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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-06-19 |
Metabolic Reprogramming in Recurrent Spontaneous Abortion: Key Biomarkers Identification and Diagnostic Model Development
2026 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70078
PMID:42309513
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研究论文 | 本研究整合多个数据集,通过生物信息学方法鉴定与复发性流产相关的代谢重编程关键生物标志物,并构建诊断模型 | 首次从代谢重编程角度系统识别复发性流产的诊断生物标志物,结合多种机器学习算法构建诊断模型,并通过单细胞测序和体外实验验证免疫-代谢互作关系 | 未提及具体局限性 | 探究复发性流产中的代谢重编程机制,鉴定诊断生物标志物并构建诊断模型 | 复发性流产患者及其蜕膜组织样本 | 机器学习 | 复发性流产 | RNA测序, 单细胞RNA测序, PCR, 蛋白质印迹, CCK-8, Transwell实验 | 逻辑回归, 支持向量机递归特征消除, 最小绝对收缩和选择算子 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | GSE26787和GSE165004数据集(具体样本数未提供),GSE214607单细胞RNA测序数据集 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 242 | 2026-06-19 |
The "Three-Tier Regulatory Network" of Orthokeratology in Myopia Control: Evidence Weight of Underlying Mechanisms, Controversies, and New Perspectives for Clinical Translation--A Review
2026, Clinical ophthalmology (Auckland, N.Z.)
DOI:10.2147/OPTH.S600353
PMID:42311277
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综述 | 本文系统综述了角膜塑形镜控制近视的机制,并提出基于证据权重的“初始驱动-中间信号整合-终端效应”三级调控网络模型 | 创新性地提出了基于证据权重的三级调控网络模型,整合了光学离焦、角膜生物力学、神经血管调节和分子信号通路等多途径协同调控机制 | 文中指出当前领域存在关键争议(如个体反应差异),但未详细讨论自身研究方法的局限性 | 系统梳理角膜塑形镜延缓近视进展的核心机制,并为临床转化和个性化治疗策略提供可行建议 | 角膜塑形镜及其控制近视的机制 | NA | 近视 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 243 | 2026-06-19 |
Metabolic reprogramming of glutamine is associated with M2 macrophage polarization in allergic rhinitis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1815245
PMID:42311656
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研究论文 | 结合人类鼻黏膜代谢组学、动物模型、单细胞转录组学和蛋白质分析,探究谷氨酰胺在过敏性鼻炎病理生理中的作用 | 首次发现谷氨酰胺与过敏性鼻炎中M2型巨噬细胞极化及FGFR1的非经典修饰相关联,提出免疫代谢调控鼻黏膜微环境的新机制 | 研究结果仅为假设生成性质,关联模型需进一步验证因果关系 | 探究代谢信号如何整合到过敏性鼻炎的免疫信号中 | 过敏性鼻炎患者鼻黏膜组织、小鼠模型、巨噬细胞 | 数字病理学 | 过敏性鼻炎 | 代谢组学分析、单细胞转录组测序、批量RNA测序、蛋白质检测 | NA | 代谢组数据、单细胞转录组数据、批量RNA测序数据 | 人类鼻黏膜样本(数量未明确)、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 244 | 2026-06-19 |
Swimming ameliorates intervertebral disc degeneration accompanied by Rpl23a downregulation and changes in its immune-inflammatory pathway
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1819987
PMID:42311670
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研究论文 | 本研究探讨了核糖体蛋白L23a在椎间盘退变中调控免疫相互作用的机制,并评估了游泳运动干预对该信号轴的影响 | 首次揭示了Rpl23a在椎间盘免疫微环境中的作用及其通过NF-κB通路介导的炎症机制,并证实游泳运动可通过下调Rpl23a改善椎间盘退变 | 未提及具体局限性 | 研究Rpl23a在椎间盘退变免疫相互作用中的机制,并评估运动干预的调控效果 | 大鼠椎间盘退变模型及体外细胞实验 | 机器学习 | 椎间盘退变 | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 两个公开数据集(GSE189551, GSE153066)及大鼠体内实验 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 245 | 2026-06-19 |
Pan-Cancer Analysis of a Depression-Related Gene Signature Identifies an Immunosuppressive Tumor Microenvironment and Links to Immunotherapy Response in Breast Cancer
2026, Breast cancer (Dove Medical Press)
DOI:10.2147/BCTT.S578930
PMID:42311838
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研究论文 | 通过泛癌分析抑郁相关基因特征,发现其与免疫抑制性肿瘤微环境及乳腺癌免疫治疗反应相关 | 首次系统探讨抑郁相关基因特征在33种癌症中的表达模式及其与肿瘤免疫微环境、免疫治疗反应的关系,并识别出CACNA1H作为重要候选基因 | 基于公共数据库的分析需进一步实验验证;抑郁相关基因特征的临床转化价值需更多前瞻性研究 | 探究抑郁相关基因特征在不同癌症中的分子和免疫相关性,特别是其与肿瘤微环境、免疫治疗反应的关系 | TCGA中33种癌症类型的超过10,000个肿瘤样本 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单样本基因集富集分析 | NA | 基因表达数据 | 超过10,000个肿瘤样本,来自33种癌症类型 | NA | NA | NA | NA |
| 246 | 2026-06-19 |
Intrinsic elaboration of prefrontal modularity: a dual-control model of axon bundling and synaptic docking
2026, Frontiers in neuroanatomy
IF:2.1Q3
DOI:10.3389/fnana.2026.1761080
PMID:42311937
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综述 | 本文综合经典神经解剖学框架与空间转录组学和连接组学的最新进展,提出了前额叶皮质模块化内在精细化的双控制模型 | 提出了前额叶皮质通过轴突束化和突触对接的双控制模型实现内在精细化的新框架,强调共享分子工具包的组合逻辑而非新基因的作用 | 主要基于经典神经解剖学数据与组学数据的整合推断,缺乏直接的实验验证该模型的具体机制 | 揭示前额叶皮质在缺乏直接感觉模板的情况下如何实现高度有序模块化架构的机制 | 前额叶皮质的模块化架构及其与视觉系统、嗅觉系统、海马体的对比分析 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学, 连接组学, 轴突束化成像 | NA | 转录组数据, 连接组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 连接组学 | NA | NA |
| 247 | 2026-06-19 |
Identification of Immune-Related Genes in Predicting the Progression of Colitis-Associated Colorectal Cancer: An Integrated Bioinformatics and Experimental Validation Study
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S588177
PMID:42312092
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研究论文 | 通过整合生物信息学和实验验证,识别与免疫相关的基因以预测结肠炎相关结直肠癌的进展 | 首次利用WGCNA、弹性网络逻辑回归和单细胞RNA测序综合分析,鉴定出与中性粒细胞和树突状细胞相关的13个关键免疫细胞相关CAC基因,并构建了20基因预后签名 | 当前研究主要依赖公共数据库和临床样本验证,尚未进行大规模前瞻性队列验证;免疫疗法反应预测基于TIDE评分,需要进一步实验验证 | 探索免疫细胞相关基因在结肠炎相关结直肠癌进展中的作用及其诊断和预后价值 | 溃疡性结肠炎和结直肠癌患者的数据集及临床样本 | 生物信息学 | 结直肠癌, 溃疡性结肠炎 | WGCNA, 弹性网络逻辑回归, 单细胞RNA测序, AUCell算法, Cox回归, LASSO回归, RT-qPCR | NA | 基因表达数据, 临床样本 | 未明确说明具体样本数量,涉及公共数据集和临床样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 248 | 2026-06-19 |
Development and functional adaptation of intestinal macrophages across the lifespan
2026, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.70111
PMID:42312249
|
综述 | 系统整合了从产前到衰老期肠道巨噬细胞的起源、功能多样性和生命周期特异性作用 | 提出了一个统一框架来理解生命周期各阶段肠道巨噬细胞的生物学,整合了谱系追踪、单细胞转录组学和功能研究的最新证据 | 未明确提及局限性 | 提供从产前发育到成年和衰老阶段肠道巨噬细胞起源、异质性和功能的全面综合 | 肠道巨噬细胞 | NA | 炎症性肠病 | 谱系追踪、单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 249 | 2026-06-18 |
Mitochondrial pyruvate metabolism in club cells drives airway inflammation
2026-01-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102742
PMID:41418787
|
研究论文 | 研究气道上皮棒细胞中线粒体丙酮酸代谢如何调控上皮分化和过敏性气道炎症 | 揭示了棒细胞中MPC2缺失通过CXCL17-CXCR4信号与肺泡巨噬细胞交互,抑制CCL17介导的2型炎症,首次阐明线粒体丙酮酸代谢在哮喘发病中的代谢-免疫串扰机制 | 主要基于小鼠OVA诱导哮喘模型,结果在人类哮喘患者中的直接验证有限 | 探究气道棒细胞中丙酮酸代谢控制上皮分化及过敏性气道炎症的机制 | 哮喘患者气道组织、Mpc2条件敲除小鼠及OVA哮喘模型 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 哮喘患者样本(数量未明确)及基因敲除小鼠 | 未明确 | 单细胞RNA测序 | 未明确 | 未明确 |
| 250 | 2026-06-18 |
An innovative in vitro system unveils IGF1R signaling regulating Merkel cell generation
2026-01-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102756
PMID:41455470
|
研究论文 | 建立创新的体外系统,揭示IGF1R信号调控默克尔细胞生成 | 首次建立短期外胚层外植体、小鼠皮肤类器官和人诱导多能干细胞来源的皮肤类器官等多种创新培养系统,并结合单细胞和空间转录组学分析及药理筛选,鉴定IGF1R为默克尔细胞形成的新调控因子 | 未提及具体局限性,但可能涉及类器官培养系统的成熟度、体内外差异及临床转化挑战 | 揭示默克尔细胞发育的调控机制,并建立可靠的体外培养系统 | 默克尔细胞、小鼠皮肤组织、人诱导多能干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学、药理筛选 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 小鼠外胚层外植体、小鼠皮肤类器官、人诱导多能干细胞来源的皮肤类器官(具体样本量未说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium |
| 251 | 2026-06-18 |
Spatial transcriptomics mapping of immune cell and TGFβ signalling pathway heterogeneity in testicular germ cell tumours
2026-01, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70100
PMID:40693358
|
研究论文 | 利用空间转录组学分析睾丸生殖细胞肿瘤中免疫细胞和TGFβ信号通路的异质性 | 首次应用空间全转录组学工作流程在组织切片级别解析TGCT中免疫细胞和TGFβ信号通路异质性,揭示GCNIS向肿瘤转变的潜在分子机制 | 样本量有限,仅来自四名患者;结果需在更大队列中验证 | 探究睾丸生殖细胞肿瘤及其前体病变的组织异质性,特别是免疫细胞组成和TGFβ信号通路的作用 | 睾丸生殖细胞肿瘤组织切片(含非精原细胞瘤和精原细胞瘤) | 数字病理学 | 睾丸生殖细胞肿瘤 | 空间转录组学 | NA | 转录本序列 | 4例患者组织样本(3例非精原细胞瘤、1例精原细胞瘤),90个以上感兴趣区域 | NanoString | 空间转录组学 | NanoString GeoMx | NanoString GeoMx空间全转录组学工作流程 |
| 252 | 2026-06-18 |
Innate Immune-Cloaked Microgel-Coated Mesenchymal Stromal Cells Reverse Persistent Pulmonary Fibrosis via Reparative Macrophages
2026-01, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202504590
PMID:40984773
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研究论文 | 本研究提出一种基于先天免疫检查点材料的策略,通过CD47自我标记激动剂功能化的柔软微凝胶涂层包裹间充质基质细胞,有效逃避组织驻留巨噬细胞的清除,并通过旁分泌机制逆转肺部持续性纤维化损伤 | 首次将先天免疫检查点材料与微凝胶涂层相结合,实现间充质基质细胞的免疫隐身,并通过单细胞RNA测序鉴定出介导修复作用的过渡性抗原呈递巨噬细胞亚群 | 未提及 | 开发一种能逃避先天免疫清除并调节宿主免疫成分的治疗策略,用于治疗慢性纤维化疾病 | 间充质基质细胞和肺部纤维化模型小鼠 | 机器学习 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 基因表达数据 | 未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于单细胞RNA测序的10x Chromium系统 |
| 253 | 2026-06-18 |
Bioinformatics Analysis of Transcriptomic Data (Bulk and scRNA-Seq) for Immuno-Oncology
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4734-9_18
PMID:41028272
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综述 | 本文综述了用于免疫肿瘤学的转录组数据(包括bulk和scRNA-Seq)的生物信息学分析方法 | 系统性地总结了大规模高通量数据(如NGS、scRNA-seq和质谱流式技术)在免疫学中的应用,涵盖免疫细胞异质性、基因表达谱和免疫受体库分析等多方面,为研究者提供全面的分析指南 | 仅为综述性介绍,缺乏具体实验验证或案例分析,且未深入讨论各方法的技术局限性和特定应用场景 | 提供用于免疫肿瘤学研究的生物信息学工具和技术的全面指南,帮助研究者进行有效的数据分析和解读 | 免疫系统中的细胞异质性、基因表达模式、免疫受体库以及多组学整合的调控网络 | 机器学习 | 肺癌 | NGS, 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 | NA | 文本 | NA | Illumina, 10x Genomics | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq, 10x Chromium | NA |
| 254 | 2026-06-18 |
Molecular and Chromatin Accessibility Programs Underlying Epithelial Injury and Impaired Regeneration in Neonatal Necrotizing Enterocolitis
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101730
PMID:41571092
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研究论文 | 该研究利用多组学框架揭示新生儿坏死性小肠结肠炎中上皮损伤和再生障碍的分子及染色质可及性程序 | 首次整合转录组、染色质可及性和空间转录组学,全面解析NEC中肠上皮损伤的机制,并发现Ezh2是维持LGR5+肠干细胞身份和再生的关键表观遗传调控因子 | 研究基于小鼠模型,结论需要人类样本验证;WNT信号再激活的治疗策略尚未在体内验证其长期效果和安全性 | 阐明新生儿坏死性小肠结肠炎中上皮再生缺陷的分子机制,识别治疗靶点以恢复上皮再生 | 新生小鼠NEC模型及肠道组织,包括肠上皮干细胞、过渡扩增细胞和肠内分泌细胞等细胞类型 | 数字病理学 | 新生儿坏死性小肠结肠炎 | bulk RNA-seq, snRNA-seq, snATAC-seq, MERFISH | NA | 转录组、染色质可及性、空间转录组数据 | 新生小鼠NEC模型组与对照组,每组样本数量文中未明确说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 255 | 2026-06-18 |
Analysis of immune and autophagy-related genes and their regulatory mechanisms in osteoporosis patients post-menopause
2026, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2026.1783374
PMID:42305270
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研究论文 | 分析绝经后骨质疏松症中免疫和自噬相关基因及其调控机制,并构建诊断模型 | 首次整合免疫和自噬相关差异表达基因,基于CDK2、DDIT3和MAPK3个核心基因构建并验证了高预测准确度(AUC=0.91)的诊断模型,并通过单细胞RNA测序和假时间分析揭示了基因在骨髓间充质干细胞分化过程中的动态表达 | 研究基于公开数据库和动物模型,需要更多临床样本验证;核心基因的功能机制尚需进一步实验验证 | 识别绝经后骨质疏松症中连接免疫细胞和自噬的关键基因,并构建诊断模型 | 绝经后骨质疏松症患者 | 机器学习 | 骨质疏松症 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | 公共数据库数据及卵巢切除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 256 | 2026-06-18 |
Identification of potential drug target genes for atopic dermatitis leveraging Mendelian randomization, single-cell transcriptomics, and spatial transcriptomics
2026, Archives of medical science : AMS
IF:3.0Q1
DOI:10.5114/aoms/208855
PMID:42305302
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研究论文 | 通过整合孟德尔随机化、单细胞转录组学和空间转录组学,识别特应性皮炎的潜在药物靶点基因 | 首次结合孟德尔随机化、共定位分析、单细胞RNA测序和空间转录组数据,系统筛选特应性皮炎的潜在药物靶点基因 | 未提供明确的局限性信息 | 识别特应性皮炎的潜在药物靶点基因 | 特应性皮炎患者及对照组的遗传数据、单细胞转录组和空间转录组数据 | 机器学习和基因组学 | 特应性皮炎 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、遗传变异数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | GWAS数据集:病例22,474例,对照774,187例;独立验证队列:病例10,788例,对照30,047例 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 257 | 2026-06-18 |
CD4/CD8 ratio is associated with structural reorganization of vaccine-induced immune responses in people living with HIV
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1821444
PMID:42305530
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研究论文 | 单细胞RNA测序分析揭示CD4/CD8比值与HIV感染者疫苗诱导免疫反应的结构重组相关 | 首次通过单细胞RNA测序与配对TCR分析,结合蛋白互作网络拓扑结构,揭示CD4/CD8比值定义的不同免疫状态下疫苗诱导免疫反应的网络级组织差异 | 未提及具体限制 | 探究HIV感染者中CD4/CD8比值如何影响疫苗诱导的免疫反应及其分子机制 | HIV感染者与健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞生物学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序、配对TCR分析、蛋白互作网络分析、Bulk BCR分析 | NA | 单细胞转录组数据、TCR/BCR序列数据 | HIV感染者和健康对照者外周血单个核细胞样本,共采集两次(首次和第二次mRNA疫苗后) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 258 | 2026-06-18 |
A machine learning integrated multi-omics framework for risk prediction and target discovery in insomnia aggravated sepsis induced acute lung injury
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1721749
PMID:42305536
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研究论文 | 该研究通过整合多组学数据和机器学习方法,揭示了失眠加剧败血症诱导急性肺损伤的关键生物标志物PTPN6及其潜在机制 | 首次将失眠与败血症诱导的急性肺损伤关联起来,利用孟德尔随机化确立因果关系,并通过机器学习(随机森林、SVM、KNN)结合SHAP可解释性建模识别核心基因PTPN6,发现其通过调节巨噬细胞极化和JAK/STAT3信号通路发挥抑制作用 | 需要进一步的机制研究和全面临床验证以完全阐明涉及的复杂调控网络 | 识别失眠加剧败血症诱导急性肺损伤的关键生物标志物并阐明其分子机制 | 失眠与败血症诱导急性肺损伤的因果关系及分子通路 | 机器学习 | 急性肺损伤 | 孟德尔随机化、加权基因共表达网络分析、单细胞RNA测序 | 随机森林、SVM、KNN | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型(LPS诱导的SALI模型) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 259 | 2026-06-18 |
Irofulven and RSL3 synergistically target ferroptosis-related gene PTGR1 to treat head and neck squamous cell carcinoma
2026-Jan, Open life sciences
IF:1.7Q3
DOI:10.1515/biol-2025-1332
PMID:42306048
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研究论文 | 研究铁死亡相关基因PTGR1在头颈部鳞状细胞癌中的作用,并发现Irofulven与RSL3的协同治疗策略 | 首次构建基于铁死亡相关基因的预后模型,并结合单细胞RNA测序分析肿瘤分类风险评分,发现Irofulven靶向PTGR1并与铁死亡诱导剂RSL3协同治疗HNSCC | 基于数据库分析和体外实验,未进行体内验证或大规模临床试验 | 评估铁死亡作为HNSCC生物标志物和治疗靶点的潜力,开发联合治疗策略 | 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)细胞系和数据库样本 | 机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO回归模型 | 基因表达数据、DNA甲基化数据、突变数据、单细胞转录组数据 | 来自公共数据库的HNSCC样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 260 | 2026-06-18 |
Pathogenic mechanisms of RPGR mutations in X-linked retinitis pigmentosa: integrating clinical pedigree and single-cell transcriptomics
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1814462
PMID:42306097
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研究论文 | 通过整合临床家系分析和单细胞转录组学,阐明RPGR突变导致X连锁视网膜色素变性的致病机制 | 首次将临床家系与单细胞转录组分析相结合,揭示RPGR功能缺失突变通过破坏纤毛运输-光转导轴、激活应激反应并阻滞光感受器分化而致病的分子机制 | 单细胞转录组数据来源于视网膜类器官模型,可能无法完全模拟体内真实病理过程 | 鉴定X连锁视网膜色素变性中的RPGR致病突变并阐明光感受器变性的细胞与分子机制 | 中国X连锁视网膜色素变性家系三代成员及RPGR突变视网膜类器官 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | 全外显子测序, 桑格测序, 单细胞RNA测序 | 无特定模型 | 测序数据 | 一个中国XLRP家系共三代成员 | 无明确信息 | 单细胞RNA测序 | 无明确信息 | 无明确信息 |