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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-03-09 |
Workshop Introduction: Advances of AI Methods in Single Cell Spatial Omics
2026, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
DOI:10.1142/9789819824755_0061
PMID:41758189
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workshop introduction | 本次研讨会聚焦于人工智能方法在单细胞空间组学中的最新进展与应用 | 强调AI和机器学习在空间转录组学、蛋白质组学和代谢组学中的前沿应用,包括数据整合、细胞间相互作用建模等 | NA | 促进AI方法在单细胞空间组学领域的发展与应用,推动疾病研究和精准医学 | 空间转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据 | machine learning | NA | NA | NA | 空间组学数据 | NA | NA | 单细胞空间组学 | NA | NA |
| 202 | 2026-03-09 |
Unveiling the Role of SLC6A17 in Lung Adenocarcinoma: Prognosis, Pathways, and Therapeutic Implications
2026, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,揭示了SLC6A17基因在肺腺癌中的异常表达、预后价值、相关通路及治疗意义 | 首次系统性地研究了SLC6A17在肺腺癌中的表达模式、预后关联、免疫浸润相关性及药物反应,并利用单细胞测序数据进行了深入分析 | 研究主要基于公共数据库和细胞系数据,缺乏大规模临床样本的直接验证,且机制研究有待进一步深入 | 阐明SLC6A17在肺腺癌中的作用,评估其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 | 肺腺癌患者数据、细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | 生物信息学分析、qRTPCR、单细胞测序数据分析 | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 | TCGA数据库中的肺腺癌患者数据、GSE87340数据集、多种细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 203 | 2026-03-09 |
Single-cell sequencing reveals reversible glial remodeling in the visual cortex during visual deprivation and recovery
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1730619
PMID:41789061
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了视觉剥夺和恢复期间视觉皮层中非神经元细胞(如小胶质细胞和少突胶质细胞)的可逆性重塑过程 | 首次在豚鼠模型中利用单细胞测序全面描绘了视觉皮层在视觉剥夺和恢复过程中的动态转录组变化,并揭示了小胶质细胞-少突胶质细胞轴在皮质可塑性中的关键作用 | 研究仅基于豚鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证;样本量相对较小,可能影响统计效力 | 全面表征视觉剥夺和恢复过程中视觉皮层非神经元细胞的动态变化 | 豚鼠的初级视觉皮层(V1) | 数字病理学 | 近视 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫荧光,定量PCR,Western blotting,透射电子显微镜 | 轨迹推断,细胞间通讯映射 | 转录组数据,图像数据 | 三组豚鼠:正常对照组(NC)、形觉剥夺组(FDM;5周单眼剥夺)、恢复组(REC;4周剥夺后1周恢复视觉) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 204 | 2026-03-09 |
Integrating multi-omics and machine learning to unravel mechanisms of lymph node metastasis in papillary carcinoma with and without thyroiditis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1708330
PMID:41789084
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法,揭示了伴有和不伴有甲状腺炎的甲状腺乳头状癌淋巴结转移的机制差异 | 首次在单细胞分辨率下比较了PTC-blank和PTC-thyroiditis的分子和细胞异质性,识别了与淋巴结转移相关的关键驱动因素,并开发了一个17基因预测模型 | 研究依赖于公共数据库数据,可能受到样本选择和批次效应的影响,且预测模型需要在前瞻性临床队列中进一步验证 | 比较PTC-blank和PTC-thyroiditis的分子和细胞异质性,识别淋巴结转移的关键驱动因素,并开发临床预测模型 | 甲状腺乳头状癌患者,根据是否伴有甲状腺炎分为PTC-blank和PTC-thyroiditis两组 | 机器学习和计算生物学 | 甲状腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 孟德尔随机化, 分子对接 | LASSO, 随机森林, KNN | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA数据库的批量RNA-seq数据和GSE184362的单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 205 | 2026-03-09 |
Identification of FTO as a key m6A demethylase linking immune dysregulation to sepsis pathogenesis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1756059
PMID:41789088
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和实验分析,识别出FTO作为脓毒症的关键m6A去甲基化酶,并揭示了其在免疫失调和脓毒症发病机制中的作用 | 首次通过多机器学习算法共识特征选择,将FTO确定为脓毒症的潜在诊断生物标志物和m6A甲基化调节因子,并利用单细胞RNA测序数据阐明其在免疫细胞亚群中的分布和功能 | 研究主要基于公开转录组数据集和体外模型,缺乏大规模临床队列验证和体内实验证据 | 识别脓毒症的潜在诊断生物标志物并阐明其分子机制 | 脓毒症患者和健康对照的转录组数据,以及体外巨噬细胞和中性粒细胞模型 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序,单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO,机器学习算法 | 基因表达数据 | 五个公开转录组数据集(GSE13904,GSE26440,GSE28750,GSE95233,GSE57065)中的脓毒症和健康对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 206 | 2026-03-09 |
A multi-dimensional omics framework identifies GPR35 as a driver of M2 macrophage activation and poor prognosis in colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1783260
PMID:41789103
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研究论文 | 本研究通过整合多队列单细胞RNA测序数据,构建了结直肠癌肿瘤微环境的综合图谱,识别出GPR35作为M2巨噬细胞激活的关键驱动因子,并与不良预后及免疫治疗抵抗相关 | 首次通过单细胞多组学框架将GPR35鉴定为结直肠癌中M2巨噬细胞激活和免疫逃避的细胞内在驱动因子,并验证其作为免疫治疗抵抗的生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析,体内功能验证和临床转化应用仍需进一步实验 | 探究结直肠癌肿瘤微环境中驱动免疫逃避的机制,并识别新的治疗靶点 | 结直肠癌患者肿瘤样本中的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解, WGCNA | 单细胞转录组数据 | 多队列结直肠癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 207 | 2026-03-09 |
Identification of public neoantigens with broad HLA class I coverage as candidates for off-the-shelf cancer vaccine development in colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1686224
PMID:41789101
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研究论文 | 本研究通过整合TCGA突变数据和HLA I类结合预测,开发了一个结直肠癌特异性、即用型新抗原面板,并在越南患者队列中进行了功能验证 | 开发了一个针对亚洲和高加索人群、具有广泛HLA I类覆盖的结直肠癌即用型新抗原面板,并首次在越南患者队列中对TP53_R273H新抗原进行了功能免疫原性验证 | 研究队列规模有限(n=67),功能验证仅在7名患者中进行,需要更大规模、多人群的临床研究来确认面板的普适性和疗效 | 开发一种具有广泛人群覆盖和功能验证的即用型癌症疫苗新抗原面板,用于结直肠癌免疫治疗 | 结直肠癌患者,特别是亚洲和高加索人群,以及患者来源的CD8⁺ T细胞 | 癌症免疫学 | 结直肠癌 | TCGA突变数据分析,HLA I类结合预测,IFN-γ ELISpot检测,单细胞RNA测序 | NA | 基因组突变数据,HLA分型数据,免疫反应功能数据,单细胞转录组数据 | TCGA数据库的结直肠癌突变数据,越南结直肠癌患者队列(n=67),其中7名患者进行了功能验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 208 | 2026-03-09 |
PAH-former: Transfer learning for efficient discovery of pulmonary arterial hypertension-associated genes
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0344084
PMID:41790620
|
研究论文 | 本研究开发了一个名为PAH-former的迁移学习平台,用于从有限的公开单细胞RNA测序数据中高效发现与肺动脉高压相关的基因 | 通过微调Geneformer深度学习模型,创建了专门针对肺动脉高压的PAH-former模型,并利用其进行计算机模拟扰动分析来识别新的疾病相关基因 | 研究依赖于公开可用的有限患者样本数据,且体外验证仅在人类肺动脉内皮细胞中进行 | 高效识别肺动脉高压的新型功能相关疾病基因 | 肺动脉高压相关的基因 | 机器学习 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型(基于Geneformer) | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 209 | 2026-03-09 |
<em>IGHG1, HLA-DOB, </em>and <em>GABBR1</em>: Genetic Insights into Rheumatoid Arthritis Using Mendelian Randomisation and Single-Cell RNA Sequencing
2026-Jan, Journal of the College of Physicians and Surgeons--Pakistan : JCPSP
DOI:10.29271/jcpsp.2026.01.71
PMID:41792070
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研究论文 | 本研究通过整合差异基因表达分析、孟德尔随机化和单细胞RNA测序,识别了与类风湿关节炎相关的关键基因,并探索了其在疾病发病机制中的作用 | 首次将孟德尔随机化与单细胞RNA测序结合,识别出GABBR1这一G蛋白偶联受体与类风湿关节炎的新关联,揭示了其在免疫调节和炎症中的复杂作用 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量可能有限,影响结果的普适性 | 识别类风湿关节炎的关键基因并探索其在疾病发病机制中的作用,以提出新的治疗靶点 | 类风湿关节炎患者与健康对照的基因表达数据,特别是滑膜组织的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 差异基因表达分析 | 线性模型(limma包) | 基因表达谱, 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,数据来源于公共数据库(GEO、GWAS Catalogue、NIH ImmPort) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 210 | 2026-03-08 |
Liver Macrophage Changes during Early Adaptation to Alcohol Exposure
2026-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.10.004
PMID:41177326
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研究论文 | 本研究探讨了酒精暴露早期对小鼠和人类肝脏巨噬细胞(包括Kupffer细胞和浸润巨噬细胞)的影响,揭示了其表型变化和炎症反应动态 | 首次通过单细胞RNA测序结合流式细胞术和体外细胞培养,系统比较了酒精暴露早期小鼠Kupffer细胞与浸润巨噬细胞的表型变化,并在人类肝脏中验证了无肝病状态下的类似表型转变 | 研究主要关注早期酒精暴露效应,未探讨长期酒精摄入或已形成肝病的情况,且人类样本来源于尸检和移植患者,可能无法完全代表健康人群 | 阐明酒精暴露早期肝脏巨噬细胞(特别是Kupffer细胞与浸润巨噬细胞)的表型变化及其在维持肝脏稳态中的作用 | 小鼠模型(Lieber-Decarli乙醇饮食)和人类肝脏组织(来自尸检和移植患者的不同酒精表型个体) | NA | 酒精相关性肝病 | 流式细胞术、体外细胞培养、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、组织学数据 | 未明确具体数量,包括小鼠模型和人类肝脏组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 211 | 2026-03-07 |
CEBPB Expression in Tumor Cells Drives Immune Evasion in Colorectal Cancer via CTLA4 Up-regulation in T Cells
2026, Cancer communications (London, England)
DOI:10.34133/cancomm.0013
PMID:41743630
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了结直肠癌中CEBPB表达如何通过上调T细胞中的CTLA4驱动免疫逃逸 | 首次发现肿瘤细胞中CEBPB表达与T细胞CTLA4上调之间的直接关联,并阐明p53突变通过CEBPB介导的免疫抑制机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞共培养实验,人类样本验证相对有限,且机制细节需进一步探索 | 阐明结直肠癌免疫逃逸的分子机制 | 结直肠癌患者肿瘤组织、小鼠模型及细胞系 | 单细胞测序 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 30名结直肠癌患者肿瘤组织及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 212 | 2026-03-07 |
Multi-omics profiling of sodium-overload (NECSO) programs identifies NEK8 as a central driver of colorectal cancer progression through single-cell and spatial transcriptomics
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1765055
PMID:41743703
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析,揭示了钠超载细胞死亡程序在结直肠癌进展中的核心作用,并识别NEK8为关键驱动因子 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学来研究NECSO程序在结直肠癌中的作用,并开发了一个基于NECSO的五基因预后模型 | 研究主要基于TCGA和GEO数据集进行验证,可能缺乏前瞻性临床队列的独立验证 | 探究钠超载细胞死亡程序在结直肠癌进展中的作用及其与免疫调节的关联 | 结直肠癌患者样本和细胞系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | TCGA和GEO数据集中的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 213 | 2026-03-07 |
Systematic Comparison of Droplet-Based and Microwell-Based Platforms for Comprehensive Single-Cell Transcriptomic Analysis in Clinical Samples
2026, IET nanobiotechnology
IF:3.8Q3
DOI:10.1049/nbt2/9314222
PMID:41755812
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研究论文 | 本研究系统比较了基于液滴和微孔板的单细胞RNA测序平台在临床样本分析中的性能,揭示了平台间在mRNA偏好、细胞类型恢复和基因表达模式等方面的差异 | 首次在临床样本中全面比较了基于液滴和微孔板的scRNA-seq平台,揭示了平台特异性技术偏差对数据解释的影响,为跨平台数据整合提供了新见解 | 研究可能未涵盖所有临床样本类型或平台变体,且批次效应校正后仍存在残留差异 | 比较不同单细胞RNA测序平台在临床样本分析中的性能差异,以优化平台选择和数据整合策略 | 临床样本(具体肿瘤类型未明确说明) | 单细胞转录组学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基于液滴和基于微孔板的scRNA-seq平台 |
| 214 | 2026-03-07 |
Salidroside targets the Notch1/Hes5 axis to reconstruct the molecular innate immune-vascular network and correlates with repair after ischemic stroke
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1756559
PMID:41756274
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了缺血性中风后神经分子先天免疫-血管网络的失调,并发现红景天主要活性成分红景天苷通过靶向Notch1/Hes5轴调节星形胶质细胞状态,从而促进神经修复 | 首次在单细胞分辨率下,将红景天苷的神经保护作用与Notch1+Hes5+星形胶质细胞亚群的调控联系起来,并系统描绘了缺血性中风后先天免疫微环境的细胞图谱和调控网络 | 研究主要基于小鼠模型,其在人类疾病中的转化意义尚需进一步验证;单细胞测序数据主要来自特定时间点,动态变化过程仍需更全面的时序分析 | 阐明缺血性中风后神经分子先天免疫-血管网络的失调机制,并探究中药红景天活性成分红景天苷的细胞类型特异性免疫调节作用 | 缺血性中风小鼠模型的脑组织细胞 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序,网络药理学,分子对接,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 215 | 2026-03-07 |
Metabolic reprogramming of glioma-associated macrophages identifies detoxification and energetic macrophages as drivers of immunosuppression and therapeutic vulnerability
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1752553
PMID:41756290
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研究论文 | 本研究通过代谢重编程对胶质瘤相关巨噬细胞进行分型,鉴定出解毒与能量型巨噬细胞是免疫抑制和潜在治疗靶点的关键驱动因素 | 首次基于代谢特征对胶质瘤相关巨噬细胞进行系统分型,并构建了结合代谢风险模型与EGFR/IDH状态的临床预后工具 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分相对有限,需要更多功能实验证实代谢亚型的具体机制 | 阐明胶质瘤相关巨噬细胞的代谢重编程特征及其临床预后价值 | 胶质瘤患者样本中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序,转录组测序,Western blot | 逐步Cox回归 + 随机生存森林 | 单细胞RNA-seq数据,批量转录组数据,临床数据 | 未明确指定具体样本数量,但包含胶质瘤患者的单细胞和批量测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 216 | 2026-03-07 |
Characterizing tumor microenvironment heterogeneity in EBV+ nTNKL vs ENKTL using spatial transcriptomics and MIF
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1717844
PMID:41756304
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和多重免疫荧光技术,比较了EBV阳性淋巴结T/NK细胞淋巴瘤(EBV+ nTNKL)与结外NK/T细胞淋巴瘤(ENKTL)的肿瘤微环境异质性 | 首次通过空间转录组学揭示ENKTL与EBV+ nTNKL在免疫微环境、细胞间通讯和分子特征上的根本差异,为这一罕见淋巴瘤亚型提供了新的生物学见解 | 样本量有限(仅14例EBV+ nTNKL患者),可能影响结果的普遍性 | 阐明EBV+ nTNKL与ENKTL的免疫学和分子结构差异,探索其临床意义和治疗策略 | EBV阳性淋巴结T/NK细胞淋巴瘤(EBV+ nTNKL)和结外NK/T细胞淋巴瘤(ENKTL)患者组织样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学,多重免疫荧光 | NA | 空间转录组数据,免疫荧光图像 | 14例EBV+ nTNKL患者(回顾性队列)及代表性ENKTL标本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 217 | 2026-03-07 |
Annotation-free prediction of immunotherapy response in melanoma using single-cell transcriptomic data
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0343633
PMID:41758825
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研究论文 | 本研究开发了一种基于人工智能的模型,利用单细胞RNA测序数据预测黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂的反应,无需细胞类型注释 | 提出了一种无需细胞类型注释的AI模型,直接从单细胞转录组数据预测免疫治疗反应,并识别出29个关键预测生物标志物,如CCR7和MTRNR2L2 | 研究基于公共数据集,样本量相对有限,且模型在独立验证中可能受批次效应或技术差异影响 | 预测黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂的治疗反应 | 黑色素瘤患者的肿瘤浸润细胞 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | Extreme Gradient Boosting, Random Forest, Logistic Regression, Support Vector Machine, Feedforward Neural Network, Convolutional Neural Network | 单细胞转录组数据 | 16,290个肿瘤浸润细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | Smart-seq2 | Smart-seq2平台 |
| 218 | 2026-03-07 |
Fcer1g and St3gal1: Macrophage-associated angiogenesis biomarkers and therapeutic targets in sepsis-induced acute lung injury
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0343449
PMID:41758834
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和机器学习算法,鉴定出Fcer1g和St3gal1作为脓毒症相关急性肺损伤中巨噬细胞相关的血管生成关键生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次系统性地结合WGCNA、多种机器学习算法和单细胞RNA测序技术,在脓毒症相关急性肺损伤中鉴定出巨噬细胞相关的血管生成关键基因Fcer1g和St3gal1,并揭示了它们通过糖免疫信号通路介导巨噬细胞-内皮细胞相互作用的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和生物信息学分析,尚未在人类患者中进行充分验证;基因表达模式和机制在人类SALI中的适用性需要进一步实验证实 | 鉴定脓毒症相关急性肺损伤中巨噬细胞相关的血管生成相关基因,作为新型诊断生物标志物和治疗靶点 | 脓毒症相关急性肺损伤(SALI)中的巨噬细胞和血管生成过程 | 生物信息学 | 急性肺损伤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-PCR | LASSO回归, 随机森林, SVM | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量,使用了GEO数据库的转录组数据集和独立验证集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 219 | 2026-03-07 |
Dapagliflozin mitigates myocardial inflammation and metabolic stress in heart failure through STAT1 inhibition: Evidence from multi-omics analyses and experimental exploration
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0343296
PMID:41758878
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和实验验证,揭示了达格列净通过抑制STAT1信号通路减轻心力衰竭中的心肌炎症和代谢应激的分子机制 | 首次将STAT1确定为连接心力衰竭中代谢应激与免疫失衡的关键枢纽基因,并通过单细胞转录组学分析在特定髓系细胞亚群中验证了其异常表达 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,临床样本验证有限;单细胞测序数据来自公共数据库,样本量相对较小 | 探究达格列净在心力衰竭中的分子作用机制,特别是其对STAT1信号通路的调控作用 | 心力衰竭患者的心肌组织样本、心肌梗死诱导的心力衰竭大鼠模型以及H9C2心肌细胞系 | 生物信息学与计算生物学 | 心血管疾病 | RNA测序、单细胞RNA测序、Western blot、ELISA、流式细胞术、qPCR | 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、Seurat、Harmony | 转录组数据、单细胞转录组数据、蛋白质表达数据、细胞表型数据 | 公共数据集GSE57345(批量RNA-seq)、GSE145154(单细胞RNA-seq,包含4例正常对照、8例扩张型心肌病、6例缺血性心肌病梗死区、6例非梗死区样本),以及大鼠模型(对照组、HF组、HF+DAPA组各若干) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 220 | 2026-03-07 |
Identification and validation of prognostic genes related to glycolysis and M2 macrophage in hepatocellular carcinoma: an integrated analysis of bulk RNA sequencing and single-cell RNA sequencing
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1710411
PMID:41766871
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研究论文 | 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,识别并验证了与糖酵解和M2巨噬细胞相关的肝细胞癌预后基因 | 首次整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,系统性地研究了糖酵解与M2巨噬细胞在肝细胞癌进展中的相互作用,并构建了包含8个基因的预后风险模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床研究验证;RT-qPCR验证的样本量有限 | 识别与糖酵解和M2巨噬细胞相关的肝细胞癌预后基因,并阐明其潜在机制 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA测序,单细胞RNA测序,RT-qPCR | 回归分析,风险模型,列线图 | 转录组数据,单细胞转录组数据 | TCGA-LIHC数据集及公共scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |