单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1119 篇文献，本页显示第 1101 - 1119 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1101 | 2025-10-06 |
Human microbiota influence the immune cell composition and gene expression in the tumor environment of a murine model of glioma
2025-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2508432
PMID:40443227
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人源化微生物组小鼠，揭示肠道微生物群影响胶质瘤肿瘤微环境中免疫细胞组成和基因表达 | 首次在胶质瘤小鼠模型中证明人源肠道微生物群通过调节肿瘤微环境中M1型巨噬细胞比例和炎症标志物表达影响抗PD-1治疗效果 | 研究样本量有限，仅使用两种人源化微生物系；观察时间较短（仅14天）；机制研究不够深入 | 探究人源肠道微生物群对胶质瘤微环境免疫细胞组成和抗PD-1治疗反应的影响 | 人源化微生物组小鼠和GL261胶质瘤细胞系 | 单细胞测序分析 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 微生物组数据 | 两种人源化微生物系小鼠（HuM1和HuM2），在胶质瘤模型中分析肿瘤免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | NA |
| 1102 | 2025-10-06 |
Cross-disease integration of single-cell RNA sequencing data from lung myeloid cells reveals TAM signature in in vitro model
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2502278
PMID:40448976
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据验证了3D人类细胞培养模型作为研究肿瘤相关巨噬细胞的临床前模型 | 首次将体外3D模型中的巨噬细胞单细胞数据与患者来源数据集整合，发现其与SPP1 TAM群体的表型特征相似 | 研究基于体外模型，与真实人体环境存在差异 | 验证3D人类细胞培养模型在研究肿瘤相关巨噬细胞方面的适用性 | 肺髓系细胞、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 3D细胞培养模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1103 | 2025-10-06 |
Faecalibacterium prausnitzii prevents age-related heart failure by suppressing ferroptosis in cardiomyocytes through butyrate-mediated LCN2 regulation
2025-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2505119
PMID:40364435
|
研究论文 | 本研究揭示了普拉梭菌通过丁酸盐介导的LCN2调控抑制心肌细胞铁死亡，从而预防年龄相关性心力衰竭的机制 | 首次发现年龄相关肠道菌群失调通过铁死亡途径驱动心力衰竭，并阐明普拉梭菌及其代谢产物丁酸盐的保护作用机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，在人类中的直接证据仍需进一步验证 | 探索年龄相关肠道菌群改变与老年人心力衰竭之间的潜在联系 | 老年个体、心力衰竭患者、大鼠模型、心肌细胞 | 微生物组学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 16S rRNA测序, PCR, 基因编辑 | 动物模型 | 基因表达数据, 微生物组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | NA |
| 1104 | 2025-10-06 |
Comprehensive characterization of the molecular feature of T cells in laryngeal cancer: evidence from integrated single-cell and bulk RNA sequencing data using multiple machine learning approaches
2025-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2025.2477287
PMID:40179028
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，结合多种机器学习方法，全面表征喉癌中T细胞的分子特征 | 首次在单细胞分辨率下系统研究喉癌中T细胞相关分子特征，并开发了基于10种机器学习方法的TCRG分类器 | 样本量有限（仅3例喉癌组织），需要更大规模验证 | 阐明喉癌中T细胞相关分子的临床相关性并开发预后预测模型 | 喉癌组织和匹配的癌旁正常组织 | 生物信息学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，机器学习 | 多种机器学习方法（10种） | RNA测序数据 | 3例喉癌组织及匹配癌旁组织，TCGA和GEO数据库数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x单细胞RNA测序平台 |
| 1105 | 2025-10-06 |
CD8+ T cells in breast cancer tumors and draining lymph nodes: PD-1 levels, effector functions and prognostic relevance
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2502354
PMID:40351118
|
研究论文 | 本研究评估了乳腺癌患者不同组织中CD8 T细胞的PD-1表达水平、功能状态及其预后意义 | 首次在乳腺癌中系统比较肿瘤组织、瘤旁组织和引流淋巴结中CD8 T细胞的耗竭阶段分布特征 | 研究主要聚焦于luminal型乳腺癌，样本来源组织类型有限 | 探究CD8 T细胞在不同组织中的耗竭状态及其临床意义 | 乳腺癌患者的肿瘤组织、瘤旁组织和肿瘤引流淋巴结中的CD8 T细胞 | 免疫肿瘤学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, TCR-β测序 | NA | 基因表达数据, T细胞受体序列数据 | 乳腺癌患者组织样本（肿瘤、瘤旁、引流淋巴结） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1106 | 2025-10-06 |
Comprehensive profiling of cell type-specific expression and distribution of complement genes in mouse and human kidneys: insights into normal physiology and response to kidney transplantations
2025-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2025.2471568
PMID:40015727
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序全面分析了小鼠和人类肾脏中补体基因的细胞类型特异性表达模式 | 首次在肾脏细胞景观演变背景下系统分析补体基因表达，比较了正常与移植排斥肾脏的差异 | 研究主要基于现有数据库的二次分析，缺乏实验验证 | 探究肾脏中补体基因的表达分布及其在肾脏移植排斥反应中的变化 | 健康人类受试者、C57BL/6小鼠和肾脏移植排斥小鼠 | 单细胞转录组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 基因表达数据 | 来自NCBI GEO数据库的健康人类、正常小鼠和移植排斥小鼠肾脏单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1107 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing of peripheral blood mononuclear cells reveals immune landscape of monkeypox patients with HIV
2025-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2025.2459136
PMID:39868995
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析猴痘患者外周血单个核细胞，揭示HIV感染者免疫景观特征 | 首次在单细胞分辨率下比较HIV感染与非感染猴痘患者的免疫反应差异，发现单核细胞和中性粒细胞介导的细胞互作异常 | 样本量较小（仅6例患者），HIV感染者病毒载量低于检测限可能影响结果代表性 | 探究HIV感染对猴痘患者免疫病理机制的影响 | 猴痘住院患者的外周血单个核细胞（PBMCs） | 单细胞组学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例猴痘患者（3例HIV+，3例HIV-） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1108 | 2025-10-07 |
Integrating RNA-seq and scRNA-seq to explore the prognostic features and immune landscape of exosome-related genes in breast cancer metastasis
2025-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2024.2447917
PMID:39847423
|
研究论文 | 通过整合RNA-seq和scRNA-seq数据探索外泌体相关基因在乳腺癌转移中的预后特征和免疫景观 | 首次整合RNA-seq和单细胞RNA-seq数据构建基于外泌体相关基因的乳腺癌转移预后模型 | 模型预测性能的AUC值相对较低（0.602-0.654），需要进一步验证 | 探索外泌体相关基因在乳腺癌转移中的作用并建立预后模型 | 乳腺癌样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, CIBERSORT, ssGSEA | Cox回归, Lasso-Cox回归, 风险评分模型 | 基因表达数据 | TCGA数据库中的乳腺癌队列 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1109 | 2025-10-07 |
Revealing the role of natural killer cells in ankylosing spondylitis: identifying diagnostic biomarkers and therapeutic targets
2025-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2025.2457523
PMID:39853176
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证揭示了自然杀伤细胞在强直性脊柱炎中的作用机制 | 首次整合多个微阵列数据集和单细胞RNA测序数据系统分析NK细胞在AS中的功能，并识别出6个关键基因作为潜在诊断标志物 | 样本量有限，部分结果验证依赖于公共数据集，需要更大规模临床样本验证 | 探索自然杀伤细胞在强直性脊柱炎发病机制中的作用，识别诊断生物标志物和治疗靶点 | 强直性脊柱炎患者和对照组的基因表达数据 | 生物信息学 | 强直性脊柱炎 | 微阵列分析, 单细胞RNA测序, 实时PCR, WGCNA分析 | 逻辑回归分析, 列线图 | 基因表达数据 | 多个公共数据集（GSE25101, GSE73754, GSE194315等） | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 1110 | 2025-10-07 |
Construction and validation of renal cell carcinoma tumor cell differentiation-related prognostic classification (RCC-TCDC): an integrated bioinformatic analysis and clinical study
2025-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2025.2490830
PMID:40248945
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析和临床研究，构建并验证了肾细胞癌肿瘤细胞分化相关的预后分类系统 | 首次基于肿瘤细胞分化特征构建肾细胞癌分子分类系统，整合单细胞和bulk RNA-seq数据 | 研究样本量相对有限，需要更大规模的外部验证 | 开发基于肿瘤细胞分化的肾细胞癌分子分类系统，用于精准风险分层和个性化治疗 | 肾细胞癌患者 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 免疫组织化学染色 | Lasso回归, 多变量预后模型, Cox回归分析 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA-KIRC队列和新华队列370例肾肿瘤患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1111 | 2025-10-07 |
Integrated bioinformatics analysis identifies neutrophils and villous cytotrophoblasts infiltration characterized by BLC6 upregulation as associated with the co-occurrence of gestational diabetes mellitus and pre-eclampsia
2025-Dec, Hypertension in pregnancy
IF:1.5Q4
DOI:10.1080/10641955.2025.2475814
PMID:40122115
|
研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定与妊娠期糖尿病和子痫前期共病相关的中性粒细胞和绒毛细胞滋养细胞浸润特征 | 首次发现BCL6在GDM和PE共病患者的中性粒细胞和绒毛细胞滋养细胞中高表达，并鉴定出三个共同枢纽基因 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证 | 鉴定与妊娠期糖尿病和子痫前期共病相关的枢纽基因和通路 | 妊娠期糖尿病和子痫前期患者 | 生物信息学 | 妊娠期糖尿病和子痫前期 | 生物信息学分析，单细胞测序 | 回归模型，ROC分析 | 基因表达矩阵数据 | 来自GEO数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1112 | 2025-10-07 |
Novel therapeutic targets uncovered by genome-wide integrative analysis in bronchopulmonary dysplasia
2025-Dec, The journal of maternal-fetal & neonatal medicine : the official journal of the European Association of Perinatal Medicine, the Federation of Asia and Oceania Perinatal Societies, the International Society of Perinatal Obstetricians
DOI:10.1080/14767058.2025.2469837
PMID:39988826
|
研究论文 | 通过整合基因组关联研究、单细胞转录组学和孟德尔随机化分析，识别支气管肺发育不良的基因表达失调和分子通路 | 首次将GWAS、scRNA-seq和MR分析整合应用于BPD研究，发现肌成纤维细胞是关键互作细胞类型并鉴定出CDH4等保护基因和GRB10风险基因 | 未提及样本量大小和研究人群特征，缺乏实验验证 | 探索支气管肺发育不良的遗传机制并识别新的治疗靶点 | 极早产儿支气管肺发育不良患者 | 基因组学 | 支气管肺发育不良 | GWAS, scRNA-seq, MR分析 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1113 | 2025-10-07 |
The Role of Autophagy and Cell Communication in COPD Progression: Insights from Bioinformatics and scRNA-seq
2025-Dec, COPD
IF:2.2Q3
DOI:10.1080/15412555.2024.2444663
PMID:39991824
|
研究论文 | 通过生物信息学和单细胞RNA测序分析自噬相关基因在COPD中的作用及细胞通讯模式 | 结合生物信息学工具和单细胞RNA测序技术，首次系统分析吸烟激活的自噬相关基因在COPD免疫景观和细胞通讯中的作用 | NA | 研究自噬和细胞通讯在慢性阻塞性肺疾病进展中的作用机制 | COPD患者（重点关注吸烟激活的自噬相关基因和免疫细胞） | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 生物信息学分析，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1114 | 2025-10-07 |
The pancreatic tumor microenvironment of treatment-naïve patients causes a functional shift in γδ T cells, impairing their anti-tumoral defense
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2466301
PMID:39945298
|
研究论文 | 本研究探讨胰腺导管腺癌肿瘤微环境对γδ T细胞功能的抑制作用 | 首次使用治疗初治患者的类器官条件培养基证明PDAC肿瘤微环境导致γδ T细胞功能转变 | 样本量有限，主要依赖体外实验验证 | 研究胰腺癌肿瘤微环境如何影响γδ T细胞的抗肿瘤功能 | 治疗初治胰腺导管腺癌患者的γδ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,类器官培养 | NA | 流式细胞数据,单细胞转录组数据 | 治疗初治PDAC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1115 | 2025-10-07 |
Key RNA-binding proteins in renal fibrosis: a comprehensive bioinformatics and machine learning framework for diagnostic and therapeutic insights
2025-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2025.2463560
PMID:39957043
|
研究论文 | 通过综合生物信息学和机器学习方法识别与肾纤维化相关的关键RNA结合蛋白，并建立诊断模型 | 首次整合生物信息学、机器学习方法和单细胞RNA测序技术系统鉴定肾纤维化中的关键RNA结合蛋白 | 研究主要基于公共数据库和动物模型，需要进一步临床验证 | 识别肾纤维化中的关键RNA结合蛋白，开发诊断模型并探索治疗靶点 | 肾纤维化患者样本和正常肾脏样本 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，机器学习建模 | lasso回归，logistic回归 | 基因表达数据 | 175个肾纤维化样本和99个正常肾脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1116 | 2025-10-07 |
The secretomes of bovine mammary epithelial cell subpopulations differentially modulate macrophage function
2025-Dec, The veterinary quarterly
DOI:10.1080/01652176.2025.2463338
PMID:39921381
|
研究论文 | 本研究探讨了牛乳腺上皮细胞亚群分泌组对巨噬细胞功能的差异调节作用 | 首次发现不表达CD73的牛乳腺上皮细胞亚群分泌组能最强效增强巨噬细胞的吞噬功能和活性氧积累 | 研究仅针对体外培养的巨噬细胞，未进行体内验证实验 | 优化牛乳腺上皮细胞分泌组作为乳腺炎治疗方案的开发 | 牛乳腺上皮细胞亚群和巨噬细胞 | 细胞生物学 | 乳腺炎 | 单细胞RNA测序, 荧光激活细胞分选 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | 牛外周血单核细胞分化的巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1117 | 2025-10-07 |
Prognostic significance of neutrophil extracellular trap-related genes in childhood acute lymphoblastic leukemia: insights from multi-omics and in vitro experiment
2025-Dec, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1080/16078454.2025.2452701
PMID:39829399
|
研究论文 | 本研究基于中性粒细胞胞外诱捕网相关基因构建儿童急性淋巴细胞白血病的预后模型 | 首次将中性粒细胞胞外诱捕网相关基因与儿童急性淋巴细胞白血病预后关联，并通过多组学分析和体外实验验证 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发儿童急性淋巴细胞白血病的预后预测模型 | 儿童急性淋巴细胞白血病患者 | 生物信息学 | 急性淋巴细胞白血病 | 转录组测序, 单细胞转录组测序, RT-qPCR, 多组学分析 | LASSO回归, Cox回归, 风险模型, 列线图 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 来自TARGET-ALL-P2、TARGET-ALL-P3队列和GSE26713、GSE130116数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1118 | 2024-12-21 |
A diagnostic signatures for intervertebral disc degeneration using TNFAIP6 and COL6A2 based on single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq analyses
2025-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2024.2443568
PMID:39704340
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析，识别与椎间盘退变相关的潜在生物标志物和信号通路 | 首次通过单细胞和批量RNA测序结合的方法，识别出TNFAIP6和COL6A2作为椎间盘退变的诊断标志物，并验证了ZEB2作为转录因子在调控这些关键基因中的潜在作用 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能存在样本偏倚和数据质量问题 | 识别与椎间盘退变相关的潜在生物标志物和信号通路，以辅助诊断和预测疾病活动 | 椎间盘退变病例的生物标志物和信号通路 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、批量RNA测序、RT-qPCR、免疫组化（IHC） | NA | RNA | 多个数据集（GSE70362、GSE124272）和组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1119 | 2024-12-20 |
Characterisation of the tumour microenvironment and PD-L1 granularity reveals the prognostic value of cancer-associated myofibroblasts in non-invasive bladder cancer
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2024.2438291
PMID:39698899
|
研究论文 | 研究分析了非肌肉浸润性膀胱癌（NMIBC）的肿瘤微环境（TME）组成和PD-L1表达，并探讨了癌症相关肌成纤维细胞（myoCAF）的预后价值 | 首次系统分析了NMIBC的肿瘤微环境组成，并揭示了myoCAF在预测疾病进展和复发中的潜在预后价值 | 研究样本量有限，且仅限于NMIBC患者，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨NMIBC的肿瘤微环境特征及其在治疗预后中的作用 | NMIBC患者的肿瘤和非肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组学分析、组织微阵列 | NA | 组织 | 73名NMIBC患者及888名独立队列患者 | NA | NA | NA | NA |