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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-03-07 |
Decoding the role of RPL38 in lung adenocarcinoma: a multi-omics approach
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1778481
PMID:41766901
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研究论文 | 本研究通过多组学方法解码RPL38在肺腺癌中的作用,揭示其作为肿瘤促进因子的功能 | 首次整合机器学习、空间转录组学和功能实验,系统评估RPL38在肺腺癌中的预后价值和生物学功能 | 研究主要基于TCGA队列数据,缺乏外部独立验证队列 | 阐明RPL38在肺腺癌发生发展中的作用及其临床意义 | 肺腺癌患者数据、肺腺癌细胞系和皮下移植瘤模型 | 机器学习 | 肺腺癌 | 机器学习、空间转录组学、CCK-8、集落形成、伤口愈合、Transwell实验 | 风险预测模型 | 基因表达数据、空间转录组数据、实验数据 | TCGA-LUAD队列患者数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 222 | 2026-03-07 |
Increased secreted PLA2 in epithelial cells promotes the progression of chronic non-atrophic gastritis to chronic atrophic gastritis through the TGF-β signaling
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0343531
PMID:41779702
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研究论文 | 本研究探讨了上皮细胞中分泌型磷脂酶A2(PLA2G10)通过TGF-β信号通路促进慢性非萎缩性胃炎向慢性萎缩性胃炎进展的机制 | 首次揭示了PLA2G10在慢性胃炎进展中的关键作用,并明确了其通过TGF-β信号通路介导的分子机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,需要进一步临床样本验证;未涉及PLA2G10与其他信号通路的交叉作用 | 探究PLA2G10是否通过TGF-β信号通路促进慢性非萎缩性胃炎向慢性萎缩性胃炎的进展 | SD大鼠慢性胃炎模型、人胃黏膜上皮细胞(GES-1) | 生物信息学与分子生物学 | 胃炎 | RNA微阵列、单细胞RNA测序、生物信息学分析、体内外实验验证 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量,使用SD大鼠模型和GES-1细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 223 | 2026-03-07 |
Mass spectrometry-based multi-omics analysis elucidates immune microenvironmental characteristics and the risk of distant metastasis in N1c colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1590042
PMID:41782869
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研究论文 | 本研究通过质谱和多组学分析揭示了N1c结直肠癌的免疫微环境特征及其与远处转移风险的关系 | 首次利用数据非依赖性采集质谱分析N1c结直肠癌的蛋白质表达谱,结合机器学习识别了10个与肿瘤沉积相关的转移基因,并通过单细胞RNA测序明确了PLOD1在成纤维细胞中的高表达及其在细胞迁移和侵袭中的作用 | 样本量较小(仅13例患者),且研究基于回顾性队列,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 阐明N1c结直肠癌的生物学特征、免疫微环境及远处转移模式,以优化分期系统和精准治疗策略 | 13例T1-T4N1cM1结直肠癌患者的福尔马林固定石蜡包埋样本,以及多队列验证中的1,582例结直肠癌患者数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 数据非依赖性采集质谱,单细胞RNA测序,免疫组织化学染色,Masson三色染色,伤口愈合实验,Transwell实验 | 机器学习算法(9种) | 蛋白质组数据,单细胞RNA测序数据,临床数据,图像数据 | 13例N1c结直肠癌患者样本,多队列验证包括1,582例结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 224 | 2026-03-07 |
Dynamic activation and dual roles of SOX9+ hepatocytes in liver regeneration under acute and chronic injury by single-cell transcriptomics
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1743286
PMID:41788307
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学,系统性地描述了SOX9+肝细胞在急性和慢性肝损伤中的动态激活和双重作用 | 首次系统性地揭示了SOX9+肝细胞在急性和慢性肝损伤中的动态激活模式及其在再生和纤维化中的双重作用 | 研究主要基于公开数据集,缺乏实验验证,且样本来源有限 | 探究SOX9+肝细胞在急性和慢性肝损伤中的动态激活和功能角色 | 小鼠肝损伤模型(部分肝切除术和乙酰氨基酚诱导的急性肝损伤)以及人类非酒精性脂肪肝病组织 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 225 | 2026-03-07 |
Integrative multi-omics analysis reveals cellular and molecular insights into gestational diabetes mellitus
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1706588
PMID:41788625
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,揭示了妊娠期糖尿病(GDM)的细胞和分子机制,并识别了潜在的生物标志物和治疗靶点 | 首次结合基因组学、转录组学和单细胞RNA测序数据,利用孟德尔随机化(MR)优先筛选与GDM有因果关联的基因,并通过qPCR在胎盘样本中进行验证 | 需要进一步研究以阐明这些基因的具体作用机制,并开发针对性的治疗方法 | 揭示GDM的分子基础并探索潜在的治疗靶点 | 妊娠期糖尿病(GDM)患者及对照组的胎盘样本 | 多组学分析 | 妊娠期糖尿病 | 基因组学、转录组学、单细胞RNA测序、孟德尔随机化(MR)、定量PCR(qPCR) | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,但涉及人类和小鼠胎盘样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 226 | 2026-03-07 |
Unveiling prognostic genes and regulatory mechanisms of stress granules in gastric cancers: an integrated analysis of bulk transcriptomics and single-cell RNA sequencing
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1750088
PMID:41789004
|
研究论文 | 本研究通过整合批量转录组学和单细胞RNA测序数据,揭示了应激颗粒相关基因在胃癌中的预后价值,并构建了一个预测模型 | 首次整合批量转录组学和单细胞RNA测序数据,系统性地识别了胃癌中与应激颗粒相关的预后基因,并构建了具有临床潜力的风险评分模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证,且分子机制尚未通过实验完全阐明 | 识别胃癌中与应激颗粒相关的预后基因,阐明其临床和生物学意义,并验证其作为患者总体生存预测指标的潜力 | 胃癌患者及其转录组和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,批量转录组学分析 | Cox回归风险评分模型 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,数据来源于公共数据库 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 227 | 2026-03-07 |
Multi-dimensional evidence establishing the causal association between metabolic syndrome and gout and the molecular mechanisms of comorbidity
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1769138
PMID:41789074
|
研究论文 | 本研究通过多维方法系统评估了代谢综合征及其组分与痛风的因果关系,并揭示了共病的遗传基础和转录组特征 | 采用三阶段研究设计整合临床队列、孟德尔随机化和转录组数据,首次系统建立了代谢综合征与痛风的因果关联,并提出了TAP2-UPR-Th17病理轴 | 研究主要基于观察性数据和遗传学证据,需要进一步实验验证分子机制 | 评估代谢综合征与痛风的因果关系并揭示其分子机制 | 代谢综合征患者和痛风患者 | 生物信息学 | 痛风 | 单细胞RNA测序,转录组分析,孟德尔随机化 | 倾向评分匹配,限制性立方样条,潜在类别轨迹模型 | 临床数据,遗传数据,转录组数据 | 临床队列8,853例,转录组数据集GSE160170、GSE98895,单细胞RNA测序数据集GSE217561 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 228 | 2026-03-07 |
Bronchoalveolar lavage fluid in immune checkpoint inhibitor-related pneumonitis: from pathophysiological window to a precision diagnostic tool
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1788186
PMID:41789086
|
综述 | 本文探讨了支气管肺泡灌洗液在免疫检查点抑制剂相关肺炎中的诊断价值,从病理生理窗口到精准诊断工具 | 提出将BALF分析整合到人工智能框架中以提升诊断精度和指导个性化治疗 | 缺乏标准化的采样和解读方法限制了结果的可重复性和BALF分析在临床实践中的广泛应用 | 改善免疫检查点抑制剂相关肺炎的临床管理,通过理解其生物学基础 | 支气管肺泡灌洗液 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞学、分子和多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 229 | 2026-03-07 |
ScRNA-seq reveals dynamic macrophage heterogeneity in chronic liver disease progression and prognostic biomarkers KLF2/SPP1 in HCC
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1766301
PMID:41789089
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,揭示了慢性肝病进展中巨噬细胞的动态异质性,并鉴定出KLF2和SPP1作为肝细胞癌的预后生物标志物 | 构建了阶段解析的细胞图谱,识别了MASH和HCC中特定的巨噬细胞亚型及其转录特征,并开发了基因集富集评分方法来检测预后标志物 | 未直接证明SPP1+巨噬细胞对细胞毒性T细胞的功能抑制或耗竭作用 | 解析慢性肝病过程中的阶段特异性免疫和转录特征,并鉴定预后生物标志物 | 健康肝脏、代谢功能障碍相关脂肪性肝炎、肝硬化和肝细胞癌的单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, RNA荧光原位杂交 | NA | 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | 整合了健康肝脏、MASH、肝硬化和HCC的单细胞RNA测序数据集,以及TCGA-LIHC临床数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 230 | 2026-03-07 |
Identification of MTURN as a trained immunity-related biomarker for heart failure via integrative transcriptomic machine learning analysis and experimental validation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1739660
PMID:41789108
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学数据和机器学习算法,识别出MTURN作为与训练免疫相关的心力衰竭生物标志物,并通过实验验证了其与PIEZO1介导的心脏重构的潜在关联 | 首次将训练免疫概念与心力衰竭生物标志物发现相结合,并利用多队列转录组数据整合、机器学习筛选及单细胞RNA-seq分析,系统性地鉴定出MTURN这一新型生物标志物 | 研究主要基于转录组数据,功能机制验证仍需进一步深入;临床样本的异质性可能影响结果的普适性 | 发现可靠的心力衰竭分子生物标志物以促进个性化治疗 | 心力衰竭患者转录组数据、THP-1来源的巨噬细胞训练免疫模型、AC16心肌细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 六种机器学习算法(未具体说明) | 转录组数据 | 五个独立的心力衰竭队列和一个巨噬细胞训练免疫模型数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 231 | 2026-03-06 |
Large-scale single-cell analysis and in silico perturbation reveal dynamic evolution of HCC: from initiation to therapeutic targeting
2026-Jan-30, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01307-2
PMID:41617928
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和空间分析数据,系统解析了肝细胞癌(HCC)从起始到治疗靶向的动态演化过程,揭示了肿瘤内异质性、微环境生态系统及潜在治疗靶点 | 整合跨正常肝组织、原发肿瘤、门静脉癌栓和转移淋巴结的单细胞转录组与空间分析,首次系统描绘HCC进展的细胞生态系统;识别了四种具有不同临床轨迹和治疗脆弱性的恶性肝细胞转录元程序;通过空间映射揭示了基质结构与恶性表型的空间关联;利用Geneformer虚拟敲除筛选鉴定出HSP90B1作为关键依赖性靶点 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质组或表观遗传层面的验证;虚拟筛选结果需进一步实验验证;样本来源和数量可能限制某些亚群的普适性 | 系统解析肝细胞癌(HCC)的肿瘤内异质性和微环境动态演化,识别驱动疾病进展的关键细胞状态和潜在治疗靶点 | 肝细胞癌(HCC)患者样本,包括正常肝组织、原发肿瘤、门静脉癌栓(PVTT)和转移淋巴结(MLN) | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组分析,虚拟敲除筛选 | Geneformer | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 大规模单细胞样本(具体数量未明确说明),涵盖正常肝、原发肿瘤、PVTT和MLN | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 232 | 2026-03-06 |
Mitochondrial complex I subunit NDUFS4 overexpression drives glioma progression by regulating mitochondrial function and COX5B
2026-Jan-30, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01281-9
PMID:41617910
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研究论文 | 本研究探讨了线粒体蛋白NDUFS4在胶质瘤细胞中的表达、功能意义及潜在机制 | 首次通过单细胞RNA测序定位NDUFS4在胶质瘤细胞中的高表达,并揭示其通过调控线粒体功能和COX5B驱动胶质瘤进展 | NA | 探究NDUFS4在胶质瘤进展中的作用机制 | 胶质瘤细胞、患者组织、胶质瘤异种移植模型 | NA | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9, shRNA, 多组学整合 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 233 | 2026-03-06 |
Notch3 regulates pericyte phenotypic plasticity in colorectal cancer
2026-Jan-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09629-4
PMID:41618002
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研究论文 | 本研究探讨了Notch3信号在结直肠癌中周细胞表型和功能中的作用,揭示了其调控周细胞表型可塑性及影响肿瘤血管生成的机制 | 首次将Notch3信号通路与结直肠癌周细胞的表型可塑性直接关联,并通过单细胞RNA测序揭示了周细胞异质性中Notch3活性的差异 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,临床转化潜力需进一步验证 | 阐明Notch3信号在结直肠癌周细胞表型调控中的作用及其对肿瘤进展的影响 | 小鼠和人类结直肠癌中的周细胞 | 肿瘤微环境研究 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、体内基因操作 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 小鼠模型和人类结直肠癌样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 234 | 2026-03-06 |
Prostaglandin E2 Reverses Myofibroblast Differentiation in Eosinophilic Esophagitis
2026-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.27.702012
PMID:41659461
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研究论文 | 本研究探讨了前列腺素E2(PGE2)在嗜酸性粒细胞性食管炎(EoE)中逆转肌成纤维细胞分化的疗效和机制 | 首次探索了通过调节肌成纤维细胞作为EoE纤维狭窄性食管炎的治疗可能性,并揭示了PGE2通过cAMP/YAP/THBS-1通路促进肌成纤维细胞去分化的新机制 | 研究主要基于细胞模型和小鼠模型,尚未在人体临床试验中得到验证 | 研究PGE2对EoE肌成纤维细胞去分化的疗效和机制,探索EoE纤维狭窄的治疗策略 | 胎儿食管成纤维细胞(FEF3)、患者来源的成纤维细胞、EoE小鼠模型 | NA | 嗜酸性粒细胞性食管炎 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | 基因表达数据、组织学数据 | 胎儿食管成纤维细胞系、患者来源细胞、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 235 | 2026-03-06 |
Allergen-specific human IgE isolated through an allergen-agnostic pipeline-understanding immune response and allergen recognition
2026-Jan-28, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09600-3
PMID:41606257
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研究论文 | 本文介绍了一种从过敏患者免疫库中直接生成重组IgE的流程,用于研究过敏的分子机制 | 开发了一种不依赖特定过敏原的流程,通过单细胞测序技术从IgM B细胞中识别和生成高亲和力IgE抗体 | NA | 研究过敏的分子机制,开发用于过敏研究、诊断和治疗的抗体 | 过敏患者的骨髓和外周血IgM B细胞 | 自然语言处理 | 过敏 | 单细胞测序,高通量转录组测序 | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 236 | 2026-03-06 |
Subclinical fields of BRAF V600E-mutant melanocytes populate human skin and are enriched around melanoma and naevi
2026-01-27, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf412
PMID:41148046
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研究论文 | 本研究揭示了在临床健康皮肤中普遍存在BRAF V600E突变黑色素细胞的亚临床区域,这些区域在黑色素瘤和痣周围富集,挑战了BRAF V600E突变本身具有致癌性的传统观点 | 首次在无可见病变的高风险成人皮肤中系统性识别出BRAF V600E突变黑色素细胞区域,并发现这些细胞处于生长停滞状态,为黑色素瘤起源提供了新视角 | 样本主要来自高风险澳大利亚人群,可能无法完全代表普通人群;研究未长期追踪这些突变细胞的肿瘤转化过程 | 探究BRAF V600E突变黑色素细胞是否普遍存在于高风险黑色素瘤成人的非病变皮肤中 | 97例来自高风险个体的临床健康皮肤样本,包括痣或黑色素瘤邻近皮肤、光损伤皮肤、光保护皮肤及新生儿包皮来源的黑色素母细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 免疫组织化学、液滴数字PCR、单细胞RNA测序 | NA | 组织切片图像、基因表达数据 | 97例皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 237 | 2026-03-06 |
Heterogeneous generation and expansion of epidermal-resident memory T cells in individuals allergic to nickel
2026-01-27, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf427
PMID:41206452
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研究论文 | 本研究探讨了镍过敏个体在反复暴露于镍后,表皮驻留记忆T细胞的异质性生成和扩增机制 | 首次在镍过敏个体中,通过重复斑贴试验结合单细胞RNA测序,揭示了表皮TRM细胞的克隆扩增和分化多样性,并发现了耗竭样T细胞亚群的存在 | 样本量较小(12名参与者),且未发现特定T细胞亚型与临床反应严重程度的相关性 | 研究反复镍暴露如何影响镍过敏个体的临床反应及表皮TRM细胞的积累和分化 | 12名镍过敏参与者 | 免疫学 | 过敏性接触性皮炎 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12名镍过敏参与者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 238 | 2026-03-06 |
SpaceBF: spatial coexpression analysis using Bayesian fused approaches in spatial omics datasets
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag006
PMID:41556565
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaceBF的贝叶斯融合建模框架,用于空间组学数据中的空间共表达分析 | SpaceBF通过预定义空间邻接图上的融合马蹄先验,在局部和全局水平估计共表达,允许大边缘特定差异逃逸收缩同时保持整体结构,相比常用方法具有更高特异性和功效 | NA | 开发一种稳健的方法来识别空间组学数据中分子对之间的空间变化共表达 | 空间转录组学和质谱成像数据中的基因、肽、脂质或N-聚糖 | 空间组学 | 癌症 | 空间转录组学,质谱成像 | 贝叶斯融合模型 | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学,质谱成像 | NA | NA |
| 239 | 2026-03-06 |
Advances in Adipose Tissue Biology
2026-Jan-13, Endocrine reviews
IF:22.0Q1
DOI:10.1210/endrev/bnaf032
PMID:41071598
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综述 | 本文综述了脂肪组织生物学的最新进展,强调了其在人类生理调节中的核心作用及其功能障碍与肥胖相关疾病的关系 | 突出了脂肪组织从惰性组织到动态调节器官的认知转变,以及单细胞RNA测序等技术在揭示脂肪库特异性机制方面的应用潜力 | 作为一篇综述文章,未提出新的原始研究数据或实验验证 | 总结脂肪组织在健康和疾病中的关键作用及生物学研究进展 | 脂肪组织及其细胞,特别是脂肪细胞 | NA | 2型糖尿病、心血管疾病、肝病、多种癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 240 | 2026-03-06 |
Integrative single cell RNA-sequencing and spatial transcriptomics uncovers distinct macrophage-fibroblast cross-talk in human hip synovium between patients with femoroacetabular impingement and osteoarthritis
2026-Jan-12, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70033
PMID:41524472
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了股骨髋臼撞击症(FAI)与髋关节骨关节炎(OA)患者髋关节滑膜中巨噬细胞-成纤维细胞交互的差异 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学,系统比较了FAI和髋OA患者滑膜细胞组成、转录组谱及细胞间相互作用,并识别了EREG+成纤维样滑膜细胞(FLS)及其与COL1A1+IGFBP5+纤维化巨噬细胞(MΦ)通过FGF2-SDC4信号通路的独特交互 | 样本量较小(每组6例),且研究仅限于人类髋关节滑膜,未涉及其他关节或动物模型,可能限制结果的普适性 | 探究FAI和髋OA患者髋关节滑膜中细胞组成、转录组变化及细胞间相互作用的差异,以揭示疾病进展机制 | 人类髋关节滑膜样本,来自FAI和髋OA患者 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 12例人类髋关节滑膜样本(FAI和髋OA各6例) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |