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当前共找到 1109 篇文献，本页显示第 981 - 1000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2025-12-03 |
CASP1 as a potential target of Dendrobium in Sjögren's syndrome: Multi-omics analysis and preliminary experimental evidence
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115670
PMID:41101222
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析，探讨了CASP1在原发性干燥综合征(pSS)发病机制中的潜在作用，以及中药成分石斛的可能治疗机制 | 首次通过多组学整合分析（包括转录组、网络药理学、单细胞测序和分子对接）系统性地识别了CASP1作为pSS的潜在治疗靶点，并验证了石斛活性成分与CASP1的结合潜力 | 研究主要基于生物信息学分析和初步实验验证，因果关系和治疗效果需要进一步的功能验证研究 | 探索CASP1在pSS发病机制中的作用及石斛的治疗机制 | 原发性干燥综合征(pSS)患者 | 生物信息学 | 干燥综合征 | 转录组测序, 单细胞测序, RT-qPCR, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 65名pSS患者及健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 982 | 2025-12-03 |
IRF5 siRNA Nanoimmunotherapy: Restoring Macrophage Efferocytosis in Atherosclerosis
2025-Dec-02, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向IRF5的siRNA纳米免疫治疗平台，用于恢复动脉粥样硬化斑块中巨噬细胞的胞葬功能 | 利用工程化siRNA纳米颗粒平台特异性抑制斑块不稳定巨噬细胞分子IRF5，首次实现通过siIRF5纳米免疫治疗增强斑块巨噬细胞的胞葬能力并改善斑块稳定性 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证疗效和安全性 | 开发治疗动脉粥样硬化的新型免疫治疗方法 | 动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞（特别是Cd11c+和Trem2hi亚群） | 纳米医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2个独立的ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 983 | 2025-12-03 |
Profiling Cell-state Fingerprints Based on Deep Learning Model with Meta-programs of Pan-cancer
2025-Dec-02, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf123
PMID:41329499
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研究论文 | 本研究基于深度学习模型StateNet，利用泛癌元程序生成细胞状态指纹，以分析癌症细胞状态的共性与个体差异 | 开发了深度学习模型StateNet，首次基于泛癌元程序生成细胞状态指纹，用于揭示癌症细胞的共享特征和个体特性，并识别了ACAT2作为缺氧与脂质代谢通路的关键介导因子 | 研究主要依赖单细胞RNA测序数据，可能未涵盖所有细胞状态或组织类型，且样本量虽大但仍有扩展空间 | 旨在解析泛癌中细胞状态的共同机制和个体差异，开发工具用于癌症分析和预后预测 | 159,372个细胞，来自245个细胞系，覆盖14种组织类型，以及3,210个癌症样本 | 机器学习 | 泛癌 | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型StateNet | 单细胞RNA测序数据 | 159,372个细胞（来自245个细胞系）和3,210个癌症样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 984 | 2025-12-03 |
Spatiotemporal liver dynamics shape hepatocellular heterogeneity and impact in vivo gene engineering
2025-Dec, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.06.018
PMID:40617259
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研究论文 | 本研究通过克隆追踪、单细胞和空间转录组学技术，探索了小鼠肝脏生长过程中肝细胞异质性的演变及其对体内基因工程的影响 | 揭示了新生肝脏中克隆性肝细胞在空间生态位中的定位及其对成年组织生成的贡献，并展示了靶向这些细胞可提高基因编辑效率 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类肝脏中的适用性尚需进一步验证 | 探究肝细胞异质性在肝脏生长中的动态变化及其对体内基因治疗策略的影响 | 不同年龄阶段的小鼠肝脏组织 | 数字病理学 | NA | 克隆追踪、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间数据 | 不同年龄的小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 985 | 2025-12-03 |
Spatial Transcriptomics of Developing Wheat Seed Reveals Concentric Gene Expression Zones and Subgenome Biased Expression of Key Genes
2025-Dec, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70351
PMID:40904198
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研究论文 | 本研究利用STOmics空间转录组平台，可视化小麦种子在灌浆关键期的基因表达空间模式，揭示了胚乳中的同心表达区域和亚基因组偏向表达的关键基因 | 首次在小麦种子中应用空间转录组技术，实现了亚细胞分辨率的转录本定位，识别了与八个功能细胞群相关的基因表达簇，并发现了胚乳内四个同心区域的表达模式 | 研究仅聚焦于14 DPA（花后天数）的小麦种子，未覆盖整个发育过程，且样本量有限 | 探究小麦种子发育过程中基因表达的空间组织，以理解营养储存、胁迫耐受和萌发等关键过程 | 小麦（Triticum aestivum）种子，特别是在灌浆关键期的发育阶段 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 超过4,000,000个空间解析的转录本 | STOmics | 空间转录组学 | STOmics空间转录组平台 | NA |
| 986 | 2025-12-03 |
Combining Mendelian randomization and network toxicology to decipher the causal role and molecular mechanisms of environmental pollutants in breast cancer: A focus on Methyl-4-hydroxybenzoate
2025-Dec, Cancer epidemiology
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.canep.2025.102953
PMID:41183465
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化和网络毒理学方法，探讨了环境污染物甲基对羟基苯甲酸酯在乳腺癌中的因果作用及分子机制 | 首次结合孟德尔随机化和网络毒理学，提出了一种非雌激素受体依赖的致癌机制假说，涉及生长因子信号传导失调和代谢重编程 | 研究主要基于遗传数据和计算分析，缺乏直接的实验验证，且样本来源有限（如FinnGen联盟） | 探究甲基对羟基苯甲酸酯在乳腺癌中的因果角色及其非雌激素机制 | 乳腺癌患者及尿液甲基对羟基苯甲酸酯硫酸盐的遗传数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 孟德尔随机化分析、网络毒理学、转录组分析、单细胞/空间RNA测序、分子对接 | NA | 遗传数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 尿液MEP硫酸盐数据n=8285，FinnGen联盟乳腺癌风险数据n=182,927 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 987 | 2025-12-03 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing analysis reveals cuproptosis-related proteins in Crohn's disease
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148990
PMID:41232892
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研究论文 | 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了克罗恩病中与铜死亡相关的蛋白标志物及其与代谢和免疫的关联 | 首次将铜死亡相关蛋白与克罗恩病联系起来，并整合批量与单细胞数据构建诊断模型，揭示了CD274、PDK1、CP和SLC31A2等新标志物 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；单细胞分析仅为初步探索性结果，需进一步功能研究确认 | 探索铜死亡相关蛋白在克罗恩病中的作用，并构建诊断模型 | 克罗恩病患者炎症组织与非炎症组织 | 生物信息学 | 克罗恩病 | RNA测序，单细胞RNA测序，RT-qPCR | 诊断模型 | 基因表达数据 | 494例组织样本（批量数据）和25,121个细胞（单细胞数据） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 988 | 2025-12-03 |
Systematically Revealing Quantitative Multi-Target Integrative Effects of Plants With Artificial Intelligence Method
2025-Dec, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70321
PMID:40824771
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于人工智能的新方法，以山楂为例，系统揭示了植物在单细胞水平上对疾病的多靶点潜在整合效应 | 提出了一种基于深度自编码神经网络模型的新方法，将植物与疾病之间多个共同靶点在单细胞转录组中的表达水平编码为一个整合值（MTIS），首次在单细胞水平上实现了植物多靶点潜在整合效应的景观和定量图谱 | 该方法目前仅以山楂和动脉粥样硬化为例进行了验证，其广泛适用性有待更多植物和疾病模型的进一步测试 | 系统揭示植物对疾病的定量多靶点整合效应 | 山楂（植物）对动脉粥样硬化疾病的影响 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | 深度自编码神经网络 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 989 | 2025-12-02 |
Neutrophil-enriched gene signature correlates with teplizumab therapy resistance in different stages of type 1 diabetes
2025-Dec-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176403
PMID:41026533
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了与teplizumab治疗1型糖尿病疗效相关的免疫基因特征，并开发了一个基于血液的26基因预测模型 | 首次在1型糖尿病中通过跨物种（小鼠和人类）单细胞转录组学分析，鉴定出与teplizumab治疗反应相关的特异性免疫细胞特征，特别是中性粒细胞富集特征与治疗抵抗的关联，并开发了高精度的血液基因预测模型 | 研究样本量相对有限，且主要基于观察性数据，需要在前瞻性队列中进一步验证预测模型的临床实用性 | 探究teplizumab治疗1型糖尿病疗效异质性的免疫学机制，并开发预测治疗反应的生物标志物 | 非肥胖糖尿病（NOD）小鼠和1型糖尿病患者的血液及胰腺样本 | 单细胞转录组学 | 1型糖尿病 | 单细胞转录组测序 | 弹性网络逻辑回归模型 | 单细胞RNA-seq数据 | 来自NOD小鼠的配对外周血和胰腺样本，以及来自AbATE和TN10临床试验的人类全血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 990 | 2025-12-02 |
Heterogeneity of Acute Myeloid Leukemia patients explored through single-cell and single-sample gene regulatory networks
2025-Dec, Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms
DOI:10.1016/j.bbagrm.2025.195119
PMID:41197948
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据构建急性髓系白血病患者的基因调控网络，探索疾病异质性并揭示个性化治疗潜力 | 首次结合单细胞数据与单样本网络方法（LIONESS）构建患者特异性基因调控网络，实现完美患者区分并识别细胞类型特异性调控程序 | 网络构建依赖四种推断方法的一致性，可能受算法限制；样本量未明确说明，可能影响泛化性 | 探究急性髓系白血病在基因调控层面的异质性，为个性化治疗提供基础 | 急性髓系白血病患者与健康对照的祖细胞、单核细胞和树突状细胞 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络推断方法（ARACNE, CLR, MRNET, GENIE3）与LIONESS | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 991 | 2025-12-02 |
Integrating computational pathology and multi-transcriptomics to characterize glioblastoma heterogeneity and identify prognostic biomarkers
2025-Dec, Human pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1016/j.humpath.2025.105982
PMID:41232838
|
研究论文 | 本研究通过整合计算病理学和多转录组学数据，表征胶质母细胞瘤的异质性并识别预后生物标志物 | 创新性地结合了全切片图像的病理特征、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学数据，并开发了机器学习模型来识别与预后相关的关键基因和细胞亚群 | 模型在验证集上的C-index相对较低（0.616），样本量可能有限，且研究主要基于TCGA等公共数据集，需要进一步的外部验证 | 改善胶质母细胞瘤的预后评估并识别潜在的治疗靶点 | 胶质母细胞瘤（GBM）患者 | 计算病理学 | 胶质母细胞瘤 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学 | Lasso + plsRcox | 图像, 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 992 | 2025-12-02 |
Plasminogen activator inhibitor 1 promotes aortic aging-like pathophysiology in humans and mice
2025-Dec-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI196714
PMID:41026613
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研究论文 | 本研究通过人类遗传学分析和基因工程小鼠模型，揭示了纤溶酶原激活物抑制剂1（PAI-1）在促进主动脉衰老样病理生理中的作用及其机制 | 首次结合人类功能缺失性SERPINE1变异体的保护效应与对应基因工程小鼠模型，系统阐明PAI-1通过调控细胞外基质和血管平滑肌细胞可塑性影响血管衰老的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据来源于遗传变异分析，需进一步在人群中进行干预性验证 | 探究PAI-1在心血管衰老过程中的作用机制及作为治疗靶点的潜力 | 携带SERPINE1功能缺失变异的人类个体、Serpine1TA700/+基因工程小鼠、PAI-1过表达小鼠 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | 基因工程小鼠模型 | 遗传学数据、生理学测量数据、转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及基因工程小鼠品系比较 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 993 | 2025-12-02 |
Ccn1 Mediates Pyroptosis and Purine Metabolism Pattern Shifts in a High-Uric Acid Microenvironment After Spinal Cord Injury
2025-Dec-01, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05529-6
PMID:41324748
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研究论文 | 本研究通过空间代谢组学、Bulk-RNA测序和单细胞RNA测序，揭示了脊髓损伤后高尿酸微环境的存在，并发现Ccn1在该微环境中介导细胞焦亡和嘌呤代谢模式转变 | 首次利用空间代谢组学鉴定脊髓损伤后高尿酸微环境，并阐明Ccn1在调控细胞焦亡和嘌呤代谢中的关键作用 | 研究主要基于大鼠模型和PC12细胞系，人类临床相关性需进一步验证 | 探究脊髓损伤后微环境的代谢变化及Ccn1在其中的功能机制 | SD大鼠脊髓组织和PC12细胞系 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 空间代谢组学, Bulk-RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据, RNA测序数据 | 体外实验每组n=6, 体内实验每组n=6 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 994 | 2025-12-01 |
Type I IFN drives neutrophil swarming, impeding lung T cell-macrophage interactions and TB control
2025-Dec-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250466
PMID:40986319
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了I型干扰素在结核感染早期通过驱动中性粒细胞聚集而限制CD4+ T细胞-巨噬细胞相互作用的新机制 | 发现相对耐药小鼠早期肺内I型干扰素反应更强，并阐明其通过中性粒细胞群聚阻碍T细胞-巨噬细胞空间互作的独特免疫调控机制 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中验证；观察时间限于感染初期数周 | 探究结核分枝杆菌感染早期决定感染结局的免疫机制 | C57BL/6和C3HeB/FeJ小鼠的肺部免疫细胞 | 免疫学 | 结核病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 两种基因型小鼠在感染初数周内的肺部样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 995 | 2025-12-01 |
Inhibition of Cholesterol Transport from Lysosomes by Itraconazole Repolarizes Tumor-associated Macrophages to Anti-tumor M1 type
2025-Dec, Anticancer research
IF:1.6Q4
DOI:10.21873/anticanres.17866
PMID:41318128
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研究论文 | 本研究探讨伊曲康唑通过抑制溶酶体胆固醇转运将肿瘤相关巨噬细胞从促瘤M2表型重编程为抗瘤M1表型的机制 | 首次揭示伊曲康唑通过抑制溶酶体胆固醇释放实现巨噬细胞表型重编程的新机制 | 研究仅使用THP-1细胞来源的M2巨噬细胞，未在体内模型验证 | 探究伊曲康唑诱导肿瘤相关巨噬细胞表型重编程的分子机制 | THP-1细胞来源的M2巨噬细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,延时成像,Western blot | 细胞模型 | 基因表达数据,图像数据,蛋白质数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 996 | 2025-12-01 |
Potential Role of Tumor-derived MIF in B-Cell Antigen Presentation in Lung Adenocarcinoma: Single-cell and TCGA Analyses
2025-Dec, Anticancer research
IF:1.6Q4
DOI:10.21873/anticanres.17874
PMID:41318120
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研究论文 | 本研究通过单细胞和TCGA分析探讨了肿瘤源性MIF在肺腺癌B细胞抗原呈递中的潜在作用 | 首次在单细胞水平揭示MIF通过调控B细胞获得抗原呈递细胞样功能在肺腺癌中的双重作用 | 样本量较小（仅3个肿瘤样本），需要更大规模验证 | 研究肿瘤源性MIF在肺腺癌免疫调控和预后中的作用 | 肺腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞和恶性细胞 | 单细胞分析 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | Seurat，CellChat，GEPIA2 | 单细胞RNA测序数据，TCGA临床数据 | 3个肺腺癌肿瘤（29,936个细胞）和TCGA-LUAD队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 997 | 2025-11-30 |
Integrating multi-omics and machine learning to decipher the role of GSTP1 in endocrine-disrupting chemical-induced prostate cancer pathogenesis
2025-Dec-05, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178335
PMID:41202964
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法，揭示了GSTP1在内分泌干扰化学物诱导前列腺癌发病机制中的关键作用 | 首次整合多组学数据与机器学习框架系统识别EDC-PCa关联基因，并通过孟德尔随机化验证GSTP1的因果保护作用 | 研究基于公共数据库的转录组数据，缺乏实验验证；样本来源和数量存在限制 | 系统识别内分泌干扰化学物暴露与前列腺癌发病关联的关键基因 | 前列腺癌相关基因和内分泌干扰化学物相互作用 | 机器学习 | 前列腺癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | 集成机器学习框架, glmBoost, RF | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 四个转录组数据集(GSE32571, GSE71016, GSE46602, GSE200879) | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 998 | 2025-11-29 |
Single-Cell Atlas of Aging Human Skin Reveals FOSB-Related Transcriptional Programs and Druggable Targets
2025-Dec, Journal of cosmetic dermatology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/jocd.70569
PMID:41293818
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类皮肤衰老图谱，揭示FOSB相关转录程序和可药物靶点 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示人类皮肤衰老的转录调控网络，发现FOSB作为关键衰老相关转录因子 | 样本数量有限，仅比较年轻和老年组，缺乏中间年龄段数据 | 研究人类皮肤衰老的细胞类型特异性转录调控机制和潜在治疗靶点 | 年轻和老年人皮肤细胞 | 单细胞基因组学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | 基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年人类皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 999 | 2025-11-28 |
Spatially resolved single-cell transcriptome analysis of murine Salmonella infection reveals the role of distal colonocytes in the inflammatory response
2025-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2579909
PMID:41277366
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研究论文 | 通过整合多种转录组测序技术，揭示了小鼠沙门氏菌感染期间结肠的时空单细胞转录组景观，发现远端结肠细胞在炎症反应中的关键作用 | 首次结合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间RNA-seq数据，系统描绘了肠道感染过程中的时空转录组动态，并鉴定出远端结肠细胞的关键响应作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证相对有限 | 阐明肠道对病原体感染的区室化反应的细胞和分子基础 | 小鼠结肠组织和人类肠道单细胞转录组数据 | 空间转录组学 | 肠道感染 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间RNA-seq | NA | 转录组数据 | 一周感染时间过程的小鼠结肠样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1000 | 2025-11-28 |
Functional role of granulocytic myeloid-derived suppressor cells in CAR-T therapy: insights from single-cell RNA sequencing in multiple myeloma
2025-Dec, Immunopharmacology and immunotoxicology
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/08923973.2025.2585083
PMID:41198058
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤患者CAR-T治疗中粒细胞样髓源抑制细胞的功能作用 | 首次在CAR-T治疗背景下系统分析G-MDSCs的免疫抑制机制，发现PTGS1作为关键标志物并构建了高精度预后预测模型 | 样本量有限且患者间存在异质性，结果具有探索性，需要更大更多样化的队列验证 | 全面分析G-MDSCs在多发性骨髓瘤CAR-T治疗中的功能作用 | 多发性骨髓瘤患者 | 单细胞转录组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，基因集富集分析，体外功能实验 | 风险预测模型 | 单细胞转录组数据，RNA-seq数据，生存数据 | 7例多发性骨髓瘤患者（单细胞数据），713例多发性骨髓瘤患者（验证队列） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |