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当前共找到 1921 篇文献,本页显示第 201 - 220 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
201 2026-06-23
SPP1 as a Critical Regulator of Cardiac Cell Reprogramming Following Myocardial Infarction Through Single-Cell Transcriptomic Analysis
2026, Human mutation IF:3.3Q2
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示SPP1在心肌梗死后心脏细胞重编程中的关键调控作用 结合26种机器学习算法与单细胞转录组数据,首次识别SPP1作为心肌梗死后心脏修复的关键调控因子,并发现两种具有不同修复轨迹的心肌细胞重编程亚型 发现需要在独立临床队列和更生理相关的实验系统中验证 阐明急性心肌梗死后心肌细胞重编程的分子机制及潜在治疗靶点 急性心肌梗死患者的心肌细胞及H9c2心肌母细胞模型 机器学习 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA测序 机器学习算法 基因表达数据 276个基因,来自急性心肌梗死患者的批量及单细胞RNA测序样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
202 2026-06-23
Multiomics Biomarkers for Differential Diagnosis of Pleural Effusion: Integration of Proteomic Markers and Single-Cell Transcriptomics
2026, Human mutation IF:3.3Q2
研究论文 整合蛋白质组标志物与单细胞转录组学分析,建立胸腔积液鉴别诊断的多组学生物标志物模型,并揭示疾病特异性免疫机制及突变驱动的治疗机会 首次将蛋白质组生物标志物、单细胞转录组学与基因组突变谱整合,构建顺序多标志物算法,实现胸腔积液高准确度鉴别诊断,并发现EGFR突变与免疫抑制微环境的关联 单中心研究设计、样本量相对有限(564例),且未对诊断模型进行外部验证 评估整合蛋白质组标志物、单细胞转录组学与基因组突变谱对胸腔积液鉴别诊断的准确性及机制解析能力 胸腔积液患者(包括炎性、结核性及恶性胸腔积液) 计算生物学 胸腔积液 单细胞RNA测序、靶向下一代测序(NGS)、蛋白质标志物检测 顺序多标志物算法 基因表达数据、突变数据、蛋白质标志物浓度数据 564例胸腔积液患者(炎性95例,结核性299例,恶性170例) Illumina 单细胞RNA测序、靶向测序 Illumina NovaSeq 单细胞RNA测序和靶向下一代测序(涵盖15个癌症相关基因)
203 2026-06-23
Integrated RNA-seq and scRNA-seq to explore the biological mechanisms of mitophagy-related genes in ulcerative colitis
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 整合RNA-seq和scRNA-seq数据探究线粒体自噬相关基因在溃疡性结肠炎中的生物学机制并构建诊断模型 首次通过多组学整合分析(RNA-seq和scRNA-seq)联合免疫浸润评估,系统揭示线粒体自噬相关基因在溃疡性结肠炎中的作用机制,并建立基于logistic回归的高精度诊断模型 研究仅基于公共数据库数据进行生物信息学分析,小鼠模型验证结果需进一步在临床样本中验证;构建的诊断模型有待大规模前瞻性队列验证其临床实用性 探索线粒体自噬对溃疡性结肠炎的影响并建立诊断模型 溃疡性结肠炎患者、健康对照者以及小鼠结肠炎模型 生物信息学 溃疡性结肠炎 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, Western blot logistic回归模型, 加权基因共表达网络分析 转录组数据 公共数据库中UC患者和健康对照的转录组数据集 NA 常规RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
204 2026-06-23
Single-cell RNA sequencing identifies microglial state changes associated with iTBS after ischemia-reperfusion injury
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序鉴定间歇性θ爆发刺激(iTBS)在大鼠脑缺血再灌注损伤后与小胶质细胞状态变化相关的机制 首次在单细胞水平上揭示iTBS通过改变小胶质细胞转录状态(如Vav3和Cblb基因变化)来减轻神经功能障碍,并协调其他细胞群的反应 研究仅限于大鼠模型,且iTBS的具体生物学机制尚未完全阐明,未来需进一步探索神经炎症过程 阐明iTBS在脑卒中后神经保护中的细胞水平作用机制 大脑中动脉闭塞(MCAO)大鼠模型中的神经细胞(特别是小胶质细胞) 单细胞转录组学 脑缺血再灌注损伤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 大鼠模型,但具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Genomics单细胞RNA测序技术(具体型号未明确)
205 2026-06-23
Single-cell extracellular vesicle-program scoring maps immunometabolic rewiring and immune crosstalk of mesenchymal stromal cells in intervertebral disc degeneration, prioritizing AP2S1 and CSTB
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,研究间充质干细胞来源的细胞外囊泡相关转录程序在椎间盘退变中的免疫代谢重编程和免疫串扰作用,并优先考虑AP2S1和CSTB 首次在单细胞分辨率下描绘间充质干细胞胞外囊泡相关程序,并将其置于免疫通信和免疫代谢框架中,通过共识LASSO/SVM-RFE工作流程优先考虑候选调控因子 未提及 了解间充质干细胞胞外囊泡相关转录程序在椎间盘退变中的免疫代谢重编程和免疫串扰作用 椎间盘退变患者的髓核样本中的间充质干细胞 机器学习 椎间盘退变 单细胞RNA测序,RT-qPCR LASSO,SVM-RFE 基因表达数据 8个椎间盘退变样本和3个对照髓核样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
206 2026-06-23
Machine learning integration of bulk and single-cell RNA-Seq data reveals COPS2 as a central immune regulator in deep vein thrombosis
2026, American journal of translational research IF:1.7Q4
研究论文 通过机器学习和多组学整合分析,揭示COPS2是深静脉血栓中的关键免疫调节因子 首次利用蛋白质组全孟德尔随机化、免疫细胞介导分析、批量与单细胞转录组学及机器学习相结合的多组学策略,系统性鉴定COPS2在深静脉血栓中的免疫-内皮交互调控作用,并验证其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限、功能验证仅在内皮细胞中进行、动物模型与人类的差异等 识别深静脉血栓中失调的免疫-内皮交互的上游分子调控因子 深静脉血栓(DVT)患者及动物模型中的血浆蛋白、免疫细胞(效应记忆CD8 T细胞)和内皮细胞 机器学习 深静脉血栓 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 机器学习模型 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 多个独立队列 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
207 2026-06-23
Metabolic Subtypes Predict Treatment Response in Acute Myeloid Leukemia: A Pilot Study
2026, Blood and lymphatic cancer : targets and therapy
研究论文 基于纵向代谢组学与多组学整合建立急性髓系白血病的动态代谢亚型系统,并评估其预测治疗反应的能力 首次提出基于代谢通路的动态亚型(G1/G2和TG1/TG2)分类系统,并结合单细胞和空间转录组学揭示代谢重编程与化疗耐药之间的细胞机制关联 样本量较小(29例患者),且缺乏前瞻性验证队列 建立并验证基于动态代谢亚型的急性髓系白血病治疗反应预测系统 急性髓系白血病患者 机器学习 急性髓系白血病 代谢组学、转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 代谢组学数据、转录组数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 内部队列29例患者;外部验证队列共994例(Beat2、GSE6891、GSE37642) NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
208 2026-06-23
Evidence of Sertoli cell lineage contribution to the rete testis population during embryonic development
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 通过嵌合器官培养和单细胞RNA测序分析,证明胚胎发育过程中支持细胞谱系可贡献于睾丸网细胞群 首次提出支持细胞谱系可分化为近端睾丸网细胞,并揭示远端睾丸网通过局部信号调控这一过程,更新了睾丸网形态发生的传统模型 研究主要基于小鼠模型,人类睾丸发育的普适性需进一步验证;器官培养实验存在潜在的人为干扰因素 探究胚胎发育过程中支持细胞谱系是否贡献于睾丸网细胞群的起源 E12.5-E16.5小鼠胚胎泌尿生殖复合体中的支持细胞和睾丸网细胞 发育生物学 NA 嵌合器官培养、单细胞RNA测序、RNA速度分析、配体-受体介导的细胞通讯推断 RNA速度模型和配体-受体网络分析 基因表达数据 E12.5-E16.5小鼠胚胎的多个时间点样本,具体数量未明确说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于已发表数据集的重新分析
209 2026-06-23
Integrated Single-Cell and Bulk Transcriptomic Analysis Reveals an Endothelial Gene Signature Shaping EndMT and Prognosis in Hepatocellular Carcinoma
2026, Human mutation IF:3.3Q2
研究论文 通过整合单细胞与批量转录组分析,揭示了一个内皮基因特征在肝细胞癌中塑造内皮-间质转化及预后 首次整合单细胞RNA测序与多组学分析,构建基于19个内皮相关基因的预后模型,并利用肝癌-血管类器官共培养系统模拟内皮-间质转化过程,验证特定基因的空间共定位 NA 探索内皮细胞在肝细胞癌进展中的作用,特别是内皮-间质转化过程及其分子机制,并评估内皮相关基因在预后中的应用 肝细胞癌中的内皮细胞及其相关基因 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序, 多组学分析, LASSO回归, 类器官培养 NA 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
210 2026-06-23
High-Altitude Hypoxic Preconditioning Attenuates Lipopolysaccharide-Induced Lung Injury and is Associated with Alveolar-Capillary Barrier Maintenance
2026, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究探讨高原缺氧预处理对脂多糖诱导的肺损伤的保护作用及其与肺泡-毛细血管屏障维持的关联 首次通过单细胞RNA测序揭示高原缺氧预处理对肺泡-毛细血管屏障中内皮细胞、上皮细胞和巨噬细胞转录特征的协调变化 未明确说明具体限制 研究高原缺氧预处理对脂多糖挑战下肺泡-毛细血管屏障保护的影响及相关细胞转录特征 大鼠模型及其肺部细胞(内皮细胞、上皮细胞、巨噬细胞) 机器学习 肺损伤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 大鼠模型分为四组(C、CL、H、HL),具体数量未说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
211 2026-06-23
Development and Validation of an m6A-Derived Prognostic Signature in Lung Adenocarcinoma
2026, Journal of Cancer IF:3.3Q2
research paper 基于m6A相关基因开发并验证了一种肺腺癌预后特征模型 整合了47个m6A相关基因,通过无监督共识聚类和LASSO-Cox回归构建八基因预后模型,并结合免疫浸润、肿瘤突变负荷、免疫治疗反应和单细胞RNA测序进行综合验证 NA 开发一种基于m6A修饰的预后特征模型,用于肺腺癌患者风险分层和治疗反应预测 肺腺癌患者 machine learning lung cancer RNA-seq LASSO-Cox regression transcriptomic data 多个大规模队列 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
212 2026-06-23
SCpubr: a user-friendly R-package for generating publication-ready visualizations of single-cell transcriptome analyses
2026, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 介绍SCpubr,一个用于生成单细胞转录组分析中高质量出版级可视化的R包 提供简洁函数调用,将标准分析输出直接转为符合期刊要求的可视化图形,降低用户自定义难度 未在文中明确提及,推测可能依赖Seurat和ggplot2,对不熟悉这些工具的开发者可能有限制 开发一个用户友好的R包,简化单细胞转录组分析结果的可视化过程 单细胞转录组数据分析中的图表生成 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
213 2026-06-23
MGST1 drives lymph node metastasis in papillary thyroid carcinoma via mitochondrial metabolic reprogramming and immune suppression
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多组学整合分析发现MGST1通过线粒体代谢重编程和免疫抑制驱动甲状腺乳头状癌淋巴结转移 首次揭示MGST1在甲状腺乳头状癌中连接线粒体代谢重编程、免疫逃逸与淋巴结转移,并建立基于MGST1的转移风险分层模型 文章未明确提及具体局限性 探究甲状腺乳头状癌淋巴结转移中线粒体代谢重编程和免疫逃逸的驱动机制及可干预靶点 甲状腺乳头状癌肿瘤组织及细胞样本 机器学习 甲状腺乳头状癌 转录组测序, 单细胞RNA测序 共识机器学习框架 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 TCGA/GTEx综合数据集及大型独立临床队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
214 2026-06-23
Immune cell senescence and chronic bone diseases: osteoimmune mechanisms and therapeutic perspectives
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了免疫细胞衰老在慢性骨疾病中的作用机制,包括骨免疫微环境失调及不同疾病中的特异性表现 系统总结了免疫细胞衰老在不同慢性骨疾病(如骨质疏松、骨关节炎、类风湿关节炎和糖尿病相关骨病)中的差异性与共同致病机制,并提出了未来整合单细胞测序、空间转录组学和多组学方法的研究方向 目前针对免疫细胞衰老的干预策略仍处于临床前或早期转化阶段,缺乏成熟的临床应用方案 揭示免疫细胞衰老通过骨免疫机制驱动慢性骨疾病的病理过程,并探讨潜在治疗策略 免疫细胞(包括巨噬细胞、T细胞、B细胞等)在骨微环境中的衰老变化及其对慢性骨疾病的影响 机器学习 骨质疏松症, 骨关节炎, 类风湿关节炎, 糖尿病相关骨病 NA NA NA NA NA NA NA NA
215 2026-06-23
Comprehensive analysis of the TGF-β signaling pathway: molecular mechanisms, disease drivers, and frontiers in clinical translation
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 全面分析TGF-β信号通路在免疫稳态、纤维化及肿瘤进展中的多维机制、治疗靶点前景与临床转化挑战 系统整合单细胞组学与空间转录组学揭示TGF-β信号在不同细胞谱系中的动态特征,并探讨基于患者分层、精准纳米递送和联合治疗的临床转化新方向 TGF-β靶向治疗仍面临毒副作用和疾病阶段依赖性等挑战,且临床转化效果需进一步验证 阐明TGF-β信号通路在免疫调节、纤维化和肿瘤中的分子机制,评估其作为治疗靶点的前景与局限性 TGF-β信号通路的分子机制、疾病驱动因素及临床转化前沿 机器学习 纤维化, 肿瘤 单细胞组学, 空间转录组学 NA 文本 NA 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'端测序, 10x Visium石蜡包埋组织空间转录组学
216 2026-06-23
Identification and analysis of diagnostic senescence-related gene signatures for acute myocardial infarction based on multi-omics data and machine learning
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 基于多组学数据和机器学习识别急性心肌梗死诊断相关的衰老基因特征并构建多维度模型 整合转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序及小鼠模型等多维度数据,首次构建基于衰老相关基因(FOS、SOD2、MXD1、GRN)的急性心肌梗死诊断分类器、患者分层系统和衰老评分系统 研究样本量有限,且模型仍需在更大规模的前瞻性队列中进行验证;衰老评分与中性粒细胞浸润的相关性仅为中度,机制尚未完全阐明 识别急性心肌梗死相关的衰老基因并建立多维度诊断评估和患者分层模型 急性心肌梗死患者和健康对照组的血液样本及小鼠心肌梗死模型 机器学习 心血管疾病 RNA测序、单细胞RNA测序、蛋白质组学 机器学习-四种算法联合应用 转录组数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质组数据 106例AMI患者和76例对照(训练集);37例AMI患者和15例对照(验证集) NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
217 2026-06-23
Integrating In silico perturbation with multilayer omics to decode regulatory networks in cancer immunity: a new frontier in precision oncology
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了通过计算机模拟敲除整合多层组学数据(基因组、转录组、蛋白质组和代谢组)以解译癌症免疫调控网络的方法,并探讨其在精准肿瘤学中的应用前景 将计算机模拟敲除方法与多层组学数据整合,用于解码肿瘤免疫调控网络,并扩展到空间转录组学以实现组织水平细胞间相互作用的建模,代表精准肿瘤学前沿方向 当前多层组学数据整合仍面临挑战,且肿瘤生物学的复杂性限制了模型的准确性 探索计算机模拟敲除方法在解码癌症免疫调控网络中的应用,推动精准免疫治疗的发展 肿瘤微环境中的免疫调控基因、免疫逃逸机制及治疗靶点 机器学习 癌症 计算机模拟敲除 深度学习框架 组学数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
218 2026-06-23
VSIG2 is associated with an immune-cold microenvironment and reduced response to PD-1 blockade in bladder cancer
2026, Frontiers in cellular and infection microbiology IF:4.6Q1
研究论文 本研究探讨VSIG2在膀胱癌中与免疫冷微环境及PD-1阻断治疗反应降低的关联 首次揭示VSIG2作为肿瘤内在分子在膀胱癌中促进免疫排斥并影响免疫治疗疗效,并体内验证其作为治疗靶点的潜力 未提供明确局限性信息 探究VSIG2在膀胱癌免疫微环境塑造及免疫治疗反应中的作用 膀胱癌患者肿瘤组织样本、单细胞RNA-seq数据集、MB49小鼠模型 机器学习 膀胱癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组织化学 NA 转录组数据, 单细胞RNA-seq数据 多个独立队列及湘雅队列(具体数量未说明) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'测序
219 2026-06-23
Fibrillin-1 Orchestrates a Pro-senescent Niche Driving Peritubular Endothelial Senescence via ZEB1/endothelin-1/β-catenin Signaling
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞/空间转录组学、脱细胞支架模型、多种小鼠慢性肾病模型、血管超声及组织透明化三维成像技术,发现纤连蛋白-1(FBN1)作为促纤维化微环境核心组分,通过ZEB1/内皮素-1/β-catenin信号轴直接驱动血管内皮细胞衰老,导致微血管稀疏 首次揭示FBN1通过空间组织的FBN1/ZEB1/ET-1/β-catenin信号轴连接基质成分与内皮衰老,证明基质组分通过构建稳定病理微环境主动促进慢性肾病血管病变 未在人体样本中验证该信号轴的作用,且仅在鼠类模型中观察,物种差异可能影响临床转化 阐明慢性肾病中微血管稀疏的上游调控机制,特别是内皮细胞衰老的启动因素 小鼠肾脏组织内皮细胞及管周微环境中的基质组分 计算机视觉 慢性肾病 单细胞转录组学,空间转录组学,组织透明化三维成像,血管超声 NA 基因表达数据,图像 多种小鼠慢性肾病模型 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium空间转录组学
220 2026-06-23
Spatial and single-cell transcriptomics reveal a HIF-1α/NF-κB-driven hypoxia-induced senescence axis in BPH epithelium
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 整合空间和单细胞转录组学揭示HIF-1α/NF-κB驱动的缺氧诱导衰老轴在良性前列腺增生上皮中的作用 首次通过整合激光捕获显微切割RNA测序、公共单细胞RNA测序、空间转录组学、人类组织验证、小鼠模型分析和扰动实验,揭示了缺氧相关HIF-1α/NF-κB信号轴驱动BPH上皮衰老的机制 SA-β-gal阳性细胞主要在上皮中,但未探索其他细胞类型如间质细胞的具体作用,且样本量有限,缺乏更广泛的队列验证 阐明良性前列腺增生中缺氧相关上皮衰老的分子机制 良性前列腺增生(BPH)患者组织样本、BPH-1和RWPE-1细胞系、睾酮丙酸酯诱导的BPH样小鼠模型 自然语言处理 前列腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA 基因表达数据 52个人类BPH标本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
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