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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-09-20 |
Multi-omics analysis identifies macrophage immunometabolic signatures in ulcerative colitis
2026, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2026.1858403
PMID:42755516
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、批量转录组学、WGCNA和机器学习算法,识别溃疡性结肠炎中巨噬细胞相关的免疫代谢特征基因,并通过实验验证其诊断价值 | 首次通过多组学整合分析(scRNA-seq、批量转录组、WGCNA、机器学习)系统识别溃疡性结肠炎中六个巨噬细胞相关免疫代谢调控基因(CYBB、CR1、INPP5D、CTSH、IFI16、NCF4),并结合亚型分型和实验验证揭示其诊断相关性 | 诊断性能AUC超过0.98,可能存在过拟合风险,且样本量及独立验证数据集的具体规模未明确说明 | 识别溃疡性结肠炎中巨噬细胞相关的代谢调控因子及其诊断价值 | 溃疡性结肠炎患者肠道组织及巨噬细胞 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序,批量转录组学,WGCNA,LASSO,SVM-RFE,随机森林,免疫组化(H&E染色),Western blotting | LASSO,SVM-RFE,随机森林 | 基因表达数据(单细胞转录组、批量转录组),图像 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 182 | 2026-09-20 |
Single-cell RNA sequencing reveals a pro-fibrotic epithelial subpopulation contributing to endometrial dysfunction in polycystic ovary syndrome
2026, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2026.1873463
PMID:42755579
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序技术,全面分析了非肥胖型多囊卵巢综合征、肥胖型多囊卵巢综合征及健康对照者增殖期子宫内膜的细胞异质性,揭示了促进纤维化的上皮细胞亚群与子宫内膜功能障碍的关系 | 首次在非肥胖型和肥胖型多囊卵巢综合征患者中鉴定出一个具有上皮-间充质转化倾向的子宫内膜上皮细胞亚群(DCN高表达ECM1高表达EC2),并揭示了BMP信号通路与TGFβ信号通路失衡驱动子宫内膜上皮细胞纤维化转化的机制 | 研究仅聚焦于增殖期子宫内膜,未涵盖分泌期;样本量有限;未进行功能验证实验来证实DCN高表达ECM1高表达EC2亚群在子宫内膜功能障碍中的因果作用 | 探究多囊卵巢综合征患者子宫内膜功能障碍的细胞学机制,特别是非肥胖型和肥胖型多囊卵巢综合征患者中各类细胞的具体作用 | 非肥胖型多囊卵巢综合征患者、肥胖型多囊卵巢综合征患者及健康对照者的增殖期子宫内膜组织 | 单细胞组学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 183 | 2026-09-20 |
Genes and cells associated with sublingual allergen immunotherapy revealed by integrated transcriptome analysis in allergic rhinitis patients
2026, Frontiers in allergy
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/falgy.2026.1855863
PMID:42755715
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研究论文 | 该研究通过对过敏性鼻炎患者外周血单个核细胞进行RNA测序,并结合单细胞转录组分析,揭示了与舌下过敏原免疫治疗疗程和疗效相关的基因和细胞 | 首次整合批量RNA测序和单细胞转录组分析,系统鉴定了与舌下过敏原免疫治疗疗程相关的164个基因和与疗效相关的257个上调及349个下调基因,发现自然杀伤细胞相关信号可能与SLIT疗效相关 | 样本量较小(27例患者和3例健康志愿者),qPCR验证仅确认了部分基因的表达趋势,研究结果需要更大规模的队列研究进行验证并评估其临床相关性 | 探索与舌下过敏原免疫治疗疗程和疗效相关的基因和细胞,以阐明SLIT疗效差异的分子机制 | 27例接受舌下过敏原免疫治疗的过敏性鼻炎患者和3例健康志愿者 | 转录组学 | 过敏性鼻炎 | RNA测序,qPCR,单细胞转录组 | NA | 文本 | 27例过敏性鼻炎患者和3例健康志愿者的外周血单个核细胞 | NA | bulk RNA-seq,single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 184 | 2026-09-20 |
Single-cell profiling reveals context-dependent immune regulation shared by sepsis and systemic lupus erythematosus
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1892194
PMID:42755868
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研究论文 | 通过整合公共转录组数据和单细胞RNA测序数据,揭示脓毒症与系统性红斑狼疮共享的免疫调控程序,并验证SIGLEC1在巨噬细胞炎症反应中的功能 | 整合多维证据框架对共享候选基因进行优先级排序,结合内部和外部单细胞RNA测序数据揭示SIGLEC1和TRIM25在脓毒症和SLE中的疾病及队列依赖性表达模式,并通过功能实验验证SIGLEC1在巨噬细胞炎症反应中的作用 | 部分分析依赖于公共数据集,样本量有限,功能验证仅在THP-1来源的巨噬细胞中进行,缺乏体内实验验证 | 表征脓毒症与系统性红斑狼疮之间共享的免疫相关程序,确定优先候选基因的细胞背景,并功能性评估SIGLEC1在巨噬细胞炎症反应中的作用 | 脓毒症和系统性红斑狼疮患者样本及THP-1来源的巨噬细胞 | 机器学习 | 脓毒症, 系统性红斑狼疮 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, qPCR, ELISA, 流式细胞术 | NA | 转录组数据, 图像 | 5个内部样本(正常、SIRS和脓毒症)及外部数据集(GSE167363、GSE162577、GSE136035) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 185 | 2026-09-20 |
A mast cell-associated apoptosis-related transcriptomic signature in clear cell renal cell carcinoma and in vitro characterization of YBX3
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1894244
PMID:42755874
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序鉴定透明细胞肾细胞癌中的肥大细胞,构建肥大细胞相关凋亡评分(MCAS)用于预后分层,并体外验证YBX3的功能 | 首次将肥大细胞相关基因与凋亡基因集相交,利用机器学习生存算法构建MCAS预后特征;通过SurvSHAP和SurvLIME联合鉴定关键基因YBX3,并体外验证其促进恶性表型和凋亡抵抗的功能 | 摘要未提及具体局限性,但研究主要基于公共数据库分析和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证和前瞻性临床队列验证 | 构建肥大细胞相关凋亡相关转录组特征(MCAS)用于透明细胞肾细胞癌的预后分层,并探究关键基因YBX3的生物学功能 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者样本及ccRCC细胞系 | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, western blotting, CCK-8, 克隆形成实验, EdU, Transwell迁移实验, 流式细胞术 | CoxBoost, 随机生存森林 | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 图像 | TCGA-KIRC队列及两个外部验证队列,具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 186 | 2026-09-20 |
Multi-omics integration reveals macrophage polarization and ferroptosis as key mechanisms underlying kaempferol's therapeutic efficacy in peripheral artery disease
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1733284
PMID:42755983
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研究论文 | 该研究通过整合bulk转录组学、单细胞RNA测序、网络药理学和实验验证,揭示了巨噬细胞极化和铁死亡是山奈酚治疗外周动脉疾病的关键机制 | 首次通过多组学整合策略揭示山奈酚通过调控巨噬细胞极化和铁死亡发挥治疗外周动脉疾病的作用机制,并结合斑马鱼血管再生损伤模型进行验证 | 研究主要基于生物信息学分析和细胞及斑马鱼模型验证,缺乏哺乳动物体内模型和临床试验数据,山奈酚的临床转化应用仍需进一步验证 | 阐明外周动脉疾病的分子机制以及山奈酚的治疗效果及其潜在作用靶点 | 外周动脉疾病患者转录组数据、RAW264.7细胞、斑马鱼血管再生损伤模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | bulk转录组测序, 单细胞RNA测序, 网络药理学, 分子对接 | WGCNA, CIBERSORTx | 转录组数据, 图像 | 1,144个差异表达基因,87个PAD相关基因,70个重叠靶点 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 187 | 2026-09-20 |
Integrative transcriptomic analysis identifies CCL22-associated immune signatures in air pollution-related atopic dermatitis
2026, Frontiers in public health
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/fpubh.2026.1906298
PMID:42756293
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研究论文 | 本研究通过整合系统毒理学与转录组学框架,识别与空气污染相关特应性皮炎(AD)中的CCL22相关免疫特征 | 首次将污染物相关靶点与AD相关基因进行整合分析,结合机器学习多算法组合筛选出最优预测模型(plsRglm + AdaBoost),并发现CCL22作为污染物优先化的AD特征基因,通过单细胞转录组学和分子对接探索其免疫与基质重塑程序 | 研究结论基于生物信息学预测和动物模型验证,尚需未来受控暴露研究进一步证实;分子对接仅为探索性分析 | 识别连接空气污染物相关靶点与AD免疫失调的分子特征,优先筛选污染物相关免疫标志物 | 空气污染相关特应性皮炎(AD)的分子特征及候选免疫标志物 | 机器学习, 数字病理学, 转录组学 | 特应性皮炎 | 转录组学分析, 单细胞转录组学, 机器学习, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, GO/KEGG富集分析, 免疫浸润分析, 计算机模拟基因扰动, 分子对接, DNFB诱导小鼠模型验证 | plsRglm + AdaBoost, 15种机器学习算法及175种预测组合 | 基因表达数据(转录组), 单细胞转录组数据, 文本/公共数据库数据 | NA | NA | 单细胞转录组学, 批量转录组学 | NA | NA |
| 188 | 2026-09-20 |
Unravelling Ferroptosis in Sepsis: A Comprehensive Integrative Transcriptomic Analysis Across Age and Disease Severity
2026, Bioinformatics and biology insights
IF:2.3Q3
DOI:10.1177/11779322261447645
PMID:42756334
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研究论文 | 本文通过整合17个转录组数据集,系统分析了脓毒症中铁死亡相关基因的转录调控特征及其与年龄和疾病严重程度的关系 | 首次系统性地整合多平台转录组数据(微阵列、bulk RNA测序和单细胞RNA测序)全面表征人脓毒症中铁死亡的转录调控,发现铁死亡调控随疾病进展加剧且在成人中更显著,并鉴定单核细胞为外周血中铁死亡的主要调控细胞 | 依赖已有公开数据集,可能存在批次效应和样本异质性;缺乏实验验证;部分基因功能机制未深入探讨 | 系统表征人脓毒症中铁死亡相关基因的转录组调控特征,探索其与年龄和疾病严重程度的关系,并寻找潜在的诊断和治疗靶点 | 脓毒症患者和健康对照者的血液样本 | 机器学习,自然语言处理 | 脓毒症 | 微阵列,bulk RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据,文本 | 17个转录组数据集(包括脓毒症患者和健康对照者的血液样本) | NA | bulk RNA-seq,single-cell RNA-seq,微阵列 | NA | NA |
| 189 | 2026-09-20 |
Macrophage-linked lipid metabolic signatures for HCC prognosis identified through integrated bulk and single-cell transcriptomics
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1898124
PMID:42756356
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研究论文 | 该研究整合 bulk 和单细胞转录组数据,鉴定与肝细胞癌预后相关的巨噬细胞相关脂质代谢基因(MLMGs),并构建预后风险评分模型 | 首次将巨噬细胞相关差异基因与脂质代谢相关基因结合,通过单因素 Cox 分析和机器学习方法筛选出 FABP5 和 ECHS1 两个预后基因,构建 HCC 风险评分模型,并结合免疫图谱、细胞通讯推断和拟时序分析揭示其潜在机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,RT-qPCR 验证样本量有限,缺乏大规模前瞻性队列验证,且 FABP5 和 ECHS1 在 HCC 中的具体分子机制尚未深入阐明 | 评估巨噬细胞相关脂质代谢基因与肝细胞癌进展和预后的关联,构建预后风险评分模型 | 肝细胞癌(HCC)患者及其转录组和单细胞数据 | 机器学习, 数字病理学 | 肝癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | 机器学习(单因素Cox分析及机器学习筛选), 风险评分模型 | 基因表达数据(转录组), 单细胞转录组数据, 文本 | 公共HCC转录组和单细胞队列(GSE149614和TCGA-HCC),具体样本量未在摘要中明确 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 190 | 2026-09-20 |
Single-cell RNA sequencing in diabetic foot ulcers: pathogenesis, biomarkers, and translational potential
2026, Frontiers in clinical diabetes and healthcare
DOI:10.3389/fcdhc.2026.1833678
PMID:42757034
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在糖尿病足溃疡研究中的应用,揭示了JMJD3介导的巨噬细胞极化失败和IGF-1-SP1-CD248通路失调等机制,并指出JMJD3等可作为生物标志物和治疗靶点。 | 系统总结了单细胞RNA测序在糖尿病足溃疡发病机制、生物标志物发现和精准医疗中的最新进展,提出了JMJD3和IGF-1-SP1-CD248通路作为新的治疗靶点。 | 作为综述,缺乏原始实验数据验证,且未详细讨论单细胞RNA测序技术的成本、样本处理偏差等局限性。 | 总结单细胞RNA测序在糖尿病足溃疡研究中的应用,阐明发病机制,发现治疗靶点和生物标志物,推动精准医疗。 | 糖尿病足溃疡的相关研究文献和单细胞RNA测序数据。 | 机器学习 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 191 | 2026-09-20 |
Integrated analysis of bulk transcriptomics and single-cell transcriptomics revealed the association characteristics between heart failure and β-hydroxybutyrylation-related genes
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0357103
PMID:42758764
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研究论文 | 该研究整合批量转录组学和单细胞转录组学数据,结合机器学习、分子对接和ELISA验证,识别出与β-羟基丁酰化相关的心力衰竭诊断生物标志物HMOX2和KPNA2,并揭示T细胞在心力衰竭中的关键作用 | 首次将β-羟基丁酰化相关基因与心力衰竭诊断相结合,通过批量转录组学和单细胞转录组学整合分析识别出HMOX2和KPNA2两个新型诊断生物标志物,并通过ELISA实验验证了其蛋白表达水平 | H2AFZ的ELISA验证未达到统计学显著性(p>0.05),血清样本量较小(仅4例心衰患者和4例健康对照),部分结果依赖于生物信息学预测而非实验验证 | 探究β-羟基丁酰化相关基因与心力衰竭的关联,识别Kbhb相关的HF生物标志物并探索其潜在治疗靶点 | 心力衰竭患者和健康对照的转录组数据及血清样本 | 机器学习, 数字病理学 | 心力衰竭, 心血管疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, ELISA | 机器学习算法 | 转录组数据, 图像, 文本 | 4例心力衰竭患者和4例健康对照的血清样本,以及公共数据库中的心力衰竭相关转录组数据集 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 192 | 2026-09-19 |
Endozoicomonas acroporae enhances coral thermal resilience through host-microbe coordination
2026-01-14, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wrag173
PMID:42384952
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研究论文 | 该研究将Endozoicomonas acroporae Acr-14T确立为珊瑚益生菌,并表征其对造礁珊瑚Stylophora pistillata在热应激下增强耐受性的宿主-微生物协同机制 | 首次通过体内实验证明Endozoicomonas acroporae Acr-14T可增强珊瑚热耐受性,并形成珊瑚相关微生物聚集体;组装了S. pistillata clade 1的染色体水平基因组以支持转录组分析;利用单细胞转录组学揭示了益生菌处理珊瑚胃皮细胞中SAMe代谢和促生存信号相关基因表达的改变 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究益生菌Endozoicomonas acroporae Acr-14T增强珊瑚热耐受性的效果及其分子机制,特别是宿主-微生物相互作用 | 造礁珊瑚Stylophora pistillata及其相关细菌Endozoicomonas acroporae Acr-14T | 机器学习, 数字病理学, 微生物组学 | NA | 染色体水平基因组组装, 转录组测序, 单细胞转录组测序, 微生物组分析 | NA | 图像, 文本, 基因组序列, 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞转录组测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞转录组平台 |
| 193 | 2026-09-19 |
Intracellular microbial signals in the gastrointestinal tract of dairy cattle
2026-01-12, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-025-02319-z
PMID:41526999
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析奶牛胃肠道中细胞内微生物信号,揭示了其与瘤胃发育的潜在关联 | 首次在奶牛胃肠道上皮细胞中发现细胞内微生物群,并揭示了其与瘤胃发育的潜在关系 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究奶牛胃肠道上皮细胞中是否存在细胞内微生物群及其与瘤胃发育的关联 | 新生和成年奶牛的十种胃肠道组织 | 单细胞分析、微生物组学 | NA | 单细胞RNA测序、荧光原位杂交 | NA | 单细胞RNA测序数据、图像 | 来自新生和成年奶牛的十种胃肠道组织类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 194 | 2026-09-19 |
Single-Cell Clonal Lineage Tracing Identifies the Transcriptional Program Controlling the Cell-Fate Decisions by Neoantigen-Specific CD8+ T Cells
2026-Jan-08, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0203
PMID:41081433
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组和T细胞受体联合分析,追踪了新抗原特异性CD8+ T细胞在肿瘤和引流淋巴结中的克隆扩增与分化,并揭示了控制其细胞命运选择的转录程序 | 联合单细胞转录组和TCR谱系追踪,首次系统解析了新抗原特异性CD8+ T细胞在肿瘤和引流淋巴结中的克隆谱系和分化路径,并发现平衡分布的多分化命运克隆扩增能力最强 | 研究基于小鼠前列腺癌模型,结论在人类癌症中的普适性仍需进一步验证 | 揭示控制新抗原特异性CD8+ T细胞细胞命运决定的转录程序 | 小鼠前列腺癌模型中的新抗原特异性CD8+ T细胞 | 单细胞组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq | NA | NA |
| 195 | 2026-09-19 |
The Risk Genes S1PR5, CMC1, and ASAH1 as Potential Targets for the Diagnosis, Immunotherapy, and Treatment of Colon Adenocarcinoma by Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Analysis
2026, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 该研究利用单细胞和批量RNA测序数据,构建了一个基于免疫细胞功能的风险模型,用于预测结肠腺癌的预后和免疫治疗反应,并发现了S1PR5、CMC1和ASAH1三个新的潜在治疗靶点 | 构建了一个新的基于免疫细胞功能的风险模型,并发现了三个未报道的模型基因(S1PR5、CMC1和ASAH1)作为结直肠癌的潜在治疗靶点 | 未在摘要中明确提及 | 构建一个新的免疫细胞功能风险模型,以预测结肠腺癌的预后和免疫治疗反应,并发现新的治疗靶点 | 结肠腺癌患者 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、qPCR、免疫组织化学 | Lasso回归 | 基因表达数据、图像 | 单细胞数据集GSE146771,训练队列和两个独立的GEO外部队列 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 196 | 2026-09-19 |
Epithelial cell derived lumican modulates extracellular matrix dynamics in early-life airways disease
2026-01, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.08.030
PMID:40972979
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研究论文 | 该研究通过空间转录组学、共聚焦显微镜和SHG显微镜技术,揭示了早期气道疾病(学龄前喘息和学龄期哮喘)中上皮细胞来源的lumican如何调节细胞外基质动态变化 | 首次发现lumican在早期气道重塑中的关键作用,揭示了胶原相关表型和几何变化在早期气道重塑中的先前未描述的作用,证明lumican是学龄前喘息和学龄期哮喘中与胶原组织相关的关键重塑因子 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 研究学龄前喘息(1-5岁)和学龄期哮喘(6-16岁)中气道细胞外基质景观改变的机制,并追踪屋尘螨暴露新生小鼠的ECM动态变化 | 学龄前喘息患儿、学龄期哮喘患儿的支气管内活检标本,以及屋尘螨暴露的新生小鼠肺标本 | 空间转录组学 | 哮喘 | 空间转录组学、共聚焦显微镜、SHG显微镜 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 197 | 2026-09-19 |
Identification and Verification of Mitochondria-Related Diagnostic Markers of Spinal Cord Injury by WGCNA and Machine Learning
2026, Behavioural neurology
IF:2.7Q2
DOI:10.1155/bn/1749750
PMID:41810912
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研究论文 | 通过WGCNA和机器学习识别并验证脊髓损伤的线粒体相关诊断标志物 | 整合WGCNA与多种机器学习算法筛选线粒体相关关键基因,并结合免疫浸润分析和单细胞RNA测序验证其诊断价值 | 研究主要基于GEO数据库的转录组数据,缺乏实验验证和更大规模的独立临床队列验证 | 识别脊髓损伤中线粒体相关的诊断标志物并探索其分子机制和免疫反应 | 脊髓损伤患者样本与对照样本的RNA测序数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 脊髓损伤 | RNA-seq、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | WGCNA、机器学习算法(具体模型未明确) | 基因表达数据(转录组数据)、单细胞转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 198 | 2026-09-19 |
Single-Cell and Bulk Transcriptomic Integration Reveals a Stemness-Related Astrocyte Subpopulation for Prognostic Risk Stratification in Glioblastoma
2026, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究整合单细胞和bulk转录组数据,识别出胶质母细胞瘤中与干性相关的星形胶质细胞亚群,并构建了四基因预后风险分层模型 | 首次整合单细胞和bulk转录组数据识别出干性高的星形胶质细胞亚群,并基于该亚群构建了包含ALDOA、FABP5、TIMP1和MT1M的四基因预后风险模型,揭示了高风险肿瘤的免疫抑制微环境特征 | 研究主要在公共数据库队列中进行验证,体外功能实验仅针对ALDOA基因,缺乏更多基因的功能验证和前瞻性临床队列验证 | 识别胶质母细胞瘤中与干性相关的星形胶质细胞亚群,构建预后风险分层模型并探索其临床意义 | 胶质母细胞瘤患者样本及GBM细胞系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, LASSO Cox回归, 体外功能实验 | LASSO Cox回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 199 | 2026-09-19 |
MZB1 expression levels are associated with long-term maintenance of high anti-HBs titers: single-cell RNA-seq with validation by nested case-control and intervention studies
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1913957
PMID:42751130
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序发现MZB1在长期维持高抗-HBs滴度个体的B细胞中显著上调,并通过巢式病例对照和干预研究验证了血清MZB1水平与乙肝疫苗应答强度的关联 | 首次发现MZB1表达与乙肝疫苗接种后长期维持高抗-HBs滴度相关,并揭示血清MZB1可作为预测乙肝疫苗抗体应答的生物标志物,且MZB1在抗-HBs出现之前即被疫苗诱导升高 | 单细胞RNA测序样本量较小(仅20例),验证队列样本量有限(巢式病例对照102例、干预研究79例),且未深入探讨MZB1的上游调控通路及功能机制 | 探究乙肝疫苗接种后长期维持高抗-HBs滴度的潜在机制,并寻找可预测疫苗应答的生物标志物 | 接种乙肝疫苗后维持高抗-HBs滴度超过30年的受试者、已血清转化的受试者、乙肝疫苗低应答或无应答者 | 机器学习 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 单细胞RNA测序20例(10例高抗-HBs滴度维持者+10例血清转化者),巢式病例对照研究102例,干预研究79例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 200 | 2026-09-19 |
HIV-driven tumor ecosystem: from chronic immune dysfunction to cancer evolution
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1901762
PMID:42751305
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综述 | 该综述将HIV相关恶性肿瘤的病毒学、免疫学、肿瘤微环境和临床治疗反应整合为一个系统性的“肿瘤生态系统”框架 | 首次将KSHV、EBV、HPV等单个致癌病毒视角与免疫功能障碍视角整合为统一的系统性肿瘤生态系统框架,涵盖病毒学、免疫学、肿瘤微环境和临床治疗反应 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,主要基于已有文献的综合分析 | 构建HIV相关恶性肿瘤的肿瘤生态系统理论框架,指导精准预防和治疗策略 | HIV感染患者的肿瘤生态系统,包括淋巴瘤和卡波西肉瘤等HIV相关癌症 | 肿瘤免疫学 | HIV相关恶性肿瘤 | 单细胞组学,空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞组学,空间转录组学 | NA | NA |