单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1237 篇文献，本页显示第 1061 - 1080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2025-12-03 |
Profiling Cell-state Fingerprints Based on Deep Learning Model with Meta-programs of Pan-cancer
2025-Dec-02, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf123
PMID:41329499
|
研究论文 | 本研究基于深度学习模型StateNet，利用泛癌元程序生成细胞状态指纹，以分析癌症细胞状态的共性与个体差异 | 开发了深度学习模型StateNet，首次基于泛癌元程序生成细胞状态指纹，用于揭示癌症细胞的共享特征和个体特性，并识别了ACAT2作为缺氧与脂质代谢通路的关键介导因子 | 研究主要依赖单细胞RNA测序数据，可能未涵盖所有细胞状态或组织类型，且样本量虽大但仍有扩展空间 | 旨在解析泛癌中细胞状态的共同机制和个体差异，开发工具用于癌症分析和预后预测 | 159,372个细胞，来自245个细胞系，覆盖14种组织类型，以及3,210个癌症样本 | 机器学习 | 泛癌 | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型StateNet | 单细胞RNA测序数据 | 159,372个细胞（来自245个细胞系）和3,210个癌症样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1062 | 2025-12-03 |
Spatiotemporal liver dynamics shape hepatocellular heterogeneity and impact in vivo gene engineering
2025-Dec, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.06.018
PMID:40617259
|
研究论文 | 本研究通过克隆追踪、单细胞和空间转录组学技术，探索了小鼠肝脏生长过程中肝细胞异质性的演变及其对体内基因工程的影响 | 揭示了新生肝脏中克隆性肝细胞在空间生态位中的定位及其对成年组织生成的贡献，并展示了靶向这些细胞可提高基因编辑效率 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类肝脏中的适用性尚需进一步验证 | 探究肝细胞异质性在肝脏生长中的动态变化及其对体内基因治疗策略的影响 | 不同年龄阶段的小鼠肝脏组织 | 数字病理学 | NA | 克隆追踪、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间数据 | 不同年龄的小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1063 | 2025-12-03 |
Spatial Transcriptomics of Developing Wheat Seed Reveals Concentric Gene Expression Zones and Subgenome Biased Expression of Key Genes
2025-Dec, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70351
PMID:40904198
|
研究论文 | 本研究利用STOmics空间转录组平台，可视化小麦种子在灌浆关键期的基因表达空间模式，揭示了胚乳中的同心表达区域和亚基因组偏向表达的关键基因 | 首次在小麦种子中应用空间转录组技术，实现了亚细胞分辨率的转录本定位，识别了与八个功能细胞群相关的基因表达簇，并发现了胚乳内四个同心区域的表达模式 | 研究仅聚焦于14 DPA（花后天数）的小麦种子，未覆盖整个发育过程，且样本量有限 | 探究小麦种子发育过程中基因表达的空间组织，以理解营养储存、胁迫耐受和萌发等关键过程 | 小麦（Triticum aestivum）种子，特别是在灌浆关键期的发育阶段 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 超过4,000,000个空间解析的转录本 | STOmics | 空间转录组学 | STOmics空间转录组平台 | NA |
| 1064 | 2025-12-03 |
Spatial Cross-talk Modeling of the Tumor Microenvironment Identifies CCR5-Mediated Glia-to-Glia Signaling as a Key Regulator of Brain Metastatic Progression
2025-Dec-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0237
PMID:40960488
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和细胞间通讯分析，揭示了脑转移瘤微环境中胶质细胞间信号传导的关键作用，并提出了靶向CCR5介导的胶质细胞信号传导作为治疗新策略 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学，系统解析脑转移进展中胶质细胞间的空间交互作用，并发现CCL4-CCR5信号轴可作为治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证不足；靶向治疗的长效性和潜在脱靶效应未充分评估 | 探究脑转移瘤微环境中胶质细胞间信号传导机制及其对肿瘤进展的调控作用 | 脑转移瘤微环境中的星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞 | 空间转录组学 | 脑转移瘤 | RNA测序, 空间转录组学, 细胞间通讯分析 | NA | 转录组数据, 空间表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1065 | 2025-12-03 |
Combining Mendelian randomization and network toxicology to decipher the causal role and molecular mechanisms of environmental pollutants in breast cancer: A focus on Methyl-4-hydroxybenzoate
2025-Dec, Cancer epidemiology
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.canep.2025.102953
PMID:41183465
|
研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化和网络毒理学方法，探讨了环境污染物甲基对羟基苯甲酸酯在乳腺癌中的因果作用及分子机制 | 首次结合孟德尔随机化和网络毒理学，提出了一种非雌激素受体依赖的致癌机制假说，涉及生长因子信号传导失调和代谢重编程 | 研究主要基于遗传数据和计算分析，缺乏直接的实验验证，且样本来源有限（如FinnGen联盟） | 探究甲基对羟基苯甲酸酯在乳腺癌中的因果角色及其非雌激素机制 | 乳腺癌患者及尿液甲基对羟基苯甲酸酯硫酸盐的遗传数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 孟德尔随机化分析、网络毒理学、转录组分析、单细胞/空间RNA测序、分子对接 | NA | 遗传数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 尿液MEP硫酸盐数据n=8285，FinnGen联盟乳腺癌风险数据n=182,927 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1066 | 2025-12-03 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing analysis reveals cuproptosis-related proteins in Crohn's disease
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148990
PMID:41232892
|
研究论文 | 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了克罗恩病中与铜死亡相关的蛋白标志物及其与代谢和免疫的关联 | 首次将铜死亡相关蛋白与克罗恩病联系起来，并整合批量与单细胞数据构建诊断模型，揭示了CD274、PDK1、CP和SLC31A2等新标志物 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；单细胞分析仅为初步探索性结果，需进一步功能研究确认 | 探索铜死亡相关蛋白在克罗恩病中的作用，并构建诊断模型 | 克罗恩病患者炎症组织与非炎症组织 | 生物信息学 | 克罗恩病 | RNA测序，单细胞RNA测序，RT-qPCR | 诊断模型 | 基因表达数据 | 494例组织样本（批量数据）和25,121个细胞（单细胞数据） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1067 | 2025-12-03 |
Systematically Revealing Quantitative Multi-Target Integrative Effects of Plants With Artificial Intelligence Method
2025-Dec, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70321
PMID:40824771
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于人工智能的新方法，以山楂为例，系统揭示了植物在单细胞水平上对疾病的多靶点潜在整合效应 | 提出了一种基于深度自编码神经网络模型的新方法，将植物与疾病之间多个共同靶点在单细胞转录组中的表达水平编码为一个整合值（MTIS），首次在单细胞水平上实现了植物多靶点潜在整合效应的景观和定量图谱 | 该方法目前仅以山楂和动脉粥样硬化为例进行了验证，其广泛适用性有待更多植物和疾病模型的进一步测试 | 系统揭示植物对疾病的定量多靶点整合效应 | 山楂（植物）对动脉粥样硬化疾病的影响 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | 深度自编码神经网络 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1068 | 2025-12-03 |
Oxidative Stress and Pyroptosis Mediated by CEBPB/HMGB1 Signaling in Sepsis-Exacerbated Coronary Atherosclerosis
2025-Dec, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1177/15230864251380263
PMID:41167615
|
研究论文 | 本研究探讨了氧化应激和CEBPB/HMGB1/VCAM1信号轴在脓毒症加剧的冠状动脉疾病中的作用 | 揭示了CEBPB/HMGB1/VCAM1轴在脓毒症中连接全身炎症与氧化血管损伤的新机制，为CAD并发症提供了治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，人类临床验证有限 | 探索脓毒症加剧冠状动脉粥样硬化的分子机制，特别是氧化应激和细胞焦亡的作用 | 雄性ApoE小鼠、THP-1来源的巨噬细胞、人主动脉内皮细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量转录组学、染色质免疫沉淀、双荧光素酶报告基因检测、酶联免疫吸附试验、活性氧检测、流式细胞术 | NA | RNA测序数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1069 | 2025-12-03 |
Tumor and Immune Dynamics Following Sequential CDK4/6 and PD-1 Inhibition: Results from a Phase 2 Study in Dedifferentiated Liposarcoma
2025-Dec-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0334
PMID:41325133
|
研究论文 | 本研究通过一项2期临床试验，评估了CDK4/6抑制剂帕博西尼与PD-1抑制剂瑞替法利单抗在晚期去分化脂肪肉瘤中的联合治疗效果，并利用单细胞RNA测序和高参数流式细胞术分析了肿瘤和免疫动态变化 | 首次在晚期去分化脂肪肉瘤患者中，采用帕博西尼先导给药后联合PD-1抑制剂的序贯治疗策略，并通过单细胞RNA测序和高参数流式细胞术全面评估了肿瘤和宿主免疫的动态响应 | 研究因42%的免疫相关毒性率而提前终止，样本量较小（12例患者），且仅部分患者有配对肿瘤活检分析，可能限制了统计功效和结论的普适性 | 评估CDK4/6抑制剂与PD-1抑制剂序贯联合治疗在晚期去分化脂肪肉瘤中的疗效，并探究肿瘤和免疫系统的动态变化机制 | 晚期去分化脂肪肉瘤患者 | 数字病理学 | 脂肪肉瘤 | 单细胞RNA测序, 高参数流式细胞术 | NA | RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 12例患者，其中9例有至少1次肿瘤活检分析，3例有配对活检，10例有配对血液样本分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1070 | 2025-12-03 |
Multimodal foundation transformer models for multiscale genomics
2025-Dec-01, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02918-6
PMID:41326819
|
综述 | 本文探讨了基于Transformer的模型在分析和整合多尺度生物数据方面的最新进展，并提出了一个模块化的“超级Transformer”架构设计 | 将Transformer模型分为三个层级进行系统分类，并提出了利用交叉注意力机制整合异质模态的模块化“超级Transformer”架构 | 本文为综述性文章，未涉及具体实验验证，主要讨论模型架构和挑战 | 为多尺度、多模态基因组学研究提供Transformer模型的资源与路线图 | 基因组序列、单细胞转录组学和空间数据 | 机器学习 | NA | NA | Transformer, 大型语言模型 | 基因组序列, 单细胞转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1071 | 2025-12-03 |
Three-Year Follow-Up of Neoadjuvant Tislelizumab with Chemotherapy in Locally Advanced Gastric and Gastroesophageal Junction Adenocarcinoma: Revealing Cancer-Associated Fibroblast Heterogeneity Corresponding to PD-1 Blockade Efficacy
2025-Dec-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508433
PMID:41327861
|
研究论文 | 本研究报道了局部晚期胃癌患者接受新辅助替雷利珠单抗联合SOX化疗方案治疗的三年随访数据，并通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了癌症相关成纤维细胞异质性对PD-1阻断疗效的影响 | 首次在局部晚期胃癌新辅助免疫治疗背景下，通过单细胞RNA测序和空间转录组学鉴定并验证了三种癌症相关成纤维细胞表型，特别是发现炎症性CAFs与免疫治疗疗效负相关 | 研究为单臂II期临床试验，样本量较小（49例患者），且单细胞测序仅来自7例患者，需要更大规模随机对照试验验证 | 评估新辅助替雷利珠单抗联合SOX化疗在局部晚期胃癌中的长期疗效，并探索癌症相关成纤维细胞异质性对PD-1阻断疗效的影响机制 | 局部晚期胃癌和胃食管结合部腺癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Cox回归模型, Kaplan-Meier分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据, 临床随访数据 | 49例患者（其中7例进行了单细胞RNA测序） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1072 | 2025-12-02 |
Integrating pathology genomics and single-cell genomics to identify lactate metabolism-related prognostic features and therapeutic strategies for melanoma
2025-Dec, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02190-1
PMID:41006685
|
研究论文 | 本研究整合病理基因组学和单细胞基因组学，构建了基于乳酸代谢的预后模型，并探索了黑色素瘤的治疗策略 | 首次整合多组学数据（包括病理影像特征、单细胞RNA测序、空间转录组学等）系统表征黑色素瘤乳酸代谢特征，并开发了结合病理特征和基因的预后模型，同时通过实验验证了关键基因RAB32的功能 | 研究主要基于TCGA等公共数据集，外部验证可能有限；模型在临床广泛应用前需进一步前瞻性验证 | 系统表征黑色素瘤乳酸代谢的分子特征，构建预后模型并探索治疗策略 | 皮肤黑色素瘤（SKCM）患者样本及细胞系 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 基因集变异分析, 机器学习 | ResNet50, 10种机器学习算法组合 | 图像, 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | TCGA队列训练和验证集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1073 | 2025-12-02 |
Endothelial SPRY1 deficiency associates with angiogenic-metabolic reprogramming in pulmonary arterial hypertension: a multi-omics analysis of bulk and single-cell transcriptomic profiles
2025-Dec, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02175-0
PMID:41006686
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组测序、高维加权基因共表达网络分析和机器学习，揭示了肺动脉高压中肺毛细血管内皮细胞的扩张及其代谢重编程，并鉴定出SPRY1为关键生物标志物 | 首次通过多组学分析结合机器学习，在肺动脉高压中系统揭示了毛细血管内皮细胞的异质性扩张与糖酵解-三羧酸循环代谢通路失调的关联，并鉴定出SPRY1这一新型关键生物标志物 | 研究主要基于GEO数据库的测序数据，虽然在大鼠模型中进行了验证，但临床样本量有限，且机制研究深度有待进一步实验验证 | 阐明肺动脉高压血管重塑的细胞分子机制，鉴定关键致病因子 | 肺动脉高压患者的肺组织样本、正常对照肺组织、野百合碱诱导的肺动脉高压大鼠模型 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序，高维加权基因共表达网络分析，机器学习 | 机器学习（未指定具体模型） | 转录组测序数据 | 未明确样本数量，包含PAH患者和正常对照的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1074 | 2025-12-02 |
Neutrophil-enriched gene signature correlates with teplizumab therapy resistance in different stages of type 1 diabetes
2025-Dec-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176403
PMID:41026533
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了与teplizumab治疗1型糖尿病疗效相关的免疫基因特征，并开发了一个基于血液的26基因预测模型 | 首次在1型糖尿病中通过跨物种（小鼠和人类）单细胞转录组学分析，鉴定出与teplizumab治疗反应相关的特异性免疫细胞特征，特别是中性粒细胞富集特征与治疗抵抗的关联，并开发了高精度的血液基因预测模型 | 研究样本量相对有限，且主要基于观察性数据，需要在前瞻性队列中进一步验证预测模型的临床实用性 | 探究teplizumab治疗1型糖尿病疗效异质性的免疫学机制，并开发预测治疗反应的生物标志物 | 非肥胖糖尿病（NOD）小鼠和1型糖尿病患者的血液及胰腺样本 | 单细胞转录组学 | 1型糖尿病 | 单细胞转录组测序 | 弹性网络逻辑回归模型 | 单细胞RNA-seq数据 | 来自NOD小鼠的配对外周血和胰腺样本，以及来自AbATE和TN10临床试验的人类全血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1075 | 2025-12-02 |
ERO1A-positive tumor epithelial cells in colorectal cancer progression: a multi-omics perspective
2025-Dec, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02184-z
PMID:41028408
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法，识别并验证了结直肠癌中ERO1A阳性肿瘤上皮细胞亚群在促进肿瘤进展和不良预后中的关键作用 | 首次从多组学角度系统鉴定并验证了ERO1A阳性上皮细胞亚群在结直肠癌中的关键作用，并基于此构建了优于现有111个模型的预后预测工具ETSRM | 研究结论主要基于回顾性队列数据，需前瞻性临床研究进一步验证；涉及的信号通路机制有待更深入的实验探索 | 探究结直肠癌进展的关键驱动细胞亚群及其与肿瘤微环境的相互作用 | 结直肠癌患者样本（来自21个多中心队列）及相关的细胞与动物模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、生物信息学分析、体外与体内实验 | 风险预测模型（ETSRM） | 转录组数据、蛋白质组数据、空间转录组数据 | 来自21个多中心队列的2767例结直肠癌样本 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 1076 | 2025-12-02 |
Heterogeneity of Acute Myeloid Leukemia patients explored through single-cell and single-sample gene regulatory networks
2025-Dec, Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms
DOI:10.1016/j.bbagrm.2025.195119
PMID:41197948
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据构建急性髓系白血病患者的基因调控网络，探索疾病异质性并揭示个性化治疗潜力 | 首次结合单细胞数据与单样本网络方法（LIONESS）构建患者特异性基因调控网络，实现完美患者区分并识别细胞类型特异性调控程序 | 网络构建依赖四种推断方法的一致性，可能受算法限制；样本量未明确说明，可能影响泛化性 | 探究急性髓系白血病在基因调控层面的异质性，为个性化治疗提供基础 | 急性髓系白血病患者与健康对照的祖细胞、单核细胞和树突状细胞 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络推断方法（ARACNE, CLR, MRNET, GENIE3）与LIONESS | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1077 | 2025-12-02 |
Integrating computational pathology and multi-transcriptomics to characterize glioblastoma heterogeneity and identify prognostic biomarkers
2025-Dec, Human pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1016/j.humpath.2025.105982
PMID:41232838
|
研究论文 | 本研究通过整合计算病理学和多转录组学数据，表征胶质母细胞瘤的异质性并识别预后生物标志物 | 创新性地结合了全切片图像的病理特征、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学数据，并开发了机器学习模型来识别与预后相关的关键基因和细胞亚群 | 模型在验证集上的C-index相对较低（0.616），样本量可能有限，且研究主要基于TCGA等公共数据集，需要进一步的外部验证 | 改善胶质母细胞瘤的预后评估并识别潜在的治疗靶点 | 胶质母细胞瘤（GBM）患者 | 计算病理学 | 胶质母细胞瘤 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学 | Lasso + plsRcox | 图像, 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1078 | 2025-12-02 |
Integrative analysis of RiboSis-related gene expression in colorectal cancer: implications for prognosis and immunotherapy
2025-Dec, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02166-1
PMID:40839324
|
研究论文 | 本研究通过整合分析结直肠癌中核糖体生物发生相关基因的表达，构建了一个预后特征模型，并探讨了其在免疫治疗响应中的潜在应用 | 首次利用单细胞RNA测序数据结合非负矩阵因子化方法鉴定结直肠癌中与核糖体生物发生相关的细胞亚型，并开发了一个基于多算法机器学习的预后特征模型，该模型在多个数据集中验证了高预测准确性 | 研究主要依赖于公共数据库的回顾性数据，样本量相对有限，且实验验证仅聚焦于单个枢纽基因PFDN2，未来需要更大规模的前瞻性研究和更全面的功能验证 | 探索核糖体生物发生相关基因在结直肠癌中的临床意义，包括预后评估和免疫治疗响应预测 | 结直肠癌组织样本及其中的单细胞数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵因子化, 机器学习集成方法 | 单细胞RNA测序数据 | 3个结直肠癌组织的scRNA-seq数据用于初步分析，13个结直肠癌样本的26,961个细胞用于详细研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1079 | 2025-12-02 |
Plasminogen activator inhibitor 1 promotes aortic aging-like pathophysiology in humans and mice
2025-Dec-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI196714
PMID:41026613
|
研究论文 | 本研究通过人类遗传学分析和基因工程小鼠模型，揭示了纤溶酶原激活物抑制剂1（PAI-1）在促进主动脉衰老样病理生理中的作用及其机制 | 首次结合人类功能缺失性SERPINE1变异体的保护效应与对应基因工程小鼠模型，系统阐明PAI-1通过调控细胞外基质和血管平滑肌细胞可塑性影响血管衰老的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据来源于遗传变异分析，需进一步在人群中进行干预性验证 | 探究PAI-1在心血管衰老过程中的作用机制及作为治疗靶点的潜力 | 携带SERPINE1功能缺失变异的人类个体、Serpine1TA700/+基因工程小鼠、PAI-1过表达小鼠 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | 基因工程小鼠模型 | 遗传学数据、生理学测量数据、转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及基因工程小鼠品系比较 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1080 | 2025-12-02 |
Deciphering macrophage heterogeneity and factors driving M2 polarization in lung adenocarcinoma through single-cell RNA sequencing
2025-Dec, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02172-3
PMID:41099999
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析肺腺癌中巨噬细胞的异质性及M2极化的驱动因素，发现BCAT1表达与M2巨噬细胞浸润正相关，并可能通过促进M2极化形成免疫抑制微环境，影响免疫治疗效果 | 利用单细胞测序数据识别BCAT1作为驱动巨噬细胞M2极化的关键基因，并通过体外和体内实验验证其在肺腺癌免疫抑制微环境中的作用 | 研究基于特定数据集GSE207422，样本来源和规模可能限制结论的普适性；BCAT1的具体作用机制仍需进一步探索 | 探究肺腺癌肿瘤微环境中巨噬细胞的异质性及M2极化的分子驱动因素，以改善免疫治疗反应 | 肺腺癌患者的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |