本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-02-05 |
Preventing surgery-induced natural killer cell suppression and metastases by inhibiting PI3K-gamma signaling in myeloid-derived suppressor cells
2026-Jan-29, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013304
PMID:41611243
|
研究论文 | 本研究探讨了手术诱导的髓源性抑制细胞(sx-MDSCs)通过PI3K-γ信号通路抑制自然杀伤细胞活性并促进术后转移的机制,并提出了PI3K-γ抑制剂作为潜在治疗策略 | 首次通过单细胞RNA测序和功能筛选,揭示了手术诱导的MDSCs中PI3K-γ信号通路的激活及其在术后免疫抑制和转移中的关键作用,并验证了PI3K-γ抑制剂在临床前模型中的治疗效果 | 研究样本量有限(n=55),且临床前模型结果需进一步在更大规模临床试验中验证 | 旨在功能表征手术诱导的MDSCs,并探索减轻其免疫抑制作用的潜在治疗策略 | 癌症患者(n=55)的手术样本和临床前小鼠模型 | 数字病理学 | 癌症 | 多色流式细胞术, 单细胞RNA测序, 小分子筛选 | NA | 细胞表型数据, 基因表达数据 | 55名癌症患者的手术样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 222 | 2026-02-05 |
Tumor-derived ITIH2 activates PI3K\AKT pathway via THBS1 ubiquitination and promotes tumor angiogenesis in hepatocellular carcinoma
2026-Jan-28, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2026.168175
PMID:41616982
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析识别了肝细胞癌中的关键细胞类型,并发现ITIH2作为一种新的预后生物标志物,通过泛素化依赖的THBS1调控激活PI3K/AKT通路,从而促进肿瘤血管生成和肝细胞癌进展 | 首次将ITIH2识别为肝细胞癌中与血管生成相关的新型预后生物标志物,并揭示了其通过泛素化调控THBS1稳定性来激活PI3K/AKT通路促进肿瘤血管生成的分子机制 | 研究仅基于两名患者的单细胞RNA测序数据,样本量较小;功能实验主要在体外和动物模型中进行,临床验证有限 | 探究肝细胞癌中肿瘤微环境与血管生成之间的相互作用机制,并识别新的预后生物标志物 | 肝细胞癌患者样本、肿瘤血管内皮细胞、ITIH2和THBS1蛋白 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化染色、集落形成实验、CCK-8实验、流式细胞术、泛素化分析 | LASSO回归、多变量Cox回归、风险评分系统、列线图 | 单细胞RNA测序数据、临床样本数据、蛋白质表达数据 | 两名肝细胞癌患者的单细胞RNA测序数据(GSE166635),TCGA和ICGC数据集作为训练和验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 223 | 2026-02-05 |
A protective role of ECSIT in chemotherapy-induced intestinal mucositis by maintaining Lgr5+ intestinal stem cells and gut homeostasis
2026-Jan-27, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2026.124236
PMID:41611204
|
研究论文 | 本研究阐明了ECSIT在化疗诱导的肠黏膜炎中通过Wnt/β-catenin通路维持Lgr5+肠道干细胞和肠道稳态的保护作用 | 首次揭示了ECSIT通过稳定β-catenin复合体调控Wnt信号通路,从而维持Lgr5+肠道干细胞平衡和肠道免疫稳态的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本分析有限,且具体分子机制如ECSIT如何精确稳定β-catenin复合体仍需进一步探索 | 阐明ECSIT在化疗诱导的肠黏膜炎中对肠道干细胞平衡和黏膜修复的调控作用 | 肠道上皮细胞、Lgr5+肠道干细胞、肠道特异性基因敲除小鼠模型 | 分子生物学与干细胞研究 | 化疗诱导的肠黏膜炎 | 多组学分析、基因编辑、单细胞RNA测序、基因集富集分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据、病理学数据 | 未明确具体样本数量,涉及小鼠模型和临床样本分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 224 | 2026-02-05 |
Cellular and molecular mechanisms of nasolacrimal duct obstruction: New insights into CD4+ T cell-MIF-fibroblast pathways
2026-Jan-27, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.01.060
PMID:41611124
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了鼻泪管阻塞(NLDO)的细胞转录组图谱,并阐明了以巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)为中心的CD4+ T细胞-成纤维细胞通路在纤维化过程中的关键作用 | 首次在NLDO中应用单细胞RNA测序技术,识别了CD4+ T细胞通过MIF激活成纤维细胞并形成自持性反馈循环的新机制 | 样本量较小(4例用于单细胞测序,13例用于功能验证),且仅针对绝经后女性患者,可能限制结果的普适性 | 阐明鼻泪管阻塞的免疫调控机制,特别是纤维化过程的细胞和分子基础 | 鼻泪管阻塞患者的鼻泪管组织、体液样本 | 数字病理学 | 鼻泪管阻塞 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4例患者用于单细胞RNA测序(67,658个细胞),13例患者用于组织学和体外功能实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 225 | 2026-02-05 |
POSTN⁺ cancer-associated fibroblast-CCL3⁺ macrophage crosstalk defines the immune-excluded tumor microenvironment in clear cell renal cell carcinoma
2026-Jan-23, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102682
PMID:41579565
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组和批量转录组数据,揭示了透明细胞肾细胞癌中POSTN⁺癌症相关成纤维细胞与CCL3⁺巨噬细胞之间的相互作用,定义了驱动免疫排斥和免疫治疗抵抗的基质-免疫信号轴 | 首次在ccRCC中系统识别了七种成纤维细胞亚型,并发现POSTN⁺ CAFs通过GATA6调控向ECM重塑表型分化,与CCL3⁺巨噬细胞在侵袭前沿共定位形成免疫排斥微环境 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;空间共定位分析可能受限于分辨率;临床队列样本量有限,需要进一步实验验证机制 | 阐明透明细胞肾细胞癌免疫排斥肿瘤微环境的基质-免疫相互作用机制 | 透明细胞肾细胞癌的肿瘤微环境,特别是成纤维细胞亚型和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组分析 | CellChat, NicheNet, SpaGene | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据 | 整合了8个单细胞RNA测序数据集、2个空间转录组数据集及多个批量转录组队列(包括TCGA-KIRC和ICB治疗队列) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 226 | 2026-02-05 |
Developmental single-cell atlas of coronary vessel growth and cardiomyocyte interaction in zebrafish
2026-Jan-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205065
PMID:41531417
|
研究论文 | 本研究结合高分辨率成像与单细胞RNA测序技术,系统描绘了斑马鱼冠状动脉血管发育的细胞与分子图谱,揭示了血管与心肌细胞相互作用的动态过程 | 首次构建斑马鱼冠状动脉发育的单细胞时空图谱,定义了四个发育阶段里程碑,并发现血管支架引导心肌细胞生长的新机制 | 研究局限于斑马鱼模型,哺乳动物冠状动脉发育可能存在物种特异性差异 | 解析冠状动脉血管发育的细胞分子机制及其与心肌细胞生长的协同关系 | 斑马鱼心脏发育过程中的冠状动脉血管网络与心室细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、高分辨率成像、遗传操作技术 | NA | 单细胞转录组数据、显微图像数据 | 37,554个心室细胞,涵盖7-30mm体长范围的发育阶段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 227 | 2026-02-05 |
Leveraging AI for cell biology discovery
2026-Jan-08, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253023
PMID:41502213
|
综述 | 本文综述了人工智能在细胞生物学中的多样化应用及其对显微镜、成像、药物发现和合成生物学等领域的影响 | 系统性地探讨了AI在单细胞分辨率图像分析、复杂生物数据模式识别、细胞行为建模以及蛋白质结构预测等方面的创新应用,并强调了AI工具民主化的未来方向 | NA | 探索人工智能在细胞生物学中的变革性作用及其对基础研究和治疗应用的潜在推动 | 细胞生物学中的复杂生物数据,包括细胞图像、单细胞转录组学数据、蛋白质结构和细胞行为 | 机器学习 | NA | 深度学习 | NA | 图像、生物数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 228 | 2026-02-05 |
S2potAE: multimodal spatial spot autoencoder integrating image and transcriptomic features for deconvolution
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag020
PMID:41619214
|
研究论文 | 本文提出了一种名为S2potAE的多模态空间点自编码器框架,通过整合基因表达数据、空间坐标和组织学图像的形态特征,用于精确的空间转录组学点水平反卷积 | S2potAE创新性地采用多级特征聚合策略,结合基于图的空间编码器和组织学图像的感知嵌入,并引入辅助病理分类任务以增强生物相关性和模型可解释性 | NA | 解决空间转录组学中由于粒度差异、批次效应和空间异质性导致的细胞类型比例准确确定难题 | 人类乳腺癌、小鼠大脑前部和人类背外侧前额叶皮层的模拟与真实数据集 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 自编码器 | 基因表达数据、空间坐标、组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 229 | 2026-02-05 |
Advances and challenges in single-cell RNA sequencing data analysis: a comprehensive review
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf723
PMID:41619215
|
综述 | 本文全面回顾了单细胞RNA测序数据分析的进展与挑战,包括预处理、注释工具和多模态整合等计算策略 | 综述了新兴的计算策略,如SCTransform和Harmony用于预处理与批次整合,基于transformer的注释工具scGPT和CellTypist,以及多模态整合方法,并提出了促进临床应用的路线图 | 临床转化仍受数据稀疏性、批次效应和缺乏标准化基准等挑战限制,且存在罕见患者来源克隆再识别的伦理风险 | 回顾单细胞RNA测序数据分析的进展与挑战,并促进其临床转化 | 单细胞RNA测序数据及其分析计算策略 | 自然语言处理 | 胶质母细胞瘤, 严重COVID-19 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞ATAC测序 | transformer, scGPT, CellTypist, scANVI | 基因表达数据, 空间转录组数据, 表观遗传数据 | 超过100,000个细胞的队列, 预训练模型使用3,300万个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞ATAC测序 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 230 | 2026-01-07 |
Unveiling the TBX2-driven molecular landscape of large and giant congenital melanocytic naevi: from single-cell sequencing to targeted therapy
2026-Jan-06, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf415
PMID:41126440
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 231 | 2026-02-05 |
Single-cell analysis identifies BASP1 as a driver of drug resistance and cell plasticity in oral squamous cell carcinoma
2026-Jan-06, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.111126
PMID:41506484
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了BASP1基因在口腔鳞状细胞癌顺铂耐药性和细胞可塑性中的关键驱动作用 | 首次在单细胞水平上识别出BASP1是口腔鳞状细胞癌顺铂耐药性和上皮-间质转化的关键调控因子,并阐明了其通过调控LIN7A表达和抑制microRNA hsa-mir-501-3p诱导β-catenin介导EMT的分子机制 | 研究主要基于细胞系模型,缺乏体内实验和临床样本的验证 | 探究口腔鳞状细胞癌顺铂耐药性的分子机制,并寻找克服耐药性的潜在治疗靶点 | 人类口腔鳞状细胞癌细胞系(包括顺铂敏感型、早期耐药型和晚期耐药型) | 单细胞组学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种不同耐药表型的口腔鳞状细胞癌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 232 | 2026-02-05 |
Advancing single-cell omics and cell-based therapeutics with quantum computing
2026-Jan-02, Nature reviews. Molecular cell biology
DOI:10.1038/s41580-025-00918-0
PMID:41478876
|
路线图文章 | 本文探讨了量子计算如何与单细胞组学技术结合,以克服计算瓶颈并推动细胞行为建模和细胞疗法的发展 | 提出了量子计算作为新型计算范式,用于解决单细胞分析中的计算挑战,并展示了其在细胞疗法中的潜在应用案例 | NA | 探索量子计算在单细胞组学和细胞疗法中的整合潜力,以生成变革性的细胞行为模型 | 单细胞和空间转录组学、多组学技术以及细胞群体 | 机器学习和计算生物学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学、多组学技术 | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 233 | 2026-02-05 |
AugGCL: Multimodal graph learning for spatial transcriptomics analysis with enhanced gene and morphological data
2026-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013912
PMID:41576146
|
研究论文 | 本文提出了一种名为AugGCL的增强图卷积学习框架,用于空间转录组学分析,通过增强基因和形态学数据来改善空间结构解码和基因表达重建 | AugGCL引入了邻域信息聚合机制,整合表达相似性和空间邻近性构建加权图和增强表达矩阵,同时采用双流加权图卷积网络联合建模基因特征和图像衍生形态信息,增强弱空间信号并锐化边界 | NA | 旨在解决空间转录组学中表达稀疏性、复杂组织结构和弱空间信号等挑战,以重建解剖学准确的空间域 | 人类背外侧前额叶皮层、乳腺癌和小鼠胚胎数据集 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 图卷积网络(GCN) | 基因表达数据和图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 234 | 2026-02-05 |
Single-cell multi-omics sequencing reveals the immunological disturbance underlying Kawasaki disease
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1758948
PMID:41623592
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术,揭示了川崎病中免疫细胞群的异质性及其潜在的免疫失调机制 | 首次在单细胞水平上整合多组学数据(scRNA-seq和scATAC-seq)系统描绘川崎病的免疫细胞异质性和染色质可及性变化,并识别出与静脉注射免疫球蛋白耐药相关的特定NK细胞亚群 | 样本量较小(仅2名川崎病患儿和2名健康对照),且为横断面研究,无法评估疾病进程中的动态变化 | 阐明川崎病的免疫失调细胞异质性和调控机制 | 川崎病患儿和健康对照儿童的外周血单个核细胞 | 单细胞多组学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据,单细胞染色质可及性数据 | 4例样本(2名川崎病患儿,2名年龄匹配的健康对照儿童) | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq,单细胞多组学 | NA | NA |
| 235 | 2026-02-05 |
Hypoxia-Induced Osteopontin-Positive Glioma-Associated Macrophages Facilitate Glioma Mesenchymal Transition via NF-κB Pathway Activation
2026, Cancer communications (London, England)
DOI:10.34133/cancomm.0007
PMID:41625475
|
研究论文 | 本研究揭示了缺氧诱导的骨桥蛋白阳性胶质瘤相关巨噬细胞通过NF-κB通路促进胶质母细胞瘤间质转化的机制 | 首次发现缺氧通过H3K4me3-WDR5表观遗传轴诱导巨噬细胞表达骨桥蛋白,并阐明这些OPN阳性GAMs通过分泌OPN激活CD44/NF-κB/PD-L1通路促进胶质瘤间质转化 | 研究主要基于体外和动物模型,临床样本验证相对有限,且未深入探讨其他缺氧相关因子在GAMs调控中的作用 | 阐明缺氧条件下胶质瘤相关巨噬细胞促进胶质母细胞瘤进展的分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞、胶质瘤相关巨噬细胞、临床胶质瘤样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组分析、染色质免疫沉淀、实时定量PCR、Western印迹、免疫荧光 | NA | RNA测序数据、空间转录组数据、蛋白质印迹数据、免疫荧光图像 | 未明确说明具体样本数量,但包含临床样本和体内模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 236 | 2026-02-05 |
The Ly6ghigh Neutrophil Subset Dictates Breast Cancer Lung Metastasis via CD8+ T Cell Death
2026, Cancer communications (London, England)
DOI:10.34133/cancomm.0003
PMID:41625479
|
研究论文 | 本文揭示了Ly6g高表达中性粒细胞亚群通过NETs诱导CD8+ T细胞凋亡,从而促进乳腺癌肺转移的机制 | 首次发现Ly6ghigh中性粒细胞通过NETs中的cathelicidin直接结合CD8+ T细胞的线粒体蛋白Ant1,触发线粒体通透性转换孔开放,导致细胞凋亡 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证有限;机制细节如cathelicidin与Ant1结合的具体结构域尚未完全阐明 | 探究乳腺癌肺转移微环境中中性粒细胞与CD8+ T细胞的相互作用机制 | 小鼠乳腺癌肺转移模型中的中性粒细胞亚群和CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、多重免疫荧光、蛋白质结合实验 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、免疫荧光图像、蛋白质互作数据 | 小鼠肺组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 237 | 2026-02-05 |
CXCL8/SDC1 axis mediates tumor stem cell interactions to drive remote transfer in thyroid cancer
2026-Jan, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2025.101354
PMID:41626563
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组测序,揭示了CXCL8/SDC1轴通过激活JAK-STAT信号通路驱动甲状腺癌干细胞自我更新和远处转移的分子机制 | 首次在甲状腺癌中利用单细胞和空间转录组测序技术,结合功能实验和动物模型,系统阐明了CXCL8/SDC1轴介导肿瘤干细胞与单细胞互作网络促进远处转移的新机制 | 研究主要基于体外细胞系和动物模型,临床样本验证的队列规模未明确说明,且缺乏对CXCL8/SDC1轴靶向治疗的深入药效学评估 | 探究甲状腺癌远处转移的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 甲状腺癌患者肿瘤样本、FTC-238细胞系、裸鼠模型 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组测序、肿瘤组织转录组分析、ELISA、Western blotting、球体形成实验、集落形成实验、CCK-8实验、Transwell实验 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、批量转录组数据、临床数据 | 甲状腺癌患者肿瘤样本(具体数量未明确)、FTC-238细胞系、裸鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 238 | 2026-02-05 |
IER3 Promotes Malignant Progression of Colorectal Cancer Through the NF-κB Pathway
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/8379666
PMID:41626627
|
研究论文 | 本研究揭示了应激反应基因IER3通过激活NF-κB通路,驱动结直肠癌恶性进展并重塑免疫抑制性肿瘤免疫微环境 | 首次在单细胞分辨率上鉴定出与侵袭性疾病和不良预后相关的IER3表达恶性亚群,并阐明IER3通过FN1-CD44轴重塑免疫微环境的机制 | 未明确IER3表达调控的具体上游机制,临床样本量可能有限,动物模型验证需进一步扩展 | 探究IER3在结直肠癌发病机制和免疫调节中的功能作用 | 结直肠癌临床样本及体外/体内模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 临床样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 239 | 2026-02-05 |
Construction of a Mitochondria-Related Gene Diagnostic Model Based on Integrated Multiomics Data and Functional Validation of ANK2 as a Key Regulator in Colorectal Cancer
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/9306920
PMID:41626625
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,构建了一个基于线粒体相关基因的结直肠癌诊断模型,并验证了ANK2作为关键调控因子的功能 | 整合TCGA和多个GEO公共数据集的转录组数据与MitoCarta3.0数据库的线粒体相关基因数据,利用LASSO回归和SVM-RFE两种机器学习算法识别关键基因并构建诊断模型,并结合单细胞RNA测序数据和分子生物学实验进行功能验证 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床队列进一步验证模型的诊断效能 | 开发一种基于线粒体相关基因的新型、高效的结直肠癌分子诊断方法 | 结直肠癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组测序,单细胞RNA测序,qRT-PCR,Western blotting,免疫组化 | LASSO回归,SVM-RFE | 基因表达数据,单细胞数据 | 1174个样本(来自TCGA和GEO数据集:GSE21510,GSE44076,GSE9348),以及单细胞数据集GSE245552 | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 240 | 2026-02-05 |
Multi-Omics Evidence Based on Spatial Transcriptomics Data Reveals the Therapeutic Value of Copper Death Genes in Glioblastoma
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/6453352
PMID:41626626
|
研究论文 | 本研究基于空间转录组学数据,通过多组学分析揭示了铜死亡基因在胶质母细胞瘤中的治疗价值 | 首次构建了基于铜死亡相关microRNAs的预后特征模型,并验证其在低级别胶质瘤预后预测和免疫治疗评估中的新框架 | 研究主要依赖于TCGA和CGGA等公共数据库数据,需要进一步实验验证临床适用性 | 探索铜死亡相关基因在胶质瘤预后预测和免疫治疗评估中的价值 | 低级别胶质瘤患者和胶质母细胞瘤细胞 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 空间转录组学,多组学分析,单变量Cox回归,Lasso回归,多变量Cox回归,Kaplan-Meier生存分析,基因集富集分析,基因集变异分析 | 预后特征模型 | 转录组数据,临床数据,突变数据 | TCGA数据库和CGGA外部验证队列的低级别胶质瘤患者样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |