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当前共找到 1119 篇文献,本页显示第 961 - 980 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
961 2025-12-03
Identification and Validation of Phagocytosis-Regulating Factors as Potential Prognostic and Diagnostic Biomarkers for Intracerebral Hemorrhage Through Single-Cell and Bulk Transcriptomic
2025-Dec-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞和批量转录组学分析,识别并验证了吞噬作用调控因子作为脑出血潜在预后和诊断生物标志物 首次结合单细胞RNA测序和机器学习方法,系统识别了与脑出血相关的吞噬调控基因,并构建了ceRNA调控网络 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证 探索吞噬作用调控因子在脑出血中的诊断和预后价值 脑出血患者与正常脑组织的转录组数据 生物信息学 脑出血 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习 机器学习特征选择算法, CIBERSORT算法 转录组数据 来自GEO数据库的多个数据集 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
962 2025-12-03
CASP1 as a potential target of Dendrobium in Sjögren's syndrome: Multi-omics analysis and preliminary experimental evidence
2025-Dec-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过多组学整合分析,探讨了CASP1在原发性干燥综合征(pSS)发病机制中的潜在作用,以及中药成分石斛的可能治疗机制 首次通过多组学整合分析(包括转录组、网络药理学、单细胞测序和分子对接)系统性地识别了CASP1作为pSS的潜在治疗靶点,并验证了石斛活性成分与CASP1的结合潜力 研究主要基于生物信息学分析和初步实验验证,因果关系和治疗效果需要进一步的功能验证研究 探索CASP1在pSS发病机制中的作用及石斛的治疗机制 原发性干燥综合征(pSS)患者 生物信息学 干燥综合征 转录组测序, 单细胞测序, RT-qPCR, 分子对接 NA 基因表达数据, 单细胞测序数据 65名pSS患者及健康对照 NA 单细胞RNA-seq, 转录组测序 NA NA
963 2025-12-03
IRF5 siRNA Nanoimmunotherapy: Restoring Macrophage Efferocytosis in Atherosclerosis
2025-Dec-02, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究开发了一种靶向IRF5的siRNA纳米免疫治疗平台,用于恢复动脉粥样硬化斑块中巨噬细胞的胞葬功能 利用工程化siRNA纳米颗粒平台特异性抑制斑块不稳定巨噬细胞分子IRF5,首次实现通过siIRF5纳米免疫治疗增强斑块巨噬细胞的胞葬能力并改善斑块稳定性 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体中验证疗效和安全性 开发治疗动脉粥样硬化的新型免疫治疗方法 动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞(特别是Cd11c+和Trem2hi亚群) 纳米医学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 2个独立的ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
964 2025-12-03
Profiling Cell-state Fingerprints Based on Deep Learning Model with Meta-programs of Pan-cancer
2025-Dec-02, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 本研究基于深度学习模型StateNet,利用泛癌元程序生成细胞状态指纹,以分析癌症细胞状态的共性与个体差异 开发了深度学习模型StateNet,首次基于泛癌元程序生成细胞状态指纹,用于揭示癌症细胞的共享特征和个体特性,并识别了ACAT2作为缺氧与脂质代谢通路的关键介导因子 研究主要依赖单细胞RNA测序数据,可能未涵盖所有细胞状态或组织类型,且样本量虽大但仍有扩展空间 旨在解析泛癌中细胞状态的共同机制和个体差异,开发工具用于癌症分析和预后预测 159,372个细胞,来自245个细胞系,覆盖14种组织类型,以及3,210个癌症样本 机器学习 泛癌 单细胞RNA测序 深度学习模型StateNet 单细胞RNA测序数据 159,372个细胞(来自245个细胞系)和3,210个癌症样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
965 2025-12-03
Spatiotemporal liver dynamics shape hepatocellular heterogeneity and impact in vivo gene engineering
2025-Dec, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究通过克隆追踪、单细胞和空间转录组学技术,探索了小鼠肝脏生长过程中肝细胞异质性的演变及其对体内基因工程的影响 揭示了新生肝脏中克隆性肝细胞在空间生态位中的定位及其对成年组织生成的贡献,并展示了靶向这些细胞可提高基因编辑效率 研究主要基于小鼠模型,结果在人类肝脏中的适用性尚需进一步验证 探究肝细胞异质性在肝脏生长中的动态变化及其对体内基因治疗策略的影响 不同年龄阶段的小鼠肝脏组织 数字病理学 NA 克隆追踪、单细胞转录组学、空间转录组学 NA 转录组数据、空间数据 不同年龄的小鼠肝脏样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
966 2025-12-03
Spatial Transcriptomics of Developing Wheat Seed Reveals Concentric Gene Expression Zones and Subgenome Biased Expression of Key Genes
2025-Dec, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1
研究论文 本研究利用STOmics空间转录组平台,可视化小麦种子在灌浆关键期的基因表达空间模式,揭示了胚乳中的同心表达区域和亚基因组偏向表达的关键基因 首次在小麦种子中应用空间转录组技术,实现了亚细胞分辨率的转录本定位,识别了与八个功能细胞群相关的基因表达簇,并发现了胚乳内四个同心区域的表达模式 研究仅聚焦于14 DPA(花后天数)的小麦种子,未覆盖整个发育过程,且样本量有限 探究小麦种子发育过程中基因表达的空间组织,以理解营养储存、胁迫耐受和萌发等关键过程 小麦(Triticum aestivum)种子,特别是在灌浆关键期的发育阶段 空间转录组学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 超过4,000,000个空间解析的转录本 STOmics 空间转录组学 STOmics空间转录组平台 NA
967 2025-12-03
Spatial Cross-talk Modeling of the Tumor Microenvironment Identifies CCR5-Mediated Glia-to-Glia Signaling as a Key Regulator of Brain Metastatic Progression
2025-Dec-01, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学和细胞间通讯分析,揭示了脑转移瘤微环境中胶质细胞间信号传导的关键作用,并提出了靶向CCR5介导的胶质细胞信号传导作为治疗新策略 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学,系统解析脑转移进展中胶质细胞间的空间交互作用,并发现CCL4-CCR5信号轴可作为治疗靶点 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证不足;靶向治疗的长效性和潜在脱靶效应未充分评估 探究脑转移瘤微环境中胶质细胞间信号传导机制及其对肿瘤进展的调控作用 脑转移瘤微环境中的星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞 空间转录组学 脑转移瘤 RNA测序, 空间转录组学, 细胞间通讯分析 NA 转录组数据, 空间表达数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
968 2025-12-03
Combining Mendelian randomization and network toxicology to decipher the causal role and molecular mechanisms of environmental pollutants in breast cancer: A focus on Methyl-4-hydroxybenzoate
2025-Dec, Cancer epidemiology IF:2.4Q2
研究论文 本研究通过整合孟德尔随机化和网络毒理学方法,探讨了环境污染物甲基对羟基苯甲酸酯在乳腺癌中的因果作用及分子机制 首次结合孟德尔随机化和网络毒理学,提出了一种非雌激素受体依赖的致癌机制假说,涉及生长因子信号传导失调和代谢重编程 研究主要基于遗传数据和计算分析,缺乏直接的实验验证,且样本来源有限(如FinnGen联盟) 探究甲基对羟基苯甲酸酯在乳腺癌中的因果角色及其非雌激素机制 乳腺癌患者及尿液甲基对羟基苯甲酸酯硫酸盐的遗传数据 生物信息学 乳腺癌 孟德尔随机化分析、网络毒理学、转录组分析、单细胞/空间RNA测序、分子对接 NA 遗传数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 尿液MEP硫酸盐数据n=8285,FinnGen联盟乳腺癌风险数据n=182,927 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
969 2025-12-03
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing analysis reveals cuproptosis-related proteins in Crohn's disease
2025-Dec, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,揭示了克罗恩病中与铜死亡相关的蛋白标志物及其与代谢和免疫的关联 首次将铜死亡相关蛋白与克罗恩病联系起来,并整合批量与单细胞数据构建诊断模型,揭示了CD274、PDK1、CP和SLC31A2等新标志物 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;单细胞分析仅为初步探索性结果,需进一步功能研究确认 探索铜死亡相关蛋白在克罗恩病中的作用,并构建诊断模型 克罗恩病患者炎症组织与非炎症组织 生物信息学 克罗恩病 RNA测序,单细胞RNA测序,RT-qPCR 诊断模型 基因表达数据 494例组织样本(批量数据)和25,121个细胞(单细胞数据) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
970 2025-12-03
Systematically Revealing Quantitative Multi-Target Integrative Effects of Plants With Artificial Intelligence Method
2025-Dec, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1
研究论文 本研究开发了一种基于人工智能的新方法,以山楂为例,系统揭示了植物在单细胞水平上对疾病的多靶点潜在整合效应 提出了一种基于深度自编码神经网络模型的新方法,将植物与疾病之间多个共同靶点在单细胞转录组中的表达水平编码为一个整合值(MTIS),首次在单细胞水平上实现了植物多靶点潜在整合效应的景观和定量图谱 该方法目前仅以山楂和动脉粥样硬化为例进行了验证,其广泛适用性有待更多植物和疾病模型的进一步测试 系统揭示植物对疾病的定量多靶点整合效应 山楂(植物)对动脉粥样硬化疾病的影响 机器学习 心血管疾病 单细胞转录组测序 深度自编码神经网络 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
971 2025-12-02
Integrating pathology genomics and single-cell genomics to identify lactate metabolism-related prognostic features and therapeutic strategies for melanoma
2025-Dec, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究整合病理基因组学和单细胞基因组学,构建了基于乳酸代谢的预后模型,并探索了黑色素瘤的治疗策略 首次整合多组学数据(包括病理影像特征、单细胞RNA测序、空间转录组学等)系统表征黑色素瘤乳酸代谢特征,并开发了结合病理特征和基因的预后模型,同时通过实验验证了关键基因RAB32的功能 研究主要基于TCGA等公共数据集,外部验证可能有限;模型在临床广泛应用前需进一步前瞻性验证 系统表征黑色素瘤乳酸代谢的分子特征,构建预后模型并探索治疗策略 皮肤黑色素瘤(SKCM)患者样本及细胞系 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 基因集变异分析, 机器学习 ResNet50, 10种机器学习算法组合 图像, 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 TCGA队列训练和验证集 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
972 2025-12-02
Endothelial SPRY1 deficiency associates with angiogenic-metabolic reprogramming in pulmonary arterial hypertension: a multi-omics analysis of bulk and single-cell transcriptomic profiles
2025-Dec, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组测序、高维加权基因共表达网络分析和机器学习,揭示了肺动脉高压中肺毛细血管内皮细胞的扩张及其代谢重编程,并鉴定出SPRY1为关键生物标志物 首次通过多组学分析结合机器学习,在肺动脉高压中系统揭示了毛细血管内皮细胞的异质性扩张与糖酵解-三羧酸循环代谢通路失调的关联,并鉴定出SPRY1这一新型关键生物标志物 研究主要基于GEO数据库的测序数据,虽然在大鼠模型中进行了验证,但临床样本量有限,且机制研究深度有待进一步实验验证 阐明肺动脉高压血管重塑的细胞分子机制,鉴定关键致病因子 肺动脉高压患者的肺组织样本、正常对照肺组织、野百合碱诱导的肺动脉高压大鼠模型 生物信息学 肺动脉高压 单细胞RNA测序,高维加权基因共表达网络分析,机器学习 机器学习(未指定具体模型) 转录组测序数据 未明确样本数量,包含PAH患者和正常对照的肺组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
973 2025-12-02
Neutrophil-enriched gene signature correlates with teplizumab therapy resistance in different stages of type 1 diabetes
2025-Dec-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了与teplizumab治疗1型糖尿病疗效相关的免疫基因特征,并开发了一个基于血液的26基因预测模型 首次在1型糖尿病中通过跨物种(小鼠和人类)单细胞转录组学分析,鉴定出与teplizumab治疗反应相关的特异性免疫细胞特征,特别是中性粒细胞富集特征与治疗抵抗的关联,并开发了高精度的血液基因预测模型 研究样本量相对有限,且主要基于观察性数据,需要在前瞻性队列中进一步验证预测模型的临床实用性 探究teplizumab治疗1型糖尿病疗效异质性的免疫学机制,并开发预测治疗反应的生物标志物 非肥胖糖尿病(NOD)小鼠和1型糖尿病患者的血液及胰腺样本 单细胞转录组学 1型糖尿病 单细胞转录组测序 弹性网络逻辑回归模型 单细胞RNA-seq数据 来自NOD小鼠的配对外周血和胰腺样本,以及来自AbATE和TN10临床试验的人类全血样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
974 2025-12-02
ERO1A-positive tumor epithelial cells in colorectal cancer progression: a multi-omics perspective
2025-Dec, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过多组学方法,识别并验证了结直肠癌中ERO1A阳性肿瘤上皮细胞亚群在促进肿瘤进展和不良预后中的关键作用 首次从多组学角度系统鉴定并验证了ERO1A阳性上皮细胞亚群在结直肠癌中的关键作用,并基于此构建了优于现有111个模型的预后预测工具ETSRM 研究结论主要基于回顾性队列数据,需前瞻性临床研究进一步验证;涉及的信号通路机制有待更深入的实验探索 探究结直肠癌进展的关键驱动细胞亚群及其与肿瘤微环境的相互作用 结直肠癌患者样本(来自21个多中心队列)及相关的细胞与动物模型 数字病理学 结直肠癌 单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、生物信息学分析、体外与体内实验 风险预测模型(ETSRM) 转录组数据、蛋白质组数据、空间转录组数据 来自21个多中心队列的2767例结直肠癌样本 NA 单细胞转录组学, 空间转录组学, 蛋白质组学 NA NA
975 2025-12-02
Heterogeneity of Acute Myeloid Leukemia patients explored through single-cell and single-sample gene regulatory networks
2025-Dec, Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序数据构建急性髓系白血病患者的基因调控网络,探索疾病异质性并揭示个性化治疗潜力 首次结合单细胞数据与单样本网络方法(LIONESS)构建患者特异性基因调控网络,实现完美患者区分并识别细胞类型特异性调控程序 网络构建依赖四种推断方法的一致性,可能受算法限制;样本量未明确说明,可能影响泛化性 探究急性髓系白血病在基因调控层面的异质性,为个性化治疗提供基础 急性髓系白血病患者与健康对照的祖细胞、单核细胞和树突状细胞 生物信息学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 基因调控网络推断方法(ARACNE, CLR, MRNET, GENIE3)与LIONESS 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
976 2025-12-02
Integrating computational pathology and multi-transcriptomics to characterize glioblastoma heterogeneity and identify prognostic biomarkers
2025-Dec, Human pathology IF:2.7Q2
研究论文 本研究通过整合计算病理学和多转录组学数据,表征胶质母细胞瘤的异质性并识别预后生物标志物 创新性地结合了全切片图像的病理特征、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学数据,并开发了机器学习模型来识别与预后相关的关键基因和细胞亚群 模型在验证集上的C-index相对较低(0.616),样本量可能有限,且研究主要基于TCGA等公共数据集,需要进一步的外部验证 改善胶质母细胞瘤的预后评估并识别潜在的治疗靶点 胶质母细胞瘤(GBM)患者 计算病理学 胶质母细胞瘤 bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学 Lasso + plsRcox 图像, 转录组数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
977 2025-12-02
Integrative analysis of RiboSis-related gene expression in colorectal cancer: implications for prognosis and immunotherapy
2025-Dec, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过整合分析结直肠癌中核糖体生物发生相关基因的表达,构建了一个预后特征模型,并探讨了其在免疫治疗响应中的潜在应用 首次利用单细胞RNA测序数据结合非负矩阵因子化方法鉴定结直肠癌中与核糖体生物发生相关的细胞亚型,并开发了一个基于多算法机器学习的预后特征模型,该模型在多个数据集中验证了高预测准确性 研究主要依赖于公共数据库的回顾性数据,样本量相对有限,且实验验证仅聚焦于单个枢纽基因PFDN2,未来需要更大规模的前瞻性研究和更全面的功能验证 探索核糖体生物发生相关基因在结直肠癌中的临床意义,包括预后评估和免疫治疗响应预测 结直肠癌组织样本及其中的单细胞数据 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 非负矩阵因子化, 机器学习集成方法 单细胞RNA测序数据 3个结直肠癌组织的scRNA-seq数据用于初步分析,13个结直肠癌样本的26,961个细胞用于详细研究 NA 单细胞RNA-seq NA NA
978 2025-12-02
Plasminogen activator inhibitor 1 promotes aortic aging-like pathophysiology in humans and mice
2025-Dec-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过人类遗传学分析和基因工程小鼠模型,揭示了纤溶酶原激活物抑制剂1(PAI-1)在促进主动脉衰老样病理生理中的作用及其机制 首次结合人类功能缺失性SERPINE1变异体的保护效应与对应基因工程小鼠模型,系统阐明PAI-1通过调控细胞外基质和血管平滑肌细胞可塑性影响血管衰老的机制 研究主要基于小鼠模型,人类数据来源于遗传变异分析,需进一步在人群中进行干预性验证 探究PAI-1在心血管衰老过程中的作用机制及作为治疗靶点的潜力 携带SERPINE1功能缺失变异的人类个体、Serpine1TA700/+基因工程小鼠、PAI-1过表达小鼠 心血管疾病研究 心血管疾病 单细胞转录组测序 基因工程小鼠模型 遗传学数据、生理学测量数据、转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及基因工程小鼠品系比较 NA 单细胞RNA-seq NA NA
979 2025-12-02
Deciphering macrophage heterogeneity and factors driving M2 polarization in lung adenocarcinoma through single-cell RNA sequencing
2025-Dec, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序解析肺腺癌中巨噬细胞的异质性及M2极化的驱动因素,发现BCAT1表达与M2巨噬细胞浸润正相关,并可能通过促进M2极化形成免疫抑制微环境,影响免疫治疗效果 利用单细胞测序数据识别BCAT1作为驱动巨噬细胞M2极化的关键基因,并通过体外和体内实验验证其在肺腺癌免疫抑制微环境中的作用 研究基于特定数据集GSE207422,样本来源和规模可能限制结论的普适性;BCAT1的具体作用机制仍需进一步探索 探究肺腺癌肿瘤微环境中巨噬细胞的异质性及M2极化的分子驱动因素,以改善免疫治疗反应 肺腺癌患者的肿瘤相关巨噬细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
980 2025-12-02
Multi-omics nominates VDAC2 as a candidate protective locus in sepsis-associated cholesterol dysregulation
2025-Dec, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过多组学与机器学习方法,探索脓毒症中胆固醇代谢失调,并鉴定VDAC2作为潜在的保护性基因位点 整合转录组、单细胞RNA测序数据及101种机器学习算法构建诊断与预后模型,首次通过多组学方法将VDAC2确定为脓毒症胆固醇代谢失调中的候选保护性位点 研究基于公共数据库的回顾性数据,需进一步实验验证VDAC2的功能机制 探索脓毒症中胆固醇代谢失调的分子机制,并识别新的治疗靶点 脓毒症患者的基因表达数据 机器学习 脓毒症 转录组测序, 单细胞RNA测序 机器学习算法, 非负矩阵分解, 诊断模型, 预后模型 基因表达数据 从GEO数据库获取的脓毒症转录组及单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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