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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-02-12
Palmitoylation-related gene expression and its prognostic value in prostate cancer: insights into immune infiltration and therapeutic potential
2026-Jan-31, Translational andrology and urology IF:1.9Q3
研究论文 本研究探讨了前列腺癌中棕榈酰化相关基因的表达特征、其与免疫浸润的关联以及潜在的治疗应用 首次系统性地将前列腺癌中的棕榈酰化相关基因表达与预后、免疫浸润景观和化疗药物敏感性联系起来,并构建了一个基于单细胞RNA测序特征基因的预后模型 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要更多前瞻性临床研究和实验来验证棕榈酰化途径的分子机制和治疗潜力 评估棕榈酰化相关基因在前列腺癌中的预后价值,并探索其与肿瘤生物学、免疫浸润和治疗反应的关系 前列腺癌患者(来自TCGA、DKFZ、MSKCC、GEO等多个数据库)和前列腺癌细胞系 生物信息学与计算生物学 前列腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 机器学习 整合了十种算法的机器学习方法, ssGSEA 基因表达数据, 临床信息 来自多个公共数据库(TCGA、DKFZ、MSKCC、GEO、ArrayExpress、PCaProfiler、PCaDB)的前列腺癌患者数据,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
2 2026-02-12
CD4+CXCL13+ exhausted T cells drive immune microenvironment divergence in synchronous double primary lung adenocarcinoma with different degrees of invasiveness
2026-Jan-31, Translational lung cancer research IF:4.0Q1
研究论文 本研究首次全面分析了同步双原发肺腺癌中不同侵袭程度病灶的免疫微环境,揭示了CD4+ CXCL13+耗竭T细胞在免疫抑制中的关键作用 首次在同步双原发肺腺癌中比较不同侵袭程度病灶的免疫微环境,并识别出CD4+ CXCL13+耗竭T细胞作为肿瘤免疫进展的关键驱动因素 样本量较小(仅10例患者),且仅针对T/NK细胞亚群进行分析,可能未涵盖所有免疫细胞类型 探究早期肺腺癌进展过程中免疫微环境的演化,并识别关键免疫细胞亚群和信号通路 同步双原发肺腺癌患者的微浸润性腺癌和浸润性腺癌病灶 数字病理学 肺癌 下一代测序, 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 流式细胞术 Mfuzz聚类, CellChat, Monocle 基因表达数据, 图像数据 10例同步双原发肺腺癌患者 NA 单细胞RNA-seq, 下一代测序 NA NA
3 2026-02-12
Construction and validation of a CT-based radiomics-deep learning signature for non-invasive prediction of PD-L1 expression and immunotherapy outcomes in non-small cell lung cancer
2026-Jan-31, Translational lung cancer research IF:4.0Q1
研究论文 本研究构建并验证了一个基于CT的放射组学-深度学习特征,用于无创预测非小细胞肺癌的PD-L1表达和免疫治疗结果 首次将放射组学特征与深度学习特征融合,构建了一个综合的RADLsig,用于从常规CT图像中无创预测PD-L1表达,并在独立的免疫治疗队列和TCIA队列中验证了其预测性能和生物学相关性 研究为回顾性设计,且模型开发队列中腺癌和早期疾病患者占主导,可能影响模型的普适性 开发一种基于常规CT图像的无创预测工具,用于预测NSCLC患者的PD-L1表达状态和免疫治疗反应 非小细胞肺癌患者 计算机视觉 肺癌 放射组学特征提取,深度学习 放射组学模型,深度学习模型,融合模型 CT图像 模型开发队列531名患者,独立免疫治疗验证队列145名患者,TCIA验证队列128名患者 NA NA NA NA
4 2026-02-12
Comprehensive bioinformatic analysis and experimental validation identify MT1M and MT1X as key metallothioneins in BC pathogenesis
2026-Jan-31, Journal of trace elements in medicine and biology : organ of the Society for Minerals and Trace Elements (GMS) IF:3.6Q2
研究论文 本研究通过整合生物信息学分析和实验验证,识别了MT1M和MT1X作为乳腺癌发病机制中的关键金属硫蛋白 首次通过整合多组学数据和机器学习方法,系统性地鉴定了金属硫蛋白相关基因在乳腺癌中的核心作用,并实验验证了MT1M和MT1X的肿瘤抑制功能 研究主要基于公开数据集和体外实验,缺乏大规模临床队列验证和体内动物模型实验 探索金属硫蛋白相关基因在乳腺癌发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 乳腺癌组织和细胞系 生物信息学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, PCR, 蛋白质印迹, CCK-8, 迁移和侵袭实验 LASSO回归, 随机森林, 逻辑回归 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 整合了两个乳腺癌数据集(GSE42568和GSE29044),涉及62个金属硫蛋白相关基因 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
5 2026-02-12
Diffusion-based Representation Integration for Foundation Models Improves Spatial Transcriptomics Analysis
2026-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一个名为DRIFT的框架,通过利用空间转录组学数据衍生的空间图上的扩散,将空间上下文整合到基础模型的输入表示中,以改进空间转录组学分析 DRIFT框架创新性地使用热核扩散在空间邻域中传播嵌入,将ST数据的局部邻域上下文整合到现有单细胞基础模型中,从而弥合了通用空间转录组学建模的差距 NA 旨在通过整合空间上下文到基础模型表示中,提升空间转录组学数据的分析性能 空间转录组学数据 空间转录组学 NA 热核扩散 基础模型 基因表达谱数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
6 2026-02-12
FOXN1 immunodeficiency detected by TREC-based newborn screening - A challenge of management?
2026-Jan-27, Immunology letters IF:3.3Q3
研究论文 本文通过TREC新生儿筛查识别出四例新型FOXN1突变,并详细描述了三位新生儿的临床过程,强调了对非SCID FOXN1免疫缺陷管理的挑战 首次在TREC新生儿筛查中检测到四种新型FOXN1突变,并利用高分辨率单细胞RNA测序和先进流式细胞术进行综合免疫表征,揭示了该罕见疾病的异质性免疫学过程 研究样本量较小(仅三位新生儿),且临床表型与基因型关联不完全,可能限制了结果的普遍性 探讨非SCID FOXN1免疫缺陷的基因型-表型相关性及管理策略 三位携带新型FOXN1突变的新生儿患者 数字病理学 免疫缺陷病 TREC新生儿筛查、高分辨率单细胞RNA测序、流式细胞术免疫表型分析 NA 基因序列数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 三位新生儿患者及健康脐带血对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7 2026-02-12
EVA1A responds to endoplasmic reticulum stress to regulate renal fibrosis by promoting TGF-β signaling pathway
2026-Jan-25, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究揭示了EVA1A作为内质网应激的传感器,通过稳定和促进TGFBR2从内质网分泌至质膜,从而激活TGF-β信号通路,调控肾纤维化的机制 首次阐明了EVA1A在肾纤维化中的作用,并揭示了其通过内质网应激-CHOP轴上调,并与BIP相互作用以稳定和促进TGFBR2分泌,从而激活TGF-β信号通路的新机制 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,尚未在人体中进行直接验证;EVA1A与BIP/TGFBR2相互作用的具体结构细节仍需进一步探索 阐明EVA1A在TGF-β信号通路调控和肾纤维化中的作用及其分子机制 慢性肾病患者的肾组织、UUO和UIRI诱导的纤维化肾病小鼠模型、培养的肾上皮细胞 NA 慢性肾病 单细胞RNA-seq、免疫组织化学染色、Western blot、免疫共沉淀、双分子荧光互补 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据、图像数据 慢性肾病患者样本、UUO和UIRI处理的小鼠模型、培养的肾上皮细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8 2026-02-12
Klotho protects the osteogenic function of human periodontal ligament stem cells in periodontitis by inhibiting NOX4-mediated ferroptosis
2026-Jan-16, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究揭示了Klotho蛋白通过抑制NOX4介导的铁死亡,保护人牙周膜干细胞在牙周炎环境中的成骨功能 首次发现Klotho在牙周炎炎症环境中通过抑制NOX4表达来对抗hPDLSCs的铁死亡,从而保护其成骨功能,为牙周组织再生工程提供了新的潜在策略 研究主要基于体外炎症环境和动物模型,尚未在人体临床试验中得到验证,且分子机制的具体信号通路细节有待进一步阐明 探究Klotho蛋白是否能在炎症环境中保护人牙周膜干细胞免受铁死亡影响,并维持其成骨功能,以期为牙周炎治疗提供新靶点 人牙周膜干细胞、C57BL/6小鼠牙周炎模型 干细胞生物学与再生医学 牙周炎 单细胞RNA测序、细胞过表达、体外成骨诱导、动物模型 细胞模型、小鼠疾病模型 基因表达数据、细胞功能数据、组织形态数据 未在摘要中明确说明具体样本数量,涉及hPDLSCs细胞系及C57BL/6小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
9 2026-02-12
Targeting the CCL7-STAT1 axis attenuates microglial neurotoxicity and photoreceptor degeneration in retinitis pigmentosa
2026-Jan-16, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CCL7-STAT1轴在视网膜色素变性中调控小胶质细胞功能障碍的关键作用 首次通过scRNA-seq在RP模型中鉴定出CCL7hi小胶质细胞亚群作为神经炎症和光感受器退化的关键调控者,并阐明了CCL7-STAT1自放大炎症级联机制 研究主要基于rd10小鼠模型,临床转化仍需进一步验证;未涉及其他RP亚型或长期治疗效应 探索视网膜色素变性中微胶质细胞介导的神经炎症分子机制,并寻找疾病修饰治疗靶点 rd10小鼠模型的视网膜微胶质细胞和光感受器 单细胞组学 视网膜色素变性 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 rd10小鼠视网膜微胶质细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
10 2026-01-18
Neighborhood nonnegative matrix factorization identifies patterns and spatially-variable genes in large-scale spatial transcriptomics data
2026-Jan-16, Genome biology IF:10.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
11 2026-02-12
4D multimodal wound healing atlas reveals organ-level controls of repair phase transitions
2026-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究构建了一个名为OWHA的4D多模态伤口愈合图谱,通过整合多种单细胞和空间转录组技术,在器官尺度上揭示了哺乳动物伤口愈合的完整时空动态 首次创建了4D、器官尺度的哺乳动物伤口愈合分子蓝图,通过多模态技术克服了传统图谱的技术限制,发现了仅通过snRNA-seq才能检测到的关键角质形成细胞亚群(Basal IV)及其调控轴 研究主要基于小鼠模型,尽管进行了跨物种整合验证,但人类数据的获取仍受限于解离诱导的假象,需要多模态图谱来准确捕获 解码器官尺度伤口愈合的系统级原理,揭示协调修复阶段转换的分子逻辑 小鼠皮肤伤口愈合过程,涵盖从早期到晚期愈合阶段的多种皮肤微解剖组织生态位 数字病理学 皮肤伤口(包括糖尿病溃疡) snRNA-seq, scRNA-seq, CITE-seq, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 超过725,000个小鼠单细胞和空间转录组 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
12 2026-02-12
Whole genome sequence analysis of pulmonary function and COPD in 44,287 multi-ancestry participants
2026-Jan-15, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本研究通过对44,287名多族裔参与者进行全基因组序列分析,探索与肺功能和慢性阻塞性肺疾病相关的遗传变异 利用多族裔样本的全基因组序列数据,发现了与肺功能和COPD相关的低频或人群特异性遗传变异,并验证了HMCN1基因的作用 研究依赖于现有数据库如UK Biobank进行验证,可能受限于样本多样性和数据覆盖范围 通过全基因组序列分析,识别与肺功能和慢性阻塞性肺疾病相关的遗传变异 44,287名多族裔参与者,包括肺功能指标(FEV1、FVC、FEV1/FVC)和COPD病例对照状态 基因组学 慢性阻塞性肺疾病 全基因组序列分析,单细胞RNA-seq,CRISPR基因编辑 NA 基因组序列数据,单细胞RNA-seq数据 44,287名多族裔参与者 NA 全基因组测序,单细胞RNA-seq NA NA
13 2026-01-18
Combining spatial and single-cell transcriptome data to analyze tertiary lymphoid structures in clear cell renal cell carcinoma reveals prognostic biomarkers
2026-Jan-15, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
14 2026-02-12
Immune dysregulation triggered by inflammatory cytokines in patients with severe respiratory infections
2026-Jan-15, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了严重呼吸道病毒感染(以COVID-19为例)中免疫失调的特征,并探讨了高剂量重组蛋白疫苗对免疫反应的调节作用 构建了包含近30万个PBMC的高分辨率免疫细胞图谱,首次系统性地描绘了不同严重程度COVID-19患者的免疫特征,并明确了过表达IL相关基因的高度炎症性CD14+单核细胞是危重患者炎症风暴的核心驱动因素 样本量相对较小(17例患者),且为观察性研究,需要更大规模的队列验证 阐明严重呼吸道病毒感染中免疫失调的机制,并探索疫苗剂量对免疫反应的影响 17名不同严重程度(中度、重度、危重及康复期)的COVID-19患者的外周血单个核细胞(PBMCs) 单细胞组学 COVID-19 单细胞转录组测序 NA 单细胞RNA测序数据 17名COVID-19患者(包含不同严重程度及康复期) NA 单细胞RNA-seq NA NA
15 2026-02-12
Activating KRAS mutations mark premalignant cystic structures in congenital pulmonary airway malformations
2026-Jan-15, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析先天性肺气道畸形(CPAM)中KRAS突变囊肿的转录组特征,揭示其与KRAS突变肺癌的相似性 首次在CPAM囊肿中利用单细胞RNA测序技术鉴定KRAS突变相关的转录组变化,并建立气道类器官模型验证KRAS对细胞增殖的直接影响 样本量较小(n=3),且研究仅关注KRAS突变,未全面评估其他遗传或环境因素对恶性转化的影响 评估KRAS突变作为CPAM患者恶性转化风险因素的潜在作用 先天性肺气道畸形(CPAM)患者的切除肺组织及衍生的气道类器官 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、免疫荧光染色、类器官培养 气道类器官模型 单细胞转录组数据、图像数据 3例CPAM患者(KRAS突变阳性与阴性对照) NA 单细胞RNA测序 NA NA
16 2026-02-12
Unveiling cholesterol metabolism-related gene ACOX2: a multi-omics discovery of a novel biomarker in IgA nephropathy
2026-Jan-15, Hereditas IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过多组学整合框架,揭示了胆固醇代谢相关基因ACOX2在IgA肾病中的保护作用,并鉴定其为一种新型生物标志物 首次将多组学方法(包括GWAS、SMR、scRNA-seq等)系统应用于IgA肾病,识别出ACOX2作为关键保护性基因,并发现FAD作为潜在治疗配体 研究主要基于遗传和转录组数据,缺乏直接的体内功能验证和临床试验数据 探究胆固醇代谢在IgA肾病中的作用,并识别关键生物标志物 IgA肾病(IgAN)患者 生物信息学 肾脏疾病 GWAS, SMR, scRNA-seq, 分子对接, 分子动力学模拟 多组学整合框架 遗传数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 NA NA
17 2026-02-12
Spatiotemporal transcriptomic mapping reveals region-specific glial activation and astrocyte shifts in epileptogenesis beyond the hippocampus
2026-Jan-15, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,在锂-毛果芸香碱诱导的癫痫持续状态大鼠模型中,揭示了癫痫发生过程中海马以外区域的胶质细胞激活和星形胶质细胞功能亚型转变 通过空间转录组学技术首次全面绘制了癫痫发生过程中海马以外区域的转录动态,发现了丘脑核团和白质束在潜伏期的胶质细胞激活,以及星形胶质细胞功能亚型的区域性转变 研究基于大鼠模型,结果可能不完全适用于人类颞叶癫痫;样本量相对较小(n=16);空间转录组学技术分辨率有限,可能无法完全解析细胞亚型细节 探究颞叶癫痫发生过程中海马以外区域的分子和细胞机制,特别是胶质细胞的时空动态变化 锂-毛果芸香碱诱导的癫痫持续状态大鼠模型(n=16)的冠状脑切片 空间转录组学 颞叶癫痫 空间转录组学 NA 空间转录组数据 16只大鼠(包括对照组和癫痫持续状态模型) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium Visium空间转录组平台,用于冠状脑切片的转录组空间映射
18 2026-02-12
T-cell exhaustion indicator characterizes the tumor microenvironment landscape and predicts colon adenocarcinoma prognosis via integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-sequencing
2026-Jan-14, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA-seq和bulk RNA-seq数据,开发了一个基于T细胞耗竭相关基因的预后模型,用于预测结肠腺癌患者的生存和治疗反应,并验证了FAT4基因在调控结肠腺癌细胞增殖和凋亡中的作用 首次整合单细胞和bulk RNA-seq数据,构建了一个基于T细胞耗竭相关基因的预后特征,并揭示了FAT4基因在结肠腺癌中的新功能 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床研究验证模型的普适性 阐明T细胞耗竭与结肠腺癌预后的关系,并开发有效的预后预测方法 结肠腺癌患者及其肿瘤微环境中的T细胞 数字病理学 结肠癌 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 流式细胞术, RT-qPCR GSVA, 单变量Cox, LASSO, 随机森林 转录组数据 来自TCGA和GEO数据库(GSE103479, GSE17536)的结肠腺癌样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
19 2026-02-12
Integrating single-cell and bulk transcriptomes with machine learning reveals a CAF signature for immunotherapy response in dMMR endometrial cancer
2026-Jan-14, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,结合机器学习方法,构建了一个Wnt相关CAF风险特征模型,用于预测dMMR子宫内膜癌的预后和免疫治疗反应 首次在dMMR子宫内膜癌中系统整合单细胞与批量转录组数据,并应用包含10种算法和101种组合的机器学习框架来识别Wnt相关CAF亚群并构建预后风险特征 研究依赖于公共数据库数据,缺乏独立的前瞻性队列验证,且样本量相对有限 探究癌症相关成纤维细胞在dMMR子宫内膜癌预后和免疫治疗反应中的作用,并构建预测模型 dMMR子宫内膜癌患者 机器学习 子宫内膜癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 CoxBoost, Elastic Net 转录组数据 单细胞数据包含9,682个肿瘤细胞和5,476个正常细胞,具体患者样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
20 2026-02-12
Single-cell and spatial transcriptomic profiling of cardiac fibroblasts following myocardial infarction
2026-Jan-13, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本文通过单细胞和空间转录组学技术,研究了心肌梗死后心脏成纤维细胞的转录动态和分子事件 整合了bulk RNA测序、RNAscope原位杂交和空间转录组学数据,首次在解剖和时间维度上描绘了心脏成纤维细胞向修复性亚群转变的基因表达变化 研究主要关注心肌梗死早期阶段,长期动态和功能验证可能不足 探究心肌梗死后心脏成纤维细胞的异质性及其修复性亚群的出现机制 心肌梗死后的小鼠心脏成纤维细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, RNAscope原位杂交, bulk RNA-seq NA 转录组数据, 空间基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
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