且样本量未明确说明 | 探究BuCy预处理方案对睾丸功能的损伤机制及恢复过程 | 小鼠睾丸组织及生殖细胞 | 数字病理学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |