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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1041 | 2025-12-04 |
Transfer of Damaged Mitochondria from Cancer Cells to Cancer-Associated Fibroblasts Promotes Tyrosine Kinase Inhibitor Tolerance in EGFR-Mutant Lung Cancer
2025-Dec-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0433
PMID:41329713
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研究论文 | 本研究揭示了EGFR突变肺癌中,癌症相关成纤维细胞通过接收肿瘤细胞受损线粒体,促进酪氨酸激酶抑制剂耐受的新机制 | 首次发现RGS5+MYL9+ CAF作为“代谢池”接收肿瘤细胞受损线粒体,通过CCL11信号招募和Miro1/RhoA激活形成隧道纳米管,并证明Rho激酶抑制剂法舒地尔可阻断此过程 | 研究主要基于单细胞RNA测序和体内实验,临床转化效果需进一步验证 | 探究EGFR突变肺癌中酪氨酸激酶抑制剂耐受的机制 | EGFR突变肺腺癌的耐药持续细胞和癌症相关成纤维细胞 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1042 | 2025-12-04 |
Elevated 5-HTR7 deteriorates dysregulated megakaryocytopoiesis in immune thrombocytopenic purpura via upregulating the PKA/Orai1/ERK1/2 pathway
2025-Dec-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.287287
PMID:40534501
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研究论文 | 本研究探讨了5-羟色胺受体7(5-HTR7)在免疫性血小板减少性紫癜(ITP)中通过上调PKA/Orai1/ERK1/2通路损害巨核细胞成熟并导致血小板减少的机制 | 首次揭示了5-HTR7在ITP发病机制中的具体作用,并阐明了其通过PKA/Orai1/ERK轴抑制钙离子内流从而损害巨核细胞成熟的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型,其临床转化效果仍需进一步验证 | 探究5-HTR7在ITP中调控巨核细胞生成障碍的分子机制 | ITP患者的巨核细胞及小鼠ITP模型 | NA | 免疫性血小板减少性紫癜 | 流式细胞术、免疫荧光、单细胞RNA测序、Western blot、共聚焦显微镜 | NA | 测序数据、图像数据、蛋白质印迹数据 | 未明确具体样本数量,涉及ITP患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1043 | 2025-12-04 |
Igf2 regulates early postnatal DPP4+ preadipocyte pool expansion
2025-Dec-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.352710.125
PMID:40930990
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了早期小鼠皮下脂肪组织中DPP4+前脂肪细胞群的扩张机制,并发现IGF2在此过程中驱动细胞增殖而非分化 | 首次识别出断奶前小鼠皮下脂肪网状间质中表达IGF2的DPP4+前体细胞群,并阐明IGF2在促进前脂肪细胞扩张中的时间限制性作用 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类组织中验证;单细胞测序数据可能受技术偏差影响 | 探究早期生命阶段脂肪组织快速扩张的细胞机制,以理解代谢健康性肥胖 | 断奶前和成年小鼠的皮下脂肪组织 | 单细胞组学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠皮下脂肪组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1044 | 2025-12-04 |
Depleting IL1R2+ Tumor-Infiltrating Regulatory T Cells with an ADCC-Prone Nanobody Construct Boosts the Efficacy of Anti-PD-1 Immunotherapy
2025-Dec-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-3095
PMID:40960523
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研究论文 | 本研究通过靶向肿瘤浸润调节性T细胞(tiTreg)表面的IL1R2,开发了一种ADCC倾向的纳米抗体构建体,以增强抗PD-1免疫疗法的疗效 | 首次将IL1R2鉴定为高度活化和强抑制性肿瘤浸润调节性T细胞(tiTreg)的表面标志物,并开发了具有优化ADCC功能的抗IL1R2纳米抗体-Fc构建体,可特异性清除IL1R2+ tiTregs,并与抗PD-1疗法产生协同抗肿瘤效应 | 研究主要基于小鼠模型和人类数据集的分析,尚未在临床环境中验证;IL1R2受体本身对tiTreg的丰度和活化并非必需,其具体功能机制有待进一步阐明 | 探索特异性靶向肿瘤浸润调节性T细胞(tiTreg)以增强免疫检查点阻断疗法疗效的策略 | 三阴性乳腺癌(TNBC)和结直肠癌小鼠模型以及人类TNBC和结直肠癌数据集中的肿瘤浸润调节性T细胞(tiTreg) | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌,结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),细胞转录组和表位测序索引(CITE-seq),荟萃分析 | NA | 单细胞转录组数据,表位数据,测序数据 | 来自小鼠模型和人类数据集(TNBC和结直肠癌)的样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1045 | 2025-12-04 |
CCNE1 Exerts a Protective Effect on Parkinson's Disease by Regulating Ferroptosis-Related Proteins
2025-Dec, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.71110
PMID:41319014
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析揭示了CCNE1通过上调PARP16表达调控铁死亡,从而对帕金森病发挥神经保护作用的分子机制 | 首次从分子层面阐明了CCNE1通过调控铁死亡关键蛋白PARP16发挥神经保护作用的机制,为帕金森病研究提供了新视角 | 孟德尔随机化分析存在潜在的多效性偏倚风险,且机制验证主要依赖于生物信息学分析 | 探究铁死亡相关蛋白如何通过遗传变异调控帕金森病风险 | 帕金森病患者相关的蛋白质与基因 | 生物信息学 | 帕金森病 | 孟德尔随机化分析、全基因组关联研究、单细胞RNA测序、转录组分析 | 两样本孟德尔随机化、中介分析 | 遗传变异数据、蛋白质定量性状位点数据、基因表达数据 | 基于UKB-PPP和deCODE研究的pQTL数据及PD GWAS数据,涉及210个显著相关蛋白 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1046 | 2025-12-04 |
Development and Validation of a Prognostic Model for Lung Cancer Based on Machine Learning and Immune Microenvironment Analysis
2025-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70962
PMID:41319095
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研究论文 | 本研究基于机器学习和免疫微环境分析,开发并验证了一个用于肺癌的预后模型 | 整合了多种机器学习算法和单细胞RNA测序数据,识别了关键的免疫基因和细胞间通讯网络,为肺癌预后提供了新的预测工具和免疫学见解 | 研究依赖于公共数据库(TCGA和GEO)的数据,可能存在样本选择偏差,且模型在独立队列中的验证未在摘要中明确说明 | 开发一个准确的肺癌预后预测工具,并探究免疫微环境在肺癌进展和治疗反应中的作用 | 肺癌患者及其RNA表达谱和临床数据 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 多种机器学习算法组合 | RNA表达谱数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1047 | 2025-12-04 |
Epigenetic Regulation of G6PD Drives Metabolic Reprogramming in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2025-Dec, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70202
PMID:41054380
|
研究论文 | 本研究探讨了肿瘤特异性增强子在肝内胆管癌代谢重编程中的作用,特别是G6PD和戊糖磷酸途径的调控 | 首次将增强子介导的表观遗传调控与肝内胆管癌中的G6PD过表达和戊糖磷酸途径活性联系起来,揭示了肿瘤特异性增强子作为关键表观遗传驱动因子的新作用 | 未来研究需探索将增强子分析整合到精准医学框架中,并开发新的增强子靶向策略 | 研究肿瘤特异性增强子在肝内胆管癌代谢重编程中的作用及其治疗潜力 | 肝内胆管癌肿瘤上皮细胞 | 表观遗传学 | 肝内胆管癌 | 原生延伸转录本捕获分析基因表达,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1048 | 2025-12-04 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals the Effect of Commensal Bacteria on the Multistep Development of Esophageal Cancer
2025-Dec, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70226
PMID:41077998
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了食管共生菌在食管鳞状细胞癌多阶段发展中的作用,包括其对上皮细胞恶性转化和炎症性成纤维细胞形成的影响 | 首次在单细胞水平上系统分析了食管共生菌在ESCC肿瘤微环境中的异质性分布及其对慢性炎症和免疫抑制状态的调控机制 | 研究基于小鼠模型,结果向人类临床转化的适用性需进一步验证;抗生素处理可能产生非特异性效应 | 阐明食管共生菌在食管鳞状细胞癌发生发展中的具体作用机制 | 小鼠自发性食管鳞状细胞癌模型中的54,562个单细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 54,562个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1049 | 2025-12-04 |
Integration of scRNA-Seq and scATAC-Seq Reveals Malignant Characteristics of Sarcomatoid Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2025-Dec, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70220
PMID:41082386
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据,揭示了肉瘤样透明细胞肾细胞癌的恶性特征 | 首次利用scATAC-seq识别肉瘤样分化肿瘤细胞的转录调控特征,并鉴定出DST、FRMD4A和PREX2作为该疾病的肿瘤标志物 | 研究仅基于单例患者样本,样本量较小,可能影响结果的普遍性 | 阐明肉瘤样透明细胞肾细胞癌的恶性特征,为诊断和治疗提供新见解 | 肉瘤样透明细胞肾细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | scRNA-seq, scATAC-seq, WES | NA | 单细胞转录组数据、单细胞染色质可及性数据、全外显子组测序数据 | 1例肉瘤样ccRCC患者样本,以及19例经典ccRCC样本(共19,819个肿瘤细胞和21,684个细胞核) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1050 | 2025-12-04 |
MedakaBase as a unified genomic resource platform for medaka fish biology
2025-Dec-01, DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/dnares/dsaf030
PMID:41122912
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研究论文 | 本文介绍了MedakaBase作为一个统一的基因组资源平台,用于支持青鳉鱼生物学研究,整合了多物种的基因组数据和分析工具 | 首次为青鳉鱼建立了一个统一的基因组资源平台,整合了分散的组学数据,并提供面向基因的分析功能,包括单细胞转录组优化的基因模型 | 平台目前主要覆盖七个Oryzias物种,数据范围可能有限,且依赖于NBRP团队生成的部分原始数据 | 为青鳉鱼生物学研究提供一个统一的基因组资源平台,整合和分析多物种的组学数据 | 青鳉鱼(Oryzias latipes)及其他六个Oryzias物种的基因组数据 | 基因组学 | NA | 基因组测序、转录组分析、单细胞转录组分析 | NA | 基因组序列、转录组数据、基因组变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1051 | 2025-12-04 |
β-catenin initiates peritoneal fibrosis by triggering mitochondrial fission-mediated mesothelial cell senescence fate transition
2025-Dec-01, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-025-00669-1
PMID:41320784
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研究论文 | 本研究揭示了β-catenin通过触发线粒体分裂介导的间皮细胞衰老命运转变,从而启动腹膜纤维化的机制 | 首次在单细胞水平上明确了长期腹膜透析患者中间皮细胞向衰老命运的转变,并阐明了β-catenin-Drp1-线粒体分裂-TGF-β1信号轴在驱动这一过程及后续纤维化中的关键作用 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,其结论在人体中的普适性及长期疗效仍需进一步临床验证 | 探究腹膜纤维化的起始机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 腹膜间皮细胞、来自腹膜透析患者的透析液流出物和腹膜活检标本、PDF诱导的小鼠模型、原代培养的间皮细胞 | 单细胞组学与分子病理学 | 终末期肾病相关的腹膜纤维化 | 单细胞RNA测序,转录组测序,免疫荧光,Western blotting | NA | 单细胞RNA测序数据,转录组数据,蛋白质印迹数据,免疫荧光图像 | 包含腹膜透析患者临床队列、小鼠模型及原代细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1052 | 2025-12-04 |
Restoring macrophage iron homeostasis by natural carrier-free nanoplatform for the therapy of rheumatoid arthritis syndromes
2025-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102544
PMID:41322152
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研究论文 | 本研究开发了一种无载体纳米药物RTNs,通过自组装天然产物RBA和TMP,用于恢复巨噬细胞铁稳态以治疗类风湿关节炎综合征 | 首次利用无载体自组装纳米平台结合天然产物,靶向巨噬细胞铁稳态治疗RA,并整合单细胞测序分析阐明机制 | 未明确提及样本量细节或长期毒性数据,且研究基于动物模型,临床转化潜力待验证 | 开发安全有效的策略治疗类风湿关节炎综合征,特别是针对铁过载引发的巨噬细胞极化问题 | 类风湿关节炎患者(通过佐剂诱导关节炎啮齿动物模型模拟) | NA | 类风湿关节炎 | 单细胞测序分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1053 | 2025-12-04 |
A practical protocol of processing mineralized tissue for Visium spatial transcriptomics
2025-Dec, Mechanobiology in medicine
DOI:10.1016/j.mbm.2025.100163
PMID:41323651
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研究论文 | 本文提出了一种用于处理矿化组织以进行Visium空间转录组学分析的优化工作流程 | 使用Morse's溶液替代传统EDTA脱钙,实现快速脱钙(<24小时)同时保持RNA质量,并强调使用SCHOTT NEXTERION® Slide H(3-D水凝胶涂层)以增强脆弱脱钙骨切片的粘附性 | NA | 克服矿化组织空间转录组学分析中因脱钙过程导致的RNA完整性和基因检测问题 | 完整和骨折的小鼠股骨样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠股骨样本(具体数量未明确说明) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium V2和Visium HD |
| 1054 | 2025-12-04 |
CellUntangler: Separating distinct biological signals in single-cell data with deep generative models
2025-Dec-01, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101073
PMID:41330382
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研究论文 | 本文提出了一种名为CellUntangler的深度生成模型,用于从单细胞RNA测序数据中分离不同的生物信号 | 提出了一种新的深度生成模型,将细胞嵌入到由多个子空间组成的潜在空间中,每个子空间采用适当的几何结构来捕获不同的生物信号,从而能够同时解耦多种过程 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种能够从单细胞数据中分离不同生物信号的方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度生成模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1055 | 2025-12-04 |
A genome-scale single-cell CRISPRi map of trans gene regulation across human pluripotent stem cell lines
2025-Dec-01, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101076
PMID:41330380
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研究论文 | 本研究构建了一个跨人类多能干细胞系的基因组规模CRISPR干扰扰动图谱,结合单细胞RNA测序,以探索基因调控的遗传背景依赖性 | 首次在人类多能细胞中实现了跨多个遗传背景的基因组规模CRISPR干扰扰动图谱,结合单细胞RNA测序,揭示了扰动效应的遗传变异 | NA | 理解人类基因组调控,解析疾病相关突变或基因表达变化的基础 | 人类多能干细胞系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),CRISPR干扰 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1056 | 2025-12-04 |
Integrating Multiple Clustering Techniques and Performance Measures via Ranking for scRNA-Seq Data
2025-Dec, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.70331
PMID:41330405
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研究论文 | 本文提出了一种通过整合多种聚类技术和性能度量来评估和排名单细胞RNA-seq数据聚类方法的新方法 | 将微阵列数据时代的稳定性度量适应于单细胞数据,并结合多种现有度量来评估聚类技术在不同参数选择下的特性,通过聚合方法对所有度量进行排名 | 研究仅基于五个已知分组和一个未知分组的数据集进行验证,可能未覆盖所有单细胞数据场景 | 评估和排名单细胞RNA-seq数据的聚类技术,以提高聚类结果的可靠性和准确性 | 单细胞基因表达数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 聚类技术 | 基因表达数据 | 六个数据集(五个已知分组,一个未知分组) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1057 | 2025-12-03 |
Transcriptional and temporal heterogeneity of developing α cells revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Dec-15, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152996
PMID:41242298
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了发育中α细胞的转录和时间异质性 | 利用时间分辨报告小鼠系“Gcg-Timer”进行单细胞转录组分析,首次展示了α细胞生成过程中的转录动态和细胞异质性,并发现线粒体转录本在α细胞中比在发育中的β细胞中表达更显著 | 研究主要基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;单细胞测序技术本身存在技术噪音和批次效应 | 探索胰腺α细胞在发育过程中的转录动态和细胞异质性 | 小鼠胚胎中的Gcg表达α细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1058 | 2025-12-03 |
Identification and Validation of Phagocytosis-Regulating Factors as Potential Prognostic and Diagnostic Biomarkers for Intracerebral Hemorrhage Through Single-Cell and Bulk Transcriptomic
2025-Dec-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502582RR
PMID:41329043
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组学分析,识别并验证了吞噬作用调控因子作为脑出血潜在预后和诊断生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和机器学习方法,系统识别了与脑出血相关的吞噬调控基因,并构建了ceRNA调控网络 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证 | 探索吞噬作用调控因子在脑出血中的诊断和预后价值 | 脑出血患者与正常脑组织的转录组数据 | 生物信息学 | 脑出血 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习 | 机器学习特征选择算法, CIBERSORT算法 | 转录组数据 | 来自GEO数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1059 | 2025-12-03 |
CASP1 as a potential target of Dendrobium in Sjögren's syndrome: Multi-omics analysis and preliminary experimental evidence
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115670
PMID:41101222
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析,探讨了CASP1在原发性干燥综合征(pSS)发病机制中的潜在作用,以及中药成分石斛的可能治疗机制 | 首次通过多组学整合分析(包括转录组、网络药理学、单细胞测序和分子对接)系统性地识别了CASP1作为pSS的潜在治疗靶点,并验证了石斛活性成分与CASP1的结合潜力 | 研究主要基于生物信息学分析和初步实验验证,因果关系和治疗效果需要进一步的功能验证研究 | 探索CASP1在pSS发病机制中的作用及石斛的治疗机制 | 原发性干燥综合征(pSS)患者 | 生物信息学 | 干燥综合征 | 转录组测序, 单细胞测序, RT-qPCR, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 65名pSS患者及健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 1060 | 2025-12-03 |
IRF5 siRNA Nanoimmunotherapy: Restoring Macrophage Efferocytosis in Atherosclerosis
2025-Dec-02, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向IRF5的siRNA纳米免疫治疗平台,用于恢复动脉粥样硬化斑块中巨噬细胞的胞葬功能 | 利用工程化siRNA纳米颗粒平台特异性抑制斑块不稳定巨噬细胞分子IRF5,首次实现通过siIRF5纳米免疫治疗增强斑块巨噬细胞的胞葬能力并改善斑块稳定性 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体中验证疗效和安全性 | 开发治疗动脉粥样硬化的新型免疫治疗方法 | 动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞(特别是Cd11c+和Trem2hi亚群) | 纳米医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2个独立的ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |