本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-09-16 |
Advances in graft-versus-host disease: emerging therapeutic strategies, biomarker discoveries, and innovative treatment approaches
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1816067
PMID:42367753
|
综述 | 该综述总结了移植物抗宿主病的临床表现、精准诊断标志物、发病机制驱动因素以及新兴治疗策略 | 整合了ST2/REG3α MAGIC生物标志物组合、新型B细胞亚群cGPS、单细胞RNA测序和血浆游离RNA转录组分析等精准诊断进展,并区分了2024年预防建议与新获批的类固醇难治性疾病治疗 | 作为综述,未提供原始实验数据,且未对各项进展进行定量比较或荟萃分析 | 概述移植物抗宿主病的临床谱系、精准诊断进展、发病机制驱动因素及当前治疗格局 | 移植物抗宿主病患者,包括经典急性GVHD、慢性GVHD及重叠综合征 | 临床医学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序, 血浆游离RNA分析 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 222 | 2026-09-16 |
Genetic Liability to COPD and Periodontitis Risk: Integrative Genetic and Single-Cell Evidence Implicating Macrophage Reprogramming
2026, International journal of chronic obstructive pulmonary disease
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/COPD.S622582
PMID:42733807
|
研究论文 | 本文通过孟德尔随机化、单细胞RNA测序和体外实验,评估了慢性阻塞性肺疾病遗传易感性与牙周炎风险之间的关联,并探讨了巨噬细胞重编程相关的免疫机制。 | 整合了遗传学(双样本MR和MVMR)、单细胞转录组和体外巨噬细胞实验,首次系统性地揭示了COPD遗传易感性对牙周炎风险的因果关联,并定位到单核-巨噬细胞谱系及HSP90AA1和ALOX15B两个候选保护性介质。 | 吸烟启动模型的条件F统计量为5.02,提示存在弱工具变量偏倚,需谨慎解读;研究结论为遗传关联而非确定的吸烟独立性因果关系;巨噬细胞和候选基因作为假设生成性介质,需在匹配的人类队列和靶向扰动模型中验证。 | 探究遗传代理的COPD易感性是否与牙周炎风险相关,并探索潜在的共享免疫细胞机制。 | COPD和牙周炎的遗传数据、COPD外周血和牙周炎牙龈的单细胞RNA测序数据、RAW264.7巨噬细胞。 | 机器学习, 单细胞组学, 遗传流行病学 | 肺癌, 牙周炎 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 通路富集分析, 基于汇总数据的孟德尔随机化, 体外细胞实验 | 双样本孟德尔随机化, 多变量孟德尔随机化, 逆方差加权法, 基于汇总数据的孟德尔随机化 | 遗传数据, 单细胞转录组数据, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 223 | 2026-09-16 |
ITGBL1 and RPN1 Mark a Fibrotic NP Subpopulation with Coupled Integrin Signaling and N-Glycosylation Programs in IVDD
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S629922
PMID:42733874
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 224 | 2026-09-14 |
Machine learning-integrated multi-omics risk prediction for pulmonary fungal infection in COPD and lung cancer: a transcriptomic and immune profiling study
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1900277
PMID:42725278
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序与TCGA-LUAD批量RNA测序数据,构建五种机器学习模型预测COPD和肺癌患者侵袭性肺部真菌感染风险,并通过体外qRT-PCR验证关键基因 | 首次将scRNA-seq与TCGA批量转录组数据进行跨组学整合,结合五种机器学习模型构建IPFI风险预测模型,并在体外通过热灭活烟曲霉分生孢子刺激A549细胞和THP-1衍生巨噬细胞验证候选基因的生物学相关性 | 研究基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床队列验证;体外实验使用热灭活真菌孢子而非活体感染模型,可能无法完全反映体内真实感染过程;样本来源和数量有限 | 构建并验证整合多组学数据的机器学习模型,用于COPD和肺癌患者侵袭性肺部真菌感染的早期风险预测和分层 | COPD和肺癌患者的肺组织样本及细胞系(A549细胞和THP-1衍生巨噬细胞) | 机器学习, 数字病理学, 转录组学 | 肺癌, 慢性阻塞性肺疾病, 肺部真菌感染 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, qRT-PCR | 逻辑回归, SVM, 随机森林, XGBoost, LASSO | 基因表达数据, 转录组数据 | scRNA-seq数据包含12,078个细胞(来自正常和COPD肺组织);TCGA-LUAD队列包含539个肿瘤样本和59个正常样本 | Illumina | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 225 | 2026-09-14 |
VCAN is upregulated in the cervical cancer stroma and modulates macrophage polarization
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1902341
PMID:42729226
|
研究论文 | 该研究重新分析宫颈癌组织的单细胞RNA测序数据,发现VCAN在单核细胞和成纤维细胞中高表达,并探讨VCAN-V3蛋白对巨噬细胞极化的影响 | 首次系统鉴定宫颈癌组织中产生versican的细胞类型,发现表达versican的巨噬细胞,并揭示VCAN-V3核心蛋白可抑制M1相关基因表达并诱导M2样转录表型 | 仅对一例宫颈癌患者放疗前后外周血单个核细胞进行单细胞RNA测序,样本量有限;VCAN-V3对巨噬细胞极化的机制研究仅在RAW264.7细胞系中进行,缺乏体内验证 | 鉴定宫颈癌组织中产生versican的细胞类型,并探究versican对巨噬细胞极化的调控作用 | 宫颈癌组织、癌旁正常组织、宫颈癌患者外周血单个核细胞、RAW264.7巨噬细胞系 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化染色、多重免疫荧光染色 | NA | 图像、文本 | 1例宫颈癌患者放疗前后的外周血单个核细胞样本,以及宫颈癌组织与癌旁正常组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 226 | 2026-09-14 |
Integration of single-cell and bulk RNA sequencing data identified an aortic dissection-enriched ANGPTL4+ macrophage subpopulation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1874233
PMID:42729239
|
研究论文 | 该研究整合了单细胞和批量RNA测序数据,识别出一个在主动脉夹层中富集的ANGPTL4+巨噬细胞亚群,并构建了临床预测模型 | 首次识别出主动脉夹层富集的ANGPTL4+巨噬细胞亚群,揭示了其糖酵解表型、早期单核细胞来源特征以及通过ANGPTL和SPP1信号通路与结构细胞的相互作用,并鉴定了ANGPTL4、PHLDA1和SERPINE1作为特征基因 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证,缺乏体内动物模型验证和更大规模的临床队列验证 | 探究主动脉夹层中巨噬细胞的分子和细胞机制,识别新的治疗靶点 | 主动脉夹层患者样本中的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 6个公开单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 227 | 2026-09-14 |
Zinc and metallothionein dysregulation in B cells in multiple sclerosis, with disease-specific CXCR3+/CXCR3⁻ divergence in blood
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1922905
PMID:42729258
|
研究论文 | 该文重新分析两个公开的人单细胞RNA测序数据集,研究多发性硬化症患者脑脊液和外周血B细胞中锌转运蛋白和金属硫蛋白基因表达的失调情况 | 首次在多发性硬化症中揭示了锌稳态通路异常作为B细胞的疾病相关特征,并发现外周血中CXCR3+和CXCR3- B细胞亚群之间存在疾病特异性差异 | 研究基于公开数据集的重新分析,样本量有限,未进行实验验证,锌/金属硫蛋白特征的具体功能机制尚不明确 | 探究多发性硬化症中致病性B细胞群体的锌稳态调控情况 | 多发性硬化症患者、临床孤立综合征患者及健康对照者的脑脊液和外周血B细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 两个公开的人类单细胞RNA测序数据集,包含脑脊液和外周血B细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 228 | 2026-09-14 |
Multi-omics approaches in idiopathic pulmonary fibrosis: from molecular mechanisms to therapeutic targets and precision medicine
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1899849
PMID:42729333
|
综述 | 本文综述了多组学方法在特发性肺纤维化研究中的应用,涵盖基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组分析和单细胞测序,以揭示其分子机制并识别生物标志物和药物靶点 | 系统整合多组学数据以识别特发性肺纤维化的分子内型、候选生物标志物和潜在治疗靶点,推动精准医学发展 | 数据整合困难、组织异质性、队列规模有限以及缺乏功能验证,这些是临床转化的主要障碍 | 阐明特发性肺纤维化的分子机制,识别潜在生物标志物和药物靶点,推动精准医学和个性化治疗策略的发展 | 特发性肺纤维化患者及相关多组学数据 | 机器学习 | 肺纤维化 | 基因组学, 表观基因组学, 转录组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 微生物组分析, 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 229 | 2026-09-14 |
Concurrent expression of glucose-6-phosphate dehydrogenase and secreted phosphoprotein 1 characterizes an aggressive and immunosuppressive tumor state in hepatocellular carcinoma
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1851314
PMID:42729366
|
研究论文 | 该研究整合单细胞转录组学、大规模批量转录组建模和独立临床验证,揭示肝细胞癌中G6PD与SPP1共表达表征一种侵袭性和免疫抑制性肿瘤状态 | 首次发现G6PD和SPP1在治疗进展病灶的肿瘤肝细胞中同时上调,构建了代谢-转录风险特征可有效分层HCC患者总体生存,并揭示其与'炎症但抑制'肿瘤微环境的关联 | 该关联对现代联合治疗的预测价值需要在接受治疗的队列中进行前瞻性验证 | 探索肝细胞癌治疗耐药的生物学特征 | 肝细胞癌患者肿瘤样本,包括一个治疗进展病灶和114例初治患者的独立回顾性队列 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学,批量转录组学,免疫组织化学 | NA | 图像,文本 | 1个治疗进展病灶的单细胞转录组样本,TCGA-LIHC和ICGC LIRI-JP大队列,以及114例初治患者的独立回顾性验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 230 | 2026-09-14 |
Bone formation niche dysfunction in osteoporosis: insights from single-cell and spatial transcriptomic studies
2026, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2026.1909423
PMID:42729472
|
综述 | 该综述综合了单细胞和空间转录组学的最新发现,提出了骨形成微环境的三区模型,并提出了骨质疏松症中“空间去分区化”的假设 | 提出了骨形成微环境的三区模型(骨髓侧基质区、逆转/过渡区、骨表面形成区),并首次提出“空间去分区化”作为骨质疏松症的假设生成框架,将骨重建隔室 canopy 假说从概念层面推进到分子层面 | 现有的人类空间图谱主要来源于骨关节炎股骨头,因此提供的是参考图谱而非骨质疏松症特异性微环境紊乱的直接证据 | 整合单细胞和空间转录组学证据,建立理解骨形成和骨质疏松症的空间框架,并提出微环境修复性治疗策略 | 骨形成微环境、间充质基质细胞、骨质疏松症中的骨形成生态位 | 空间转录组学、单细胞转录组学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 231 | 2026-09-14 |
Spatial dynamics of cancer-associated fibroblasts links fibroblastic differentiation to immune exclusion and tumor progression
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1886779
PMID:42729505
|
研究论文 | 该研究通过整合单细胞分辨率空间转录组学和标准空间转录组学数据,构建计算框架,揭示了癌症相关成纤维细胞的空间动态及其与免疫细胞和肿瘤细胞的相互作用 | 提出了从成纤维细胞祖细胞到COL11A1表达型侵袭性CAF(aCAF)的连续转变模型,并揭示了aCAF在肿瘤边界富集、与免疫排斥及脂质相关巨噬细胞共定位的空间关联,同时开发了开源工具SpatialAttractor用于空间基因共表达分析 | 摘要中未明确说明样本量、具体肿瘤类型数量及平台细节,研究的普适性和临床转化价值仍需进一步验证 | 研究癌症相关成纤维细胞(CAF)的空间异质性及其在肿瘤微环境中与免疫细胞和肿瘤细胞的相互作用 | 多种肿瘤类型中的癌症相关成纤维细胞(CAFs)、肿瘤细胞及免疫细胞 | 空间转录组学, 数字病理学 | 泛癌种 | 单细胞分辨率空间转录组学, 标准空间转录组学 | NA | 空间转录组数据, 图像 | NA | NA | 单细胞空间转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 232 | 2026-09-14 |
Clonal evolution in gastrointestinal cancers: multi-omics insights into tumor heterogeneity, microenvironmental selection, and translational biomarkers
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1907210
PMID:42729528
|
综述 | 本文综述了肝细胞癌、食管鳞状细胞癌和胃癌中克隆演化的多组学研究,涵盖肿瘤异质性、微环境选择及转化生物标志物 | 系统整合了多区域和单细胞DNA测序、单细胞和空间转录组学、蛋白质组学及纵向液体活检等多组学技术,从克隆演化角度对比了三种胃肠道癌症在播散时间、选择压力和生物标志物成熟度上的差异,并批判性讨论了系统发育推断的假设和采样偏倚 | 受限于横断面肿瘤图谱的因果推断局限、克隆性造血干扰、采样偏倚对系统发育推断的约束,以及广泛多组学相对于聚焦检测的增量价值尚不明确;标志物指导干预的治疗获益仍取决于具体情境,自适应治疗和演化引导仍处于研究阶段 | 阐明胃肠道癌症中克隆演化的多组学特征,探讨肿瘤异质性、微环境选择及转化生物标志物的研究现状与挑战 | 肝细胞癌、食管鳞状细胞癌和胃癌 | 数字病理学, 机器学习 | 肝癌, 食管癌, 胃癌 | 多区域DNA测序, 单细胞DNA测序, 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 蛋白质组学, 纵向液体活检 | NA | 图像, 文本, 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞DNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 233 | 2026-09-14 |
Single-cell transcriptomics deciphers cancer-associated fibroblast heterogeneity and immune regulatory mechanisms in the bladder cancer tumor microenvironment
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1889050
PMID:42729537
|
研究论文 | 本研究通过分析膀胱癌单细胞转录组数据,揭示了癌症相关成纤维细胞的异质性及其免疫调控机制,并构建了一个六基因myCAF评分进行验证 | 在膀胱癌邻近组织中鉴定出两种转录差异显著的成纤维细胞状态(稳态成纤维细胞和CCL2高表达活化样成纤维细胞),并通过扩散伪时间分析揭示CCL2高表达细胞处于更晚的分化状态 | 肿瘤样本中未保留成纤维细胞样细胞,myCAF评分在协变量调整后不能独立预测总生存期,且在独立队列GSE31684中未能重复验证,研究为探索性计算框架,需要前瞻性验证 | 解析膀胱癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞的异质性及其免疫调控机制 | 膀胱癌肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞(CAFs),以及膀胱癌细胞系RT4和T24 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞转录组测序,RT-qPCR | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 9,253个质控后细胞(6,035个邻近组织细胞和3,218个肿瘤细胞),TCGA-BLCA bulk转录组数据408例(过滤后401例),GSE31684队列93例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 234 | 2026-09-14 |
Progress and challenges in exploring the pathogenesis of depressive disorders via RNA sequencing
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1792849
PMID:42729848
|
综述 | 本文综述了利用RNA测序技术(包括bulk RNA-seq、scRNA-seq和snRNA-seq)探索抑郁症(包括MDD、PND、PMD和PSD)发病机制的最新进展 | 系统总结了不同类型抑郁症在转录组水平上的共享核心病理机制(免疫炎症激活、突触可塑性受损、线粒体能量代谢障碍)及各自特异的分子通路,并提出了未来研究方向 | 样本来源受限、数据异质性高、临床转化不足 | 综述RNA测序技术在探索抑郁症发病机制中的应用进展与挑战 | 抑郁症患者(包括重度抑郁症、围产期抑郁症、围绝经期抑郁症和卒中后抑郁症) | 机器学习 | 抑郁症 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, single-nucleus RNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, single-nucleus RNA-seq | NA | NA |
| 235 | 2026-09-14 |
A multi-omics integrative analyses reveals CYBB-mediated apoptotic and immune dysregulation as a key target of berberine in diffuse large B-cell lymphoma
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1870435
PMID:42730162
|
研究论文 | 通过整合遗传因果推断、多组学数据与功能验证,揭示小檗碱在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的关键靶点CYBB及其介导的凋亡和免疫失调机制 | 首次将孟德尔随机化、多组学整合分析与功能验证相结合,系统鉴定小檗碱相关基因与DLBCL的因果关联,并优先确定CYBB为小檗碱功能相关核心靶点,揭示小檗碱-CYBB轴在DLBCL中的潜在作用 | 缺乏挽救实验来确认CYBB靶向的特异性及其相对贡献 | 鉴定小檗碱在弥漫性大B细胞淋巴瘤中相关的分子靶点和作用机制 | 760个小檗碱相关候选基因及弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 机器学习, 数字病理学 | 淋巴瘤 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 转录组测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | 机器学习预后模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 图像 | 760个小檗碱相关候选基因(其中315个具有足够工具变量用于孟德尔随机化分析) | NA | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | NA | NA |
| 236 | 2026-09-14 |
Integrating single-cell transcriptomics to construct an oncogene-driven prognostic model and elucidate metabolic-immune crosstalk in hepatocellular carcinoma
2026, Molecular & cellular oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.1080/23723556.2026.2685984
PMID:42730392
|
研究论文 | 该研究整合TCGA与多中心单细胞转录组数据,构建了单细胞致癌基因评分系统及基于随机生存森林的肝细胞癌预后模型,并揭示了代谢-免疫串扰 | 开发了单细胞“致癌基因评分”系统以量化单个细胞的致癌活性,并构建了基于随机生存森林的预后模型,揭示了高致癌活性与单细胞代谢-免疫串扰的关联 | 研究主要基于计算框架和假设生成,需要进一步实验验证其机制和临床适用性 | 构建致癌基因驱动的预后模型,并阐明肝细胞癌中的代谢-免疫串扰机制 | 肝细胞癌患者样本,包括TCGA和多中心单细胞转录组数据 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞转录组测序 | 随机生存森林 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 237 | 2026-09-13 |
Single-cell atlas of gastric cancer reveals malignant epithelial evolution and regulatory reprogramming of the tumor microenvironment
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0347679
PMID:42018572
|
研究论文 | 该研究通过整合慢性胃炎、肠化生、癌旁及肿瘤组织的单细胞转录组数据,构建了胃癌的单细胞图谱,揭示了恶性上皮演化及肿瘤微环境的调控重编程 | 构建了涵盖胃炎-肠化生-胃癌级联过程的统一单细胞转录组图谱,识别了两个肿瘤特异性恶性上皮亚群及原癌中间态细胞,揭示了CD44-细胞外基质轴在细胞间通讯中的关键作用,并发现多个与不良预后相关的恶性上皮相关转录因子 | 摘要中未明确说明样本量、平台细节及验证队列的具体信息,可能受限于单细胞测序的样本数量及回顾性分析设计 | 旨在解析胃癌发生过程中细胞水平的异质性及微环境重塑,验证炎症-肠化生-癌变级联模型 | 慢性胃炎(浅表性)、肠化生、癌旁组织及胃癌组织 | 数字病理学,机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),拷贝数变异推断,拟时序轨迹分析,基因调控网络分析,细胞间通讯分析 | NA | 单细胞转录组数据,图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 238 | 2026-09-13 |
Mapping the function of EF-hand domain-containing protein 2 and determining its clinical relevance in non-small-cell lung cancer through single-cell transcriptomics
2026, CytoJournal
IF:2.5Q2
DOI:10.25259/Cytojournal_29_2025
PMID:42022043
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索非小细胞肺癌肿瘤微环境的细胞组成和转录变异性,并评估EFHD2在肿瘤进展中的作用及其相关信号通路 | 首次通过单细胞转录组学系统描绘非小细胞肺癌肿瘤微环境中EFHD2的表达图谱,揭示其与免疫细胞浸润的关联,并提出JAK-STAT信号通路作为EFHD2发挥作用的潜在机制 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 探索非小细胞肺癌肿瘤微环境的细胞组成和转录变异性,评估EFHD2在肿瘤进展中的作用及其相关信号通路 | 非小细胞肺癌肿瘤微环境及EFHD2蛋白 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、Western blot、qRT-PCR | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 239 | 2026-09-13 |
The PROM1+SMAD5+ Tumor-Initiating Subpopulation Shapes Premetastatic Niches through Spatial Multi-Omics Landscapes in HER2-Positive Breast Cancer
2026, Cancer communications (London, England)
DOI:10.34133/cancomm.0046
PMID:42718887
|
研究论文 | 该研究利用空间多组学技术揭示了HER2阳性乳腺癌中PROM1+SMAD5+肿瘤起始细胞亚群通过基质细胞相互作用驱动肺转移的机制 | 首次鉴定出PROM1+SMAD5+肿瘤起始亚群及其与ADIPOQ+NOTCH4+脂肪细胞和DCN+TM4SF1+成纤维细胞形成的“三位一体生态位”,并阐明通过外泌体miRNA和EGFR-SMAD5-CYP3A4轴诱导部分上皮间质转化和转移的新机制 | 摘要未提及具体局限性,如样本量限制、模型系统的转化相关性等 | 探索乳腺肿瘤起始细胞的微环境调控机制及其在HER2阳性乳腺癌转移中的作用 | HER2阳性乳腺癌肿瘤起始细胞、基质细胞亚群及临床样本 | 空间多组学、肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 空间转录组学、代谢组学、空间原位分析、蛋白质组学、外泌体miRNA高通量测序、单核RNA测序 | NA | 图像、文本、测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单核RNA-seq, 代谢组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 240 | 2026-09-13 |
From transcriptomic profiling to precision oncology: a bibliometric analysis of RNA sequencing in acute myeloid leukemia
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1877223
PMID:42723741
|
研究论文 | 该文通过文献计量学方法分析了2007年至2025年间RNA测序在急性髓系白血病中的全球研究格局与主题演变 | 首次对AML RNA-seq研究进行系统的全球文献计量分析,揭示了从转录组分析到精准肿瘤学的主题演变 | 文献计量学的突出程度不能直接等同于临床实用价值 | 绘制AML RNA-seq研究的全球格局,识别主要知识领域、新兴主题及研究优先事项的时间变化 | Web of Science Core Collection和Scopus数据库中2007年1月1日至2025年8月18日间发表的AML RNA-seq相关文献 | 机器学习, 自然语言处理 | 白血病 | RNA-seq | NA | 文本 | 3460篇文章和综述 | NA | RNA-seq | NA | NA |