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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-03-11 |
Single-cell transcriptomics reveals cellular and genetic mechanisms of alpine adaptation in Rosa sericea
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1733247
PMID:41799984
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术揭示了高山植物绢毛蔷薇(Rosa sericea)叶片在细胞和遗传水平上的高海拔适应机制 | 首次构建了绢毛蔷薇叶片的单细胞转录图谱,结合hdWGCNA、伪时间轨迹分析等多种方法,鉴定了与高海拔适应相关的细胞类型特异性基因模块和调控网络 | 研究仅针对叶片组织,未涵盖其他器官;功能验证实验相对有限;样本来自特定地理区域,普适性需进一步验证 | 探究高山植物在极端环境下的细胞与遗传适应机制 | 绢毛蔷薇(Rosa sericea)叶片细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞核RNA测序(snRNA-seq)、加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)、基因本体富集分析、基因集富集分析(GSEA)、伪时间轨迹推断、基因过表达技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 31,796个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 182 | 2026-03-11 |
The mechanism of Vicenin-2 in ameliorating skin photoaging: involvement of m6A-modified macrophage polarization
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1778993
PMID:41800084
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研究论文 | 本研究探讨了天然黄酮类化合物Vicenin-2通过调节m6A修饰的巨噬细胞极化来改善皮肤光老化的机制 | 首次揭示了Vicenin-2通过上调m6A修饰调节因子KIAA1429,增强整体m6A RNA甲基化,并抑制NF-κB通路激活,从而促进巨噬细胞从促炎M1表型向抗炎M2表型转变,为光老化干预提供了新的潜在局部治疗剂 | 研究主要基于小鼠模型和RAW264.7细胞系,尚未在人体中进行验证;具体m6A修饰的靶基因及其在巨噬细胞极化中的详细作用机制有待进一步阐明 | 探究Vicenin-2改善皮肤光老化的作用机制,特别是其在调节巨噬细胞极化中的作用 | 皮肤光老化小鼠模型、LPS诱导的RAW264.7巨噬细胞 | 单细胞组学 | 皮肤光老化 | 单细胞测序、体内外实验 | NA | 单细胞测序数据、体内外实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 183 | 2026-03-11 |
scCNMF: an integrated analysis model for paired single-cell RNA sequencing and assay for transposase-accessible chromatin sequencing data leveraging cell similarity and cis-regulatory potential
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20836
PMID:41800139
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scCNMF的新模型,用于整合分析配对的单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据,以提升细胞状态表征和基因调控网络重建的准确性 | scCNMF模型首次在非负矩阵分解框架中同时考虑了细胞相似性结构和先验调控信息,有效解决了scATAC-seq数据高稀疏性和细胞水平调控交互的整合难题 | 未明确说明模型在超大规模数据集上的计算效率或对特定细胞类型的适用性限制 | 开发一种能够整合配对单细胞多组学数据的分析方法,以提高细胞聚类准确性和生物学可解释性 | 配对的单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 非负矩阵分解 | 单细胞多组学数据 | 多个真实世界数据集(未指定具体数量) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 184 | 2026-03-11 |
Neuro-immune-related gene signatures define molecular subtypes and prognostic score in bladder cancer with SERPINE2 as a potential therapeutic target
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20917
PMID:41800135
|
研究论文 | 本研究通过分析膀胱癌转录组数据,构建了神经免疫相关评分模型,识别了核心基因并验证了SERPINE2作为潜在治疗靶点的作用 | 首次在膀胱癌中系统研究了神经免疫相互作用的分子特征,构建了具有预测能力的神经免疫相关评分模型,并通过单细胞测序揭示了肿瘤微环境的异质性,同时通过功能实验和GWAS分析验证了SERPINE2的致癌作用和遗传易感性 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,功能验证仅在T24细胞系中进行,缺乏体内实验和更广泛的临床样本验证 | 探究膀胱癌中神经免疫相互作用的分子特征,构建预后模型并识别潜在治疗靶点 | 膀胱癌患者转录组数据、单细胞转录组数据、T24膀胱癌细胞系 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 转录组分析、单细胞RNA-seq、shRNA敲低、功能实验、全基因组关联研究 | 预后评分模型 | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 来自TCGA和UCSC Xena数据库的膀胱癌患者转录组数据,以及单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 185 | 2026-03-11 |
Itaconate Modulates Neutrophil Homeostasis to Ameliorate Airway Inflammation in Diesel Exhaust Particles-exacerbated Asthma via Inhibiting NETs Formation
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.124927
PMID:41800242
|
研究论文 | 本研究揭示了衣康酸通过抑制中性粒细胞胞外诱捕网形成,调节中性粒细胞稳态,从而改善柴油机尾气颗粒加剧的哮喘中的气道炎症 | 首次阐明了中性粒细胞在DEP诱导的皮质类固醇抵抗性哮喘中的双重免疫调节功能,即同时通过NETosis和Th17激活传播炎症,又通过ITA介导的代谢调节抑制免疫过度激活 | 研究主要基于小鼠模型,其在人体中的确切机制和疗效仍需进一步验证 | 探究柴油机尾气颗粒加剧的哮喘中皮质类固醇抵抗的生物学机制,并评估衣康酸的治疗潜力 | 哮喘小鼠模型、中性粒细胞 | NA | 哮喘 | 多组学分析、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 186 | 2026-03-11 |
Targeting Macrophage-to-Myofibroblast Transition Mitigates Progression from Inflammation to Fibrosis in Rosacea
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.128841
PMID:41800255
|
研究论文 | 本研究揭示了酒渣鼻中巨噬细胞向肌成纤维细胞转化(MMT)是驱动纤维化重塑的关键机制,并发现天然化合物鸦胆子素A可通过靶向STAT3棕榈酰化抑制MMT和炎症 | 首次在酒渣鼻中鉴定出巨噬细胞向肌成纤维细胞转化(MMT)是连接炎症与纤维化的关键机制,并发现STAT3棕榈酰化是MMT的调控靶点,天然化合物鸦胆子素A具有双重抗炎抗纤维化作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本量有限,鸦胆子素A在人体中的疗效和安全性需进一步验证 | 探究酒渣鼻从炎症进展为纤维化的分子机制,并寻找潜在治疗靶点 | 酒渣鼻患者皮肤组织、LL37诱导的小鼠酒渣鼻模型、巨噬细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学(ST)、血清蛋白质组学、组织染色、谱系追踪 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据、组织图像数据 | 酒渣鼻患者皮肤活检组织、LL37诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 187 | 2026-03-11 |
Metabolic Adaptation of CD8⁺ T Cells Limits the Efficacy of Fatty Acid Oxidation Inhibition in Type 1 Diabetes
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.125649
PMID:41800251
|
研究论文 | 本研究探讨了脂肪酸氧化抑制剂曲美他嗪在1型糖尿病非肥胖糖尿病小鼠模型中对CD8⁺ T细胞的代谢适应和疾病进展的影响 | 揭示了CD8⁺ T细胞通过上调CPT1A来适应脂肪酸氧化抑制的代谢逃逸新机制,并验证了脂肪酸氧化作为1型糖尿病治疗靶点的重要性 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果尚需验证;长期治疗可能因代谢适应而降低疗效 | 评估脂肪酸氧化抑制剂曲美他嗪对1型糖尿病自身免疫反应的调控作用及潜在治疗价值 | 非肥胖糖尿病小鼠模型、人类CD8⁺ T细胞、胰岛浸润免疫细胞 | 免疫代谢学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 非肥胖糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 188 | 2026-03-11 |
ANXA1-mediated mTOR/FABP4 Inhibition Drives Antifibrotic Macrophage Reprogramming in Lupus Nephritis
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.118613
PMID:41800263
|
研究论文 | 本研究探讨了ANXA1通过抑制mTOR/FABP4通路驱动巨噬细胞向抗纤维化表型重编程,从而减轻狼疮性肾炎中的纤维化过程 | 首次揭示ANXA1通过FPR2/ALX受体信号抑制mTOR/FABP4活性,增强脂肪酸氧化,促进巨噬细胞向抗纤维化表型极化,为狼疮性肾炎提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞RNA测序数据,人类样本验证有限,且ANXA1-mimetic肽Ac2-26的临床转化潜力需进一步评估 | 探究ANXA1在狼疮性肾炎纤维化中的作用机制,并寻找新的治疗策略 | 狼疮性肾炎患者样本、狼疮易感小鼠模型以及单细胞RNA测序鉴定的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 狼疮性肾炎患者样本和狼疮易感小鼠模型,具体样本数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 189 | 2026-03-11 |
CD44/POU2F2/BCL9L axis mediates MIF-driven SPP1+TAM activation in colorectal cancer metastasis
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.116575
PMID:41800265
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研究论文 | 本研究揭示了在结直肠癌转移中,MIF/CD44/POU2F2/BCL9L信号轴介导SPP1+TAM激活的机制 | 首次发现MIF/CD44/POU2F2/BCL9L信号轴在SPP1+TAM激活和结直肠癌转移中的关键作用,并识别了潜在的治疗靶点 | 样本量相对较小(临床组织微阵列n=42),且机制研究主要在体外和动物模型中进行,需要进一步临床验证 | 探究SPP1+TAMs在结直肠癌转移中的激活机制并识别治疗靶点 | 结直肠癌细胞、SPP1+肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)、临床结直肠癌患者组织 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据、临床组织微阵列数据 | 临床组织微阵列样本42例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 190 | 2026-03-11 |
Integrated Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Reveals the Diagnostic Value of Synovial Tissue Calprotectin and the MDSC-Associated Immune Microenvironment in Periprosthetic Joint Infection
2026, Infection and drug resistance
IF:2.9Q2
DOI:10.2147/IDR.S574816
PMID:41804369
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序,揭示了钙卫蛋白在人工关节感染滑膜组织中的诊断价值及其与MDSC相关免疫微环境的关系 | 首次在PJI滑膜组织中全面表征S100A8和S100A9的细胞表达谱,并揭示其与MDSC介导的免疫抑制微环境的紧密关联 | 样本量相对有限,且主要依赖公共数据库数据,需要进一步独立队列验证 | 探究人工关节感染(PJI)的诊断生物标志物及其免疫微环境特征 | 人工关节感染(PJI)患者和对照组的滑膜组织及超声处理液样本 | 数字病理学 | 人工关节感染 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学染色 | CellChat算法 | RNA测序数据, 图像数据 | 93例样本(53例PJI患者, 40例无菌性失败对照) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 191 | 2026-03-10 |
Xiangpi Shengji Ointment Accelerates Anal Fistula Healing by Regulating Macrophage-Fibroblast Crosstalk Through the Nuclear Factor Kappa B/Hypoxia-Inducible Factor Alpha/Vascular Endothelial Growth Factor Signaling Axis
2026, Molecular and cellular biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1080/10985549.2025.2597464
PMID:41457935
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研究论文 | 本研究揭示了象皮生肌膏通过调控NF-κB/HIF-α/VEGF信号轴,促进巨噬细胞M1极化与成纤维细胞功能,从而加速肛瘘愈合的分子机制 | 首次结合网络药理学、转录组学及单细胞RNA测序技术,系统阐明了象皮生肌膏通过NF-κB/HIF-α/VEGF信号轴调控巨噬细胞-成纤维细胞互作促进肛瘘愈合的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,其结论在人体中的适用性及临床转化效果仍需进一步验证 | 探究象皮生肌膏促进肛瘘伤口愈合的分子机制 | 肛瘘愈合过程、巨噬细胞、成纤维细胞 | 生物信息学与分子生物学 | 肛瘘 | 网络药理学、转录组分析、单细胞RNA测序、CCK-8、ELISA、WB、RT-qPCR | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、体外细胞实验数据、体内动物模型数据 | 使用了公开数据集GSE28914和GSE203244,并建立了小鼠肛瘘模型进行体内验证 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 192 | 2026-03-10 |
Cochlear neural functional competence: an integrative transcriptomic module analysis of excitability, plasticity and microenvironmental support programs
2026, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2026.1776907
PMID:41797834
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研究论文 | 本研究通过整合分析多个耳蜗转录组数据集,构建了一个用于评估螺旋神经元功能状态的综合评分框架(CNFC) | 提出了一个整合神经元兴奋性、可塑性、营养/代谢支持和损伤/炎症等转录程序的模块化分析框架,并开发了可量化的CNFC评分,超越了传统的神经元存活率预测 | MSC治疗的功能性后果尚未明确建立,部分结论仍需进一步机制验证 | 开发一个从转录组数据中总结耳蜗神经元功能状态的透明、可生成假设的分析框架,以补充传统的存活率指标 | 螺旋神经元、毛细胞及耳蜗组织 | 转录组学 | 听力损失 | RNA-seq, 微阵列, 空间转录组学 | 模块化基因评分框架 | 转录组数据 | 多个公开数据集(涵盖发育期、成年期及损伤/退化期样本) | NA | RNA-seq, 微阵列, 空间转录组学 | NA | NA |
| 193 | 2026-03-09 |
A spatiotemporal atlas of cerebrovascular development in zebrafish
2026-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68995-z
PMID:41620404
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研究论文 | 本研究结合原位测序、单细胞转录组学和3D血管重建技术,构建了斑马鱼大脑内皮发育的时空图谱 | 首次将原位测序、单细胞转录组学和3D血管重建技术整合,实现了分子、细胞和结构尺度的多维度映射,并发现了三个未表征的CapEC富集基因对血管模式和血脑屏障完整性的调控作用 | 研究仅聚焦于斑马鱼3-11天发育阶段,未覆盖全生命周期;功能验证仅限于三个基因,可能存在其他重要调控因子未被发现 | 解析脊椎动物脑血管发育的分子和细胞动力学机制 | 斑马鱼大脑内皮细胞 | 空间转录组学 | NA | 原位测序, 单细胞转录组学, 3D血管重建 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据, 3D成像数据 | 斑马鱼3-11天发育阶段样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 194 | 2026-03-09 |
ACACA modulates R-loop homeostasis to enhance lipid metabolism and microenvironmental interactions in ccRCC
2026-Jan-31, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01319-y
PMID:41620551
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和临床数据,发现ACACA通过调节R-loop稳态来增强脂质代谢和微环境相互作用,从而驱动透明细胞肾细胞癌的进展 | 首次揭示ACACA作为R-loop相关代谢驱动因子,连接基因组应激与脂质重编程及肿瘤微环境重塑在ccRCC中的作用机制 | 研究主要基于公共数据集和体外实验,缺乏大规模临床样本验证和更深入的机制探索 | 探究R-loop在透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中的作用及其与代谢重编程的关联 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的肿瘤微环境、R-loop结构和ACACA基因 | 生物信息学与计算生物学 | 肾细胞癌 | 转录组测序、单细胞转录组学、空间转录组学、ssGSEA分析 | 线性机器学习算法 | 转录组数据、临床数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 公共ccRCC转录组和临床数据集(未明确具体样本数) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 195 | 2026-03-09 |
Kynurenine mediates the chemotherapy-induced intestinal toxicity through modulation of gut microbiota
2026-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68741-5
PMID:41593057
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研究论文 | 本文揭示了化疗诱导的肠道毒性中,血清L-犬尿氨酸通过调节肠道菌群加剧损伤的机制 | 首次发现L-犬尿氨酸通过驱动肠道菌群失调(特别是乳杆菌的减少)并激活TNFα/JNK通路,介导化疗诱导的肠道毒性 | 研究主要基于小鼠模型和患者血清样本,临床转化和具体干预策略的有效性需进一步验证 | 探究化疗诱导肠道毒性的分子机制,并寻找潜在治疗靶点 | 化疗患者血清样本、小鼠模型、骨髓细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因敲除模型 | NA | 基因表达数据、血清代谢物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 196 | 2026-03-09 |
Deficiency of SMARCB1 drives an immunosuppressive microenvironment in meningioma
2026-Jan-24, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02217-3
PMID:41578352
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研究论文 | 本研究揭示了SMARCB1缺陷通过调控IL-17/CSF1轴驱动脑膜瘤免疫抑制微环境中CD163+巨噬细胞浸润的机制 | 首次将SMARCB1突变与脑膜瘤免疫抑制微环境联系起来,并发现IL-17/CSF1轴是介导CD163+巨噬细胞浸润的关键通路 | 样本量相对有限(共148例患者),机制研究主要基于公共数据库分析和体外实验验证,缺乏体内功能验证 | 探究脑膜瘤免疫抑制微环境的形成机制及其与SMARCB1突变的关系 | 脑膜瘤患者(包括不同WHO分级和疾病状态)的肿瘤组织和血清样本 | 肿瘤免疫学 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、全外显子测序、免疫组化染色、多重免疫荧光染色 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质表达数据、空间分布数据 | 148例脑膜瘤患者(113例预后队列,35例验证队列) | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, whole exon sequencing | NA | NA |
| 197 | 2026-03-09 |
Single-nucleus multiple-organ chromatin accessibility landscape in the adult rat
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag013
PMID:41632074
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研究论文 | 本研究通过单核ATAC测序技术构建了成年大鼠多器官染色质可及性图谱,识别了77种细胞类型,并分析了细胞类型和器官特异性转录因子、内皮与基质细胞的共享与特异性特征、跨器官巨噬细胞调控状态以及跨物种基因调控程序的保守性与特异性 | 首次系统性地生成了大鼠多器官单核染色质可及性图谱,填补了该重要生物医学模型生物在此领域的空白,并进行了跨器官和跨物种的细胞类型注释与功能推断 | NA | 构建大鼠多器官染色质可及性图谱,以解析组织特异性调控机制并支持大鼠模型在系统生物学和生物医学研究中的更广泛应用 | 成年大鼠(Rattus norvegicus)的9个器官 | 基因组学 | NA | 单核ATAC测序(snATAC-seq) | NA | 染色质可及性数据 | 超过110,000个细胞,来自9个器官的25个文库 | NA | 单核ATAC-seq | NA | NA |
| 198 | 2026-03-09 |
Single-cell profiling of peripheral and local immune compartments reveal unique genotype-independent prognostic immune signatures across isocitrate dehydrogenase-stratified glioma
2026-Jan-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf206
PMID:40974256
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析IDH突变型和野生型胶质瘤的局部与外周免疫环境,揭示了独特的基因型无关预后免疫特征 | 首次在IDH分层胶质瘤中系统比较局部与外周免疫细胞图谱,并鉴定出GZMH+ CD8+ T细胞等新型免疫细胞亚群及基因型无关的预后标志 | 样本量较小(仅18例),且未验证免疫特征在独立队列中的预后价值 | 揭示胶质瘤中局部与外周免疫环境的差异及其与IDH基因型的关联 | IDH突变型和野生型胶质瘤患者的肿瘤组织与外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18例胶质瘤患者(6例IDH突变型,12例IDH野生型) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 199 | 2026-03-09 |
YBX1&YBX3 as novel targets to potentiate immune checkpoint blockade response in gliomas
2026-Jan-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf227
PMID:41025501
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研究论文 | 本研究揭示了CHK2-YBX1&YBX3调控枢纽在胶质母细胞瘤免疫逃逸中的作用,并证明靶向该枢纽可增强免疫检查点阻断疗法的疗效 | 首次将CHK2、YBX1和YBX3定义为胶质瘤内在免疫抑制程序的核心调控枢纽,并提出通过靶向该枢纽来增强免疫检查点阻断疗法反应的新策略 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证;机制研究虽深入,但具体下游信号通路细节仍需进一步阐明 | 探究胶质母细胞瘤抵抗CD8⁺ T细胞杀伤的肿瘤内在机制,并寻找增强免疫检查点阻断疗法疗效的新靶点 | 人源和小鼠胶质瘤细胞系、临床前胶质瘤模型、人类胶质母细胞瘤肿瘤样本 | 肿瘤免疫学、分子生物学 | 胶质母细胞瘤 | 免疫沉淀-质谱联用、磷酸化蛋白质组学、批量RNA测序、染色质免疫沉淀测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 蛋白质相互作用数据、转录组数据、表观遗传数据、单细胞基因表达数据、空间基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及人类和小鼠胶质瘤细胞以及人类GBM肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 200 | 2026-03-09 |
Identification of cancer-associated fibroblasts and analysis of the association of origin with endothelial-to-mesenchymal transition in hepatocellular carcinoma
2026-01, Scandinavian journal of gastroenterology
IF:1.6Q3
DOI:10.1080/00365521.2025.2594783
PMID:41320635
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研究论文 | 本研究通过免疫组化、免疫荧光和空间转录组学技术,探讨了肝细胞癌中癌症相关成纤维细胞的起源及其与内皮-间质转化的关联 | 首次结合Visium和Visium HD空间转录组学技术,揭示了内皮细胞通过EndoMT转化为CAFs的潜在机制,并识别了CTGF作为关键分子决定因素 | 样本量较小(仅57例HCC组织),且研究主要基于间接组织分布观察和相关性分析,缺乏直接的体内功能验证 | 探究肝细胞癌中癌症相关成纤维细胞的细胞起源及其分子决定因素,以期为HCC的分子靶向治疗提供依据 | 肝细胞癌组织样本及其中的癌症相关成纤维细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 免疫组织化学染色、免疫荧光双染色、空间转录组学 | NA | 组织图像、空间转录组数据 | 57例肝细胞癌组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium, Visium HD | Visium和Visium HD空间转录组学平台 |