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当前共找到 1157 篇文献，本页显示第 1021 - 1040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1021 | 2025-11-27 |
HyperDiffuseNet: A Deep Hyperbolic Manifold Learning Method for Dimensionality Reduction in Spatial Transcriptomics
2025-Dec, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1177/15578666251377097
PMID:40982255
|
研究论文 | 提出一种基于双曲流形学习的深度几何学习框架HyperDiffuseNet，用于空间转录组数据的降维表示 | 首次将双曲潜在空间与变分自编码器结合用于空间转录组数据，通过图卷积网络学习多尺度空间依赖关系并整合扩散矩阵到双曲嵌入中 | 仅在多个ST数据集上进行了实证评估，未涉及更广泛的生物学验证或临床应用 | 解决空间转录组数据高维度和复杂空间层次结构分析挑战 | 空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 变分自编码器, 图卷积网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1022 | 2025-11-27 |
stPipe: a flexible and streamlined R/Bioconductor pipeline for preprocessing sequencing-based spatial transcriptomics data
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf167
PMID:41278534
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研究论文 | 介绍了一个用于预处理测序空间转录组数据的灵活简化R/Bioconductor流程stPipe | 开发了首个全面模块化的预处理流程，支持所有主流测序空间转录组平台，提供统一的数据处理标准 | 仅支持测序空间转录组数据，不包含基于成像的空间转录组技术 | 解决不同空间转录组平台数据预处理标准化和简化的问题 | 测序空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组测序数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, Slide-seq, Stereo-seq | 支持所有主流测序空间转录组平台 |
| 1023 | 2025-11-27 |
An engineered human hepatitis A virus capable of rapid proliferation in vitro and causing hepatitis in mice
2025-Dec, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101582
PMID:41281447
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研究论文 | 通过理性诱变开发了一种能在体外快速增殖并能在小鼠体内引发甲型肝炎的工程化人类甲型肝炎病毒 | 开发了具有遗传可操作性的重组HAV-2m病毒，在体外复制效率高，并建立了能诱导急性甲型肝炎的小鼠模型，揭示了病毒2C蛋白中的新型毒力决定因子 | 研究使用Ifnar1基因敲除小鼠模型，可能不能完全模拟人类免疫系统对HAV的反应 | 开发遗传可操作的甲型肝炎病毒模型以促进发病机制研究和抗病毒策略评估 | 工程化人类甲型肝炎病毒(HAV-2m)和Ifnar1-/-小鼠 | 病毒学 | 甲型肝炎 | 单细胞RNA测序, 理性诱变, 反向遗传学 | 动物模型 | 基因序列数据, 病理学数据, 血清生化数据 | Ifnar1-/-小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1024 | 2025-11-26 |
Fibroblastic FLT3L supports lymph node dendritic cells in the interfollicular niche
2025-Dec, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02332-2
PMID:41249485
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研究论文 | 本研究揭示了表达Gremlin1的淋巴结成纤维网状细胞通过提供FLT3L支持树突状细胞稳态的机制 | 首次发现GREM1+成纤维网状细胞是淋巴结中提供FLT3L支持树突状细胞稳态的特定生态位 | NA | 探索淋巴结中维持树突状细胞稳态的特定生态位和机制 | 人和小鼠淋巴结中的树突状细胞和成纤维网状细胞 | 细胞生物学 | NA | 空间转录组学,细胞流式分析,遗传模型 | NA | 基因表达数据,细胞定位数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1025 | 2025-11-26 |
Macrophage Cell and Diagnostic Biomarkers in BLCA: Integrating Machine Learning With Single-Cell Analysis
2025-Dec, Clinical genitourinary cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1016/j.clgc.2025.102447
PMID:41139554
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析和机器学习方法，识别膀胱癌中巨噬细胞亚型并构建预后预测模型 | 首次系统识别膀胱癌中9种巨噬细胞亚型，并基于7个巨噬细胞相关基因构建预后模型 | 研究依赖于公共数据库数据，缺乏独立的前瞻性验证队列 | 探索膀胱癌中巨噬细胞异质性并开发诊断生物标志物 | 膀胱癌患者的外周血单核细胞、膀胱癌细胞和尿路上皮来源细胞 | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞测序, 伪时间分析, 细胞间通讯分析, 加权基因共表达网络分析 | LASSO回归, 随机森林 | 单细胞测序数据, 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的膀胱癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1026 | 2025-11-26 |
Construction of a deep learning model and identification of BSG, PPARD, and SLC16A8 expression as potential indicators in the context of strategies for precision therapy to acute myeloid leukemia
2025-Dec, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1080/16078454.2025.2592516
PMID:41284982
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析急性髓系白血病肿瘤微环境中T细胞的异质性，构建了基于BSG、PPARD和SLC16A8基因的预后风险模型 | 首次在AML中基于特定T细胞亚群（Cluster 4）构建深度学习预后模型，并鉴定BSG、PPARD和SLC16A8作为独立预后标志物 | 研究依赖于外部数据集进行验证，需要进一步实验验证基因功能机制 | 探索AML肿瘤微环境中T细胞异质性，寻找精准治疗的生物标志物 | 急性髓系白血病患者的T细胞亚群 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 随机森林, LASSO回归 | 基因表达数据 | AML患者单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1027 | 2025-11-25 |
Ciao3 knockout causes acute lung injury through immune activation using single cell sequencing
2025-Dec-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.124063
PMID:41187899
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示Ciao3基因敲除通过免疫激活导致急性肺损伤的机制 | 首次在Ciao3条件性敲除小鼠模型中结合单细胞RNA测序技术系统阐明免疫细胞在急性肺损伤中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本数量有限 | 阐明Ciao3基因缺失导致急性肺损伤的分子机制 | Ciao3基因突变患者和内皮细胞特异性Ciao3敲除小鼠 | 单细胞生物学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 免疫组化 | NA | 单细胞RNA测序数据, bulk RNA测序数据 | 1名纯合子患者和Ciao3条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1028 | 2025-11-25 |
Malignant cell-mediated Treg immune suppression via ICOSLG-ICOS axis in tumor microenvironment relates to nasopharyngeal carcinoma prognosis
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115743
PMID:41151481
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示鼻咽癌肿瘤微环境中恶性细胞通过ICOSLG-ICOS轴激活Treg细胞介导免疫抑制的机制 | 首次在鼻咽癌中发现Mal (TUBB2B+)细胞通过ICOSLG-ICOS通路激活Treg (TNFRSF4+)细胞，进而抑制多种免疫细胞功能的免疫逃逸新机制 | 研究样本主要来自亚洲人群，结果在其他人群中的普适性需要进一步验证 | 阐明鼻咽癌肿瘤微环境中细胞间相互作用与患者预后的关系 | 鼻咽癌患者肿瘤组织和肿瘤微环境中的各类细胞 | 单细胞生物学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 多重免疫组化 | scissor, scAB, CellChat分析 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫组化图像 | 82个样本共488,771个细胞（其中50个样本269,521个单细胞），183例鼻咽癌患者批量RNA数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1029 | 2025-11-25 |
Melatonin ameliorates bronchopulmonary dysplasia by modulating the NF-κB pathway via the gut microbiota-short-chain fatty acid axis
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115730
PMID:41151484
|
研究论文 | 本研究揭示了褪黑素通过调节肠道微生物群-短链脂肪酸轴改善支气管肺发育不良的机制 | 首次发现褪黑素通过增加肠道Ligilactobacillus murinus丰度和短链脂肪酸产生，抑制NF-κB通路和细胞焦亡来改善BPD | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步研究 | 阐明褪黑素通过肠道微生物-短链脂肪酸轴改善支气管肺发育不良的作用机制 | 博来霉素诱导的BPD小鼠模型、人支气管上皮细胞(BEAS-2B)、婴儿肺组织单细胞RNA测序数据 | 生物医学研究 | 支气管肺发育不良 | 宏基因组学、16S rRNA测序、非靶向代谢组学、RNA转录组学、单细胞RNA测序 | 动物模型、细胞模型 | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据、单细胞测序数据 | BPD小鼠模型、BEAS-2B细胞系、公共单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序,宏基因组学,代谢组学,转录组学 | NA | NA |
| 1030 | 2025-11-25 |
Pirfenidone regulates obesity-related renal injury through the SIRT3 signaling pathway
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115709
PMID:41151486
|
研究论文 | 本研究探讨了吡非尼酮通过SIRT3信号通路调节肥胖相关肾损伤的作用机制 | 首次揭示吡非尼酮通过SIRT3依赖方式改善肥胖相关肾损伤的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，尚未进行临床验证 | 探究吡非尼酮对肥胖相关肾损伤的治疗作用及其分子机制 | C57BL/6J雄性小鼠、人近端肾小管上皮细胞(HK-2)和人原代肾近端小管上皮细胞(PTECs) | 分子生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序分析、分子对接、免疫共沉淀 | 动物模型、细胞模型 | 分子生物学数据、细胞实验数据 | C57BL/6J雄性小鼠分组实验，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1031 | 2025-11-25 |
GPRC5A+ myCAFs promote ESCC progression via TGF-β-induced fibroblast activation and ANXA1-mediated M2 macrophage polarization
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115663
PMID:41082840
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现GPRC5A+肌成纤维细胞通过TGF-β通路激活成纤维细胞和ANXA1介导的M2巨噬细胞极化促进食管鳞癌进展 | 首次鉴定GPRC5A作为肌成纤维细胞亚群特异性标志物，并揭示其通过双重机制驱动肿瘤进展的新机制 | 样本量相对有限（15例肿瘤和11例正常组织），需进一步验证 | 探究食管鳞癌中癌相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤微环境调控中的作用机制 | 食管鳞癌组织和正常食管组织 | 单细胞生物学 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序，转录组去卷积分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 15例ESCC肿瘤组织和11例正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1032 | 2025-11-25 |
Paeoniflorin attenuates hepatic ischemia-reperfusion injury by modulating Tmem176b+ macrophages polarization
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115657
PMID:41092769
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示芍药苷通过调节Tmem176b+巨噬细胞极化减轻肝脏缺血再灌注损伤的机制 | 首次发现芍药苷特异性靶向Tmem176b+巨噬细胞亚群，通过调控THBS1-CD47免疫抑制轴和SPP1-CD44促炎信号通路发挥保护作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证；单细胞测序样本量相对有限 | 探究芍药苷在肝脏缺血再灌注损伤中对巨噬细胞极化的调节机制 | 肝脏缺血再灌注损伤小鼠模型中的巨噬细胞亚群 | 单细胞组学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，伪时间轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 45,673个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1033 | 2025-11-25 |
Integration of scRNA-seq and bulk RNA-seq reveals that macrophage ferroptosis inhibits MSC osteogenic differentiation in inflammatory microenvironments
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115744
PMID:41166988
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序技术，揭示巨噬细胞铁死亡在炎症微环境中抑制间充质干细胞成骨分化的机制 | 首次揭示巨噬细胞铁死亡通过调控M1/M2极化影响MSC PANoptosis和成骨分化的新机制 | 研究主要聚焦于巨噬细胞铁死亡的效应，其他细胞类型的贡献尚未充分探讨 | 探究炎症微环境中巨噬细胞铁死亡对骨再生和MSC成骨分化的影响机制 | 巨噬细胞、间充质干细胞(MSC)、骨感染临床样本 | 单细胞生物学 | 骨感染 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 包含体内、体外实验和临床样本的多层次验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1034 | 2025-11-25 |
Single-Cell Profiling of Lichen Planus Reveals Type I IFN Response Triggering the Interface Dermatitis Reaction
2025-Dec, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.043
PMID:40499747
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了扁平苔藓中I型干扰素反应触发界面皮炎反应的免疫发病机制 | 首次在扁平苔藓中发现I型干扰素富集环境，并证实IFN-β通过敏化角质形成细胞增强CD8 T细胞介导的细胞死亡 | NA | 研究扁平苔瘆的免疫发病机制及驱动界面皮炎反应的潜在机制 | 扁平苔瘆患者皮损组织与健康对照皮肤 | 单细胞组学 | 皮肤炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 扁平苔瘆患者皮损组织与健康对照皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1035 | 2025-11-25 |
Analyzing the toxicological effects of PET-MPs on male infertility: Insights from network toxicology, mendelian randomization, and transcriptomics
2025-Dec, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2025.101076
PMID:40929757
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研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学、孟德尔随机化和转录组学方法，探讨了PET微塑料导致男性不育的分子机制 | 首次发现CLK4是PET微塑料导致男性不育的功能靶点，并揭示了其通过调节Th1细胞浸润和干扰精子发生过程的双重作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外模拟，缺乏体内实验验证 | 探究PET微塑料对男性生殖功能损害的分子机制 | 男性不育相关基因和细胞类型 | 生物信息学 | 男性不育 | 网络毒理学, 孟德尔随机化, 转录组学, 分子对接, 分子动力学模拟, bulk RNA-seq, scRNA-seq | SMR分析 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1036 | 2025-11-25 |
Molecular insights into the role of tumor-specific endothelial cells in metastasis
2025-Dec, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104964
PMID:41015325
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综述 | 本文综述了肿瘤特异性内皮细胞在肿瘤转移和免疫逃逸中的关键作用及其治疗潜力 | 系统阐述了肿瘤特异性内皮细胞区别于正常内皮细胞的独特特征及其在肿瘤进展中的多重功能 | NA | 探讨肿瘤特异性内皮细胞在癌症转移和治疗中的作用机制 | 肿瘤特异性内皮细胞 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1037 | 2025-11-25 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics-Based Research Reveals Association Between M2a Macrophages and Tumor Spread through Air Spaces in Lung Adenocarcinoma
2025-Dec, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.07.017
PMID:40946801
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示M2a巨噬细胞通过CCL17/CCR4轴促进β-catenin信号通路，从而增强肺腺癌气腔播散的发生发展 | 创新性地结合单细胞RNA测序与数字空间分析空间转录组学技术，针对STAS的空间特性探索肿瘤相关巨噬细胞的作用机制 | NA | 探索肺腺癌中气腔播散的发生和定植机制，特别是肿瘤相关巨噬细胞在其中的作用 | 肺腺癌组织中的肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 数字空间分析空间转录组学 |
| 1038 | 2025-11-25 |
Comprehensive multi-omics analysis identifies transferrin receptor as a therapeutic target in esophageal cancer
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148121
PMID:41067362
|
研究论文 | 通过多组学方法鉴定转铁蛋白受体(TFRC)作为食管癌的潜在治疗靶点 | 首次通过整合单细胞RNA测序、转录组分析和基因组关联研究，系统揭示TFRC在食管癌免疫逃逸中的关键作用机制 | NA | 识别食管癌的新型生物标志物并探索其在疾病进展中的作用 | 食管癌样本 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,基因表达数量性状位点分析,全基因组关联研究,多重免疫荧光检测 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1039 | 2025-11-25 |
Single-cell RNA sequencing reveals oocyte-granulosa crosstalk and regulatory networks driving chicken primordial follicle assembly
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148357
PMID:41109371
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示鸡原始卵泡组装过程中卵母细胞与颗粒细胞的相互作用及调控网络 | 首次构建鸡生殖细胞和颗粒细胞的单细胞转录组图谱，揭示原始卵泡组装过程中的细胞异质性和双向调控机制 | 研究局限于鸡模型，调控机制在其它物种中的普适性需要进一步验证 | 解析鸡原始卵泡组装的分子调控机制 | 鸡卵巢生殖细胞和颗粒细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | UMAP, Pseudotime轨迹分析, CellChat | 单细胞转录组数据 | 鸡卵巢关键发育阶段的细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1040 | 2025-11-24 |
Screening and Validation of Genes Associated With Lysosomal-Dependent Cell Death in Colorectal Cancer
2025-Dec, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70024
PMID:40964747
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研究论文 | 本研究通过分析结直肠癌与溶酶体依赖性细胞死亡的相关性，鉴定出ATP6V0A4、CLU和IL13RA2作为潜在生物标志物 | 首次构建基于溶酶体依赖性细胞死亡相关基因的结直肠癌风险模型，并系统评估其与肿瘤免疫微环境和化疗药物敏感性的关联 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索结直肠癌中溶酶体依赖性细胞死亡相关基因的预后价值和治疗靶点潜力 | 结直肠癌患者和正常组织样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞测序，Cox回归分析，LASSO分析，富集分析 | 风险模型，列线图 | 基因表达数据，临床数据 | TCGA-CRC和GSE17538数据集，包含临床样本 | NA | 单细胞测序，bulk RNA-seq | NA | NA |