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当前共找到 2200 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-09-18 |
In Vivo CRISPR Interference Screen Reveals Long Noncoding RNA Portfolio Crucial for Cutaneous Squamous Cell Carcinoma Tumor Growth
2026-Jan, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.038
PMID:40441291
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研究论文 | 通过对正常和cSCC人类皮肤组织的单细胞测序数据进行假体分析，并结合体外和体内CRISPR干扰筛选，鉴定出影响皮肤鳞状细胞癌生长的关键长链非编码RNA | 首次通过体内CRISPR干扰筛选结合单细胞测序假体分析，系统性揭示了长链非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌生长中的调控作用，并验证了LINC00704和LINC01116作为cSCC生长调控因子和潜在生物标志物 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 揭示长链非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌生长中的调控作用和机制 | 正常和cSCC人类皮肤组织中的角质形成细胞亚群及cSCC细胞系 | 数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞测序, CRISPR干扰筛选 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 202 | 2026-09-18 |
Unraveling the Role of Perivascular Macrophages in Alzheimer's Disease: Insights from the Crosstalk between Immunometabolism and Ferroptosis
2026, Current neuropharmacology
IF:4.8Q1
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序数据和孟德尔随机化分析，揭示了阿尔茨海默病中血管周围巨噬细胞在免疫代谢与铁死亡交叉对话中的作用 | 首次从免疫代谢与铁死亡交叉对话的角度，结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法，系统揭示血管周围巨噬细胞在阿尔茨海默病中的保护性机制，并鉴定出八个关键因果基因 | 研究主要基于公共数据库的生物信息学分析，缺乏实验验证；样本量有限；未进行体内外功能实验证实关键基因的具体机制 | 探究血管周围巨噬细胞在阿尔茨海默病发病机制中的作用，特别是免疫代谢与铁死亡交叉对话相关的分子通路 | 阿尔茨海默病患者和对照受试者的血管周围巨噬细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化 | NA | 文本, 基因表达数据 | 来自GEO数据库的阿尔茨海默病患者和对照受试者的血管周围巨噬细胞单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 203 | 2026-09-17 |
Single-cell transcriptomics reveals distinct microglial state remodeling associated with the (R)-nicotine/diosmetin combination and galantamine in LPS-challenged BV2 cells
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1901868
PMID:42745774
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组学揭示了(R)-尼古丁/地奥司明联合用药与加兰他敏在LPS刺激的BV2细胞中诱导的不同小胶质细胞状态重塑。 | 首次在单细胞分辨率上比较了(R)-尼古丁、地奥司明、其联合用药(DR)及加兰他敏对LPS刺激BV2小胶质细胞异质性转录状态的影响，并结合RNA velocity与SCENIC调控子推断揭示了不同治疗相关的转录与调控模式差异。 | 研究使用BV2小胶质细胞样细胞系而非原代小胶质细胞或体内模型，可能无法完全反映体内小胶质细胞的复杂性与微环境相互作用。 | 在单细胞分辨率上比较(R)-尼古丁、地奥司明、其联合用药及加兰他敏对LPS刺激的BV2小胶质细胞异质性转录状态的重塑作用。 | LPS刺激的BV2小胶质细胞样细胞 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 每组3个生物学重复，共4组（LPS对照、(R)-尼古丁、地奥司明、DR联合用药、加兰他敏），共12个样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 204 | 2026-09-17 |
Donor-dependent heterogeneity and matrix-remodeling transcriptional programs in COL2A1-variant urine-derived cell cultures with IGF1-associated cell-state shifts
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1920598
PMID:42745831
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研究论文 | 该研究通过软骨诱导尿液来源细胞（chUDCs）比较COL2A1变异患者与健康对照的转录组差异，并探索IGF1对细胞状态的影响 | 首次利用COL2A1变异患者来源的尿液衍生细胞进行软骨诱导，结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq揭示供体依赖性异质性和基质重塑转录程序，并发现IGF1相关细胞状态转变 | 未对IGF1处理的对照供体细胞系进行单细胞测序分析，因此IGF1相关变化仅为探索性结果，不能声称是COL2A1特异性效应；样本量较小（3例患者和3例对照） | 探索COL2A1相关生长障碍中软骨生物学和生长因子响应性的转录程序 | 携带杂合致病性COL2A1变异的个体的尿液来源细胞及健康对照的尿液来源细胞 | 数字病理学, 机器学习 | COL2A1相关骨骼发育不良 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 文本, 图像 | 3例COL2A1变异患者和3例健康对照的尿液来源细胞，其中2例患者来源细胞系进行了单细胞RNA测序 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 205 | 2026-09-17 |
Network-informed deconvolution of bulk immune gene co-expression reveals single-cell programs and spatial organization
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1843602
PMID:42745838
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研究论文 | 该研究开发了一种网络信息引导的解卷积框架，利用批量RNA-seq数据构建免疫相关基因的贝叶斯网络调控结构，并将其投影到单细胞RNA-seq数据上以识别免疫细胞状态，同时结合空间转录组学评估其空间一致性 | 提出了一种网络信息引导的解卷积框架，利用贝叶斯网络从批量RNA-seq数据中提取调控结构，并将网络标志物投影到单细胞数据中以定义免疫细胞状态，而非仅依赖传统的基于表达的聚类分析，同时整合了批量转录组、单细胞转录组和空间转录组三个尺度的数据 | 摘要中未明确说明该研究的局限性 | 开发一种网络信息引导的解卷积框架，以识别免疫细胞亚群并表征其功能，同时将批量免疫基因共表达、单细胞程序和空间组织联系起来 | 外周血单个核细胞（PBMC）和肺腺癌（LUAD）单细胞RNA-seq数据集，以及空间转录组数据集和背景匹配的批量RNA-seq队列 | 机器学习 | 肺癌 | scRNA-seq, 批量RNA-seq, 空间转录组学 | 贝叶斯网络 | 文本（基因表达数据） | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 206 | 2026-09-17 |
PAFAH1B1 governs follicular development by modulating the protein complex of CCNE1-CDK2-CDK1 to induce cell cycle arrest
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1919659
PMID:42745890
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和整合分析发现PAFAH1B1参与细胞周期调控，并证实PAFAH1B1通过结合CCNE1-CDK2-CDK1复合物阻滞G2/M期，从而抑制颗粒细胞增殖和卵泡发育 | 首次在猪基因型-组织表达数据库中发现PAFAH1B1作为细胞周期的新型调控因子，揭示了PAFAH1B1通过物理结合CCNE1-CDK2-CDK1复合物阻滞G2/M期来抑制颗粒细胞增殖和卵泡发育的新机制，并证明了CpG岛去甲基化可促进PAFAH1B1转录 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究卵泡发育过程中颗粒细胞增殖和细胞周期调控的分子机制，鉴定参与细胞周期调控的新基因 | 猪卵巢颗粒细胞和卵泡 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，免疫共沉淀，流式细胞术，EdU染色，HE染色，TUNEL检测，染色质可及性分析，CRISPR/dCas9-TET1表观遗传编辑 | NA | 图像，文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 207 | 2026-09-17 |
Identification of Wnt/β-catenin- and immune-related genes in hepatic ischemia-reperfusion injury using bulk transcriptomics, single-cell RNA sequencing, and a murine model
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1745640
PMID:42745923
|
研究论文 | 该研究通过整合肝脏移植相关转录组数据集与单细胞RNA测序数据，结合小鼠肝缺血再灌注损伤模型，筛选并验证了与Wnt/β-catenin信号通路评分和免疫调控相关的关键基因HSP90AA1、HSP90AB1、NFATC1和THBS1 | 首次联合bulk转录组学、单细胞RNA测序和非移植小鼠HIRI模型，基于Wnt/β-catenin信号评分和免疫调控整合分析，识别并验证了HSP90AA1、HSP90AB1、NFATC1和THBS1四个关键生物标志物，并构建了TF-mRNA及lncRNA-miRNA-mRNA调控网络 | 非移植小鼠HIRI模型仅提供初步表达验证，关键基因的时间依赖性意义和 therapeutic 价值仍需在肝移植模型及基因功能干预实验中进一步验证 | 筛选与肝移植后肝缺血再灌注损伤中Wnt/β-catenin信号评分和免疫调控相关的关键基因 | 肝移植相关肝缺血再灌注损伤患者转录组数据及非移植小鼠HIRI模型 | 数字病理学 | 肝移植相关肝缺血再灌注损伤 | bulk转录组测序, 单细胞RNA测序, qPCR, Western blot, 组织学分析, 血清学评估 | WGCNA, Boruta, LASSO, CIBERSORT | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像, 文本 | 三个肝移植相关转录组数据集（GSE151648、GSE12720、GSE189539）及非移植小鼠HIRI模型样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 208 | 2026-09-17 |
Tekt2 regulates hair cell development and function by maintaining normal kinocilium morphology in zebrafish
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1898887
PMID:42745927
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序、原位杂交、基因功能缺失与拯救实验、行为学检测、扫描电镜和FM染料摄取等方法，揭示了Tekt2在斑马鱼感觉毛细胞中通过维持动纤毛正常形态来调控毛细胞发育与功能的作用 | 首次系统阐明Tekt2在斑马鱼感觉毛细胞中富集于毛细胞顶端和动纤毛，并证明其缺失会导致动纤毛形态异常、毛束组织紊乱、顶端极性破坏及机械转导功能受损，明确了tektin家族蛋白在感觉毛细胞形态发生和功能中的关键作用 | 研究主要基于斑马鱼模型，未在哺乳动物或人类毛细胞中验证Tekt2功能的保守性，且对Tekt2调控动纤毛形态的具体分子机制探讨尚不深入 | 探究tektin 2（tekt2）在斑马鱼感觉毛细胞中的表达模式及其在毛细胞形态发生、动纤毛维持和机械转导功能中的作用 | 斑马鱼的感觉毛细胞，包括神经丘、斑和嵴中的毛细胞 | 发育生物学、听力与平衡觉研究 | 听力障碍、前庭功能障碍 | 单细胞RNA测序、整胚原位杂交、基因功能缺失与拯救分析、行为学检测、扫描电子显微镜、FM染料摄取实验 | 斑马鱼基因敲除与转基因拯救模型 | 图像、文本、行为学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 209 | 2026-09-17 |
Complement expression profiles in human glomerular mesangial cells, endothelial cells, podocytes and proximal tubular epithelial cells
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1881549
PMID:42746023
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研究论文 | 该研究综合表征了非疾病人肾组织中肾小球系膜细胞、肾小球内皮细胞、足细胞和近端肾小管上皮细胞中补体成分的表达谱 | 首次系统全面地比较了四种人肾固有细胞中经典途径、凝集素途径和替代途径相关补体成分及其调控因子的表达特征，并结合培养细胞实验与单细胞RNA测序数据进行了验证 | 研究主要基于体外培养细胞和公共数据库及单细胞测序数据，缺乏蛋白质水平的全面验证，且仅关注非疾病肾组织，未涉及疾病状态下的补体表达变化 | 全面表征非疾病人肾组织中四种肾固有细胞的补体成分表达谱 | 人肾小球系膜细胞、肾小球内皮细胞、足细胞和近端肾小管上皮细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RT-PCR、免疫荧光染色、单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | 四种人肾固有细胞（培养细胞）及公共单细胞RNA测序数据集中的非疾病人肾组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序 |
| 210 | 2026-09-17 |
Aqueous humour extracellular vesicle membrane protein profiling reveals pathological features of refractory macular edema
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1880885
PMID:42746022
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研究论文 | 本研究通过分析房水来源的细胞外囊泡膜蛋白，揭示了难治性糖尿病性黄斑水肿和视网膜静脉阻塞相关黄斑水肿的不同病理特征和通路 | 首次利用EV Array芯片对房水细胞外囊泡膜蛋白进行高通量分析，发现了难治性DME和RVO-ME的病因特异性通路的差异，并鉴定出可高精度区分难治性病例的EV蛋白标志物 | 样本量较小（共28例患者），需要更大规模的队列研究验证；仅分析了膜蛋白，未涵盖EV其他组分；随访时间未明确 | 探究房水来源的细胞外囊泡膜蛋白能否表征黄斑水肿对抗VEGF治疗的难治性，并揭示不同病因的特异性通路 | 28例DME或RVO-ME患者（各14例），分为初治亚组和难治亚组 | 数字病理学 | 黄斑水肿 | EV Array芯片蛋白组学分析、生物信息学分析、单细胞RNA-seq数据分析 | NA | 蛋白表达数据、文本 | 28例患者房水样本（14例DME，14例RVO-ME） | NA | bulk RNA-seq | EV Array芯片（435抗体） | EV Array芯片靶向435种抗体进行细胞外囊泡膜蛋白谱分析，并利用公共单细胞RNA-seq数据进行细胞来源映射 |
| 211 | 2026-09-17 |
Spatial immune biomarkers in triple-negative breast cancer: emerging evidence, technology trade-offs, and barriers to clinical translation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1899098
PMID:42746148
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综述 | 本文综述了三阴性乳腺癌中空间免疫生物标志物的研究进展，比较了多种空间成像与转录组技术，并讨论了其临床转化的障碍 | 系统梳理了TNBC中空间免疫生物标志物的新兴证据，并对多重免疫荧光、MIBI-TOF、成像质谱流式、空间转录组学和基于H&E的人工智能等技术进行了多维度比较，指出了临床转化面临的采样、分割和阈值选择等挑战 | 大多数报告的预后或治疗反应关联仍为回顾性或探索性，标志物定义对采样、分割和阈值选择敏感，缺乏前瞻性验证 | 探讨三阴性乳腺癌中空间免疫生物标志物的研究现状、技术权衡及临床转化障碍 | 三阴性乳腺癌患者的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学, 空间生物学 | 三阴性乳腺癌 | 多重免疫荧光, 飞行时间多重离子束成像, 成像质谱流式, 空间转录组学, 基于H&E的人工智能 | 人工智能 | 图像, 空间转录组数据 | NA | NA | 多重免疫荧光, 飞行时间多重离子束成像, 成像质谱流式, 空间转录组学 | NA | NA |
| 212 | 2026-09-17 |
Multi-omics and machine learning reveal LYZ and ISG15 as diagnostic and therapeutic targets in autoimmune-mediated chronic kidney disease
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1922463
PMID:42746275
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研究论文 | 该研究整合转录组学、单细胞RNA测序和机器学习方法，识别出LYZ和ISG15作为自身免疫介导的慢性肾脏病的诊断生物标志物和治疗靶点，并通过动物模型验证了槲皮素和全反式维甲酸的治疗效果 | 首次通过多算法整合（LASSO、随机森林、Boruta和MCODE）结合多组学数据系统鉴定LYZ和ISG15作为自身免疫介导CKD的核心诊断标志物，并发现槲皮素和ATRA可靶向逆转其过表达从而减轻肾脏纤维化 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 系统识别参与自身免疫介导的慢性肾脏病进展的关键特异性基因，寻找早期诊断生物标志物和特异性治疗靶点 | 自身免疫介导的慢性肾脏病患者样本及IRI小鼠模型 | 机器学习 | 慢性肾脏病 | 转录组学、单细胞RNA测序 | LASSO、随机森林、Boruta、人工神经网络（ANN） | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 213 | 2026-09-16 |
Expression profile of GSDMB in oral squamous cell carcinoma and its impact on tumor immune microenvironment and prognosis
2026-01-30, BMC oral health
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12903-026-07781-1
PMID:41612289
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法结合体外实验，分析了GSDMB在口腔鳞状细胞癌中的表达特征及其对肿瘤免疫微环境和预后的影响 | 首次系统研究GSDMB在口腔鳞状细胞癌中的表达谱，结合多组学数据和单细胞及空间转录组数据，揭示GSDMB与肿瘤突变负荷、免疫微环境及药物敏感性的关联，并通过体外实验验证GSDMB敲低对5-FU敏感性的影响 | 主要依赖生物信息学预测和体外细胞实验，缺乏体内动物模型和临床大样本验证 | 探究GSDMB在口腔鳞状细胞癌中的表达模式及其潜在生物学功能，评估其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 口腔鳞状细胞癌细胞系SCC25及公共数据库中的口腔鳞状细胞癌样本 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | 图像, 文本 | SCC25细胞系及公共数据库中口腔鳞状细胞癌样本，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 214 | 2026-09-16 |
Integrated multi-omics identifies MCRS1 as a causal hub linking aging, metabolic syndrome, and breast cancer progression
2026-Jan-20, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004592
PMID:41556158
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研究论文 | 本研究整合多组学数据，鉴定出MCRS1作为连接衰老、代谢综合征和乳腺癌进展的因果核心枢纽分子 | 首次通过整合转录组学、机器学习、孟德尔随机化和单细胞RNA测序，将MCRS1确立为连接衰老和代谢综合征与乳腺癌发病的因果核心分子枢纽，并进行了全面的临床前验证 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 鉴定并验证位于衰老、代谢综合征和乳腺癌交叉点的因果驱动分子 | 乳腺癌、代谢综合征和衰老队列的转录组数据集及乳腺癌细胞和C57BL/6小鼠模型 | 机器学习 | 乳腺癌 | 转录组学、机器学习、孟德尔随机化、单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据、图像（单细胞数据） | NA | NA | 单细胞RNA测序、批量转录组学 | NA | NA |
| 215 | 2026-09-16 |
Deciphering CD4+ Naive T cell-mediated divergent pathogenic links between type 2 diabetes and pathologic scarring via an integrated multi-omics approach
2026-Jan-19, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004905
PMID:41556164
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研究论文 | 该研究通过整合多组学方法，揭示了2型糖尿病与病理性瘢痕（增生性瘢痕和瘢痕疙瘩）之间的差异性因果关联，并阐明CD4+初始T细胞介导的免疫细胞机制和关键分子调控因子 | 首次采用整合多组学方法（包括MR-PheWAS、MR-Meta、单细胞RNA测序、细胞间通讯推断、代谢通路分析和转录组差异表达分析）揭示T2D对增生性瘢痕和瘢痕疙瘩的相反因果效应，并鉴定出CD4+初始T细胞及其关键基因（GPR35、TMEM91、ZBTB32）在其中的介导作用 | 摘要中未提及具体局限性 | 研究糖尿病与病理性瘢痕（增生性瘢痕和瘢痕疙瘩）之间的因果关系，并阐明其潜在的免疫细胞机制和关键分子调控因子 | 糖尿病（1型和2型）与病理性瘢痕（增生性瘢痕和瘢痕疙瘩） | 机器学习, 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 全表型组关联研究, 细胞间通讯推断, 代谢通路分析, 转录组差异表达分析 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 216 | 2026-09-16 |
New insight into the risk stratification and treatment priority of breast cancer: TMT scoring system
2026-Jan-13, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004615
PMID:41427575
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研究论文 | 该研究基于17个核心基因构建了肿瘤线粒体转移（TMT）评分系统，用于评估乳腺癌的风险分层和治疗优先级 | 首次提出基于17个核心基因的TMT评分系统，结合多细胞和单细胞分辨率揭示线粒体转移与肿瘤微环境的关联 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发创新的预后工具以改善乳腺癌患者的预后评估和治疗策略 | 乳腺癌患者及其肿瘤样本 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、共培养实验 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 217 | 2026-09-16 |
Extracellular matrix-derived mechanical force induces CDK4/6 inhibitor resistance by inhibiting NEK10 dependent cell cycle regulation in breast cancer
2026-Jan-12, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004527
PMID:41427545
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研究论文 | 该研究探讨了细胞外基质来源的机械力通过抑制NEK10依赖的细胞周期调控，诱导乳腺癌对CDK4/6抑制剂产生耐药性 | 首次揭示细胞外基质来源的生物力学信号通过细胞骨架依赖途径下调NEK10表达，进而抑制NEK10/p53/CDKN1A轴并激活CDK2信号，从而介导CDK4/6抑制剂耐药；提出NEK10作为乳腺癌治疗潜在靶点，并证明CDK4/6与CDK2联合抑制可改善NEK10低表达乳腺癌的疗效 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 研究细胞外基质来源的生物力学信号在HR+/HER2-乳腺癌中介导CDK4/6抑制剂耐药的作用及其分子机制 | HR+/HER2-乳腺癌细胞、乳腺癌类器官、乳腺癌患者样本 | 肿瘤生物学、单细胞测序 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、Western blotting | NA | 基因表达数据、图像、文本 | 23例乳腺癌患者的单细胞测序数据、TCGA数据库中1092例患者数据、25例临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 218 | 2026-09-16 |
Integrative multi-omics and radiogenomic profiling decodes NNK-related tumor remodeling and prognostic stratification in pancreatic cancer
2026-Jan-07, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004732
PMID:41504500
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研究论文 | 该研究通过整合多组学和影像基因组学分析，揭示了烟草特异性致癌物NNK与胰腺癌进展的关系，并构建了基于CT的影像组学模型来无创解码NNK相关的分子改变 | 首次整合毒理基因组学挖掘、多队列转录组分析、单细胞RNA测序和CT影像组学，构建了NNK相关的ITGA3引导的影像组学模型（NIR评分），实现了对环境致癌物暴露与肿瘤影像表型之间关联的无创解码 | 研究未明确说明样本量的具体数量及队列来源的多样性限制，影像组学模型的外部验证仍需更大规模的前瞻性队列研究加以证实 | 阐明烟草特异性致癌物NNK与胰腺癌进展的关系，并开发基于CT的影像组学模型以无创方式解码NNK相关的分子改变 | 胰腺癌患者及其NNK相关的基因表达数据和CT影像数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 毒理基因组学挖掘、转录组分析、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA测序、CT影像组学 | 多算法机器学习框架、Cox比例风险模型 | 图像、文本（基因表达数据） | NA | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA-seq | NA | NA |
| 219 | 2026-09-16 |
Prediction of Clinical Outcomes and Immunotherapy Response in Breast Cancer Based on T Cell-Mediated Tumor Killing-Related Traits
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
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研究论文 | 本研究基于T细胞介导的肿瘤杀伤相关基因构建乳腺癌预后风险模型，预测患者生存结局和免疫治疗反应 | 首次基于T细胞介导的肿瘤杀伤（TTK）相关特征构建了包含HOXC13、KDELR2、POP1、PGK1和ZIC2五个基因的乳腺癌预后风险模型，并结合单细胞RNA测序和细胞功能实验验证了关键基因的生物学功能 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，缺乏前瞻性临床试验验证；风险模型的临床转化应用仍需进一步多中心大样本研究证实 | 识别T细胞介导的肿瘤杀伤相关预后生物标志物，预测乳腺癌患者的生存结局和免疫治疗反应 | 乳腺癌（BRCA）患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | LASSO回归, 单因素Cox回归, WGCNA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA乳腺癌队列（训练集）和GSE20685队列（外部验证集），具体样本量未在摘要中明确说明 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 220 | 2026-09-16 |
Biomarkers of mitochondrial dynamics in idiopathic pulmonary fibrosis: Identification and validation through transcriptomic and single-cell analyses
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0347845
PMID:42024670
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研究论文 | 该研究整合批量转录组、单细胞RNA测序数据，利用机器学习模型筛选并验证特发性肺纤维化中与线粒体动力学相关的候选生物标志物CD247、IL7R和RETN | 首次系统整合多组学数据与101种机器学习模型组合，识别并验证IPF中线粒体动力学相关生物标志物CD247、IL7R和RETN，揭示其细胞类型特异性及调控网络 | 独立临床验证队列规模有限，单细胞分析仅基于一个公开数据集，分子对接结果仅为预测性，缺乏直接的功能实验验证 | 系统识别并验证特发性肺纤维化中与线粒体动力学相关的候选生物标志物，并表征其细胞类型特异性及潜在调控关系 | 特发性肺纤维化患者及相关的批量转录组数据集、单细胞RNA测序数据和独立临床队列样本 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、RT-qPCR | 随机森林、LASSO、支持向量机、人工神经网络 | 转录组数据、单细胞表达数据、临床样本表达数据 | 多个GEO批量转录组数据集、一个公开单细胞RNA测序数据集以及一个小规模独立临床队列 | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq | NA | NA |