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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-02-06 |
Novel insights into meningioma brain invasion with spatial transcriptomic profiling
2026-Jan-04, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02206-6
PMID:41486296
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探究脑膜瘤脑侵袭的分子特征,重点关注肿瘤细胞和免疫细胞在脑-瘤边界的基因表达变化 | 首次应用空间转录组学分析脑膜瘤脑侵袭的分子机制,揭示了KRT18、CSF1R等关键基因在侵袭过程中的空间特异性表达模式 | 样本量较小(16例肿瘤),需要更大规模研究验证发现;空间转录组学分辨率有限,无法达到单细胞水平 | 探究脑膜瘤脑侵袭的分子机制及其与预后的关系 | 脑膜瘤患者肿瘤组织(包括侵袭性和非侵袭性病例) | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 16例脑膜瘤肿瘤(8例侵袭性,8例非侵袭性) | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiling | NanoString GeoMx数字空间分析平台,使用1800基因panel |
| 202 | 2026-01-04 |
Exploring molecular mechanisms of radioactive iodine therapy in thyroid cancer using single-cell RNA sequencing data
2026-Jan-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04317-x
PMID:41483448
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 203 | 2026-02-06 |
Integrated experimental and computational workflows for single-cell transcriptomics in plants
2026-Jan-03, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-025-01490-6
PMID:41484617
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研究论文 | 本研究通过系统性地基准测试玉米中的批量与单细胞转录组工作流程,建立了一个优化的集成框架,以解决植物单细胞转录组学中的组织制备、核分离和转录组质量挑战 | 开发了改进的批量RNA-seq协议作为单细胞数据集的参考,比较了原生质体、新鲜核和冷冻核三种输入类型在组织中的转录组谱可比性,并利用批量RNA-seq提供额外生物背景以验证单细胞分析结果 | 所有实验数据均来自玉米,可能限制了在其他植物物种中的直接适用性 | 优化植物单细胞转录组学的实验和计算工作流程,以解决细胞异质性解析中的挑战 | 玉米组织中的细胞类型,包括原生质体、新鲜核和冷冻核 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 204 | 2026-02-06 |
Comprehensive profiling of lactylation-associated genes in pulmonary hypertension through bulk and single-cell RNA sequencing integration
2026-Jan-03, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03446-9
PMID:41484613
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,全面分析了肺动脉高压中乳酰化相关基因,并鉴定出LCP1作为核心诊断标志物 | 首次在肺动脉高压中整合bulk和单细胞RNA测序数据来系统研究乳酰化相关基因,并揭示了免疫细胞中的乳酰化水平变化 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于体外细胞模型,缺乏更深入的体内功能验证 | 探究乳酰化在肺动脉高压发生发展中的作用及其分子机制 | 肺动脉高压患者和对照组的bulk RNA-seq及单细胞RNA-seq数据,以及缺氧诱导的肺动脉平滑肌细胞 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-PCR, western blot | NA | RNA测序数据, 基因表达数据 | 来自多个数据集(GSE113439, GSE186996, GSE210248)的肺动脉高压患者和对照组样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 205 | 2026-02-06 |
SLPI⁺ AT2-Like Cells Orchestrate Lung Adenocarcinoma Invasion via Wnt Pathway Activation and Stromal Crosstalk in a Spatially Defined Margin Niche
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516580
PMID:41216859
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,揭示了肺腺癌侵袭前沿中一种表达SLPI的AT2样细胞亚群及其与肿瘤微环境中其他细胞的相互作用机制 | 首次在肺腺癌侵袭边缘鉴定出表达SLPI的AT2样细胞亚群,并阐明了其通过Wnt通路激活和与基质细胞(如MRC1+巨噬细胞和肌成纤维细胞)的空间协同作用驱动肿瘤侵袭的机制 | 研究主要基于转录组学数据,功能验证和体内实验可能有限,且样本来源和数量未在摘要中明确说明 | 探究肺腺癌侵袭过程中的关键细胞类型、空间分布及其功能相互作用 | 肺腺癌肿瘤组织,重点关注侵袭边缘的肿瘤细胞和肿瘤微环境细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 206 | 2026-02-06 |
TMEM131-Mediated Soluble TRAIL Triggered Type II Alveolar Epithelial Cell Senescence in Radiation-Induced Lung Injury
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509973
PMID:41293955
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研究论文 | 本研究揭示了TMEM131介导的可溶性TRAIL通过抑制线粒体自噬导致II型肺泡上皮细胞衰老,在辐射诱导的肺损伤发病机制中起关键作用 | 首次发现TMEM131介导TRAIL从内质网向高尔基体的运输过程,并阐明可溶性TRAIL通过死亡受体5激活mTOR通路抑制线粒体自噬的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证相对有限;TMEM131介导的运输机制在人体中的普适性需进一步验证 | 阐明辐射诱导肺损伤的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 辐射诱导肺损伤小鼠模型、II型肺泡上皮细胞、临床患者血浆样本 | 单细胞组学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序, 定量蛋白质组学, 免疫沉淀质谱 | 基因敲除小鼠模型 (Trail;Sftpc-Cre) | 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据, 免疫荧光图像 | 未明确样本数量,包含小鼠模型和临床患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 207 | 2026-02-06 |
Retinoic Acid Reprograms Mast Cells Toward a Proinflammatory State to Enhance Antitumor Immunity
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509340
PMID:41309490
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示了肥大细胞在肿瘤微环境中的异质性,并发现视黄酸信号可驱动肥大细胞向促炎表型极化,从而增强抗肿瘤免疫 | 首次系统性地描绘了十种癌症类型中肥大细胞的转录和空间异质性图谱,并鉴定出一个具有抗原呈递特征和免疫激活潜能的促炎性肥大细胞亚群,揭示了视黄酸-RARα-CIITA信号轴在肥大细胞重编程中的关键作用 | 研究主要基于转录组数据,功能验证和机制细节仍需进一步实验确认;临床相关性分析为观察性结果,需前瞻性研究验证 | 探究肥大细胞在肿瘤微环境中的分子特征、功能多样性及其对抗肿瘤免疫的调控机制 | 十种人类癌症类型中的肥大细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间数据 | 十种癌症类型的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 208 | 2026-02-06 |
High-Dimensional Profiling of Circulating Dendritic Cells and Monocytes in Atopic Dermatitis Patients by Mass Cytometry
2026-Jan, Allergy, asthma & immunology research
DOI:10.4168/aair.2026.18.1.104
PMID:41345746
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研究论文 | 本研究通过质谱流式细胞术分析了特应性皮炎患者外周血中树突状细胞和单核细胞的高维特征,揭示了cDC1频率降低和DC3特征增强的现象 | 首次利用质谱流式细胞术系统比较特应性皮炎患者与健康对照的循环树突状细胞和单核细胞亚群,并结合公共单细胞RNA测序数据和皮肤免疫荧光染色进行验证 | 样本量相对有限(48例患者和48例对照),且为横断面研究,无法确定因果关系 | 探究特应性皮炎中髓系细胞(特别是树突状细胞和单核细胞)在疾病发病机制中的作用 | 特应性皮炎患者和健康对照者的外周血单个核细胞,以及公共单细胞RNA测序数据和皮肤组织样本 | 免疫学 | 特应性皮炎 | 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | NA | 细胞计数数据,基因表达数据,图像数据 | 48例特应性皮炎患者和48例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 209 | 2026-02-06 |
Targeting SH3GL1 for prognosis and immune response in breast cancer
2026-Jan, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2025.101377
PMID:41631242
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研究论文 | 本研究识别了铜死亡相关基因SH3GL1作为乳腺癌进展和免疫调控的关键调节因子 | 首次将SH3GL1与乳腺癌的铜死亡过程、免疫微环境及免疫治疗反应联系起来,揭示了其在预后和免疫调节中的双重作用 | 研究主要基于公共数据集和体外实验,缺乏大规模临床队列验证和体内机制研究 | 探索SH3GL1在乳腺癌中的预后价值和免疫调控功能 | 乳腺癌肿瘤组织和细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 基因表达谱分析、meta分析、单细胞RNA测序、功能实验 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 210 | 2026-02-06 |
Advances in the diagnosis and treatment of oligoasthenozoospermia based on epigenetic regulation
2026 Jan-Dec, Therapeutic advances in urology
IF:2.6Q2
DOI:10.1177/17562872251414924
PMID:41631254
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综述 | 本文综述了基于表观遗传调控的少弱精子症诊断与治疗进展 | 整合基因组学、转录组学和单细胞研究,阐明DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA在少弱精子症中的作用,并评估单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序及整合多组学方法在解析细胞类型和阶段特异性调控中的应用 | NA | 提高对男性生殖细胞发育的理解,并改善生殖健康 | 少弱精子症患者及其表观遗传调控机制 | 生殖医学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 整合多组学 | NA | 基因组, 转录组, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 211 | 2026-02-06 |
Allogeneic hematopoietic stem cell transplantation for the treatment of chronic active Epstein-Barr virus infection
2026 Jan-Dec, Cell transplantation
IF:3.2Q2
DOI:10.1177/09636897251414206
PMID:41618712
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综述 | 本文综述了异基因造血干细胞移植(allo-HSCT)治疗慢性活动性EB病毒感染(CAEBV)的现状、理论基础、临床挑战及未来研究方向 | 整合了最新的单细胞测序和嵌合体研究证据,明确了EBV感染的造血干细胞是CAEBV的“种子”细胞,并基于此系统论证了allo-HSCT作为唯一可能根治性策略的理论依据,同时前瞻性地提出了“移植前病毒载量降低-移植后复发预防”的综合策略新思路 | 本文是一篇综述,未报告原始临床研究数据,其结论和建议主要基于对现有文献的总结和分析 | 探讨异基因造血干细胞移植作为慢性活动性EB病毒感染潜在根治性治疗策略的有效性、挑战及未来优化方向 | 慢性活动性EB病毒感染(CAEBV)患者 | NA | 慢性活动性EB病毒感染 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 212 | 2026-02-06 |
Single cell RNA sequencing analysis and molecular biology experiments identify NAFLD-related fibroblasts and highlights seven hub genes in NAFLD
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0332881
PMID:41628143
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结合分子生物学实验,识别了与非酒精性脂肪肝病相关的成纤维细胞亚群,并鉴定了七个关键基因 | 利用单细胞RNA测序数据识别NAFLD特异性成纤维细胞亚群,并结合多种机器学习方法筛选出七个与NAFLD发病机制相关的关键基因 | 研究基于公开数据集GSE182365,样本量可能有限,且湿实验验证主要在模型中进行,需进一步临床验证 | 探索NAFLD进展的潜在机制,识别与疾病相关的成纤维细胞亚群和关键基因 | 健康与NAFLD患者的肝脏样本 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序,机器学习算法,湿实验验证 | 高维加权基因共表达网络分析,七种机器学习方法 | 单细胞RNA测序数据 | 来自GSE182365数据集的健康与NAFLD患者肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 213 | 2026-02-06 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Biomarkers for NK Cell Dysfunction in Endometriosis-Associated Immune Dysregulation
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/9028037
PMID:41640571
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了子宫内膜异位症中NK细胞功能障碍的生物标志物,并提出了GNLY、PRF1和ENTPD1作为潜在的分子诊断标志物 | 整合单细胞RNA测序与批量RNA测序数据,结合机器学习方法识别出三个关键基因,并发现ENTPD1在免疫调节和基质细胞迁移中的双重功能 | 样本量较小(仅3名患者和3个正常样本),且验证队列的AUC值在外部验证中有所下降 | 探究子宫内膜异位症中NK细胞功能障碍的生物标志物及其在免疫失调中的作用机制 | 子宫内膜异位症患者的病变组织和正常子宫内膜样本 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qPCR, 伤口愈合实验, Transwell实验 | LASSO, SVM-RFE | RNA测序数据, 基因表达数据 | 3名子宫内膜异位症患者的病变组织, 3个正常子宫内膜样本, 以及来自GEO的三个批量RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 214 | 2026-02-06 |
VST-DAVis: an R Shiny application and web-browser for spatial transcriptomics data analysis and visualization
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag007
PMID:41640624
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研究论文 | 本文介绍了一个名为VST-DAVis的交互式R Shiny应用程序和网络浏览器,专为分析10x Genomics Visium HD平台生成的空间转录组学数据而设计 | 开发了一个用户友好的交互式工具,使无编程背景的研究者也能通过图形界面进行端到端的空间转录组学分析,并整合了多种流行的R分析包 | NA | 为空间转录组学数据分析提供一个直观、易用的分析平台 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium HD | 10x Genomics Visium HD平台 |
| 215 | 2026-02-06 |
Engineering scalable vascularized kidney organoids for in vivo glomerular filtration with human endothelial integration
2026, npj biomedical innovations
DOI:10.1038/s44385-025-00063-5
PMID:41640674
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研究论文 | 本文开发了一种可扩展的血管化肾脏类器官生产方法,用于体内肾小球滤过功能研究 | 通过动态培养环境和三角翼搅拌生物反应器,将血管化肾脏类器官的生产效率提高了50倍以上,并实现了人类内皮细胞整合的肾小球滤过功能 | NA | 开发可扩展的血管化肾脏类器官生产系统,用于肾脏疾病模型和再生医学应用 | 人类多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 组织工程与再生医学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 216 | 2026-02-06 |
Single-cell RNA sequencing revealed cell heterogeneity in sagittal suture mesenchyme
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1725375
PMID:41640972
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研究论文 | 本研究通过整合10x Genomics和Smart-seq3单细胞转录组测序技术,首次识别了矢状缝间充质中的增殖性祖细胞群,揭示了其在颅骨快速发育中的关键作用 | 首次在发育中的颅缝生态位中识别出具有瞬时扩增细胞特征的增殖性祖细胞群,并阐明了SuSCs和TACs中的关键调控基因和信号网络 | NA | 探索颅缝间充质中细胞异质性及其在颅骨发育和稳态维持中的作用机制 | 矢状缝间充质细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 5-乙炔基-2'-脱氧尿苷检测, 原位杂交, 谱系追踪 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, Smart-seq3 | 10x Genomics单细胞转录组测序与Smart-seq3技术整合 |
| 217 | 2026-02-06 |
TIMELESS Promotes LUAD Growth via Suppressing Transferrin-Mediated Ferroptosis and Reprograms the Tumor Microenvironment against Anti-PD-1 Immunotherapy
2026, Cancer communications (London, England)
DOI:10.34133/cancomm.0009
PMID:41641368
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研究论文 | 本研究揭示了RNA结合蛋白TIMELESS通过招募CNOT3加速转铁蛋白mRNA降解,从而抑制铁死亡并促进肺腺癌生长,并重塑肿瘤微环境以抵抗抗PD-1免疫治疗的分子机制 | 首次发现TIMELESS通过招募CNOT3复合物降解转铁蛋白mRNA来调控铁死亡,并阐明了其在肺腺癌生长和抗PD-1免疫治疗抵抗中的双重作用 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证相对有限;TIMELESS/TF轴在其他癌症类型中的普适性未探讨 | 阐明高表达的RNA结合蛋白TIMELESS在肺腺癌进展中的分子网络和机制作用 | 肺腺癌细胞、小鼠原位肺癌模型、临床组织微阵列样本 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | PAR-CLIP测序, RNA测序, 免疫沉淀-质谱, GST pull-down, 免疫荧光-荧光原位杂交, RNA免疫沉淀, poly(A)尾分析, RNA稳定性检测, 流式细胞术, 多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质互作数据, 组织图像数据 | 来自TCGA-LUAD、GEO和单细胞RNA测序数据集的多个数据集,以及组织微阵列样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 218 | 2026-02-06 |
Research Progress of Interstitial Lung Disease Based on Single-Cell Sequencing Technology
2026, Canadian respiratory journal
IF:2.1Q3
DOI:10.1155/carj/8863968
PMID:41641446
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综述 | 本文总结了基于单细胞测序技术在间质性肺病(ILD)研究中的最新进展,重点聚焦于特发性肺纤维化、尘肺病和结缔组织病相关ILD | 利用单细胞测序技术为揭示ILD的复杂发病机制提供了新视角,克服了传统研究方法的局限 | NA | 总结单细胞测序在ILD研究中的应用进展并展望未来研究方向 | 间质性肺病(ILD),包括特发性肺纤维化、尘肺病和结缔组织病相关ILD | 数字病理学 | 肺病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 219 | 2026-02-05 |
Monocyte-derived macrophages promote retinal damage after ischemic stroke via IL-1β-dependent mechanism
2026-Jan-30, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2026.115676
PMID:41621472
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研究论文 | 本研究揭示了单核细胞来源的巨噬细胞通过IL-1β依赖机制促进缺血性卒中后视网膜损伤 | 首次利用单细胞RNA测序结合Cx3cr1Ccr2报告小鼠和CCL2中和抗体干预,明确了卒中后视网膜中浸润的单核细胞来源巨噬细胞的扩增及其促炎表型,并证实其通过IL-1β依赖途径驱动视网膜病理 | 研究主要基于小鼠MCAO模型,人类临床相关性需进一步验证;视网膜损伤机制可能涉及其他炎症因子或细胞类型 | 探究缺血性卒中后视网膜损伤的炎症机制,特别是单核细胞来源巨噬细胞的作用 | 小鼠(包括Cx3cr1Ccr2报告小鼠和Nlrp3缺陷小鼠)的视网膜组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,免疫荧光染色,Luminex检测,TUNEL,HE染色,视网膜电图 | NA | RNA测序数据,图像数据,电生理数据 | 未明确说明具体样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 220 | 2026-02-05 |
Targeting PKMYT1 enhances antitumor immune responses to PD-L1 blockade in castration-resistant prostate cancer
2026-Jan-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013247
PMID:41617394
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研究论文 | 本研究揭示了PKMYT1在去势抵抗性前列腺癌(CRPC)中作为肿瘤进展和免疫逃逸的关键双重调节因子,并证明靶向PKMYT1可增强抗PD-L1免疫治疗的疗效 | 首次将PKMYT1鉴定为CRPC中调节肿瘤免疫微环境的关键靶点,并阐明其通过激活cGAS-STING通路和干扰素信号来增强抗肿瘤免疫应答的机制 | 研究主要基于临床前模型(细胞系和小鼠模型),尚未在人体临床试验中得到验证 | 克服CRPC对免疫治疗的耐药性,开发新的联合治疗策略 | 去势抵抗性前列腺癌(CRPC) | 肿瘤免疫学 | 前列腺癌 | 生物信息学分析、免疫组织化学、单细胞RNA测序、小鼠模型 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、单细胞转录组数据 | 公共数据库中的前列腺癌样本、临床前列腺癌标本队列、前列腺癌细胞系、同基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |