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当前共找到 1234 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-02-03 |
scXDR: drug response prediction across single-cell datasets via heterogeneous network transfer learning
2026-Jan-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09418-5
PMID:41507436
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研究论文 | 本研究提出了一种名为scXDR的异质网络迁移学习模型，用于跨单细胞数据集的药物反应预测 | 通过异质网络整合药物、基因和细胞间的特征与关联，进行消息传递、特征与结构对齐、结构重建和药物-细胞评分预测，避免了传统方法依赖批量RNA测序与单细胞RNA测序数据整合的局限性 | 未明确提及模型在处理大规模数据集时的计算效率或对罕见细胞类型的预测能力 | 提高单细胞水平药物反应预测的准确性，为药物开发和精准治疗提供指导 | 药物、基因、细胞（包括个体细胞和细胞群） | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 异质网络迁移学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 262 | 2026-02-03 |
Evaluating genetic ancestry inference from single-cell transcriptomic datasets
2026-Jan-08, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2026.100564
PMID:41508611
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研究论文 | 本文提出一个评估从单细胞转录组数据推断遗传祖先方法的框架，并应用于人类细胞图谱数据集 | 首次系统评估单细胞转录组数据中遗传祖先推断方法的准确性，并揭示了现有数据集中祖先代表性不平衡的问题 | 仅评估了10个数据集中的401名供体，样本多样性可能有限；未考虑不同测序深度对变异检测的影响 | 评估单细胞转录组数据中遗传祖先推断方法的准确性，促进遗传多样性在单细胞研究中的代表性 | 单细胞转录组数据集中的遗传多态性 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | ADMIXTURE等群体遗传学工具 | 单细胞转录组测序数据 | 来自10个人类细胞图谱数据集的401名供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 263 | 2026-02-03 |
PAX6 Deficiency Compromises the Ability of Limbal Epithelial Stem Cells to Properly Differentiate Into Mature Corneal Epithelial Cells
2026-Jan-05, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.1.56
PMID:41590604
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了PAX6缺陷小鼠角膜/缘组织的转录组变化，揭示了PAX6缺乏导致缘上皮干细胞功能异常和角膜上皮细胞分化缺陷的分子机制 | 首次在单细胞分辨率下应用scRNA-seq技术，系统性地揭示了PAX6缺乏如何影响缘上皮干细胞向成熟角膜上皮细胞的分化过程，并识别了特定的细胞簇变化 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类患者样本，且样本量相对较小，可能限制了结果的普适性 | 探究PAX6缺乏在无虹膜相关角膜病变（AAK）中导致缘上皮干细胞功能异常的分子机制 | 野生型和PAX6杂合（Pax6 het）小鼠的角膜/缘组织 | 单细胞转录组学 | 无虹膜相关角膜病变 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 野生型和PAX6杂合小鼠的角膜/缘组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 264 | 2026-02-03 |
Type I interferon drives dysfunction of a distinct CD8+ HLA-DRB1+ T cell subset in systemic lupus erythematosus
2026-Jan-03, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.01.02.26343348
PMID:41607660
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研究论文 | 本研究全面表征了系统性红斑狼疮中一个独特的CD8+ HLA-DRB1+ T细胞亚群，揭示了I型干扰素如何驱动其功能失调状态 | 首次全面表征了SLE中一个独特的CD8+ HLA-DRB1+ T细胞亚群，揭示了I型干扰素通过促进耗竭和损害脱颗粒来驱动其功能失调的机制 | 研究主要基于外周血样本，对肾脏浸润细胞的验证依赖于现有数据集分析 | 旨在全面表征系统性红斑狼疮中CD8+ HLA-DRB1+ T细胞的功能和分子特征 | 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的外周血CD8+ T细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据、流式细胞数据 | SLE患者和健康对照者的外周血CD8+ T细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 265 | 2026-02-03 |
Potential Key Genes for Giant Cell Arteritis Revealed Based on Single-Cell Sequencing and Mendelian Randomization Analysis
2026, International archives of allergy and immunology
IF:2.5Q3
DOI:10.1159/000546323
PMID:40349694
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、表达数量性状位点和全基因组关联研究数据，采用双样本孟德尔随机化方法，识别了与巨细胞动脉炎风险降低相关的三个关键基因RCAN3、RPS6和HLA-DQB1 | 首次结合单细胞RNA测序数据和孟德尔随机化分析来探索巨细胞动脉炎的致病基因，并通过共定位分析验证了基因与疾病之间的因果关系 | 未在文中明确说明样本量或数据来源的具体限制，且研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 识别与巨细胞动脉炎相关的关键基因并探索其潜在致病机制 | CD4+ T细胞中的标志基因与巨细胞动脉炎之间的因果关系 | 生物信息学 | 巨细胞动脉炎 | 单细胞RNA测序, 表达数量性状位点分析, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化, 共定位分析 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据, 遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 266 | 2026-02-03 |
Tissue-resident macrophage and dendritic cells drive type I IFN immunity to enteroviruses in the liver
2026-Jan, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013891
PMID:41592119
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研究论文 | 本研究通过结合表达人FcRn的小鼠模型和单细胞RNA测序，揭示了肝脏中库普弗细胞和树突状细胞亚群是驱动早期I型干扰素应答以抵抗艾柯病毒感染的关键先天免疫细胞 | 首次明确了在艾柯病毒肝脏感染中，库普弗细胞和特定树突状细胞亚群是启动早期I型干扰素应答的主要细胞来源，并证明肝细胞的保护依赖于这些免疫细胞产生的干扰素信号 | 研究主要基于小鼠模型，其免疫反应与人类可能存在差异；未详细探讨III型干扰素在保护中的具体作用机制 | 阐明在艾柯病毒肝脏感染中，负责启动抗病毒I型干扰素应答的特定先天免疫细胞类型及其保护机制 | 表达人FcRn的转基因小鼠、Ifnar1/Ifnlr1基因敲除小鼠、肝细胞条件性Ifnar1敲除小鼠及肝脏中的各类细胞（肝细胞、库普弗细胞、树突状细胞等） | 免疫学 | 病毒感染（艾柯病毒） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、条件性基因敲除小鼠模型、体内感染模型 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及多种基因工程小鼠品系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 267 | 2026-02-02 |
A Glucose-Responsive Intelligent Antibacterial and Oxygen-Producing Hydrogel Promotes the Healing of Diabetic Wounds by Regulating Cellular Heterogeneity
2026-Jan-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517028
PMID:41619261
|
研究论文 | 本研究开发了一种葡萄糖响应型智能抗菌产氧水凝胶CF-CPGaMPN，用于促进糖尿病感染伤口的愈合 | 通过结合PVP@CaO纳米颗粒、过氧化氢酶和GaMPN纳米颗粒，实现了葡萄糖触发的按需药物释放，并利用单细胞RNA测序分析了伤口周围的多细胞生态系统 | NA | 开发一种智能水凝胶以促进糖尿病感染伤口的愈合 | 糖尿病感染伤口及其周围的多细胞生态系统 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 268 | 2026-02-02 |
COL14A1 drives ischemic cardiac injury in PCOS: an artificial intelligence-identified biomarker
2026-Jan-31, QJM : monthly journal of the Association of Physicians
DOI:10.1093/qjmed/hcag033
PMID:41619759
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与人工智能方法，鉴定出COL14A1是多囊卵巢综合征与缺血性心肌病共享的关键生物标志物，并揭示了其在免疫-纤维化轴中的作用机制 | 首次通过整合多组学数据与105种机器学习模型组合，系统鉴定出连接PCOS与缺血性心脏损伤的共享生物标志物COL14A1，并利用单细胞及空间转录组学解析其细胞特异性与组织定位 | 研究结论主要基于生物信息学分析与体外数据，缺乏体内实验验证；候选药物罗非昔布的疗效尚未经过临床验证 | 鉴定PCOS与缺血性心肌病之间的共享诊断生物标志物并阐明其生物学基础 | 多囊卵巢综合征患者与缺血性心肌病患者的转录组数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组测序，单细胞RNA测序，空间转录组学，分子对接 | Elastic Net | 基因表达数据 | 来自多个GEO队列的PCOS与ICM转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 269 | 2026-02-02 |
A spectral dimension reduction technique that improves pattern detection in multivariate spatial data
2026-Jan-31, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag052
PMID:41619788
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于多变量空间转录组学数据模式识别的统计方法，通过构建低维特征空间投影来最大化空间依赖性度量Moran's I | 提出了一种无需参数调优的算法，能有效减少非空间变异并优于主成分分析预处理，同时提供校准的空间基因表达测试 | NA | 提高多变量空间数据中模式检测的准确性 | 多变量空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 统计降维算法 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 270 | 2026-02-02 |
A spatiotemporal atlas of cerebrovascular development in zebrafish
2026-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68995-z
PMID:41620404
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研究论文 | 本研究结合原位测序、单细胞转录组学和3D血管重建技术，绘制了斑马鱼大脑内皮发育的时空图谱 | 整合多尺度数据（分子、细胞和结构）揭示脑血管发育动态，识别出6种内皮亚型并验证了三个未表征基因在血管模式和血脑屏障完整性中的作用 | 研究聚焦于斑马鱼模型，结果向哺乳动物的直接转化需进一步验证 | 探究脊椎动物大脑脑血管发育的分子和细胞动力学 | 斑马鱼大脑内皮细胞（3-11天受精后） | 数字病理学 | NA | 原位测序, 单细胞转录组学, 3D血管重建, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间数据, 3D图像 | 斑马鱼大脑内皮细胞（3-11 dpf），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 271 | 2026-02-02 |
Neoadjuvant modified FOLFIRINOX plus nivolumab in borderline-resectable pancreatic ductal adenocarcinoma: a pilot phase 1 trial
2026-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68976-2
PMID:41620440
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研究论文 | 这是一项评估新辅助改良FOLFIRINOX联合纳武利尤单抗治疗临界可切除胰腺导管腺癌的1b/2期临床试验 | 首次在临界可切除PDAC患者中评估化疗联合免疫检查点抑制剂的新辅助治疗方案，并采用空间转录组学等先进技术进行转化研究 | 单臂研究设计，样本量较小（28例患者），缺乏随机对照组 | 评估改良FOLFIRINOX联合纳武利尤单抗新辅助治疗的安全性和病理缓解率 | 临界可切除胰腺导管腺癌患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 基因表达分析、免疫组织化学、空间转录组学 | NA | 临床数据、基因表达数据、空间转录组数据 | 28例患者（22例接受手术） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 272 | 2026-02-02 |
Molecular signatures of resilience to Alzheimer's disease in neocortical layer 4 neurons
2026-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68920-4
PMID:41620473
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研究论文 | 本研究利用单核和空间转录组学技术，识别了阿尔茨海默病中具有韧性的神经元群体，并发现KCNIP4作为关键韧性因子 | 首次在阿尔茨海默病中识别出初级视觉皮层第4层神经元中的韧性群体，并揭示KCNIP4作为关键韧性因子，通过补偿机制对抗神经元过度兴奋 | 研究主要基于男性App小鼠模型，可能未全面反映人类阿尔茨海默病的复杂性 | 探究阿尔茨海默病中神经元韧性的分子基础 | 阿尔茨海默病早期受影响（前额叶皮层、楔前叶）和晚期受影响（初级视觉皮层）的新皮层区域神经元 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单核转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 273 | 2026-02-02 |
Oxidative stress-associated genes TPPP3 and VEGFA in COPD revealed by bulk and single-cell sequencing analysis
2026-Jan-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37375-4
PMID:41620539
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和实验方法，识别并验证了慢性阻塞性肺疾病（COPD）中与氧化应激相关的关键基因和通路 | 结合了批量测序和单细胞RNA测序分析，识别出COPD中与氧化应激相关的12个枢纽基因，并特别强调了TPPP3和VEGFA在上皮细胞中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库和体外细胞模型，需要在更多临床样本和体内模型中进一步验证 | 识别和验证COPD中与氧化应激相关的关键基因和通路，探索新的治疗策略和潜在生物标志物 | 慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者数据、人支气管上皮细胞（BEAS-2B） | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、机器学习算法 | LASSO回归、随机森林 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的公共COPD数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 274 | 2026-02-02 |
ACACA modulates R-loop homeostasis to enhance lipid metabolism and microenvironmental interactions in ccRCC
2026-Jan-31, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01319-y
PMID:41620551
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研究论文 | 本研究通过整合公开的ccRCC转录组和临床数据集，量化R-loop相关活性并构建预后模型，发现ACACA作为R-loop相关代谢驱动因子，连接基因组应激与脂质重编程及肿瘤微环境重塑 | 首次揭示ACACA在ccRCC中作为R-loop相关代谢驱动因子，连接基因组应激、脂质代谢重编程和肿瘤微环境相互作用 | 研究主要基于公开数据集和体外实验，缺乏大规模临床样本验证和体内机制的深入探索 | 探究R-loop在ccRCC肿瘤微环境中的作用，并识别关键代谢驱动因子 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的肿瘤微环境、R-loop结构和ACACA基因 | 生物信息学与癌症研究 | 肾细胞癌 | 单样本基因集富集分析（ssGSEA）、线性机器学习算法、单细胞转录组学、空间转录组学、体外实验和异种移植实验 | 线性机器学习算法 | 转录组数据、临床数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 基于公开的ccRCC转录组和临床数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 275 | 2026-02-02 |
Spatial transcriptomic profiling uncovers the molecular effects of the neurotoxicant polychlorinated biphenyls (PCBs) in the brains of adult mice
2026-Jan-31, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-026-03466-x
PMID:41620578
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术，探讨了多氯联苯（PCBs）暴露对成年小鼠大脑功能和认知的影响 | 首次结合空间转录组学分析，揭示了PCBs暴露在小鼠多个大脑区域（如海马体、新皮层）的分子特征及其与血脑屏障完整性的关联 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠，未考虑性别差异；暴露时间为七周，长期效应未评估；样本量未明确说明 | 评估PCBs暴露对大脑功能和认知的分子机制影响 | 成年雄性C57BL/6J小鼠 | 空间转录组学 | 神经毒性相关认知障碍 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 276 | 2026-02-02 |
Revealing FPR1 as a potential pathogenic biomarker for aortic dissection based on Mendelian randomization, single-cell transcriptome and clinical data analysis
2026-Jan-31, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00732-4
PMID:41620799
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 277 | 2026-02-02 |
Runx1 transcription factor modulates opioid analgesia and withdrawal in humans and rodents
2026-Jan-30, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.11.018
PMID:41619726
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研究论文 | 本研究揭示了Runx1转录因子通过调控小胶质细胞转录组，影响人类和啮齿类动物的阿片类镇痛效果和戒断反应 | 首次将Runx1确定为阿片类镇痛反应和戒断的遗传决定因素，并通过单细胞RNA测序和染色质免疫沉淀测序揭示了其在小胶质细胞中的独特调控机制 | 研究主要基于动物模型，人类关联分析可能需要更大样本验证，且未详细探讨Runx1在其他细胞类型中的作用 | 探究Runx1转录因子在阿片类镇痛和戒断反应个体差异中的作用机制 | 小鼠模型和人类个体 | 神经科学 | 疼痛管理 | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 278 | 2026-02-02 |
A pan-cancer single-cell transcriptomic atlas of human bone metastases
2026-Jan-30, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102583
PMID:41619722
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研究论文 | 本研究构建了一个涵盖13种不同来源的62例骨转移样本的单细胞转录组图谱，揭示了骨转移的分子机制和免疫治疗新靶点 | 首次创建了人类骨转移的单细胞转录组全景图谱，整合了大规模原发性和转移性泛癌数据集，并验证了抗PD-1/TIGIT联合免疫疗法在骨转移小鼠模型中的有效性 | 样本量相对有限（62例骨转移样本），且主要基于单细胞RNA测序数据，可能未涵盖所有分子机制 | 探究人类骨转移的分子机制，并寻找免疫治疗优化策略 | 骨转移样本、配对的原发肿瘤和正常骨髓样本 | 数字病理学 | 骨转移 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | 单细胞转录组数据 | 62例骨转移样本，涵盖13种不同癌症来源 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 279 | 2026-02-02 |
Stem cell specification and niche formation in developing incisor require actomyosin forces
2026-Jan-29, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf074
PMID:41296682
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠切牙发育过程中干细胞规范和生态位形成的精确时间，揭示了肌动球蛋白网络在维持干细胞未分化状态中的作用 | 首次发现表达Sox2的干细胞样群体在功能生态位形成之前就已存在，并揭示了肌动球蛋白网络产生的收缩张力在限制干细胞位置和维持其干性中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类或其他物种中的普适性尚不明确，且对肌动球蛋白网络的具体调控机制仍需进一步探索 | 探究小鼠切牙发育过程中干细胞规范和生态位形成的时间关系及其调控机制 | 小鼠胚胎切牙的牙上皮组织 | 发育生物学 | NA | 遗传谱系追踪，单细胞RNA测序 | NA | 遗传谱系数据，单细胞RNA测序数据 | 不同发育阶段的小鼠胚胎切牙样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 280 | 2026-02-02 |
Resolving clonal evolution and selection of extrachromosomal DNA at single-cell resolution
2026-Jan-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03933-2
PMID:41606654
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研究论文 | 本研究提出了一种名为ecSingle的计算方法，利用单细胞RNA测序数据解析肿瘤中染色体外DNA的异质性和克隆进化 | 开发了一种基于单细胞RNA测序数据解析染色体外DNA异质性的新计算方法，并首次在单细胞水平上揭示了ecDNA的克隆选择和转录状态关联 | 方法依赖于标准单细胞RNA测序数据，可能受限于测序深度和覆盖范围，且需要基因组测序验证 | 研究肿瘤中染色体外DNA的克隆进化和选择机制 | 肿瘤样本中的染色体外DNA | 计算生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，单分子长读长测序，基因组测序 | 计算方法（ecSingle） | 单细胞RNA测序数据，基因组测序数据 | 未明确指定具体样本数量，涉及肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq，单分子长读长测序 | NA | NA |