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当前共找到 1119 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-02-08 |
CIA: unveiling cellular identities with cluster-independent annotation in single-cell RNA sequencing data for comprehensive cell type characterization and exploration
2025-Dec-17, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06320-z
PMID:41408153
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CIA（Cluster Independent Annotation）的新型计算工具，用于在单细胞RNA测序数据中准确识别细胞类型，无需完全注释的参考数据集或复杂机器学习过程 | 开发了CIA工具，基于预定义细胞类型签名，提供用户友好且实用的单细胞类型和功能注释解决方案，支持Python和R语言，适用于所有主要单细胞分析框架 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中细胞识别和分类的挑战，提供高效且可解释的细胞类型注释工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 142 | 2026-02-08 |
BGN Secreted by Cancer-Associated Fibroblasts Promotes Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression via Activation of TLR4-Mediated Erk and NF-κB Signaling Pathways
2025-Dec-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262412024
PMID:41465449
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研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞分泌的BGN通过激活TLR4介导的Erk和NF-κB信号通路促进食管鳞状细胞癌进展 | 首次在ESCC中鉴定出CAF分泌的BGN是关键促癌因子，并阐明其通过TLR4受体激活Erk和NF-κB信号通路的分子机制 | 研究主要基于细胞系和体外共培养模型，缺乏体内动物实验验证；临床样本量有限（66例） | 探究癌症相关成纤维细胞在食管鳞状细胞癌进展中的具体作用机制 | 食管鳞状细胞癌细胞系（TE-9、TE-10、TE-15）、间充质干细胞、66例ESCC组织样本 | 肿瘤生物学 | 食管鳞状细胞癌 | cDNA微阵列分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | 共培养模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、临床病理数据 | 3个ESCC细胞系、间充质干细胞、66例ESCC组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 143 | 2026-02-07 |
Multi-omics analysis identifies a microbiota-bile acid-TLR signaling axis driving bladder injury in interstitial cystitis
2025-Dec-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68060-1
PMID:41457077
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研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了一种微生物-胆汁酸-TLR信号轴在间质性膀胱炎中驱动膀胱损伤的机制 | 首次整合宏基因组测序、靶向代谢组学和单细胞RNA测序，识别出Enterococcus avium富集的微生物特征和胆汁酸代谢改变，并证实其通过TLR3激活导致膀胱上皮损伤 | 研究主要基于实验模型验证，人类样本的直接临床转化和长期效果需进一步评估 | 探究间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征（HIC）的上游驱动机制，以寻找生物标志物和靶向治疗机会 | Hunner型间质性膀胱炎患者的尿液、血清样本及实验模型 | 多组学分析 | 间质性膀胱炎 | 宏基因组测序、靶向代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因组、代谢组、转录组数据 | NA | NA | 宏基因组测序, 靶向代谢组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 144 | 2026-02-07 |
Construction of a single-cell transcriptome atlas for Pogostemon cablin embryoids reveals PcNAC048 as a dual regulator coordinating lateral root morphogenesis and patchouli alcohol biosynthesis
2025-Dec-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09434-5
PMID:41461945
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了广藿香胚状体的单细胞转录组图谱，揭示了PcNAC048作为协调侧根形态发生和广藿香醇生物合成的双重调控因子 | 首次在广藿香中应用单细胞RNA测序技术构建胚状体转录组图谱，并鉴定出PcNAC048作为同时调控发育和次生代谢的新转录因子 | 研究主要基于体外培养的胚状体，可能无法完全反映自然生长条件下的基因表达模式，且转基因验证仅在拟南芥中进行 | 探究广藿香胚状体发育的细胞分化轨迹及调控广藿香醇生物合成的分子机制 | 广藿香（Pogostemon cablin）的胚状体，包括球形胚、心形胚、鱼雷形胚和子叶胚 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序，酵母单杂交，双荧光素酶报告基因检测，病毒诱导基因沉默 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但包括球形胚和子叶胚阶段的单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 145 | 2026-02-07 |
CYP27A1 suppresses brain metastasis via ferroptosis in lung adenocarcinoma: a six-gene signature predicting the immunotherapy response and clinical outcomes
2025-Dec-10, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04112-2
PMID:41372758
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA-seq数据，识别了肺腺癌脑转移的分子驱动因素，构建了一个六基因预后模型，并验证了CYP27A1通过铁死亡抑制脑转移的功能 | 首次整合单细胞和批量RNA-seq数据识别肺腺癌脑转移相关基因，构建了六基因预后模型，并揭示了CYP27A1通过调控铁死亡抑制脑转移的新机制 | 样本量相对较小（仅4例患者的单细胞数据），功能验证仅限于体外实验，缺乏体内模型验证 | 识别肺腺癌脑转移的分子驱动因素，构建预后模型并评估免疫治疗反应 | 肺腺癌患者及其脑转移相关细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据 | 4例LUAD患者的scRNA-seq数据（GSE117570）和TCGA-LUAD队列的批量RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 146 | 2026-02-06 |
Single-Cell Transcriptome-Wide Mendelian Randomization and Colocalization Analyses Uncover Cell-Specific Mechanisms in Epigenetic Age Acceleration
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503032R
PMID:41378907
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞表达数量性状位点数据，结合孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析，揭示了免疫细胞特异性基因表达对四种主要表观遗传时钟的因果影响 | 首次在单细胞分辨率下，结合孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析，系统性地识别了影响表观遗传年龄加速的细胞特异性因果基因 | 研究主要聚焦于14种免疫细胞类型，可能未涵盖其他细胞类型对表观遗传年龄的影响 | 阐明表观遗传年龄加速背后的细胞特异性基因调控机制 | 14种免疫细胞类型中的基因表达与四种表观遗传时钟（IEAA, HannumAge, GrimAge, PhenoAge）的关联 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞表达数量性状位点分析, 孟德尔随机化, 贝叶斯共定位, 表型全基因组关联研究 | 孟德尔随机化模型, 贝叶斯共定位模型 | 单细胞RNA-seq数据, 表观遗传时钟数据, 全基因组关联研究数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 147 | 2026-02-06 |
MMP14-Dependent Activation of TGF-β Signaling Enhances Malignancies via Promoting Necroptosis in Glioblastoma
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501932R
PMID:41384860
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了MMP14通过激活TGF-β信号通路促进胶质母细胞瘤坏死性凋亡和恶性行为的机制 | 首次将MMP14鉴定为胶质母细胞瘤中与坏死性凋亡相关的枢纽基因，并阐明了其通过TGF-β-SMAD2-RIP1信号轴调控坏死性凋亡异质性的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内动物模型的直接验证 | 探究坏死性凋亡在胶质母细胞瘤恶性进展中的作用机制 | 胶质母细胞瘤细胞及相关的分子信号通路 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 加权基因共表达网络分析，单细胞分析，空间转录组学 | NA | 转录组数据，单细胞数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 148 | 2026-02-06 |
Proton-Pump Inhibitor Use and Gastrointestinal Disease Risk: A Mendelian Randomization Study of Omics and Pharmacological Pathways
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503152R
PMID:41420535
|
研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化和多组学方法，系统评估了质子泵抑制剂（PPI）相关基因与24种胃肠道疾病风险的关联 | 首次整合PPI的直接作用靶点基因及其药代动力学相关基因，结合多祖先队列、单细胞测序和荟萃分析，揭示了PPI药理作用的组织特异性及其在胃肠道疾病中的双重（治疗/致癌）潜力 | 需要进一步研究PPI与良性胃肠道疾病的关系，且部分发现需在更多人群中验证 | 阐明质子泵抑制剂（PPI）使用与胃肠道疾病风险的潜在因果关系及分子机制 | 与PPI直接靶点、代谢和转运相关的基因，以及24种胃肠道疾病 | 生物信息学与多组学整合分析 | 胃肠道疾病（包括肝癌、胰腺癌、食管癌、结直肠癌、急慢性胰腺炎等） | 孟德尔随机化（两样本）、共定位分析、SMR分析、荟萃分析、单细胞测序、组织表达谱分析 | 孟德尔随机化模型、荟萃分析模型 | 基因组数据、表达数量性状位点（eQTL）数据、单细胞RNA测序数据、疾病关联统计数据 | 多祖先队列（UK Biobank 和 FinnGen） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 149 | 2026-02-06 |
Single-Cell Multi-Omics Reveals B2M-Mediated Myeloid Reprogramming and Constructs a Predictive Model for Early Hepatocellular Carcinoma Recurrence
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503144R
PMID:41427790
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了B2M介导的髓系重编程，并构建了早期肝细胞癌复发的预测模型 | 首次在单细胞分辨率下整合多组学数据探索早期HCC复发的分子机制，并识别出B2M相关的髓系细胞重编程作为关键驱动因素 | 预测模型的AUC仅大于0.65，性能中等，且研究样本量可能有限 | 探索早期肝细胞癌复发的分子机制并开发预测工具 | 肝细胞癌患者肿瘤组织及免疫微环境 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 转录组学 | LASSO回归模型 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据, 转录组数据, 临床特征数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 150 | 2026-02-06 |
Pan cohort immune biomarker of CD8 lymphocyte activation enabling HGSOC outcome prediction and treatment response
2025-Dec-31, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04363-5
PMID:41474480
|
研究论文 | 本研究开发了一个与CD8⁺ T细胞激活相关的免疫预后特征（CIPS），用于预测晚期高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）患者的生存结局和治疗反应 | 通过整合机器学习方法，从多队列数据中识别出10个基因的CD8⁺ T细胞激活特征，该特征在预测生存和免疫治疗反应方面优于现有模型 | 研究主要基于转录组数据，未涉及蛋白质水平验证；样本来源为回顾性队列，需要前瞻性研究进一步验证 | 开发一个稳健的与CD8⁺ T细胞激活相关的生物标志物，以改善晚期HGSOC的预后预测和临床管理 | 晚期高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）患者 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单样本基因集富集分析，加权基因共表达网络分析，单细胞RNA-seq分析 | 机器学习整合方法 | 转录组数据，临床数据 | 874名晚期HGSOC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 151 | 2026-02-06 |
Integrating multi-omics data and machine learning to identify endocrine disrupting chemicals targeting key ccRCC-related genes
2025-Dec-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04138-y
PMID:41467947
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法，识别了靶向关键ccRCC相关基因的内分泌干扰化学物及其相关基因 | 首次整合多组学数据与机器学习，系统识别与ccRCC相关的EDCs及其靶基因，并揭示了它们在肿瘤微环境中的相互作用 | 研究基于计算模型和现有数据集，需要实验验证EDCs与ccRCC之间的直接因果关系 | 识别与ccRCC发病机制相关的内分泌干扰化学物及其靶基因 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）及相关内分泌干扰化学物 | 机器学习 | 肾细胞癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | 机器学习算法（共评估101种） | RNA测序数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 152 | 2026-02-06 |
Machine learning-enabled spatial multi-omics uncovers lactate-driven targets and tumor microenvironmental reprogramming in cancer
2025-Dec-30, NPJ digital medicine
IF:12.4Q1
DOI:10.1038/s41746-025-02286-7
PMID:41469480
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、空间转录组学、空间代谢组学、免疫荧光及TCGA生存数据，结合机器学习模型，揭示了乳酸在肺腺癌微环境中的空间分布、细胞类型特异性效应及其对血管生成、免疫抑制和预后分层的调控作用 | 首次将空间代谢组学与单细胞/空间转录组学、机器学习模型整合，系统解析了乳酸在肿瘤微环境中的空间分布模式及其细胞类型特异性调控网络，并建立了乳酸驱动型内皮细胞/成纤维细胞程序与临床预后的强关联 | 研究主要聚焦于肺腺癌，结论在其他癌种中的普适性需进一步验证；空间代谢组学的分辨率仍有提升空间；机器学习模型的生物学可解释性可进一步深化 | 揭示乳酸在肿瘤代谢重编程中的空间分布规律、细胞类型特异性效应及其对肿瘤微环境重塑和临床预后的影响机制 | 肺腺癌（LUAD）组织样本及其单细胞、空间多组学数据，TCGA临床生存数据 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组学、空间代谢组学、免疫荧光、生存分析 | 随机森林、弹性网络回归、SVM、ANN、决策树 | 转录组数据、代谢组数据、空间成像数据、临床生存数据 | 未明确具体样本数量（涉及TCGA队列及空间多组学样本） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 153 | 2026-02-05 |
Targeting chemokine-driven metastasis in non-small cell lung cancer: Development and evaluation of chemokine nanosponges for therapy
2025-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102511
PMID:41625363
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研究论文 | 本研究开发了一种针对非小细胞肺癌转移的CCL20吸附纳米海绵，通过工程化巨噬细胞膜结合Toll样受体激动剂R848，实现精准治疗和肿瘤微环境重塑 | 首次利用单细胞RNA测序鉴定M2型肿瘤相关巨噬细胞中CCL20的关键作用，并设计出具有靶向和吸附双重功能的纳米海绵，结合免疫调节剂实现协同治疗 | 研究主要基于临床前模型，尚未进行人体临床试验；纳米海绵的长期生物安全性和大规模制备工艺仍需进一步验证 | 开发针对非小细胞肺癌转移的新型纳米治疗策略，通过调控肿瘤微环境中的趋化因子信号通路抑制肿瘤生长和转移 | 非小细胞肺癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、CCL20趋化因子、工程化纳米海绵材料 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及体外和体内实验模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 154 | 2026-02-05 |
Macrophage-related immune responses to polyetherketoneketone bone implants: Single-cell transcriptome analysis
2025-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102257
PMID:41625371
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了钛基和聚醚酮酮（PEKK）基骨植入物引发的早期巨噬细胞免疫反应差异 | 首次在单细胞分辨率下揭示了不同骨植入材料（钛与PEKK）引发的巨噬细胞极化动态和细胞间相互作用的差异，并明确了这些差异如何影响骨整合和造血稳态 | 研究主要关注早期免疫反应，长期植入效果和临床转化潜力仍需进一步验证；体外或动物模型结果向人体应用的推广存在不确定性 | 探究PEKK作为钛替代骨植入材料时，其早期免疫反应（特别是巨噬细胞相关反应）如何影响骨整合效果 | 钛基和聚醚酮酮（PEKK）基骨植入物植入后的骨髓微环境中的巨噬细胞及其他免疫细胞 | 单细胞组学 | 骨科植入物相关 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 155 | 2026-02-03 |
Disturbed flow induces reprogramming of endothelial cells to immune-like and foam cells under hypercholesterolaemia during atherogenesis
2025-Dec-31, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf233
PMID:41288601
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系示踪技术，验证了在动脉粥样硬化形成过程中，紊乱血流与高胆固醇血症共同诱导内皮细胞发生免疫样和泡沫样细胞重编程的“双重打击”假说 | 提出了内皮细胞在紊乱血流和高胆固醇血症共同作用下，可重编程为免疫样细胞（EndIT）和泡沫样细胞（EndFT）的新概念，并通过遗传谱系示踪模型进行了验证 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，虽然分析了人类斑块数据，但仍需更多人类在体研究进一步验证 | 探究紊乱血流与高胆固醇血症在动脉粥样硬化发生中的协同作用机制，特别是对内皮细胞重编程的影响 | 小鼠颈动脉内皮细胞、人类主动脉内皮细胞（HAECs）以及动脉粥样硬化斑块 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫组织化学染色，谱系示踪 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 来自95只小鼠的98,553个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 156 | 2026-02-03 |
Single-cell analysis of B cell dysregulation in pediatric sepsis stratified by disease severity
2025-Dec-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34126-9
PMID:41476192
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析了儿童脓毒症患者外周血白细胞，揭示了B细胞在疾病严重程度分层中的关键作用及其耗竭机制 | 首次在儿童脓毒症中应用单细胞RNA测序技术，识别并验证了自然杀伤样B细胞（NKB）等B细胞亚群的耗竭和转录重编程，拓宽了人类脓毒症中B细胞表型的认知 | 样本量较小（仅6名脓毒症患者和4名健康对照），且研究集中在儿科群体，可能限制结果的普遍性 | 探究儿童脓毒症中B细胞耗竭的机制及其与疾病严重程度的关系 | 儿童脓毒症患者（包括轻度和重度）及健康对照的外周血白细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 6名儿童脓毒症患者（3名轻度，3名重度）和4名健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 157 | 2026-02-03 |
Single-cell transcriptomics and spatial validation reveal dysfunction of keratinocytes and NK cells driving acne development
2025-Dec-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34373-w
PMID:41476262
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和空间免疫荧光技术，揭示了健康皮肤、轻度痤疮和重度痤疮中角质形成细胞与自然杀伤（NK）细胞的功能失调是驱动痤疮发展的关键机制 | 提出了“双重免疫-屏障失衡”的创新病理模型，首次系统阐述了角质形成细胞从防御到异常分化、以及NK细胞从激活到耗竭的时序性功能转变在痤疮进展中的核心作用 | 未明确说明样本的具体数量与人口统计学特征，且空间验证主要依赖免疫荧光技术，可能缺乏更高通量的空间多组学数据支撑 | 阐明痤疮发生发展的细胞与分子机制，为早期诊断和精准干预提供理论基础 | 健康皮肤、轻度痤疮和重度痤疮患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病（痤疮） | 单细胞RNA测序，空间免疫荧光 | 伪时间分析，功能富集分析 | 单细胞转录组数据，空间成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 158 | 2026-02-03 |
VAMP5 promotes glioma progression through bioinformatics analysis clinical correlation and functional validation
2025-Dec-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04375-1
PMID:41467924
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析、临床关联和功能验证，揭示了VAMP5在胶质瘤进展中的促进作用 | 首次系统性地整合多组学数据（TCGA、GEO、单细胞RNA测序）并结合体外体内实验，全面阐明了VAMP5在胶质瘤中的表达模式、临床意义、功能角色及免疫调节机制，提出其作为新型预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于公共数据库和细胞系/动物模型，缺乏大规模前瞻性临床队列验证；VAMP5的具体下游信号通路和与免疫微环境相互作用的分子细节仍需进一步探索 | 探究VAMP5在胶质瘤中的表达模式、临床意义及功能作用，以寻找新的诊断、预后和治疗靶点 | 胶质瘤组织、正常脑组织、胶质母细胞瘤（GBM）细胞系、动物模型 | 生物信息学与肿瘤生物学 | 胶质瘤 | 生物信息学分析、实时定量PCR、免疫组织化学、Western blot、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、通路富集分析、免疫浸润分析、体外功能实验、体内实验 | NA | 基因表达数据、临床病理数据、单细胞测序数据、蛋白质相互作用数据、实验数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个数据集及临床样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 159 | 2026-02-03 |
Integrated transcriptomic and single-cell analysis reveals cell cycle dysregulation and cellular heterogeneity in lung cancer
2025-Dec-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04303-3
PMID:41467951
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学和单细胞分析，揭示了肺癌中细胞周期失调和细胞异质性 | 结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq，识别了与临床表型相关的基因模块及细胞周期关键调控因子 | 研究主要基于细胞系和有限组织样本，未在大型临床队列中进行验证 | 解析肺癌的转录景观和肿瘤微环境中的细胞异质性，以识别潜在治疗靶点和预后生物标志物 | 肺癌组织、邻近正常样本以及A549和H1299肺癌细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR | WGCNA, 伪时间轨迹分析 | RNA序列数据 | 肺癌组织与邻近正常样本，以及A549和H1299细胞系 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 160 | 2026-02-03 |
CCL20 secreted by KRT15high tumor Cells promotes tertiary lymphoid structure formation and enhances anti-PD-1 therapy response in HPV+HNSCC
2025-Dec-29, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08359-5
PMID:41462011
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研究论文 | 本研究揭示了HPV阳性头颈鳞状细胞癌中KRT15高表达肿瘤细胞通过分泌CCL20促进三级淋巴结构形成，从而增强抗PD-1疗法疗效的机制 | 首次阐明HPV感染通过KRT15高表达肿瘤细胞分泌CCL20促进三级淋巴结构形成的具体机制，并证实其对抗PD-1疗法疗效的增强作用 | 样本量相对有限（59例患者），且机制研究主要在动物模型中进行，需进一步临床验证 | 探究HPV阳性头颈鳞状细胞癌中三级淋巴结构形成的机制及其对抗PD-1免疫疗法疗效的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者组织样本、单细胞测序数据、空间转录组数据及小鼠模型 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、RNA-seq、免疫组织化学、多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、组织图像数据 | 59例头颈鳞状细胞癌患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |