单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1237 篇文献，本页显示第 1141 - 1160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1141 | 2025-11-15 |
Bioinformatics Analysis and Experimental Validation of Disulphidptosis in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Dec, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103955
PMID:41106220
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证研究二硫死亡相关基因在口腔鳞状细胞癌中的表达及其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 首次系统研究二硫死亡相关基因在口腔鳞癌中的表达模式，发现INF2和DSTN等15个关键基因与患者生存和免疫细胞浸润相关 | 需要进一步的实验室验证和临床试验来探索INF2和DSTN的治疗靶向性及其对免疫微环境的影响 | 研究二硫死亡相关基因在口腔鳞状细胞癌中的表达水平并评估其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 口腔鳞状细胞癌样本和相关的二硫死亡相关基因 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA测序, 实时PCR, 单细胞RNA测序, 功能富集分析, 生存分析, 免疫细胞浸润分析 | 接收者操作特征分析 | RNA测序数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1142 | 2025-11-15 |
Uncovering the Molecular Networks of Extracellular Vesicles in the Pathogenesis of Periodontitis
2025-Dec, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103936
PMID:41138693
|
研究论文 | 通过整合多种组学数据揭示牙周炎发病机制中的细胞外囊泡相关基因网络 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和因果遗传分析系统研究牙周炎中的EV相关基因网络 | 需要进一步的实验验证 | 探索牙周炎发病机制中的细胞外囊泡相关基因网络 | 牙周炎相关基因、细胞外囊泡相关基因 | 生物信息学 | 牙周炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 因果遗传分析, 分子对接 | XGBoost | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1143 | 2025-11-15 |
Elucidating the Mechanism of Radiation Therapy on Mesenchymal Cell Fate in Preventing Heterotopic Ossification
2025-Dec-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000006366
PMID:38829115
|
研究论文 | 本研究通过动物模型探究放射治疗预防异位骨化的机制，在单细胞水平分析放射诱导的间充质细胞命运变化 | 首次在单细胞水平探索放射治疗预防创伤性异位骨化的机制，揭示放射对间充质祖细胞数量和分化的双重影响 | 研究仅限于小鼠模型，临床转化需进一步验证 | 阐明放射治疗预防异位骨化的分子机制 | C57BL6J雄性小鼠的间充质祖细胞 | 单细胞测序分析 | 异位骨化 | 单细胞RNA测序，免疫荧光显微镜，显微计算机断层扫描 | 动物模型 | 单细胞转录组数据，图像数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1144 | 2025-11-15 |
Analysis of the role of RNA regulatory networks in cancer treatment: Mechanisms, applications and future prospects (Review)
2025-Dec, Molecular and clinical oncology
IF:1.4Q4
DOI:10.3892/mco.2025.2909
PMID:41220798
|
综述 | 本文综述了RNA调控网络在癌症治疗中的作用机制、应用前景及未来发展方向 | 重点关注isomiRs的功能动态及其在精准肿瘤学中的转化潜力，整合了单细胞测序和CRISPR筛选等先进技术 | NA | 分析RNA调控网络在癌症治疗中的机制、应用和未来前景 | RNA调控网络，特别是isomiRs和竞争性内源RNA网络 | 自然语言处理 | 癌症 | 单细胞测序，CRISPR筛选 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1145 | 2025-11-15 |
A drop-based workflow for fast and robust joint profiling of transcriptome and chromatin accessibility in the same cell
2025-Dec, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000258
PMID:41221081
|
研究论文 | 开发了一种基于液滴微流控的单细胞多组学工作流程，可在同一细胞中同时分析转录组和染色质可及性 | 提出快速、稳健的液滴微流控协议，实现单细胞水平RNA和染色质可及性的同步分析 | NA | 开发单细胞多组学技术以解析细胞异质性和生物学复杂性 | 单个细胞 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 转录组数据, 染色质可及性数据 | 数万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | 液滴微流控系统, 凝胶珠乳浊液(GEM)生成技术 |
| 1146 | 2025-11-15 |
TLR4-IN-C34 attenuates the progression of osteoarthritis through inhibiting inflammation, angiogenesis and pain
2025-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112084
PMID:40854507
|
研究论文 | 本文研究TLR4抑制剂C34通过抑制炎症、血管生成和疼痛来减缓骨关节炎进展的作用机制 | 首次在单细胞水平证实TLR4在OA患者软骨中表达升高，并发现特异性TLR4抑制剂C34具有多重抗OA效应 | NA | 探讨TLR4抑制剂C34对骨关节炎的治疗作用及机制 | 人类软骨样本、小鼠骨关节炎模型 | NA | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1147 | 2025-11-14 |
Effects of esketamine on electrophysiology and metabolic reprogramming in brain organoids: insights into antidepressant mechanisms
2025-Dec, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03198-4
PMID:40885845
|
研究论文 | 本研究通过脑类器官探究艾司氯胺酮对电生理和代谢重编程的影响 | 首次在人类脑类器官模型中系统研究艾司氯胺酮对电生理和代谢的浓度与时间依赖性影响 | 研究仅限于体外脑类器官模型，未进行体内验证 | 探究艾司氯胺酮的抗抑郁作用机制 | 健康对照和抑郁症患者来源的iPSC脑类器官 | 神经科学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序，电生理记录，代谢分析 | 脑类器官模型 | 电生理数据，单细胞转录组数据，代谢数据 | 健康对照和抑郁症患者来源的脑类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1148 | 2025-11-14 |
Influence of Age on Fracture Healing in Young and Middle-Aged Mice in a Proximal Femur Fracture Model
2025-Dec, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society
IF:2.1Q2
DOI:10.1002/jor.70063
PMID:40931376
|
研究论文 | 本研究通过小鼠股骨近端骨折模型探讨年龄对骨折愈合的影响 | 首次在年轻和中年小鼠中系统比较股骨近端骨折愈合差异，并发现衰老细胞和SASP因子在年龄相关愈合延迟中的作用 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠，未考虑性别差异和更老年齡组 | 确定年龄对小鼠股骨近端骨折愈合的影响及分子机制 | 12周和52周龄雄性C57BL/6J小鼠 | 骨生物学 | 骨质疏松性骨折 | 多重细胞因子分析,µCT分析,组织形态计量学,免疫染色,空间转录组学 | NA | 图像,分子表达数据 | 年轻和中年雄性C57BL/6J小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1149 | 2025-11-14 |
Time-Series Transcriptomics Identifies Xanthine Dehydrogenase in Injured Neurons Correlated With Orthodontic Pain
2025-Dec, Orthodontics & craniofacial research
IF:2.4Q2
DOI:10.1111/ocr.70036
PMID:41002069
|
研究论文 | 本研究通过时间序列转录组学分析，发现黄嘌呤脱氢酶(Xdh)在正畸疼痛高峰期的受损神经元中高表达，并开发了OTMPTGTA网络平台供研究人员探索疼痛相关基因 | 首次将时间序列转录组学应用于正畸疼痛研究，识别出Xdh在Atf3+受损神经元中的关键作用，并开发了用户友好的数据分析平台 | 研究基于小鼠模型，需要进一步验证其在人类中的适用性；样本量相对有限 | 探索正畸牙齿移动疼痛的分子和细胞机制 | 小鼠三叉神经节组织和神经元 | 转录组学 | 正畸疼痛 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 小鼠三叉神经节组织样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1150 | 2025-11-14 |
Esaxerenone inhibits renal macrophage proliferation through MR/TGF-β1 pathway in db/db mice
2025-Dec-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.124008
PMID:41067301
|
研究论文 | 本研究探讨了盐皮质激素受体阻滞剂esaxerenone通过MR/TGF-β1通路抑制db/db小鼠肾脏巨噬细胞增殖的作用机制 | 首次揭示esaxerenone通过MR/TGF-β1信号通路特异性抑制高糖诱导的巨噬细胞增殖，特别是M1亚型 | 研究仅使用db/db小鼠模型，未在其他糖尿病模型验证；体外实验使用骨髓来源巨噬细胞，与肾脏原位巨噬细胞存在差异 | 研究盐皮质激素受体阻滞对糖尿病肾病中巨噬细胞增殖的影响及其机制 | db/db糖尿病模型小鼠和骨髓来源巨噬细胞 | 分子病理学 | 糖尿病肾病 | 免疫组织化学、流式细胞术、单细胞RNA测序 | 动物模型 | 分子标记表达数据、细胞表型数据、基因表达数据 | 8周龄db/db小鼠，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1151 | 2025-11-14 |
The epidermal immune microenvironment plays a central role in the pathogenesis of psoriasis
2025-Dec, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2025.102674
PMID:41072151
|
研究论文 | 本文探讨了表皮免疫微环境在银屑病发病机制中的核心作用 | 揭示了表皮免疫微环境作为银屑病核心致病机制，强调角质形成细胞既是炎症效应器又是疾病驱动者的双重角色 | NA | 阐明银屑病的发病机制并探索新的治疗靶点 | 银屑病患者的皮肤免疫微环境 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1152 | 2025-11-14 |
A Tertiary Lymphoid Structure-Related Gene Signature Predicts Prognosis and Treatment Response in Hepatocellular Carcinoma
2025-Dec, World journal of oncology
IF:2.1Q3
DOI:10.14740/wjon2646
PMID:41208844
|
研究论文 | 本研究开发并验证了一个与三级淋巴结构相关的六基因特征，用于预测肝细胞癌患者的预后和治疗反应 | 首次建立了基于三级淋巴结构的六基因特征评分系统，并在多个独立队列中验证了其对免疫治疗反应的预测价值 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，需要前瞻性临床试验进一步验证 | 开发预测肝细胞癌预后和治疗反应的生物标志物 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组分析，单细胞RNA测序，LASSO-Cox回归 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据 | 多个独立肝细胞癌队列（包括TCGA和GEO数据库） | NA | 单细胞RNA测序，转录组测序 | NA | NA |
| 1153 | 2025-11-14 |
Analysis of the SH3-Domain Kinase Binding Protein 1 Predictive Model for Pancreatic Ductal Adenocarcinoma and CCCTC-Binding Factor Transcriptional Regulatory Study
2025-Dec, World journal of oncology
IF:2.1Q3
DOI:10.14740/wjon2668
PMID:41208840
|
研究论文 | 通过多组学整合分析系统评估SH3KBP1在胰腺导管腺癌中的表达模式、生物学功能及调控机制 | 首次通过机器学习算法结合多组学数据鉴定SH3KBP1作为胰腺癌关键预测生物标志物，并揭示CTCF转录因子对其的调控机制 | 样本量相对有限（179例肿瘤样本和171例非肿瘤样本），需更大规模验证 | 系统研究SH3KBP1在胰腺导管腺癌中的表达特征、生物学功能及转录调控机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤组织及细胞系 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,CRISPR基因敲除,转录因子结合位点预测 | 支持向量机(SVM),LASSO回归,SHAP分析 | mRNA表达数据,蛋白质组学数据,单细胞RNA测序数据,空间转录组学数据 | 179例PDAC肿瘤样本,171例非肿瘤样本（包括4例癌旁组织和167例正常对照）,300对PDAC和非肿瘤样本的蛋白质组学数据 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 所有分析均在R平台上使用专业软件包完成 |
| 1154 | 2025-11-14 |
Bioinformatics driven in gene targeting platform for gold anticancer strategy delivery
2025-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102438
PMID:41209699
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学方法识别TNBC中高表达基因SDC1，并构建金纳米簇靶向核酸递送系统抑制肿瘤血管生成 | 首次发现SDC1基因与TNBC预后及依托泊苷耐药性的正相关性，并开发了基于肿瘤微环境响应性的金纳米簇靶向递送系统 | NA | 发现新的靶向基因并开发核酸递送系统用于三阴性乳腺癌治疗 | 三阴性乳腺癌细胞及肿瘤微环境 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 基因芯片数据分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1155 | 2025-11-14 |
Probiotics derived sodium benzoate improves social behavior of offspring exposed in the maternal immune activation through regulation of histone lysine benzoylation in astrocytes
2025-Dec, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03164-0
PMID:40855005
|
研究论文 | 本研究揭示益生菌衍生的苯甲酸钠通过调控星形胶质细胞组蛋白赖氨酸苯甲酰化改善母体免疫激活后代社交行为 | 首次发现益生菌代谢物苯甲酸钠通过组蛋白赖氨酸苯甲酰化表观遗传机制调节星形胶质细胞功能，揭示微生物-肠-脑轴新作用通路 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床转化需进一步验证 | 探索益生菌代谢物改善自闭症谱系障碍社交行为的分子机制 | 母体免疫激活诱导的自闭症小鼠模型及星形胶质细胞 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序,RNA测序,Cut & Tag分析 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据,表观遗传数据 | 自闭症队列人群及MIA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,表观遗传分析 | NA | NA |
| 1156 | 2025-11-14 |
Comparative transcriptomics of lateral hypothalamic cell types reveals conserved growth hormone-tachykinin dynamics in feeding
2025-Dec, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102251
PMID:40947010
|
研究论文 | 本研究通过比较转录组学分析揭示了侧下丘脑细胞类型中生长激素-速激肽动态在摄食行为中的保守机制 | 首次在斑马鱼和老鼠中鉴定出共表达生长激素受体和速激肽的保守GABA能神经元集群，并发现其在摄食状态下的激活机制 | 研究主要基于幼虫斑马鱼模型，在成年动物和人类中的保守性需要进一步验证 | 阐明侧下丘脑神经元在食欲调控中的分子和细胞特征及其进化保守性 | 斑马鱼和老鼠的侧下丘脑神经元 | 神经科学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序，Act-seq方法，整合比较转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 幼虫斑马鱼侧下丘脑神经元（饥饿和饱食状态） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Act-seq方法（活动依赖性转录特征捕获） |
| 1157 | 2025-11-14 |
LILRB4 regulates circadian disruption-induced mammary tumorigenesis via non-canonical WNT signaling pathway
2025-Dec, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03597-5
PMID:41102383
|
研究论文 | 本研究探讨了昼夜节律紊乱通过LILRB4和非经典WNT信号通路促进乳腺肿瘤发生的作用机制 | 首次揭示LILRB4作为昼夜节律紊乱与侵袭性乳腺肿瘤发生之间的关键连接分子，并证明靶向LILRB4免疫疗法可抑制肿瘤转移 | 研究主要基于基因工程小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证 | 阐明昼夜节律紊乱促进乳腺肿瘤发生的分子机制 | 侵袭性乳腺癌基因工程小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,多重免疫染色,实时PCR | 基因工程小鼠模型 | 单细胞测序数据,流式数据,图像数据,基因表达数据 | LD12:12和昼夜节律紊乱小鼠的肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1158 | 2025-11-13 |
Single-cell immune landscape of acute kidney injury after cardiac surgery with cardiopulmonary bypass
2025-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2025.2581506
PMID:41199602
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了心脏手术后急性肾损伤患者的免疫细胞景观 | 首次整合单细胞RNA测序、流式细胞术和蛋白质微阵列技术研究心脏手术相关急性肾损伤 | 单中心研究，样本量较小（4名患者） | 阐明心脏手术后急性肾损伤的免疫细胞机制 | 接受心脏手术的成年患者 | 单细胞分析 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 蛋白质微阵列 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 蛋白质微阵列数据 | 4名患者，42,362个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1159 | 2025-11-10 |
Exploring the therapeutic role of thiabendazole in lung adenocarcinoma via network pharmacology and single-cell analysis
2025-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102548
PMID:41130017
|
研究论文 | 通过网络药理学和单细胞分析探索噻苯达唑在肺腺癌中的治疗作用 | 首次结合网络药理学和单细胞RNA测序技术系统研究抗寄生虫药物噻苯达唑在肺腺癌中的抗癌机制 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索噻苯达唑在肺腺癌治疗中的作用机制 | 肺腺癌相关基因和免疫细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 网络药理学, 分子对接 | LASSO回归, 支持向量机, 随机森林 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 多个GEO数据集(GSE136103, GSE10072, GSE19188, GSE19804, GSE30219, GSE40791) | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 1160 | 2025-11-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Potential Mechanism of RUNX3 Reshaping Tumor Microenvironment in Non-small-cell Lung Cancer
2025-Dec, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-025-18034-w
PMID:40916017
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了RUNX3在非小细胞肺癌中重塑肿瘤微环境的潜在机制 | 首次在单细胞水平上系统分析RUNX3表达状态对非小细胞肺癌肿瘤微环境的影响 | 样本量较小（仅7例患者），需要更大规模研究验证 | 探索RUNX3在非小细胞肺癌中调控肿瘤微环境的具体生物学机制 | 非小细胞肺癌患者的癌组织和癌旁组织 | 单细胞测序分析 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学染色 | Seurat分析流程 | 单细胞转录组数据 | 7例非小细胞肺癌患者，包含3对癌和癌旁组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |