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当前共找到 764 篇文献,本页显示第 121 - 140 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
121 2025-12-15
SOX18 and SOX30 in NSCLC: The Epigenetic Landscape of Methylation, miRNA Regulation, and Network Crosstalk in Tumor Progression
2025-Dec-02, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究探讨了SOX18和SOX30在非小细胞肺癌中的表观遗传调控、miRNA调节及其与血管生成和免疫调节通路的网络互作 首次在NSCLC中系统揭示了SOX18和SOX30的差异性表达模式及其表观遗传调控机制,并利用空间转录组学技术揭示了SOX18在肿瘤核心和侵袭边缘的富集定位及其与关键信号分子的共定位关系 研究主要基于组织样本和体外细胞模型,缺乏体内动物模型的验证;样本量虽达800例,但未涉及更广泛的NSCLC亚型或转移性样本 阐明SOX18和SOX30在非小细胞肺癌肿瘤进展中的表观遗传调控机制、miRNA调节作用及其与肿瘤微环境的相互作用 800例非小细胞肺癌标本(400例肺腺癌,400例鳞状细胞癌)、NSCLC细胞系及3D球状体培养模型 数字病理学 肺癌 免疫组织化学、RT-qPCR、Western印迹、空间转录组学、液滴数字甲基化特异性PCR NA 图像、文本、空间转录组数据 800例NSCLC标本(400例腺癌,400例鳞癌) NA 空间转录组学 NA NA
122 2025-12-15
A Large-Scale Single-Cell Atlas Reveals the Peripheral Immune Panorama of Bacterial Pneumonia
2025-Dec, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1
研究论文 本研究通过构建大规模单细胞转录组图谱,揭示了细菌性肺炎患者外周血免疫细胞在疾病不同严重程度下的全景变化 首次构建了涵盖不同严重程度细菌性肺炎患者的大规模外周血免疫细胞单细胞转录组图谱,系统揭示了疾病严重程度与免疫细胞亚群组成、功能状态及信号通路活性的关联 研究样本量相对有限(共100例),且为横断面研究,无法完全阐明免疫动态变化的因果关系 阐明细菌性肺炎的免疫发病机制,识别驱动疾病严重程度的关键细胞和分子特征 细菌性肺炎患者(包括重症和轻症)及健康对照者的外周血免疫细胞 单细胞组学 细菌性肺炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、临床数据、分子数据 100名个体(39例重症肺炎、31例轻症肺炎、30例健康对照) NA 单细胞RNA-seq NA NA
123 2025-12-15
Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female
2025-Dec, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术,揭示了疟原虫在按蚊中肠内的关键发育阶段转换和宿主-寄生虫相互作用 首次结合单细胞RNA测序和共聚焦显微镜,系统解析了疟原虫在按蚊中肠内的发育过渡和相互作用,并识别出调控卵囊生长的关键过程及转录因子PfSIP2 研究主要基于实验室条件,尽管验证了野外来源的寄生虫,但可能未完全覆盖自然传播环境中的所有变异 探究疟原虫在按蚊中肠内的发育机制和宿主-寄生虫相互作用,以识别阻断传播的潜在靶点 恶性疟原虫和按蚊中肠细胞,包括不同发育阶段和代谢条件下的寄生虫与宿主细胞 单细胞组学 疟疾 单细胞RNA测序,共聚焦显微镜,功能分析 NA 单细胞转录组数据,图像数据 多个发育阶段和代谢条件下的寄生虫与蚊子细胞样本,包括野外来源的寄生虫 NA 单细胞RNA-seq NA NA
124 2025-12-15
Decidual cell invasion and decidualization at the trophoblast-decidual interaction in the progression of cesarean scar pregnancy
2025-Dec, Journal of reproductive immunology IF:2.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验,探讨了KISS1基因在剖宫产瘢痕妊娠(CSP)进展中蜕膜细胞侵袭和蜕膜化过程中的作用 首次在单细胞水平上揭示了CSP中蜕膜细胞KISS1表达下调及其通过PI3K/AKT信号通路影响蜕膜化的机制,并发现miR-6809和miR-4768对KISS1的调控作用 研究样本量有限,且主要基于体外实验,需要更多临床样本和体内实验验证 阐明KISS1基因在CSP进展中蜕膜细胞侵袭过程中的作用及其分子机制 剖宫产瘢痕妊娠(CSP)和正常早孕宫内妊娠(IUP)的蜕膜组织样本 数字病理学 妊娠相关疾病 单细胞RNA测序,免疫组化,qRT-PCR,Western blotting,RNA干扰,过表达实验,RNA-seq,荧光素酶报告实验 NA 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 CSP和IUP的蜕膜组织样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
125 2025-12-15
Nicheformer: a foundation model for single-cell and spatial omics
2025-Dec, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文介绍了Nicheformer,一个基于Transformer的基础模型,用于单细胞和空间组学分析,旨在捕获细胞的空间上下文信息 Nicheformer是首个在人类和小鼠的单细胞及空间转录组数据上训练的基础模型,能够学习捕获空间上下文的细胞表示,并支持空间组成和标签预测等下游任务 仅使用解离数据训练的模型无法恢复空间微环境的复杂性,强调了多尺度整合的必要性 开发一个基础模型以改善单细胞和空间组学数据的分析,特别是空间上下文的预测和整合 人类和小鼠的细胞,包括解离单细胞和空间转录组数据 数字病理学 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 Transformer 单细胞和空间转录组数据 超过5700万解离细胞和5300万空间解析细胞,涵盖73个组织 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
126 2025-12-15
Cancer-associated fibroblast miR-148a-5p/CALD1/collagen VI pathway promotes proliferation in Helicobacter pylori-positive gastric cancer
2025-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
研究论文 本研究揭示了幽门螺杆菌通过激活癌症相关成纤维细胞中的TLR/miR-148a-5p/CALD1/胶原VI通路促进胃癌细胞增殖的机制 首次在幽门螺杆菌阳性胃癌中鉴定出CAFs通过miR-148a-5p/CALD1/胶原VI轴促进肿瘤增殖的新信号通路,并证明miR-148a-5p激动剂可作为化疗增敏剂 未明确说明样本量大小,且研究主要基于小鼠模型,临床转化需进一步验证 探究幽门螺杆菌如何通过影响癌症相关成纤维细胞促进胃癌增殖,并寻找潜在治疗靶点 幽门螺杆菌阳性胃癌、癌症相关成纤维细胞、胃癌细胞 肿瘤生物学 胃癌 microRNA测序、转录组测序、单细胞测序、分子生物学实验、体外细胞共培养、体内CDX和PDX模型 NA 测序数据、实验数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
127 2025-12-15
Characteristics linking ischemia-reperfusion to chronic lung allograft dysfunction in lung transplantation: A single-cell bioinformatics analysis
2025-Dec, Transplant immunology IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA-seq数据集,揭示了肺移植中缺血再灌注损伤与慢性肺移植物功能障碍之间的细胞和分子联系 首次使用单细胞生物信息学方法系统描绘了IRI到CLAD过程中的细胞动态变化、代谢抑制、铜死亡激活及巨噬细胞向肌成纤维细胞转变等关键机制 研究结果需要进一步在动物模型和临床样本中进行验证 探究肺移植中缺血再灌注损伤与慢性肺移植物功能障碍之间的细胞和分子联系 肺移植相关的细胞群体,包括上皮细胞、Club细胞和髓系细胞 生物信息学 肺移植相关疾病 单细胞RNA-seq Louvain聚类、UMAP可视化、Augur方法、CellChat、MEBOCOST、pySCENIC 单细胞RNA-seq数据 整合自GSE220797和GSE224210数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
128 2025-12-15
Spatially resolved multi-omics of human metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2025-Dec, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学及代谢组学技术,绘制了人类代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)的空间多组学图谱 首次在人类MASLD中整合单细胞与空间转录组学及代谢组学数据,识别了MITF作为脂质相关巨噬细胞的关键调控因子,并揭示了其通过肝细胞生长因子分泌的肝保护作用 样本量相对有限(共61例),且主要基于观察性数据,需要进一步功能验证 探究人类代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)的分子机制和空间异质性 人类肝脏组织,包括对照组、代谢功能障碍相关脂肪肝(MASL)和代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)患者 数字病理学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 单细胞转录组学, 空间转录组学, 代谢组学, 质谱成像 NA 转录组数据, 代谢组数据, 空间数据 61例人类肝脏样本(对照组10例, MASL 17例, MASH 34例) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 空间代谢组学 NA NA
129 2025-12-15
IFN-Mediated Bronchial Epithelium Cellular Senescence in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Dec, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者支气管上皮细胞中细胞衰老的机制,并探讨了IFN通路抑制剂对衰老的调控作用 首次在COPD支气管上皮细胞中通过单细胞RNA测序系统分析细胞衰老基因表达,并发现I/II型IFNs介导的衰老表型可通过JAK-STAT或cGAS-STING通路抑制剂逆转 研究样本量有限,且主要基于体外细胞培养和测序数据,需要更多体内实验验证 阐明COPD支气管上皮细胞衰老的分子机制及其在疾病发病中的作用 COPD患者和健康对照者的原代支气管上皮细胞及肺组织 单细胞组学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 COPD患者和健康对照者的原代支气管上皮细胞(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
130 2025-12-15
Presynaptic Changes in Mouse Rod Photoreceptors During Early Retinitis Pigmentosa
2025-Dec-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,探讨了P23H/Gnat2-/-视网膜色素变性小鼠早期视杆细胞突触前分子变化 首次结合单细胞RNA测序和蛋白质组学技术,揭示了视网膜色素变性早期视杆细胞突触SNARE复合体和囊泡蛋白的分子上调机制 研究仅使用1月龄小鼠模型,未涵盖疾病晚期阶段;样本量有限,且主要基于动物模型,人类临床相关性需进一步验证 探究视网膜色素变性早期视杆细胞突触可塑性的分子机制 P23H/Gnat2-/-视网膜色素变性小鼠和Gnat2-/-对照小鼠的视网膜组织 数字病理学 视网膜色素变性 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 免疫组织化学 NA 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像数据 1月龄P23H/Gnat2-/- RP小鼠和Gnat2-/-对照小鼠的视网膜样本 NA 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 NA NA
131 2025-12-15
Antiviral and immune modulatory activities of STING agonists in a mouse model of persistent hepatitis B virus infection
2025-Dec, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 本文研究了STING激动剂在持续HBV感染小鼠模型中的抗病毒和免疫调节活性 首次使用STING敲除和人类STING敲入小鼠模型,证明STING激动剂治疗以STING依赖性方式激活免疫反应并抑制HBV复制,为慢性乙型肝炎治疗提供了新策略 研究仅基于小鼠模型,人类应用效果未验证;样本量较小,HBs-Ab仅在1/4小鼠中检测到 评估STING激动剂作为免疫疗法治疗慢性乙型肝炎的潜力 AAV-HBV转导的小鼠模型 免疫学 乙型肝炎 RNA-seq NA RNA序列数据 未明确指定,但涉及小鼠模型和单细胞RNA-seq分析 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
132 2025-12-12
Fibroblasts in the tumor microenvironment: heterogeneity and dynamic interactions in tumor progression revealed by spatial transcriptomics
2025-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
133 2025-12-14
Breakthroughs of ultrasound-targeted microbubble destruction in treating myocardial ischemia-reperfusion injury: from angiogenesis regulation to precise inflammation suppression
2025-Dec-31, Drug delivery IF:6.5Q1
综述 本文综述了超声靶向微泡破坏技术在治疗心肌缺血再灌注损伤中的最新进展,涵盖从血管生成调控到精准炎症抑制等多个方面 系统总结了UTMD技术通过调控HIF-1α/VEGF通路促进血管生成、抑制NLRP3炎症小体激活以减轻炎症反应的双重作用机制,并强调了结合放射组学、人工智能及多组学技术(如单细胞RNA测序)实现精准诊断与治疗的新策略 作为一篇综述文章,未报告原始实验数据或具体临床研究结果,主要基于现有文献进行总结与展望 探讨超声靶向微泡破坏技术治疗心肌缺血再灌注损伤的机制、应用及未来研究方向 心肌缺血再灌注损伤及其相关的分子通路、细胞过程与治疗策略 心血管疾病 心血管疾病 超声靶向微泡破坏、单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢组学、放射组学、人工智能图像分析 NA 多组学数据、医学影像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
134 2025-12-14
Predictive markers for the efficacy of CAR T-cell therapy: the interplay between CAR T-cell fitness and systemic immunity
2025-Dec-23, Blood advances IF:7.4Q1
综述 本文探讨了预测CAR T细胞疗法疗效的生物标志物,重点关注CAR T细胞适应性与系统性免疫的相互作用 整合了单细胞转录组学、蛋白质组学和细胞因子多功能性分析等新兴技术,结合机器学习方法,用于识别预测性生物标志物和优化治疗策略 NA 识别和验证CAR T细胞疗法的预测性生物标志物,以改善患者分层和治疗效果 CAR T细胞疗法在淋巴恶性肿瘤患者中的疗效和安全性 机器学习 淋巴恶性肿瘤 单细胞转录组学、蛋白质组学、细胞因子多功能性分析 机器学习 转录组数据、蛋白质组数据、细胞因子数据 NA NA NA NA NA
135 2025-12-14
Ovarian somatic tissue rejuvenates circulating apolipoproteins and promotes cognitive health in postreproductive female mice
2025-Dec-13, GeroScience IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过移植年轻卵巢体细胞组织或细胞,探索了其在改善老年雌性小鼠认知功能和脂质信号方面的作用 首次利用单细胞转录组学和拉曼光谱技术,识别出两种卵巢体细胞类型,这些细胞通过脂质信号通路恢复老年雌性小鼠的健康状态 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证,且具体分子机制需进一步阐明 探究年轻卵巢体细胞组织或细胞移植对老年雌性小鼠健康,特别是认知功能和脂质信号的影响 老年、生殖后雌性小鼠及其血清、组织样本 生物医学 阿尔茨海默病 单细胞转录组学,拉曼光谱 NA 转录组数据,光谱数据,生理数据 老年雌性小鼠样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
136 2025-12-14
Integrative bulk and single-cell transcriptomic profiling identifies core gene networks and potential therapeutic targets in glioma
2025-Dec-13, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合多队列批量转录组数据和单细胞RNA测序数据,系统识别了胶质瘤的核心基因网络和潜在治疗靶点 采用多算法整合策略(包括CytoHubba、LASSO、SVM-RFE和随机森林)筛选特征基因,并结合单细胞转录组数据验证了核心基因在肿瘤细胞亚群中的特异性表达模式 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,临床样本验证规模有限(69例),且功能机制尚未通过实验完全验证 识别胶质瘤的新型诊断生物标志物和潜在治疗靶点 胶质瘤组织样本及相关转录组数据 生物信息学 胶质瘤 批量RNA测序,单细胞RNA测序,qRT-PCR WGCNA,LASSO回归,SVM-RFE,随机森林 基因表达数据,单细胞转录组数据 504个批量转录组样本(来自5个GEO数据集)和69个临床验证样本 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
137 2025-12-14
Spatial transcriptomics reveals expression gradients in developing wheat inflorescences at cellular resolution
2025-Dec-13, The Plant cell
研究论文 本研究利用MERFISH空间转录组技术,在细胞分辨率下揭示了小麦花序发育过程中沿顶端-基部轴的基因表达梯度 首次在小麦花序组织中优化并应用MERFISH技术,实现了200个基因在细胞水平的空间定位,揭示了花序发育的时空组织模式 仅分析了200个基因的表达模式,可能未覆盖所有相关基因;研究聚焦于小麦特定发育阶段,其他物种或阶段需进一步验证 解析小麦花序发育过程中基因表达的空间模式,以理解花序架构多样性的分子基础 小麦(Triticum aestivum)花序组织,包括四个发育阶段 空间转录组学 NA MERFISH(多重错误鲁棒荧光原位杂交) NA 空间转录组数据 约50,000个细胞,覆盖四个发育阶段 NA 空间转录组学 NA NA
138 2025-12-14
Atherosclerosis licenses for an exceeding immune response in COVID-19 disease by interferon priming in circulating myeloid cells
2025-Dec-13, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究探讨了动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)患者感染COVID-19后,其循环髓系细胞因表观遗传印记而表现出过度炎症反应的分子机制 首次在单细胞水平揭示了ASCVD患者感染SARS-CoV-2后髓系免疫反应的失调特征,并证实了表观遗传印记通过I型干扰素信号通路导致过度炎症反应的机制 研究主要基于中度COVID-19患者,未涵盖重症病例;体外感染实验可能无法完全模拟体内复杂环境 阐明心血管疾病患者感染COVID-19后出现更严重炎症反应的分子机制 动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)患者与COVID-19患者的免疫细胞 单细胞组学与免疫学 心血管疾病与COVID-19 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转座酶可及染色质测序(ATAC-seq)、多重细胞因子检测、酶联免疫吸附试验(ELISA)、批量RNA测序 NA 单细胞转录组数据、表观基因组数据、细胞因子数据、临床数据 德国全国性队列(NAPKON)中的ASCVD合并COVID-19患者 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq, 批量RNA测序 NA NA
139 2025-12-14
Uncovering the toxicological impact of benzo[a]pyrene on Alzheimer's disease via network toxicology, machine learning, and single-cell transcriptomics
2025-Dec-12, Journal of Alzheimer's disease : JAD
研究论文 本研究整合网络毒理学、机器学习、单细胞转录组学和文献计量学,探索苯并[a]芘在阿尔茨海默病中的分子机制 首次整合网络毒理学、机器学习、单细胞转录组学和文献计量学,系统揭示环境神经毒物苯并[a]芘通过靶向EGFR和HSP90AB1促进阿尔茨海默病发展的分子机制,并发现EGFR作为潜在生物标志物的诊断价值 研究主要基于生物信息学分析和公开数据集,缺乏体内或体外实验验证;单细胞数据仅来源于一个数据集(GSE157827),样本代表性可能有限 探索环境神经毒物苯并[a]芘在阿尔茨海默病发病机制中的作用 苯并[a]芘与阿尔茨海默病的共同靶点基因及其分子机制 机器学习 阿尔茨海默病 单细胞RNA-seq,分子对接 LASSO,SVM 基因表达数据,单细胞转录组数据 使用了GEO数据库的AD差异表达数据和单细胞RNA-seq数据集(GSE157827),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
140 2025-12-14
MOH: a novel multilayer multi-omics heterogeneous graph for single-cell clustering
2025-Dec-12, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为MOH的新型多层多组学异构图算法,用于单细胞聚类分析 MOH通过构建多层异构图整合三种单细胞组学数据(scRNA-seq、scATAC-seq和空间转录组学),并引入层内和层间边来捕捉关联和相似性关系,克服了传统方法仅整合两种组学数据且忽视细胞间相互作用的局限 未明确提及具体局限性,但暗示了模型在引入新组学数据时可能需要调整图结构,这可能影响其可扩展性 开发一种能够整合多种单细胞组学数据的聚类算法,以更准确地识别细胞群体 单细胞多组学数据,包括scRNA-seq、scATAC-seq和空间转录组学 机器学习 癌症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)、空间转录组学 多层异构图算法 单细胞多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
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